Spg013929 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg013929
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold3: 42150782 .. 42153877 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg013929
SyntenySpg013929
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGTTAACGGCATCGGGAGAAAGGTACTCTCTCCCGAGGTCACGTCAACAACGTCAAGATAAAAGTACTCTCTCGCGACGCCGCGACGGGGCATCAAGAGAAAGATACTCTCTCTCGACGCCGTGTTGACGGCGTTGAGAGAGACGAAGTTTCTGCCGACGCCGTCATTAACGGTGTCGGCAAAGAGTTTATTAAAAAAAACCCTAACCCAATTTTCATCTTCTCCATCTCGACACAGCCCCATCTCCCTCCAAATTTCTGCGATCCGAACCCCTACGCTGCGCCTCGCCCTCCGCCGCCACACCTCGCCGTACAACCGTGCCTTGCCCTACGTCGCGCCTCGCCGTCCAACGCCTGCCGCTGTTCGTTGCTCTCCGCCGTTCCTTGCTCTACGTCGTGCCTCGTCCAACCGCACCTCGCCGTACGCCGTGTTTGTATGTATGCCTGTTCTTATCTTTGGATAGTTCCCCTTGATTATAGTATTTTTCTTGCCCCTATTTTTGGGGTTCTGTTATAGAGTTTTGGTTTTGGTTGTTGTGCTCGCTGTTTGAAATTTTCATTAGCGTGTTAAGAACGTAGTCTGTGTGTATTTTGTTGAATTTCTGCTGGTTTCTTGACTATTGAAGTTTGGAATTGAGTGGGATTTTGGTGTTTGTTTGATTGATGGTTGATGTTATTAAAAACTTTGATTTTGCAATGCTGTATTATTGCTTGAATGGATGTATTGTGAAGTTCTTCTATGGTTCAATGGTTATATGTTCTTTTTGGATTGAACTGATTACAGGTAAACATTCAAGTTTCTTGATAAATTGGTAGGAATTTGTAATATTTCTAGAGTCATTTTTATTTTTGTTATTTGAATTTGTGTTATGTACCTAGGATCTGTTATGGGAAGGAAATTGGCTAGAAATTTGTTTGAGTTATTTGCTCTCTTTAAAAGCAATCAAATTGTAAGAGAGGTGCTTTACACAAGCTTAAGGTTGGACATTTCACCACCATATAAAGGAAACTTTGATTTTCTCTCCTCTATCTCTTATTTATGTGTGTGTTTTGTGCCTCCGTCTTCGACTTCGTTGATTTCGATTCTGGCATCATCTCTTTCTCCGACTCTTTCTTGTTTCCAATCACCCATTCATGTTGCTGTGTGATGTATATAAGAATGTCGTGACATGGTTGCTCTACTTAGAATGATATTATGCCCATGAAAATGAATACAAATTTTCTTGTTTTGAAACTTTAACCTATAAGACTAGCAATAATTAGAGGCCATTGTTGAGTTTGAAGCCTAGTTAATTGGGAGCAAATCAAAAGTAGTATATTTCATTAAGTGTGCCTTCCATCATTCATTTCATTAAGGTGCTTGGCAGTGGGCAGACAAGGGAAGGACATGGTAGAAAGATGACAAATTTGTTTTCTTCAGCAACTTTGAGTTTGTTAATACCCTTTTCCAAATACCACACCTTACTGATATGATTTTGGGTTTAACTTTGTTCCACTTCCATCATTCATTCATTAATTCTCATCCATTAATAGCTTATAACATATTCTTAGTATTCTTATACTTTGACTTCTAATAATGTCCTGCTCCTTTTACTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAACAAATTATTTTTGTATTTTTTAAAATGCTTACAAATATGTATTTTTTAAAAAGAGTAGTTATAAATGTAGTTATAAATGTAACGAACTAGACAAATAAAAGATGGAGCCATTGTGGCAAGGACTAGTGATATGGTCAAAATATGGTTTGAGCAAAGTAATAAGAAAGGTATGGCTTGCTTGAAACATAAATCATGGAAATTGGTAAGACTTACTTGGTCTCCTAATATGCTCGTTTAAGTGCTGAAAACTGGTTTCTAAATCTTGGGAAGTGTTATTTTGTAGATTCATCACCTTGAAGCACTCACTGTCAAGGAACGTATTGGTGAATTTAAGGATTTGGCTTGTTGGTGAGTGAGGTGGTTCTCCTTCAGCACTCATTTGTTTCGAATAAGCTTTTTAACTCAAGTATAATCTTTAGATGTTATTGTTTGTTATTGTTTAGGAGCTCTCCAAATTAATTTAGCAAGCGCGTTAAGATTTATGCAAGTATTTTCTACCTTTTGGGGCCCGTTTGATTGTGTGTTAGCATGTTGTGTGCCTTGCTTGTGTTATTCATGATTTACATGAATATTTTCTCTTAATTATATGATCTAAGCATGTTGTAAGAATTTTGTTGTAGAAGTATGTTGTATGTGCATATAGTGGTGGACATAATGCATCGATCTAAAAGCATGATGTAGGATACATCGGTTTTAGTGACTCTATGAGTAAACAGTCAAAGGACCTTGTGTGTAGAAGAGATAATGTATAATTCAAGAATGTGAGTAAACAGTCAAAGGACCTTGTGAGTAAACAACCAAAATTAGGTACGCCCTCAATATAAAATTTGCAATTATCTTAATGTAGTATGATTTAATCAATATGTAGAGTTGTTAATACGAGACCTGACTCGTATGCTGATTGTTGTAGAGTTCTGTTGAATTGAAGTATGGGGAAGTTAATTGAAATATTATAGGAGTGTTATTTTTATGTTTGTTGGTGTTTTAAAAATTTTGGGTTAGCCATATGTATGTCGTTATGTTGCTGAAATTTCTGGATAGTTGTTAATACTTATTTACATGTTTTGCATGTCTTGTTAAAATATTTGCATTCTACACCATCTGTTTGAGTTTGATTTCAAGATGGAATCTATCAAAAGTTTTCATTGATATGAGTTTGGATGTTAAGAAATTTTTTTCATATTTGGTCTAATGCAGCTAGATGAGCATGATTCTTTCTAAAGGAAATACTAGGAAGGTTGTTGGGTGGTTTTGTGTTTTAGTTAAGGTATGTTGTGTGTGTTTCTCTTGTACAGAAATTGTTCTATTCCTCTTTTTGTTTTCAAAACCATTTTGTTTACTTGAATCCTGAATTTCCATCACCAGGTGTTCAGGGAGAATCACAAGGCACTTCACATTGTCTAGAAGCACGTGAGTTCAAGTTGATTTTCTCAATGGTGTATGTTGGTGGGGCTAAGGAAGTTTCTTTTTATCTTTAG

mRNA sequence

ATGTTAACGGCATCGGGAGAAAGCCCCATCTCCCTCCAAATTTCTGCGATCCGAACCCCTACGCTGCGCCTCGCCCTCCGCCGCCACACCTCGCCGTACAACCGTGCCTTGCCCTACGTCGCGCCTCGCCGTCCAACGCCTGCCGCTGTTCGTTGCTCTCCGCCGTTCCTTGCTCTACGTCGTGCCTCGTCCAACCGCACCTCGCCATTCATCACCTTGAAGCACTCACTGTCAAGGAACGTATTGGTGAATTTAAGGATTTGGCTTGTTGGTGTTCAGGGAGAATCACAAGGCACTTCACATTGTCTAGAAGCACGTGAGTTCAAGTTGATTTTCTCAATGGTGTATGTTGGTGGGGCTAAGGAAGTTTCTTTTTATCTTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTTAACGGCATCGGGAGAAAGCCCCATCTCCCTCCAAATTTCTGCGATCCGAACCCCTACGCTGCGCCTCGCCCTCCGCCGCCACACCTCGCCGTACAACCGTGCCTTGCCCTACGTCGCGCCTCGCCGTCCAACGCCTGCCGCTGTTCGTTGCTCTCCGCCGTTCCTTGCTCTACGTCGTGCCTCGTCCAACCGCACCTCGCCATTCATCACCTTGAAGCACTCACTGTCAAGGAACGTATTGGTGAATTTAAGGATTTGGCTTGTTGGTGTTCAGGGAGAATCACAAGGCACTTCACATTGTCTAGAAGCACGTGAGTTCAAGTTGATTTTCTCAATGGTGTATGTTGGTGGGGCTAAGGAAGTTTCTTTTTATCTTTAG

Protein sequence

MLTASGESPISLQISAIRTPTLRLALRRHTSPYNRALPYVAPRRPTPAAVRCSPPFLALRRASSNRTSPFITLKHSLSRNVLVNLRIWLVGVQGESQGTSHCLEAREFKLIFSMVYVGGAKEVSFYL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg013929.1Spg013929.1mRNA