Spg026794 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg026794
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold13: 24048378 .. 24053022 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg026794
SyntenySpg026794
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGATCCCTCTTTACCTGTTAGTCATTGTGATTTAATACATACAATAATTATTTAGTATTAAAATTATTAATAGTTAAAGGAGTAACGTAACCTGTTGAGCATGGATCAAAGCCATTAAAGCAAAGGAAGTGTGAACCAGATTGGAAGTATTTCCTTGAAAAGGTGTATATACTTTTGTTTTACACGAAACGTGGCTCTCTCCCCAACCACCATCTCTACATTGGATTTTAAGTAGAAAATCCACACCTCTTCTTATTGCTGAGCAATTATCGTAAGTGTTTCCAGCTGCCTCTAATCCTTTTATGGCAAAATACGTAGCATATAAGTGACATATTCCCCAATTTCCATACCATGATCCGTCCTTTTTTTGTGTTTCTTTCATGTAGTTTGTTGCTTTTGTTATAAAAGTCTCAATCTCTCTCTTTCTATGACTTGGAAACAGCCTCTTGAAAAGCACCACCGCCTGTATCGATGATGATGTGCATTCTACATATCTAATTTTACTCATTGCATTCATTCATACCAAAGTTAGAAACGGATCAAATTTAATTTAATTTTAATTTGAAAAAAAAACTATTACATAATTTACGTACTCATACTCCAATATTGAGTATTCTAAGAACTCCAGTGGATTCAGTCGCTGAAAAGTATGAGATCACACACAAATGATCATATTAAATTAACTAATCTATTTTCTTTTAAGATTTAAATTTCATATAGTATGTTTTATAAATTGTGTTTACCTCGAGCCATGATAACGCGGTGCTTGTTGGTTGCCAAGCTGACACTCCACCATTTCTTGCCTGTTTAATCAACAATAAAACTTGCAGTTATATACACTAATGCTATGTTTGGAACCAAAATCACTGCTTTTCATCCTCAGACACTTCTATTTTAAAATAGTAATGTTTGGAAATGGAAGCAAAATCACTTTAAAGTGCTTCTTCATCAATCATTTGAGAGGTGATTTTTCAGTAAATTTTGGTAAAACAATTGTGAGAAATTTAAAAAATTACTATTATTTCAGATTTGAAAAGAAATAAAACCTCCTACTTTTCTTTTTTTTTTCTCTCTGATTTTTTTACCTCTTCTCTATTCCTTTTTGTCAAAATGTTTTGTTCCTTCCTCTAACTTCTCTTTTACTTTTTCTTTGGTCTAAAATTTTGTATGTCTCTCTAACTTTATTTCTTTATTTTTGAATTTTTACTTTATTTCTTTATTTTTGAATTTTTGCTTGCTTCATTAGAATTCTCTCTTTAATTTTTTTTGCTTCACTCTAAAATGTTTGCCCCTCCTTGTCTCTAACTTTTTTTCTCTTTGAAACTTTTCTCTCGAATGCAAGGCTTATTTTAGTAACCAAACAAAACATTAATATTTGAAAACAAAACTTTTACATCAAAATCTCTTGTATAGGTGTGTAGTCAAATATTAAAATAATCTATAATTAAACATTTTACAAAAATAATTATAATTGAATCATAGACTTAAAAAAAACACTTATTTTAAAGTCATCTTCAAACATTCCTTCAATCATTCAAACTCACTTTTAAAAGTGTACCAACAAACATTGAAATGATTATAGGTAAATCACTTTTAAACAAATCATTTTTGCTAAAATCACTTCAATTTGCCTAAATGTTTTTAACCAGAGTGATTTAATTATAATTATTTTTGTAAAAGTGTTTAATTATTAATCATCTTAGTGTTTGGTTTCACACTTTTAAAATCAATTTTAAAATTTAAATTCAAATTTTTATAAGATAATTATGTAAATTTTATATAATTTATATTACTAATTATGTTTTTTTTACTTTAAATAATTTGATAAAAAATTAAAGACAAACTTGTAAACAATTGTATCAGGAAAATTCTAATTTTAGTTCAAATAAAAAAATAAATAAATAAATTAGAAGCAACAATTAAATATAAAAATAAAAAGAATAAAATGAAATAAGATAAAGGACAGCTTGCACAGATAGCAAACTCAACTATAATAATAGCAAAATTAGCAACATATTAAAGAATTTGCAAAAATAGCAAAATTTAACATCTAGTCCATCTAAATTACTAAAAAGCCCATCTGACATGATTACCCAGCCCATCTAGCCTGTTTTTTTCCTTCTTCCCATTTCTATCAAGTCTATCATTGATAGATTCTATCAGTAATAGAATTCTGTCATTGATAGATTCTATCAATGATAGAATTTCGTCACTGATAAATTCTATCTGTAACAACCCAAATAAAAAAAAAAAGAGGGAAAAGGGGGGACTTTTTCCCCCCAAATTTTCGGTAAAGACTAGGAAAAAAAAAGGGGTCAAATTTCTCTCTCCACGATTTTCATCCCTTTCTCACGCTCCCACTCTCACAGCCTCTCTCTCTCGACTGCAGCAGCACGCGAGCCACCGCCTTCCGTCGCACATCGTCGCCGCTCCACCGTTCTCTCGTAGCCGTAAATCGTCGCGAGCTGCCGGTGAGTTCTCCCTCTCAGATTTCTCTCTCGTGTGGCTCTCTCTCTCGGTCTACAGCGTGCCGCCGTCCTTCTCCGTTGCAGATCTGCACGCCGTCGCCTTTCGCCGCGCCGCCCACCATTCACGCTCGCCGCCGTCTGCTCTGCCATCGCCGTCGCCGCGTTGTGCAAGTGGTGCGGACAGCAACGTTTTTGGGTCGTTTTTACAATTTTCCAGCAGCTTTGGCTTTGGGTAAGTGAGATTGAAAGCTTTTCGGTTTGATTTTAGTGTTTAATCATATACCCACTAATGTTTAGAACTTGTTCAGCAAGCTCTTCTTTTGATTTTCAACGTTTCAGACAATGGGTATTTGATTTCCAGTGGACTTGAATATTTCTAGTAGTGGGTAAGAGTTTCTAAGATGAATTTGGGTTGGTTATGGTGTGTAATCAAATACCCATTGACTTTAGCTATTGATTTTAAGGTACCCATAGTATTTGGAGGCAGATTTGTCGATTTGGAGCGAAATTTAGAACCCAGACAGCAAGCTTAAGGTTCTATTTTGGTGAGTTTTGGGTGTGAAATTTATCTCCATGATTATTTGGCTCCTAGTTGTATGCTTGCAATAATATCCTTTTGGTTTAAGAATTCTTTTCACCTTGTGTAGATTGATTAAAGGCCTTGGGAGCTAAGAAGCTAAATTAGCATTTGGCAAACATTATTTGGCTATGTAAGTAACCTTACTACTTGGAAAGCCTTGGCTAGACTAGGCTATTTATTATGAATTGTTACATGCCTTAAATATTATAAAACAAGAGACATCGATTATGTACGGTTGGAATATGGAATGTGATTTTGTGTGTTCTGGTGATACTAAATCTTCTACTTATGCGTGTGTTTGTCACTATTGAATGCTCGGAATGTTTGTGTTGGTAAGTATGAAATGTTCTGCTTGGGTAAACCTTGAATGCTTTGAATGCTCTATGTTGGGGAAGATAGGATGTTTTATATGGTTGAGTTGTGGATGCGAGACCTAACTCGCTTTGTTTTGTGGAAGTTCGGAGTCTATTCTATTGATTGGAAGTGTTGTGGAAGTTTGTAGTTGGGCAGTTCTGAATATAGAAGCGTATACTCTTGTTTACAGGTGATAAGAAACTTGAGGTCAGCTATACGAACGTCGTTGTGTTGCCGAATTTTTCGGTAGCATTACAGGGAATAATGAGGCTAAGTTTTGTGATATCACTTGGATTACGATGTGCTAAGATTGACTGGTGGTTGTTTAAAATATGCATATGCCTTTTCTATTTAGTGTTATGGATGTTGGTTATGATATCTATGCTTGAATGAGATGAAAGGCGAGGTAGTTAAAACATGTGAAACCCTTCAGAGACCTTTATGGGAAAGAAACTTGATGGTTAGGTTGCAAGTTAAATCAGACTCTGTTAACAGGGGCCCTAATACGAAATGAGGATAGGTTACTTATTCCAGTAGGGACCGTGGCAATTAAACACCTAGGACTGAAATGTTTATAGACTGAGATGAGGAGCTAAATGGGCGGGACTCGGCTTCGCAGACTAGGTGCCATCTACTATCTGTGGGAGTAAAGTTCCGACTACAAACCCATGGACGCCCCACCAGTGAGTTGGTAGTTGTAGTGCTATGCACACATAGGTGCCTTGATGGGTGAGACTTGGCTTCACTGACTGGGTGCCTTCTACCATCAGTAGGAGTAGAGATCTCTCGCAATTCCCACTTGTGTACCTCCAGTGAGTTGGTAAGCATGTGACAGGCTGGTTAATTGTCCACATGACCCGTACGTCATGATAGATGAAACGAAATGAAATGAAATGACTATCAGGTCCTTTAACAACAACTAACCTCAAGTTATCCATGTAATGCTTGTAAATCTCCTCCCAATAGTAGTGTTACTTACTGAGTATTTTTAATACTCATTCTTTTTAAAATGTTTCCTTTCAGGTACGAGCAAGGACATACAAAGCGTGTGACGGATTGCTGCTGACGAGCCATGGAAAATATGTGAACGTTACTTCCGCGTAGTTTAGTTCCTCATTTTTCTTTTAGTCAGATTTGTAAATTGTGGTTTTTAAGGGTTTAAATATGTCTGTATATTGTTTTTAGAAAACCTCTGTTTTAATGAAGTTTTTGCAAGTTTCTTGTTTTATTTGGGATCCCAG

mRNA sequence

ATGGATCCCTCTTTACCTCAGCACGCGAGCCACCGCCTTCCGTCGCACATCGTCGCCGCTCCACCGTTCTCTCGTAGCCGTAAATCGTCGCGAGCTGCCGGTGAGTTCTCCCTCTCAGATTTCTCTCTCGTGTGGCTCTCTCTCTCGGTCTACAGCGTGCCGCCGTCCTTCTCCGTTGCAGATCTGCACGCCGTCGCCTTTCGCCGCGCCGCCCACCATTCACGCTCGCCGCCGTCTGCTCTGCCATCGCCGTCGCCGCGTTGTGCAAGTGGTGCGGACAGCAACGTTTTTGGGTCGTTTTTACAATTTTCCAGCAGCTTTGGCTTTGGTTCGGAGTCTATTCTATTGATTGGAAGTGTTGTGGAAGTTTGTAGTTGGGCAGTTCTGAATATAGAAGCGTATACTCTTGTTTACAGGTACGAGCAAGGACATACAAAGCGTGTGACGGATTGCTGCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGATCCCTCTTTACCTCAGCACGCGAGCCACCGCCTTCCGTCGCACATCGTCGCCGCTCCACCGTTCTCTCGTAGCCGTAAATCGTCGCGAGCTGCCGGTGAGTTCTCCCTCTCAGATTTCTCTCTCGTGTGGCTCTCTCTCTCGGTCTACAGCGTGCCGCCGTCCTTCTCCGTTGCAGATCTGCACGCCGTCGCCTTTCGCCGCGCCGCCCACCATTCACGCTCGCCGCCGTCTGCTCTGCCATCGCCGTCGCCGCGTTGTGCAAGTGGTGCGGACAGCAACGTTTTTGGGTCGTTTTTACAATTTTCCAGCAGCTTTGGCTTTGGTTCGGAGTCTATTCTATTGATTGGAAGTGTTGTGGAAGTTTGTAGTTGGGCAGTTCTGAATATAGAAGCGTATACTCTTGTTTACAGGTACGAGCAAGGACATACAAAGCGTGTGACGGATTGCTGCTGA

Protein sequence

MDPSLPQHASHRLPSHIVAAPPFSRSRKSSRAAGEFSLSDFSLVWLSLSVYSVPPSFSVADLHAVAFRRAAHHSRSPPSALPSPSPRCASGADSNVFGSFLQFSSSFGFGSESILLIGSVVEVCSWAVLNIEAYTLVYRYEQGHTKRVTDCC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg026794.1Spg026794.1mRNA