Spg024578 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg024578
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold12: 15683537 .. 15690646 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg024578
SyntenySpg024578
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
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ATGAGTCACGACGGACTCGGAACTGCCTTCATCTGCCCAGAAATACGGTCGCATTTGGTTTTTGCCTTGCCAGAAATGTAGTCTGGTTTTTCCAGATATCCTCTGTTTTTCTGCAAAACCATATAATATGGGTCTTTTTTAGCACAAATAAGCATAATTTGACATACATGACTCTCAACTCCCTAATTCATCAACATTAACACTTTTTGAGCTCGAGAATAGTGAATTTGATCTAAAACATACAACTTTGACAAGATAATGAGCTAAATATAAGGGTAAAATAGGTATGTTTTTTACCCTTATCAGCTCCGCACTCACACCCACGTGATTTCCGCATCACACTCCGTTACTCATGAATTTCGCGCCATGTGTTGCGCCTCAAACTCAACTCATGCTACACACCCCCCTGCAACATGCAAGCCAAACTCAAACGTGCTTAACACGACATCTCATCATGCTTAACAACCAAACACGCCCATCTCAGGCAACACAAGGATGCATATCATGCTTCACACAAGCACTTCAACGATCACAACACAACAGTTACAGTTCATGCTCATCACAAGCAACAAACAAATACATGCTTGATAAGTGATAACTGTCCGAAAGGTAGTTATTTAGGCCTTAATTCTATAGGGATTTGTGTGTCTTTTGTGCTTAATAGGGTTGCTTTTAGATGAATATTATATGTTTTAACCCATTTGGAAGAATGGAGGCTTTGAAAGTTATTTTGTGCAGAAAATATTGCTGAGCGACGTGAGGGAGCAAAATCTGTGCTGCAGCAAACCTGGGAGCAAAACTGCCACGTCACAGCTCGTTATCCATTTTAATAAAGTGGCGTTAGCTGAATTATTTTCGGATCTAAGAAGCTTGGAAAGCCTGCCATGTGTCCAATTTAACCTAAACCTCATCTTATAAAAGGAGGAGCCGTCGAAGTTAAAGGCATTCACGATTGGGAGACCGAATCAATCGGCTGTAGGCCGAATTGACGGCAGAATGGAGATCTAAGAAGACCATTTGCGATTCCTCTCAAGAAGACGAAGTTCTTCCATGTTCTTGGTGGTTTGGAGCAGCCGTTTCATCTCCCCAATTACTAAAAGGATTAGTATTTCTTGTGTATTTTGCATTATGGATGTGCTTATCGAGATTGTAACGTGTTTTATGTTTTCAATCATGAACTAATTGCTTTGTAGGCATAGGTTAAGAATTATGTGATTGTTATATTTATAAATCTGGAAATTCTATTTGATCATTATCATCTTGAATTATTGTTGATCTTTAATTTCATTATGTGCCCGCCTAGCTAGCCGGTATGTATAGCTTCTCCTAGTTTCAGGGATGATTTAGGAGTTGTGTGGCAATAACTCACGCTAGATCATTGTGTATTGGTGAACGCCAGTGACTGAGTTAGGGATAGCCAGTTGCCTAGTGCTTGATCGGTAGAGCTTCATTGGTTTTGAAACATATTCCAAAAAATCCGGAGTTCCGGGAGGATCCCGCTGATAATACTGCATGAGATTGACGGATCAAAAGAATTGCCGGAGCATCTTTATAAACAATTACAGAAGTCTTAACCTGTGTCTGTTTCCATTCTGTTTTCTCTGTCGTTAATCATTTACTGCTTTCGCATATCTTTTGTTTCAGCATTTTAAAAACCCAATCAAATTAACCAACCTTTTGAAATCACTAAAAAGGCAAATTAAATCAATAGAGGTAGGCATTTCAAGACCCTGTGGATACGATAAATACTTATCACTTGCTGCTAGATTGTGTATACTTGCACAGTATTCTGGAGTTAATTTATCTCATATTTTTAACCACTTCAGAATTGCAACAAGTTTTTGGCGCCGTTGCCGGGGACTTGAAATTGTTTTATTTGATTGATTTTTTTTTTGTGTATTTTTAGTGATTTGGTGAGTGAATTTTTTTATTGTTTCTTTTTTTTTTGCAGGTGTGACTTTGGTATATGAGTGTTCCCCTTCGGATTAGATTTTAAAAAAAAAATAGTTCAAGTGAAACTCGACGAGGAATCATGTGATGCAGCAAAGTTCGCCGCTGGAGCAAAATGGGCAGCAAAATAATCAGGCTAAGAATCCTATCCTTGTAGCAAATGATACGGACAGAGCCATTAGAGCGTATGTTTTTCAAATAATTAACGAGTTGAATCCAGTGATAGTGCGTCCAGTCATTGAGGCAACAAACTTTGAAATGAAACCGGTCATGTTTCACATGTTAGAGATGGTTGGCCAATTCCATGGTTTATCATCTGAGGACCCCCATTTACATCTTAAGTCTTTTCTAGGAGTTAGTGATTCATTTGTTATTCAGGGAGTGTCGAGAGATGCCTTTAGATTAACCCTATTTCCTTATTCCCTTAGAGATGGAGCAAAGGCGTGGTTGAATTCTTTTGCTCCAGCATCGATAAGTACGTGGAATGAGCTAGTAGAGAAATTTCTTAGTAAGTATTTTCCACCAACTAGGAGTGCCAAGTTGAGGAGTGAGATAGTGAGATTTAGGCAAAATGAGGAAGAAACTTTTAGTGAGGCTTGGGAAAGGTTTAAGGAGCTTTTGCGAAAGTGTCCCTACCACTGTTTACTACATTGTATTCAAATAGAAATATTTTACAATGGGTTAAACATAGCAACCCAGTGTATGGTTGATGCTTCTGCGGGAGGGGACCTTTTGGCAAAAACTTTTAATGAGGCATATGAGATTTTAGAGAGAATATCAACCTACAGTTGTCAGTGGTCAGATGTTAGAGGCTCTAGTAAGAAAGTTAAGAGTGTGATAGAAGTTAATGGTGTGTCTACCATTAGGGCCGATATTGCAATGTTAGCTAACGCTCTTAAAAACATAATTGTGGTAAGCAATGTTCAGCAACCGCCAGTGGTGGAATCTGCTGCAGTTGTAAATCAAGTTACAGAAGAATCATGTGTTTATTGTGATGAAGAGCATAACTATGAGTTTTGTCCTAACAATCCAGCTTCTGTGTTTTTTGCAGGTAATCAAAGGAATAACCTTTATTCTAACTTTTATAATCCAGGTTGGCGCAACCACCCCAAGTTTGCGTGGGGAGGGCAAGGGAGCAATTCGCAAGTCCCCCAAGCACAACAAAAGGTGGTGAACCAGTTCGGATTTGCTAAATCACAGGCATTGCCCCAGCAAAATAAGCAGGCTTTGCCCCAGCAAAATTCGGGTAATTCTCTGGAGTCAATGATGAAGGATTATATGGCTCGTAATGATGTCATAATCCAAAGTCAGCAGGCTTCATTGAGAGTCCTAGAGTTTCAGGTGGGCCAACTAGCTAATGAGCTGAAGGCACGACCTCAAGGGAACATTCCTTCAGATATTGAACACCCTATAAGGGAAGGTAAGAAGCAGGTGCAGGCAGTGACTTTAAGGAGTGGTAAGCCACTAGAAGATAGAAAAGAGCCTAGTAAACCCCAGGAAGTAGAAAAGAGTAGTGATAGTAATGTTGTCGAAAAAGAATTGGGGTCTGGTCAATATGATGGAGGCAGCAGCAAAGATGCTGGAGCAATTAGTTCTGTTCCAGATGTAGAACCCCCACCTTATGTACCGTCCCCACCCTATGACCCACCCTTACCTTTTCCACAAAGGCAGAAGTCTAAGAACCAAGATGGTAGTCCATTTTTGGCAACTGGTAGATCATTGATGGATGTCCAACAAGGGGAGTTTACAACGAGGGTGCATGACCAAAAGGTGAAGTTTAATATGTTTGATGCAATGAAATATCCTAATGATCTTGAGGATTGCTCGTGCATTTAGGTGTTGGATGAGTTTGTTGAGGACCACTTTGAGAAGGAATTGATGGAGTACCATACCCAAAAATTTGGAGAAATCCAAATTGAGGATTTGGAAATAGGTGGATTGGAGCATGAGTATAAAGATACAGGTGAGATTTCTAGTTTTAAGAGGAGTTTGGAATCCTTAGAGCCAATAGATGAGAAATCCAAGCCTATTGAACCTTGTAATTCATTGATATTGCTCCAGCAACCTGAGATTAGGAAATTCTTCATTGATGAGAGGTTATTTACTGTAGCTCATATTAAGGTAGTGAAAACACCTTGGTATTTGATTGTGGAAATTTGCCTCCTGGTTTATCAAAAGAACAAATGAAAGAATTTTTCCATGAGGTAAAGTTTTATTTATCAAACGATGCATCTATGGTTAGACAATGTGTTGATGATGGCTGTGAGTCTAAAGTAAATTTGATTTCTGTTTAGATTTAATTTCAGTTTGAATTTTTAATTTCTGTTTAGATTAGATTTTTAATAATATATCTTCCTGATTTAATTCTGAAATATTCTTCTTTGAAGTTCCTGGCAGATTAGGGGAGCGCAGGTTTTGAGGGAGCAAAAATTTCAGCATTCTAATCAGAAGCTCCCATTATTTGATCTCGTTTTTTTATGTTAATTTTGATTTATTGTCTGTTTTGATATTATTTTGATTTGTTTTGATTTTGATTTGATTTGATTTTTATTTATTATTTATTTATTTTTATTTTTATTTTCTTGGTTAGTTTAGATTTGATTTTGAAGAAATTTTCAAAAGATTTTTCCAGATTTAAATAAAAAACAATATATCTTGTGGATGTTATTTAAAAAAAAAGATTTGATTTCATAGTTTTGTTGAGAAGATCAAAGATTTTATTCGGTTAAGATTTTTTGTGAGATAAGATTATAATTTTACCGTTGAGATTTTATTGTGTGGGCATGTAGTTAATTACCAAAGATGTCATGTGTTGAGCAGAAGGAAGCTGACGTTATGGTTGTTACACACAGAGGGAACACAGTCAATGTAAGATCTTACCGTTTGACAGATAATCAAAATTTTCTATGAATCCATGAAGTTAAAACGGTAACTTAAATTAATTAAGAGATAATTAGGGGCTAATTATTTGTTGAAGATCTTTGAGTTAGTGTCCTACTTATACGATCTCCCATCAGGTACGTTTTTCACTCTTATCTTTTATTACTACT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mRNA sequence

ATGAGTCACGACGGACTCGGAACTGCCTTCATCTGCCCAGAAATACGGTCGCATTTGGTTTTTGCCTTGCCAGAAATGCAACACAAGGATGCATATCATGCTTCACACAAGCACTTCAACGATCACAACACAACAGTTACAGTTCATGCTCATCACAAGCAACAAACAAATACATGCTTGATAAGTGATAACTGTCCGAAAGGTGTGACTTTGGTATATGAGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAGTCACGACGGACTCGGAACTGCCTTCATCTGCCCAGAAATACGGTCGCATTTGGTTTTTGCCTTGCCAGAAATGCAACACAAGGATGCATATCATGCTTCACACAAGCACTTCAACGATCACAACACAACAGTTACAGTTCATGCTCATCACAAGCAACAAACAAATACATGCTTGATAAGTGATAACTGTCCGAAAGGTGTGACTTTGGTATATGAGTAA

Protein sequence

MSHDGLGTAFICPEIRSHLVFALPEMQHKDAYHASHKHFNDHNTTVTVHAHHKQQTNTCLISDNCPKGVTLVYE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg024578.1Spg024578.1mRNA