Spg024542 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
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Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTCAGGTAAAGGTTGAAGGTAGTGTTGGAATATCTGTTTTGATTGAGTTATGCTATGTCTAATGTTTTGAATTCTCAAGGGAAGGTTGGTTAGTATTGCTCGGGACGTTCAATAGTTCAAGTTTGGGGGTATGATAGCTCTCCAAAAGGGAGTTATTTAGGCCTTATTTCTATAGTGTTTTGTGTGTCATCTGTGTTAAGTAGGGTTGCTTTTAGATGAATATTAGATGTTTTAACCTATTTGGAAGAATAGATGCTTTGGAAGTTATTTTGTGCAGGAAATAATGTTGAGCGACTTGAGGGAGAAAAATCTATGATCCAGCAAAGCACGGAGCAAAACTGCCGCGTGAGCCGCACGTGATTCATTAAATGAGGTGGCGTTAGCTGAATTAATCTCAGATCTAGGAAGCTTGGAGAGCCCTCCACGTGTAAAATTTGACCTAATTAGGGTTTACTCCACTCTATAAAAGGAAGTAGTCGTCTCAAGTCCAAAACATTCCAAATTCGAGAAAGGAAAGTCCTATTCCATTCGTAGAGGCTTACTTTCCATCTTTGAAAGTCGAATAAAGGAGGAACGATTGGAGACCTCAAGAAGACCATTAGCTACAGATTTCTTCAAGGGAATTAATCTTTTCTTGTAATTTCTTGTAGTTATGGATGCACATACTCAGATTGTGGCATGTGTTACCTTGTACATCATGAACTAAATTTGCTTAGGTGTTGGTTAGGATCTACGTAGTTGCCATGCTTATTACTCTATGCAATATAAATTGATTTGAGCATCTTGATTATTTGTTGTGCCTATTTCTATTTTGTGCCCGCCTGGCTAGTCGGTATGAATATCACTTCTTAGTTTCAGGGATGATTTGAGAAGTGTGTGGCAATTAATCACATTAGACCATTATGTGTTGGTGGACACCAGTGACTGAGTTAGGGATAACCAGTTGCCTAGTGCTTGATCGGTAGCACGTCATTGGAGTTGAAACACATTCCAAAAAATCCAAAGTTCTGGGAGGATCCTACTGATAAGACTGCAAGAGAATTGCCTAATTAATATTATTTCTAGAATATCTTTTAAAACAATTACAGAAATCCTGACCAACGCCTGTTTCCAATCTGTCTGCTTTATCCGTTTACTTTCTACTCTGTTATTTCTTTTGCTTCAGCATTTTATCAAAACCAATCATTTTAACAATCTTGAAACCATTAAAAAGTTACATAAAATAGGTAGAGTGGAAGCCATTCAAAACCTCGTGGATACAATAAATTACTTATCACTTGCTGCTGATTGTGTATACTTGTATAGTATTCTAGAGCTTATTTTTATCATATCTTTACCCCACTCTAGAAGGCAACAGCTACCTACCAGCACCTATTTCGTGGCTCCTCAACCACTCCCCACACTATATAGGCTCGTGATTCGAAGTCAAATCCAAGCAGAACTCATTGGGAAGAAGAGGGTGGTGACAGAACCCTAGTTAATGCCCATGAGTAAGAATGCTCGAGGTCCTTCTTAGATGACTAAATTCTAACCTTAGTTAGACATCAAACCTTAGTGTTTGTAGGGATTTTCACCCTATTCCCATTTGTAAAGGAGAGTAGAGTGTCGAGCGAACTCTAGAAGGATTGGATAAAAGAAAAAAACTCTAGTATTTAGCTACTGCCCATTATTTCTGGCACTTGTCACTTTTCATTCATTTGTATTCTTTATATTTTATTTCAATGGAAAGTTGTTCATTTGCACTTTATCCCATCATGCTTAGCTAAATCCCCCTATGGGGTTCAATATAGTGAATTCCCTTATGGTTCAATAGCTTGAAAGTGTTTATTTGCTTAAGTAGTATTCAATGCATGTCATTCTTTATTGATTATCATTTTGATCTTGCTGAGTTTAAATTGATCACTTAGAATTTGCATGCTATGTGAGTTTGATCTTGAAAGGGACGAACAATATCGGTTCCCATAAAGGTGATATAGGAGAAAAGGCTAGAAATAGTGTATTCGGTGTTATAGGGCGAGGCTGCCTAAGGCACCCTATAACAACTATAGGGTTATAGATTGCATGCTTGCTTTATCTATGTCGGAATCGAGTCACAGAAATGTGCATAACGGTTCTTGGGAGCAAGGCCAAATAGAAGTTAAATCTGACCCAATGCATTGAATAGGCTTAAGTTGAATAAGCTATGATTAGAGTTATTTGCCTTTGGGATGAATTTATATTGAACACCTCGTTTTATTTATCATTGTTATTTCTTTACTTATTTGTTTTGTTTATTTTCCAAAAATCAATCATCAACTATTTATTTGGTTACCTATTCTAAGCAATCTTTGAACAATTTCTTCTTCAAATCTGAGTTATTTCAATTTAGAAGACATTATGTCCTTTATATAGAGTGTCATATCCCTTTTCTATTCATAATAGGTTAGGGATATATTTAATTAATTAATTACTCTTCACAATTCTAATAGGATGAGGATTCATTTAATTAATTAATATTAATTAATTAAATAAATAAAATTTAATTAATTTCATTTAAATCATATTTAGATGAATATCTCCCACATAACCTATAGTTTTAATTAAATCAAATTCAATTAAATTAAATAATTAATTAATTCTCCAATTAATTAATTACTAAATTAAATATCTCATATTTAATTTAAGCCTACAATTAAATCGTATTTAATTGTATTTCTCTCAATTAATAAAGTTTAATTAAGTTTAATTTTAAATTAAACTTTATATTATAACGTATCACATACATTATATTAATTGTATCTCATACAATTAACTTGATTTCCCATAATGGATTTTGAACTATACAAATTTCTTTCAAGAATAATTGTTCCTAATTACCCTTTATGAGCTAGCAGGGGGACCTAATGGACCTATAGATCAGAAGCTCCAATGATTTGAGGTTAAATGACTAAACTCATTAATCAGTTTAACCAATGTTCATTAACTGCGGGTCACTCCACTAAAGACGCACAGCTGCACTCTTCTCACTGCAGATTATTTCTGTGTCCATGGATATAGACCAATAACGGTAAGTCAATCCTTCACGAGTGTTCATTACGCCAGCTTGGTCAAATTACCATTTTACCCTTGGGTTACCTCTGTCTCCTTAAGTACCACTAGTTCCTCTAATGAACAACCCGTTTATGGTCTAACCAGTAAACGGAAGTTCCTCTCGGGCCAGGAGAGGATGGGCGCCTTTGTTCAAGACTGGAAATCATCCCTTAAGGGAACACTCATGTACTTGCCCTAAAGACGGGAAGGAGTGAATTCCATCTTGTGTTGTTATGTTCCCAGCCCACACTTGGTCTTATCCCTGAAATGGTAGGCTTATTGAGTCGACGAATCTGGCCACTCGCACCCATACAAATCTAAGGATAATCCCTCATGAAAAGGAGTCCATAACACACTCAGGATTAAGATTGAGTTACCTAGTGTAACGCCCCGCGTTTCGAAATCAAACCATTTTGGGAATTGTTGAGCGTTCTTATTCTAATTTAGAAAATTAGAATTTGAGTTTAGCCTTGGGTTGTTAAATTAGATCTCTATAATATAGGGAGAAGATATTTTTATTAAATCTTTCACTCTCTAATTTTGGAGTTTAGTTTTCATATAGTTTCCCTAAGTTAAAGGAGTAACCCAAATATTATTTTAATTAGATTTCTTTTTCCAAATCCTTGGATTCCTTAATTTGATTGCAATTTTGGTTAAGAGAAATATTGGAAGTTTAGAGAGCCCTAGATTTTCCCCTCCTTTTATTTTTAGTTTTTTCTAATTGGGGAAAATTTAAAGAAACCCTAGAGCTCATATTTTTTTCCCTCTTTCCATTATGCTGCCGCCAGACCCCCCCCCCTCTGAAATTCGTTCTTCTCTTTACGCCGCTCACCCCCCCCCCCCCCCAATCGCCTTCTTCTTCTCCTCACGCATCAATCGCCTAACCCCCTTTTGTCGTTCTCTCCTTCGTGCAAGCAAGGTGTTGTCGCCGCTCTTCGGTCTCCTCCCTCTCTCGTGTTCCCGGTGCTGCCATCTCTCTCTCTCCTGTTTTCTCCTCCTCCGACGAGACCTACGCGAGCAATAAGTCCGACGGACGATTCTTCTTTGGCCAGCCTTCCTCGTGTGCGAGCGACGTCGAGTCTTCCTCCTTCCCTGAGACCCACAGCGTAAGTTCTCTCTCTCTGTCGTGTTTCAGCCAGTAGCGAGCAGACCCACGCGAATCTCTTCCTAGCTCTCGTTCTTCCATTTTTTTAGCACTAGCAGCAAGAGATCCACAAGATTGTGGGTTTCTAGTGGTCGATTTGTGAAGCCCAGGCGCTTTCACGTCGTTTAGCTGCCCTCTCTCTCGGTCCAGCGAGTCTCACTCTGTTTTCAACCCTCCTATGTCATTTGTTCGACGTTCTGGTAAGCTTTCACTTGAGCCTGCACTCTTTAGAGTTCAAAATTGAGTTACCCATAACTCAAATGGCCTTGTTATGATTTACCCATGCTTATTCGACTTCAAATCAAGATTATCCACTCCTTAACAACTCCAAATATGCAGGATTCAACTTTGTTGCACACCAATCAGCGAGCTATTGAGCTCATAGTTTGTTTTCGGCAATTACTCATAAGTTGAAAGGTCTCAAATCGGATTACCCATAGCTCGTTAACTTGGGTTTTGGGTAGTTAAGTAAGTTTCAGCATGCCTTATACCTGTTCGAACTCATTAAAAAGTATTTTAAGGTCTGATAAATCGATCCCTAATGAATGGAAGTTTCCCATTTGTAGGTTCGGACTCATTTGATCGCTTCTAGCATGGATCGAAGTCCTTTTTGGTAAGGAGCAGTTAAGAGAGCTTTGTTTAAACCCTTTCAAGCTAGTCTTGTGTGTTGTGAATTAGTTTCTAACCCTTGGAAACTTTGCTTATAGTTTGGGTTTGCTTTCAGATTGTTCCAAATCCTAGCTTAGGCCTCTTACTGGGTAAGAACATCTCTTCTAGGCCCTTTTCGCCTTAGTTTAAGGTTTAACAAGTGAATTTTAGCCTTGAAACCATTTCATTTCCTATTGTAGGAGCTCGTTAGGTTCACTTAGGATCGTTTTAGCAATTGGTAAGTGGAATTCTACTTGTTGAGTCTGGTTGCTTGTGTACTCATATGTTATGTGCTCTGCTCCTTGGTTTTATTGTATGTTGTATACATATATGTGTGTGTATGTTGCTTTTTCATTGACAAGTTTTGAGAATCTTGAAATCGATGTATTGAATTGTTATGTTGAATCATTTTGAGATGTTGTGACTGGAATTTAATGTGAAAAGTATGTTGTTTCATGGTGATTTTCTGATAGACATGAATTTAATGTAGAGAACATGTTGTTTGGTTGATACATGGACTAAAAGCATGACATGAGTTAGAAAGCATGTATGGAATATGCATTTTGGGTCGTGGGCATGTCATTGGCATAAACATAGTCTAGAAGCATGATGAGTAGGATTCATGCATTCTAGTGAGATTGTGAGGTCAGAGGGCCTTGTGTGTTGAAAAGGAAAGCTAGGTGAATGCCAGGTGCCTCGGGTAAAAATGGTCGAGGGGTGGTATGTCACCAATGGATTAAGAGGAGCATCGGGTGCCTTGGGTAATATGGCCAAGGGGGATGTGATGAGTCTATACGTTGTGAAAGTCATCGGGTGCCTTGGGTAATATGGCCAAGGGGCGATGCACAGTTTGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGCTGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTGGTCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGACAGTGCGGCTCGGAGGGTCAGTCTTGGAGAGCTTTGATAGAATTCAGAGGAGTTTAGAGGATTCAGAGGAGTCAGATAGAGCTTGTTAGAGCTTGAGTTAGTGGTTATGGATATATGTCACATGAGTATGTTGCTTGATGTATGGTTTAATGCATGGTGTATGTGTTAATTATTTTCCATGTATATTGAGCTTGTGTGTGGAAAACACGATATCTGCCTTGTATGCGTATGTGATTGATGGCTCTGCAGGTGTGAGCCACTTACTTAGTTCCATGGCTTTTGTACTGATCCACCCCTAGGTTTTGCAGGTGATGAGCACATTCAAACTTGGTGATGAAAATGAGGCTTGAATGAAAGACCATTAGTTAGCTCGTTTCCTTGATTTACTTTCGTGCTTAGAGTTTGGTTGGGTTTTGTTATACCGAAAACGGAAGTAGTTGTCGATTATTTTGTGGGCTCTTGTAATAGACTTAAGAGTTTAATTTCTTTTATTTGGGATGTGTTCGTTTTATTAATTATACTTGTTACGAGATCTGACTCGTAATATATCTGCTTGAGAGTTGGAGTTAGTTCTTATGTTACTGAGTATGTTTGGGATGTATGTTGTCAAGTGAAGTTGAAGATATATGAGTAAGAAGTGTCTTTCAGGTTTTCAGGTGTTTAAAATTTTTGGTTAGTTAAAGTTACGTCGTTATGCTGCCGAAATTTTTGGGGCATCAAGTTGGCGTTAGTGTAATAATTTAGTAATGTTCCCTAGTTTAGATTGAATTTTGGGGGCCTTACACCTAGGTCATCCTATTGAAATAGAAACCTAACTAGTCAACGGTGTTACATCTAGTGGTTACTATTTTGCAGTCCGGTCTTATGCCAACTCATTGCATAGGATACCCCCACTCGCATGTCCACTACATGAACGCGTTGGATCAATGTGTTTGTATCAAATGCAAAGTGGGTCGTGTTGGGTTTAATGTCCTATAAACTCGTAGTTTGTAAATCGTTAAACATATTTCTATTTCCAATAAAGTCGTTATTGAAGTTATTCAGTAAAAGATGTTATTAAATATGTAAATTGCAAATGATTAACCTAAATCCAATAAACTAAGATCCTTGACTATAAAATGAATACTCGAACTATATGTATGGACATATCGTAGGATCAAGTTCAAGTTTATAGTCAAAATAGTCTATAGTATAAGGATACGGTTGGGTACCTTATCCTAGTAACACTATGGACGCGGCCCACTTTGTATTAAGTACAAACGATGAGATCCTAAGTCGTTCATGTGGAGACATGCGAGTGGGGGCGTCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACTGGACCACGAAATAAGTCACTTTCTCTTTATAACGCCGTTTACTGAAGAAACTGACTATTTCTCATAGATGACCTAGGTAACTCGTTCTTAATCCTGAGCTATCTATGAACTCCTGTTTATGCGAGATTATCCTTTGATCTGCATGGGTGAGAGTGGCCAGCATCGCCGACTCAACAAGCCTACCATTTTGGGGATAAGATCAAATAGATAGCTGGGGACATAGTTTTGCAAGACGGAATTCACTCCTACCCTTTTCAGGGATAGCAGAGAGGTTGTTCTCTTAAGTACTAACTCTGGGACTTGAACAAGGGGCCCCCACCCTCTCGTTGGATCGAGAGGGACTTAGGTTTGATGGTTGGACCACAAACCGATTGTTCATTAGAGGATTAGTGGAACTTAAGGAACAAGAAGTACTATAGGGGTGAAACGGTTATTTGACCTAGCTATAGCTACGAACAACCTGTGAAGGAACGACTTACTAAACATGGTTAAATCAAGTGGACGGAAATATATCTATAGTGAGGGGAGTGCAACTATCGGGCTATAGTGGAGTGTCCCGGTAGTTAACGAATGTTGGCTAGCTTTGATAATGAGATTAGTCGGTTAGTCTCGAATCGTTGGAGCCCATGATCTATAGGTCCATTAGGTCCCTCTACTAGCTCATATCGGATTAAAGCTTAGAACATAATGATAGGTATCTTTGAATCGTTCAAAAACGGGAAATAGGGCTTTATCGTAAAAAGTGTTTGACACAATGATTTAATTATGAATTAAATTAGAAATTGAGAGATAAGATATTTAAAAGTGTTTTAAATACTATATATATGTATTAGGAATCATATATAATTCATGGCACTAGGTGATAATGATTAATTGGATTAATCATGTCAAAATTACTTGGAATTGTCCCAATTAATTGCCTAGAAATCAATTTCAATTTTGAATTGAAATTGGAATGAATTGCAAGCTGAAAATTCAGAATTAAGATTCAAATTTTAGTGGATTTAGTTGCATTCCCACTCTTGCATGATGATGCATAGTGGAAAACAACACAACCATGCACTAGTTGCATGTGTTGTGAGTTAAACACCTAGAATCCACTTTGAGTTGCATTTTCACCATGTGTCTAGTGTCATGAAGCTTGTCTTTGCATGGAAGAGGTCTATTTAAGAGCTTGAATCAGATTCAAAGACAAGAGAGAGTGATTTTCTTAAGGTTATGCTGCTGGAATTTTCTCTCAATCTCATTCACCTCCATAGATCTCTCAAGAGCTTGAACCTTCAAGCATTCCCTTCCCTTTCCTTATCACTATAGACTCCCACAAGTCATTCTAGGCAAGGAGAATAGTAGAGAAGACACTAAAGGTTGTCCAAGAGAAGTTGGAGAAGGAAAACACCACAAGGAGTTCCTCTCAAGTGAGCTACAAAGAGGTTGGTACTCCTTTACTTTCTGTTATGTTTTTCCAGAACATGCATGCTTTAGATACAAAATTGAATGTCTTAAGTGCTTTCGATCTTCAATTGCTTCCGCATGTGTAATATGTACACCTTCAATTGGTATCCGAGCATGATTAGAGCACTTAATTCGTTTTAATTTTGCTGTGGTGGGTACCATTTTGAAATTGAATTTTCTGTGTGCTAAAATGGAAGTGTTCTGGTTTGGCAATTTTTTGAGCTTTCAAACCTTCATGAAATTGTAATTGCTCGGATATGTAAGAGCGTTAATGTGTGTACTAGAGTCTGTAATTTTTATAGAGTCATTAGAGTCCATATAGGCTGTAAAATCGAAGAAAAACTGGAGATGACGCAGCAGAAAAGGAAAATTCCAGCAGCAGTTTTTTTTTTCTTTTTCTTTTCCAGTCCAATTCGGTTCAGCTGCTTTTGTTGGGGTCCGGTTCGGTCTGCTGCAGCTTATTTACACACTTTTGAAGGCCGGTTCACTCCATGGAGGGTTGGTTCGGGTCGGTTCGTGAAGCTCGGGATTGCTACAAGCTTTTATTTATTAATTATTATTGTAATAATTAGTTAAAGTGCTTGTTTTAAATTGCCAAACCATTCCATTTTAGTCTTGATTTAATTTCTTTTATGCATGGAGAATGTATGGTTTAATTAGATTAAATGTATGTGCATTATGAGTATGCCATATAGATTAAAATCCCACCATAGGAAAGCATATTCATGCATTTTTAATAAGTGTTATTAAATGTTCAAATGCATGAGGGAAATTTCATGTTTAATTGATATAAGTGTTATATTGATTTAGGGCGATTCATGCTTGAATGGTTAATTAAAATTGGTTAATTGATATAAAAGTTATATTAATTAAAAGATAAAGTAACCTAGCATGAAGCATGAAATTTCATTAGTGTTTGTTTATAAAGAGTTATATTCAAATGGGGAAGCATGTTATAGATTAGATTTATAAATGTTATAAATCACTTAGAAATCTAAAATCTATAACAAAGAAAAGGTGCATGCTCACTTAGGGTTAAATTATATCCAACTCTCGATCGATTTCAATTAGATTCAAATAGGTCGATAAGCTTGTAAAACATAGGTTACAAGAGAACTCACCCGACGAGATGCTGTCTAAGGCTGGAGGTATTTAAGTTGACGGTTTACGGAACACCTCCTACCTGGGCATCAAGTCGGTTCTTGAGTTAAAGTTAACCCATTTTTATGAGCATGCACGTGTGTGATGTGAGGTTTTAATCGTTATCACCTAGACATCGTAAGATTAAATGAACTTAGACTTAGGGTCATTCAATTAGCCGGAATTCGCCTAAGTATAAGTATACCCAAAACCGTTTAAAATACTTAGTGGGAGGGGAGAGATATATCAAATCCATTTCCTTCTCACGTTCTCCTTTTAGTTCACAACGTGAGATTTATGCTTGGCCTCGTGTTGATTATACCTCAACTGCTCCATTCGGAAGGTGTTTGCATAAATCAATAACAAGGTGAATGGAGAAAGTATTTATAGTAAGTGAGTGAAGGAAGTGTGTCAACACATCCTGCAGTCTCCTCCGTTAGGTTGCACCGTGAGATTTCCATGTTGCGCCTGCTTGTATGCCCTGGAGCTACTAACCATTCGGAGGGTTGTAACATGGAGATCGAAACAACGCAAACTCCTGAGACGGATAGGATTACTTAG ATGTTTTTCCAGAACATGCATGCTTTAGATACAAAATTGAATGTCTTAAGTGCTTTCGATCTTCAATTGCTTCCGCATGTTCCAATTCGGTTCAGCTGCTTTTGTTGGGGTCCGGTTCGGTCTGCTGCAGCTTATTTACACACTTTTGAAGGCCGGTTCACTCCATGGAGGGTTGGTTCGGGTCGGTTACAAGAGAACTCACCCGACGAGATGCTGTCTAAGGCTGGAGTCTCCTCCGTTAGGTTGCACCGTGAGATTTCCATGTTGCGCCTGCTTGTATGCCCTGGAGCTACTAACCATTCGGAGGGTTGTAACATGGAGATCGAAACAACGCAAACTCCTGAGACGGATAGGATTACTTAG ATGTTTTTCCAGAACATGCATGCTTTAGATACAAAATTGAATGTCTTAAGTGCTTTCGATCTTCAATTGCTTCCGCATGTTCCAATTCGGTTCAGCTGCTTTTGTTGGGGTCCGGTTCGGTCTGCTGCAGCTTATTTACACACTTTTGAAGGCCGGTTCACTCCATGGAGGGTTGGTTCGGGTCGGTTACAAGAGAACTCACCCGACGAGATGCTGTCTAAGGCTGGAGTCTCCTCCGTTAGGTTGCACCGTGAGATTTCCATGTTGCGCCTGCTTGTATGCCCTGGAGCTACTAACCATTCGGAGGGTTGTAACATGGAGATCGAAACAACGCAAACTCCTGAGACGGATAGGATTACTTAG MFFQNMHALDTKLNVLSAFDLQLLPHVPIRFSCFCWGPVRSAAAYLHTFEGRFTPWRVGSGRLQENSPDEMLSKAGVSSVRLHREISMLRLLVCPGATNHSEGCNMEIETTQTPETDRIT Homology
BLAST of Spg024542 vs. NCBI nr
Match: KAA0055183.1 (gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK25777.1 gag/pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 2.6e-05 Identity = 27/43 (62.79%), Postives = 34/43 (79.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg024542 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DQ34 (Gag/pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold640G00130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 1.3e-05 Identity = 27/43 (62.79%), Postives = 34/43 (79.07%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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