Spg015550 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview


Name	Spg015550
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
Description	MuDRA-like transposase
Location	scaffold10: 15025395 .. 15040421 (-)
RNA-Seq Expression	Spg015550
Synteny	Spg015550

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGCGAGCGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTTTGCACAAAGACCGGACCGCGAAATAGTTAACCACTAACTGTAACACCGTTAGTTAGTTCGGTTTCTATTTCACTAGGATGACCTAGGCAACTTGGCCTTAATCCTGAGTGGATTATGGACTCCTGTCCATGAGGGATTTTCCTTTGATTTGTACGAGTGAGAGTGGCCTATTCGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGATTGGGGAGCTGGGAACATAGTCTTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCAACTTTAGGGTAAGTAGAGGTGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCGGGTCTTGAACAATGGGCCCTACCCTCTTTATGGCACGAGAGGGATTTCTGTTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGACCAAGAGGTAGTCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGGGGTACGAACACACGTGAAGGGCTAACTTGCTGTTGACGGTCGATATCCGTGGACACAGAAATATATCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGGTTCTATAGTGGAGTGAACCACAGTTAACGAATATTGATTAACTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATCAGGTCCCACCGGTAGCTCTATAAGGGCGTTGAGGTAAATTTCTAAGGGTGATTTGAATATTCGAAGTGGTTCGAATATTAAGTTTAAATATGAATTGGATTCATATTAAAAACTATAGGTTATAATTAATACACATATGATGTATATTAATTCTATAGTTAATTTGAGAGATATATATATAATTAAATATATGATATTTAATTGTGATATTAATTAATTGCTGAATTAATTAATATTTTGGTTTTAATTTTAATTAAATTTGATTTAATTAAGCTATATTAAAACTATAGGATAAATGGAGTTTATTTTGTATAAATATGTTTATACAAATGTTATTTAATTAAATTAATAGTTAATTTAATTAAAGGTTTAATTAATATTATTAATTAAATTATTTCCCATCAGTTAGGGTAACTGATGGGAACGTGTGCTCCCTTTTTTCCTCAATCTTGCGTGAATGGGAGGGTTTTAAGGGGGTAGTTGTGCATTTTACGGTATGCTCTCCATCATTCAGTTTGGCTCTCTGAAAAAGCTCACGCAGAATTCTCTCTATCTCTCCCAATTCTAAGAAAACTCTCGGGAATTCTCTCCCAAAAAGAATACAGAGAAATTTTTCCCATAGAACCCTTAGAGATTGTGCTCCCACAAGCCCCTAACACGCAACCTTCAAGAGAATACCGGTGGATCTTTGTTGGTGGTGTTCGTGACTATTTTACAGCGAAATCAAGGTCTCCTTGCTGCTGTTTTTGGGAGCAATTCGAAGGATTTTTGGCGAATTGTTCAAGAAAGTCTTCAAAGGTAATGTTATCTTGAACTTGGATCAATAGGATCCTAATGAGATTAGATCTAGATTTTTCCTAATGAGTTTTAGCATGTTTTATAATTAAAATTCAGCATGTTAAATTATGTTTACTGTTGTGTTTTTATTTGCCAACGTATTGGTATTTTAGTTCAAATTAAAACTGAGTTAAGGTTCTGAACGTTTCCGCTGCGCAAGGGCTTTTTATCCCTTCAGTTCCCTTAAGTGCTGAATCCAAATCTTGAACAAGGGGCCCCACCCTCTCATTGGCCTGAGGGGGATCTTGTTTAATGGTTGGACCATAAACAAAATTGTTCATTAGAGGACCAGTGGACTTAAGGAACTAAGATGTGCTATAGGGGTAAAACGGACTTTAGACCTATCTATAGTAACGAACGACCTGTGAAGGATTGACTTACTAATCATGGTTACATCGAGTGGACACAAATATATCTACAGTGAGGGGAGTTCAACTACTAGGCTATAGTGGAGTGTCCCAGTAGTTAACGAATGTTGGTTAACTAGGTTAAAAGAGTTTGACTAGTTTAACCCCGTACCGATGGAGCCCATGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCCTTGCTAGCTCGAGACTAACCTTTAGAACAATATGGTGGATAAAATATGAATTGCTTTAAGTTCATGTTGAGAAATATGAGTAAAGGTGATAGGCGTTGTTGATATGTTGGGTTTTTGTGAAAACTATTATGGTGAGTATTTAATATTTAAATATGATCTAACTACTGATAACATAAATAGGGATTCATGATTGATAATAACATTTAGGAAATGTTTGGGATTGGTGGAAAAATATTAATTTAATATTTAATATTAAATTAATAATTAATTAATTTTTTAATAATTATTTTAAATTAATTTTGAATTAATTTAAAATTGAAAAATTGAATTTTGATTTTAATTTTTCAGATTATTAAAGTTCAAATAATTATCCAACTTATCATGGATAATTATGGATTTAATAAAAATAAAAAAAATGATTGATTTTTTGGAGGTGGAGTGCATGGTGACTAAACTCATGCACTCACCCCAAATTGGACACCAAATTTCCCACTAATCTTTTGTAAATTGAGTGTCAATTGCTGGAGCATTCTTGCATCTCTAATTCCTCTATAAAAGGCAAGGAGATGACGGAAGAAATTAAGCTTGAAAGATAGAGAAATGTTGCCAAATTGAAAACTCACCATAACTCACTTTTCAAGCTTGTTCTTCATACTTTCTTTCTCAAATTCCATCACTTGAGGATCCCACAATCCGTTCTAAAGGCTTGAGGATAGCAAGGAAGATCCTTTGGTGGTTCGTGACTCGTTGGTGAAGAAAAACAACAAAGAAATCCAACCAATTCTCCATTGATTCAAGGTTGGTAAACTATGCTCTGTTTTTCTTCTTCTTGGACAGCATGCAAACAATGATCAAATTAAACAAATTATGTGCCTAAGATCCGAAATTGCTTCCGCATTTTAGATATTAACACTTTCAAGTAGCATATAAGTGATGTACTTCAATTTAGATATATCTGATATACTGAATATAAAACAATGATATACTGTTAATATACTTTATATTAGGAATATCATTTCACTAATATACCAGAGTAAAGTATATCAACATTATATCAGATATATTTCATTTTAGGTATATCAATAGTATATCAGCAGTCAGATATAGAGAAATTTTGGTAGATAGCCCGTTTTGGAGACATTTTCACATATGTCTAAAATTTTGGATATTTACAAGATTAGATTTTCAGGTATATTTTCTTCCCTTTATACCCTTATTTTTATCATATATTTTCAATTAATATTAAAAATGATAATATTATATTTCAAATAAGCCAACCGAATATGCTACATTTTAGGAAGGTATTTTTCACCCGATTTTCCCTTTATTCCCTAAATTTAGGAATGTTCCCATAATCGTGGTTTACTTTCCTTCATTCTCCGGCTGTCCTTCGTTTTGGTTTTATTTCCGACCACATCCCATTTATTTTCTTTATTTTCCGGCAGCTCTTTCTCTCACTTTCTGTTGACCATTGCCGGTGGTTTTCTAAAATTTTCCCTGCTCTGTTTCTGTGGTTTTCCGACTTCATACATCAGTTCATAGAATCTTTGTTTGGTTGTGGTATTTTTCTGTAGGTTTCCGACAATCTGTATTTAGTTTTTACGTTCCGGTTTCCAGTGGTTTGAACATGGGTACTTTTTCAGTTTTTATATTTTATATATTCCAAGAGACATATCGTTTTAGTCAATCTAAGTTTCGTATACAGTACATATTATAAGCATGTTTTTATATGGCTAGGTTTTCAGTTTTTATATTTTATATATTCCAAGGGACATATCGTTTTAGTCAATGTAAGTTTCGTATACAGTACACATTATAAACATGTTTTTATATGGCTAGGTTTTCAGTTTTAATATTTTATATATTCGAAGAGATATCGTTTTAGTCAATGTAAGTTTCGTATACAGTACACATTATAAACATGTTTTAATATGGCTACGTTTTCAGTTTTTATATTTTATATATTAAGAGGGATATATCGTTTTAGTCAATGTAAGTTTCGTATATGGGTTCGTTTTTAATTTTAATAATTAATATATTCCAAGGATATCTCATTTCAGTCAATATCAGTTTTATGTTCAGTCAATATATTCTTCTTTCTTCTTGTTATTCACTGTGTTTGGTTGCTTTTAATTTTGGTTTGTATATATGTTGGGTTTTTTTTCATATATATTCATATTAGGTATATTGTAATTATATGATGGGTTTGTATATATGCTGGGTTTTTTCCATATATCTTCATATTAGGGGTTTTTCATATATTTTCTTGTTATTCTGATTATACTGTGTTCGGGTTTATAGAACATGTATAGATTATGTATTTTTGTGTATATATCATATTTTACATATTATATATTCCAAATTATACCAAAATACATATCATATGTCAGATTAGTTATGTTTCATATATAACATGTGTGTCTGATATATATTTTGTGGTTTATTGCTTATATATATTTTTAAGGTAGCGTAACTGTTCAAATGTTGCACGATGGTCATTGGAACGAGAGTGAGAATTATGTGGACCACCAAATATCACAGCTGTTATTGAATGATGGGATGACTTTTATTGAGTTTCAGCATTGTATCATGCAAAAACTAGGCAGTTTAGGTAATTTGGATCTCCCCAATATATTTGTTAGCATAGGCTCCCAAAATTTTATAAAGAAGGATGCAGAAGTCTCTGAAGATAAGGACGTAAGATGGTTGTTTAGAATAGCCTCAAACAATAATGAACTGTACTGTGACGTAATTGTTGATTCAAAGAACAACCTATCAGTTAATTTGAACAATATCCCCCTCACAGCTACATACTCTAATGAATCGGTAGGTGAAGGACGCTTTTTCCACACCATTGATGTTTCTAAGATGTCTTCCAATTTTGAGATTTGTATGGACGACATGTTCTCTTCCAAGATTGTGTTACAGAATGTGATTCGATCTATTGCCATCAGAGACAACTTCCAATTCAAAACCGTGAAATCTAACCGTGATTTTTTGGTCGTGCAATGTGTTGTTGAGGATTGTGAGTGGTTCCTTAGAGCATGTCGATTCGGAGATGATGATAGTCCCACTTGGGTTGTCAAGAGATTTGACAATGATCATATCTGTTCAATTGATGTTGTTTTGATTGACCACAAGCAAGCGACATTTACCTTCATCAAAGATTGTATTAAACGGAAGATTAGCATTGCGGTTAGTGAATTACCCACTCCTAAAGACATTATATCATTTATTCGATCAGAATATGGTTTGCGTTTTAGCTATCATAAAGCTTGGCGTGCTCGTGAAGCTGCATTAAATGAGATTAGAGGATCTCCAAAAGACTCATACAAAATGATCCCATCATTTTCCCATATGTTGAATATTAAAAATCCAGGTTCGTTTACTATATATCGTTGTTTAAATCATATGTTCTATTAGCTATCACAGTTATTATAGTTGATATAATATATACCTATTATTTGTATTCATTCAGGTTCAATAACTGAATATAAGATTGATGGAGATGAGAGATTTCGATACTTTTTCATGGCGTTATCAGTATGCATTTCTGGTTGGAAGCATTATCATCCAATTGTTTCTGTAGATGGTACACAAATGAAAAACAAGTTCGCCGACACTCTGATAACAGCTTCAACTCCTGATGCGAACGATCAAATATTCCCTTTAGCATTTTGTGTTGTCAATTCAGAGAACGATAGGTCATGGAAATGGTTTTTCCAGCAACTAAGTAAAATTTTTGGTCATCGTAAAGAAATAGTTATTGTTTTCGACAGGCACAAGAGCATTGGCAAAGCAATTCACGACGTCTTGCCTGACGTGTTGCATTGCATTTGCATGGTTAGTTCACTGAGGTCAGATCAGTGGACTTTTGGACCTGAGTCTTTGCTTATCATTCTTTAATTCTTGATTCACTTTTTTCATGTATCACATGTTATTTTTTTTTTTCACAAGAAGAAAAAAAAGGGTGTTGAAATTCTATTTAGTGTTTATTTGATTTCATTCAACAAGCGAAACTGGTGTAGCTGAAAATTTAACTTATTTTTCCAACATCTGGCCAACGTACTTGTATTACAAGATGATATCAATTACTCATTATTCACAATGTAATGCGGTGCCTTTTGTTGAGAGACCTGTGCTTTTTGTTCCTACTGATCTGTAATTATTCTTGTTTATTAACCTTATTTGATGTTGATTGTTATCATCAGCTAGGATCTTTCTAGTTCCAAATTACCTGCCTACAAGTTTACCTAATACAGGATACTTCTTCATATCATCTGAAGGTGCTCTGGTTTATTAACCTTAATTGATGTTGATTGTTTATCATCAGTTAGGATCTTATGATTCAATGAGTAAGAATTGTGATCTGGTTGCTTTTAGCCATTGTTTAGATATGGTGGGAAAGGTTGTTGCTATTACAGGTTTTTTTTTCAACAAATGGACTTTCATGTGCAGGACATGCCAAATAAAAAGAATGGTGGGAGTTTGATGTGTCATCAAAATGTCAGCGGAGTGATAAAAGTGGGGTTGTCTTTTGTTTAACATGCCACAAAAAACGATTTTTCTATAAGCGTATTGAATGATGGTAAGAAGACTGAGAAACTTTAACTCGTATTTGTTCCAAACTAAATTTGAATTAATTTGTTATGCTACAAGTAAACAAATTTTTTCTTTTTTAATAATTTTTTTAACTCATATCTCATGCAGTTAGCATGGGTCAAACAAAATTTTTAGGACTGCTTGCTTTTAGCCATTGTTTAGATATGATTATATTAAGGATGCCAAGAAAAAACTTTTGAAAATGGTTTGTTATGAAACAGGTACTTTGATAGAGCAAGGGAGAATGTTGTGAATGCATGCCCATGTTATCGTGGTCACTGTAATTGCAAGGCTTGCTTAAGAGAGTGTAGAGGTAAAAACTTCTTTTACCTCGTGCCCTCATTTTCCAGTAACTGGAAGTTGGGTAGTCGTCCATACCTAATTACCGAATTTCTATGGTTGTTTTATGGTAGTGTCTTGTTTTGCATATACAGATTGCTCCTAAAGAATTGGGTAAGTGTAAAAGTAGATTAAAAGTCTTGCTATATAAGGTTCTACCCATTCTCAGGAATATTCAAGGGGAACAGAGTTCTGAATTGGAGATCGAAGGGAATATACAAGGTATATTGCTTTAAAGAATCTGGTATTTGAGAGAATAGTTTCTAATCTAGAAAAATCCTTCTGGTCATCTATGTGTTTTTGGTTGAATTTTAAGTGTAATTTTTCCTATTTTGTTTATCTTTCTTGTTTCTTGGTATTTGTTGTGAAGTGTTCATAGTGTTGGTTTTAAATAACTTTTCTTGCACACGCAGCAACAAAGTTGTTTGATGTTTTTGAGGTTGTTTTCTTCATTTGCATTAACATGGTTCCCATCCCACCAGAAGCCAAATCAATTTGGGTTATGTGAAATATGTGTCAGTTGACGAAATTGTTGGTGTTAGGATATGTTATCTGTATTAGCTCAATTATCGCTATATTGCACAGAAGACTAAACAAATATTGATGATCACAATTGGATTTTAACCCATTTTCTTAGTTTTGAATATGTCTGCTAATGCTTCTTTTCATGTTCATTTTTAGTGTTCATTCTTGCTTCCTTTCAACAAGTTTAGAGCAACTTGCTTAAGAACAATGCCCAGATTCAAGCTAAGGGTGACAATTCTCCTGTACCTGGTAATCAGTTTGTTTTTTCTTCTTTGGACTTTACATGTTCAAATCCAAACTCAAGTTTAAACCCAAACCCAAATTGTATAGGATTGGTTAGTTGTTTAGAATTCTTGGATAGTTAATTTTTTTGAACACCCTTAGTTAAAGGCACTGCCTAACAACTGCAATAAGTATATTATGTTCTTTGGATGCAAAGATTATTGCTTTGTAGCACATATTGAGTGAAAGTGAGTGTTTATGCCATTTACATGATTATTGTTCTCTGCCTTTGAATTTGGTTTTTGAATGTTGAAATATTTTGTGATTGTTGCTTTTTGTTGTTAGTTTGGTTTGGAGAAATTGAGAATTTAGTTTGGAAAGGAAGGAATAAATGATTGATAATGGTAGAATATCACGCATGGCTTATGAAGCTTTTTGTTGGCCCCACCCTTTTAGAGTAGAAACAAGCTTTTCATTGATATGTCAAACGTTACAAAGTGGAAAACAAAGTCTACCGGCCAAAATTACAAGCTAGAATCAATACCCATGATGAATTTTACAAAAACTCTCTCCAATTATTGTTTGTTACAAAGGGAGTCTAATTACCAAACTCCTTATCAATAGAAACCTGAAAGATGCATATAACTTTGCTAGCTCAAATATGCCCCTCCAATGTGTAGCTTTACCATGCATTGGAAAGTTTACTATTTCTTTCCAACCATGTAGAGACTCTAGAGTATCAACTTAGTTAATTGTTTAGGAGGTTTGTTGGAAAAGTAATAGAAGTATGATTTTCATGAGGATCAAGGTCATGATCTCTATGCCAGAGATTTATTATTTGATTTCAAGTAAGGACTATTGTGATTTACATCCTTTTTAGAACAAGGCACAACTTGTTATGATTGCACATGATGTGGATCCGATTGAGTTGTTGTTTGGCTTCCAACTCTGTGCAAGAAGATGCAAATTTCATATTGCATTGTGAAGGGAAAAGCACATTTGAGAGCGGTAAGCTTTTTCTTTTTCCTTTTCTTGACAAAGATTTTACAGTTCTCTAAATCTTGAGGGCAATTGTTTCAAATTTGTTTCCTTTTTAATAGACTAGGTTTTTACCACTTGCATTGCACGTGTAATAATTTTAGTAAAATATTATAAAGTAAAATTAATTTAAAACTAATTAAGATTAGTTCTATACATTTTTATATTAGTTTTCTTTTTTATACTTCCATGATGATTTCTTTTTTTCTAATCTGACTAAGAATTATGGAATTTATGGTTAGACATAAAAACCAATTGGAGAACAATGCACAAGGGAATTTAGAATCAAATTCTAATTTGATATTATTTGGAATCAAATTACATATTCAAACTTTTCTATAATTGAAAGAGAAGTTTTCATTTTCATGAAGACAACATTATTAGATTTCAAATAGTGGTTGCAAAATAAGACTTTGCTAAGATGAAATACAACCTCTTACCATATTTAAAGCATAATAAGATTATCTCATTATCATTGTTTTGAAATTTAAATAGGTAACTTTTTAGAAATTGAAAATGATGAGATTTATTTAAATATAGACAAAGAAATAGTCTAGAATAAATTTAAATTGAAAAAATTCAAATTCAAATTATGCACAATATATTCAAAACAAATTAGGGGTAAAGCAAGAAAATAAATAAAAATCATAGAATATCAAATATCTATAAATATTTGAGAATCTCAATAAAGTTTAATGTTTTTTTTTTAAATAAACTAATTGATTTTTAAATTACAAAATTATTTTTTTAACAAGTTAATTTGAAAACAACCTTATATAAAGTTATTTGAGAATCATTGTGTAATGATAATTTCAATAAAATTTAAATGGAAATTGATCTTTTTTTAAAAGAAAAAAAATTCATCAAAACTACCAAATTATTTTTAAAATATGTAATTTAAAAACAATCATGAATAATTCAAAACCAAAAGAATTATTCCAAGTGCACAAAAAATCTTAATTAATTCCCAACACATGAAGTTTGGTTTTTATATTAATAAATTAAAATAAACGAAAGTTAAAAAAATATTATATTCGGAAACTGACTACTTGTTAATCATAATATATTTTAATTGAAATTGATTATTAAAAAAACTAGAAAATCGATTTTCTAATTACCAAATTACTTTTTAAAAATGTAACTTAAAAACAACCGTGAAGAATCCAAAACCAAATGAATTCTTCTAGTACACAAAAAAAAAACTTTTTTATTTGCTTTTTTTTAGTTCCAATACACAAAAAAACTCGATATCATGGTGTAATGATAATTTCAATAAAATTTTAATTGAAATTGATCTTTTTTTTTTTACACAAAAAAACTTGATATCATGGTATAGTGATAATTTTAATAAAATATAAATTCAAATTGATCTTTAAAAAAAATCGATTTTCTAATTACTAAATTATTTTTAAAAAAAAATGTAATTTAAAAACAACCATAAAAAATCTAAAACCAAAAGAATTCTTCCAAACACATAAAATATCTAGATATTGTGTAGTGAAAATTCCAATGGAATTTTAATTCATATTGATGTAAAAAAAAAAAAAAAATCAATTTTCTAATTACTATATTATTTTTTAAAAAATTAATTTAAAAACAACCTTAAGAATTCAAAATCAAAAGAATTCTTCCCAGTATACAAAAAAAAAAAATCTTAATTAATTCCTAATACATGAGGTTTTGTTCTTATATTAATATATTTAAAAAAAAAAACGACTATTAAAAAAATACTATATCCGAAAAATGAGTTAATCATAATATAATATTCGGGAAAAACTAAAAAAGTAAAAATAACAACAATAAAATAGAAAATATTTGTAAATATTTTAAAATCATGGTGTAGTGACAATTCGATAGTTTCAGTAACATTTTAATTGAAATTCATTTTTTTTTCAAATGAATTCTTCTGAGTACACAAAATATGTTGATTAATTCACAACATATAATGTTTGTTTTTATATTAATAAATTTAAATCAACAACTATTCAAAAATATAATAATATGATATTCGAGAATCATAGTCTAGATAAATGGACAAAATTCAAATTCAAATTATGTCCACTATATTCAAACTAAATTAGTGGTAAGTGAATTAATTTAGACTCTTAATATGAAACTCACAAATTATAATTTTGGATAGGGCTGATCATCGGTCGGTCGGCGTTGGTTTTGGACTCAAACCGACGCCGACCACCGACAAGTCGGTCTCCGACGGTCGACTTTCATCGATTTGAGAGGGATACATTACGCCGACCGACCGATGATACCGGCGGTCGGTCGGTTAGGGTCGGTTTTAAGAGTGCGGTGTGAGGAATAAATAAAAAAAAGGAAAAAGAAAGAAAAAAACACAGAAGATGAACCATCTGAGCTTCAGATTCCGAAGAAAGAAGATATGAAAAAAAAAAAAAAAGGAGACAAAAATAGGATGAAAACAGAAAGAAGAAGAAAAGGAAATGGCATAAACGAAAAGAAGAAGAAAAATGAAAGAAAAAGAAAGATGTATAGAAAAAAAAAAAAGAAGAAGATGGAAACAAGAAAAGAAAAATGAAACGAGAAGAGTCTGAGAAGGTGAGAGGGAAGAAAAGAAAAATGAAATAAGAAAAGTAAAATGAAAGAAGAAGCGTGTGAAAGATGAATTGAAGAAAGATCGAAGGAAATAAATTGAAAAAAAAAATTATTAAATGTTACTTGGGAAGACCATCAGACGCGTTTTCAATTATATCTTTTTTTTAAAAAAAATTTCGATCGGTTCTATCGATTTTCGTCCTTATTGGGCAAACCGACTGACCGACCCCGATCGAGAATATCAAAAAACCAACGAACCGACGTCGGTTCAGTCGGTTTCGATCGGTCGGCTCGGTTTTTCGGATTTTCTTGCTCACCCCTAATTTTGGAGACAACGAAATCAAATTAAGAAAATAAAAAATTTTAACAATAAAGGAAAAGAAAGAGATACCTGAAACAGAGATGAATAATTGGAAAAGATAATTACTTTTAGAATTGGAAACTACCAAAAAAAATTAGAAAAAAGGAAATTAAATAGCGTAAAAAAATTTCCAAAAGAATCTGATTATTGTTAACTATATAGTATATAATATCATATTCGAGCACAACATTCTCATTAAATTTAGGCAAAATTAAACAAAAACAACATGAAAATAAATTTATGTGAATATTTTTTTAAAAATTATTTGAGTATCACATAGGGATGATTTTAAGAGAGTTACCTGAAACGAACAATTGGAATAGGTGAGTAGTTTTAGATGTGAAAACCAATTGCAGAAGATGGATAATTTATAGAGGAAATTTAGATTAAAATTCTAATTTGATATGATTTTGAATCAAATCACATATTGTTTTGAATTTTATTAAATTATGAATTTTGATTGATATATGAGATTTAAAAATAATCCGATTTTGACTGATGTAATTAACTAAAATTTAAAGGGGTATTTTAGTCTAAAAATGTTTTTTAGAAATCCTTCCTTCTTAATATAGTATAGATATAGACTGTTCATAAAAAGACTGCATCAGTTTTGTGCTTGGCAACCGTTAAGAACGAAGATAAGTTGGAGTTTAGCAAGATCCTAGAAGTTATATCAAGGTGACTAGCACACTTAAAATAAATGTAACACTTTACTAGTACCCTTGTGTAAAGCTTAATTTTAATACCTTTGCTGATGTATTTTATTTGTTAAGGCAAATTTCAACGATAAGTATGACGAGTCATTTTTCTTGGAGGTTGTGAAGACAAAATACTTGGCGAGATTGTGAAGACAAAATACTTGGGTTGTTGGCGAGATTGTGAAGACAAAATACTTGGAGGTTGGTCGTTCCTATAGACCGAAGGACAACATAAGTAATATTCAGCAAGAGTTAGGTGTGAATCTGAGTTATGATAAGACATGGAGAGCTAGAGAACATGTCTTGGTTCCTGCCAGAGGGTCTCCTAAAGAGTCATACAAAATGTTACCGCGGTTTGGAGAAGCGTTGAAAATTGAAAATCCAGTTTCAATTTTTGACTTGGAAGTGGACGAGGGTCGTTACTTCAAGCATGTGTTCATGGCATTTGGGTCCTCAATCAGAGTGTTCTTGAACTCTTCGCCCGATTTTGGTAGTAGATGGGACTCATGACGGGAAAGTTCAGTGGAAAGCTCATGATTGCAGTAGGCATCGATGGAAACAACCAAACATACCCCATAGGGTTTGGCATTGGGAGTGGAGAAACTGATGAATTGTGGACCTACTTTTTCCGGCAAATGGAGCGTGCTATTGGTCAACTTAATCCCCTAGTGATTGTATCTGATAGGCACAAGAGCATATGCAAGGCAGTACGAATTGTGTTTCCTGATACAGCCCACTGCTACTGTATCCACCATCTAGAAGAGAACTTGAAAATAAAGTTTAAGGATCACGACTTTATTCCACTCTACCTTAAAGCAGAGAAGGCATTTCGTGATACAGAGTTTTGAGAATATTGGGGCAAAATTCCAATAAGTGCCCAAAAATACTTGGAAGAAGTCGGACTTGAACGTTGGTCTCGTGTTTTTCAGTGTGGAATGAGATACAATCAAATGACCACGAACATTGCGGAATGTGTAAACTCCTTATTGAAAGATGCGAGAGAGTTACCAATAATGGGCCTTCTTGAGCACATTAGGGGATGACTGCAAGCCAATTACTACGACCGTCGTATCAATGCAGCAAATTGGGATGCACCGATATAAAAATATGGTGAGGAAATTGTTCTAGAAGCGGAGAAGAATGCGATAAGGCACGTGGTTCGACCAATTGCCGGTACGAATTCCAAGTCGACGATGGACACTTGGGTGGTTGTGTCAACATCCACACGAGGACGTGTACTTGTCGTGAATTTGACTGCTTCGAACTTCCGTGCTCCCATGCAATTGCAGCCAGCATCTACCGGAACGTGCCATACTTGGATCTCTGTTCTTCATGCTACCGTGTTGAAGTAGTGCTAGCTGCTTATGCAGAACCCGTATATCCACTAGGACATGTATCGGAGTGGAAAACATCCGAAAATTTTATGGATTTCGAAGTCTTGCCTCCAAAGAGGGTTCCAAGAGTGGGTCGACGACAAACATTGAGGATACCATCCACGGGAGAGGTTAGACAAGTTCACAAATGTACTCGATGTGGAAACAGAGGTCATAATAGGAAAACTTGCCGCCAACCACTGTAACGACCCTACTTTTCATGCCTAGATCCTAGAGCCGTTACTACATACATTGCTTTCTACTTCTAAGAATGGCGAGGAAATATCATTTAAAGAAAACATACTTAGAAATTTTGCGAAACTTTTCAGCCTGGGATCCCAGTTAAAACAACACAAAAGAACACTTTAGCCATTCACACAAAACTTTAAGCGGAATAAACCTTAAATCATTCGCAACACAAGTTCAAAAAAAGAATTTCAAAACATAAAATGCGGAAGACTATCCTAAAGGAGATCCATGGCTCAGCAGCTCTCCGTCACGCGTTCTGTACACCTTTACCTCTACCTGCAGTTGTATGTAAGGGAAAAGAATGAGTATTTAAGAAAATACTCAGTAAGTAGCAATCAAGGTTTAAACATTTTATTCGAGTTAAGGGCCTAAGGGTTAGGTCATCTCATTCTCATTCATTTCATTTATCTGTAGTTCGGGTCTCGTGTTCAATTAGTACACCTATATACATATAAGTTTGCCAACTCACTGACAGTGCACAAGTGGGAGTTTTGGGAGGTCTCTACTCCTACTGATGGTAGATGGCACCCAGTCAGTGGAGCTAAGTCTCGTCCCTCAAGGCACTAATGGGCGCGTAGCGCTCTAAACTACCATTTCACTGGTGGGGCGTTCATGGGTTTAAGTCAGGAATTAACTTCCACAGTTAGTAAATGGCACCTAGACTGCAAAGCCAAGTCCCGCCCATTAAGCCCCTCATTTCAGTCTATCACATCTCAGTCCTAGGTGTTTAATTGACACGTCCCTCGTCTAAGGCACTAGCCTATTCCTTTCCCTTTTAGGACCCCTTAACTCTTGCTATTTTTAACTGCAACCCTGTTTAATACATCGGTTTCTTTTCTCAGATTACTGACAGGCTAACTAATAGGTACCATCCCAACTCAGTCATATCTCAAGACAAAGAAATGGAGGCGACAACTGCTACTCCTAACAGAGAAAACCACAACTTCTCGTTGCCCACAAACAATGTCAGTCAGCTTTAA

mRNA sequence

ATGCGAGCGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTCCATCAGGTCCCACCGGTAGCTCTATAAGGGCGTTGAGCGAAATCAAGGTCTCCTTGCTGCTGTTTTTGGGAGCAATTCGAAGGATTTTTGGCGAATTGTTCAAGAAAGTCTTCAAAGGTTTCCGACAATCTGTATTTAGTTTTTACGTTCCGGTTTCCAGTGGTTTGAACATGGGTAGCGTAACTGTTCAAATGTTGCACGATGGTCATTGGAACGAGAGTGAGAATTATGTGGACCACCAAATATCACAGCTGTTATTGAATGATGGGATGACTTTTATTGAGTTTCAGCATTGTATCATGCAAAAACTAGGCAGTTTAGGTAATTTGGATCTCCCCAATATATTTGTTAGCATAGGCTCCCAAAATTTTATAAAGAAGGATGCAGAAGTCTCTGAAGATAAGGACGTAAGATGGTTGTTTAGAATAGCCTCAAACAATAATGAACTGTACTGTGACGTAATTGTTGATTCAAAGAACAACCTATCAGTTAATTTGAACAATATCCCCCTCACAGCTACATACTCTAATGAATCGGTAGGTGAAGGACGCTTTTTCCACACCATTGATGTTTCTAAGATGTCTTCCAATTTTGAGATTTGTATGGACGACATGTTCTCTTCCAAGATTGTGTTACAGAATGTGATTCGATCTATTGCCATCAGAGACAACTTCCAATTCAAAACCGTGAAATCTAACCGTGATTTTTTGGTCGTGCAATGTGTTGTTGAGGATTGTGAGTGGTTCCTTAGAGCATGTCGATTCGGAGATGATGATAGTCCCACTTGGGTTGTCAAGAGATTTGACAATGATCATATCTGTTCAATTGATTTAGGATCTTATGATTCAATGAGTAAGAATTGTGATCTGGTTGCTTTTAGCCATTGTTTAGATATGGTGGGAAAGGTTGTTGCTATTACAGGAATATTCAAGGGGAACAGAGTTCTGAATTGGAGATCGAAGGGAATATACAAGTGTTCATTCTTGCTTCCTTTCAACAAGTTTAGAGCAACTTGCTTAAGAACAATGCCCAGATTCAAGCTAAGGGTGACAATTCTCCTGTACCTGGCACGTGGTTCGACCAATTGCCGGTACGAATTCCAAGTCGACGATGGACACTTGGGTGGTTGTGTCAACATCCACACGAGGACGTGTACTTGTCGTGAATTTGACTGCTTCGAACTTCCGTGCTCCCATGCAATTGCAGCCAGCATCTACCGGAACGTGCCATACTTGGATCTCTGTTCTTCATGCTACCGTGTTGAAGTAGTGCTAGCTGCTTATGCAGAACCCGTATATCCACTAGGACATGTATCGGAGTGGAAAACATCCGAAAATTTTATGGATTTCGAAGTCTTGCCTCCAAAGAGGGTTCCAAGAGTGGGTCGACGACAAACATTGAGGATACCATCCACGGGAGAGTTCGGGTCTCGTGTTCAATTAGTACACCTATATACATATAAGTTTGCCAACTCACTGACAGTGCACAAGTGGGAGTTTTGGGAGGTCTCTACTCCTACTGATGGTAGATGGCACCCAATTACTGACAGGCTAACTAATAGGTACCATCCCAACTCAGTCATATCTCAAGACAAAGAAATGGAGGCGACAACTGCTACTCCTAACAGAGAAAACCACAACTTCTCGTTGCCCACAAACAATGTCAGTCAGCTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCGAGCGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTCCATCAGGTCCCACCGGTAGCTCTATAAGGGCGTTGAGCGAAATCAAGGTCTCCTTGCTGCTGTTTTTGGGAGCAATTCGAAGGATTTTTGGCGAATTGTTCAAGAAAGTCTTCAAAGGTTTCCGACAATCTGTATTTAGTTTTTACGTTCCGGTTTCCAGTGGTTTGAACATGGGTAGCGTAACTGTTCAAATGTTGCACGATGGTCATTGGAACGAGAGTGAGAATTATGTGGACCACCAAATATCACAGCTGTTATTGAATGATGGGATGACTTTTATTGAGTTTCAGCATTGTATCATGCAAAAACTAGGCAGTTTAGGTAATTTGGATCTCCCCAATATATTTGTTAGCATAGGCTCCCAAAATTTTATAAAGAAGGATGCAGAAGTCTCTGAAGATAAGGACGTAAGATGGTTGTTTAGAATAGCCTCAAACAATAATGAACTGTACTGTGACGTAATTGTTGATTCAAAGAACAACCTATCAGTTAATTTGAACAATATCCCCCTCACAGCTACATACTCTAATGAATCGGTAGGTGAAGGACGCTTTTTCCACACCATTGATGTTTCTAAGATGTCTTCCAATTTTGAGATTTGTATGGACGACATGTTCTCTTCCAAGATTGTGTTACAGAATGTGATTCGATCTATTGCCATCAGAGACAACTTCCAATTCAAAACCGTGAAATCTAACCGTGATTTTTTGGTCGTGCAATGTGTTGTTGAGGATTGTGAGTGGTTCCTTAGAGCATGTCGATTCGGAGATGATGATAGTCCCACTTGGGTTGTCAAGAGATTTGACAATGATCATATCTGTTCAATTGATTTAGGATCTTATGATTCAATGAGTAAGAATTGTGATCTGGTTGCTTTTAGCCATTGTTTAGATATGGTGGGAAAGGTTGTTGCTATTACAGGAATATTCAAGGGGAACAGAGTTCTGAATTGGAGATCGAAGGGAATATACAAGTGTTCATTCTTGCTTCCTTTCAACAAGTTTAGAGCAACTTGCTTAAGAACAATGCCCAGATTCAAGCTAAGGGTGACAATTCTCCTGTACCTGGCACGTGGTTCGACCAATTGCCGGTACGAATTCCAAGTCGACGATGGACACTTGGGTGGTTGTGTCAACATCCACACGAGGACGTGTACTTGTCGTGAATTTGACTGCTTCGAACTTCCGTGCTCCCATGCAATTGCAGCCAGCATCTACCGGAACGTGCCATACTTGGATCTCTGTTCTTCATGCTACCGTGTTGAAGTAGTGCTAGCTGCTTATGCAGAACCCGTATATCCACTAGGACATGTATCGGAGTGGAAAACATCCGAAAATTTTATGGATTTCGAAGTCTTGCCTCCAAAGAGGGTTCCAAGAGTGGGTCGACGACAAACATTGAGGATACCATCCACGGGAGAGTTCGGGTCTCGTGTTCAATTAGTACACCTATATACATATAAGTTTGCCAACTCACTGACAGTGCACAAGTGGGAGTTTTGGGAGGTCTCTACTCCTACTGATGGTAGATGGCACCCAATTACTGACAGGCTAACTAATAGGTACCATCCCAACTCAGTCATATCTCAAGACAAAGAAATGGAGGCGACAACTGCTACTCCTAACAGAGAAAACCACAACTTCTCGTTGCCCACAAACAATGTCAGTCAGCTTTAA

Protein sequence

MRAGVSCAMSPSGPTGSSIRALSEIKVSLLLFLGAIRRIFGELFKKVFKGFRQSVFSFYVPVSSGLNMGSVTVQMLHDGHWNESENYVDHQISQLLLNDGMTFIEFQHCIMQKLGSLGNLDLPNIFVSIGSQNFIKKDAEVSEDKDVRWLFRIASNNNELYCDVIVDSKNNLSVNLNNIPLTATYSNESVGEGRFFHTIDVSKMSSNFEICMDDMFSSKIVLQNVIRSIAIRDNFQFKTVKSNRDFLVVQCVVEDCEWFLRACRFGDDDSPTWVVKRFDNDHICSIDLGSYDSMSKNCDLVAFSHCLDMVGKVVAITGIFKGNRVLNWRSKGIYKCSFLLPFNKFRATCLRTMPRFKLRVTILLYLARGSTNCRYEFQVDDGHLGGCVNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEVVLAAYAEPVYPLGHVSEWKTSENFMDFEVLPPKRVPRVGRRQTLRIPSTGEFGSRVQLVHLYTYKFANSLTVHKWEFWEVSTPTDGRWHPITDRLTNRYHPNSVISQDKEMEATTATPNRENHNFSLPTNNVSQL

Homology

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022155207.1 (uncharacterized protein LOC111022347 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 196.1 bits (497), Expect = 8.5e-46
Identity = 90/218 (41.28%), Postives = 148/218 (67.89%), Query Frame = 0


Query: 73  VQMLHDGHWNESENYVDHQISQLLLNDGMTFIEFQHCIMQKLGSLGNLDLPNIFVSIGSQ 132
           + M H G WN+ +NYV++++S+L+++  M++ +    IM++LG +G+ D P+IF  IG+ 
Sbjct: 1   MSMFHGGFWNDRDNYVEYKVSELIIHQEMSYAKLLKDIMEQLGLVGSSDYPDIFSCIGTT 60

Query: 133 NFIKKDAEVSEDKDVRWLFRIASNNNELYCDVIVDSKNNLSVNLNNIPLTATYS--NESV 192
            F+ KD ++S+DKDV WL+ +  N     C ++VD +N LS  L+ +P+  + S  N   
Sbjct: 61  QFM-KDMKISDDKDVHWLYNVIFNGVAQCCSLVVDCRNCLSNVLDRMPINTSSSIDNGIP 120

Query: 193 GEGRFFHTIDVSKMSSNFEICMDDMFSSKIVLQNVIRSIAIRDNFQFKTVKSNRDFLVVQ 252
             G+F ++IDV+ +  NF I ++D F  K  LQN +RS+AIRDNFQF+T+KSNRD L+V+
Sbjct: 121 SIGQFHYSIDVTNILRNFHIEVNDKFCGKKNLQNALRSVAIRDNFQFRTIKSNRDVLIVR 180

Query: 253 CVVEDCEWFLRACRFGDDDSPTWVVKRFDNDHICSIDL 289
             +++C+W+L A +FGD  S  W+VK+F  +H CS+++
Sbjct: 181 FFMDNCQWYLHASKFGDQGSEIWIVKKFVQEHTCSLEI 217

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022134813.1 (uncharacterized protein LOC111006994 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 174.1 bits (440), Expect = 3.5e-39
Identity = 82/190 (43.16%), Postives = 125/190 (65.79%), Query Frame = 0


Query: 101 MTFIEFQHCIMQKLGSLGNLDLPNIFVSIGSQNFIKKDAEVSEDKDVRWLFRIASNNNEL 160
           M++      IM+ LG +G+ D P++F  +G+  FIKKD ++S+DKDV WL+ I SN    
Sbjct: 1   MSYANLXEEIMKILGLVGSSDYPDVFACVGTIQFIKKDMKISDDKDVHWLYNIISNGAIQ 60

Query: 161 YCDVIVDSKNNLSVNLNNIPLTATYS--NESVGEGRFFHTIDVSKMSSNFEICMDDMFSS 220
            C ++VD +N LS  L+ +P+  + S  N     G+F+  IDV+ +S+ F I ++D F  
Sbjct: 61  CCSLVVDCRNCLSNILDXMPINTSSSMDNGIQSFGQFYRXIDVANISATFHIXVNDKFCG 120

Query: 221 KIVLQNVIRSIAIRDNFQFKTVKSNRDFLVVQCVVEDCEWFLRACRFGDDDSPTWVVKRF 280
           K  LQN +RS+AIR NF F+TVKSNR+ L+V C+  +C+WFL A +FGD  S  W+VK+F
Sbjct: 121 KRNLQNALRSVAIRXNFXFRTVKSNREVLIVXCLTNNCQWFLHASKFGDKGSEIWIVKKF 180

Query: 281 DNDHICSIDL 289
            ++H CS+++
Sbjct: 181 VHEHTCSLEI 190

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022159268.1 (uncharacterized protein LOC111025678 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 138.3 bits (347), Expect = 2.1e-28
Identity = 59/111 (53.15%), Postives = 80/111 (72.07%), Query Frame = 0


Query: 374 RYEFQVDDGHLGGCVNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEV 433
           ++ FQV DG+L G V+++   C+CREFD F++PCSHAIAA+  RN+    LC   Y    
Sbjct: 376 QFHFQVRDGNLDGIVDLNAMMCSCREFDYFKIPCSHAIAAATMRNINPYSLCDEAYTTNS 435

Query: 434 VLAAYAEPVYPLGHVSEWKTSENFMDFEVLPPKRVPRVGRRQTLRIPSTGE 485
            + AYAEP++P+GH+S W +S  F++  V PPK VPRVGRR+T+RIPSTGE
Sbjct: 436 WILAYAEPIFPVGHISTWNSSPEFVNIPVEPPKTVPRVGRRKTVRIPSTGE 486

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022145820.1 (uncharacterized protein LOC111015181 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 2.7e-28
Identity = 60/111 (54.05%), Postives = 78/111 (70.27%), Query Frame = 0


Query: 374 RYEFQVDDGHLGGCVNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEV 433
           ++ FQV D +L G V+++  TC CREFD F++PCSHAIAA+  RN+    LC   Y    
Sbjct: 394 QFHFQVQDDNLDGIVDLNAMTCNCREFDYFKIPCSHAIAAATMRNINPYSLCDEAYTTNS 453

Query: 434 VLAAYAEPVYPLGHVSEWKTSENFMDFEVLPPKRVPRVGRRQTLRIPSTGE 485
            + AYAEP++P+GHVS W +S  F++  V PPK VPRVGRR+T RIPSTGE
Sbjct: 454 WILAYAEPIFPVGHVSTWNSSPEFVNIPVEPPKTVPRVGRRKTTRIPSTGE 504

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022146373.1 (uncharacterized protein LOC111015601 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 2.7e-28
Identity = 60/111 (54.05%), Postives = 79/111 (71.17%), Query Frame = 0


Query: 374 RYEFQVDDGHLGGCVNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEV 433
           ++ FQV D +L G V+++  TC+CREFD F++PCSHAIAA+  RN+    LC   Y    
Sbjct: 317 QFHFQVRDDNLDGIVDLNAMTCSCREFDYFKIPCSHAIAAATMRNINPYSLCDEAYTTNF 376

Query: 434 VLAAYAEPVYPLGHVSEWKTSENFMDFEVLPPKRVPRVGRRQTLRIPSTGE 485
            + AYAEP++P+GHVS W +S  F++  V PPK VPRVGRR+T RIPSTGE
Sbjct: 377 WILAYAEPIFPVGHVSTWNSSPEFVNIPVEPPKTVPRVGRRKTTRIPSTGE 427

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DNQ8 (uncharacterized protein LOC111022347 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022347 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 196.1 bits (497), Expect = 4.1e-46
Identity = 90/218 (41.28%), Postives = 148/218 (67.89%), Query Frame = 0


Query: 73  VQMLHDGHWNESENYVDHQISQLLLNDGMTFIEFQHCIMQKLGSLGNLDLPNIFVSIGSQ 132
           + M H G WN+ +NYV++++S+L+++  M++ +    IM++LG +G+ D P+IF  IG+ 
Sbjct: 1   MSMFHGGFWNDRDNYVEYKVSELIIHQEMSYAKLLKDIMEQLGLVGSSDYPDIFSCIGTT 60

Query: 133 NFIKKDAEVSEDKDVRWLFRIASNNNELYCDVIVDSKNNLSVNLNNIPLTATYS--NESV 192
            F+ KD ++S+DKDV WL+ +  N     C ++VD +N LS  L+ +P+  + S  N   
Sbjct: 61  QFM-KDMKISDDKDVHWLYNVIFNGVAQCCSLVVDCRNCLSNVLDRMPINTSSSIDNGIP 120

Query: 193 GEGRFFHTIDVSKMSSNFEICMDDMFSSKIVLQNVIRSIAIRDNFQFKTVKSNRDFLVVQ 252
             G+F ++IDV+ +  NF I ++D F  K  LQN +RS+AIRDNFQF+T+KSNRD L+V+
Sbjct: 121 SIGQFHYSIDVTNILRNFHIEVNDKFCGKKNLQNALRSVAIRDNFQFRTIKSNRDVLIVR 180

Query: 253 CVVEDCEWFLRACRFGDDDSPTWVVKRFDNDHICSIDL 289
             +++C+W+L A +FGD  S  W+VK+F  +H CS+++
Sbjct: 181 FFMDNCQWYLHASKFGDQGSEIWIVKKFVQEHTCSLEI 217

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C328 (uncharacterized protein LOC111006994 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006994 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 174.1 bits (440), Expect = 1.7e-39
Identity = 82/190 (43.16%), Postives = 125/190 (65.79%), Query Frame = 0


Query: 101 MTFIEFQHCIMQKLGSLGNLDLPNIFVSIGSQNFIKKDAEVSEDKDVRWLFRIASNNNEL 160
           M++      IM+ LG +G+ D P++F  +G+  FIKKD ++S+DKDV WL+ I SN    
Sbjct: 1   MSYANLXEEIMKILGLVGSSDYPDVFACVGTIQFIKKDMKISDDKDVHWLYNIISNGAIQ 60

Query: 161 YCDVIVDSKNNLSVNLNNIPLTATYS--NESVGEGRFFHTIDVSKMSSNFEICMDDMFSS 220
            C ++VD +N LS  L+ +P+  + S  N     G+F+  IDV+ +S+ F I ++D F  
Sbjct: 61  CCSLVVDCRNCLSNILDXMPINTSSSMDNGIQSFGQFYRXIDVANISATFHIXVNDKFCG 120

Query: 221 KIVLQNVIRSIAIRDNFQFKTVKSNRDFLVVQCVVEDCEWFLRACRFGDDDSPTWVVKRF 280
           K  LQN +RS+AIR NF F+TVKSNR+ L+V C+  +C+WFL A +FGD  S  W+VK+F
Sbjct: 121 KRNLQNALRSVAIRXNFXFRTVKSNREVLIVXCLTNNCQWFLHASKFGDKGSEIWIVKKF 180

Query: 281 DNDHICSIDL 289
            ++H CS+++
Sbjct: 181 VHEHTCSLEI 190

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DYC4 (uncharacterized protein LOC111025678 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025678 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 138.3 bits (347), Expect = 1.0e-28
Identity = 59/111 (53.15%), Postives = 80/111 (72.07%), Query Frame = 0


Query: 374 RYEFQVDDGHLGGCVNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEV 433
           ++ FQV DG+L G V+++   C+CREFD F++PCSHAIAA+  RN+    LC   Y    
Sbjct: 376 QFHFQVRDGNLDGIVDLNAMMCSCREFDYFKIPCSHAIAAATMRNINPYSLCDEAYTTNS 435

Query: 434 VLAAYAEPVYPLGHVSEWKTSENFMDFEVLPPKRVPRVGRRQTLRIPSTGE 485
            + AYAEP++P+GH+S W +S  F++  V PPK VPRVGRR+T+RIPSTGE
Sbjct: 436 WILAYAEPIFPVGHISTWNSSPEFVNIPVEPPKTVPRVGRRKTVRIPSTGE 486

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CYE7 (uncharacterized protein LOC111015601 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015601 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 1.3e-28
Identity = 60/111 (54.05%), Postives = 79/111 (71.17%), Query Frame = 0


Query: 374 RYEFQVDDGHLGGCVNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEV 433
           ++ FQV D +L G V+++  TC+CREFD F++PCSHAIAA+  RN+    LC   Y    
Sbjct: 317 QFHFQVRDDNLDGIVDLNAMTCSCREFDYFKIPCSHAIAAATMRNINPYSLCDEAYTTNF 376

Query: 434 VLAAYAEPVYPLGHVSEWKTSENFMDFEVLPPKRVPRVGRRQTLRIPSTGE 485
            + AYAEP++P+GHVS W +S  F++  V PPK VPRVGRR+T RIPSTGE
Sbjct: 377 WILAYAEPIFPVGHVSTWNSSPEFVNIPVEPPKTVPRVGRRKTTRIPSTGE 427

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CVL4 (uncharacterized protein LOC111015181 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015181 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 1.3e-28
Identity = 60/111 (54.05%), Postives = 78/111 (70.27%), Query Frame = 0


Query: 374 RYEFQVDDGHLGGCVNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEV 433
           ++ FQV D +L G V+++  TC CREFD F++PCSHAIAA+  RN+    LC   Y    
Sbjct: 394 QFHFQVQDDNLDGIVDLNAMTCNCREFDYFKIPCSHAIAAATMRNINPYSLCDEAYTTNS 453

Query: 434 VLAAYAEPVYPLGHVSEWKTSENFMDFEVLPPKRVPRVGRRQTLRIPSTGE 485
            + AYAEP++P+GHVS W +S  F++  V PPK VPRVGRR+T RIPSTGE
Sbjct: 454 WILAYAEPIFPVGHVSTWNSSPEFVNIPVEPPKTVPRVGRRKTTRIPSTGE 504

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. TAIR 10
Match: AT1G64260.1 (MuDR family transposase )

HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 5.4e-06
Identity = 22/64 (34.38%), Postives = 31/64 (48.44%), Query Frame = 0


Query: 388 VNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEVVLAAYAEPVYPLGH 447
           V ++  TCTCR+F  ++ PC HA+A      +  L     CY VE     YA    P+  
Sbjct: 636 VQLNVSTCTCRKFQSYKFPCLHALAVFEKLKINPLQYVDECYTVEQYCKTYAATFSPVPD 695

Query: 448 VSEW 452
           V+ W
Sbjct: 696 VAAW 699

[Close]

BLAST of Spg015550 vs. TAIR 10
Match: AT1G49920.1 (MuDR family transposase )

HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 1.3e-04
Identity = 22/66 (33.33%), Postives = 30/66 (45.45%), Query Frame = 0


Query: 386 GCVNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEVVLAAYAEPVYPL 445
           G V ++  TCTC EF   + PC HA+A      +  L     CY VE     Y+    P+
Sbjct: 650 GIVQLNDTTCTCGEFQKNKFPCLHALAVCDELKINPLQYVDDCYTVERYHKTYSAKFSPV 709

Query: 446 GHVSEW 452
             +S W
Sbjct: 710 PELSAW 715

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022155207.1	8.5e-46	41.28	uncharacterized protein LOC111022347 [Momordica charantia]	[more]
XP_022134813.1	3.5e-39	43.16	uncharacterized protein LOC111006994 [Momordica charantia]	[more]
XP_022159268.1	2.1e-28	53.15	uncharacterized protein LOC111025678 [Momordica charantia]	[more]
XP_022145820.1	2.7e-28	54.05	uncharacterized protein LOC111015181 [Momordica charantia]	[more]
XP_022146373.1	2.7e-28	54.05	uncharacterized protein LOC111015601 [Momordica charantia]	[more]

BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1DNQ8	4.1e-46	41.28	uncharacterized protein LOC111022347 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022...	[more]
A0A6J1C328	1.7e-39	43.16	uncharacterized protein LOC111006994 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006...	[more]
A0A6J1DYC4	1.0e-28	53.15	uncharacterized protein LOC111025678 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025...	[more]
A0A6J1CYE7	1.3e-28	54.05	uncharacterized protein LOC111015601 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015...	[more]
A0A6J1CVL4	1.3e-28	54.05	uncharacterized protein LOC111015181 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015...	[more]

BLAST of Spg015550 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G64260.1	5.4e-06	34.38	MuDR family transposase	[more]
AT1G49920.1	1.3e-04	33.33	MuDR family transposase	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR006564	Zinc finger, PMZ-type	SMART	SM00575	26again6	coord: 393..420 e-value: 1.3E-5 score: 34.7
IPR007527	Zinc finger, SWIM-type	PFAM	PF04434	SWIM	coord: 391..416 e-value: 5.3E-5 score: 22.8
IPR007527	Zinc finger, SWIM-type	PROSITE	PS50966	ZF_SWIM	coord: 375..418 score: 9.927938
IPR004332	Transposase, MuDR, plant	PFAM	PF03108	DBD_Tnp_Mut	coord: 216..266 e-value: 4.4E-6 score: 26.6
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 539..568

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Spg015550.1	Spg015550.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009987	cellular process
molecular_function	GO:0008270	zinc ion binding