Spg024014 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview


Name	Spg024014
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1
Location	scaffold13: 5692128 .. 5719961 (-)
RNA-Seq Expression	Spg024014
Synteny	Spg024014

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDS

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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

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Protein sequence

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Homology

[Close]

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Query: 1   MEVLSRCASSSSSLRLAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRER 60
           ME LSRCASSSSS  LAFFNVH QHT S RATVKS VLPWN  VVG GRSTSLG DGR R
Sbjct: 3   MEFLSRCASSSSSPCLAFFNVHLQHTISCRATVKSQVLPWNFPVVGFGRSTSLGTDGRGR 62

Query: 61  IWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------QQ 120
           IWGC+CG NR LLLRQLWRYHSSLS AS + SV Y                       + 
Sbjct: 63  IWGCSCGTNRGLLLRQLWRYHSSLSSASGMSSVCYRYVLKWKKYAGNFRRVRNAMEKFRH 122

Query: 121 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPS-------------------------------- 141
           RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTF D+PS                                
Sbjct: 123 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFEDSPSWALTEENLLFLEAWRTIDRAYIDKNFNGQSWF 182

[Close]

BLAST of Spg024014 vs. NCBI nr
Match: KAG6593798.1 (Carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 182.2 bits (461), Expect = 3.4e-42
Identity = 114/213 (53.52%), Postives = 118/213 (55.40%), Query Frame = 0


Query: 1   MEVLSRCASSSSSLRLAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRER 60
           ME LSRCASSSSS   AFFNVH QHT S RATVKS VL WNS VVG GRSTSLG DGR R
Sbjct: 3   MEFLSRCASSSSSPCFAFFNVHLQHTISCRATVKSQVLAWNSPVVGFGRSTSLGTDGRGR 62

Query: 61  IWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------QQ 120
           IWGC+CG NR LLLRQLWRYHSSLS AS + SV Y                       + 
Sbjct: 63  IWGCSCGTNRGLLLRQLWRYHSSLSSASGMSSVCYRYVFKWKKYAVNFRRVRNAMEKFRH 122

Query: 121 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPS-------------------------------- 141
           RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTF D+PS                                
Sbjct: 123 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFEDSPSWALTEENLLFLEAWRTIDRAYIDKNFNGQSWF 182

[Close]

BLAST of Spg024014 vs. NCBI nr
Match: XP_023514398.1 (carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 181.4 bits (459), Expect = 5.7e-42
Identity = 114/214 (53.27%), Postives = 119/214 (55.61%), Query Frame = 0


Query: 1   MEVLSRCASSSSSLR-LAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRE 60
           ME LSRCASSSSS    AFFNVH QHT S RATVKS VLPWNS VVG GRSTSLG DGR 
Sbjct: 3   MEFLSRCASSSSSSPCFAFFNVHLQHTISCRATVKSQVLPWNSPVVGFGRSTSLGTDGRG 62

Query: 61  RIWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------Q 120
           RIWGC CGPNR LLLR+LWRYHSSLS +S + SV Y                       +
Sbjct: 63  RIWGCTCGPNRGLLLRKLWRYHSSLSSSSGMSSVCYRYVFKWKKYAGNFRRVRNAMEKSR 122

Query: 121 QRFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPS------------------------------- 141
            RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTF D+PS                               
Sbjct: 123 HRFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFEDSPSWALTEENLLFLEAWRTIDRAYIDKNFNGQSW 182

[Close]

BLAST of Spg024014 vs. NCBI nr
Match: XP_022964278.1 (carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 180.6 bits (457), Expect = 9.8e-42
Identity = 113/213 (53.05%), Postives = 118/213 (55.40%), Query Frame = 0


Query: 1   MEVLSRCASSSSSLRLAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRER 60
           ME LSRCASSSSS   AFFNVH QHT S RATVKS VL WNS VVG GRSTSLG DGR R
Sbjct: 3   MEFLSRCASSSSSPCFAFFNVHLQHTISCRATVKSQVLAWNSPVVGFGRSTSLGTDGRGR 62

Query: 61  IWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------QQ 120
           IWGC+CG NR LLLR+LWRYHSSLS AS + SV Y                       + 
Sbjct: 63  IWGCSCGTNRGLLLRKLWRYHSSLSSASGMSSVCYRYVFKWKKYAVNFRRVRNAMEKFRH 122

Query: 121 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPS-------------------------------- 141
           RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTF D+PS                                
Sbjct: 123 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFEDSPSWALTEENLLFLEAWRTIDRAYIDKNFNGQSWF 182

[Close]

BLAST of Spg024014 vs. NCBI nr
Match: XP_023000490.1 (carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 177.9 bits (450), Expect = 6.4e-41
Identity = 114/213 (53.52%), Postives = 118/213 (55.40%), Query Frame = 0


Query: 1   MEVLSRCASSSSSLRLAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRER 60
           ME LSRCASSSSS  LAFFNVH QHT S RATVK  VLPWN  VVG GRSTSLG DGR R
Sbjct: 3   MEFLSRCASSSSSPCLAFFNVHLQHTISCRATVK--VLPWNFPVVGFGRSTSLGTDGRGR 62

Query: 61  IWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------QQ 120
           IWGC+CG NR LLLRQLWRYHSSLS AS + SV Y                       + 
Sbjct: 63  IWGCSCGTNRGLLLRQLWRYHSSLSSASGMSSVCYRYVLKWKKYAGNFRRVRNAMEKFRH 122

Query: 121 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPS-------------------------------- 141
           RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTF D+PS                                
Sbjct: 123 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFEDSPSWALTEENLLFLEAWRTIDRAYIDKNFNGQSWF 182

[Close]

BLAST of Spg024014 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KK55 (carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111494745 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 184.5 bits (467), Expect = 3.3e-43
Identity = 115/213 (53.99%), Postives = 119/213 (55.87%), Query Frame = 0


Query: 1   MEVLSRCASSSSSLRLAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRER 60
           ME LSRCASSSSS  LAFFNVH QHT S RATVKS VLPWN  VVG GRSTSLG DGR R
Sbjct: 3   MEFLSRCASSSSSPCLAFFNVHLQHTISCRATVKSQVLPWNFPVVGFGRSTSLGTDGRGR 62

Query: 61  IWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------QQ 120
           IWGC+CG NR LLLRQLWRYHSSLS AS + SV Y                       + 
Sbjct: 63  IWGCSCGTNRGLLLRQLWRYHSSLSSASGMSSVCYRYVLKWKKYAGNFRRVRNAMEKFRH 122

Query: 121 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPS-------------------------------- 141
           RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTF D+PS                                
Sbjct: 123 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFEDSPSWALTEENLLFLEAWRTIDRAYIDKNFNGQSWF 182

[Close]

BLAST of Spg024014 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HKC2 (carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464342 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 180.6 bits (457), Expect = 4.7e-42
Identity = 113/213 (53.05%), Postives = 118/213 (55.40%), Query Frame = 0


Query: 1   MEVLSRCASSSSSLRLAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRER 60
           ME LSRCASSSSS   AFFNVH QHT S RATVKS VL WNS VVG GRSTSLG DGR R
Sbjct: 3   MEFLSRCASSSSSPCFAFFNVHLQHTISCRATVKSQVLAWNSPVVGFGRSTSLGTDGRGR 62

Query: 61  IWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------QQ 120
           IWGC+CG NR LLLR+LWRYHSSLS AS + SV Y                       + 
Sbjct: 63  IWGCSCGTNRGLLLRKLWRYHSSLSSASGMSSVCYRYVFKWKKYAVNFRRVRNAMEKFRH 122

Query: 121 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPS-------------------------------- 141
           RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTF D+PS                                
Sbjct: 123 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFEDSPSWALTEENLLFLEAWRTIDRAYIDKNFNGQSWF 182

[Close]

BLAST of Spg024014 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KIH6 (carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111494745 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 177.9 bits (450), Expect = 3.1e-41
Identity = 114/213 (53.52%), Postives = 118/213 (55.40%), Query Frame = 0


Query: 1   MEVLSRCASSSSSLRLAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRER 60
           ME LSRCASSSSS  LAFFNVH QHT S RATVK  VLPWN  VVG GRSTSLG DGR R
Sbjct: 3   MEFLSRCASSSSSPCLAFFNVHLQHTISCRATVK--VLPWNFPVVGFGRSTSLGTDGRGR 62

Query: 61  IWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------QQ 120
           IWGC+CG NR LLLRQLWRYHSSLS AS + SV Y                       + 
Sbjct: 63  IWGCSCGTNRGLLLRQLWRYHSSLSSASGMSSVCYRYVLKWKKYAGNFRRVRNAMEKFRH 122

Query: 121 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPS-------------------------------- 141
           RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTF D+PS                                
Sbjct: 123 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFEDSPSWALTEENLLFLEAWRTIDRAYIDKNFNGQSWF 182

[Close]

BLAST of Spg024014 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H648 (carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460464 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 5.2e-41
Identity = 99/160 (61.88%), Postives = 110/160 (68.75%), Query Frame = 0


Query: 1   MEVLSRCASSSSSLRLAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRER 60
           ME LS CASSSSS R AFFNV HQ+T SSRATVKS VLPWN SVVGLGRST L  DGRER
Sbjct: 1   MEFLSSCASSSSSQRFAFFNVQHQNTLSSRATVKSQVLPWNFSVVGLGRSTRLSADGRER 60

Query: 61  IWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------QQ 120
           I GCNCG NRVLL RQ WRYHS L+ + DL+S++Y                       +Q
Sbjct: 61  ILGCNCGSNRVLLFRQSWRYHSCLASSFDLISLNYRYVFNRNIYQVNFRRIRSSLGKFRQ 120

Query: 121 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPSYIAIKKMLATLD 138
           RFSV+LARVMVCVMLVMSVSSTFG  PS    ++ L  L+
Sbjct: 121 RFSVKLARVMVCVMLVMSVSSTFGGTPSQALTEENLLFLE 160

[Close]

BLAST of Spg024014 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HMP7 (carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111464342 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 174.1 bits (440), Expect = 4.4e-40
Identity = 112/213 (52.58%), Postives = 117/213 (54.93%), Query Frame = 0


Query: 1   MEVLSRCASSSSSLRLAFFNVHHQHTFSSRATVKSHVLPWNSSVVGLGRSTSLGIDGRER 60
           ME LSRCASSSSS   AFFNVH QHT S RATVK  VL WNS VVG GRSTSLG DGR R
Sbjct: 3   MEFLSRCASSSSSPCFAFFNVHLQHTISCRATVK--VLAWNSPVVGFGRSTSLGTDGRGR 62

Query: 61  IWGCNCGPNRVLLLRQLWRYHSSLSFASDLMSVSY-----------------------QQ 120
           IWGC+CG NR LLLR+LWRYHSSLS AS + SV Y                       + 
Sbjct: 63  IWGCSCGTNRGLLLRKLWRYHSSLSSASGMSSVCYRYVFKWKKYAVNFRRVRNAMEKFRH 122

Query: 121 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFGDNPS-------------------------------- 141
           RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTF D+PS                                
Sbjct: 123 RFSVQLARVMVCVMLVMSVSSTFEDSPSWALTEENLLFLEAWRTIDRAYIDKNFNGQSWF 182

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spg024014 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_023000489.1	6.8e-43	53.99	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbi...	[more]
KAG6593798.1	3.4e-42	53.52	Carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argy...	[more]
XP_023514398.1	5.7e-42	53.27	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbi...	[more]
XP_022964278.1	9.8e-42	53.05	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbi...	[more]
XP_023000490.1	6.4e-41	53.52	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbi...	[more]

BLAST of Spg024014 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg024014 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1KK55	3.3e-43	53.99	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucur...	[more]
A0A6J1HKC2	4.7e-42	53.05	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucur...	[more]
A0A6J1KIH6	3.1e-41	53.52	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucur...	[more]
A0A6J1H648	5.2e-41	61.88	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucur...	[more]
A0A6J1HMP7	4.4e-40	52.58	carboxyl-terminal-processing peptidase 2, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucur...	[more]

BLAST of Spg024014 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spg024014.1	Spg024014.1	mRNA