Spg016741 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg016741
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold9: 41822911 .. 41836604 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg016741
SyntenySpg016741
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACTCACAAGGTTCTTTGTCGGGGGACAATATTTCAGCTTCAAAGTGACCAGGTTCTCCTTTGGCCTTAAAACCCATTGCTCTGGTCTGCTTTCGATGATGTTAGTAGTTGTGATTTGGTTTGAACTGCTGAGAGCTTGGTTAACGATGTTCCTATAGTCCCATAAACTCCATAGAATAATGACAATCTTTTTCATCTCTTTTTCAACCAAATTATCCATCAACCACGACTAGAAATCAATTGGATTCCACGTTCCCTTGTTCGTGGCAAACAAATTATCCGTAAGGGAATGAACGATTTCCAAATCTTTTTAGCCAACTTACAGCCTCAAAAGATGTGTTTAGAAGATTCTTCATGAGTCCTACAAAACAGACAATAGGGATTAGTGGATATTCCTTTTCCAATAATATTCAATTTCACAGGAATAAGGGAGTCATGAATTATCCTCGAAAGCCATAATTTTGCCTTGGGGATAGCTTTAACTTTCCAAAACTTTCTCCAAATGGGCTTAGTTACGAACAAATTGGCTCTTATGTTAATTTTCCACTCTCCTTTTCCAATCCCTACAAATCAAATAAATAAATTGTCAAAGCAAGCATATTCCAACAGTAATTGCCGTGTATCATTGACCAAGATGTCAGAGGTTCGAATCCTCCCACCCTCAAATGTTGATATACTAACCAAAAAAAAAAAAAATGAATAGATTCGCATTTTACCGTTTTTTAATTTTTATTTATTCATTTTACCACTTTTCTTTTTAATTCATCTTACGGTGTCATTAGTTTAATTTAAATATTCAATTTTTTATTTCACCTGATTGAATCCTAGATTTGAGTTAAGTTATCCCCTCCTTCGCCCCAGAAAATATCTTCGTACAAGTGGCACTTGAACCCTAAAATATCTTCATCCTTTCATGTGCAAAAAATAATATTTAAATAACTTTAATTATTTAACTTTTTCCAAAGCCTGACACGTAGCAAAAATGGGTTCCCCAACTCGCTTTCGTACTTGTTCTTTTAAGAAAATTTATATAAAATAAACTTTTTGTTTATAATTTCTTTACTGTTTGTTCCCCCACTTTTCAGTAGATATTTAATTATTTATTATCCTAATGGAATTTAAAAATAACTATTTGCTTGGTTTAGAATAGACGACGTGTTCGATTTTCGTTCGCTTATTATGCCACGTAGACGAACCTAATTCTTTTCACATCCGCACGTGATCTGGAATTTCCAGCCTGTTCTCACGACACGTCTTCGACGGGAAAAATTATCTAGGGGTGCCACGTGGTATTAAGACAGGCATCGCTTCGCCACGTAAGCATTCCTAATTCTTCATATTTGATTTATTAATTCAGAAATAAGACGTGGATATTGGTTTTTTTTTTTTAAAAAAGAGAAGTGGATATTCGTTAGTTTTTTCGCACGTGCGTAGAAAATCCCTCTTTTTTTTAAAAAAAATATTTTCTTATAGATATAATATGATTCTCATTCAGTTAAATACTTTAGATTGTTAACAAATAAATGGAGTAATTACATTTTTTATTTGTTGAAATCAACCACAAGAAAGACGATGTAAGAACATAACTCAACTGGTATAAATTGATCAATAGATCATAGGTTCAATATTTGACTCTTACATGTTATAAAAAAAAAAAAAAGGGCAAGGTGGCGAATTAAAAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAGAAAGGCGATGTGACCATCCTAAAGCTACCAATCTCTCTAGTAAAGGGTATTTGGATTTAAGAGTTGGGTGGAGTGGAATTCCGCTCAATTCCTTATTTGTTCGAATAACATATAACACTCAATTACAGGATCCATAAACTTATTTACCATATAATACTAGAAAAACATTATTTACAAAAAAAAAAAAAAAACTAGAAAAAAAAGGGAACGATTGAGTATTTAAATTAAAGTATTTTCTAAAATAAAAGAAAAAAGAATTGAATGGTCCGATTAACCACCCAAAAAAAATGTTGAGATCTGAATGAACTAAAAAGAAAAAGATAATAGTAAAAAATAAAATCAGAGACAAATATTTTTTTTAACTTGAAAAATTAAATATTGGAGAACGAAATTTGTCATGGAACATATTTTTATATTGGATAAATGTACAATATCGAAAATATTTTATGATATTATAATTTATAGCCAACTACAAAGTACCAAGCGTGCTAAATCCTCCGGCCTTCGTCTGTCACATCACGACTATAAATATCTCCTTTATTCTCGTTTTCCGTTTTCTTTTCGGGTGTCTAGAGAGATCATCAAACATCAGACTACTCTGCCTCTTCGTCGCTTGGTACCAGCGTCTTTGGTCTCCTCGCGTGAGGCATCGCATACAATCGTCCTCCATTTCTTCTACTCAGGTTTGCATTCTTTCGCTTTGAACTCTTCCTCGGATTTTTCTTCTTCTTCGATCTTCATCGCCCTCCATGTCCGTGCTTCTCAACTTATTTTCATGCTTACAATGCTTGTCTCTGGTATAATTTCCCGCTCTGATTTTTACTTTCATACTCGATTCTGCTGTTTTTACGGAATCTCAGTTCGATCGCTTTTCTCATCGAAAGGAGATGTCGTTTCGGAAGCCAGTTCTCAGATCCGTTCGGTTAGCTTTAATCCGCGAGGAGAAGAAAACTGAAAAAGGCGAGACTCCAAGCTCAACTGTTCCGCTGCCTGCGAATTACTAGGTAATCTTGTTTCTAGCATCCTCTTGTGAACCGAACGATGCATTACGATGTAGAATCGCTTTATTGCAGAATTCATTTTTCATCGTAAGTTGTCTACACGCTTTTACGTACTTTCTACGTTTTTCTTACCTGAGAACCAGTGCTTGATCTACGGCACGGTATTTATTTATAGTTCGTCTTTCCGTTTCACTACTGCAACTGTTTGGATTATTCTGAAGCAAACGTAAAACAAGTGAAGAACTAATGCGGTCTGGCTTTTATTTCATCTATCTGTGTCTGTGTGTGTGTGTGACATTATAATATGACGTTTGTTTATTTATTTTTAATTTGTCATCATTCACTTTACCTGTCAGATCGTTTATTATATTGAGATATTGACAAGGATGCTTGCTTTTGTGCTTGTACGTAATTTTTAAACTCGCATTTCATAACAATAGCACAATATGATATTTAATGATTTTATATCTAAAGAGAGTTGGAAATTATAGAGCAAGAAGTTTTATAGCTTCAAGTGTTTGGTTTTTTTGATACTGCTCGGAAGTTAGCGCTCAAAGTATTCTGGAGATAGCCACTAGTTTTCCATAATGTGTTTTTTTTTCTAAAGCATTTGAGATTCCTTGGACAAGATTATCTGTTTTTTATATTTGCGCCTCCGTAACTTGTTTGAACCTGAACCTAGGCACCTGATATTCAAGTTACTTATTCACTACTTGAAATGACTTCTGTCGCAGCATTTTATATCTACCGCTGTAAATTTTTTTTGGATGTTGACGACATCAGTATGATTTGCTTATAGCCTCCCTCCTCTTTTCTTTTACCTTTTTTTGTTTGTAAGTGATTCTGGCTTGGTCTGTAAAGAAAGGATCCTTTTATTTGCTATCTTGAAATAAATATAGGGATGATATTGATGATGGATCACAAAGTTTGAAACTCTAGAGCTTTGGGAGTAGTTCATATTTACCTGTTAAGGTTATCTAAGATCATACTTCTGAGACATGCCTGATGCTTTTGTTTGTTGAAACAAATCAAACAGACTTCTTTATATGATATTAATTGTAAATATTATTTTATTAATTAATAATGAGTTAGGACTCATGCTCTATTGAATGCTGCATTTGTCGCATTCATTAAAAGCATGATTTTAGTAGAATTGGTTATACAAGATCTTAAGTGTTCTGTCCGACAAAATCATCTTTGTAGTCTTTGTGATATAGGGTACTGTAAGTTTCATTGTTAGTTAGTTAGCACTCATAACTTTTGTTTTGGTACGCTAGCAGTCTTCTTTACCATGAAAACTGCGGCTAAACATTTGAGTTAGTAGTTGTTAATCTCACCTCCCGAAGCATGGAAGCAATCTTGAATGAGCAACAGTTACACACTATCTAATCTCTCGTTTATTCTGGATAGGATCTCAATTACTTTTAATTGCTTTGGCAAAAGGGTTTGGACCTCAAGACACGTCAGTTAATGTTTCCTCTCCGTTTTTTGGTTTTATATTTGCAACTTTCTCTAGATGACTACCTGGGTTTAGCAAACAATATTCAACGTTCACTTGGTTGGTGTTGGTGGGAAAATTCATCACAACCAGTACATTCCAAGGGTTTAGGGATTAGAATGATACATTATTTATAAAAATGGGGTTTTGGGATTAGAATTAAGTCTGTGCATTGTTCCCCCGTTTCTTTATTAATCTTTGGAGTCAGGTCTTTAATGCTTAGGCATTTCTTGCATGCATTAATCAAGAGATAAATGGCTTGACAAGAGATTTCAAATGGTGACTCTATCATAGGTAAAGCCAAAGCTCTTATAATTGTGAGATTACCATTCTTTGGCATCTTGGTTAAAGGAAATGAGAATAGCCTCAGCGAAGAGTTTAAATGAAGCCAACACATGGGACAAAATCCTTCTTAAAGCCTCTTCATAGGATGCATTGGCAACAAAATTTGGGCGTACGTATAGGTATAGCTAATGGTGCATACTCTTGTATTGTATCTTGTATAGTATTGTTTGTGGAAGTTGTCTCATTTATGTTAGTTTTTTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTAATTGTATTGTTTATCCAGTTATCTTTATAATTTCTTCTTAGTGAAATCACCAAGATTAATTAAAAATATTACAGTTAAAATTGTCAAAGAGAACTAGTTGGGTTGAATTTTGGAGCAATTGGGCGTTCAACTTGTTGCCTTCTTTAGGTATCATCCACACTCAAGATAATGAATTCATCTGCAAGGTTTACACTGGAGTAAACTCGTGTCTTCAGAAATAGGTACAACAAACTTCTTTAAGAGGCTGGTTGAATTCTTCCTCTAATGAATCCTGGCATGAACAAAATAACCACCATTTTCCATGTCTTGATGAATTAATCCTCTTAGTCTCCTTTGCATGGCAAAGTAAAACGTTGTGGTCCATCCTTATTTGGTGGTTTCTACGAACCAAAAAGTTGGTTGTTTTGGTTGGACAAAGATGTAGATTATGGATTTTATTGACAATTGACATTCTTGCAAAGTTGTACCAAATACCAATCACCCACCAGGTAGTAAACCCTTAAGAATAACTAACAATTAAATTTTCATGTCCTGAATAAGTATTTGATGTATGATAAACACTGACATCATTGATGAAAGTTTAAACGAGCTGCTGGTGCATGGGGGACCATAGTGATAGTTTCTTTTTGGGGCCATGAAAAGTCGCAATGGTGGGAAGTTGGGAACTGAGCAATTTAAATTTTCAGGAAGATGGTTCTATAGTTGATGATCTCAAGGACTTTGATAAAATAGTTTTTGGCTGTGTTCTAGAAGCTTTTTAGTGATAATCTCAATCCAGAATTAATCGATATCTTCGAGTGAATCCAGTATTTTACTTTTACATAATATAATTTTTTGGAAAATTTCGTTTAGAAGATTATGTAGGCTATGCTGATAGTCCGTGATTTTGGCTCACTATGATCATGATTTAGTATGCCCACACTGGACCATTAAATCATTGCCACATAGAACCATTAAATCATTTATTCTTTTGAAATGTGTTAGAATTTATTTATCATTTTGAGGATTTTACCCTTTTGCCATCCATCTATCTTGTTTTATATTAATCTTGCCTCTAAAATCAGTATGAGTAGTGAATTTGTCCTCATTTTGGTTTGAGATATTTACTTGGCCAGATATTATAAAATGAAATCTCTTACATATTCTTATGCAGCCTTTGAAATTGGTCATAATGGTTAGGAAACCTGGAGTGAGTATTTGACAACCTTGCTTTTGATCCCATATATCTGTGTCTTCCCTCCAGAATGGTTCATAGATATTCTTAGCTAAGCTTGGCATCCAACTCCTGCATTTTTTTTTAATTAAAAAAAATTATTGACTTATCTCTATCTAAATGAATCGACAATTAGGTAGTAACTAATAAAATGTGTGAAAATTCTTTTGCCTTTTGAGGAAGATCGCTTGTGTGTAAGTGATCAATTTTAAAGTTTGTGTATCCTTTCTGTTGTATATGTTACCTTCTTGGATTGTACAAACATAGATTATAGCAGTTGTTCCAGTCTAAGATCATTCCCTCTGATTTAGAATAGGAATGTTAAGAATGTGAGATGAGAACCATTAAGAGGCATGCTCATGAGGATTTTTAGTGAGGATGGTAGACATACATAAATTAAAGTAACAAAAGCCAATTTACTGAAGGTTTGGGTTGAAAATTTTTTGTTGGTGTCTAGCACCACATACCTATCTGTTGTGTTTCATCACGTTTATGGTGACCATCACTGAATGAAGCTTGCCACAAAGGTTCTTTGTGGCTTTTTATTTTAAAAAAATGTACATCACTCCACACCTAAGATGGGTCCTCTTGCTTTGATTACATTCGTTATTATTTGTGTTGAAGTCAGTTTTTCATCCTTATATCCTCATTGATGCAATTGTACTCCTTCTAGTGTGATTACCTAGTCCCCTTTCCTTTTAGTACATTCTTTTTCCCTAGTTAGTTTCTCCTTTCTTTCAAGTTCCTGCGGGTACCTGAATTCCATTATCTGTTAGTAGCTCCTCACATAAATATTTTATCATCTAACAGTCATAGTTGTGCATGGGATGGCTTGAAATGCAGTTTTAATTTTTTTGTTACTGACAATAGGAATAATTTAAGCAGATCTTAGCTCATTCTATTTTAGACATTGTGCACATTATTGTTAGATCATCTAACAGTCATAATTGGGCACGTAATAGGAATAATTATTGTGAATACGACATTGTGCACATTATTTCCGAGTAGTATCACCGTTGAAAATTAGTTTTATTTGTTGAGACCTTAATTATTATGAATATGACATTGTGCACATTATTTTCGAGTAGTGTTACTTTTGAAAAATTAATTTATTTGTTAATAACACCCTGTATGTCATGCAAGTACGGTCAAAAGTTAAGTTTTCTTTGTTTTTTGATCTCTCATGGGAGTTGGGTTATATACGATTATCTTAAAAATATCTATCTTTCGAGTTTAAGGGCCCGTTTGGAATACCTTTTATTTTGAGTGTTTTTCAAGAATACATTTTCTTTTAAACATTTTGTATAAAAATTGTTTAGAATTTAAACACTCATATGTTTGATTACATTTCCTTTTAAGTGTTTCTATACACAAGCTATTATATACTTGAGAACTATATTTAAAAAAATTGCTTTCAAGTGTTTCTCTCAAAATAGTTTATTTCTCAATCTCATTTTTTAACAAGTCATTTTTAGAGGTTGTTAAAAACTAGAATTTTTTCAAAATGATTTTTTTTTTTTCAAAATTAAACACTTGAAAAGTTAAACCAAACATACCCTAAGTTTGATGAGAATAATATTCTACTACAAGCACTATTATTCTTGATTGGCAGTCCTTCCTTTGAAGGGGACCTTTTTGTGGGCTGGTTATTTTTGTATGTCCTTGTATTCTTTCATTTTTTTCTCAATGAAAGTTGGTTTTATCTTAAAAAAAAAATACTCTACTACAAGCAATTCATTTTGACAGTGCTCTCATATGGCCTTTGGGATGAGCTGATGTTTGTGCAATTTTATGGGGCCTTTGGAGAGAGATAAATAATAGGACATTTAGAGGAGTTGAAAGGAACCTGAGTGATGTTTGGTCTTTCTTGAGGTTCTATGTTTTTCTTTGGGCTTCAATGATGAGGTCTTTTTATAATTATGCTTTAGGTCTTATTTTACTTGATTGAAGTCATCTTTAGTTTTGACTCTCTTTTTGTGGGCTTGATTTTTTATATGCCCTTATTCTTTCATTTTTTCTAGTTTGATTTTTCCATTTTAAAAGAATGAATTAGTGCTCTACTTTTTTTTTCCATCCTTTGCTGTAATAATATCCTGGGGTTTACAACAATAACTTGATATATTCAATGTAACTTAAATTTTGAAACAGGAAGGTTCTAGATCTGCTTCTGAACCTTTGAGCTTCACTAATTCAAGGTTGTTGGCTTTACGCTAGCTGGGAAATATTTACAAGTTAGTAGCTAGATTGTTTTCAATTCTCTAGTGGTCTTGCTTACTTTATAAGCTGAGTCTGTTATTAGGATTGTTTTTTACAAAAGTACTTTGAATATTAATTTTTTTTGTGATGTGCAATGCAATATACTCGTGAACCATTCATTATTCTTTTTGCATAATTTTCTGCTATGTCTGACATCACATATCCTTCGGGAAAGTTCTTGCTTATGTGATAAGGTGCTTCCCAAACTTTGGGCATATATTAGCAACCTGGCGAGCATAATCCTTCTTCCAGTTCCACTAGATTGCCTACAATTGGAACGTCTCATTTATAACTTCTATGAAGTCGAGGCTCTCCCCTTCCATATATCATTGATTGATGAAATGATGTTTCTTACTAAAAAAAATTGAAAATTTATGCAGTTTGGAATAGCATGATTTGGAGTGATGCACTGATTAAACTATTGTCTTGGATTTAAAATGTCTCCGTTTAGTAGAGATGGGAAATTATTTTTTTGTTAAATTTCTTTGCTGAATTGTGGCTTACTCTAATGTTATGCTAATTATCTTGCTAAACAGACTGCTGGATCAGTTGGCTGAAGTTGAGCAGGAGAGATACGAGGTAAATACTATATGACTTTCCATGATGAACATCATATACAACTGCTGGGTGAAATTATTGTGGATAAATATTCTGTTTAATCTACTTGTTTCCTGTCCCCAATGATTCTCCAGAATTTTTTTTTTATAATATCTCAAGCATCAGTCATAAAATAAGTATGAACATTTGAACCTAGCTGATTATAATGAAGGTGCCAAACAAACCTTAAGATTTCTGGAAAATGAAGTGTGCATGCCGATGCGATTTCAATTATTTTTTGTTGCACATAGCCTTCTCTTCACATAAATACCCTTGTCTTAATCACCACAAACGAGACAAAGCTGGTTTCTTTTGGTATGGAATAGTCCATTACTCTACCACATTTCGTTGATTGAAAGACAATTTGCAACCTTACACCGTTTTCTTGATGCAAAATAAGAAACATCTTCCTGGTTGGTGTAAGGTCTCTTTTTGTTAGCGTAGTTGTAGTCTGCTGCAACCATCAAAAGAACAAGATTGGAATAGTGACTCTGGAAAAGTTCATTTGTATTCATTATTGAACATTTATGAAATTTGTCGCAATTGTACCCCAGTTTTGTAGCTCTTTCCGGTGCCTCATGCTCTTGTTGCTGTGGTTGGCTGAGTTGAAGGTTGATAGGTATGCCTGCATCCTCTCCAACACCAAGTCCGTTTGTAAGACTGCTTATATGTGCTCCATTGGCATCCTTTGTTCCATAGACCTAGGATGGTGAAAATTTTCTTTGAAGGTGACTAAGCAACACAAAGTTTTATTGGTTAAACAATTAAAACCTTTAGTTTTTTATTTATCGGATATCCCCAAAGGGACACGTTTAGTTTCTTTTCAGGAACAATTAAAGTTTGCTTCAATTGTCTACATCTTTTACCTTTTTGTATAATTCCAGGTTTTCTTGACGAATTATGTTTACCTTCTTATAAAGTTCCAAATTGTCTTGGTGAATCAAGTTTCCCTATAACAAAGAGAAGGTAATTTAGTAACCAAACTAATTGAGAACAGAAAATTCAGAACTGTAGTTGCTTAACCTTTCTGTTTAGGTCTTGTATCTCATCCATTAAGATTTGATCCTGCTCAAACAAAGGAAAAGATCTGTAAAACACCCAACACATTTAACAAATGATACAGTTAGATACCTTCTTCATACGGACACCACGGAGACTTATCTCCAGTTGATTTTCTAGATTCTGTAGATCTTTGACGCTCAGGCCAGTCAGCTCTTCACCCATCATTTGCCTGTAATTTTATCCATTAGTGGTATTCTATCATAATGAATTAGGGGTTTGACTTGTATATCAGTTTTAGCTTGAGCCACATGCTGGAAATATATTAGGAAAATGTATGCTTGGTTCATGCTTGGTCGTCATTTGAAATAAGTGTACATGGTTACGATTGTGTGAACTTTGAAGTATATTGGAGGCTTACCACATATGGCCATTAAGGAGTTGAAGAAGATTTCATATTTGCATTTCATTCTATTGCATTTTCCTATGGTGTTAGTGTTTATCCAGTAACATGTAATGATATAGAATAGAAGAGGATATGTTAGTACCGATGATTTTCATGTAAGCTCTGCAGTTGCTGCCGTAACATTGCTGCTTCCCTTTGCCAGTACTAATGATTAAAAATCAGAATGTAATTTCCTTACTATAGAAGTATAAGAGTATGCCTTCTATATATGGGCGCAAAAATATATTAAGCTAGCATAGTTAATGAATGCATTAATATTCAAATATAATAGCGTGGACATTCTTTTCCACTCTACAAACAATATACATGTATGCTTATGATCAATTTTTAAGTGAAAAAGTGAATGTTGATACTAAATTGAACATTGAGCCTGAACTGCATATATGTAGCGAATGAAAATTTTGAATATTTAGATCTGACTAGTGTAACTGTTAGAGAGAAATCATAGTATTTTTAAGTTTTTCATTACGGATTACAATGGGATGTTAGCCTGGCGATGGGCAAGGGATCTTAATTCATGTACACCCCATTTCCTCTCAAAATCCTTGCCTACAACCCTTGTTCTCTCAACATCCTGGCCAGTGGCCTACAAGGCTACAATCCATTTCCACTTTTCGGGAACAAAGAATCCTATTAATGAGGATTGTGATTCTTATTTGAGCAAATTTTCTTGGTCAGTTTTTATTTTAGAATATTGAATAACATAAGAATTACTTAGATATGAATTGATAATGGTATAATTTTCGGCCAAAATAGAAAATTGTATTTTTTTTTCTTATTATTTATTAGTTTGTTTAATTTACTTTGTAGAAATATCTAATCATTTTTGTTAATATACAATGACAACTTAACTTTTCAGGTTTGTCATTTCACAAAAATAAACCCTTTCAGGTTTGTCATGTTGCTATTTTTATGCGTTCTGCTCTCTTTTATCTTTCTGGATTTAGATGTTGAATCATCTGTTTGATTTTGTTCAGCGACATCACTAGCTCAAGGATCCAAGATTCTTGATCTCATGATTGTGGTTTGGATTGTTCTTTCAGCATGTGTCAGGTAAATAGAAGGTTTGTGCCACATCTCTTTTAAGCAAAATAATTTGCATTTATAATTCTGAATCTTTGTCTCCGATGAGATACAAACATATCTCATTGACAGTAGTATTGGTGGGTACTAATACGTCCAAATTCACAATGATTCTCGATGAACTGGTCAAACCTAGATTTCAACATAAATCTAACCACATTTGATCCAGATCCATCATGATTGATGTTCTTGCTAAGTTGCTAGTAATTCACTTCGGGCAGTTCTTCCAATCCCAATTAAACTTCTGTTATACCTTAACTGCACTGTCCCAGACCCTCCCGCTCCTCCCCACCCCCACATTCCACAACATACTCGTACCAGCAATAACTGTGATGTATAATACTTATTAGTCATCGTATCCAGAAACTTAACTGATAGGAAATCTAGATGTTTGTGTTTTAACAAGCATACATGATCTTTTGCCTAATATGTCTGGCAGTCAGAAGGAAAAATAATTTAAGTCCCAGATGCTAAAGAATACCTTGACTTCAGAAGTCGAGACCCCAAGCTGATGGTGCTCCTCCTTTGTTTTGTTATATCGTTCTATTAGTGTTTTCATGCTGGTAAGATAGTCAATAATCTATGAGTTAGAGATAAAGTCCTCTTCCTCTTTCCGAAATTGATTATCATATGAAATTTGAAAAACATAATGATATGTGCAAGAAATGAAAATTTATTGGGAAGACATGAAAAGTTGAAATTTAACAATTACCTTGTGAGCATTCATCAATAAGATGAGCCTATTTACTCCATGATTTCCTTTCAATCTAGTTTTCCCAGTTAAACCTAGACTTTTAATCTCATGAAGTAGGCTCTTGACATTTTCAAGATTCTCCTCAGAGTTCTATGATGGAAATTCAAATTTGCTGGGTGGTAGAATGAAAATCGTAGTCATATGACAACATCAGAGGGGTGGTAAACAGGTTGACTAACATTTGAACCTTTTTTTCCTAGAACATCTAAAGTTCAAACAAATAAATCTTAAGAAGTTCACCTATTAATACAGATATAGTGAAATAATATTGAGAATTATGTTCAAAACAATACATGGTCACAAATAAAATTCATAATTTATTAATGTGCAAATTCAATTAACATGAAGAATATTAAAGCGACAAAATTTAAGTGGGTTAGAGAGTTTAAATGCAGATTTGTAATGTTTCAGCCTATAATGAAACCTAAACCTCGATGTGCCCTCCTTGAATATTTTAGTACCAGCCAGTTCTTTTTTGTAGGTGAGTACCAAACATCATCAACCTTCATCAATCTTTATTAGCTTAGGATCAAACCAATACAAAGTTTCCATAGTAAAGTCGCGATAAAAAGTGGATTTACCAATTTCTCCTGATCCCAAAGAATTTCTACACTCTTACAATGAATCCTTCATGAAACTCTCTCCCAAAAGTTATAGAAAATAAAGAGGCTCGAAAGGATTTGCAACTCAAAATTTGAGAGTTTTTTCAATTAGAGGCTTTCTTCTCGAAGTGTTTGAGCACGTCTAGGAGTTTTCTTCTTGAAGTTTGATTATGTAGACTTGTGAGACCCAGGCATGAAGTTGTCCTCTAGTTGATGCCAAGATAAGAGTCTAGACGGTCATGTGCACACCACATATCAGCATTTCAGTTATGTTCAAACATAAGCAGTTTGGTAGCTTGGCAAAGAGAAATGACTTGGAATTTAATCATTTATCCGAACTGTCGCCCTCCCCCATCCCCACCCCCAACCTCACAAAACATCAAACCGACTAAAAAAAAATCTCAAACCCTACCCTAAGGGAACAACAGAATCCAGAAATATCTCTAGGCCTCTACTGAAAAGGTACTTGGAAGCTTTTTCCACTTCGTTTCAGCAATCATTGAGTATTTTATTCAGTATAGTTGCTTGTTTAATTTATAATATGGTTTGAACAATTCCATTTGAGTTTTGTTTTAGAGCTACCTTTTCATATATAAATGAAAACCAATATGGAGATATTAAAAATACCCTTCATTTTATCTTCATTGACTATCATTTAATCTATCAAATAGTTCTACACATGCCAATATGAGCATAGCTCAACTGGCATAAACTTGTACTACTAGTGGTTCGAATCTCCCAACCCCACCCCACATGTTGTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAATAGAAAAAAGTTCTACACATAGTAGTTGATTATATTTATAGAGGCATGCATCGTGCACTTGAATGTCTTTCAATCTAATAACGCAATCTTAGGTATCTAAATTCATGGAGCGACACACTGATCAAAGCAAAGGA

mRNA sequence

ATGACTCACAAGGTTCTTTGTCGGGGGACAATATTTCAGCTTCAAAGTGACCAGAGATCATCAAACATCAGACTACTCTGCCTCTTCGTCGCTTGGTACCAGCGTCTTTGGTCTCCTCGCGTGAGGCATCGCATACAATCGTCCTCCATTTCTTCTACTCAGTTCGATCGCTTTTCTCATCGAAAGGAGATGTCGTTTCGGAAGCCAGTTCTCAGATCCGTTCGGTTAGCTTTAATCCGCGAGGAGAAGAAAACTGAAAAAGGCGAGACTCCAAGCTCAACTGTTCCGCTGCCTGCGAATTACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGACTCACAAGGTTCTTTGTCGGGGGACAATATTTCAGCTTCAAAGTGACCAGAGATCATCAAACATCAGACTACTCTGCCTCTTCGTCGCTTGGTACCAGCGTCTTTGGTCTCCTCGCGTGAGGCATCGCATACAATCGTCCTCCATTTCTTCTACTCAGTTCGATCGCTTTTCTCATCGAAAGGAGATGTCGTTTCGGAAGCCAGTTCTCAGATCCGTTCGGTTAGCTTTAATCCGCGAGGAGAAGAAAACTGAAAAAGGCGAGACTCCAAGCTCAACTGTTCCGCTGCCTGCGAATTACTAG

Protein sequence

MTHKVLCRGTIFQLQSDQRSSNIRLLCLFVAWYQRLWSPRVRHRIQSSSISSTQFDRFSHRKEMSFRKPVLRSVRLALIREEKKTEKGETPSSTVPLPANY
Homology
[Close]
BLAST of Spg016741 vs. NCBI nr
Match: KAG6591706.1 (hypothetical protein SDJN03_14052, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 8.1e-08
Identity = 38/49 (77.55%), Postives = 40/49 (81.63%), Query Frame = 0 

Query: 49 SISSTQFDRFSHRKEMSFRKPVLRSVRLALIREEKKTEKGETPSSTVPL 98
          SISS QFD F HR  +S RK VLRSV LAL REEKKTEKGE+PSSTVPL
Sbjct: 3  SISSVQFDHFLHRHGISPRKIVLRSVWLALNREEKKTEKGESPSSTVPL 51

[Close]
BLAST of Spg016741 vs. NCBI nr
Match: KAG7024588.1 (hypothetical protein SDJN02_13406, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 1.1e-07
Identity = 37/53 (69.81%), Postives = 42/53 (79.25%), Query Frame = 0 

Query: 45 IQSSSISSTQFDRFSHRKEMSFRKPVLRSVRLALIREEKKTEKGETPSSTVPL 98
          + S+   S+QFD F HR  +S RK VLRSV LALIREEKKTEKGE+PSSTVPL
Sbjct: 5  LYSAIFMSSQFDHFLHRHGISPRKIVLRSVWLALIREEKKTEKGESPSSTVPL 57

[Close]
BLAST of Spg016741 vs. NCBI nr
Match: XP_022975998.1 (uncharacterized protein LOC111476529 isoform X1 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 7.6e-06
Identity = 34/57 (59.65%), Postives = 41/57 (71.93%), Query Frame = 0 

Query: 41 VRHRIQSSSISSTQFDRFSHRKEMSFRKPVLRSVRLALIREEKKTEKGETPSSTVPL 98
          V+  + S+    +QFD F H+  +S RK VLRSV LALIREEKKTE  E+PSSTVPL
Sbjct: 7  VQLSLYSAIFMPSQFDHFLHQHGISLRKIVLRSVWLALIREEKKTETSESPSSTVPL 63

[Close]
BLAST of Spg016741 vs. NCBI nr
Match: XP_022975999.1 (uncharacterized protein LOC111476529 isoform X2 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 7.6e-06
Identity = 34/57 (59.65%), Postives = 41/57 (71.93%), Query Frame = 0 

Query: 41 VRHRIQSSSISSTQFDRFSHRKEMSFRKPVLRSVRLALIREEKKTEKGETPSSTVPL 98
          V+  + S+    +QFD F H+  +S RK VLRSV LALIREEKKTE  E+PSSTVPL
Sbjct: 7  VQLSLYSAIFMPSQFDHFLHQHGISLRKIVLRSVWLALIREEKKTETSESPSSTVPL 63

[Close]
BLAST of Spg016741 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IKU1 (uncharacterized protein LOC111476529 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476529 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 3.7e-06
Identity = 34/57 (59.65%), Postives = 41/57 (71.93%), Query Frame = 0 

Query: 41 VRHRIQSSSISSTQFDRFSHRKEMSFRKPVLRSVRLALIREEKKTEKGETPSSTVPL 98
          V+  + S+    +QFD F H+  +S RK VLRSV LALIREEKKTE  E+PSSTVPL
Sbjct: 7  VQLSLYSAIFMPSQFDHFLHQHGISLRKIVLRSVWLALIREEKKTETSESPSSTVPL 63

[Close]
BLAST of Spg016741 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IM83 (uncharacterized protein LOC111476529 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476529 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 3.7e-06
Identity = 34/57 (59.65%), Postives = 41/57 (71.93%), Query Frame = 0 

Query: 41 VRHRIQSSSISSTQFDRFSHRKEMSFRKPVLRSVRLALIREEKKTEKGETPSSTVPL 98
          V+  + S+    +QFD F H+  +S RK VLRSV LALIREEKKTE  E+PSSTVPL
Sbjct: 7  VQLSLYSAIFMPSQFDHFLHQHGISLRKIVLRSVWLALIREEKKTETSESPSSTVPL 63

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Spg016741 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG6591706.18.1e-0877.55hypothetical protein SDJN03_14052, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
KAG7024588.11.1e-0769.81hypothetical protein SDJN02_13406, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyro... [more]
XP_022975998.17.6e-0659.65uncharacterized protein LOC111476529 isoform X1 [Cucurbita maxima][more]
XP_022975999.17.6e-0659.65uncharacterized protein LOC111476529 isoform X2 [Cucurbita maxima][more]
BLAST of Spg016741 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Spg016741 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1IKU13.7e-0659.65uncharacterized protein LOC111476529 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=L... [more]
A0A6J1IM833.7e-0659.65uncharacterized protein LOC111476529 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=L... [more]
BLAST of Spg016741 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 82..101

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg016741.1Spg016741.1mRNA