Spg017497 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg017497
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold4: 40485391 .. 40493980 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg017497
SyntenySpg017497
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GACAAACTTGTGGGTAACGCCCCGATCCAAAAAACAAACTCCTCTTCCTCGTTGGAAGGGGCTTCCAAAAAAGAATGAGGGAAACTGAATGTTGCGATTCGCACAAGCTCGTTGGCTATGGCGCTACAAGAATGGGGGCAATAAGAGAAAAAGATCTCTTCTTCAGCTTGCTTAATCTACTTCTTCAAGGAGGAAAGTGATTTTCGATTAGTTTTCTTCCTCATTGTTCAGAAGCTTCACAACACCAGAGGTGTCCGATTCAACCCAAATTAAGGGAATTGAAAGATCTGGTTTGGACGCTCTGATTGAAGGTAAATATTTTAGCCCTTTGACTATGGCTTTCATCTTGAGAAATTTGACGGACCAGCTCCTGTTGATCCTTTTGTGGCCCGCATTGTAGATTCGGAAGAGTCACGCATTATCCGGTCCTGCCCTCCCCTCTTCTTCGACTCGTTCTAAGAGGCATCCACATTCAGCTTCCAAGTGCCACACAAGGGAGGAGACCACTTTGCTTGACTCATTGGACTCTTCAACCTTGAGGGGGAAACCTTATCTTCTGATCTCAGGTTCTCTTTTCGCTTTGAAGTTTTAATTGGAATTTTACTTTTGATGACGGTCAAAATTTGATTCTGGTTTGGCTTGTTGTGATTGTGTAAAATTCTATTTCTGTGGTCCCATAAGTCCCAAAATATGATCACGACAGTCTCTAAATCCTCTGCATTCAAGTTTTGGAGGCACCACTTCCAGTAATCTGTTGGCTTCCCCCCGACCCTGATCAAACCAAAGAGATTTTTCTGTTAGGGGAATAAACATTTGCCAAGTGCATTTGGCTATCTTACAATTCCATAGGAAATGGGTTGTCGTCTCTTCTTTCTTCCTACAAAACAAACAACAAGGGTTCATATCGATGCCTTTTTTTTTCTAATATTAGATTGAGTAGGGAGAGCATTGTGGATAAATCTCCACATACAGATCTTAGCCCTTGGGATAGCTTTGATTTTCCAAAACTTTCTCCAAAAAGGTTTTGCTTCATTAGTAGAGGAAGAAGAAGTCTTGGAGCTGTTATGAATTTGAGAGGCTAAGTGATACGCGAATTTGACTAAGAATGTTCCTTTGGGATCAAAATTCTAGATTATCTCATCTTTTCTCTCTAGACCTCTTGTGGGAATGTTGAGAATAACTGAGGCATCTGAAGGCGTGAAGCTATCTACGATCACATCCTCCCTCCAATTACCATATTCGTCCAATATATTGGCAACAAATCTTCCTTTATGATTATCTCTCACCAAGATAGGGAAACGACTCCCTTGGTTAGCTATTCATGGATTTTGACCTATCTTAACATGGTGTCCATTACCTACCCTCCATCTGTAGCCTTCCTTGAAAATTTCTCGACCCCAAATGATGTTTCTCTAGGTTAAAGAAGGGTTGTTTCCCAACGGGGCGTTTAGGAACTCCCTCCCCTTGAAATACCTTCCTCTAAGTGTTTTTGATAATAGGGAGGTAGGCTTTTTTATGATTCGTCAACTCAGCTTAGCAAGCATAGCTTGGTTGAACAATTTGATGTCTCTAAAACCCAGCTCTCCTCTATCCTTGCTTGAACATAGTTTGCTCCATCTAATCTAATGGGCTCTATCCTTTGAGTTGGAAGTGCCCCACCATAATTTAGCACATAATTTGCTAATCTCTTTGCATATGTAGTTTGACAACTTGAAGCAATTCCTGGTATAGGTAATTGGGATGACCTGAACTATAGCCTTTATCAGAACTTCTTTTCCCCTTGCAGAGAAAAGCTTTTCTTTCCTTCTGTTTGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAAGGTAACATTTGACCGATTATTAATAAAATTTTATTGATGTATTTTTCAATAAAGTGTTATTGTTTATATTATGTTTATCTTGCCTAAATAACCCTAATCCGATAAACTAACATCCTAGGCTGTAAAAACTTGATGTGAAATTTTCCTACCGCAAGCGCACGAGTCAAGTAATAATAAAGTGATTTTGCAATCAAGTGTCGTCCTCTGGATTGGATTTTTAAGTTAAATTAACTACCATGAATATTCTTGCTCAATTTTATTTAGGGACCAAAAGGTAGTGAGTTTTGGAAACAAAGAATATGCAAATTAAAGATGTGAAATTCAATTGAGAGAATACTTAGGAAATTGATTTCGTCAATTTAATCTAGGATTGATTTTAGGGAATGAATTATAACGCACAATGGTTTTATGAGTCTAAGAACCTTTAATCACAACTACCTCTCCCGAGTATAATTGATTCTCATGCAAATTAACTAACTTGATATCCCTATCTAAGTTCTTTGATATGCAAGACATTTAGTTCTTTTTGACCAATTCTAAAGTCACTCTAAATCCCGTCAAGATTTTAGAAATTCTACTTTAGTCATGCAATCTTAATTAAGTCTACGCTAAATCCCCTCTCCCGAGCAAGACTCAACACTTGGATCATTCAACTAATGACCAATTAATTGAAAGCATTAAATTAAGAATGCAAACATAAAACAATTGCACAATTCAACCCATAAATCAATCCATAAACTAAAAAGACTACATCAATCCCTAAGTAACAAACTTAGCTACTCATACATGGCGTTACAAGATAAACTAAGCATGAAAAAGCCATTAAAAACTAACTAAAGTAAGAGGGAAAGAAGATTAAACACTAGGTGGCCGAGACCGCACGTCCCCGTCACGATCTCCACGAACAAAGTCTTCAATCCCGCTCTCCACCACTTACTTCAGCTTCCAAAGAGGGTTTTTCCCTCTGTTGTCGGCTCAAAATCTCCCAAAAGAAGTCCTCCAAAAAACCCTAATCGCAAAATATAAATAGGGAAAATTTTGGTCGCAGCGTCGCGACACTATAGAGGCAGCGTCACGACGCTATAGAGGCAGCGTCGCGATACCGTGATTCTGGAAAATTCGCCGAGAGCGTCGCGACGCTATGAGTTTTTTTTTTTTAGAATGAAAACTCCAAATATAGAATGTCAGCGTCGAAACGCCCAAAGAGCAACGTCTCGACGCTGGTATGCGGATGAGCCTATCTTCAATCTTCCAACTTTGATTCTTTTTTTATACTTCGACTTCTTTTTGCATCCCGAACATCCAATTGGCTCAAAACTATATTTCCTACAAATACAACACATAAATGCATAATTTTGGCCAATAAATTATAAAAGACTAGCTAAATTAATTAGGGAAAACTAGCTAGCTATGCTTGCTATCAGTTATATGAGTCTTGAACTGTATGTGGGGACATACGGGGATCACTGTTCAAGATACAGCCTAAAGGGTCTATAGTATAAGGATAAGGTTGGGTACGTTATCCTGGTGACACTATGGATACAGTCCACTTTGTATTTGATACACACGCAATGATACAACGCGTTCGTGTAGGGGACATGCAAGTGGAAGTATCCTATGTAATGAGTTTGCATAAGACCGGACCGCAAAATAGTAACTGTTAGTTGTAACACCGTTGACTAGTTAGGTTTCTATTTCACTAGGATGACCTAGGCCACTTAGTCTCAATCCTGAGTGAGTTATAAACTCTTGTTTACGAGAGATTGTCTTTTGATTTGTATGTGGGCGAGAGTGGCTAGTATGTCGACCCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGGAGCTGGGAACACATAATCACACAAGATGAAATTCACTCATTCTTGACTTTAGGGTAAGTAGATGAGTGTTCTCTTAAGTGGTGTCTCTGGGTCTTGAATAAAGGGCTCTACCCTCTCATTGGCCTAAGAGGGGTTTTTGTTTATTGGTAGGACCATAAATAGGTTGTTCATTACAGGAGCATTGGTACTTAAGGATGTAGAGGTAACCTAGGGGTAAATCAATAATTTGACTCAGTTGGTGTTATGAACACTTATGAAGGACTAACTTGCAGTTATTGGTCTATATTCGTGGACACAGAAATATATCTGTAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGGGTCTAAAGTGGAGTGTACCCACAGTTAACGAATATTGATTAACTTTGTGAATGAGTTTAGCCAATTAATCTCATATTGTTGGAGCTTTTGATATGTAGGTCCATTAGGTCCCACTGGTAGCTCATAAAGGGTATTGAGGTAATTAAAGTAATTTGAAATGTTCAAATTTACTAAGGGAAATAATATAATGTATGGAGATATATTATATTATAAAATTTATATTTTAATTGAACTTTATAATATAAATTTATTTTGTACATTAAAACTATAGGTTATATGAGAGAAATATAACTGAATATGACTCAGTTATGGATTGAATTAAATATATGATATTTAATTTGGTAATTAATTAGTTAGTGAATGAATGAATGAATTTAATTTAATTTAATTAAATTTGATTTAATTAAATGAATTAAATTAAAACTATAGGTTATGTGGGAGATGTTCATTTAAATATGATTTAAATCAAACTGTTAATTAAATATTGATTTAATTAATTAATTAATTATTAATATTTAAAAAAATTAATTAATTAATTAATATTTTTTTAATTAATTTATTTATTTAAATTAAATTTTTATCATAACTGATGGATCAGTTATTGGCAACACGTGGAAGCTTAGTCTTCCCTCTCCCTAACTAAACGAGTCGTGCGCCTAGTTACCTGCAGTTTTGGCTTCTCCCTCCTGTTTAGGCGTGTGAGATACTGGTAGTGATCATCGACCATTTTTGTAATCTCAGGAAAAAATTCTTCCATCTCTCAGAACTATCCATAAAGAAAAACCAATCTTAGATTTTCCCTATCAAAGGATCCCACCATCCTCCTATCTCAGAACCTGGGAGAATACCGGTGGAATACAGTGGTGGTGTACCTTTTTGTTTGACAAGATCGTGGTGAGTTACTGGAATTTGTAGAAGAGAACGTGATCCCAAGGAGTTGGTGAACCGATCAAGTCGTCAACGAGAGTAAGTCTTCT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mRNA sequence

ATGAATTGGATCCGAAATAAAGTCGTATCGAATACCATCTTTTCTGGTGGATCAAAAATCATTGTTAGCCCTCGACGGAAGCACCAAACTCATCCCATGACATTTGGAAAAGCCTCAAGATTAATTAATCCAGTAGATGTAATCCCCCCTACCAGACGACGTCGGAGATTCGACGAAGCCTTCTCTATGCCCAACTCGTTTGCGCTAATTTCTAAAGCTTCTTTTCGGGAGAGCTTCAGCGTGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAATTGGATCCGAAATAAAGTCGTATCGAATACCATCTTTTCTGGTGGATCAAAAATCATTGTTAGCCCTCGACGGAAGCACCAAACTCATCCCATGACATTTGGAAAAGCCTCAAGATTAATTAATCCAGTAGATGTAATCCCCCCTACCAGACGACGTCGGAGATTCGACGAAGCCTTCTCTATGCCCAACTCGTTTGCGCTAATTTCTAAAGCTTCTTTTCGGGAGAGCTTCAGCGTGTGA

Protein sequence

MNWIRNKVVSNTIFSGGSKIIVSPRRKHQTHPMTFGKASRLINPVDVIPPTRRRRRFDEAFSMPNSFALISKASFRESFSV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg017497.1Spg017497.1mRNA