Spg015544 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg015544
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold10: 10194234 .. 10204669 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg015544
SyntenySpg015544
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGACAGCGTCGCGACGCTGTCGCGATACCGCATTTTTGGAAAATTTGCCTATAGCGTTGCGACGCTGTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTAGATTGAAGACTCCATTTGACTCCAATTGCTGAATTGAGCTTCAAACACATACTTCCTACAAATAAAATATAAAAATGCATAAATTTGGGCAAATAATTGTAAAAGACTAGCTTAATTAATCAGAGAAAAATAGCTAGCTATGCTCGCTATCAATTATCACTGATAAACTTAAATTAAACTGATGGATAGAAACTGATAGCCTTGAATTAAACTTAACTAATAGCCTTGAATTAAATTGTTTTATATTAGCGGCTATCACTGATAGGCTTGAATTAAACACGATAAAAACTTATAGATTATGATCATCAAAGTTTATCTGTGATACACAGTGATAGACTTCGATTAATCAAAGTATATTAGTGTCTATGACTAATAGACTCCGATTAATTGAAACTTATCATCAAAGTCTGTCAGTATTTATCATTGATAGACTCCGATTAATCGAAGTCTATCAGTGACTATCAATAATAGGGACTGATAGACTATTGGAGATACTAAGGGTATTTTCGTAATTTAACGTATTTTTTGCTATTTCCGCAAATAATTTTATTTTTTTGCTATTTTTGCAATTCTTTTGCCGGTTTTTGCTATCTGTGCAAAGCCCCCTAAATTAAAACACCATTAAGAAATTGCAAGCAATCTAAACAGAGAACATTAATAAGCTCTCAATTTAAATTAACTTTACTACTAATGAGAGCATTAATAAACCAATTAAGATCTTGGCTTTCATAGTTGTAATATTGCCACACAAAAGCTTCTCCTAAATTTAACAATGGTGTAGAAAAGAAAGACATCTTATGCGACATTGAGACAAGAGTTTTTCTTGTTTCCAGACTTCATAAACTTGCATTAACAAATATTTGGTTCTTGAGAGTTGTTGTACTTGAATTACAGGGAAAGACTATTTGTACTCCATTAACTAATAATGGCTAAAGGAATATAGAAATATACTTCAGTTCTTGAAACTATTTAAAGTTTTAACTTTCACATATATTCTCTGTAACAACCAGTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGAAATGGTTTTTTTTAGGCGGTCAAAGTGGGTGAGTGGGGGGGAAGTTTCCCCCCACATTTTCGGTCAATTTGACCAGCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAATCTGAATTTCTTCTCTCCCTCTCACGTTTTCCCTCTCTCCCTCGCAGCTTTCCCTCCCTCTCTCGATTCTCTCTCTCTCGCAGTCCCTCTCTCTCTCGCTCCCTCTCGGTTCTGTCTCCCTCCGCCGCACGCCAACCGTCGCCGCCGCCGCCGCACGCCTCCGTCCGTCGCAAGTCGCCGCCGCCGGTAACGTTTTCCGTCCCTCTCTCTCTCTCTCGATTTTGTTTCTCTCGTCTCTTTCTCCCTCGATCTCTCTATCTCTCTCTCAGCCACTCTCTCTCTCTGTGTAGCAGGTCCGACGCGCCGCCGCCTGCAACCCACTCACGAGCTGCTGTCGATCTGCGAGTCGCCGTCGCCACTGTAGGCGCGGACAGCAGCGAGGAGGGACCATTTTTCCGTGTTTTCGGCTGTTTTAGGTGAGTTCCCGCATTGGGTAAGTTGATTTGAGGCTTTTGTGGGTTAGTTCTTGCATTTAAACGATTACCCATTCACTTTTTCACCCGTTCAGCAAGCGTACCCATTCAATTCCGGCGATTCAAGCAGTGGGTCTTCAAGTTTCAGCGTGTTTGAGCAATTTCGGCAGTGGGTAAGTGAGATTTAAGGTGTTTTGGGTTTATTTAATGTTTAATCATGGATGCCCATTGAGTTTAGCTTCCGATTTCAAGGTGCCCGTGGTGTTTGGAGGCCGAATTATCAAATTTGAGCGATTTGGGACTGCTGGACAGCAAGCTGTGGTTCTGTTTGGGGTAAGCTTTGGTTGTTAATTTTACCCCAAATGTAATGGGTTCTTAGTTGAATGCTTGGTTAGAGTCCATAGTTAATTAAGAGTTCATTTCCTTGTTGTAGCTTGCTTAAGAACCTTGGAGTTAAGGAATTTCTTGGAGGTTAATCAAGTATCTCCTTCACTAAGGTAAGTAGCTAGTTGGATTCAAATTTTATGTCTTAGACTAATTGACCCTTGTTTGTTAATTGGGAATTTAAAGTGGATAGTTGGATTGAAGTGCCATTTGTTTTAACTAAGTTGGTCCTTAAGCTTAAGTAAAGTGTGTTGGGTTAACTTTTGAAGCATGATTGAGCATGTTGAGATTGTCATTATTTGGGCATTAAATGAGAAGCGTGGATTATGGAATAATTGGAGTTTGGGCTAAGTGTTCTTGTTTGTGTTGAGGCCGTGATTTTCATACCCTATTTGGTTAGCCATGAACTGAAATGCTTGGGATTAATGTATACGTAGTCGTTGGATTTAGTTATATGCTTTGGCTTAATTTTCTTTGAAAAGTTAATATGTTAGCATGTATAAGATTTGCGCCTTGAGTTTTGATTGTGGAATCATGATAAGCTTCATTATAAGTCATGTTGATAGCACGAGGATCTTAAAGTTAACCTAGCATCTCTTGGTTTGTTTTAAAGCATGTTTGGCTTGGATGGCAATGTGTTTCTCTGGATTTATTTGTGATGTTGGGGAATGGGTTAAATGTCTGTTGGGTTTGGATTGAAGTTGGATGCGACATCTGTCCCGTTGTGGCTATAGAAGTGCAATTTACTGTTTCCAGGTGTATAGAAAAAAATTTGGGTTCCCTCTACGTACGTCGTTATGCTGCCGAATTTTCGGTAGCCTCAAGATGGCTTAGGAATCATATTTACCTTGAGGGAAAGGATTAGGAAAGAGAAGGGAATAGGCTAGTGCCTTAGACAAGGGTCGTGTCAATTAAACACCTAGGACTGAGATGTAATAGACTGAAATGAGGGGCTTAATGGGCGGGACTTGGCTTCGCAGTTTAGGTGCCATTTACTAACTGTGGAAGTAAATTCCTGACTTAAACCCATGAACGCCCCACCAGTGAAATGGTAGTTTAGAGCGCTACGCGCCTATTAGTGCCTTGAGGGATGAGACTTAGCTTCACTGACTGGGTGCCATCTACCATCAGTAGGAGTAGAGACCTCCCAAAAACTCCCACTTGCGCACTATCAGTGAGTTGGCAAACCTATATATATTTAAAGGTGTACTAATTGAATATGAGACCCGAACTGAAATGAAATGAAATGGAATGAAATGAAATGAAATGAAATGAACTGAAATGAGATGACCTAACCCTTAGGCCCTTAACTCGAATAAGATGTTAAAAATTTTATTGCTACTTACTGAGTATTTCCTTAAATACTCATTCTTTTCCCTTACACACAACTGCAGGTAGAGGTAAAGGTGTACGGAACGCGTGACGGAGAGCTGCTGAGCCATGGATCTCCTTTAGTTTAAGTCTTCCGCATTTTACGTTTGAAATTTCCCTTTGAACTTGTGTTGAATGATTTACGTTTTATTCCGCTTTAAGTTTGTTTGATTTACTAAAGGTTTTGTTTGTTCTGTTTTAAACTGGGATCCCAGATTGAAATGTTTCGCAAATTTCTAAGTATAGTTTCTTTAAATGGAAATTTTCCGCTGTTCTTAAAAGTAGAATGAAATGCATGTAGTAATGGCCTTAGGATCTAGGCATGAAAAGTAGGGTCGTTACAGTTGGTATCAGAGCTCTAGGTTATAGGTTCTGTAGACTGGTTTACATCGTAAACCTTAGGTATGTCCATGGCTTATCAGCAAGCATCCGGTCACGCCAGGTACACGTTTGATTACCTTGTAGCCTGTAAATATTATATGTTATATATGTTCGGAAAAGATTCATGTTGTGGGAAAGATATGCATGAGGTTTAGTGCCTGAGAATTGTTTAAAGGATTCAAGCCTGTTAGTAAGATGATAAAATTTTTGTGAAATAGATCATGCCTCCCCGAGCACAAGGACGTGGAAGAGGTCGAGGAAGAGGTCGTGGTAGGGGTCGTACAGCCCCTGAGCAAGTCGTGCCACCAGTAGAGCAGGAAGGAAACCTACCAGAAAACCCACAAGTGGAACAGCCGGGGCCTGCGGTAGGACCTGTCCCGGTGGACATTCAGGCAATAGTTCAGACCGCAGTTCAGGCCGCAGTTGCGGGCGTGCTTGCAGGGCGATAGGCCCAAGCGCCTCAGAATAACGAAGCCGCCTTATCACGGGAGGCTAGGTGCCTAAGAGATTTCAGGAAGTGGGACCCCTGTCCGTTCGATGGAGCCTCAAGGGACCCCACGGTAGCAGAGTTGTGGCTGTCCTCCATCGAGACGGTTTTCCGTCACATGAACTGCCCCGAGGACCAGAAAGTGTATTGTGCCGTGTTTTTGTTACGAGATAACGCCCTGATTTGGTGGCAATCGATTGAAAGGACCTTAGACGTCAGCAACGGACCTGTCACATGGACTCAGTTCAGGGGGGAGTTTTTCAGGAAGTATTACCCTGCCGCCTCCCGATTCAAGAAGCAATCAGAGTTTGTGGCTCTTACGCAGGGAAACCGAACCGTAGAGGAGTACGAGACAGAGTTTGCCAGACTGTCTCGGTTTGCCCCTGCCCTGGTAGCTGTAGAGGCTGATAAGGTGGAACGTTTCATCACAGGCTTAAAGGAAGAGATTCAGGGCAGTGTGGCAGCCCATGAACCCCAAGACTATGCCACGGCAGTTAGGGTGGCACAGCTAATTGATCGACGACCGTCAGCTGTCTCTTCAGAACCTTCTTCAGGTCATAAGCGAAGGTACGATCAGATGAGCTCGAACACACAGAGGGGTCACCGTTACCCTAGACGAGGTCCGCCCCAGGACCGTCGACAGAGAGCACAGAATCAGTCAAGGCCTAATCAGGATAGGCCATTATGTCAGACCTGTAGGAAGTACCACTGGGGTCGTTG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mRNA sequence

ATGGACAGCGTCGCGACGCTGTCGCGATACCGCATTTTTGGAAAATTTGCCTATAGCGTTGCGACGCTGTCCGACGCGCCGCCGCCTGCAACCCACTCACGAGCTGCTGTCGATCTGCGAGTCGCCGTCGCCACTGTAGGCGCGGACAGCAGCGAGGAGGGACCATTTTTCCGTGTTTTCGGCTGTTTTAGTTTAGCTTCCGATTTCAAGGTGCCCGTGGTGTTTGGAGGCCGAATTATCAAATTTGAGCGATTTGGGACTGCTGGACAGCAAGCTGTGGTTCTGTTTGGGATCATGCCTCCCCGAGCACAAGGACGTGGAAGAGGTCGAGGAAGAGGTCGTGGTAGGGGTCGTACAGCCCCTGAGCAAGTCGTGCCACCAGTAGAGCAGGAAGGAAACCTACCAGAAAACCCACAAGTGGAACAGCCGGGGCCTGCGGTAGGACCTGTCCCGGTGGACATTCAGGCAATAGCGCGGACAGCAGCGAGGAGGGACCATTTTTCCGTGTTTTCGGCTGTTTTAGGTGAGTTCCCGCATTGGCAAGCGTACCCATTCAATTCCGGCGATTCAAGCAGTGGGTCTTCAAGTTTCAGCGTGTTTGAGCAATTTCGGCAGTGGGTGCCCGTGGTGTTTGGAGGCCGAATTATCAAATTTGAGCGATTTGGGACTGCTGGACAGCAAGCTGTGGTTCTGTTTGGGGTAAGCTTTGCTTGCTTAAGAACCTTGGAGTTAAGGAATTTCTTGGAGGTTAATCAAGTATCTCCTTCACTAAGGTGTATAGAAAAAAATTTGGGTTCCCTCTACGTACGTCGTTATGCTGCCGAATTTTCGGTAGCCTCAAGATGGCTTAGGAATCATATTTACCTTGAGGGAAAGGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGACAGCGTCGCGACGCTGTCGCGATACCGCATTTTTGGAAAATTTGCCTATAGCGTTGCGACGCTGTCCGACGCGCCGCCGCCTGCAACCCACTCACGAGCTGCTGTCGATCTGCGAGTCGCCGTCGCCACTGTAGGCGCGGACAGCAGCGAGGAGGGACCATTTTTCCGTGTTTTCGGCTGTTTTAGTTTAGCTTCCGATTTCAAGGTGCCCGTGGTGTTTGGAGGCCGAATTATCAAATTTGAGCGATTTGGGACTGCTGGACAGCAAGCTGTGGTTCTGTTTGGGATCATGCCTCCCCGAGCACAAGGACGTGGAAGAGGTCGAGGAAGAGGTCGTGGTAGGGGTCGTACAGCCCCTGAGCAAGTCGTGCCACCAGTAGAGCAGGAAGGAAACCTACCAGAAAACCCACAAGTGGAACAGCCGGGGCCTGCGGTAGGACCTGTCCCGGTGGACATTCAGGCAATAGCGCGGACAGCAGCGAGGAGGGACCATTTTTCCGTGTTTTCGGCTGTTTTAGGTGAGTTCCCGCATTGGCAAGCGTACCCATTCAATTCCGGCGATTCAAGCAGTGGGTCTTCAAGTTTCAGCGTGTTTGAGCAATTTCGGCAGTGGGTGCCCGTGGTGTTTGGAGGCCGAATTATCAAATTTGAGCGATTTGGGACTGCTGGACAGCAAGCTGTGGTTCTGTTTGGGGTAAGCTTTGCTTGCTTAAGAACCTTGGAGTTAAGGAATTTCTTGGAGGTTAATCAAGTATCTCCTTCACTAAGGTGTATAGAAAAAAATTTGGGTTCCCTCTACGTACGTCGTTATGCTGCCGAATTTTCGGTAGCCTCAAGATGGCTTAGGAATCATATTTACCTTGAGGGAAAGGATTAG

Protein sequence

MDSVATLSRYRIFGKFAYSVATLSDAPPPATHSRAAVDLRVAVATVGADSSEEGPFFRVFGCFSLASDFKVPVVFGGRIIKFERFGTAGQQAVVLFGIMPPRAQGRGRGRGRGRGRGRTAPEQVVPPVEQEGNLPENPQVEQPGPAVGPVPVDIQAIARTAARRDHFSVFSAVLGEFPHWQAYPFNSGDSSSGSSSFSVFEQFRQWVPVVFGGRIIKFERFGTAGQQAVVLFGVSFACLRTLELRNFLEVNQVSPSLRCIEKNLGSLYVRRYAAEFSVASRWLRNHIYLEGKD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 104..146

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg015544.1Spg015544.1mRNA