Spg026595 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGAACGGGCAGAACAGTTAAAAGAAGAAATAAGGAAGATACTAGTTGCTTGCATGGCACAACCTTGGGATAAGCTAAAGTTGGTTGATTCAATCCAACAATTAGGTGTATCTTACCATTTTGAAAGTGAAATCAATCAAATCTTAGAGCAAATTTATCAGGCTTACAACGACTTCTTGAGTAATGATTATGGAGATGATCTTAATACTGTTGCTATTATGTTTCGTTTGCTTAGACAACAAGGTTATAAAATTTCATGTGGTAAGTTTAAATAACTCTTAGATTATTATCATATCAATTATGTTTTATTTTGTTATCAGTTCTACAATTTGGATTTGATGATAAAAATGTACGTCAAGGCCTCATATTAAAACAGTCTAAAAAATTAGAATTGGAGAAGATTTTCTTTCTTATCTCCATTTAGTTAACTTCAAATGTTTTTTTTTTCTCTTATTATTTTATCTCTAAATTTTGGCCAGATATATTTACAAAGTTCACAGAAAATAATGGAAAATTCAAAGAATCACTTGTCAACTATGCAAGAGGAATATTAAACCTATATGAAGCGGCACAAATGAGAGTGCATGGAGAAGAGGTGCTTGAAGAAGCTCTTGATTTTACCACGAGACATTTAAAAGTAGTTGCAGCCAATTCAAGGTCTTCTTTTGCAGCAGAAGTTGGCAATGCTTTAATAAGGCCTCTAAGAAAGACCCTTCCAAGAGTGAGGGCAAGGGAGTACATGGTCATCTATGAACAAGATCCTTCACATGATCATGTCTTGCTTACCTTCTCAAAATTAGATTTTAACTTATTACAAAAGCTTCACCAAAAGGAGTTGATTGAAATCACAAGGTACACATGAATTTCTATATTATTGTCTTTCATTCCAAGTGTCTAAGCATGATAGGTGGTTGTCCAACTATTTGGATAATTTGAGGATGAAATGATAAGATTAGCAAAACTATATGAGAGTTAGTCTTTGAAATATTTTATTTTTCCAAATTATTCATTTAATTTAAAAATAAATAATAATTTCATCTGAACTACTAAATTTTAGTAGATCTAATGGACTAATTTTAAAAGAAAACCACTCTAGAAACACTATATATATCATTTGTTATTTGCAATAGGCCGTCTTTCTTTCCTCAAAAACTAACCTGCAAATTTTGATGTCATAAGTGGATATAAATTGTTGAAAGTGTGTGATTAGTAGGGATCACAATAATATGTAAATAAACAAAATGCTCATTTCTTTAGAATGGTGGAATAAGAATAGATAAGAATTTTATATAATACCCTAGTTGGAAATAAGCCATTCTCATGTTTCCTTCCTACCATGACTATAGGTATTTAATACGTATTAAATAGGGGTTTTTCCCTGTTTCTCTATTTTAAATATTTTTTTTATATCTTGTTCGTTTTATTTAACTAAATGAGTTAGAGTCAAAGCGAGCATACCTCCGCGCTAATTGATATGTATCATCGACCCAAGAGGTCAGAGGTTTGAATCTCTCCACTCCAAATGTTGTGTTACAAAAAAAAAATTATAATAATAACTAAAATCAGTTAGAAATATTTAAATGAAATTTATAGTAAACCAAATTACATAAAAACTAATTGATAATAATGTATTGATTAGCATAATTAATGCCAACAAGAGCATAGCTCAACTGACACAAAGTTGTACTGATGACCACAAGGTTTGTGGTTCCCACATATTGTCAAAAAAAAAAAATTAGCATAATTAATTATTCATTTGTAATAAACAAAAAAAAAATAATTGATTAATTAAACATATTTACTTAATATTTATCAATAAAATTTTATCAAATTAATCCAATTAAGTTTTTATTGAAATTATTAGTTCATTTATAATCAAATATGTTTAATTAAATAATTTTAATTAGTTAATTTAATTTAGGCGAAGGATTTATTTTTCTATAATTTTCGTTATTTATTCCATCAAAAGTAACCATTGTCTATTACTTATAATCGATTTAATTTATATTAATTTATTAATTCATAAATTAATGTATCATAATTATATGAAATTAATTACATAAATCAAGCCAACAAGAGCAATGACATAAAGATGTACGGATAACCACGAGGTCTGTGGTTCGAATCCCCCACCCTCATATTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGCACACATAAATCAAACCTAAACACAATTATTCTTGTAAAAATGCAATAACATTCCGGTGTACAACCAAATACAACAATATATGATTCTCAAAAATATTATTTTGGGTAAAATACCCTTTTGGTCCCTCATGTTTCGGGTTCGTTTCCAATAGGTCCCTAGGTTTCAAAATCGAACAATCAACTCCCTACTGTTTCGGAAATAGTTCAATTTAGTCCCTCCACCGTTAATTTTTTTAACGGTGCTGACGTGACAAACGTTTAATAATAAAATAATAATTTTTAAAATTAAAATAATAATATATTAATATAAAATAATAATAATAATAATAATAAATAAAACTTTCTCTCTCTCCCTTACACGAAAACCCTTTCCCTCTCTTCCCCTAATCGCCGGCGATAGTCCACCGTCGCCGCTGCCGATGACCCCCGCCGCCACCCTTCTTCTTCTTCACTCAAATAAACCCCCTTCTTCTTCACCCAAACAAACCCCCAAAGGTCTCAAACCCACCGCCGCATCCTTACACAAAAACCCTTCCCCTCCCTTCTCCTTCTCGCCGACGATAGCCCATCGCCGCTGCCGATGACCCGCGGTCGCCGCCCTTCTTTTTCTTCTTCTTCAAAACCCTAAACTATACCCACCTCCACCTACCCCCTTCCTTTTCTTCTTTTTCTTCAAAACCAAATTCACCCAGTCACCCCTTCTTTTTCTTCTTCTTCAAATCTAAACCCCAAAAAAACAGATCCAACCACCCACCCCTTTTTCTTCAAAAACCCAACCCTCCATGCCCTTTTTCTTCTTCAAATCTAAACCCAAAAAAACAAAATTTCATAACCCACGCCACTTGAAAATCCGAAAAAAATAAAAATTCAAAAGAAGAAGAAGAAGCCGGTGGAAGAAGAAGATGTAGAAGCCGCCGCGCGCCACCATCATCGTTGGCAAGGGAAATGGGGGAAAGAAGGGGGAAAGGAAAGGGAAGTGAGGCTTCGGGCCTGGGGTGGGGGAGGGAGGAGAAAGAGATTCTTTTTCTTTTTCTTTTTTTAATATTATTATTATTATTTTAATTTTAAAAATTATTATTTTATTATTAAACGTTTGCCACGTCAGCACCGTTAAAAAAATTAACGGTGGAGGGACTAAATTGAACTATTTCTGAAACAGTGGGGACTTGATTGTTCGATTTTGAAACCTAGGGACCTATTGGAAACGAACCTGAAACATGAGGGACCAAAAGGGTATTTTACCCTATTATTTTCTAGTACTTTTCCACGATGCTAAAACCTTAACTAAAACAATACATTTTTGTTTATTAATATTGTATTTTGTTTTAACTTTTTATTAAAATATAGTGATTATAAAACTTAGGAAAAAATACTTTTTTGTCCTTGAGCTTTGAGCAATATGTGCATTTAGTCTCTGAACTTTTAAAAATAGATCTTTTTAGTTCATGAGTTTTGAGAAATAAGTTTAAAAGGTCTTCCATATTATTTTTTTTTCACACACTATTTACACACACTATTTACACACACACTAACACTAACACTATTTACACACACACTATTCACACTATTGACACACACAAACACTAACACTAACACTATTTACTCACACACACTAACACTAACACTATTTACACACACACTAACACTATTCACACACACACTATTCACACTATTCACATACACACACTAACACTAACACTATTTACACACACACTATTCACACTATTCACACACACACTAACACTAACACTATTTACACACACTATTCACACACACACATTTTTACTTTTAAAATTTTTATTATTTAGATAACAACCAGATAAAAGATAAAAGGAAACAAAACTAAAAAATAAAAAAACCTGAAAAAGATAAAAGGAAAAAAAAAATTACTGTACTTTTTATCTTTTATAAAACAAAACTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTCAACATCGAGATTCAAACATAGGCAAGTAGTGAAGAATGTATGTATGTACACCACCATACCAGACAAATAGATTTGTTTCAATCACATGGAGGTCGTATTTGAAGAGACGACCTTTTTTTTTTCTCGTTTAAAACAACAAGTTTTAGAATAACTACATTTTAATAAAAAGTTTTAAAAAATACCGTATTAATAAAAAAAATCTCCACCTAAAAACTAAAATAAATTTACAAGTTTTTTTTTTTTTTTCCCTTTTTTGAGTTCTTACAAGGTACTCATTTGTTAGGAATCCAAACACTGGAAACACACTTAGATATATATTGCAATATCAAAAGAAACTACAATATATTAATAGTCTTTCGAGAGGGCTAATTCTCTCCCAATTCTCTCCCAAGAGTCCCACAAATGGACATTGCTACTAAAATTCTCCACCCCCTAAGACCCCTAACTTCCCTATTTATAACAAAGACTCCTTAACTAATTACTAATATGCTCTTACTCTTCATCTAATACTATTTCCTCAAATATACCATACTAGTATCCTTACGTCATTCAAGAGTGTTGTTCTTATTTATTTATTTTTGTGCCTACAAATATTATAGTAAAAAGTTCAAGTTCTTTTTAAATATTTTCTCAACCTATATAATTACTGGTCATATTTACTAGGTGGTGGAGGAATTTGGACTTGTCAACAAGCTTGACATTTGCAAGAGATAGAATTGTGGAGTCCTACTTTTGGACATTGGGTGTATATTTTGAACCCCATTTCAATGTCGCAAGGGAAGTATTGACCAAAATGATTATGATGGTAACAGTTTTAGATGATATATATGATGCATATGCAACATTTGAAGAACTGCAGATCTTCACTGCAGTA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MEERAEQLKEEIRKILVACMAQPWDKLKLVDSIQQLGVSYHFESEINQILEQIYQAYNDFLSNDYGDDLNTVAIMFRLLRQQGYKISCDIFTKFTENNGKFKESLVNYARGILNLYEAAQMRVHGEEVLEEALDFTTRHLKVVAANSRSSFAAEVGNALIRPLRKTLPRVRAREYMVIYEQDPSHDHVLLTFSKLDFNLLQKLHQKELIEITRWWRNLDLSTSLTFARDRIVESYFWTLGVYFEPHFNVAREVLTKMIMMVTVLDDIYDAYATFEELQIFTAMKKQAEFYFKEAEWLNKRYKPKFEEYLKVGSDSSAYAFCATSSFLGMGDIATKEVFEWTSECPKIIEASTIIARLMDDIVSHKFEREREHVASAVECYMEQYGCSKEETYVELNKLVLDAWKDINEACLHPTIVPMPILMRILNLSRVIDLLYFDEDGFTHANGRTKSFIKSMLLDPVPCSTSPSPPPFAVSLSVSVAASSSLSVAVTVSSTVRRLPLCLNRRLPPLSQSPPLPLSQLPSPSPPQFAVSPSVSVAASSSLFHYLIKRKRLDAAAKLSQAIFPEGTASRCCAKFPSLFEAVQRQRRGAVYRDIGFIACERIMYARERSLCEENAPAKGDKDAPVKPYKEKSPMLMTKLSKQYTEENAPEMRPQLGFPTEYRDSWDLHRIIRKSPIWHQISEDRGFLPSKAFSH Homology
BLAST of Spg026595 vs. NCBI nr
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Match: XP_038903601.1 ((+)-gamma-cadinene synthase-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 610.1 bits (1572), Expect = 2.3e-170 Identity = 308/511 (60.27%), Postives = 379/511 (74.17%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. NCBI nr
Match: XP_022932164.1 ((+)-gamma-cadinene synthase-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 4.8e-168 Identity = 300/512 (58.59%), Postives = 380/512 (74.22%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. NCBI nr
Match: XP_023520451.1 (LOW QUALITY PROTEIN: (+)-gamma-cadinene synthase-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 600.9 bits (1548), Expect = 1.4e-167 Identity = 300/512 (58.59%), Postives = 379/512 (74.02%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. NCBI nr
Match: XP_022985195.1 ((+)-gamma-cadinene synthase-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 599.4 bits (1544), Expect = 4.1e-167 Identity = 300/512 (58.59%), Postives = 378/512 (73.83%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B2KSJ5 ((+)-gamma-cadinene synthase OS=Cucumis melo OX=3656 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 559.3 bits (1440), Expect = 6.1e-158 Identity = 287/520 (55.19%), Postives = 366/520 (70.38%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Q3H3 ((-)-germacrene D synthase OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT_19s0014g04930 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 496.5 bits (1277), Expect = 4.9e-139 Identity = 254/511 (49.71%), Postives = 340/511 (66.54%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9SCB6 (Probable terpene synthase 2 OS=Ricinus communis OX=3988 GN=TPS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 474.2 bits (1219), Expect = 2.6e-132 Identity = 242/509 (47.54%), Postives = 330/509 (64.83%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F6M8H4 (Probable sesquiterpene synthase OS=Santalum album OX=35974 GN=SesquiTPS1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 469.9 bits (1208), Expect = 4.9e-131 Identity = 236/510 (46.27%), Postives = 327/510 (64.12%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Q3H2 (Valencene synthase OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=ValCS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 465.3 bits (1196), Expect = 1.2e-129 Identity = 237/510 (46.47%), Postives = 324/510 (63.53%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CNP6 ((+)-gamma-cadinene synthase-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012779 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 625.9 bits (1613), Expect = 2.0e-175 Identity = 313/511 (61.25%), Postives = 389/511 (76.13%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EW93 ((+)-gamma-cadinene synthase-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111438481 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 2.3e-168 Identity = 300/512 (58.59%), Postives = 380/512 (74.22%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JAP8 ((+)-gamma-cadinene synthase-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483273 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 599.4 bits (1544), Expect = 2.0e-167 Identity = 300/512 (58.59%), Postives = 378/512 (73.83%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JCH1 (LOW QUALITY PROTEIN: (+)-gamma-cadinene synthase-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483232 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 588.2 bits (1515), Expect = 4.5e-164 Identity = 292/512 (57.03%), Postives = 377/512 (73.63%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7F9 ((+)-gamma-cadinene synthase-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483269 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 587.0 bits (1512), Expect = 1.0e-163 Identity = 298/512 (58.20%), Postives = 371/512 (72.46%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. TAIR 10
Match: AT5G23960.2 (terpene synthase 21 ) HSP 1 Score: 380.2 bits (975), Expect = 3.6e-105 Identity = 201/512 (39.26%), Postives = 302/512 (58.98%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. TAIR 10
Match: AT5G23960.1 (terpene synthase 21 ) HSP 1 Score: 379.4 bits (973), Expect = 6.2e-105 Identity = 201/514 (39.11%), Postives = 302/514 (58.75%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. TAIR 10
Match: AT1G31950.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 308.1 bits (788), Expect = 1.7e-83 Identity = 175/516 (33.91%), Postives = 283/516 (54.84%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. TAIR 10
Match: AT3G14520.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 300.8 bits (769), Expect = 2.8e-81 Identity = 172/518 (33.20%), Postives = 280/518 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Spg026595 vs. TAIR 10
Match: AT3G14540.1 (Terpenoid cyclases/Protein prenyltransferases superfamily protein ) HSP 1 Score: 300.1 bits (767), Expect = 4.7e-81 Identity = 169/518 (32.63%), Postives = 281/518 (54.25%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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