Spg022172 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg022172
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold2: 15344223 .. 15352625 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg022172
SyntenySpg022172
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGAGATGAGAGACCCGCATAGTTCTTTGGAAAATTTTGATGGTGTCTGTCCAACTATTGGGGGTGTTTCAAAATTGACCGCCATTACCATTTTAGTTTTCAATCTTAAAGTCTAGTCTTAAATTTGAAGTTTTGGATGGACTTCATTTTGTTAGACTTTGAGACTTGAAGAACATGAACAATTTGTTTTTAGCAATCTTGATTGATTTAGTTTGTTTGAAAATATTGCCTTCTTCTTTTGGAGAGGAAACAGAGAATTTTTTTTTTTGTAAAAAAATACTCTACAAGTTCAATTTACAGTAGATTTTGTACTCTTTGGGCTAACTAGTGAACAGGGTAGCTTACTCCTGGTGTCTGAATTATTACAGGTTAAAGACAAAAAAAGATGTCAGGCCAGTGCTGTAACTTTACTTCTTGATAAGGAAGAAGAAAAAGAAAAAGTTTTGTGTGGGAATATGGTTCTGAAGAGGCGCCAAAGTGCCCACAGCCTGTAAGCCCACAATCATCCAGACTGCAGAAGAGCCAGTCCAGACAAAGCATCGGACAAAACATTTTTTTTTTCAAGGGAAAAGAATAGTTCGGGAAAGAAATACTACTGAAGCAGAACTCAAGGTACTCTTGTCGAAAGTTGTATTTTATTTTTAATTTCTTCCACTTTTTGTTCCTTGTATTTTGATAATGTAACAGTAGATACTGGCGGAAGAACTGAAAAAAATAGAATCGTTCTCCTGTCATTTCTATGGTTCCTTTTTTGTACATATGTAATATCATGGAAGTAAGTTTTAAGAAATTGAGGAATGGAAAGGAATATTGGCCACTGGAAATATGAAGGTTGTCATGCTCCTATGCTCTTCCATTTTCTGCTTCTTTTCTCGCCTGAAACACGTGCTTAGTTTTTCTTTACATTTCTCAATCCTTGTGAACTTTAGCTTTTTGTCTTTTCCCTAAAATTGTTGTGAGGATGGAGCTCTAAGGGAAATATTTCACTCATGGTTTTAATAAGTTTAGAGTTGGAAAGCCTAAGTTTGTATAGTTTGAATTGTATGAAGGAATAGGTTATAGAAACTTGAGTTTGTGTAACATGTATTTGGTTTGCAATTTTATGAGTATATAAAGATTATGATATTGTAGAGTTTCGTAGACTTGAGTTTATATAACAATGGTTTGTATAGTACACAGTTCGGGGAGGAACTCCTTGTTCCTTGCTCGTTAGGTTGTGCAGTTGTTTTTTGTGATATGAAGTAATTATTGTTTCTTATAAAAAAAAAAAGCAGGATTTACAAATTTGAAACTATAGGTTACGGTTCTTAATCTCGAATTACACAGATGTAATTCATGAGACTAACTATCCTCTAATAATATTGGGGCTAACAGACAAAGGCTTCTGAATCAATTGAGAAGTCACTGGTCTATGATGGATTTGGGATAAATTTACTGTGCTGATTTGCCTAGCTAATGTCATTTCTATTGTTTCTTCTTTTTCTATGCCAATTCTAAGCTGAGTCACCCAGTTGAATAGATGGTATGGTCCGAATGCATGATTACCGTCATAAAGTTGCAAAGATTTTTCCAAGTGGTTTAATCACCACGTAGGTGGCTGTGGCAGCCACCATTGCTGTATTATCTTTTCCAACCATTTAATTTTATCTTTTTGAATCTTGATGATTTGAGGAAAAACGCCTCCTCGGTCATGGGAATAGCTTGCATTCTTAACAAGGATACAAGTCAGTAGAAAGATTCAAACTTTTGTGAAAATTTTGCTCTTGATTAGTATCGAAATCTTGAATTAAGTTCTTTTAGAACCTTTTATCTTTGTGGTTTAGTTAGATAGTAAGCTTTGCTTGATGGATGGTTTTAACTGATATGTTGTTTTTGTTCCTTCTCCTTAATTTTGTTCCCAATTACTTGGGATTTGTAGCTGCGTTTTTTTAAATTTCTAAGGATTGCCACTATTGAGATTTAACCTGTGGATTTTAATGAGAGCATCTTCTTCCTTTTTCTTTTGGATCTATTTTGTTAACAAGAAAGGTATATGTTTCTGAGATTGGATTCCACCAAACACGTTTTATTTTCTATGCTTTTAGAATTCACTGCTAAATAAATTTTCCTGATTTTTTATTTGAAGATTTAGCTTCCAAATTCTGATACTGCTACCAAATTATTTTTTTAATTCAACAAGTGCAAGAAATACTTTCTTTTTTTCCTTTTTCTTTTTTTTAATGGGTCGGTAAATTCTTGGAAATTGAACCATCATTAGGGTCTAGTGGGTAAATTAGTTGAACCATTATTAGTTAGTGATTTTTAGTTGAACCATCATTATTAGTTAGTGTATTTATAGTTGAACCATCAGTAATGCCTGAATAACTGTTTGTCCTGTTTTTTGGTGCACAAAGAAGCGATGGAAAATACTGTTGAGTGTTTTATTACCCATAGTTTGATTAATGGATACAAAAGTAAGCCTTTATAAAGGCTTAGGTTCTCAATTGGCAACCTGCTAAACCAGTCCCAACCAAGTTAAACAGAGTAAACACACCAGAGTTAATAGTAAATGCAAGCATAAAATGTAAAAACAAGAAGGGATTACACCAAGTCCTGCTGTTAACTAGTCTCCAGTTTCAAGTAGCTTGTGAGAACTTTTTAGGAGGATAATCCTTTGTTTGGTTAACATAGCAATGTGAACCTAGGGTAAATTCTAACTTTACAAATGTTATCTTCAAATTTTTGCAAAAATTCAGCATGACCTAGCCTTTTCTTCTGTTTACACTCACTGTACACATTAGAAGGATGATACTTCTTTCGAATACGAAAGATAACCAAATCATTAATGTCCAAAGATGAGTCCAAAGACTTTTCCCTATTCATTTTAGTTGCCCTTTTACTTGTATGTCACATTTGGTATTGGACCAAATCCAATTCTTGAACAGAGAGCATTTGGATCAAATCTGGGGTTATTTGAGGGAGGGACCTGAATGTAGACATCTCTGAAAGGAGACTTCTTTGTAGATTTTTTGTTTGGCATACTGTTAAAGCCAAACTCAGAGCAATCTCTGTTGACCTTTCGTTTGTGGATGGAGAGTAGTGTCAAATTTCTCCCCTAGGGTTTTCCAAAAATGACCAAGAAATTTACGAGAATCCCATGTAGACAAACAATTTCTATGAAAAATATCAGAGGTCCTTTTGAATGCCAAAAGGTTTGTCATTTTGCTTAATCGAACCACAACGAGCACAGAATCACGACCCCTTTGCATTTCTGGAGGATCGAAAATACAATTCATGGTCGAATCCAATATTAACCCAAGAGATCTTATAGGGTTTAGGTTTAGAAGTTTGATCGAGATTGTTGAGATAACGTTCTTGCAGCTTTCATTGTTGAGAATGACATGGTAGACCGCTGTTTTTTGAATATTTCTCGCAAAATGATAATATGATTCTTGCAAGGGTGTTGGTAAAATATCATCCGTAAGACCGAATGTATTCCACCATTGAATAAACCACAGAGGAAATGTGATTTTGCATGCATTTTGACAAAAGGATATGCATCTTAATTTGAAAATTATCTTGAAATTGAGAAATGTTCTCTCCTTTGGGGTTAATAATATATTTTGAATTATACTTGTCAAGTACTCTCCCTCATCTCGTTCGATACAAAGGACTTCTTCCTCTTCTAAAATCTCGGTATCGACTTCGTGTTCATGGTCTGATTCTTGTATAGTAACATCGGACACACTCAGTGGCCTCCTCTATAGACAAGCATTAGAATCAATGACCCACGTGATTACATTTATGAACTTCTTGAATAACTTTCTTTTTGATCTTTGAACGTTCAACAGTTGATGGATTAGCTTTAAACTTGTTCCAATTACATTACAAGTCTTTCTTATTGTTAGCAAACTCCCTAATTTTGTTACCAATTGTGATGTTAGTTAGAGTAGAATTGTCTGATTTGCTTCTTCTATACTTTGTGGGATACTGTAATTACATTTGTGCGAGAGCTAATCTACTGCTTGCTATTCTTGAGGCTGCAAGCTTTGATCGATCTGTCAGGGCTGGTTTCGAGGAGATTGTTGCGAGTGCTCGATTGATAGATCGCGTCTCAAACAGTTCTTGTTCCTTAACTTAAAATTTTGAATCTAAATCATGGACATTGTTGCAAATGTTTCAAGCATACGAGTACTTATGCATTGCTCGGATGACTCCCTAATAACATAGAGCGTAATATGCCCATCCACAGGATGCTTATGTTCATCGTGTCAATGCTCCTCTTGACGACATATGCTCCATTTAGAATACACATTATGTTTGACACAACACGATTGTGTTCAGTTGTATGCAATTTCTTTGACTATGCAAGGGTGTTGGTAAAATATCATCCGTAAGACCGAATGTATTCCACCATTGAATAAACCACAGAGGAAATGTGATTTTGCATGCATTTTGACAAAAGGATATGCATCTTAATTTGAAAATTATCTTGAAATTGAGAAATGTTCTCTCCTTTGGGGTTAATAATATATTTTGAATTATACTTGTCAAGTACTCTCCCTCATCTCGTTCGATACAAAGGACTTCTTCCTCTTCTAAAATCTCGGTATCGACTTCGTGTTCATGGTCTGATTCTTGTATAGTAACATCGGACACACTCAGTGGCCTCCTCTATAGACAAGCATTAGAATCAATGACCCACGTGATTACATTTATGAACTTCTTGAATAACTTTCTTTTTGATCTTTGAACGTTCAACAGTTGATGGATTAGCTTTAAACTTGTTCCAATTACATTACAAGTCTTTCTTATTGTTAGCAAACTCCCTAATTTTGTTACCAATTGTGATGTTAGTTAGAGTAGAATTGTCTGATTTGCTTCTTCTATACTTTGTGGGATACTGTAATTACATTTGTGCGAGAGCTAATCTACTGCTTGCTATTCTTGAGGCTGCAAGCTTTGATCGATCTGTCAGGGCTGGTTTCGAGGAGATTGTTGCGAGTGCTCGATTGATAGA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mRNA sequence

ATGGAGATGAGAGACCCGCATAGTTCTTTGGAAAATTTTGATGGTGTCTGTCCAACTATTGGGGGTGTTTCAAAATTGACCGCCATTACCATTTTAGTTTTCAATCTTAAAGTTAAAGACAAAAAAAGATGTCAGGCCAGTGCTGTAACTTTACTTCTTGATAAGGAAGAAGAAAAAGAAAAAGTTTTGTGTGGGAATATGGTTCTGAAGAGGCGCCAAAGTGCCCACAGCCTGAAAAACGCCTCCTCGGTCATGGGAATAGCTTGCATTCTTAACAAGGATACAACTAATCTACTGCTTGCTATTCTTGAGGCTGCAAGCTTTGATCGATCTGTCAGGGCTGGTTTCGAGGAGATTGTTGCGAGTGCTCGATTGATAGATCGCGTCTCAAACAGTTCTTCTAATCTACTGCTTGCTATTCTTGAGGCTGCAAGCTTTGATCGATCTGTCAGGGCTGGTTTCGAGGAGATTGTTGCGAGTGCTCGATTGATAGATCGCGTCTCAAACAGTTCTTATTTGGCATCAATAGTTGGCACCGTCTGTGGGGAAGAAAGCTTGCTAACATCAAGTTCGAGACTGAGTCAAGCTCACCTGTATGAGGCTGAGGCTGAGGCTGAGCCCCATCTAGTCGAGGCCGACCCTAAACTCAAAAGCACAAAACCCAAGGATATGACCAAGGAGAGACCCCCAAGAAGACAAGGGCAGAAGGGATTGGGCCCCTTGACCTCGGTTGAGGCCAACCCTCGGCACACTCCTGTGGGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAGATGAGAGACCCGCATAGTTCTTTGGAAAATTTTGATGGTGTCTGTCCAACTATTGGGGGTGTTTCAAAATTGACCGCCATTACCATTTTAGTTTTCAATCTTAAAGTTAAAGACAAAAAAAGATGTCAGGCCAGTGCTGTAACTTTACTTCTTGATAAGGAAGAAGAAAAAGAAAAAGTTTTGTGTGGGAATATGGTTCTGAAGAGGCGCCAAAGTGCCCACAGCCTGAAAAACGCCTCCTCGGTCATGGGAATAGCTTGCATTCTTAACAAGGATACAACTAATCTACTGCTTGCTATTCTTGAGGCTGCAAGCTTTGATCGATCTGTCAGGGCTGGTTTCGAGGAGATTGTTGCGAGTGCTCGATTGATAGATCGCGTCTCAAACAGTTCTTCTAATCTACTGCTTGCTATTCTTGAGGCTGCAAGCTTTGATCGATCTGTCAGGGCTGGTTTCGAGGAGATTGTTGCGAGTGCTCGATTGATAGATCGCGTCTCAAACAGTTCTTATTTGGCATCAATAGTTGGCACCGTCTGTGGGGAAGAAAGCTTGCTAACATCAAGTTCGAGACTGAGTCAAGCTCACCTGTATGAGGCTGAGGCTGAGGCTGAGCCCCATCTAGTCGAGGCCGACCCTAAACTCAAAAGCACAAAACCCAAGGATATGACCAAGGAGAGACCCCCAAGAAGACAAGGGCAGAAGGGATTGGGCCCCTTGACCTCGGTTGAGGCCAACCCTCGGCACACTCCTGTGGGTTGA

Protein sequence

MEMRDPHSSLENFDGVCPTIGGVSKLTAITILVFNLKVKDKKRCQASAVTLLLDKEEEKEKVLCGNMVLKRRQSAHSLKNASSVMGIACILNKDTTNLLLAILEAASFDRSVRAGFEEIVASARLIDRVSNSSSNLLLAILEAASFDRSVRAGFEEIVASARLIDRVSNSSYLASIVGTVCGEESLLTSSSRLSQAHLYEAEAEAEPHLVEADPKLKSTKPKDMTKERPPRRQGQKGLGPLTSVEANPRHTPVG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 207..233
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 207..254

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg022172.1Spg022172.1mRNA