Spg018909 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg018909
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold12: 26796887 .. 26807009 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg018909
SyntenySpg018909
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptidethree_prime_UTR
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mRNA sequence

ATGCAAGATGGAATTCACTCCTTTCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTTATGACAGAGTTTGCTCTGCCGAGCGTATTGAGAAACTCTATGCCGGTATGACTAGAGATAAGGGTACGGAGTTAGTAGCGACTGAGTTTCGACAAGCCTACAGAAGCCGATCTTGCCACTCGAGTCCGTGTTTAGAGTACCTTTTGTATGGTGGCAAGACTCGTAGGCTACAAGACATCGAAAGTCAGAGAACTACCTGCAGAATAGATACAATGGTTGAAGGTGATGTAGGAGGGTCAAGTCACGACCGAGAGGAGTCTCAAGGGAAAAGAAGTGTGGAGGAAAAGCAAGAACTGATGACCTTTCTTGCTGCCCAAGACGCACAGCGTCGAGACGCTGTGACGTCAGGTTTTCTTGGAGCAGAAGTTGTCGCAGCGTCGCGACGCTACCGCGATTCTGGAATTTTCTTCACTGATCACCTAGCGTCTCGACGCTCTGGTCCTAGCGTCAAACGGAGATCGGGACGGCCTACGACCCGAATTTCTCTCATCAATAGTACTTATGACAGAGTTTGCTCTGCCGAGCGTATTGAGAAACTCTACGCCGGTATGACTAGAGATAAGGGTACGGAGTTAGTAGCGACTGAGTTTCGACAAGCCTACAGAAGCCGATCTTGCCACTCGAGTCCGTGTTTAGAGTACCTTTTGTATGTATATGATGTTTCGGATGGAAGTTATGTAAAAGTTATATGTTGTAAAGAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCAAGATGGAATTCACTCCTTTCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTTATGACAGAGTTTGCTCTGCCGAGCGTATTGAGAAACTCTATGCCGGTATGACTAGAGATAAGGGTACGGAGTTAGTAGCGACTGAGTTTCGACAAGCCTACAGAAGCCGATCTTGCCACTCGAGTCCGTGTTTAGAGTACCTTTTGTATGGTGGCAAGACTCGTAGGCTACAAGACATCGAAAGTCAGAGAACTACCTGCAGAATAGATACAATGGTTGAAGGTGATGTAGGAGGGTCAAGTCACGACCGAGAGGAGTCTCAAGGGAAAAGAAGTGTGGAGGAAAAGCAAGAACTGATGACCTTTCTTGCTGCCCAAGACGCACAGCGTCGAGACGCTGTGACGTCAGGTTTTCTTGGAGCAGAAGTTGTCGCAGCGTCGCGACGCTACCGCGATTCTGGAATTTTCTTCACTGATCACCTAGCGTCTCGACGCTCTGGTCCTAGCGTCAAACGGAGATCGGGACGGCCTACGACCCGAATTTCTCTCATCAATAGTACTTATGACAGAGTTTGCTCTGCCGAGCGTATTGAGAAACTCTACGCCGGTATGACTAGAGATAAGGGTACGGAGTTAGTAGCGACTGAGTTTCGACAAGCCTACAGAAGCCGATCTTGCCACTCGAGTCCGTGTTTAGAGTACCTTTTGTATGTATATGATGTTTCGGATGGAAGTTATGTAAAAGTTATATGTTGTAAAGAGTAG

Protein sequence

MQDGIHSFPTLGKQMSYDRVCSAERIEKLYAGMTRDKGTELVATEFRQAYRSRSCHSSPCLEYLLYGGKTRRLQDIESQRTTCRIDTMVEGDVGGSSHDREESQGKRSVEEKQELMTFLAAQDAQRRDAVTSGFLGAEVVAASRRYRDSGIFFTDHLASRRSGPSVKRRSGRPTTRISLINSTYDRVCSAERIEKLYAGMTRDKGTELVATEFRQAYRSRSCHSSPCLEYLLYVYDVSDGSYVKVICCKE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 88..110
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 93..110

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg018909.1Spg018909.1mRNA