Spg015609 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview


Name	Spg015609
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	Unknown protein
Location	scaffold10: 12457174 .. 12472257 (-)
RNA-Seq Expression	Spg015609
Synteny	Spg015609

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

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CAAGGTGAATGGGGAAAGTGTCTATAGTGAGTGGGAGCGGGACACGTGTCAACGTATCCCTCAGTCTCCGACCATAGGTCACACCGTGAGAGTTCTATGGTTCGCCTGCGTGTTGCCCTAGAGCAACCATCCCTTCAGAGGGCCTGATCATAGGATTCAGAACACCGTGAACTCCTGAAAAGGATAGGGTCTCTTAGGTTAATCACCAACAGTTGTCTTACTCTTCGGTAGCCTGTTGGTGCGTACCTCTAAGATCTAAAAGTGGGAAGGTTACACTTACGAGGATGAGTTAAGTGTGTTATCCTTGACCGAATAACGGTGACTAATGTCTATAGGAATATGAGTTATTCTGGAAATAGAATTAGTTGAGAAGTGTCTCATTTTAGAGGAGAAGTAGCTGATCACCCTTCGGTGGATGTTGCTCTAAACCTCTGAAGCATTGTTGCAAAACTAAATCAATAGTTTTAGGGTTCTTTGATTGCTTGTTTTGCTAAATTGTTTGGATTGTATGCAATTGTTTGCACGTGTGATGGGTTAAGGCAAAGATAACTAATACGATCATTGTTAATTTAATTTCAACAATGGCTTCTTGACGGAACGACTTGTCGAGGGTCGTGTCAAATAATATTATAATCCACGATTCCTAAAGCTAACTTGTAGCAGTAGTGGTCGGGGTCTATCATAGAGAACAATCGGTTTATTTCTAAATTCTTTTGTGTTTTTGAGGTAACCTAAAGGGGGGTTTATGGATAAAAGATTAAGACATAAAGTAAAGGCGGGAAAATAAATAAGGAAATCTAAATGCAAGGAAAGTAAAGGCGGGGTTAGTTGATCTTACCATGAAGATTATGTAATCGGTTCTCGGGATGTAAGTTTGGTGATTCAATCATTGACTGTCGTAATTAATTGAATTATTTAACAAATTGTCTAACCGTCACTGAAACCAGTGATTAAAGACCCCTAGTGTCTCCAACCCGACCAATGTGTCGAAGTCGAAGCGTAATTAGATTGCTAACCAATGATGTCTCATTAATAAGAATCTAATTGCATTAAGTAAAAGTGGATCGTTAGATAGACTCGTATAAACTAGGAAAAGCCTAAATTCATACAATTCTAAGTCTAAATTTCTAGATTTATCATGCAATTGAGCTAATTGGGATAACACACCTTTCAACACAATTAACACAATAAACTATTACTAACAAATTTAGCATAACAATTAAATCAAGTAAAGCAAATAGGTTGTCAATCTATTTTATCAATTTAATTGTAATTAAAACAGAAATTTAGAACACAAACGACAATAATTCAATAAATTAAATATGAGGTCTCAAGAATACCAAAACTTTCATTACCGAGTCCCGATTACAGCAATCCGAGCTTAGTTGGCCATAGACAAGCACCTCCAAGCTCGAGGCTTGATCAACCGACCCTTGGACTAAGAAAACATTAAAGAAAACTTGAAAACTAAAGAGAGGGGTGGCTACAATTCAAAGAAATTGAACTAATACAAGAGATGATTCTAGACGTAAACCAAGACACTCTATTTATAAGACTTCTTGGCCTTCAAATCGTGGAAACTTGGAGCTGAAGGGAGCCTTAAATTTGGAGAATTCGTGGAGCAAATATGGAAAAATCCAATTCTGGAAAATTGACAGCGTCGAGACACTGTGGGCTGGTGTCTCGATGCTACCCCTACAATTTAGAAAAGATCGTGGAAAATTTCATTTTTGGAAAATTAATGGCGTCTCGACCCTGATGGCAGCGTCTCGACCCTACACAGTGGCGTCTCGACCCTGATCTGTGTTGACTTTTGTTGACCGAGGGTATTTTCGTCATTTTGCTTCGATTTAGCTCGTTTTAGCCCCAAATTGGCTCCAAACCTCTGTCGAGGACCTATACACGTATTATACTCATTCTAAAGCATTTTTCACAAGGAATTCAACTAAGATAAGCAAATTGGGAGATTATAAATGTATAACAAATTAGACCGATCACTTCCTCTATAATCTCACTGCTTAAAAACGGAAAATTAATCAGAGAAAATTTTTCTACGTGGAAATCCAACTTCAATATGATTCTAATTGTCGATGATCTGCAGTTTGTCTTAACGGAGGATTGTCCTCCGGCCCCTATTGCTCGTAATGCATCCCAAGCATCAAGCGATACAGATGACCACTAGGCAAAGGCCAATGAAAAGGCTCGCGCCTATATCTTAGCACGCTTATCTGAAGTTTTGGCTAAGAGACATGAGGGAATGGAAACAGCGAGAGAGATTATGAACTCTTTCCAGGAGATGTTTGGACAACCATCCTATCAACTCCACCATGACGTTCTAAAGTACGTTTAAACTACCGCATGAAAGAGGGAGCATCTGTTCAGGAACTTGTCCTAGACATGATGGTCCAATTTAACGTGGTGGAAGCAAACGACGCGGTCATAAACAAGCATAGTCAGGTTGCGTTCATCATGGAATCTCTTCCGAAGATATTCCTATAGTTTCGTAGTAATGTGATGATGAACAAGATTGTCTTCAACCTGACAAGCCTCCTGAATGAGCTACAACTCTATCAATCTCTTTTGAAAAGCAAGGGACAGATAGAAGGAGAGGCAAATGTTGCCCACTCCAAGAGAAAGTTTGAGAAGGGTTCAACTTCTGGGACTAAAGCTGTGGCCTCTTCTTCAAAGAAAATTCAGAAGAAGAAAGGTGACAAGGGGAAGGCTCCCCCAGCTGCGGGTCGAGGCAAGGGAAAAGCCAAGGTTGTGGCTGACAAGGACAAGTGCTTCCACTGTAATGTGGATGGACACTGGAAAAGAAATTGCCCAAAGTACCTCGCTGAGAAAAAGAAGGAGAAGGAAGGTAAATTTGATTTACTTGTTTTAGAAACATGCCTTGTGGAGCATGATGAGTTCACCTGGATACTTGATTCAGAGGCAACTAATCATGTTTGCTCTTCTTTTCAGGAAAGTGGTTCCTTTCGGCAGTTGGAAGATGGTGAAATGACGCTCAGGGTCGGAACAGGAGACGTCATTTCAGCCAAGGCAGCAGGAGCTGCGAAGTTATTTTTTAGAAATAGATTTTTTCTTTTAGAAAGCTTGTTTATTGTTCCTAAGATTAAGACGAACTTAATTTCTATTTCATGTTTGATTGAACAATTATATACAGTTTCCATTGAGATGAATGAAACATTCATTTATAAAAATGGAGTACTTATTTGTTCAACCAAATTAGAAAATAACTTATATATATTAAGACCAACCGAATCTAAAACACTTTTAAATCACGAATTATTTAAAACTACAGAAACTCAAAGAAAAATGTGACGTATTTCTCCTAGTAGTAACGATACCTATCTTTGGCACTTAAGACTTGGTCATATAAACATCGATAGGATCGGTTGTTTGGTAAAGAATCGACTTCTAAGTGATTTAGAAGATGATTTGCTACCTCCATGTGAATCATTTCTTGAGGGAAAAATGACCAAAAGACCTTTTACTGGAAATGGCTACAAAGCCAAAGAACCTTTAGAGTTAATACATTCGGACCTTTGTGGTCCGATGAATGTAAAGACTCGAGGATGGTACAAATACTTCATCTCATTTATAGATGACTATTTGAGGTATGGTTACTTATACCTAATGGGGCATAAGTCTGACACCCTTGAAAAATTTAAGGAGTTTAAGGCTGAAGTAGAAAACCTGTTAGGTAAAACTATTAAAACACTTTGATCAGATGGAGGTGGAGAGTATATGGACCTGAGATTCCAAGACTACATGATAGAACATGAAATTCAGTCTCAACTCTCAGCCCTTGGTACACCTCAGCAAAATGGTGTATCAGAAAGGAGAAATAGAACCCTGTTAGACATGGTTCGTTCAATGATGAGCTATGCTTAGTTGCCTAGCTCGTTTTGGGGGTATGCAGTAGAGACTGCAGTTCACATCCTGAACAATGTTTCCTCGAAGAGTGTTTCTGAAACACCTTTCGAGTTATGGAGGGGACGTAAACCTAATTTACGTTACTTCCGCATGTGGGGTTGTCCAGCACACGTGCTTGTGACAAATCCTAAGAATTTGGAACCTCGTTCGAGGCTGTGCCAATTTGTTGGTTACTCAAAAGAAACGAGAGGTGGTCTTTTTTACGACCCACAAGAAAACAAGGTGTTTGTATCGACAAATGCTACTTTCTTGGAGGAAGACCACGTGAGAGATCATAAACAATGTAGTAAGAGAGTATTAGGAGAAGGTACTAAAGAATCAACAAGAGTTGTTGATGAAGCTGGACCTTCAACAAGGGTTGATGGAGGGGCTAGTTCTTTAGGTCCGTCTCATCCTTCTCAAACGTTGAGAATACCTCGACGCAATGGGAGGGTTATATCACAATCTGACCGCTACTTGGGTTTAACTGAAACTCAGGTTGTCATCCCTGATGATGGCGTTGAAGATCCATTGTCTTATTGGCAGACAATGAATGATGTAGATAAGGACCAATGGGTCAAAGCCATGGACCTTGAAATGGAGTCTATGTACTCCAATTCAGTTTGGGAACTCATAGACCTACTTGAAGGGGGAAAACCCATAGCGTGTAAATGGATATATAAGAGGAAGAAAGATGTAGCTGGAAAGGTACAAACGTTTAAAGCTAGACTCATAGCAAAGGGGTATACCTAGAGAGAAGGGGTGATAGCGAGCATAGCTAGCTACTTTTACTTATTTGATTTAGCTAGTCTTTTATGATGTTTGGGCCGTTTTATTGTGCTTTATTGTTTATTTTGTAGGAAATGGTTGATTGGAGCTATAATGCCATATTAGAGTTAATCGGGTGCTCGGGGCGTGAAAAGATGCAAAGGAATGAAAAGAGTAAAAGTGGAAAAAAGTCAAATCTCGGTCAACAGCAGGCTAGCGTCGAGACGCTAGCTCTTGAGCGTCTCGACGCTCACATTCCATATCAGATTAGGCGCGTAAAGCTCACAGCGTCGAGACGCTATGATAGGAAGCGTCCCGACGCTACCGTTTTTCCTCATTCAGAACGCGCGTATAAGAGGCAGCGTCGCGACGCTGTCTTGACAGCGTCTCGACGCTAA

mRNA sequence

ATGTCTCTCGCTGTAGGATTTGCCACGAAGAGGAATTCGAAACTACCCTCCAACTTGAAGCCCCCTGTACCTGTTCAGGTACCATTAAGTTCGCACACAGAGATTGTATTCAGAGATGGTGCAGCGAAAAGGGCAGCACAGTCTGTGAAATTTGTCTCCAGCAAGTGGGAGGAGCGGGATTCGAAGGCTTGGCTCGTGGAGATTGTGATGGGGACGGATATTGGATTCATTGCATGTGAGAGAATTATGTATGCTCGGGATGAAGGATTGGAATTCCGTAATTCCGTAAAGCGGAAGCGTGATTGGGACCGATTTATATTGACCAATGCACCCCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATGGATACCCCCACCCGCATGTCTCCTTCATGGATGCTTTGGATTATTGCATCTGTATCGAATACAAGGTGGGTCGCATCACATAGTGTCACCAGGATAAGGAAATTAGCTCGCTATCCCAATGGAGATAAGAAAAGAAATGGGTATGATCATATCTCCCTCTATTTGGTAATGGCCGATGAGAATGACATTCTATCGACCACTAAAGAGGCTATGTTAGGAGCTGATCACGCTAATTGGACAAATATCTCCATTGGTATGAAGCCTTTTGGGGTGAACCAAAAGCAAAGCCATGAGGGCTTATGCCCAAAGTGGGCAATATCATACCATTGTAGAGATATGTGGTTGTCCAGTAGTCCCTTACAAGTGGTATCAGAGCCATGCCCCGAGCGTAGCCGTGTCGGGTGGAATCCTCGGGTGCCGAACAAAGAAGTTGTGAGCCTTGAAGTATTCATGGGGAGATCCGTGGTTGAGCTCTGGGCAGGCGGGTATACTCTGGAGAAAGGAGTTGTCCTGGATAAGAGCAAGAACTCTTGTACCATTTACAGTGGAAAACTACCGTTGGAAATGGTTGATTGGAGCTATAATGCCATATTAGAGTTAATCGGGTGCTCGGGGCGTGAAAAGATGCAAAGGAATGAAAAGAGTAAAAGTGGAAAAAAGTCAAATCTCGGTCAACAGCAGGCTAGCGTCGAGACGCTAGCTCTTGAGCGTCTCGACGCTCACATTCCATATCAGATTAGGCGCGTAAAGCTCACAGCGTCGAGACGCTATGATAGGAAGCGTCCCGACGCTACCGTTTTTCCTCATTCAGAACGCGCGTATAAGAGGCAGCGTCGCGACGCTGTCTTGACAGCGTCTCGACGCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCTCTCGCTGTAGGATTTGCCACGAAGAGGAATTCGAAACTACCCTCCAACTTGAAGCCCCCTGTACCTGTTCAGGTACCATTAAGTTCGCACACAGAGATTGTATTCAGAGATGGTGCAGCGAAAAGGGCAGCACAGTCTGTGAAATTTGTCTCCAGCAAGTGGGAGGAGCGGGATTCGAAGGCTTGGCTCGTGGAGATTGTGATGGGGACGGATATTGGATTCATTGCATGTGAGAGAATTATGTATGCTCGGGATGAAGGATTGGAATTCCGTAATTCCGTAAAGCGGAAGCGTGATTGGGACCGATTTATATTGACCAATGCACCCCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATGGATACCCCCACCCGCATGTCTCCTTCATGGATGCTTTGGATTATTGCATCTGTATCGAATACAAGGTGGGTCGCATCACATAGTGTCACCAGGATAAGGAAATTAGCTCGCTATCCCAATGGAGATAAGAAAAGAAATGGGTATGATCATATCTCCCTCTATTTGGTAATGGCCGATGAGAATGACATTCTATCGACCACTAAAGAGGCTATGTTAGGAGCTGATCACGCTAATTGGACAAATATCTCCATTGGTATGAAGCCTTTTGGGGTGAACCAAAAGCAAAGCCATGAGGGCTTATGCCCAAAGTGGGCAATATCATACCATTGTAGAGATATGTGGTTGTCCAGTAGTCCCTTACAAGTGGTATCAGAGCCATGCCCCGAGCGTAGCCGTGTCGGGTGGAATCCTCGGGTGCCGAACAAAGAAGTTGTGAGCCTTGAAGTATTCATGGGGAGATCCGTGGTTGAGCTCTGGGCAGGCGGGTATACTCTGGAGAAAGGAGTTGTCCTGGATAAGAGCAAGAACTCTTGTACCATTTACAGTGGAAAACTACCGTTGGAAATGGTTGATTGGAGCTATAATGCCATATTAGAGTTAATCGGGTGCTCGGGGCGTGAAAAGATGCAAAGGAATGAAAAGAGTAAAAGTGGAAAAAAGTCAAATCTCGGTCAACAGCAGGCTAGCGTCGAGACGCTAGCTCTTGAGCGTCTCGACGCTCACATTCCATATCAGATTAGGCGCGTAAAGCTCACAGCGTCGAGACGCTATGATAGGAAGCGTCCCGACGCTACCGTTTTTCCTCATTCAGAACGCGCGTATAAGAGGCAGCGTCGCGACGCTGTCTTGACAGCGTCTCGACGCTAA

Protein sequence

MSLAVGFATKRNSKLPSNLKPPVPVQVPLSSHTEIVFRDGAAKRAAQSVKFVSSKWEERDSKAWLVEIVMGTDIGFIACERIMYARDEGLEFRNSVKRKRDWDRFILTNAPPFGLAPEMDTPTRMSPSWMLWIIASVSNTRWVASHSVTRIRKLARYPNGDKKRNGYDHISLYLVMADENDILSTTKEAMLGADHANWTNISIGMKPFGVNQKQSHEGLCPKWAISYHCRDMWLSSSPLQVVSEPCPERSRVGWNPRVPNKEVVSLEVFMGRSVVELWAGGYTLEKGVVLDKSKNSCTIYSGKLPLEMVDWSYNAILELIGCSGREKMQRNEKSKSGKKSNLGQQQASVETLALERLDAHIPYQIRRVKLTASRRYDRKRPDATVFPHSERAYKRQRRDAVLTASRR

Homology

[Close]

BLAST of Spg015609 vs. NCBI nr
Match: XP_031739594.1 (uncharacterized protein LOC101220948 isoform X3 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 75.1 bits (183), Expect = 1.6e-09
Identity = 40/50 (80.00%), Postives = 43/50 (86.00%), Query Frame = 0


Query: 4  AVGFATKRNSKLPSNLKPPVPVQVPLSSHTEIVFRDGAAKRAAQSVKFVS 54
          AVGFATK+NSK  SNLKPPV VQVPLS   EIVFRDGAAK+AA+ VKFVS
Sbjct: 15 AVGFATKKNSKALSNLKPPVLVQVPLSLLIEIVFRDGAAKKAARFVKFVS 64

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spg015609 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_031739594.1	1.6e-09	80.00	uncharacterized protein LOC101220948 isoform X3 [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of Spg015609 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg015609 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg015609 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 381..407

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spg015609.1	Spg015609.1	mRNA