Spg011683 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAATTACTAAGATTAAATCGTTACAAATTAAAGTTTATTAGACTAAATTGTTACTTTCAGGGAGATCGGGAACAATTTTTAACTTTTTTTTTTTTGTAATAAAATTATCTATTATCGTTAAAAGAAACAAAATAAAAAGAAAAAAGGAAACAAACACAAAACTGGGCCCATTTTGTAAAATAAAACAAAAATCAATAAAAGAAAGAGGAAAATCGTAACTCTTTCATCTGTGCTAAGTCACTTCTTCTTCGCGCCGTCTCCTCCTCCGTTTCCGTTCACTGCTGCGTCCGCCGTCGTCTTTCTTCCGCTCGTATCGCTGCCACCACCGTTTTTCTTCCATACTGTGAACTGTAGAAAACATTTGCTGAATTTATCATTAAACTTCTCTCGGCTGGACTGTGAACTGTAGAACTCGCTTGAGCCCGCGCCTCTTGTTTTTTGAGCTCCTTCTCGCGCCCTTGTGACTGACGGCGACGAAAGTCACCCGATAAGCTCATCCCGAACTCGATAAAAGTGGAAACCTCGATAGTAATCTTGGAGTGATTGTTGTGCATTGCACAAGTAAGGAGTTTTGATCGAGTTGATCGATTAATACTTCAGCTTCTGAATCATTTCTACTTTCTTTTCTGGAATTTGGTACTGTAGGTTTTTCCATTTCAGCTATAGCTATGGAAACCGACGAGGCCGAGCGTGTCCTTCCATTCCAGCTCCAATTTGACAAGCCTATTGCCTCCCAGGTTTGCTTTTCCCGCTTCACCGTCGGCCTCCTACTTAGTTGCACATACATTTGTCCATTTTTTTTGGAATGATCCTTCTGCTATTGTGTGTGGTGAGTGAGCTGTTTTCTGCTCTGAATATTTGATGATTTGCTACTGCAAGGTTAAAATTGCCGAGTGGAACCCGGAAAAGGATTTGCTAGCCATGGTCACGGAAGACTCGAAGATTTTGCTCCACCGTTTCAACTGGCAGAGGTTGTGGACTATATCGCCTGGTGAGTTATATGTCTCCTTGACTTCCTTGGCTTAATTTTTTTCCTCTCCTAAATTCTTAAAAAAAGTTAACTTAACCTGTTCTCTTCGAGTTTTCAGTTCCACACTGCTTTATCGTAGTTGTTTGGTCTAAAGAAGTGCATCTGACATGTGTGTGTGTTTGTGTGTGTTTGAATCAGCATCTAATATATGTTGAAGCTTGATTTTTTTTTTTTGTCTGTTATAATGTAATGCATAGGTTAAATAGATTAATATCAAATTGTTAAAACTAAAAGGGAAATATTTCCTCATTCAAAAGACCATCTTTAAGTTATTTAATGATGACATTGATTCTTGAACTATTGGTGTTACAAACCTACACTAAAGTTTTTTCAAAAAAAAAAAAAAAACTTACACTAAAGTCTAAATTCTTGCTACGAACAATTTTGGTTCAATGAACCGTAGTACATACAACAGGAGAACGATGCTTCCTCTTGAGAACTTTGTGTTTTGCACTTGGTTATTTGTTTTAATGTGCTGCATTGTCGTTAAGTGACATCCTTGGCTATGAGTGATTGTATCATTTCTGTGTAGGAAGGTCTATAAAATCGTTATGTTGGAGGCCTGATGGTAAGGTGATAGCAGTTGGGCTTGAAGATGGGACAGTTTCATTACATGACGTTGAAGTGAGTAGCCTTACTAAACTTTCCAAAATAGTTTTCCTATTCATCAGTCGATCATGGAATTCTTACACATGTCAAACAGAACGGGAAGTTGTTGAGAAGCGTAAAGTCTCATGCAGTTGCTGTGGTTAGTTTAAACTGGGTGGTGGATAGCCAGTTGATTACAGTATGTAACTCTCCACTTATTTATTTGGTGCTTTTCATGAATTTAATTGGGAAATCATTGTGCCAACGTTATGCAGAATGTGCAACATGAATTATGATTTTCAAGTATGAGTTTCGTTCTCTCTCATTCCTTCAACCTTTTTCAAAACCGTGGTACAGGACAAAAATGAAAACTTGTCATCTTATGAAGATCGCACTAGCCGTATTTTCCCTCCTGCTCCTACAGTTCCTCGAATGCCTGGACTTGTTTCAGGAGATACTGGTTTCATTGATGACAGTGAAGACTCATTTACAGAGTTGTCAAATTCTTCACAACAACGGTTTAACATCTTGTGCAGTGGTGACAAAGATGGAAGCATCTGTTTCAGCATATTTGGTATTTTTCCAATTGGAAAAGTAGTAAGTTAACTGATTATTATCTTGGACCTTTCTTTCTCTTTGGAAAAGTAGTTAGTTAACTGGTTACTTTGCTCCCTTCATAAATATAGTCTTCAAATACACTGATAAAATTGTATCATTTCACTTGTATGAAAATCCAATGTGGTTTGTAACTTCCAAAACTGTATATTTCGGTTCTGGTTATCAATGCTTCCTGATCACTCGAAGCCCAAAGACCAAAACCCGACGCCAAGCTTTTCCGTCCTCTTCTTGTTTCTCTCTGCCCACTTCTGATATATATTTGTAATTTCTCTGTCCTGAAATTATCTGTCTAATAGGGTTTTTTGTTCTATGAAACTATTCTTGTTAATAAGTAATGACATCTGTGAAGCATCTGCCTTCATTCTTTCTTTATCATTTACTTTATAAAGAATATAGTTAAAGACCACGTGTAATCAATGAAGATAATGTAGTTATTCCTCACAAGCTCCAGAACAAGTGATAGAAATCCCGAAAGTTGCTTGATTCATGATTGTAGTATAATGGGTAACTGGAGCTTATTATTATTATTTATTACTTTCTTAAAATTTATTTTTTTAATATCTTGAGTGCATGCAGTTTTTTTTTTTTTGTTGTATTGATCAATTGAGTGCCTCCTCCATTGATGTGTTTTTTTTCTTCAATGTGACAGAACATACACAAGCTTCATATTCCTCTTCAAGTCCAAGATGCCAGTGCTTCATGTCACCTTCTGAATGCTGAAATTTACAAGGTTTGAGAAAACACTTAGGAGGATTGCTATTTTACATTTATAGATTTTATTTGACTATATGGCCTTTTCTTTTAGGGCTATAGTTTTTAATTTTTTGTCAATAGCTCTAGCAAGATTCTTGTTACTGTCCTGGTGAGGTCTTGGAACTTAACCAATTCATGAGATCTAAGTTCGTTAGTAAGTTGCATGCGTGGGGATCAGGAGAATTAATTTGCAGGTTAGATGTAAATCCATGAGGATTTTGAGTTATTGAGTTGTATAGCAAAGTATTTATTTTATTTTAAAGTTAAAGATTCACTCAAAGATATCATTGCTTTTATGCTATTCTCTAAAGAAATATGGTGACTCTGAGCAACAGGTATGATGAAATTCTTGACAAATAAAATCTTTTAATGTAGTTTAATTTACAATTTTCATCTCTTATATTGGTTCAAGTGAGGTAGAGAATTTTAATTGTTCCATATCCCGGCATGAATATGTTCCATTGTGCTTCTATATCAGCACCTATGAGCGAGCACTGGTGGTTTGCTTCCAAGATATTGCTCATTTGAAGCTTCATGCAGAAGATTGTGGGAGTTAGCTTTCTGATGGATAGTTGATATGGAGGTCGAGCTTCAAGTTTAAAAATCTCCACTGAACTATTAAAACCTCTTGGTTGTTAAATTAAATAATTTGATATTGAGGATTTTCCGTTCAGTCATTAAGATGTCTAGTTCTTACTTGTTAGATTAACTTTAATGTCGAGATTTCTCCAATAAATGTACCTGTCCTTGAAATGTAACTTTCGATTTTAGCTGGGAGTATTTGAAATGTAACTCGGATTTCAAGTTTCAGAAACCATAATTGGTTTCTGAGTAACTTCAGTAATGTAGACAATTTGTTTTACGTTTGATGTAGGTTGCTTTATCAAAAGATCTTTGTCGGTTGATAGTCATGTGCTCAGGAGAACTCGTTGGAGATGGGCATGATCCAAGAAATAGACAGATCACCGTTCAAGGTGTGCATGGCATGCATTCTTTAGTGCTTGATACTTCAATATTTAGGAAGAGGTAATGTTACTGCAGACACTTGGGATATTGCTGATTCTTTGAACATATTATTTGCTGAACTATTTGCCCTGGGATTTACATTTTCTAGTGTTCTGCTTCTATTTCTTGAATTCTGGTAGGAAGATCATTGGTGAATGATTATGGATATTATTAGGGGCATATTAGTAATATGGTAAATTTATTGTAGTTGAATGGTCATAAGCAGGATTTAGGGGTAGGGAGAGGCAAGCAGATTTTGGGAATGTGAGTATCCCCTTATAATTTTCTTTGAAATTGAAATATTTTTCCACTCCTTTTTTTCTTTTCTTGATTTCCAGCCTCTGGTTCTGGTTCCTATCATATTGTCATTATGCATTTCTTTAACTGCTCTGATATTTCCCTGAAAAAGAAAACTGCTCTGATATTTCCCTGAAAAAGAAAACTGCTCTGATATCAAGCAAATTTTCTTGTCAAAAGGCTGGTTTAGTCTTGATGAATACTATCTTATCTAGTGTCTTCCCACCATATCCTTTCTAACCTTTGTGCTCCAGGAAAAAGAAATGAAAAACTCATTTTTTCCTTCTCGTTGCAGGAAAGGTGAGCTGCATCAGGTAGCTCAACAAGCTTCTAACATTGGGGAGTTGACTGAGGTAATCAGGGCATCATTATCAGTTATGAGTAAACAGTGGTCTGATGCCATGCACACTTTCCAAGAGAAGTTTGATTCTTTATCCACGCTGATTATGAACCATGGTAATAATAGATATTAAAGATATTCATGCTACTCTTTTTACCCCTACTCATGTCGCTTCTTCTCTTACATGTAGGACTTGACTCGTCTCCCCAAGAGGAGTTTCTTAGCCTTTTAGGTGGTGCACGGACTAGTCCTCCAGTTCACCAATTTTTAGTTAACTCTCTTGGTGAAGTGGTAGGTATGTTCTGCTCTTTGATCATTTCAGAAATTAATGATCGTTTGTTCACTTGCCGATTTGTTTAATAG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METDEAERVLPFQLQFDKPIASQVKIAEWNPEKDLLAMVTEDSKILLHRFNWQRLWTISPGRSIKSLCWRPDGKVIAVGLEDGTVSLHDVENGKLLRSVKSHAVAVVSLNWVVDSQLITDKNENLSSYEDRTSRIFPPAPTVPRMPGLVSGDTGFIDDSEDSFTELSNSSQQRFNILCSGDKDGSICFSIFGIFPIGKVNIHKLHIPLQVQDASASCHLLNAEIYKVALSKDLCRLIVMCSGELVGDGHDPRNRQITVQGVHGMHSLVLDTSIFRKRKGELHQVAQQASNIGELTEVIRASLSVMSKQWSDAMHTFQEKFDSLSTLIMNHGLDSSPQEEFLSLLGGARTSPPVHQFLVNSLGEVGAKRVSKAVSGAGSELQLIVLDHLQPAVEIIGFRMGELLALSRWRARFQGVGLDEKLMNNAMEKAGMLLVQVDRFMRVLSTVLQQFSNFFNWLIRCIKLLMSEPSDQLLPYNSELVVIFLKFLYNQDPVKKLLEASENDDNIEIDSETMDVLALLALLSLMTIAFTLMGDVCFWTLVPSKVSLIYLSFNAWLVPPRGGSIFSLAWKECGGGLGSFALELSVSLCFVELLCFRSSASTLVASRVVKRQLRSSSIRPFHEKGRFLWQVRVCAILWEVVERVRELALFGGFSDCEFLRRTLGMEFQQMESRRNMNDREAKEYARLLLMENLQPNLKDSRRGTVLSSLNDYGDSCKRSMRCGGSFRRGPQTEFNSWLGLVSLIYPIRLGDDGDENQDHIFLRCPFAVRGWEQIVKAFGSFKEAFLMPFSTISRKILCEDLLSLFPFQSSSSCLSSSVPLSVSYYEVFILLLSILYVAFGSSEAVSADQSCQQNFIDYISFKVPDDSFADIANCVGIARGFIHDQSCSNEDYSSFEAVLVSIPDGSRCVDLSLYKDGQIVLLLNETASTSESSVGSYMMVVQANDLPFVSMPRSPCLDNWNVHQLKDYVVPLQMENEKVRNIPHAVVPPLAVSASRGVACVFAARKRALVYILEEDEDEASDAE Homology
BLAST of Spg011683 vs. NCBI nr
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BLAST of Spg011683 vs. NCBI nr
Match: XP_022949706.1 (anaphase-promoting complex subunit 4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1334.3 bits (3452), Expect = 0.0e+00 Identity = 727/1023 (71.07%), Postives = 747/1023 (73.02%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. NCBI nr
Match: XP_022977972.1 (anaphase-promoting complex subunit 4 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1333.2 bits (3449), Expect = 0.0e+00 Identity = 727/1023 (71.07%), Postives = 744/1023 (72.73%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. NCBI nr
Match: KAG6603721.1 (Anaphase-promoting complex subunit 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1328.2 bits (3436), Expect = 0.0e+00 Identity = 723/1023 (70.67%), Postives = 744/1023 (72.73%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. NCBI nr
Match: XP_022142094.1 (anaphase-promoting complex subunit 4 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1323.1 bits (3423), Expect = 0.0e+00 Identity = 722/1023 (70.58%), Postives = 742/1023 (72.53%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65418 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=APC4 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 942.2 bits (2434), Expect = 4.9e-273 Identity = 521/1018 (51.18%), Postives = 623/1018 (61.20%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RAQ5 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=ANAPC4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 161.8 bits (408), Expect = 4.2e-38 Identity = 124/497 (24.95%), Postives = 235/497 (47.28%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9UJX5 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ANAPC4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 161.4 bits (407), Expect = 5.5e-38 Identity = 123/497 (24.75%), Postives = 235/497 (47.28%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91W96 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Anapc4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 158.7 bits (400), Expect = 3.5e-37 Identity = 123/497 (24.75%), Postives = 234/497 (47.08%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54NI1 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=anapc4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 123.6 bits (309), Expect = 1.3e-26 Identity = 117/557 (21.01%), Postives = 240/557 (43.09%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GCS1 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453021 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1334.3 bits (3452), Expect = 0.0e+00 Identity = 727/1023 (71.07%), Postives = 747/1023 (73.02%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IJW1 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111478105 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1333.2 bits (3449), Expect = 0.0e+00 Identity = 727/1023 (71.07%), Postives = 744/1023 (72.73%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKL4 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012308 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1323.1 bits (3423), Expect = 0.0e+00 Identity = 722/1023 (70.58%), Postives = 742/1023 (72.53%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJ41 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501540 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1300.4 bits (3364), Expect = 0.0e+00 Identity = 708/1023 (69.21%), Postives = 740/1023 (72.34%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TZ68 (Anaphase-promoting complex subunit 4 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold114G001730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1297.3 bits (3356), Expect = 0.0e+00 Identity = 707/1023 (69.11%), Postives = 738/1023 (72.14%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. TAIR 10
Match: AT4G21530.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 942.2 bits (2434), Expect = 3.5e-274 Identity = 521/1018 (51.18%), Postives = 623/1018 (61.20%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. TAIR 10
Match: AT5G25150.1 (TBP-associated factor 5 ) HSP 1 Score: 48.9 bits (115), Expect = 2.8e-05 Identity = 27/107 (25.23%), Postives = 48/107 (44.86%), Query Frame = 0
BLAST of Spg011683 vs. TAIR 10
Match: AT4G29830.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 45.4 bits (106), Expect = 3.1e-04 Identity = 35/122 (28.69%), Postives = 59/122 (48.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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