Spg022529 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg022529
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold2: 15241959 .. 15245984 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg022529
SyntenySpg022529
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAAATGTGAGTCTATAGTGGAATGTACACACAGTTAATGAATATTTATTAATTTGGTTAATGAGTTTGACCAATTACTCTCACATCATTGGAGCTTCTGATCTGCAGGTCCATTAGGTCCCACTGGTAGCTCATAAAGTAATTTGAGGCAACTAAGTAATAAATGTAAATTGAAAGTGTTCAATTTACTAAGGGAAACAATATAATATATTTGGATATATTATTATGAGAGAAATTAATATTTGAAGAAATTCAAATATTAATATAAATTTGAGTCACATTAAATTTATGGAAGTTTGAAAGAGTTCAAATATGAATTAATTAATTTTAAGGCCTAAAATCTATTTGGGAAAATTAATTAATTCAATGTCGGAAATTAAATATGTGATATTTAATTGGTGGTTAATTAATTAAAAAATTAATTAATCTAGAATTAATCAATTATGGAAATAATTAATCACTTAAGGAAGTGATGGAAATGATCTAATCACTTATGGAAGTAATTAGTCATTTGTGGAAAAAATTAATCAATTATGGAATTGTTTGATCTTGGATTGATTAAATAAGGAATAAGATTGAATCAATTTTGGAAAAGATTGATTTAATTGAATATTTTATTCATGGCCACTCTTCTATAAATAGAACACTAGACCTAATTGGTTTAGAAGCCCTCTTGCTCTTAGACTCACAAGACAAGACCCTAGAATTCTCTTTAGCCTCCCTATTAGAGAAAGACTCCCACAAGTCTTTTGCCTCCTAGACTTAGAGACATACCGGTGTAACCTTTGTGGTTATTGTGTCTTTGAAGAAAAATTTCCAGCGAAGAAATCAAGAAGGAGTCGCTGCGTTTTCGTTTCGTTGGAGCATCGTTGGCGAAGAACGGTCAAGTCTACAACAAAGGTTTGTAACGGTTCTTTCCCATTTCTTTAGAAAAGCATGAAAATAAATTTAGATTTAATTTTCCAGCATGTTTATAGCAATTTCCAGAAACTTTAAAACATGTTTAAAGTTTATTTTGTCTTTTCGTAACGGTATTTTAATGTTAATTAATATACGGCGTAAGGTTCTTTTCGATGCGCTTCCGCTGCATAGGGGATTTAATCCCCTTCAGTTGGAACAACTACTAGAAGCACGACTAATAAAACTTCCTAAGTGTAAACGACTGAAACAAATGGACAAAGTCGATGATCACAACTATTACAAGTATCATTGAGCTTTCAGTCATCCAATGGAAAAATTCTTTGTCCTAACAAAAGCTAATTCTAAGGCTAGCTAAGGAAGGAAAAATTGAGCTCACTACAAGAAAATAGGTTTATTGTGGCGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGCGGTTTGGAAAATGCTGCAAGGGTTTGTAAACGTGCAGCGGTTTTGAACAACACATAACAAAATCGTTGTTATTGATACACATTGCAAAGGTTTGCTTACGATGTATTGACAAACTGTTGCGAACATGTTATTGCAACGATTAAATTGCTACACTTTTAGAAACTGTTACAATAGAGTCAATTGCAACAGTTATGTTGCAACATTTAAAACATTGTCGCAATAGACTAATGCAGCAATAACATTTTAGTAGCAATGCAAAGAAAATCGCTGCAAATATTAAGATTGTAGTGATTTTATGGTAGCATTTTTTAAACTATTGCAAATCAATATATATCTAGTTGCTCTAGATAGTAGTTAATTCAAAATTTTTGTTAAGGGACTTCACTTAAAATTTTGTACAAATAATTTACAAGAAAGCAATTAAGAACTTGGAAATAAATATATCATAAAGAAAATGAAACTTAAAATTTTCATTATTTACCAAAAATTCAAAAATATTTTTATTCATTTTCATTTATATTTGATATAAAATGAATTTTAAAAGACAAACTAAAGCATAATTTAAAATACTTACTTAAATTTAAAAAATGAGCTTTTATATATATTTTAAATGTAAAAATAATGATTCGTTCAATAATATAGTTCTTTTTGTGTCTTAGTTTGTATAGGTCATTGAACTTTAAAAAGTATCTAATATGTCCTTAAATGCATTTTGTGTCAATAATCTTTCAACTTTCTATTTTGTGTCTAATAAGTCCTTGGGTATTCAACATTTTTTAAACTTAACATGCCTACTATATACAAAATTGAAAGTGTTTTAGAGTTCCAATAGGCATAAAATTAAATTTTATATCTAATAGATTGGTTAATCATTAATCATTCACTAAATACTGAAGCAGAGGAAAACACTAACGATGGTAAGAATGATTGAGAGTTGTAAACTATATTTATCAATATAAATTATGTAAGTTATTTTTTTACTTTAATATCTTTAGTTATTTTTTATTTTTTTATTATTTAAAATTGTAAGGCATTAATGTTGTGTTGTAATTTTATTCAGGTGTAAAATGCATTCTTCCAAACGCCTTCGTGGTGCAGTGGTCGTAGAATCTTGTCCCGAACCTGGAATAGAGAGCCAACCCTCCTTAGAATCTAGTCCTAATCAAGGAAGGTATAAATATGTTTACAATAAAAATTACTTAATATACTTTATATTTTTGTTAAAAAATAGATTCATCCGGAGTGCATAGAACACGTGGGAAGACACGTATGTCTGATGTGTGGAACTTACCTAAGGGTCATAAGGTAGTTGTTGAATTTAACAACTTAGACCAACCTATTAAAGGTGGATCAAACATATTGGGCAACTTTTTAGGAACAATTGCAAGAAATTATCAACTTTGCCCTTTAAACTGTGATGACTAGAGAAAAGTACAAAAATGTACAAAGATGAAATTTGGGGTGTGTTGGAGGTACATATCATATATCATTTTGATATGATATTGTGTATTATGTATTACTATTTTTTATTTGATTTACTTTTATCAGTCGAAGTTTACACTTGGCAAGAAACATAAGAAATAGTGTTTATCATCATTGTCAAGAAAGTGAGGTGGCTATAAATACAATTTAAGAGGAGAATATGTGAGCAAATATGACACGAAAGATCAGTGTCTACAACATAAGCCAAATAATATACCAAGAGATAAGTGAGCTGGTTTAGTATCTTTTTGGTACTCAATTGAAGGAATGGTAATTGTTTTTACTTCAAGTTAGCATTAGTAGTTTTTAATCAAACTAACATTTTGCATATTATGTGAATATGACAGAAACGTAGTGCTAGAAACATGGAGATAAGAAAGAAACAAAAGTTCACTTATTCGTGTGATAGAAAAAGTTTAGCTCACAAAGCAGATGAGATGGTAAGTATTTTGTTTTTTACAAAATTATTTATGTTTAATATTATTAACAAATTTCTTATATCATGATAGCAAGAAATACTTGGACGAGATCCTACAAAAGTAGAATTGTTTATATCATCTCATACACAAAAAATGGCACTTTCATAAATGAAGAGGCTGGTGCAATAATTGTAAGCTATAAATAAACTTGTACTTTTATACTTATATATTTTTAAATAATACCTTTTAAATATTATAGGAAAAATTGCGAGATCATGTTAACCAAAATCATAATAGCTCTGAAGTCGATCCTTCTAAAAATGAAATTTTTGCACAAGTTATGGGTCAAGAACATTTAGGACATATTCGTGGCATGGGTTTGGGACCCACTCTCATTCAAATATTCAAATATCCATCACATCGATTTGTTGGGTTGAGATTCGTAATGAATCTAATATGCAAAATGCAGATGAAAGCTCTAGACTTTTGATTGTTGAATCGCATATAGCTAAGATATTTTCATTTTTGAGACGAAATGATTCTACTCAAGCTAGTAGTGCAGGCATGACTCATACAGATAGTATCCCAAGACAGGTATAATTTTATTTATGCATTAAAGTTTTGTTATTTCTTAATCAAATTTAATTATTAATATTTGAATTATGAGTGAGTAGTGCAATTTCATATACTATGTGTGTATATTATTTAGGATCATGAAGATAGCACACATGGAAATGATGGATCAAGTGCGTGA

mRNA sequence

ATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAAATGTCCATTAGGTCCCACTGCGAAGAAATCAAGAAGGAGTCGCTGCGTTTTCGTTTCGTTGGAGCATCGTTGGCGAAGAACGGTCAAGTCTACAACAAAGCGGTTTGGAAAATGCTGCAAGGGTGTAAAATGCATTCTTCCAAACGCCTTCGTGGTGCAGTGGTCGTAGAATCTTGTCCCGAACCTGGAATAGAGAGCCAACCCTCCTTAGAATCTAGTCCTAATCAAGGAAGCTCTGAAGTCGATCCTTCTAAAAATGAAATTTTTGCACAAGTTATGGGTCAAGAACATTTAGGACATATTCGTGGCATGGATGAAAGCTCTAGACTTTTGATTGTTGAATCGCATATAGCTAAGATATTTTCATTTTTGAGACGAAATGATTCTACTCAAGCTAGTAGTGCAGGCATGACTCATACAGATAGTATCCCAAGACAGGATCATGAAGATAGCACACATGGAAATGATGGATCAAGTGCGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAAATGTCCATTAGGTCCCACTGCGAAGAAATCAAGAAGGAGTCGCTGCGTTTTCGTTTCGTTGGAGCATCGTTGGCGAAGAACGGTCAAGTCTACAACAAAGCGGTTTGGAAAATGCTGCAAGGGTGTAAAATGCATTCTTCCAAACGCCTTCGTGGTGCAGTGGTCGTAGAATCTTGTCCCGAACCTGGAATAGAGAGCCAACCCTCCTTAGAATCTAGTCCTAATCAAGGAAGCTCTGAAGTCGATCCTTCTAAAAATGAAATTTTTGCACAAGTTATGGGTCAAGAACATTTAGGACATATTCGTGGCATGGATGAAAGCTCTAGACTTTTGATTGTTGAATCGCATATAGCTAAGATATTTTCATTTTTGAGACGAAATGATTCTACTCAAGCTAGTAGTGCAGGCATGACTCATACAGATAGTATCCCAAGACAGGATCATGAAGATAGCACACATGGAAATGATGGATCAAGTGCGTGA

Protein sequence

MSAVRRVQMSIRSHCEEIKKESLRFRFVGASLAKNGQVYNKAVWKMLQGCKMHSSKRLRGAVVVESCPEPGIESQPSLESSPNQGSSEVDPSKNEIFAQVMGQEHLGHIRGMDESSRLLIVESHIAKIFSFLRRNDSTQASSAGMTHTDSIPRQDHEDSTHGNDGSSA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 73..90
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 69..90
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 137..168

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg022529.1Spg022529.1mRNA