Spg011109 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg011109
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold4: 26708833 .. 26713907 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg011109
SyntenySpg011109
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGAATCTCAAGGTGCATCCTAATGAAGGAGACCGCTGGATGTGCTGACACACTTCCTTCGCCCACTTACTATAATACTTTCTCCATTCACCTTGTATTGATTTATGCAAACACCTTCCGAATGGAGCAGTTGTGGTATAAGCAACACGAGGCCAAGCATAAATCTCACGATGTGAACTTTAACGGAGAGCGCAAGAAGAAAACGATTTATTTTCATATACCTTTTTCCTCCCACTAAGTATTTTAAACAATTTGGGCATATTACTTAGGTAAATTTCAGCTCAATGAATCTATCTAAGTCTATGCCTTGTGAAATAAGGTCTTTATTCTATTGTCTAGGTGAATTAAACCCCTTTTAATTACCTAGTGTCATTTGCACGCTAATAAGACTGTGGTTAATTCAACTCAGGTGTCGAACCAGATACTGGGAGAGTTCCCTTATAACCAAAGTCTTATGTCCTACTTAACCATATTTCAAATCTATTAAAATACCAAGTATGACATTTTTCTAACCTTATTAGAAACGATGGTCTTAGGTCTATAAAAATTTTAAACCGTTAAAATTAATTCATTTTCCTAAGATCTTATGTTAGCATGCAACTATTTGTTACAGGTTGACAGTTTCTCTTCATTAACTTTTATAACTATTTACAACTTTTAATGAATTAGTCCTATAACATTTTTCTAACGATGATAAAAGTGTATAAAAATCAAGCATTTGAGTTATTTATAAAGCACCGTTTAGAAACAACCTACGTCTAGGTGTGCATAATGATTTTACTTACGATGTCTAGGTGATAAACTATTTGACCTCACATCGCTCACGCATGCTCATAAAACTCAGGTTAACTTAACTCAAGTACCAGTACGATGCCCAAGTAGGAGGTGTTCCGTAAACCGCCAACTTAAATACCTCCAACCTTAGACAACATCTTATCGGGTGAATTTTCCGTAATCTTAGCTTTACAAGATATCGACCTATTCTATGCAATTTGATAGAGTTTGAGGTTCGTTAACCCTAAGTGAGCATGCATTTATATTGTTATAGATTTTAAATGTCTATCTCGGTTTTATAACAATTATAATAGAGACAACCTATCACAATCATCTATGCTAAGGAGGTTTCATGTTGCATGCTTGTTCGTTTTCGTTTAATTAATATAACGCTTATAATAAACAAACTAAACGAAAAAAAATTAAAACATGCATCTAACATGGAACCCTTAAATCATGCATTCAATTTATTATAACTCTTATAATCTATTATTAATGCATAAAACATGCTTTCCTATGCTGGGATTTTAAATCTATATGACATATGATATGCATATTATAATCCTATTTAATTTAAACATCCATTCACAATGCATAATAAATTAAACATATTAAAATGGATCGGTTTTGGCATCCTATGCAAACAATTAACTAAATTATTACAAGAATAATTGATAAATTGATGTTGATCCACTCCCAAACCCTTCAAAACGAGGCAAACCATTTTGAAATTGCTTGAACCGGTCTAATTTAGGCTTAACCAGACCCCAAATGGCTTGGATGGGCTTGAACCAGCTGCTATGGACCGAACCGGACCGAACCAGATTGGCTGGACCGCTTCCCGCTCGATTCTCGCTGGAATTCACTTTGGTTGGAAATTCAACAGCGTCGAGACGCTGCACCATCTAGAAGCATGCTCTGTTTTTCGACAGCACGAGCACTTCGTCTTCTTTCTTCGATTACAGCTCAGATACGACTCTATTGACTCTCAAATTCTCACAGACTGTAGCCAACACATTAATGCCCATATTCATATAGGCAATTACAACTTTAATCTAAAAATTTAAAGCTAATTTGATGCCAAAACCAAAGTTATCCATTTTAGCTACCAACTCATCATTCATCTCATGAAAACAACCTAGGTGCTAAAATTAATAGAAATTAAGAGCCCAAACCTGCTCTGATACAAATTGAAGGAGTATACGAGACTCATGCGGAAGCGATTTGGATCGAGAGCCTCTCAATTTCATTAATTTTACAAACCAAAACATGCATGCAATAAGAACCGAAAACAGGGTCTATGTTTTACCAACCTCTTTGGAAACGAGCTCCATGGATGAATCTTCAACACAAACACAACGAGGACAACCACCATGATCTTCCCCGCTATCCTCCGACCTTAGAATGAGTTGTGGGACTCGATTGTATGATGGATTGGGAGAGAGAAGTGAAGTAGTTCACCAATTAGAGAGAACTCAAGTATATGTGTCTTTGGATCTAATTCCCAGCAACAGACCAACCCTTTGGTCTTCTTCTTTCTTCTCTATTCATAGATCAAAACTGAAGCTTCCACCTCCTGGAATTTGGCCAGCAAATGGCCCCAAGAAGAAGACACCAAGATTGAACAAAATGACTCACGAGAGTTAATGGGTTTTGGTGTCATTTGCACACAATTAACCTCTCGGTTAATTTAAATTAAAAATAAATTAATTTTCCTTTTAATTATTAACTCAAATAATTAATAGTTAAATTCAAAACTTAATTTTGCAAATTAAATTTACATAAAATCAATTTAGAATAATTATATAATCAAATTAAATAATTATATTAATTTAATATAAAAAATTATATTAATTCTTTTTACACCAATCCCAATTCCTTAATCTGGGTTACTTGAACGTGAATCCCTATTGACTTTATTAAATCATATTTAAAATTTTCTATCTCTCTCATATTATAGTTTCATTCATAATTAAACTAAAAAACACGTTACGTATAACGTTCAACTCCCTAAATGAATTTGAACGTTTTCAAATTCTCTCATCACTTTAGTTCTAAGGTTTATTTCGTATGAGCTAGCAGGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGACTCGAGATTAACCGATTAATCTCATTAACGTAGTTAACCTACATTCGTTAACTACCAGGACACTCCACTATAGTCTGGTAGTTGCACTCCCCTCACTGTAGATATATTTCTGTCCACCCGATACAACCATGATTAGTAACTTGACCCTTCACAGTGTTGGGTTTTATGCCCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTAACATTTGACTTGCTTCAATGAAGTATTATTTCTAAATATTTGTTTTGCCTAAATATAACCACAAATCCAATAAACTAAGAATCCATGACTATATTATGTATACTTGAAGTTTATGTGTGACATAAGTATGGATCAAGTTCAAGTAAATAGTCTAAACGATCTATAGTATATGGATAAGGTTGGGTACCTTAATCCTGGGGACACTATTGGCGCGGCTCGCTTTGTTCTTTAGAGACAGACGATGTGATCCTAATCGTTCATGTATAAGACATGTAAGTGAGGGCATCCTATGCAAAGAGTTTGCATAGAGATCGGACCAGGAGATAAGTCACTTTCACTTTACAACACCGTTTACTGTTGAAACTGAACATCTCATACATATAACCTAGGTAACTCGATCTTAATCCTGAGCTAACTATGAACTCCTGTTTATTTAGGATTATCCTTTGATTTGCATGGGTGAGAGTGGCCAAACATCGCCGATTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGATAAGACTAAATGGATAGCTGGGGACATAGCTTTGCAAGATGGAATTCACTGCTACCCGTTTTAGGGTTAGTAAAGGTTGTTCTCTTAAGTGCTGACTCCGAGTCTTGAACAAAGGGGCCCCACCCTCTCATAACCTTGAGAGGGACTTGGTTCAGTGATTGTATCGCGAACTAGTTGTTCATTAGAGGATCAGTGGAACTTAAGGAACAAGATGTAACTATAGGGGTAAAACGGACATTTGACCTAGCTCTAGTTACGAACAACCGGTGAAGGGTCGACTTACTAATCATGGTTATCTAAAGTGGACAAGAAATATATCTACAGTGAGGGGAGTGCAGCTACGGGCTATAGTGGAGTGTCCCGGAAGCTAACGAACGATGAATGACTAAGGTTAATGAGATTAATCGGTTATTATCATTTCGTTGGAGCCCATGATTTGTAGGTCCATTAGGTCCCTCTACTAGCTCAATAGGAATAAAACTTGGAACAATATGATAGGTTAATATTTGAAACGTTCAAAATTCGGAAAAGGATACAAAAGTCGCTTATATACGATATTTAACGACATGTTAGTTTAATTATGAATTAAACTTAAAATGAGAGTTATATATTTAAATATGATTTAAATATTAAACACGTGAATAGGGATTCATGTTCGAGAAAATTCGTTGGAAGAAAGAAAAACCAAGATTGCACAAATGGTATTAATTTAATATAAGATATTAAATTAAATGGTTTTTTTTAATTAATTAAATAAAGTTTTACTTAAATTAAAATAAAATCATAATTGAGTGGGATTATTCAGATTTTATATTTAAAATTACAAAATTTTGAATTTAAAAGAAATTCAAAAAGTTGGTAATTTTTGGAGGTGGTGCTTAATGACTAATCACCTTAGATTAGCCTTCTTGCACCACCTAATCCATGACTCAAATCACTCCCAAATTGCTGTCAATTTTTGGTGCAATTCTTGTGCATGATTTTCCTCTATTTATAGAGGATGAGCTGATGAAAATTGGTGGATTTTCTTCAACCTAAAATGCTGCCAAAATTCTCCCAAGAACTTCCATGTTCATACTCTCAAGTTTGATTATACCCATAAGCTTTCCTTTCCAATTCCTATTAATTCAGGATCCCACAATCCGTTCCAAGGCTTGAGGATAGTAGAGAAGATCCAAGTGGTTGTCCAAAAGCCGTTGGTGTGAATTATAAAGCATCGGGTTACACGAATTGGGAGCTTCAAGAGGTAGGTACCTTATTACTCTTTTTTTTTGTTCTTATGAACAACATGACTTCAAGTATTAAATTGATCAAATTGTGTGCCTAAGATCCAAAATTGCTTATGCATGTGTGATATTAACACCTTCACACAGGTTGTTCGTAACTATAGCGGGTCAAAAG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mRNA sequence

ATGAGAATCTCAAGGTGCATCCTAATGAAGGAGACCGCTGGATGTGCTGACACACTTCCTTCGCCCACTTACTATAATACTTTCTCCATTCACCTTGTATTGATTTATGCAAACACCTTCCGAATGGAGCAGTTGTGGCTTAACCAGACCCCAAATGGCTTGGATGGGCTTGAACCAGCTGCTATGGACCGAACCGGACCGAACCAGATTGGCTGGACCGCTTCCCGCTCGATTCTCGCTGGAATTCACTTTGGTTGGAAATTCAACAGCGTCGAGACGCTGCACCATCTAGAAGCATGCTCTGTTTTTCGACAGCACGAGCACTTCGTCTTCTTTCTTCGATTACAGCTCAGATACGACTCTATTGACTCTCAAATTCTCACAGACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGAATCTCAAGGTGCATCCTAATGAAGGAGACCGCTGGATGTGCTGACACACTTCCTTCGCCCACTTACTATAATACTTTCTCCATTCACCTTGTATTGATTTATGCAAACACCTTCCGAATGGAGCAGTTGTGGCTTAACCAGACCCCAAATGGCTTGGATGGGCTTGAACCAGCTGCTATGGACCGAACCGGACCGAACCAGATTGGCTGGACCGCTTCCCGCTCGATTCTCGCTGGAATTCACTTTGGTTGGAAATTCAACAGCGTCGAGACGCTGCACCATCTAGAAGCATGCTCTGTTTTTCGACAGCACGAGCACTTCGTCTTCTTTCTTCGATTACAGCTCAGATACGACTCTATTGACTCTCAAATTCTCACAGACTGA

Protein sequence

MRISRCILMKETAGCADTLPSPTYYNTFSIHLVLIYANTFRMEQLWLNQTPNGLDGLEPAAMDRTGPNQIGWTASRSILAGIHFGWKFNSVETLHHLEACSVFRQHEHFVFFLRLQLRYDSIDSQILTD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg011109.1Spg011109.1mRNA