Spg021297 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg021297
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold6: 48673517 .. 48683254 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg021297
SyntenySpg021297
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGTCTAAGCGCGTGGGCGAAGAGGAAAGGCAAAGAGATGTTGAAGGCCAAGCTCCACATGAAGATATTTTTAAAAATTCCAAAGCTTTCCACAAGAAATCGTGCCAAAATGGGTCCCCTGTGGAGAAGTCGCCCCTCGCACCAGCGCATGTAAGCTCGAACGGGAGAATTTACCAGGTAAGTAATTATTCTTCGGTTGTTTCTCATTTTTTCTATGGGTATGTGCATGAGGTTTCCCTTTGTATCCTTTGGCCTTTGATAATAATAGTCCTTTCCAATTTGGGTTGCCTTTGAGGGAGAGTCATGGTGGTTTTCTTCATTTTTCCGATTATGCCTTTTAATTTTAACTCCTTTCAAGTTTCTGGAAGTGTAATGTATTAACTATAGAAGTTGTAATAGTTGAGTTAGCTTAAGTCAGTTTACTTTCTGGTTTATGTGGTTATATACTCAACTGTTTAACCTATGTATTTTGGCTATTTATAAGCCCTTGCATCAATCAATAAAGGTGCGCAAGTATTATTTACTCTCTGTCTTCATATGGTATCAGATGTTTTGATCACCTTTTAAGAGAGTACCTCTTGCATCTCCTTCTCCATGGCCGACGATGACACTGTTGGTAATCCATTTTTGCCATTTTCTTCGTCTACCATCCAGCCCACGAATCAGTCAGTAATCGACCAATACGACAACCCCTACTTTCTTCATCACTCTGATGGCACGAACCTCATCCTCGTGTCTGATCTTCTTACTGAATCCAATTACAATTCTTGGAGTCAAGCAATGATTCTTGGTCTCACGGTGAAGAATAAAATGGGTTTTGTCGATGGAACCATTACTCCTCAGGCTGGTGAATTGAAGCGCTCGTGGATTATCTGCAACAGCGTCGTCAAGACTTGAATCCTCAATGCACTTTCCAAGGAAATTTTTGCAAGCATCAATTTCTCTGATTCCGCTAGAGAAGTGTGGCTAGATCTCCAACAGCGTTATTAAAGAAAGAATCGCCCTAGAATTTTTCAATTACGAAGGGAAAAATCGAATTTGGCTCAAGAACAGCTCTCCGTCACAACCTATTTCGCAAAACTCAAGACCTTGTGGAACGAACTCGCCTCCTACCGTCCTTTCTGTTCATGTGGACGATGCAATTGTGGTGGTGTCAAATAGCTTGCCCAATATTTCCAAACAGAACATGTCATGGCTTTCTTGATGGGGTTGAACGAGTCCTTCGCCCAAATACGAACTCAGTTACTTTTAATGGAGTCGGAGCCCACAATTACTCGTGCATTTTCTCTCGTTGCTTAGGAGGTCGAACAACGTGCATCTTCCGCCCCAATTTCCACCCATGTTCCTGTTACATCAGAAGCCACGACACTTCTTGCCAAGGCAAATAACACGGCTGCTTCTTCCTCTCGAAATCAGCCAAACAAGAAAAAGGAACGCCCCTTATGCACACATTGTAACACTCTAGGGCACACAGTGGATAAGTGTTACAAACTCCATGGGTATCCGCCAGGGTATCGAAATCAGAGGACGAATTCGAGCCCACATTCTTCTGTTAAAACATACGCCAATTCGAACCCGCTTGCAACATTAACTCCATAACATGCCATGGTATCTTGGTGGCACTTCAGTCGCATCTTGCCTCTTCAAAGGCTGATTCTGAACCGTCTCCTTCCAGCTCCAATGCTCACGTAGCAGGTATTTGCTCAAAATCTGTTTCTGCTTCTAGTCATTGGGTTATTGATTCTGGGGCCTCAACACGTGTTTGCTATTCTAAGGACTTATTCTCTTCTTTAAAGCATGTTTCTGGGTTTTTTGTCACTTTGCCAAATCAAAGTCGCAATACTGTTGAATATGTTTGGTGATATACAACTTTCTCCCATGCTTGTTTTAAAGACTGTGCTGTTTATTCCAAGTTCTTGTTTCAATCTCATCTCAGTGAACGCCCTAACAGCATGTTCTCCGATTATTGTCTCTTTTGTTGGAAACCTTTGCCTTCTTCAGGACGAGTCCTCTTTGAGAACGATTGGCAAAGCTGAGGTTTGGCAGGGCTTATACCTACTGTGCTGTGAATCTTTGCTGACTGATAAGACTGATCTTAGTACTAAGTCTTTGAATACTGCTGTTTGTAATGCCTTTTCACATAGTGGTCATTCTATTTGGCATGACCGTCTTGGTCATCCCTCACCTAGATATTTAAATGCATTGAAATGTATATTGTCTTTAGAATCAAATAAGAATGACTCCCAGCCTTGTTTTGTATGCCCTTTAGCCAAACAGCGCCGGTTATCCTTTTCCTCTAATAAGAGAATTGCCTCTGGACCTTTTGAACTAATACATTGCGACACTTGGGGTCCCTACCAAGCACCAACCTACTCTGGTCATTAGTATTTCTTAACCATAGTTGACGACTACACTCGCTACACTTGAACCTTTTTGATGAAAAATAAGTCTGATGCAGTTTAAATAGTTCCTCGTTTCTTTTCCTATACTGACACTCAGTTTGGCATTCCTATTAAGTGCTTCCGCTCAGACAATGGCCCTGAATTATCATTCACTGAGTTATTCAATATTATAGGCGTCTTTCATCAATTTTCCTGTGTTGAGTGTCCTGAACAGAATTTCGTGGTGGAACGTAAGCATCGGCACTTATTAAATGTAGCGCGTGCTCTCATGTTTCAGTCAAGAGTACCAATCCAATTTTGGGGGGACTGCATATTAACGGCTTCTTTCTTAATAAACCGAACTCCTTCTTCAGTTGTCGAATGGCAAACTCCTTACCTTCGGTTATATAAGAAGAATGTGGATTATACACAACTTAGAGTCTTTGGCACTCTCTGTTTTGCTTCTAGCATGTCTTCTCATAGACTAAAGTTCCAACCGCGAGCCATTCCCTCTTTTTTTATCGGGTATCCTCAAGGCACAAAAGGGTTCAAATTGTATGACATCAAAGGCAAGCGGTTTTTTGTCTCTCGGGATGTTGTCTTCCATGAAGGGATTTTTCCTTTCCATCAAGTTTCTGTCCAAGAAGATGTTTTTGATCCATTTCCAGACTTAGTCTTACTTAAGTCCTTTGATTATGCCGGGTTTCGCTCACAAGAACCAGCAACCACTCAGTCTACAACTGCTGCTTTCATTGACAGCATTGATACCAACATGGATGACCATAGTATTCCACCAGTTGTTGAAAACGATACTAACATCAGTCATCCTACTGACCCTTTGCCTGAGGTTATTTCTCTCTCAAATAACCATGTTGAACGAGTTGTTAATGCTCCAAGGCGTTCCACCAGAGAAAGAAAACCACCTTCTTACTTGAAGGAATTTCACTGCAGCCTTTTACAAAATGGTTCCTACCCGACAACAGTAGCCAAGTTCCCCTTACAAAGCTATATTTCTTATGGTCGTTTGTCACCAAGTTATAAGAAATTTGTTCTGAATGTTACTTCATTCGAAGAGCCACAGTTTGATCATAAGGCCGCCCCCTTTAAGCATTGGAGGGATGTCATGACTAGTGAGCTACAGGCTATGGAAGTCAATAAAACTTGGTTCATGGTCCCTTTACCCAAAGACAAACATTCTATAGGCTGAAAATGGGTCTACAAATTGAAGCATAAAGCTGATGGTTCCATCGAGCGTTTCAAAGCTCGCCTTGTTGCAAAAGGCTACACTCAACAAGAAGGCCTTGACTATATCGAAACTTTTTCCCCTATAGCCAAAATGGTCACCATTAGAGTTCTTCTAACCATGGGTGTCTCTTTTAAGTGGCCTTTGTTTCAGCTTGATGTGAACAATGCCTTCTTACACGGGGATCTATTTGAAGAAGTATACATGGATCTCCCGCTAGGCTACAAGCACAATTCTGTTCAAAATAAGGGGGAGCGACTAGTATGCAAATTGCACAAGTCAATCTATGGTCTCAAACAGGCCTCCAGACAGTGGTTTGATAAGTTTTCCCACTCGTTATTGACACTTGGTTTCAAACAATCCAAGTCGGATTACTCCTTGTTTACCAAAGGAAGTGGTTCATCTTTCATTGCCCTCCTCGTCTATGTTGACGACATCATTATAACGGGAGCCTCTCCTACTGACATTGATGCTTTAAAATTACGTCTTAACAAAGATTTTAAACTCAAAGACTTGGGATCTCTTCGATATTTCTTAGGCCTCGAGATTGCACGGTCTGAAAAATGGATATTTCTTTCTCAAAGAAAATATGCCCTTCAAATGGTTGAGGATGCTGGTCTCCTTTCCTCTAAACCATCAACCTTGCCCATGGATCCCAATTTAAAGCTTACGGCTGCCAATGGAGAGCTTCTCCCAGATCCTGCTGCTTATCGTCGAATTGTTGGACGACTGTTGTACCTCACAATCTCTCGGCCTGATGTGACTTTTGTTGTACATAAGCTAAGTCAGTATGTGTCTCAGCCACGAACTTCACACCTCCATGCTGCGAATACTCTTCTTCATTTCATTAAAGGGTCAGCGGGCAAAGGAATTTTCTTACCTGCTTCCTCAACGTTTCAGTTACGTGGTTTTTGTGATGCTGATTGGGCATCTTGCTCCGATTCTCGAAAGTCTACTACCCGATATTGCATTTTTCTTGGTGAAGCACTTGTGTCCTGGAAAGAAAAGAAGCATAATATTGTCTCACGGTCTTCAGCTGAAGATGAATACAGAGCGATGGCAGCTACCTCTTGTGAGATTATATGGCTGCAGCAGTTGTTAAAGGAGCTACATATTGATGAGTCTTCTCCTGCTCTTTTATTATGTGACAACAACGCTACCATCCATATTGCTACAAACCCAATCTTCCATGAAAGGACCAAACATATCGAGTTGGATTGCCATTTTGTTCGAGAGAAAGTGCTTACTGGCGTTATAAAATTGCTCCCTGTTCGGTTGAACTCTCAGCTTGCGGATGTCTTCACCAAAGCGTTATCAACTTCGTCATCCTCTACTTTATTATCCAATATGGGATTGATCAACTTCATGGCTCCATC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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGTCTAAGCGCGTGGGCGAAGAGGAAAGGCAAAGAGATGTTGAAGGCCAAGCTCCACATGAAGATATTTTTAAAAATTCCAAAGCTTTCCACAAGAAATCGTGCCAAAATGGGTCCCCTGTGGAGAAGTCGCCCCTCGCACCAGCGCATGTAAGCTCGAACGGGAGAATTTACCAGGGGGGAAACCATCATTTTGTTAATAGTGAAGCGGCAGTATGTAATCTAATTTCTTATTATTCTCCATTAAGTATCACTGAAATTCCCTTTAATGGAGGCTTGCATGGTAACTGGTCGTCGGGATGGACAGCCTTAGCTTTTGTTGGCATACATGTGACTCATTCGGGTGATAACATTAAGGATCATGGTTCCCCGTCTAAAAAGGGTAATCAGAAAAAGATTGCGGGGAAGTATGTGGACTGGGAGTGCCTAGAGTTTGAGGGTGCCTCGAGTGGAGTTTTGAAGAATCTGTTGCTGGGCGACTTGAGGGAGCGAATTTTATGCTGGAGCAAACCTGGGAGCAAAACTGCCACGTCACAGCTCGTTAGCCAACTTCATGAACCGACTTCTCCTTCCGTCTCTAAGGAAGTAGGGGCTCGTTGGTGTCTTGATGATAGTGATGTTGTGGAACATGAGATACTTAAGAGGGAGGGTGAAGAGTTTGTGAAAAGCATTCGGGGCAATAAGTATGTGGACTGGGAGTGCCTAGAGTCTGAGGGTGTCTCGAGTGGAGTTTTGAAGATTCATGAATTCAGTGAATATGCGTTTGGCATATGTTTTGAATTTGAAATATCTAAATGCATAATTTTATGTTGGCTTGATGATCTCTTGAATCAGCTTGTTGGCTTGTTGATCTTCTTGGATGATCGGCATAATGCTCTGGACCCTGAGTTCTCTGACTCTGTCTCTGAATCTCCATCCCCCAAAATGAATGGTGGCCTCCTCTATTTATAG

Protein sequence

MSKRVGEEERQRDVEGQAPHEDIFKNSKAFHKKSCQNGSPVEKSPLAPAHVSSNGRIYQGGNHHFVNSEAAVCNLISYYSPLSITEIPFNGGLHGNWSSGWTALAFVGIHVTHSGDNIKDHGSPSKKGNQKKIAGKYVDWECLEFEGASSGVLKNLLLGDLRERILCWSKPGSKTATSQLVSQLHEPTSPSVSKEVGARWCLDDSDVVEHEILKREGEEFVKSIRGNKYVDWECLESEGVSSGVLKIHEFSEYAFGICFEFEISKCIILCWLDDLLNQLVGLLIFLDDRHNALDPEFSDSVSESPSPKMNGGLLYL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..28
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 296..316

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg021297.1Spg021297.1mRNA