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Spg015550 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGAGCGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTTTGCACAAAGACCGGACCGCGAAATAGTTAACCACTAACTGTAACACCGTTAGTTAGTTCGGTTTCTATTTCACTAGGATGACCTAGGCAACTTGGCCTTAATCCTGAGTGGATTATGGACTCCTGTCCATGAGGGATTTTCCTTTGATTTGTACGAGTGAGAGTGGCCTATTCGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGATTGGGGAGCTGGGAACATAGTCTTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCAACTTTAGGGTAAGTAGAGGTGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCGGGTCTTGAACAATGGGCCCTACCCTCTTTATGGCACGAGAGGGATTTCTGTTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGTACTTAAGGACCAAGAGGTAGTCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGGGGTACGAACACACGTGAAGGGCTAACTTGCTGTTGACGGTCGATATCCGTGGACACAGAAATATATCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGGTTCTATAGTGGAGTGAACCACAGTTAACGAATATTGATTAACTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATCAGGTCCCACCGGTAGCTCTATAAGGGCGTTGAGGTAAATTTCTAAGGGTGATTTGAATATTCGAAGTGGTTCGAATATTAAGTTTAAATATGAATTGGATTCATATTAAAAACTATAGGTTATAATTAATACACATATGATGTATATTAATTCTATAGTTAATTTGAGAGATATATATATAATTAAATATATGATATTTAATTGTGATATTAATTAATTGCTGAATTAATTAATATTTTGGTTTTAATTTTAATTAAATTTGATTTAATTAAGCTATATTAAAACTATAGGATAAATGGAGTTTATTTTGTATAAATATGTTTATACAAATGTTATTTAATTAAATTAATAGTTAATTTAATTAAAGGTTTAATTAATATTATTAATTAAATTATTTCCCATCAGTTAGGGTAACTGATGGGAACGTGTGCTCCCTTTTTTCCTCAATCTTGCGTGAATGGGAGGGTTTTAAGGGGGTAGTTGTGCATTTTACGGTATGCTCTCCATCATTCAGTTTGGCTCTCTGAAAAAGCTCACGCAGAATTCTCTCTATCTCTCCCAATTCTAAGAAAACTCTCGGGAATTCTCTCCCAAAAAGAATACAGAGAAATTTTTCCCATAGAACCCTTAGAGATTGTGCTCCCACAAGCCCCTAACACGCAACCTTCAAGAGAATACCGGTGGATCTTTGTTGGTGGTGTTCGTGACTATTTTACAGCGAAATCAAGGTCTCCTTGCTGCTGTTTTTGGGAGCAATTCGAAGGATTTTTGGCGAATTGTTCAAGAAAGTCTTCAAAGGTAATGTTATCTTGAACTTGGATCAATAGGATCCTAATGAGATTAGATCTAGATTTTTCCTAATGAGTTTTAGCATGTTTTATAATTAAAATTCAGCATGTTAAATTATGTTTACTGTTGTGTTTTTATTTGCCAACGTATTGGTATTTTAGTTCAAATTAAAACTGAGTTAAGGTTCTGAACGTTTCCGCTGCGCAAGGGCTTTTTATCCCTTCAGTTCCCTTAAGTGCTGAATCCAAATCTTGAACAAGGGGCCCCACCCTCTCATTGGCCTGAGGGGGATCTTGTTTAATGGTTGGACCATAAACAAAATTGTTCATTAGAGGACCAGTGGACTTAAGGAACTAAGATGTGCTATAGGGGTAAAACGGACTTTAGACCTATCTATAGTAACGAACGACCTGTGAAGGATTGACTTACTAATCATGGTTACATCGAGTGGACACAAATATATCTACAGTGAGGGGAGTTCAACTACTAGGCTATAGTGGAGTGTCCCAGTAGTTAACGAATGTTGGTTAACTAGGTTAAAAGAGTTTGACTAGTTTAACCCCGTACCGATGGAGCCCATGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCCTTGCTAGCTCGAGACTAACCTTTAGAACAATATGGTGGATAAAATATGAATTGCTTTAAGTTCATGTTGAGAAATATGAGTAAAGGTGATAGGCGTTGTTGATATGTTGGGTTTTTGTGAAAACTATTATGGTGAGTATTTAATATTTAAATATGATCTAACTACTGATAACATAAATAGGGATTCATGATTGATAATAACATTTAGGAAATGTTTGGGATTGGTGGAAAAATATTAATTTAATATTTAATATTAAATTAATAATTAATTAATTTTTTAATAATTATTTTAAATTAATTTTGAATTAATTTAAAATTGAAAAATTGAATTTTGATTTTAATTTTTCAGATTATTAAAGTTCAAATAATTATCCAACTTATCATGGATAATTATGGATTTAATAAAAATAAAAAAAATGATTGATTTTTTGGAGGTGGAGTGCATGGTGACTAAACTCATGCACTCACCCCAAATTGGACACCAAATTTCCCACTAATCTTTTGTAAATTGAGTGTCAATTGCTGGAGCATTCTTGCATCTCTAATTCCTCTATAAAAGGCAAGGAGATGACGGAAGAAATTAAGCTTGAAAGATAGAGAAATGTTGCCAAATTGAAAACTCACCATAACTCACTTTTCAAGCTTGTTCTTCATACTTTCTTTCTCAAATTCCATCACTTGAGGATCCCACAATCCGTTCTAAAGGCTTGAGGATAGCAAGGAAGATCCTTTGGTGGTTCGTGACTCGTTGGTGAAGAAAAACAACAAAGAAATCCAACCAATTCTCCATTGATTCAAGGTTGGTAAACTATGCTCTGTTTTTCTTCTTCTTGGACAGCATGCAAACAATGATCAAATTAAACAAATTATGTGCCTAAGATCCGAAATTGCTTCCGCATTTTAGATATTAACACTTTCAAGTAGCATATAAGTGATGTACTTCAATTTAGATATATCTGATATACTGAATATAAAACAATGATATACTGTTAATATACTTTATATTAGGAATATCATTTCACTAATATACCAGAGTAAAGTATATCAACATTATATCAGATATATTTCATTTTAGGTATATCAATAGTATATCAGCAGTCAGATATAGAGAAATTTTGGTAGATAGCCCGTTTTGGAGACATTTTCACATATGTCTAAAATTTTGGATATTTACAAGATTAGATTTTCAGGTATATTTTCTTCCCTTTATACCCTTATTTTTATCATATATTTTCAATTAATATTAAAAATGATAATATTATATTTCAAATAAGCCAACCGAATATGCTACATTTTAGGAAGGTATTTTTCACCCGATTTTCCCTTTATTCCCTAAATTTAGGAATGTTCCCATAATCGTGGTTTACTTTCCTTCATTCTCCGGCTGTCCTTCGTTTTGGTTTTATTTCCGACCACATCCCATTTATTTTCTTTATTTTCCGGCAGCTCTTTCTCTCACTTTCTGTTGACCATTGCCGGTGGTTTTCTAAAATTTTCCCTGCTCTGTTTCTGTGGTTTTCCGACTTCATACATCAGTTCATAGAATCTTTGTTTGGTTGTGGTATTTTTCTGTAGGTTTCCGACAATCTGTATTTAGTTTTTACGTTCCGGTTTCCAGTGGTTTGAACATGGGTACTTTTTCAGTTTTTATATTTTATATATTCCAAGAGACATATCGTTTTAGTCAATCTAAGTTTCGTATACAGTACATATTATAAGCATGTTTTTATATGGCTAGGTTTTCAGTTTTTATATTTTATATATTCCAAGGGACATATCGTTTTAGTCAATGTAAGTTTCGTATACAGTACACATTATAAACATGTTTTTATATGGCTAGGTTTTCAGTTTTAATATTTTATATATTCGAAGAGATATCGTTTTAGTCAATGTAAGTTTCGTATACAGTACACATTATAAACATGTTTTAATATGGCTACGTTTTCAGTTTTTATATTTTATATATTAAGAGGGATATATCGTTTTAGTCAATGTAAGTTTCGTATATGGGTTCGTTTTTAATTTTAATAATTAATATATTCCAAGGATATCTCATTTCAGTCAATATCAGTTTTATGTTCAGTCAATATATTCTTCTTTCTTCTTGTTATTCACTGTGTTTGGTTGCTTTTAATTTTGGTTTGTATATATGTTGGGTTTTTTTTCATATATATTCATATTAGGTATATTGTAATTATATGATGGGTTTGTATATATGCTGGGTTTTTTCCATATATCTTCATATTAGGGGTTTTTCATATATTTTCTTGTTATTCTGATTATACTGTGTTCGGGTTTATAGAACATGTATAGATTATGTATTTTTGTGTATATATCATATTTTACATATTATATATTCCAAATTATACCAAAATACATATCATATGTCAGATTAGTTATGTTTCATATATAACATGTGTGTCTGATATATATTTTGTGGTTTATTGCTTATATATATTTTTAAGGTAGCGTAACTGTTCAAATGTTGCACGATGGTCATTGGAACGAGAGTGAGAATTATGTGGACCACCAAATATCACAGCTGTTATTGAATGATGGGATGACTTTTATTGAGTTTCAGCATTGTATCATGCAAAAACTAGGCAGTTTAGGTAATTTGGATCTCCCCAATATATTTGTTAGCATAGGCTCCCAAAATTTTATAAAGAAGGATGCAGAAGTCTCTGAAGATAAGGACGTAAGATGGTTGTTTAGAATAGCCTCAAACAATAATGAACTGTACTGTGACGTAATTGTTGATTCAAAGAACAACCTATCAGTTAATTTGAACAATATCCCCCTCACAGCTACATACTCTAATGAATCGGTAGGTGAAGGACGCTTTTTCCACACCATTGATGTTTCTAAGATGTCTTCCAATTTTGAGATTTGTATGGACGACATGTTCTCTTCCAAGATT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ATGCGAGCGGGGGTATCCTGTGCAATGAGTCCATCAGGTCCCACCGGTAGCTCTATAAGGGCGTTGAGCGAAATCAAGGTCTCCTTGCTGCTGTTTTTGGGAGCAATTCGAAGGATTTTTGGCGAATTGTTCAAGAAAGTCTTCAAAGGTTTCCGACAATCTGTATTTAGTTTTTACGTTCCGGTTTCCAGTGGTTTGAACATGGGTAGCGTAACTGTTCAAATGTTGCACGATGGTCATTGGAACGAGAGTGAGAATTATGTGGACCACCAAATATCACAGCTGTTATTGAATGATGGGATGACTTTTATTGAGTTTCAGCATTGTATCATGCAAAAACTAGGCAGTTTAGGTAATTTGGATCTCCCCAATATATTTGTTAGCATAGGCTCCCAAAATTTTATAAAGAAGGATGCAGAAGTCTCTGAAGATAAGGACGTAAGATGGTTGTTTAGAATAGCCTCAAACAATAATGAACTGTACTGTGACGTAATTGTTGATTCAAAGAACAACCTATCAGTTAATTTGAACAATATCCCCCTCACAGCTACATACTCTAATGAATCGGTAGGTGAAGGACGCTTTTTCCACACCATTGATGTTTCTAAGATGTCTTCCAATTTTGAGATTTGTATGGACGACATGTTCTCTTCCAAGATTGTGTTACAGAATGTGATTCGATCTATTGCCATCAGAGACAACTTCCAATTCAAAACCGTGAAATCTAACCGTGATTTTTTGGTCGTGCAATGTGTTGTTGAGGATTGTGAGTGGTTCCTTAGAGCATGTCGATTCGGAGATGATGATAGTCCCACTTGGGTTGTCAAGAGATTTGACAATGATCATATCTGTTCAATTGATTTAGGATCTTATGATTCAATGAGTAAGAATTGTGATCTGGTTGCTTTTAGCCATTGTTTAGATATGGTGGGAAAGGTTGTTGCTATTACAGGAATATTCAAGGGGAACAGAGTTCTGAATTGGAGATCGAAGGGAATATACAAGTGTTCATTCTTGCTTCCTTTCAACAAGTTTAGAGCAACTTGCTTAAGAACAATGCCCAGATTCAAGCTAAGGGTGACAATTCTCCTGTACCTGGCACGTGGTTCGACCAATTGCCGGTACGAATTCCAAGTCGACGATGGACACTTGGGTGGTTGTGTCAACATCCACACGAGGACGTGTACTTGTCGTGAATTTGACTGCTTCGAACTTCCGTGCTCCCATGCAATTGCAGCCAGCATCTACCGGAACGTGCCATACTTGGATCTCTGTTCTTCATGCTACCGTGTTGAAGTAGTGCTAGCTGCTTATGCAGAACCCGTATATCCACTAGGACATGTATCGGAGTGGAAAACATCCGAAAATTTTATGGATTTCGAAGTCTTGCCTCCAAAGAGGGTTCCAAGAGTGGGTCGACGACAAACATTGAGGATACCATCCACGGGAGAGTTCGGGTCTCGTGTTCAATTAGTACACCTATATACATATAAGTTTGCCAACTCACTGACAGTGCACAAGTGGGAGTTTTGGGAGGTCTCTACTCCTACTGATGGTAGATGGCACCCAATTACTGACAGGCTAACTAATAGGTACCATCCCAACTCAGTCATATCTCAAGACAAAGAAATGGAGGCGACAACTGCTACTCCTAACAGAGAAAACCACAACTTCTCGTTGCCCACAAACAATGTCAGTCAGCTTTAA MRAGVSCAMSPSGPTGSSIRALSEIKVSLLLFLGAIRRIFGELFKKVFKGFRQSVFSFYVPVSSGLNMGSVTVQMLHDGHWNESENYVDHQISQLLLNDGMTFIEFQHCIMQKLGSLGNLDLPNIFVSIGSQNFIKKDAEVSEDKDVRWLFRIASNNNELYCDVIVDSKNNLSVNLNNIPLTATYSNESVGEGRFFHTIDVSKMSSNFEICMDDMFSSKIVLQNVIRSIAIRDNFQFKTVKSNRDFLVVQCVVEDCEWFLRACRFGDDDSPTWVVKRFDNDHICSIDLGSYDSMSKNCDLVAFSHCLDMVGKVVAITGIFKGNRVLNWRSKGIYKCSFLLPFNKFRATCLRTMPRFKLRVTILLYLARGSTNCRYEFQVDDGHLGGCVNIHTRTCTCREFDCFELPCSHAIAASIYRNVPYLDLCSSCYRVEVVLAAYAEPVYPLGHVSEWKTSENFMDFEVLPPKRVPRVGRRQTLRIPSTGEFGSRVQLVHLYTYKFANSLTVHKWEFWEVSTPTDGRWHPITDRLTNRYHPNSVISQDKEMEATTATPNRENHNFSLPTNNVSQL Homology
BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022155207.1 (uncharacterized protein LOC111022347 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 196.1 bits (497), Expect = 8.5e-46 Identity = 90/218 (41.28%), Postives = 148/218 (67.89%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022134813.1 (uncharacterized protein LOC111006994 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 174.1 bits (440), Expect = 3.5e-39 Identity = 82/190 (43.16%), Postives = 125/190 (65.79%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022159268.1 (uncharacterized protein LOC111025678 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 138.3 bits (347), Expect = 2.1e-28 Identity = 59/111 (53.15%), Postives = 80/111 (72.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022145820.1 (uncharacterized protein LOC111015181 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 2.7e-28 Identity = 60/111 (54.05%), Postives = 78/111 (70.27%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. NCBI nr
Match: XP_022146373.1 (uncharacterized protein LOC111015601 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 2.7e-28 Identity = 60/111 (54.05%), Postives = 79/111 (71.17%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DNQ8 (uncharacterized protein LOC111022347 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022347 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 196.1 bits (497), Expect = 4.1e-46 Identity = 90/218 (41.28%), Postives = 148/218 (67.89%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C328 (uncharacterized protein LOC111006994 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006994 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 174.1 bits (440), Expect = 1.7e-39 Identity = 82/190 (43.16%), Postives = 125/190 (65.79%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DYC4 (uncharacterized protein LOC111025678 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025678 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 138.3 bits (347), Expect = 1.0e-28 Identity = 59/111 (53.15%), Postives = 80/111 (72.07%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CYE7 (uncharacterized protein LOC111015601 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015601 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 1.3e-28 Identity = 60/111 (54.05%), Postives = 79/111 (71.17%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CVL4 (uncharacterized protein LOC111015181 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111015181 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 1.3e-28 Identity = 60/111 (54.05%), Postives = 78/111 (70.27%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. TAIR 10
Match: AT1G64260.1 (MuDR family transposase ) HSP 1 Score: 50.4 bits (119), Expect = 5.4e-06 Identity = 22/64 (34.38%), Postives = 31/64 (48.44%), Query Frame = 0
BLAST of Spg015550 vs. TAIR 10
Match: AT1G49920.1 (MuDR family transposase ) HSP 1 Score: 45.8 bits (107), Expect = 1.3e-04 Identity = 22/66 (33.33%), Postives = 30/66 (45.45%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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