Spg012995 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg012995
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold1: 10938009 .. 10946863 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg012995
SyntenySpg012995
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TCCCTTCAGCCGCCGCGCCGCCTCCCTCCGCCGTTGACGCCGCCGCACGCCTCCCTCTCCGACCGCCGCAGCACGCCACGACGCCGGCGCCCCCTTCTCCGGTGACTCGCGGTACACACGGCGGCAACAACTCGTTTTCGGCCAGCCATCACAGTAGGTTCGTTTTTCCTTTTTCTTCTGTGTGGCTTGCGGTTATGCATCTCCTCTCTCGTCGATCTCTCACGCCCAGCCCCTCCCTTCTCTGTCTCATGTTGTAGCAGCGTGGGTGCGCGTGTTTAGCGTTGTTTCCGGCAGCAACACTGTAGGCGCGGACAGCAGCGAGGAGGGACCATTTTTTCCGCGTTTTTCGGACGTTTTAGGCGAGTTCTCGCAGTGGGTCTTCGAGTTTCAATGTCGTGGAGCATCATCGGTAGTGGGTAAGTGTTTTTAAACTTGTGTTTCAGTTGGTTTATGGTGTTAGAAGTTTACCCATTGATCGAGGCAATTATCTTCAAGGTTTTCGTAGCATTCGGTGAGTTAGTTGTTGTCTTGGAGCGTGTTAGGGAGCTTGGACAGCAAGCGCGACTGCCGTTTGGGGGCTTGGAAGCAAAGAAGTTAGGTCGGGTGGTCAAGCAACTTAACTAGCTATGTAAGTAGCCGTTGGAATAAATTCTCTGCTTTAAACTCTTTTATGTGGAGTATGGTTTGCGATAGCATGAGCTGGGTTAAATCCTAAAAGTTGCCCCTTGGAATTTAAGTAGCTAATTGTATTCAAAATTCCATGTTTTAAGTGCATTGCATGGTAGCTGAACATGGTGAGTAACATGTTTCATTGGAATGAAATGTGTATGTTTGGAATGATTTGGTTACTCGTGGCATGAAAATGTGTATAAGTGGTTCGGATTGAGACTGAGGTGATATGTTGCGTTAATTTCAAGAATATGGCTACTACATGTATAATTGTGTTGTGTGATAGAAGCGAGCGTATGACTGATGTATATTTTATAGCTGACTGACATTGTTGTGGGCAACTGGGGGGGGGGGGGGTTTGTGTTTTTCTCTGCTTAGGAGGGTTGTCGTTTAAAAAAAAAATATAGCAAGAGTTAAGGGGTCCTAAAAGGGAAAGAATTAAGAAAGGGAAAGGAATAGGCTAGTGCCTTAGAAGAGGGCCGTGTCAATTAAACACCTAGGACTGAGATGTAATAGACTGAAATGAGGGGCTTAATGGGCGGGACTTGGCTTCGCAGTCTAGGTGCCATTTACTAACTGTGGAAGTTAATTCCTGACTTAAACCCATGAACGCCCCACCAGTGAAATGGTAGTTTAGAGCGCTACGCACTCATTAGTGCCTTGAGGGATGAGACTTAGGTCCACTGACTGGGTGCCATCTACCATCAGTAGGAGTAGAGACCTCCCAAAATTCCCACTTGTGCACTATCAGTGAGTTGGCAAACTTATATATATATATAGGTGTACTAATTGAACACGAGACCCGAACTGCAGATAAATGAAATGAAATGAAATGAATGAGAAGGAGATGACCTAACCCTCAGGCCCTTAACTCGAATAAAATGTTAAAACCTTGATTGCTACTTACTGAGTATTTTCTTAAATACTCATTCTTTTCCCTTACATACAACTGCAAGTAGAGGTAAAGGTGTACAGAACGCGTGACGGAGAGCTGCTGAGCCATGGATCTCCTTTAGGATAGTCTTCCGCATTTTATGTTTTGAAATTCTTCTTTTGAACTTGAGTTGCGAATGATTTAAGGTTTATTCCGCTTAAAGTTTTGTGTGAATGGCTTAAGTGTTCTTTTGTGTTGTTTTAACTGGGATCCCAGGCCGAAAAGTTTCACAATATTTCTAAGTATGTTTTCTTTAAATGATATTTCCTCGCCATTCTTAGAAGTAGAAAGAAATGAATGTAGTAACGACTCTAGGATCTAGGCATGAAAAGTAGGGTCGTTACAATCTGTATCTCAAGTATAATGTAAGAATAAAGTAAAGAGTATCTATGTTTAATCTTATATTAAAATGTGGTTGCTTCTCTTTATTTTTTCCCCCTTCGTTCAAAACTTAGCTAACTTGCCCAAATTTCATCAACTTAACCCCATTCATAATTATTATGAATCAACCCACAAATGACAAAGTACTATTTAATTATAGCTATATTACGTATGTGAAAATAAATTAAACTTTGGGGAAAATGTTTAGACAAGTTCTGTTGGTATTTTAGTTATCTTTGAATTTGAGTAATTTATGCCCTTTTAGAAAGAAAGATATGTACTCATTCATATATATCTTTTATTTTTATTTTTTTATTATTTTACACTTACAAAGTTATTTGCACAGTACAAAATTGAGTTTGCTTGTACTTATCCATTATGAAAAATTATGAATCAACTCATCTTATTTAATAAAAAAGATGCAACTAATCGTGCTTATCTTCAAATAAACAATCTTTGGGTGATCTCTGAGGAAGTATACCAGAAATCAGACAAAAATATATTGAAAAGAATTGGGTACGTTATTAGTTTGTTCAGTAATTTTCAATCTTAAAAGTAAGTTGAAATGTTACACGAATGTGATTCAATCTTATTCTTGATGAAGAAATGAAAATTCTTTATGAAAATGGCATAAAATGAAAATAGTAAAAAACACACATACATAAATTCTTAGGAGAAAATTTTATAGCTATTATAAAAGATTTAGCTAATTAATTGAGAATTCAAAGATGATAAAAAAGAACCTATACAACACATAATTGGATAAATAATGAAATAGTAATTATATACACATGCATGCTACATTTTCATATTCTCCATAATGTTGCGAGAAGGGAGAATAATAATAAGAGTAATTGCACTGGGTGGCAAATTAATTATCTATAATAGCAAATTTAGCACCAAGTAAAAAGAATTGCAAATATGGCAAAAAAATTAGAATATTCCCATTTTACCCTTCTCTTTCTCTCCCTTCCCATTTACCTTTCTTCCTTCATTTCTAGTGTATACGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTATGAGCCTTTCTTTCCTCATTTCTTGCGTATACGATTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTGTGCATTTATGAGCTGTTATGATTTCTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTTTTATAATGAGCTATTACGATTTCTTTTTTTCCCTCTGTTTTTCAAACCACAGACCTTGTGGTTATCAGTACAACTTTATGCCAATTGAGCTAAGCTCTTGTTGGCCTTCTTTTTAATTCAAGAATGTCAAGAATACAAAATTAGCAATTTTGGTGAGTGTTTGTATAGGTATATCAAAGTATATCACTGATATACTCCGGTTAATCGTAGTCTATCACTGACTATCACTGGTCGAAGTCTATCAGGGCTATAATTGATAGATAATGAAATACAAAGAATACAAGAATAGCAATTTTATGGTGGTGGTCACGGAGCTTGTGTGCTAGTCTTTAAAAATTATATTGTTGATTGAGAGTCGCTTGTTCGTAATGGTTATTTTTGGATTTTATGTTCTAATTACCACAAGAGACTTAAATTTTTTGTTCAATTTATGATTGTAGTATAATAATTTTGGATGAGTTTCTAATTACCGAGATGATTGCAATGCAAAGTACTTTACTGATAGATTTCAATTAAATTGAAATCTATCAGTAACAATCATTGGTAGACTTCAATTAATTGATAATTAACTGATTTCTATCCGAGATAGAAACTGATAGACTTCAATTAACTGATTTCTATCCTCGATAGAAAATGATGGATTTGAATTAAACTAATTTCCATCAGTGATACAAGTCAATAGACTTTAATTAAATTGATTTCTGATAGAAACTGATAAACTTCAATTAAATTGGTTTCTATTAGTGATAGAAACTAATAGTCTTGAATTAAATTGATTTCTATCAGTGACAGAAACTGATAACCTTGAATTAAATGGTTTTCTATTAGTGATTATCACTGATAGACTTAAATTAAACTGATGGATAGAAACTGATAGCCTTGAATTAAACTGAACTAATAGCCTTGAATTAAATTGTTTTCTATCAGCGGCTATCACTGATAGACTTGAATTAAACACGATAAAAACTTATAGATTATGATCATCAAAGTCTATCAGTGATACACACTGATAGACTTCGATTAATCAAAGTCTATCAGTGTCTATCACTAATAGACTCCAATTAATTGAAACTTATTATCAAAGTCTATCAGTATTTATCATTGATAGACTCCGATTAATCGAAGTCTATCAGTGACTATCAATAATAGGGACTGATAGACTATTAGAGATACTAAGGGTATTTTCATAATTTAACGTATTTTTTGCTATTTTCGCAAATAATTTTATTTTTTTGCTATTTTTGCAATTCTTTTGCCGGTTTTTGCTATCTGTACAAAGCCCCCTAATAATAATATAATAAAAAAAAAAGCGTAAATAAACATAATTGAAAAGGGGAATAAAATTTTGAAAATTTGTTTCTATATTAAATAGCAATAATATTTACCATATAAGAATTGAGTCAAGTAGGGAATGAATAAGTTGAATTAACAAAATAAATATGGAGTGTAGTTGGAGGGTATATATTGGTATGGAAATTCACATGATTTTGTTTCTAAACAAATAATAATAAAATGAAAATATATAATTTTCTAGTCATTAAGTTTTTTAAAAAAGTAATACAATTGTAGTGTAATTATCTTCTAATGATAAAGTTTAGAAAAAAATAAATCAAATATTATGGGTAATCATTTTTCAATCATTTAAGTTTGAAAAAAAAGGAAAAACACAAAATTTAAAATTAAAAGTAAACATGAAAATTAAGAAAAGAAATTAGAAAAAAAGGAACCCATCTCCTATATGATTGGGATAGTACATGGCGTACAATTTCTTTCTTTTCAAATGGTACATGACCTATGAGGCATGAGGCACGTGACGAGAGCGTTCG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mRNA sequence

ATGCTCCTCCGAGACACCTGGCGCGCTTTCAGGGTGGGGAGGATTTGGTTTTCTCTGACTTTATCATTATCCGCTCCCCATCTCCCTTCTCGTCTTCGACCTCAGCAACTTTCCGGCGTTTCTTCTTCGTCTTCGACCGTAGCAGCCGCCGCCTGGTCCCGTTCCCCTCTTCTTCATCGACCTCCGCAGCTCCGACGCCGGCGTCAAGTGCAGCTCGTGAATTCCGGCGGCGACAGCTTCGGTGTTCGACCATCGGCGGCGTGGGATAGGGCCGAGATTATTGCATTTTCCGGCAGTGGCGTCGTTCGGCTCGTCCAGCAGGGCTTGGCGGCGTCTCAGCGACTATCGGGCGTTGTATGCTTACTTGGGCGTGACTTAAATGTTGTTTACGTGGACATGAATCAAGCATTGATTTCTTTGGATGGGCTGAATATTGTTGTAGTTGTGGTTGAAGCCTGGATGCGAGGTTTGACTCGCTGTGTCTATAGGAGTGTTTTGTTCTTGTTCCAGAGCTCAGTTTCAGGCACGCTAGCGTGCGCTCTCTCAGTTCAGGACGGTGTTGAACTTATGATCAGGCACGTTGCTCGTGCGCCATTTGGCACCAGGCATGTTTACATGCGTCAGTGGTACTTGAGAGCGTTGGCGATCGGCGAGAGTCGTGGCTTGGCTGGCTATGGGACTGCAGCTGCAAATTTTGTCATTTTCCTTAGGAATACAATTCCTTTCATTCTAACACCAGTTTCATGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTCCTCCGAGACACCTGGCGCGCTTTCAGGGTGGGGAGGATTTGGTTTTCTCTGACTTTATCATTATCCGCTCCCCATCTCCCTTCTCGTCTTCGACCTCAGCAACTTTCCGGCGTTTCTTCTTCGTCTTCGACCGTAGCAGCCGCCGCCTGGTCCCGTTCCCCTCTTCTTCATCGACCTCCGCAGCTCCGACGCCGGCGTCAAGTGCAGCTCGTGAATTCCGGCGGCGACAGCTTCGGTGTTCGACCATCGGCGGCGTGGGATAGGGCCGAGATTATTGCATTTTCCGGCAGTGGCGTCGTTCGGCTCGTCCAGCAGGGCTTGGCGGCGTCTCAGCGACTATCGGGCGTTGTATGCTTACTTGGGCGTGACTTAAATGTTGTTTACGTGGACATGAATCAAGCATTGATTTCTTTGGATGGGCTGAATATTGTTGTAGTTGTGGTTGAAGCCTGGATGCGAGGTTTGACTCGCTGTGTCTATAGGAGTGTTTTGTTCTTGTTCCAGAGCTCAGTTTCAGGCACGCTAGCGTGCGCTCTCTCAGTTCAGGACGGTGTTGAACTTATGATCAGGCACGTTGCTCGTGCGCCATTTGGCACCAGGCATGTTTACATGCGTCAGTGGTACTTGAGAGCGTTGGCGATCGGCGAGAGTCGTGGCTTGGCTGGCTATGGGACTGCAGCTGCAAATTTTGTCATTTTCCTTAGGAATACAATTCCTTTCATTCTAACACCAGTTTCATGTTGA

Protein sequence

MLLRDTWRAFRVGRIWFSLTLSLSAPHLPSRLRPQQLSGVSSSSSTVAAAAWSRSPLLHRPPQLRRRRQVQLVNSGGDSFGVRPSAAWDRAEIIAFSGSGVVRLVQQGLAASQRLSGVVCLLGRDLNVVYVDMNQALISLDGLNIVVVVVEAWMRGLTRCVYRSVLFLFQSSVSGTLACALSVQDGVELMIRHVARAPFGTRHVYMRQWYLRALAIGESRGLAGYGTAAANFVIFLRNTIPFILTPVSC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg012995.1Spg012995.1mRNA