Spg020849 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg020849
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold10: 28088407 .. 28098849 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg020849
SyntenySpg020849
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAGACTAACTCGGTTAATGAGTTTAAGCCGATTAGTCTCGTATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCACTGATAGCTCGTAAAGAGACTTGAAGCAATTAAATATAAATTGAAAATGTTCAATTTATCTGGGGAATCAAATAATGTATGTTGATGCATTATAATATAAAGTTTATGAAACTTTATAATATAATTTTTTAATTAATTTCAAAAATTAATTCTTGAGACAAAATATTTGAAAGAGTTCAAATAAATTTTAATATGAATTGGATTCATATTAATCTTAATTTTAATAAAATCCCTAAGATTAAATATATGATATTTAATTGGGTAATTAATTAATTATGGAATTAATTAATTATTTATTAAAATTAGATATTGTTCAGATAATAGATTTGAACTTATTAATAGACCTTTTTCTATTGGGAAAAGAAGACTTTTTCCTATTAGGAAAAGGTCTTGGCCTTTACCTATATATAGGACCCCTGGGGTGGGGTGAAAGGCATCCCATTGTCTCTCCTTCTCTCAGAGATCTCTCCCAAAAGACTCCCACAAGTCTCCTGCTTCAAGAAGTCTTAGAGATATACCGGTGTAGCCGATTGGTGGTGTTCGCACAAGAGGGTTGCTGCGTTTTCAATCTTATTGGCAAGAAAAGGCGAATTGATCAAGGCTTTCTACAAAAGTAAGTTTTCTATGAAATCCTTGATCACTAGGATCAATCTAGTTGATCTTTTAGCATGTTTATAGCCTATGTACAACCCATTAAATATAGATTTATTGTTGTAATATTTTGCAAATTGTATTGGTATTTCAATTAGAATCTAAGACTCTGAGTAGGTTCGGTAATACTTTCCGCTGCGTGGGGCTTTTATCCCTTCAAGGATAAAAAAAAAAAACATTCTGCTACTATCCTACTCCGACCACGAAGGTTCCGATGCAATTTCAATGGCGGCTAGGAGTCCAAGTTCAGAATCACATGGGTTTTCAAAAATTGAACTTGAGGGGCCGGAAAGTGCTGAGGATATATACAAGGTATTTGTTTAAATTCACATTTAAATTACTAAAGTTTGCTTTTGATTTTGTTAATTAGAAACATTTATAATTTCAAATTTATTTTAATTATTATTATAGATTATCTTAAATCATAGATTTGATTTGCTCTCTAATTTAGAATTTCAATTAGATATTTCGTTGAGGATATTTTTATCAATTGATAATTCATATTTTAGATTGAATTTATCTAATTTAAAAATTGTAGATTTGATGTATCTATCATTTTGGTCATTTATTCAATGAATAAATAGACCAACTGGTCATATTTTAAACCGCACATTTAAGTTTGTTCAGTCCAGCCTTAAAAAATTACTTGGACTAAATGAAAAGTCAAAATTAACTCGACTATGTAAAACAAATTAGTTATTTGCTCACATAAAAATTCTTCTATGACATCTTCATATTACAATGATTTTTATTTCTAATTTTGAATACAACAATATGGAGTGAAAAATTCAAGGAAGATAGCTCATATTAGCTGAACGAAAGTCTTTACCATTTTATGGGCTTAACATTCTGGGTATGTTCTCTACCTACCCTTATTTACTAAATGTCTATCTCAATTCGTAATTACGAATTCTGAAACATTTTTTACCTTATGTGTTTCCATGGATTTATTAACTATTCATAAGTTGCAAGCTACTCATGACATACTTATATTTTTTTTATCAATGACTAGTTTCTTTTCCCCATATCTACATAATGTTATCTACTAACGTTATTTCACGAGGAGAAAAAATGGAGCTCCTGAAAGCCCGAGTAGATGAGTCAACAAAATGTCCTTGGAAGAGTGGAAAAACCTATACTCTCCAAGGCACTCGATTTATGGAACGACCTTAGCAGAGTCGACAAACGCTCGAGAATGATGATGTTGAAGGTCTCGGTGACAATGACAGAGCCGACATGCAAGGAGCTGAGGCTAGCCCGTAGGAGGCCGACGCCCACAAATGCCAATAAGGAAGAGTTATGCGACATGAAAACACTAAGGTATGTCAACATCGATTACTCAAGCATAACTTTTACTTCGAGAAAAACTTTGCTTGAGTGGGGGGCTGCACATGGAATATGTTTCCCTAATTAAGTAAAAAACAGTCAGAAAGGCAGCAAATTTGGCCTCATGACTTTGTGGTCATAAAAACTCATACTTAGTTCCATAAAGAACTTGATCCAGGTATTTATGTCATCTTCATCTCCAAAGATTTAGCATTTTTGCTCATAAGCTACTTGACTCTATTTTTATGTCTAAAATGTTATTGAGCAATGGTAGTACTTTTTTTTAGTCTGTGCTCTTATTATAGTTTGATTGGCTAGAACTTTAATGATACACTCGCTTATGAAAAGCCTTTGTATAGACTGATCCTTGCAGAGAGGTTGACGTATTTCCTCAACCTCCCCAAGTCCCCAACAAGAGTGTACGCACCCTTGGGATGAAATTAATTCTTGCAGAGGGGTTGACGTATTTCCTCAACCTCCCCAAGTCCTCAATAGAGTGTACGCACCCTTGGGATGAAACTGGTTCTTGCAGAGGGGTTGACGTATTTTCTCAACCTCCCCAAGTCCCCAACGGAGTGTACGCACAGTTGGGATGAAACGGTCGAGAAGAGATTAATTCTTGCAGGGGTTGACATATTTTCTCAACCTCTCCAAGGTCACGGGTCAACCTCACTTCATCTGGTTTGAGCCCATCACATTACGCGAGCCAGGACTACCGAGTTCACCTCAACTCATCTGGCTTGAGCCCATACACTTCATCTGAGTCAAGCTCAACTGGCAGAGGCTGAGGCCGAGCACATCTTGCCGAGGCCGAGCATAAACTTTAAAGGTATTCTCCTCTTTACTCAACCATACTTTATGTTTTAAATAAAACTTTACTTGGGTAAGGGGGTTACAAAGGGGATATGCACTCTCTATTAAACAAAAAGCAAGATGAGATATGCACTACCTATGAAACAAAAAGCAAGAAGGGATATGCCTCCATGTTAAACAAAAGGCAAGAAGGGATAGGCCCCCCTGCTAAACAAAAGACGATAGAAGTTGACCAAGGAGGTTAGAAAACGAAACCGAGACTAACCCTCCGAGCGCTGAAGCTGATCATCCGAAGTTCGAAGCCAACCATAACCAAACGAAGAGGAGACCCTCACGATAAAGCATCTAGGGGCTAGCCTTGGAGTATTCGAACTCAGAAGGGCTTATGTAACTGCCCAAGTGAAGTGAAGAGGAAATCAACACACAAATCGACACGAGTGAGAGTTATACTCTTAAATTGGGCTTAGGGCGTTTGACCTATAGCAACAGGCCATCCTTTAATCCCAATTCAATAGAGGGGGCTTAATGTTATGGGTGAATTTGGACCTAGCCCTAAGAAAGTCAGAATGACGAGAGCCCAGAGAGGAAACAAGCCCACGAAAGCCCATTGGGCCCGAATTAATCTCTAGGGCTATTCCCTCTCCTAAAAGGAAGGGGAAAACCCTAATTTCAGCTATAAATAGAAGAGACTAACGCCAAAATAGGGGGACTCTACTTGGTATCTATTTTCTTTCTCTATATCATTATTTAACTTGCTTCACTTACGATCTCTCGACTGACTTAAGCATCGGAGTCGGTGTGGCAAGCACCACATCGGTGCTCAGTTTTCTCTTATTTTGCAGGCCACGTCTTTCCCCTTCAAATAAATTTACCGTTGATGTCACGTGGTCAGGTGAGTCGCTTGGCCAAATTTTGGCATCAACATGTTACACACTATCAAGAGAGGAGAAACTTTGTTTCTAAGATTTTATCTGAAATCAAAGTTCCTGAAGAGTATTCTTCAAATTCAAAATTCTTGTATCAGTAGAAGAATTGAAAGTTAATGGACTTAAATCTCACGATTGTCATGTTCTAATGCAACAATTGCTCCTAATTGCATTGCAGTCTATCTTACCTAAACAATTGCTCCTAATTTCTTCACAATAACGATTTATCTTACTCTTCACCTTGTTAGGAAAGTGAACTTTGTGGGTCCATTTATCTACGATTGATGTATCCTTTTGAAAGATATATGAAAGTATTGAAAAGATACATGTGAAAGTGTTAATATCTAAAATACGGAAGCAATTTTGGATCTTAGGCACATAAGAAGCTCAATTTGATCAAACATTGCATGTTGTTCATATGGAGAAAAACAGAGACAGTTTACCAACCTTGCTTAAATGGAGAAATTGGTTGGATTTGCTTCTTGTTTTTCTTCACCAATTGATCACGAACCACCATTGGATTTTCCTTGCTATCCTCAAGCCTTTGAAACGGATTGTGGGATCCTCAAGTGATGGAATTTATGGAGAAAAGCTTGAAGAACAAGCATATGAAGGTAGGTATGGTGAGTATGTATTTTGGCAGCAATTCCTTAGCTTTCAAGCTTGATTCTTTCAGCCTTCTTCTTCAGTTATATAGAGGGAACAATGTGGAAGAAAACTCACAGCAATTGACACCAAAACATCCAAGAAGAAGGTGGGATTAGTGGTGGCTTTCATGAGGGGAGTGCATGGGTTTAGTCACCATGCACTCCACCTCCAAAAATTCAAAGTTTTTGAATTTAATTTAATTCCATAATTATCTTTAATATTTAGATAATTATCTAATTTTAATTAATCTGAAAAATCAAAATTGATTTTTCAATTTTTCAATTTTTCAATTTTAAATTAATTCAAAATTAATTTAAAATAATGATTAATTAAATTAATTAATTATTAATTTAATATCTAATATTTAATTAATTATTAATTTAATATCTAATATTAAATTAATATTTTGCCACTATTCCCAAACATTTCTGAAATGTTATTTTCTTATCATGAATCCTTATTCATGTTCTCAATATTTAAATCATATTTAAATATTAAATATCACACATACTCGGTTTTCACAAAACCCGACGTACCGACAACGCCTATCACC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ATTTTAACCACTTTTGAAACCATTAAAGAGTTATACAAAATAGATAAAGTGAGAGCTATTCAGCCCCGTGGATACAATAAATTACTTATCACTTGCTGCGGATTGTGTATGCTTGCACAGTGTTCTAAAGTCTATTTTTACTATATTTTTATCCACTCTGGAAGCCCAACAAGTTTTTGGCGTCGTTGCTGGGAACTTGAATAAGTTTTTATCTAATCTGTTTTGTGTATGTGTTTTAGTGGTTTGGTGCTAGAACTTTTTGATTATTTCTTTTGTTTTTGCAGGTGTGAGTTTGGTGCATGAGCGATCCGCCTGGGGTGAGGTTCGAGCTTGATCCAGAAATTGAAAGGACATTCAGGAGAAGAAGGAGAGAGCAGCGTAGAAATACAATGGCTGATGTGTCGTGTCTCCCGGAAGTTCCAGAAGATCTAGTGAACCCCTAG

mRNA sequence

ATGATGATGTTGAAGGTCTCGGTGACAATGACAGAGCCGACATGCAAGGAGCTGAGGCTAGCCCGTAGGAGGCCGACGCCCACAAATGCCAATAAGGAAGAGTTATGCGACATGAAAACACTAAGAGAGGTTGACGTATTTCCTCAACCTCCCCAAGTCCCCAACAAGAGTGTACGCACCCTTGGGATGAAATTAATTCTTGCAGAGGGGTTGACGTATTTCCTCAACCTCCCCAAGTCCTCAATAGAGTGTACGCACCCTTGGGATGAAACTGCCCATACACTTCATCTGAGTCAAGCTCAACTGGCAGAGGCTGAGGCCGAGCACATCTTGCCGAGGCCGAGCATAAACTTTAAAGACAGTTTACCAACCTTGCTTAAATGGAGAAATTGGTTGGATTTGCTTCTTGTTTTTCTTCACCAATTGATCACGAACCACCATTGGATTTTCCTTGCTATCCTCAAGCCTTTGAAACGGATTGTGGGATCCTCAAGTGATGGAATTTATGGAGAAAAGCTTGAAGAACAAGCATATGAAGGTAGATCAAAGGATAACCCTAAACAAACAGGAGTTCATAGCAAGCTCAGGATTAAGATCGAGTTACCTAGGTCATCGTATGAAATAGTCAGTCTTAACAGTAAACGGCGTTATAAAGATCACGTCGTTTGCCTTATTCGCAAAGTAGGTCGCATCCATTGTGTTACCAGAACAAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTATGGATACGGCCCGCTTTGTATATTGATACAAACGCAATGATCCAACGTGTTCGTGTAGTTGACATGCGAGTGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCACTAAGGGCTTTGAGGAAAATTTCTAAGGGTGGATTGAATATTCGAAGGGGTTCGATTATTCGGTTAAACGATCCGCCTGGGGTGAGGTTCGAGCTTGATCCAGAAATTGAAAGGACATTCAGGAGAAGAAGGAGAGAGCAGCGTAGAAATACAATGGCTGATGTGTCGTGTCTCCCGGAAGTTCCAGAAGATCTAGTGAACCCCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGATGATGTTGAAGGTCTCGGTGACAATGACAGAGCCGACATGCAAGGAGCTGAGGCTAGCCCGTAGGAGGCCGACGCCCACAAATGCCAATAAGGAAGAGTTATGCGACATGAAAACACTAAGAGAGGTTGACGTATTTCCTCAACCTCCCCAAGTCCCCAACAAGAGTGTACGCACCCTTGGGATGAAATTAATTCTTGCAGAGGGGTTGACGTATTTCCTCAACCTCCCCAAGTCCTCAATAGAGTGTACGCACCCTTGGGATGAAACTGCCCATACACTTCATCTGAGTCAAGCTCAACTGGCAGAGGCTGAGGCCGAGCACATCTTGCCGAGGCCGAGCATAAACTTTAAAGACAGTTTACCAACCTTGCTTAAATGGAGAAATTGGTTGGATTTGCTTCTTGTTTTTCTTCACCAATTGATCACGAACCACCATTGGATTTTCCTTGCTATCCTCAAGCCTTTGAAACGGATTGTGGGATCCTCAAGTGATGGAATTTATGGAGAAAAGCTTGAAGAACAAGCATATGAAGGTAGATCAAAGGATAACCCTAAACAAACAGGAGTTCATAGCAAGCTCAGGATTAAGATCGAGTTACCTAGGTCATCGTATGAAATAGTCAGTCTTAACAGTAAACGGCGTTATAAAGATCACGTCGTTTGCCTTATTCGCAAAGTAGGTCGCATCCATTGTGTTACCAGAACAAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCCTGGTGACACTATGGATACGGCCCGCTTTGTATATTGATACAAACGCAATGATCCAACGTGTTCGTGTAGTTGACATGCGAGTGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCACTAAGGGCTTTGAGGAAAATTTCTAAGGGTGGATTGAATATTCGAAGGGGTTCGATTATTCGGTTAAACGATCCGCCTGGGGTGAGGTTCGAGCTTGATCCAGAAATTGAAAGGACATTCAGGAGAAGAAGGAGAGAGCAGCGTAGAAATACAATGGCTGATGTGTCGTGTCTCCCGGAAGTTCCAGAAGATCTAGTGAACCCCTAG

Protein sequence

MMMLKVSVTMTEPTCKELRLARRRPTPTNANKEELCDMKTLREVDVFPQPPQVPNKSVRTLGMKLILAEGLTYFLNLPKSSIECTHPWDETAHTLHLSQAQLAEAEAEHILPRPSINFKDSLPTLLKWRNWLDLLLVFLHQLITNHHWIFLAILKPLKRIVGSSSDGIYGEKLEEQAYEGRSKDNPKQTGVHSKLRIKIELPRSSYEIVSLNSKRRYKDHVVCLIRKVGRIHCVTRTRDKAGYLILVTLWIRPALYIDTNAMIQRVRVVDMRVGVSCAMSPLGPTGSSLRALRKISKGGLNIRRGSIIRLNDPPGVRFELDPEIERTFRRRRREQRRNTMADVSCLPEVPEDLVNP
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg020849.1Spg020849.1mRNA