Spg011316 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg011316
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold8: 11443433 .. 11448096 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg011316
SyntenySpg011316
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTGCTGCGTTTTTGTTCGTTGAAGCGTTGTTGGCGAAGAATGGTCAAGTCTACAACGAAGGTTTGTAACGGTTCTTTTCCGTTTCTTTAGAAAAGCATGAAAATAAAAGTAGTTTTATTTTCTAGTTATTTTCAGCATGTTTATAGCGTTTTACAGCGGCTTTAAAGCATGTTTAAAGTTTTGTTTTGCCTTTTTGTAACTATATTTTGATATTAATTAATATATGACGCAAGGTCCTATCGATTCGCTTCCGCTGTGTCGGGGCTTTCATCCCCTTCAGTTTGAAATTGATAATGTAAGTGCCCTCCAAGCCCAGATGTCTACCCTCGCTAATGCTTTCTTGAAGTTTTCAGGTACATAGAGTGCACAAACCATTGAGTCAGCTGCTGCTTTAGCATCTCAATCTCAGGAGGAGACCATGGAACAGGTTCAGTACGTATCTAATTCTAATTTTAGGGGATATAATAATAATTCTACACCTACACATTATCACCCTAACAATAGAAACCATGAAAATTTCTCTTATGCTAATAATAAGAATGTCCTTAATCCTCCTGGTTTTGCCCCTCAAAAGCAAGAAAATAAACAATCTCTAAAGGATCTTGTTGGAGCTTTTATTGCAGAGTCTAGTAACAGACAACTAAGCTAGAGGAGGCCGTTATTGCAATTAATTCCACGGTGAATGGCCACAGTGCAACCATAAAAAACATTGAGACTCATTTGGGACAGTTGGTAAGTGTTGTAAACACCATGCATAAAGGTAAAGCCCCAACTGAGCAGGAGAAACCCTAGATGGAGTACTGTAAGGCCATCATTGTGCACTAGAAGGAGGAGATTGAAGAGACTGAGGAGCCTGAGACTGAAGAATATGACACGCCTACTAGATAAGCTGAGGAGGACACATCAGATGAAGCTGAAAAGCCTGATCCTGAGCTTCCTATTCCTTCTCCCACGTTGTTGGTCCTCAAAGAGAAGAAAAAGAAGAAAAAGAAGAAAAAAAAAAAGAAAAAGAACAAGCAGGTTGAATTTGATAAGTTTATGAAAGCTTTTATGAATCTAAACATTAATATTCCTTTTGCAGAAGCACTAGAGATGCCCCAGTACAACAGATTCATGAAGGAATGGTTGGGAAAGAAAAGGAAGGAGGAGAAGGTTGACACGGTATACCTAGCATTAACATGTAGTGCTAGAGTACAACATAAGGTACATGAGAAATTAGCAGATCCGGGGAGTTTTTATGTTCCTTGTAGTTTTGGTACTTATTCTTTTAGAGCATTATGTGACTTAGGTGCTAGCATTAATATTATTCCCTTATCCTTATGCAAGAAATTAGACATAGGTGAGATTAAATCTGCCCCTGTTAGGCTCCAATTGGCTGACCAGTCTGTAGTTAGACCAGTTGGCATTATAGAAAATGTTTTAATCAAAGTAGGTAGATTTGTACTCCCTATTGATTTATATGTTATGGATATGACGGAAAATCCTTCAGTACCTATCATACTAGGGAGACCATTCCTCGCTACTAGGCGAGTTATCATTGATATTGAGCGCATGGAGCTCACTGTTAGAGTCCAAAATGAAAAAGAAATATTCAAAGCTTTTGAAGACTCTAAAGATTGTACAAAGGCGCTCGTGATAGGCTACAGGAAAGGTGCAAGCAAGAACACCTCTGGTGGATTCACAGAAAAGAAACCTCCTTGATGCATGCACGTTCAACACGTCGAGCTAAAGACGTTAAACAAGCGCTTATGGGAGGCAACCCAAGTAAGTTTGATTTTGTTTTTGTGCTTTTGATTTTTTTGTTGTTTTTGTTTTGTAGGTGTTCTTGAACTCTTGGCTTGCAAACATCCATGAGAAGGTCATCATTCTAGGGTAGTATTGTTCACCCCTTCCATTCTTTTATTGTTCTCATGCTTATGTATGCTTTAGATTTCTATACATTGAGGACAATGCATGTTTTAAGTTTGAGGGTGGACTGCTTTGCTTGTTGAGCCCTTGAGCATCTGAGTTCGGGCTATAATTTATGAGCTTCTTATGATTATGGCATATGGTTGTTTTTGGATGCTACTTTTGCATGATTATGATTTCCTAGGATAGACTTTCTTGTCAATTTTTAAGCTTTTGATGAGTTGTAAGCATGAGTGCCCAAAAAGGGAGACTTTTTAAAATTTTTCTAGGAGATGTCTTGCATTAGTGGTGTATTTTCCTTGGTTTGAATTGGACTTGAATGCTTAGGAGCGAATTATTAGGTTCATATGCTTGTTGTCACCTCGATAGGTGTAGGGAGGAGCTAAAGAGTTAATTTTTGCAAATTAGCATGTTTTATCTTGCCTAGGAGGAAAGAAAAGAATATATGCTTATCATGCTCATAAAGAAAAATCAATCTTGTTGTTACATTTGAAAGAAAAATAAATTCATGACTTATGCCCGCAATGCAATGTTTAATAATGTTTTAGGCTAAAAGAGCTACCCCTATTGTGATCAGTTAGGCCAACCAAGGGTTAAACTCGAGTTATGGGTCCCTACAATAGGTGTGTGAAAGCTAGTGTCACTTTTAAATGCTTGATTCAATTTAATTTAAAAAGCACTTAGGTATGGATGAAACAAACTAATTTGTTCCATTAGCTCATTAGTGAATCCTTAGTGCCAGTGTAGAGGGAAGATGAGTTGAGAGTTTAATAATCCAATCCCGAGCTATTAGAGTCTAATCTAGCTAAGTTAGATCTCGCTTATGCAAGTTAATTTTGGAAAAATTTAGATTTGTCTCCTTCATTGGGCCTTATGTGCATGTCTCTTGATTGCTTGCTTATTGACTTTTGAGCCTTGAGGATTGAGTTGTGTGTTGTTGCATCCTTTTACAACCGATGTCTAATTTTTAATTTGCTCGAGGACTAGCAAAAGCTTAAGTTTGGGGGTGTTTGATAGCGCGCATAGCGATCTATATTTCCCGATAAATTATAGTTAGTCTTTGAGTAATCCTTGGTCATTTTAATGCACTTTAATGTTATTTTTGTAGGAAATTGTTTATTGGAGTTAAAACGAGAATTTGGAGATGATCGGGTGTTCGGGACACCGAAAGAAGCCAAAAGAGTAAAGAGAAATCAAGTTGGAGGCTAAACAAAGTGGGCATGTCCGAGAGCTAGCGTCTGGCGTCTCGACGCTCCAAAGTTTCCTAATCTAATTTGGGAGGCAACAGAGGCAGCATCTCGACGGTGTCCCTTAGCGTATCGACGCTGTGACATTTTCCTATTCTGTTTTTGAGGTGCAGAGGACAGAGTCGCAATGCTGTCCATAGCGTCTCAATGCTGTCAACAGATTTCCTATATATTCATCCTTAATTGCTACGACCAAGGGGAGTTGATAACTCTCCAAAAGGGAGTTATTTAGGCCTTAATTCTATAGTGTTTTGTGTGTCATTTGTGCTAATTAGGGTTGCTTTTAGATAATTATTGCATGTTCTAACCCATTTGGAAGAATGGATGCTTTGGAAGTTATTTTGTGCAGAATATATTGCTGAGCGACTTGAGGGAGCAAATTCTGCGATCCAGCAAAACAGGGAGCAAAACTGCCACGTCACAGCTCGTTATCCATTTTAATGAACTGAAGTCAGTTAAGCTATTCTCGGATTTAAGAAGCAAGGAGAGTCATCCACGTGTCTAGGTCAACCTAATTCAAGTGTGTCTTCATTCTATAAAAGGGAAGAGCCGTTCAAGTCAAATTCATTCCACTTTTGGGGAAGAGATCATTTCTCATTTCCATCATTGGGAGCCAAATAGAGGAGAAAGATTGGAGACCTCAAGAAGACCATCAATTACGAAGTTGATCAAGGGAATTAGTATTTTCTTGTATTATTTTGTAATTATGGATGCACATACTCAGATTGTAGTGTGTGTTACCATGTGTGCTATGAACTAATTTACTTTAGGTGTTGGTTAGGAAATATGTAATTGCTGCGCTTAATTCTCTATGCAATATATGTTGATTTGATGCATCTTGGTTATTTGTTGTGCTCATTTATATTTTATGCCTGCTTGGCCAGCCAGTATGAATACCACTTCCTAGTTTCAGGGATGATTTAGGAAGTGTGTGACATTTAATCACACTAGATCATTGTGTATTGGTGAATGCCAGTGACTGAGCTAGGGATAGCCAGTTGCCTAGTGCTTGATCGGTAGTGCGTCATTGGAGTTGAAACACATTCTAAAAAATCCAGAGTTCCGGGAGGATCCTGCTAATAAGACTGCAAGAGTTTTGCCTGATCAATAATATTGCTAGAGCATCTTTTAAAACAATTACTAAATCCTGACCAGCGCCTGTTTCTAATCTGTCTGCTCTATTTGTTTACTTTTGTTCCGTCATTTCTTTTGCCTCAGTATTCTATAAAAACCAAACATTTTTACTACTTTCGAAACCATTAAAGAGTTGCAAAAAATAGATAAAGTGAGAGCTAATTCAGACCTTGGATTCGATAAATACTTATTACTTGCTGCGGATTGTGTATGCTTGCACAAGTGTTCTAGAGTTTAATTTCATCTTATTTTTACTCACTCTGGGAACCCAACAGGAGTCCAATTGGAGAGAATTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTCTGTGGGAGTTGAAGGCTGAAGCAAGGCCAAGGAGCGGGAACCAAGCTTGA

mRNA sequence

ATGCTGCTGCGTTTTTGTTCGTTGAAGCGTTGTTGGCGAAGAATGGTCAAGTCTACAACGAAGAGTGCACAAACCATTGAGTCAGCTGCTGCTTTAGCATCTCAATCTCAGGAGGAGACCATGGAACAGAATATATTGCTGAGCGACTTGAGGGAGCAAATTCTGCGATCCAGCAAAACAGGGAGCAAAACTGCCACGTCACAGCTCGTTATCCATTTTAATGAACTGAAGAGTCCAATTGGAGAGAATTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTCTGTGGGAGTTGAAGGCTGAAGCAAGGCCAAGGAGCGGGAACCAAGCTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTGCTGCGTTTTTGTTCGTTGAAGCGTTGTTGGCGAAGAATGGTCAAGTCTACAACGAAGAGTGCACAAACCATTGAGTCAGCTGCTGCTTTAGCATCTCAATCTCAGGAGGAGACCATGGAACAGAATATATTGCTGAGCGACTTGAGGGAGCAAATTCTGCGATCCAGCAAAACAGGGAGCAAAACTGCCACGTCACAGCTCGTTATCCATTTTAATGAACTGAAGAGTCCAATTGGAGAGAATTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTCTGTGGGAGTTGAAGGCTGAAGCAAGGCCAAGGAGCGGGAACCAAGCTTGA

Protein sequence

MLLRFCSLKRCWRRMVKSTTKSAQTIESAAALASQSQEETMEQNILLSDLREQILRSSKTGSKTATSQLVIHFNELKSPIGENLALISTRDLLWELKAEARPRSGNQA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg011316.1Spg011316.1mRNA