Spg025066 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg025066
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold12: 14989101 .. 14996678 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg025066
SyntenySpg025066
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGTCGACGGAAGTCGACGACGGTCGAAAGTCTGAGGTCGACGGTGGTGGTCAGTCGGCAGAGGTCGACGACAGCCGGTAGTCGAAGGTTAACGGTGGCGACCACTGATAGTCGAAGGTCAACGATGGTGGCCAGTTGGTGGAGGTTAGCAACGACCGGTAGTCAGAGATTGACGGAGGTGATAAAAAAGGAAAAAAGGTAAGAAATTATAACATAAATAATAAAAAAATGAAAGAGAAAGAAGTAACGAAAAAAAAAAGATGAGGGAGTGGTTAAAAAAAATGGAGGAAGAAAAGAGATTGATGTAGGAATGGGAGGGAGAGATGGATACATGCATGAAAGATAGAAAAAAAAAACAGAAACAGAATTTGAGAAACAACTTTTTGTAGTTTCTCAAATTTGGCATCCTTTTTAGAAACGTTTCTAGAAATTTAGAAACAAGAAATAGGGATGAGTTATCAAACAAGTTTGTTTCTTAAAAAAAGGAGAAATAGAAACAAGAAACAGGAAACAGGAACGTTATCAAACGAGCCCTTAGTTTCATGCTTCCAGATGTTTTAAAATTTCAACTTTGTGAAATTTGTCTATCATGTTTTGACTATTCTATTATCGTAAAATGATTTATGGTCATGGGCTCAGTTTATTAAATAAAAGATTTTTACTTATGGTCTCTTTCACTTTAAAGTTTTAAAAGTTTTACCTTTTCATGCATGTAGTAGCGACCCTCGACATGTTTTTAGCTTCCTACTAGTCAGGTCATTATATAATATGTATATTGATACATTATAATATAAAGTTAATTTTGAATATGATTCAAAATTAAACTATGGTAGAATAATGTATTTGAATAGGATTCAAATAATTATTAATATGAATATGATTTATATTAAAACTCTAGGTTAAAATTAATATGAATTAGATTCATATTAAAACTATAGGTTATGAGAGAGATGTACATTTGAATATGATTCAAATGAAATTAATTAATTAATTAATATTGATTTTAATTAAATTAGATTAATTCTAATTTAATTAATAAATAAATAATTCTTCACCATTATTGCTGGGAAGTAGAGAGTGGTTACAACTCCCTTCTCTCTTTTGGTTTAAAGATGCAGAGTGTCTTCATTTTAAGGTTGGTTGTTCATTTGTGATTTTCCTCTCTACCAAAAGTCCTCTCTCCCAAGATTTTATAGAGATCAACACAAACTGTTTGTTACTTCCCTTTCACTTTCAAAAGGAGGTTCCCACAAACCGATCCTTCCCAAGAGAATAGTGGGGAAGACTCTTTTGGTGGTGTCCAACACTGGTTTGCTGCAATTTTACTGAAGAAGAGTCTTCAAAAGTAAAATTCTATTCCTTGTATTTAGATTCTTAACCTTAGAATACATTATGAATGTATTTATGTTTTTTATTCTGTGTTGTAAAATTCTAATTCAAAATCAATGCACACGCGTTCATGTGCTTTTGCGGTGGGATTTCATCCCTTCACTGGTGTCTTCCCATATGATTGAGTTTTAGTGTTTATTACGGCCCCGTTTGATAACCATTTGGTTTTTGGTTTTTTGTTTTTGAAAAATAGGCTTGTTTTCTTTAAATTTTCTCACCATGGTTTTAATTTTTGCTAAAGACACACTTGAATTCCTAACCAAATTCTAAAAACAAAAACAAGTTTTGAAAACTACGTTTTTTAGTTTTAAAAAATTGGCTTGGTTTTTGAAAACATGGGAAGAAGGTAGGTGGAAAGCCAAAGAAACTTAGAGTTGGAAATGATGTTTATAAGCTTAAAAACCAAAAACCAAAAACAAAAAACCAAATGGTTATCAAACGAGGCCTAAATGTGTCAATCTTTTTACTGTAGCATGCAATTTCAATGTTTAATAATGATTGGTTATTTATTCCAAAGAAAAATAATTGTGCATTATTTTCAAAAACCAAACATATGAGGCAATTCAATACGATTTCAATGTCTCAAAGGGAAAAATACCATTAATTGGATCCAATTGTCAAAAAGGTCTCAATTTAATTAAATATTTAAAGAAGAAGAAAAGGAAGAATTTTATTCTATTTTTCCATTATGAGTTGTGCCTAACTTTTAGACATGGTAAATAAATTTAAATTAAAGAAACTTCTTCAAATTTAACTTAAGAAACTTGTTATACTTAGAAGTAGAGTCTGTTTGGGATGACTTTCTAAGTACTTAAAAAAGTGTTTTTAAATGAAAAAAGAGTTTTTAAGAACTTAAAAAATTATTTCAAACCAGCACTTCAATGTATAATCGTTTCTTCAAATTTTACAAAATTTAATAAGATGAGAATGAGGAATAACGTTATTAAACATAACTCAAGTGGACAAATAGATGTTCTTGTATTCTCGAAGTGGTCGAATAGATTCATACACACTAGGATAAAACATAAATTTAGAAACATTTGGATGAAGAATAATAAACTAAAATCATTAAGGTTCTATTTGGTAACCATTTCGTTTTTTGTTTTTGGTTTTTGAAAATGAAGCTTAAAAACACTACTTTCGACCATTAAGTTTCTTGGTTTTGTTATATACCTTCTTCCCTTGTTACTGGAATTTGATTAAGAATTCAAATGTCCTTGACAAATATGAAAACTTTTGTAAAGAAATTGAAAAGAAAACAAACTTAGTTTTCAAAACCAAAAACTAAAAACAAAATGATTATCAAATGAGACCTAAATAACAATCTTTTAAATTTGGAATAAGATGTTATAAAAAAAAAAATAAAAAAAATGGAATAAGATAATTTAAAATTTGGTGCTTATAAAAGCTTTGTTTGATACAATGGCTCTAGGTTTATGACAACTAGAGGATGAATAGGATTATTTAGGTCCCGTTTGATAACCATTTGGTTTTTTAAAATTAAACTTGTTTTCTTCCAATTTCTTTATAATGAGTTTCATGTTTGTTAAGGACACATTTGAATTTTTAGCCAAGTTCCAAAAAGCGAAAAATACATTTTTGGTCCCTGAGGTTTGAGTTAGGTTTCATTTTGATCCTTGAGTTTTCAAACTCAACATTCTTACCCCTTGAGGTTTGGATTTCGTTACACTCTTGACTCCTCCGTCCAATTTTCCGTTAAATCTTAACGGTTTGCTGATGTGACACCATTTTTTAATAACAATTAATTAATTAATTTTTTAAATTTTATTTTCGACCCTCCCATTTTTCCCTCCTTTCTTATTCTTCTTCCTCCTCCCCATCACCACCACCACCTTGCAACTGCTGTCGACCATTTTTTTTTTGTTTCCTCCTCTTCTCCTTCATTTCTCATTTTCTTCTCATTCCTTTCTTCTTTTCTTCTCTTTCTCCCTTGGTCACGCCACCTCCGACGACAGCCACCACGATCCTTTCTTCTTTTCTTCTCGTTCGACACGAACCTGAGCCACCTGCAACGAACCCATTCTAAAACGCGACCCAACCGTCGCGAGCCTATCGCCGTCGACGCAACCCAGTCGTCACCAACTCGCCAGTCGTCGTGACCCAACGAACCCATGATCTGAAACAAAGGAGAATCGACCCCCTTTATTCTAGCTCACCCATTTTGAAAACAGGATTGTTGCACGGGCGGAGAAATCACCAGATTCGAGGCTAGATCAGTTGTTGTCCGATGGGATCGCTGGAGAAATTGCCAGAGGTGGCATGAATCAGTTGTTGTCCATTTGAATCGCTGGAATCGTTGGAGAAATCATGTGAAGGACCGTCAGAATTGGTGGTGGCTGTCGGAGGTAGCGTGAAGGACCATAAGAATCACATGAATGGTTGGCGACGGTGGTGGTTGTCAATGAGTTGAGATTAGGGCTTGAGATGATGGAGAAGAAGAAGATTAAAGAAGAAGATGCCCATACGAGTGTATTTTTACTATAACAATGCCTACTTCACTTCCTAATGTTGCCTTGTCTCTTTTAGGAGTCGTTTGTTTCATCTTAGGATGTCCATACGGGTGGACATCTAGCTTATTTTAGATGTCCTTTTGAATCATGAGTTTCTTAATTTTTCTGTTATACACCTTTTTTTTAATCAAATTTCTTTATTCATATTTTTATTTTTTATTTAGAAATAAAATAATGTATTTATTAGATGTAATTAACTATATTTATATTTTACATTTCGATATAAAATAAACTTTAGTTAAATTCAATATTATATCTTAATTTATTTTTAATTGAAATTTAAAATGCAATATTAGTTTTTTTTTTACCTTTTCAATTATCGCTCAATACTATTGTATTTAGTCAGTTTTCTCTCTTGTATATCTATTGAAATGATTTATTTTAGTTATTTATTTGTAATTTATTAAAACTATTACTAATTATACATTTTAAAACACACAAATTCATTAGAAATAAATATTATTTCTATAAAAAATTATAATTTGAAAAAGTTATCAATATAATTCACTAAAATCATCCTGGTCTTCTTTTGAAAAAAAAAAGTTAAAATTGAAACAATATTTAATATTAAATATTTTATAAAAATTTCAAACTAATATAAATTACAAAATAACACATAAACTTAGTATAAATAAAATTGATGTACAAATATAACCTTACATTAATAAATACCAAAAACATGTAACGAGATAAACTTAAATTATATTAAATTAATATGTAAAATTACTTAAAATGAGTAACTGCATTATTGGTATAACACAATCTTAAAACATTCTCATACACAAATCTCGTAAAGCAAAAAGAGATATCCACCTTCTTAGCAGTTATCTAAAATATTCGATGTAACGCCCTGTGTTTCGAAATCGAGCCATTTTGAGATCTGGTGAGCTTTCTTGTTCTAATTTGAAAAATTAGAATTTAAGCTTAGCCTTAGGTCGTTAAATTAAGTTTCTAAAATTTAGGAAAAAGGATTTTAAATTTAAATGTTTAATTCCTAAGTTTTGAAATTTAATAGTCGATATTTATTTTAAATATCAAAAGACCCAAATCCCAACTCAATTGGGTTGTTTTCCATTCCAAATCTTTTAAGAGTTAGGAGTTTTAAATGGGATTAAATATGTTAATCCAAGTTCTTTTCCCCTCCTATTCTTAATGAGTCTTCTTTTTCTTAAGGTGTTGTTTAAAGAAAAGGAAAAAAAAAAGAGTTAAGGAAAAAGGAAAAAAAAAAAAGCCCTAGATTCCCAAACCCTCGTCCCTCTCTTCTTCACGCGTGAGAAAACCCCCCCTCCGTGAAGCTCCAGCGCCGCCCAACCTCCCCCAGCCGCAGCCGAGTTCGCCGCCGCTGCCGCCTGTGCACGTCGCACTGCCGCCGTCGAGCCTGAACCGTGGAGTTGCCGTCGATTCGCGAGTCCCTTCTCCCTCTCTCTCTCTCGCGCGTTTGTCCGCCGGCAACAGGCTCGCGAAGCCTTCATCTCGCCCTCACTCCGTGCGTCGGCCAACTGTAAGGAGACCCGTGGGCTCGTCTCCGTCGGTCTCTCTCCCGCTTGCTCGTTCTCCTCGCGTGTAAGGTCTTCTTCTCTCTCGATTCTCTTTCAAGTTTCCTCAAGTAACGAGTTTAATTCCTTGTTCCTCTTGTTTTCGGCTGGGTTAGTGGTAGAAGGCAAGATTTTCGTCGTTCTGGCGTTTTGGGCACGTTTGGGTTGTTTTAAGTTTCGTTCCAGCATGTTCGAGCTCTCTTGGTGAGTTTTCGTCGTTACCCATGCTTATTCGAGTTTGATTTTAGTTAACCCTTTTGTTATCGACTTCAAATTTCAAGAATAAGCCTTGTTTGTGTGCTGTCCAGCTGTAAATTAGACCCAAAGCGAGCTTTTGGCGATTACCCACACTTCGAGCGACCTTGAATTGAGGTGCTCTTGGTCCAACGACTTTAGATCGTCGTTTAGGACGCTCTCGATCATTGGACAACAAGTTTCAAGGTCGTTTAGGCGCTGTTCAGTAAGTTTCCTCTTCCTTAGACCCCGGTAATTCAATTATGTTGGCTCTTGAATAGCCTATAATCCATGGGTGTTTCATTAGTTTCAGTTTTAATTCAACTCGAGCCCCGGGCAGCACGTGTTTAAGGAGCTTTAGTGTTGGTTGTCAATTCCAGCAAGCTTCTGGACTCGTTAGTGTGGTTCGGTAAGCTTCTTCACCTTTTAGATCTTGTTAGAACTCTTGTTAGGCTTCGCTAGTTGGTCCCTGATGCTTGAAGTTGTTTGCTTGTAGCTTGGGATCAATTAAGGCTTACTTGGGTTATTTCCAACAAGGAACTTTATTCTGTTTGGTGGAGCTTTGAAGGTATATCATTATTCTTTAGACTCTTTCAATTGTGGTTTAAGTGCTTTTGGCTAGTCTTTAATGCTCGAACATTATTATTTTAGGATTGTTCAAGTTGGTTCCAAGTTTTCGAGCTAGCCCTTAGGCTTGAATCGAAGTTGGTTGGTAAGAAATTCTTCCCTTTGTTCTTTTAGGTTCAAATAGGGTGGTTAAGCTCAATTCTAATCTTTTATGTTATCCTTGCTGATTAGGAGCTTGCCTAGATTGGTTTAGGAGCTCTTGGATTATCTTTGGAGCTTTTCATCTAGTTTAGGAGCGTTTGGAGCTTTTGGTAAGTAGTTCCTACTTGATGTTGTCTGTTTGACTGTGTGATGCTTGCTGAATGTTACTCGCTTTATAATTACCCTCATGTTTCTTGTTTCTCTGAATATGTGTATATATATATGTTATCGTTGAAAAACATGACTTTTGTTGCATAATGACTAGTTGAAAGGCATGAATTGTTGTTGCATGTTGGTTTGATGTAAAGCGTGTTGGTTCGGTTTTGCATTTGAGAGTCAAGCATGAGTTGAGAGATGTAGTCATGTGAATGCTTAGTGGGCATGATTCATGAGTCTAGAAGCATGTTGCAGGGCATATGCATTCTAGTAGATGTGAGATATAGGTCAGGGACCTAAAGTGTGAAGGAAAGGAAAGTTGGGTGAGTGTCAGTGCACCTCGGGTACAAATGGTCGAGGGGTGACACGTCACCATTGGTTTAAGAGGAGCATCGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGGTGTGATGAGTCTAGAAAGCAAGTGTTGGGCGCCTGGGGAAGGACCAATGCTTTGCTAAGTCATCGGTGCACCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGGCGATGCACAGTTCGGGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGCTGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTGGCCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGACAGTGCGACTCGAAGGATCAGTCTTGGAGAGCCTTGTGAGGGCTAAGTATGAGTGTTGAGTGGTTAGCGAGTTGCATATAGAGAGATGCATGAGGCATGGCTTAGGAGAGTTACTCGTTTTCTAGCTTTGAGCATGATGTTCTGGTTACCGCTTTTATAAGCATGTTGGTTGCGCATGAATAGTATATGGTTTGCTTGTTTGCTTGTTTGCTGTTTGGTGGCTTCTCAGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCTTCGTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTCTCCCCCCAACTACCAGATTTTGCAGGTTATGAGGACCGCGTGGACCATGGTGATGCGGAGGAGACGTAA

mRNA sequence

ATGGGTCGACGGAAGTCGACGACGGTCGAAAGTCTGAGGTCGACGGTGGTGGTCAGTCGGCAGAGGTCGACGACAGCCGGTAGTCGAAGGTTAACGGTGGCGACCACTGATAGTCGAAGGTCAACGATGGTGGCCAGTTGGTGGAGGATTGTTGCACGGGCGGAGAAATCACCAGATTCGAGGCTAGATCAGTTGTTGTCCGATGGGATCGCTGGAGAAATTGCCAGAGGTGGCATGAATCAGTTCTCCAGCGCCGCCCAACCTCCCCCAGCCGCAGCCGAGTTCGCCGCCGCTGCCGCCTGTGCACGTCGCACTGCCGCCGTCGAGCCTGAACCGTGGAGTTGCCGTCGATTCGCGAGTCCCTTCTCCCTCTCTCTCTCTCGCGCGTTTGTCCGCCGGCAACAGGCTCGCGAAGCCTTCATCTCGCCCTCACTCCGTGCGTCGGCCAACTGTAAGGAGACCCGTGGGCTCGTCTCCGTCGGTCTCTCTCCCGCTTGCTCGTTCTCCTCGCGTGTAAGGTCTTCTTCTCTCTCGATTCTCTTTCAAGTTTCCTCAAGTAACGAGTTTAATTCCTTGTTCCTCTTGTTTTCGGCTGGGTTAGTGGTAGAAGGCAAGATTTTCGTCGTTCTGGCGTTTTGGGCACGTTTGGGTTGTTTTAAGTTTCGTTCCAGCATGTTCGAGCTCTCTTGCAAGCTTCTGGACTCGTTAGTGTGGTTCGCTTGGGATCAATTAAGGCTTACTTGGGTTATTTCCAACAAGGAACTTTATTCTGTTTGGTGGAGCTTTGAAGGAGCATCGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGGTGTGATGAGTCTAGAAAGCAAGTGTTGGGCGCCTGGGGAAGGACCAATGCTTTGCTAAGTCATCGGTGCACCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGGCGATGCACAGTTCGGGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGCTGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTGGCCCTGGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCTTCGTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTCTCCCCCCAACTACCAGATTTTGCAGGTTATGAGGACCGCGTGGACCATGGTGATGCGGAGGAGACGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGTCGACGGAAGTCGACGACGGTCGAAAGTCTGAGGTCGACGGTGGTGGTCAGTCGGCAGAGGTCGACGACAGCCGGTAGTCGAAGGTTAACGGTGGCGACCACTGATAGTCGAAGGTCAACGATGGTGGCCAGTTGGTGGAGGATTGTTGCACGGGCGGAGAAATCACCAGATTCGAGGCTAGATCAGTTGTTGTCCGATGGGATCGCTGGAGAAATTGCCAGAGGTGGCATGAATCAGTTCTCCAGCGCCGCCCAACCTCCCCCAGCCGCAGCCGAGTTCGCCGCCGCTGCCGCCTGTGCACGTCGCACTGCCGCCGTCGAGCCTGAACCGTGGAGTTGCCGTCGATTCGCGAGTCCCTTCTCCCTCTCTCTCTCTCGCGCGTTTGTCCGCCGGCAACAGGCTCGCGAAGCCTTCATCTCGCCCTCACTCCGTGCGTCGGCCAACTGTAAGGAGACCCGTGGGCTCGTCTCCGTCGGTCTCTCTCCCGCTTGCTCGTTCTCCTCGCGTGTAAGGTCTTCTTCTCTCTCGATTCTCTTTCAAGTTTCCTCAAGTAACGAGTTTAATTCCTTGTTCCTCTTGTTTTCGGCTGGGTTAGTGGTAGAAGGCAAGATTTTCGTCGTTCTGGCGTTTTGGGCACGTTTGGGTTGTTTTAAGTTTCGTTCCAGCATGTTCGAGCTCTCTTGCAAGCTTCTGGACTCGTTAGTGTGGTTCGCTTGGGATCAATTAAGGCTTACTTGGGTTATTTCCAACAAGGAACTTTATTCTGTTTGGTGGAGCTTTGAAGGAGCATCGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGGTGTGATGAGTCTAGAAAGCAAGTGTTGGGCGCCTGGGGAAGGACCAATGCTTTGCTAAGTCATCGGTGCACCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGGCGATGCACAGTTCGGGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGCTGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTGGCCCTGGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCTTCGTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTCTCCCCCCAACTACCAGATTTTGCAGGTTATGAGGACCGCGTGGACCATGGTGATGCGGAGGAGACGTAA

Protein sequence

MGRRKSTTVESLRSTVVVSRQRSTTAGSRRLTVATTDSRRSTMVASWWRIVARAEKSPDSRLDQLLSDGIAGEIARGGMNQFSSAAQPPPAAAEFAAAAACARRTAAVEPEPWSCRRFASPFSLSLSRAFVRRQQAREAFISPSLRASANCKETRGLVSVGLSPACSFSSRVRSSSLSILFQVSSSNEFNSLFLLFSAGLVVEGKIFVVLAFWARLGCFKFRSSMFELSCKLLDSLVWFAWDQLRLTWVISNKELYSVWWSFEGASRPWVQMVKGRCDESRKQVLGAWGRTNALLSHRCTLGTNGQGAMHSSGPWVQMVKGRTLSSVESIVALGRGCLPVPSCTDPLPSLSPQLPDFAGYEDRVDHGDAEET
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 353..372

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg025066.1Spg025066.1mRNA