Spg022930 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg022930
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold5: 13956194 .. 13962881 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg022930
SyntenySpg022930
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGAAGATCAAGAAGTTGGTCAGAAAGCGGCGGAGGATATTATTGCGGAAGAAGATCCGAAAGAACCAGAAGGACGGAATCAAGAGCAGTCTGAGCCAGGAGTTGCAGATACAGAGGGAGTTCGAGAAGAAAATGCAGAGGAAGTTCGAGAAGAAAATACAGAGGAAGTGTAAGAAGAACAGGCAGAGGTTGCGCCTGAAGAAGTTAGTGAGCAAGAACAGGAGGCTCGTGTGGAGGTGATTATGCCGGAAGTGCCCAAACGCCACCGTATAAAGCGAAAATCGGGCCGTGTTAAGGTAGTCCGAGCTGATACCCCCTCACCTCCAGCTACTGATTCTGAAAGAGAGAATGCTGAGAAAGAAGAGCGTAAGAAGAAGGAGGCTGAGGATAAAGCAAGAGAGGTAGCAGAGAAAATCGTGATGCCAATTTGAAGAAGGCGCTTCAGGAGAATTTTTCCAAACCATTTTCAGCCCTTCCAGCATTCCCTGAAGATTTATTGAACCCCTGGATTCCGACACCGCCTGTCGAGAGAGAAGGAGATGGAGAAGAAGATCCTGGTCAGGAGGATTGAAGAAGGGAAATTTGGGCGAGCAAACTTTTTGATGAATTAATTTTGTTGCTCGAGCATTTCTGACCACATCTTTTTCTATGTTTGCTTGAATTGTTCTGTTTCTTTTTAATTTTTCTGATGCTAAAAAAATATATCTGCTTATGTAATTTCTTTTTCTATGCTTTCAATGAAATTTCCGAAGTTATTTCTGTTCCATAAGCGTTGAGTAACTCTAACTTAACTAATTCTCTTTCTGAATTTTTGAAGCTTGGACTGGCTAAGCTTAATTAGATCAAGGTATTCTGATCTCCAGAAACCTTTTGCTTGAGCATTTTCTCTGGCCTGGTCATTGTTGCGGCAAAGAAAATTCTGGAGGTAGTGTTGACTTATGCGATCCACTTTAAGCTTAGGTCTAGTCCCACGCTTAGTTTTAAAATTCAGATAGAAAAATTTAAGTTTGGGGGGTATAATTGCAAAACTGATAATTCATTGAGGACAATGAATAATTCAAGTTTGGGGGACTTTTTGCTACTCCAATTATTTTGCTCGAGCATTCCTCTCCTTCATTAAATAATTTGTTAGGTTATTGAGTAACCGGGGACATTTGTGATACCCACAGTGTCTTCGCGTCAAAAGGTAACCTAGGAAGTGTGAAAAATGATGAAAAATTATTTGCTGAAAAAAGTGATTGTTGAAAATTTTGCTGAGAAAATTCATGGAGCAAAAGTTTTGAAGGATGAATGATAGTCCAGCAGTTTTTCTGTCTCCCAGAACTTAGGTGAGCTTCATCATAAAATGTTGCCATTCTGAGGGGCAAGAGATGGAATAACTAAGGATTTTTTAGCTTAGCAAAGAGTATTTAGCCTAATTAGTGATGAGTTGAGGCAAGGGTATACTGCACCATAAAGTGGGTCAACCCGTGCTTAAGAGCTTATGACTGTAGGGCTGCTTTAAGTCTGAAAAATGAAAATATAAACCCCTGAAATATGTGTTCAAATATGTCTGATATTAGAGCTAGGCTGTGACAAGTTCTTAGAATTGAGTTAAAAGTGGTGATTATTTGTCCATGCCGGAAGAATTATTTTGCTGAAGCAGAGCTTGGTTTTGCAGAATGCTCAGGTAAAGGTTGAAGGTGGTGATGGATTATTTGTTTTGATTAAGCTATGCTTTGTCTAACGTTTTGAATTCTTGAAGGGAAGGTTGGTTAGGTTAGTATTGCTCGGGACGTGCAATAGTTCAAGTTTGGGGGTGTGATAACTGCCCAAAAGGTAGTTATTTAGGCCTCATTTCTATCATGATTTGTGTGTCTTTTTGTGCTTAATAGGGTTGCTTTTAGAGAGATATTATATGTTTTAACCCATTTGGAAGAATGGAAGCTTTGGAGATTATTTTGTGCAGAATATGTTGCTGGGCGACCCGAGGGAGCAAACTCTGTGTTGGAGCAAAGCTGGGAGTGAAAACTGCCACGTCACAGCTCGTTAGCCAATTTAATGAATCGAATTCTGTTGAGTTATTTTCGGGATAAAGGAGCAAGGAGAGCCATCCACGTGTCTAAGTCAACCTAATTCAAGCCTTCCTCAACTCTATAAAAGGAAGTAGCCGCCCAAGTCAAAGTCATTCCACTTTTGGGAGAAAACATTCCATTCTTGGGAAGTTCCTTCCACCTTTGGGAGCCGAATAGAGGAGAGAGATTGGTGACCACCTAGAAGACCATCATTGCAAGCTGATCGAGGAGATTAGCATTTCCTTTTATTATCTTGTAATTATGGACATGCCTACTCAGATTGTAGCGTGCGTCTCCATGCATATTATGAACTAAGTAGCTTAGGCGTTGGTTAGGATACATGTAATTGTCGTGCTTAATTTCTAGTAATAAATATTGATTCTATGCATCTTGATTAATTGTTGTGTTCATTTCTATTTTATGCCCGCTTGGCCAGCCGGTATGAATACCTCTCTCTAGTTTCAGGGATGATTTAAAGAGTGTGTGGCAATTAATCACACTACGATCATTGTGTATTGGTGAACGCCAGTGACTGAGCTAGGGATAGCCAGTTGCCTAGTGCTTGATCGGTCGTACTTCATTGGGGTTGAAACACATTCCAAAAAATCCGGAGTTCCGGGAGGAATCCGCTAATAATACTGCGAGAGTTTGCATGATCAATAATATTGCTAGAGCATCTTTTAAAACAATTACTAAATCCTGACCAGCGTCTGTTTCTAATCTGTCTGTCTATCCACTTACTTTCTGTTCTGTCATTTCTTTTACTTCAGCATTATTCTTATAAAAACCAATCATTTTTACCATCTTTGAAACCATTAAAGAATTATACAAAATAGATAAAGTGGAAGCTAGTTCAGGCCTTGGATTGATAATACTTATTACTTGCTGCTGACTGTGTATACTTGCACAGAGTTCTGGAGTCCTTTTATATACTATATTTTTACTCACTCTAGGAACCCAACACTCGCCTAGGTGGAGCCACTTGTATTCTCTGATCAGTGAACTAAGGTTCTGTTGCAGGGGCGGATCCACGTTGGGGCCACGGGGGCACGTGTCCCCCCTGGATTTGTAGAATTGTATATATCTATAATATATTTCAATTATTTTTCCATAATTGGACTGTGGATCGTTGGTTTGAGGGGGGCACCTATACGCGCGCTCCTGCCTTTTTTCTTTTTTCTTTTGTTACATTTTTCAATTTTTTGTTTTATCTTTTGTTACATTTTTCATTTTTTTTAAGTCTTAACCTTTTTTCTTTTTGGTTTTGTTTCAATTTTCAATTTTAAAATCATAATATTATTATTAATTAAAATCGGTTAGAATTTAGTTTATCTTTTCATTTTATGCATTTGTATACAAAATTAAAAACAAATAGCATAATCATTATTAAATTATGTTAGAAATGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTACATTTGACCAAACATTAATAAAAGTGATGTATTATTCAATGTTTGTATTATATCTTGTCTTATTAACCCTAATCCAATAAACTAAACATCCAAGGCTAATAGAATGAGGCTTGAACTAGTATGTAGGGACATACGGGGATCAATGTTCAAGTTTTAGCCTAAAGGGTCTGTAGTATAGGGATAAGGCTGTGTACCTTATCCTGGTGACACTATGGATACGGCCCGCTTTGTATATTGATACAAACGTATTGATCCAACGCGTTCATGTAGTAGACATGCGAGTGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTTTGCACAAAGACCGGACCGCGAAATAGTTAACCACTAACTGTAACACCGTTAGTTAGCTCGGTTTCTATTTCACTAGGATGACCTAGGCAACTTGGCCTTAATCCTGAGTGGATTATGGACTCCTGTCCATGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTACGGGTGAGAGTGGCCTATTCGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACGAGACCGAGTGGGGAGCTGGGAACATAGTCTTACAAGAAGGAATTCACTCCTTCCCTACTTTAGGGTAAGTAGAGGTGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCTGGGTCTTGAATAGTGGGCCTTACCCTCTCTATGGCACGAGAGGGACTTCTGTTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGAACCAAGAGGTAGCCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGGGGTACGAACACACATGAAGGGCTAACTTGCTGTTGACGGTCGATATCCGTGGACACAGAAATATATCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGGTTCTATAGTGGAGTGAACCACAGTTAACGAATATTGATTAACTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTGATCTCATATCGTTGGAACTTCTGATCTGTAGGTCCATCAGGTCCCACCGGTAGCTCTATAAGGGCGTTGAGGTAAATTTCTAAGGGTGATTTGAATATTCGAAGTGGTTCGAATATTAAGTTTAAATATGAATTGGATTCATATTAAAAACTATAGGTTATAATTAATACACATATGATGTATATTAATTCTATAGTTAATTTGAGAGATATATATATAATTAAATATATGATATTTAATTGTGATATTAATTAATTGGTGAATTAATTAATATTTTGGTTTTAATTTTAATTAAATTTGATTTAATTAAGCTATATTAAAACTATAGGATAAATGGAGTTTATTTTGTATAAATATGTTTATACAAATGTTATTTAATTAAATTAATAGTTAATTTAATTAAAGGTTTAATTAATATTATTAATTAAATTATTTCCCATCAGTTAGGGTAACTGATGGGAACGTGTGCTCCCTTTTTCCTCAATCTTGCGTGAATTGGAGGGTTTTAAGGGGGTAGTTGTGCATTTTACGACATGCTCTCCATCATTCAGTTCGGCTCTCTGAAAAAGGCTCACGCAGAATTCTCTCTACCTCTCCCAATTCTAAGAAAGCTCTCTGCAATTCTCTCCCAAAAAGAATACAGAGAAATTTTTCCCATAGAACCCTTAGAGATTGTGCTCCCACAAGCCCCTAACGTGCAACCTTCAAGAGAATACCGGTGGATCTTTGTTGGTGGTGTTCGTGACTATTTTACAGCGAAATCAAGGTCTCCTAGCTGCTGTTTTTGGGAGCAATTCGAAGGAATTTTGGCGAATCGTTCAAGAAAGTCTTCAAAGGTAATGTTATCTTGAACTAGGATCCTAATTAGATTAGATCTAAAGGTTTTTTTCCTTTTATTAAAGCATGTTTTATAAACAGCTTCAGCATGTTAAATTATGTTTACTGCTGTGTTTTTATTTTCCAACGTACCGGTATTTTAGTTCAAATTAAATCAGAGTTAAAGGTTCTGTACGTTTCCGCTGCGCAAGGGCTTTTATCCCTTCAAGAAAAACTAATTGTATAAAGAAAAAAAAAAACTTTATCCTATTTTAATAAAATCTTAAATATTTCAATTTTTATTCTTTGGGGTGGGTAGTTCTAAATTTATTATAATTTTGTAAATAATATTACTTAATCTAAATATTATATCATTTCATTTAAAATTATATTTATATGAATGTTAAATTATAAGTTTAGTTCATATAGGTCCTTAAATTTTCAATGTTTGTGTAATAAGTCTTTTAACTTTAAAAATGTCTAATAGATCCATGAAGTTTCAATTTTGTATCTAATAGTGTCTTAAACATATTATCTTTTTAAAAAAAATTAATTCTATTAGACATAAAATTTAATTTTGTATCTAATTGAACCTTAAATTTTCATAGACCTATTAGACATTTTTTAAAGTTTAGGAACCATATAGACACAAATCTAAAAGTTTAAGATAAACTTGTAATTTAACCTAATATGATCTTGTGCCCCCCTTAATGTAAGATTCTGGATCTGTCATTGTTCTGTTGTATGGTATATCCATATTTCACTCAAGCACATCTTCTACTGTGTGTAAAATTTTACTTGAGTAGGGGGCTACACAGGGAATATGCTTTCCTAATTAAATAAAAAGCAAACTAACTTAACATGTTATGATTAAAAGATTACATGTGTTTAGTCTATGCTCTTATTTATTCTCCTACAAAAATTGATATATGAATGCAGAGACTTGAATTTTGAACTTACAAGGGCTTAAGAAGCCAAAGTCGACCCTAGTCTCTTCCTTCATTTTTCTTTTGCATAAACTAATATTTTGGTGCAGGAACTCAAAATTTGCAATAGCATGAAAATTTGTAATAACATGAAAGGTGCCTGAGGCCAACCCTATGGTTTTGCTATGTTAGTCAAATAAAAAGGCTAATAGAAAAGAAGCACCTACACAGGGGGTTTCAAAACAAAGAGACACATCAGGGGTGGAGACTAAAAGAGAAAGAGGTGGAATTGAGCAAAAATCTGATCCACAGCCTCAGCCTCGGCCAGAGGCCGAGGTGAAACTAAGGCTTGCCTGGTGATTTTCAAACCTCTCTTTCACTGTTTTCCCTTCAACTCATTATTCTTCTAACCTCTACCTAGGAGGTATTCTATCTTCCTTTATTGTTGTATGATTCTTTGCAGATGGACATATCAGTCACGAATGGAACACCAAAAGCACTTCCGGTGACCAGAAAGAAACCCCTTAGA

mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGAAGATCAAGAAGTTGGTCAGAAAGCGGCGGAGGATATTATTGCGGAAGAAGATCCGAAAGAACCAGAAGGACGGAATCAAGAGCAGTCTGAGCCAGGAGTTGCAGATACAGAGGGAGTTCGAGAAGAAAATGCAGAGGAAGTTCGAGAAGAAAATACAGAGGAAGTTGCCCAAACGCCACCGTATAAAGCGAAAATCGGGCCGTGTTAAGGTAGTCCGAGCTGATACCCCCTCACCTCCAGCTACTGATTCTGAAAGAGAGAATGCTGAGAAAGAAGAGCGTAAGAAGAAGGAGGCTGAGGATAAAGCAAGAGAGAATTATTTTGCTGAAGCAGAGCTTGGTTTTGCAGAATGCTCAGGTCCATCAGGTCCCACCGGTAGCTCTATAAGGGCGTTGAGGTCTCCTAGCTGCTGTTTTTGGGAGCAATTCGAAGGAATTTTGGCGAATCGTTCAAGAAAGTCTTCAAAGTCAAATAAAAAGGCTAATAGAAAAGAAGCACCTACACAGGGGGTTTCAAAACAAAGAGACACATCAGGGGTGGAGACTAAAAGAGAAAGAGGTGGAATTGAGCAAAAATCTGATCCACAGCCTCAGCCTCGGCCAGAGGCCGAGATGGACATATCAGTCACGAATGGAACACCAAAAGCACTTCCGGTGACCAGAAAGAAACCCCTTAGA

Protein sequence

MKIKKLVRKRRRILLRKKIRKNQKDGIKSSLSQELQIQREFEKKMQRKFEKKIQRKLPKRHRIKRKSGRVKVVRADTPSPPATDSERENAEKEERKKKEAEDKARENYFAEAELGFAECSGPSGPTGSSIRALRSPSCCFWEQFEGILANRSRKSSKSNKKANRKEAPTQGVSKQRDTSGVETKRERGGIEQKSDPQPQPRPEAEMDISVTNGTPKALPVTRKKPLR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 82..107
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 85..106
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 178..192
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 150..227
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 46..106
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 49..69

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg022930.1Spg022930.1mRNA