Spg010972 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg010972
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold4: 25591813 .. 25599297 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg010972
SyntenySpg010972
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ACCCCCCCTTCATCACATGCGTTAAACCCTTCCTTCATTTTTCCACGATTCTCTCCATGGTCTTCTCTCTACACATGAATCCTTCACCGCCTAAAACCCACGAATGATCCTCCATTCTCTCTCACGCTCAAAATTTCTTGACCTTCTCAGAGTGGTTCACATCGCATCTCTTAATGCTAGCAGTGGCGTTCCAATCTCAGTGGCGTCTACAAGATTTCTTGAGGAAGGCGTTCCAATCTCAATGAGGCTCAAATTTCTTGAGGAGGCGTTCCTATTTCTCTATTTCTCTCTGATTCACATTCCCCAATCCCACCTTTCAAGATTATTTGTTCTTCTTCTTTGCCTTGTTCTTCATCAGGTAAGACTTCTCAAGATACATTTCTATTTTGTGTTTGTTCCCTCTGCTTTTTTTTTGTACTGTTTGGTAGAATTTATCCACAAGTGACGGATCTCTTAATTTAAGCGGTGGCTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTCTTCCGTTCTAGTAATGTTTGATGTTCCTAATTTTCCGTCTTTTATGGCTATTCTCGTTAATCCCCAGCATTTGACTGTATGTAGCATGAGAGCCAAACCCAAGATCTCTTCGGTCAAGCCCTAGCTCAGAATATCCCACATTTCTATTCCAGGTAGGTCTTCAAATTGAAGGACTTATTGGGACTTTTTGTTTTGCTATTGTTGTTGGTAATGGTGTTGATGTTTGATTTTTGAGATTCAATCTTAGGGATTCAAGGAAATTACATCTCTCTCAAGTTTATCGAAGTGCAAGTTTGTTATGAAATTAATTGTGATTATCGATTTTTGTTTCTCTGTGCTGTTGTTGTTTGTTTTGAAAGTTTTGATCAAAATCGCCACTCTGAAAATTGCGGGGATTAGCTTTGCACTCTGAGCAAAGGAAAATGAACTAGAAGAAATTACTGTTTTTTTTTCTTTTACTAATTTGGAGAAGGAATTAGTTGATTTTGTATTATGAATAAATAGTTAGACAAATTTGAAGTTGAAGTTTAATTCTATAAAGTTTATTGTATTCTTTCAATTCTCTGTGTTTCTAAGAAAAAATTGTTGTTATGTTTGAGATTCATGTTTTGGTGAATACGTAAAACTGTACTTAACAATGAGAATTTAGATACCAAAATCTAGAAAAAATGAAATCTTTTAGGCTGATGGAATTGAAACAGTAGTCACTCCCCACCTGTTTGTCTTTTTTGCTTAAAAGCTGAAGAAACCATGGAACATCTTTTTTTGAATTGCCCGTTTGCTGTAAATGGGTGGGGAGGGTCTCAATTGTTATTGATTAAAGAAACAATAAAGACAATTAGTTAAGTGTAATCTTGAGTTTGAGCGTGAGAGATATTTGAGTTTTAAAGAAACAATAAAGGGTCAATTGTTCTTGATTCATGTTTTGTTGCCATGATATTTGAGTTTTATTATGAGGTGTTATCTTGAGTTTAGTTGGGTTGTCTTGTAGGGGTTTTTTTCTCTTCTTTTACAATTTTGAGGTAAATTAATAACTCACTAAGTATTCCTTCTAGAAAAATATCAATTTTACCTCTGTAAAGTGTAAACTACTCAGAACATTCTAGTTATCTTCCATTTAGAATAAGACTTGAGGTTGCTGTGATTGGGAAAAGTGAAAATTTATCTGGGTATTAATGCATCTTTTTACTTTCATAGTGTTATATATTCACATATTGTTGGAATAGCATTTAAGCTTAATCAGTTCCAGAAACAAATTTCTATTTGGAGCTCTCTGTCTGTTCTCTATCTTTCTCTCCAGCCACTTTGTGTTACTATTATCTTCCTTTTCTTTTATTCAATGATTAAAAATACTTTCTTTTCTTACCTAATATCTCATACTTCCTTCAATTTGAAGGAGTCTTCTTAGTGATGGTAAGTGTCCTCTACAATTTCCTTTTGTTCCTCTCAACCCCATCCCTTTGATTTCAAATCTCAGAAAACAATTGTGTCCAAATTTACGATGATGGAAAGCTAAAATTGGAGAGTTTGTACATGGTTTGGTGTATGGATTCAATTAAGCAACAAAATGAATTAGTTGTCTTGTTTGCTTAAGCACTTGTTTTGAAATTGTTTAATTGGAATGTTATGTCATTGATTTGATATTTTATGTGTCTGAAATATTGAAGAACATTTCTATAAGTAAATAGTTTCCTTGAAATTGTGTTGGGCTTCCCAAATAGAAGTGTTTGATATTTGTGATGAAGTGGGTGGATTTTTAAGTTTATATTGTTACTTACCCTTTTTATTGTTGTTGTTTCATATGTCCAATTACATCTCCATTTTTTTTTTCTTGTCTTCCTGGCTTGCAGTTTCCTAGGATAAAGTTGCTGAGCTTTTGGAGAATTTAAATGATTAAAAACCACGGTGAGTCCATTAACTTTTGGAACCTTATATTTGTTAGTACTGTCAACTCTTGCTTCTTGAGATTGTAAAAATAAGCATAAGAACGCGATGATGTATAAGATATACTATGTTCGAGCTATATAACTTTCAAATGGCTATTAACATATAACTAGAAGTGTAATGTCCAGATTCTTAATTATGTTTTCCATGTTTAGTGTTTAATGTCATCTGCTTCGCATCTTTTATTGATGTTCCATCTTCCAGGATCGCTACAGTTCCACCAACAGAAACAGTTTTGATGACTACAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTTGATTTTCGAGTGAGTTCTGCAGTTGTTACAGTTGATAACAAGCCACAAGGAATTCTCACGTGAGTACCATCATATTTCTTCTAAACTTGGGACTTTATACTTGCATACAGTTTCAGGTATCCTGATATTTTGTCTTTTGCAGTTCAAAGGATATTTTGATGCGATTAATTAGCACAAAATCTTCAACCAAAATCCACACTTGTAGAGAAGGTAATTTCTTTCAGCTAGCATGGACTATAAAGGACAGTGTATCTCCCCCCTTCATGGATCCTGTCTTTAGTGTTCTGTTGGTTAAACTGAAAGGTGTGCTGATTTGGATTGGGGTTGGGGGCAAGATAACTACAACAGAAATGGCAAGAAAGATAGATATAAGAGAAACACTACTCTGTATCTTGTAAAATTTGTTTTTTTATTCCTAGGTTGTTTTTTTAATATTTATTTTTAGAGTAGTAATTAAACAAAAAAAATAAATGGTGAGGTTTACACACAAAACCATGAACACAAGTGCTTAGCTTTGTCTACTAAATAGAGTTTTACAACCAAAATGCTCTAACTAAAAAGGAAGGGATATACACAAAAGACATAAGATAAATGTCAATGGTAACTAATAAAAAAGGGGTTCATCAACAATTAGAGATATTGCTTCTAAGGAAATAAAAAGAACAAATTGTTGTTCAATCTGTCAGGTGCAATATGTGTTGTTAATAGCATGATTCTTAATGTCAGATTCTTCTTAATGTCATGTGCAATATGACTTCATAGATTAAAGTACATAGTTTACAACTAGAGTTGTAGTTTAATCTCTCTTCTAAGTTCTTCTTTTCCCTTATTCATTTGTTGTAATGTTTTCTATCACAATGTTATACTTGTTTTATTTCCTTGGTCTATTTTACATTATCAAAGTCGAGGTCTCCACTCTAATCTTTTCCCTTTTTTATTTGGGAACTTAGCTATTTAGGAAAGATGTCTCATATATAATTATTCTCCTTCAATTTGTTGCAAGTAAAATCATGAGGTCTTGTTAGTAACTCATCTCTGTTTCGATGGATCAAAAGGTGGCCACTTCATGCTTATCTTGATAGTGAGGAGGCAAGAACCAAAAGAATAGAAGAGGTAACAATGGCAAAAAAGTAGAGGTCTCAAGTTTGATTTAGTTTCTTCAAATTAGAATATTGGTTTAGTTTATTGATTATGTAAATATATATATTGATGATCTTATAAACATATTTTTTTTATAGGTGAATGAAAGGATGACACATCAACATATTTATTGGAGGATATGTTCATCTGAACCTCTTGAACCATGTGTATACATGTTATTGAAATGAATGTGTTTGGAAATTTTGTACATTTTTTATTTTCATTTTTAGTTTAGGATTACGAATTACATATGTATCAGTTAGAACAGTTTGAGATTATCAACTTTTAGTATTACTCTTGAAAAAGTTTATGTAAATGCATTTAAATACATTAAATGTTTATGTAATCGAGTTGATATTACAATAGCATTTGAAATAATTTGTTAGTTATATAAAATGCTATAAAACTATTGCGTACTACTCGAAAATGGTACAAAATGTAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAAATGCTAGTAAAAGTTATTATCCATAACAATGTCTAAACAACGAGGTTAAAAATGCTATGAAAAATCAATTATAACGTTTTTATACTAATGTTATGAAAAGTTTCAATTACATCAAAATAATGCAATTAAAAATCAACTTTTTTATAGCTCTTTCTATAGCATAGAAAAAACGCTATGAAAAGTCAGAGACTTTCAATAACATCGACTATGACAACGTGTCTAAAACCACTATGATATGTTTTTTATAGCGTTTTTTTACAGCTATGAAAAATGCTATTAAAGAGCAATTATAGCGTTTTTTGTTAACGCTATGAAAAGTTTCTATAACATATAAATTATGCCATGAAAAATAGATTTTTTATAGCACTTTTTATAGCATTGAAAAAATGCTATAAAAAGTCAGGGACTTTCAATAACACCGGCTACGACGGCGTTTGAAAAACGCTATAAAAAGGCTATGATAGCATTTTTTTGACGCTATCGTATGTGATATTTGTTGTAGTGTGCGATGGAGATTCGTCAACAACGACCCGCGGACGACTCGGAATTGTCTCAATTTTTCCAGAAATGCGGTCGCGCATATGATTTTGCCTTCCCAGAAATGCGGTCACATTTCTGGGCAAATTCCAACTTTTCCTCTGTTTTCCTGCACAGCAACAAACTTAGTCAAATTCTCTTAAAATCAAGTCTTTTTAAGCACAAATGAGCATAATTTAACAAAAGTCCCTGACTTATCAACTTTAACATATTTTGAGCTCGGGAACAGTAAAATTGATTTAAACATACAACATTTGACAAAGAAATGAGCTAAATATAAGGGTAAAATAGGTATATTTTTTACCCTTATCAACGTCCCGCTTTGTATTGTGATACAAATGCAATGATCTAACGCGTTCATGTAGTGGACATGCGAGTGGGGGTATTCTGTGCAATGAGTTTGCATAAGACCGGACCGCGAAATAGTTAACCATTAGCTGTAACACCGTTAGCTAGCTAGGTTTTTATTTCACTAGGATGACCTAGGCAGCTTTGTCTCAATCCTTAGTGGGTTATGGACTCCTGTTCATAAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGGGGTGCACGCTGACTCAATAATCCTATCATTTTGGGGACAAAACCGAGTGGGGAGCAAGGAACATAATCACTCAAGATGAAATTCACTCCTTCCCGACTCTAGGGTAAGTAGAGGTGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCGAGTCTTGAACAATGGGCCCTACCCTCTCTATGGCACGAGAGGGATTTTTGTTTGTTGGTTGGACCTCAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGGGACTTAAGGATAAAGAGGTAACCCAGGGGTAAAACGGTAATTTAACCTAGCCAGGGTACGAACACACGTGAAGGACTGACTTGCTGTTATTGGTCGATGTCCGTGGACACAGAAATATATCTGCAGTGAAAAGAGTGCAGATGTGGTTCTTTAGTGGAGTGAACCACAGTTAACGAACATTGATCAACTTGGTTAATGAGTTTAGCCAATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCATTTAGGGCGTTGAGGTAAATTTCTAAGGGAGAATTGTATATTTGAAGACGTTCGAATGTTAAGTTTAAAATATGAATTGGATTCATATTAAAACTATAGGTTATAATTAATGCGCATTAGATGCACATTAATACTATAGTTTATTTGAGAGAAATATAATTAAATATATGATATTTAATTATAATATTAATTAATTGGTGAATTAATTAATTATTTGTTTTAATTTAATTTAATCAAATTTGATTTAATTAAATTACATTAAAACTATAGGTTATGTGGAATATTTATATAAATGTGTTTTATATAAATGATATTAAATTAAATGTTAATTTTATTAAATTATTAATTAATAATTTTAATTATTAATTAATTTATTCTTTTATCAGTTAGGTTAACTGATCAAAACGTGGTCTTCCACTAATCTTGGCGTTTGCGTGAATAGCGAGGGTTTTTAGGAGGAGTGGTTTTCATCCGTTGGATAACCTCCTCCTAATCGTGTATCATCTCCATTCTCACGTTAGGAAAACTTCTCTCTAGTTCTCTCACTCTCAGATTCTCTCATTTTTTTTTTCACAGAGAAAAGTTACAGAGAACTAAAATCCCTTAGTGCTTTTTGCTCCCACAAGCAACCAACGCTATATCCTAGTGAGTATACCGGTGTCTCCATTTTTGGTGGTGTTCACAATATTATTGTTGCTGTATTTTCTAGATCAAAGCAAGGGAATTGGCGAAACGATCAAGGCTTCCAAGAAAAAGTAAGTATTTTTTAACATTGATCATTAGGATCAACATTAGATTAGATCTAAGGGTTTTTGATCCATAAATAGCATGTTTTTATAGTCTTTTACAGCGTATTAAGTATGTTTTTATTGCTGTATGTATTTTGCGAATTGTGTTGGCATTTCAATTGAAAATCAAAGACTACGAGTAGGTCCTGTGATTTTTTCCGCTGCGTTGGGCTCTTATCCCTTCAATTGGTATCAGAGCCTTCTCTGTAGTACTTTATTTTAATTGAAATTTGCAATTTGCTTTAAGGTGGGATTTATTTGCATTATGAATGTATCGTTTGCATATGAATGTTTACGATTAATTGGCCTTAGATTTGCAATTTTTAATTTGATCATATGTAAAGGCCCCTGCGTTTTTGGGCATTAAAATTGTAAATCGAGTTTCTGTAAGTCTGGGTCTAGTTTAGACTGAAGAACGATGAAGATCGGGACCAAATTTGGGCAAAAACAGCGGAAAACGGCGAAGAACAGCGGCTGGAAATCGCAAAAAATCGAAAAAAAAAAGAAAATTCAGATGGAAACGCCCGCGTCAGGGTAGGGCTGACGTCATCGCATGTGGTGATGACGTCAGCGAGGTGCGGTTCAGATGGTTTTAGTGCACGCGGTCTAGTGACGCAACCGGTTTGGGTGGTTCGGTCCATGAAGAGGCGCGGTTCAGCGTATTTCCTTCGGTTCGTTGACTGGTTTGTTGACTGGTTCGTTGGTTCGTTGACTGGGCTGGTGGTTTTTACTGGTTCAGTGGTTTTTCCAGTCCGGTTTGAGTGGTTTTGA

mRNA sequence

ATGATCCTCCATTCTCTCTCACGCTCAAAATTTCTTGACCTTCTCAGAGTGGTTCACATCGCATCTCTTAATGCTAGCAGTGGCGTTCCAATCTCAGTGGCGTCTACAAGATTTCTTGAGGAAGGCGTTCCAATCTCAATGAGGCTCAAATTTCTTGAGGAGGCGTTCCTATTTCTCTATTTCTCTCTGATTCACATTCCCCAATCCCACCTTTCAAGATTATTTGTTCTTCTTCTTTGCCTTGTTCTTCATCAGCATGAGAGCCAAACCCAAGATCTCTTCGGTCAAGCCCTAGCTCAGAATATCCCACATTTCTATTCCAGGAGTCTTCTTAGTGATGTTGATAACAAGCCACAAGGAATTCTCACTTCAAAGGATATTTTGATGCGATTAATTAGCACAAAATCTTCAACCAAAATCCACACTTGTAGAGAAGGTAATTTCTTTCAGCTAGCATGGACTATAAAGGACAGTGTATCTCCCCCCTTCATGGATCCTGTCTTTAGTGTTCTGTTGGTTAAACTGAAAGGTGTGCTGATTTGGATTGGGGTTGGGGGCAAGATAACTACAACAGAAATGGCAAGAAAGATAGATATAAGAGAAACACTACTCTGTATCTTGTGGCCACTTCATGCTTATCTTGATAGTGAGGAGGCAAGAACCAAAAGAATAGAAGAGTGTGCGATGGAGATTCGTCAACAACGACCCGCGGACGACTCGGAATTGTCTCAATTTTTCCAGAAATGCGGTCGCGCATATGATTTTGCCTTCCCAGAAATGCGGTCACATTTCTGGGCAAATTCCAACTTTTCCTCTGCAGCTTTGTCTCAATCCTTAGTGGGTTATGGACTCCTGTTCATAAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCATTTAGGGCGTTGAGATCAAAGCAAGGGAATTGGCGAAACGATCAAGGCTTCCAAGAAAAATTTAGACTGAAGAACGATGAAGATCGGGACCAAATTTGGGCAAAAACAGCGGAAAACGGCGAAGAACAGCGGCTGGAAATCGCAAAAAATCGAAAAAAAAAAGAAAATTCAGATGGAAACGCCCGCGTCAGGGTAGGGCTGACGTCATCGCATGTGGTGATGACGTCAGCGAGGTGCGGTTCAGATGGTTTTAGTGCACGCGGTCTAGTGACGCAACCGGTTTGGGTGGTTCGGTCCATGAAGAGGCGCGGTTCAGCGTATTTCCTTCGGTTCGTTGACTGGTTTGTTGACTGGTTCGTTGGTTCGTTGACTGGGCTGGTGGTTTTTACTGGTTCAGTGGTTTTTCCAGTCCGGTTTGAGTGGTTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGATCCTCCATTCTCTCTCACGCTCAAAATTTCTTGACCTTCTCAGAGTGGTTCACATCGCATCTCTTAATGCTAGCAGTGGCGTTCCAATCTCAGTGGCGTCTACAAGATTTCTTGAGGAAGGCGTTCCAATCTCAATGAGGCTCAAATTTCTTGAGGAGGCGTTCCTATTTCTCTATTTCTCTCTGATTCACATTCCCCAATCCCACCTTTCAAGATTATTTGTTCTTCTTCTTTGCCTTGTTCTTCATCAGCATGAGAGCCAAACCCAAGATCTCTTCGGTCAAGCCCTAGCTCAGAATATCCCACATTTCTATTCCAGGAGTCTTCTTAGTGATGTTGATAACAAGCCACAAGGAATTCTCACTTCAAAGGATATTTTGATGCGATTAATTAGCACAAAATCTTCAACCAAAATCCACACTTGTAGAGAAGGTAATTTCTTTCAGCTAGCATGGACTATAAAGGACAGTGTATCTCCCCCCTTCATGGATCCTGTCTTTAGTGTTCTGTTGGTTAAACTGAAAGGTGTGCTGATTTGGATTGGGGTTGGGGGCAAGATAACTACAACAGAAATGGCAAGAAAGATAGATATAAGAGAAACACTACTCTGTATCTTGTGGCCACTTCATGCTTATCTTGATAGTGAGGAGGCAAGAACCAAAAGAATAGAAGAGTGTGCGATGGAGATTCGTCAACAACGACCCGCGGACGACTCGGAATTGTCTCAATTTTTCCAGAAATGCGGTCGCGCATATGATTTTGCCTTCCCAGAAATGCGGTCACATTTCTGGGCAAATTCCAACTTTTCCTCTGCAGCTTTGTCTCAATCCTTAGTGGGTTATGGACTCCTGTTCATAAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTCCATTAGGTCCCACCGGTAGCTCATTTAGGGCGTTGAGATCAAAGCAAGGGAATTGGCGAAACGATCAAGGCTTCCAAGAAAAATTTAGACTGAAGAACGATGAAGATCGGGACCAAATTTGGGCAAAAACAGCGGAAAACGGCGAAGAACAGCGGCTGGAAATCGCAAAAAATCGAAAAAAAAAAGAAAATTCAGATGGAAACGCCCGCGTCAGGGTAGGGCTGACGTCATCGCATGTGGTGATGACGTCAGCGAGGTGCGGTTCAGATGGTTTTAGTGCACGCGGTCTAGTGACGCAACCGGTTTGGGTGGTTCGGTCCATGAAGAGGCGCGGTTCAGCGTATTTCCTTCGGTTCGTTGACTGGTTTGTTGACTGGTTCGTTGGTTCGTTGACTGGGCTGGTGGTTTTTACTGGTTCAGTGGTTTTTCCAGTCCGGTTTGAGTGGTTTTGA

Protein sequence

MILHSLSRSKFLDLLRVVHIASLNASSGVPISVASTRFLEEGVPISMRLKFLEEAFLFLYFSLIHIPQSHLSRLFVLLLCLVLHQHESQTQDLFGQALAQNIPHFYSRSLLSDVDNKPQGILTSKDILMRLISTKSSTKIHTCREGNFFQLAWTIKDSVSPPFMDPVFSVLLVKLKGVLIWIGVGGKITTTEMARKIDIRETLLCILWPLHAYLDSEEARTKRIEECAMEIRQQRPADDSELSQFFQKCGRAYDFAFPEMRSHFWANSNFSSAALSQSLVGYGLLFIRDCPLICMGPLGPTGSSFRALRSKQGNWRNDQGFQEKFRLKNDEDRDQIWAKTAENGEEQRLEIAKNRKKKENSDGNARVRVGLTSSHVVMTSARCGSDGFSARGLVTQPVWVVRSMKRRGSAYFLRFVDWFVDWFVGSLTGLVVFTGSVVFPVRFEWF
Homology
BLAST of Spg010972 vs. NCBI nr
Match: KAG7023057.1 (Non-specific phospholipase C6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 82.8 bits (203), Expect = 8.2e-12
Identity = 51/104 (49.04%), Postives = 62/104 (59.62%), Query Frame = 0

Query: 109 SLLSDVDNKPQGILT-SKDILMRLISTKSSTKIHTCREGNFFQLAWTIKDSVSPPFMDPV 168
           S +  VDNKPQGILT  K     + S KSST+IHTCREGNFFQLAW+IK+ ++ P   PV
Sbjct: 252 SAVVTVDNKPQGILTWVKGYFDAINSAKSSTRIHTCREGNFFQLAWSIKECIASP---PV 311

Query: 169 FSVLLVKLKG--VLIWIGVGGKITTTEMARKIDIRETLLCILWP 210
            +VLLVKLKG   L W   G K        +     TL  ++ P
Sbjct: 312 STVLLVKLKGGAGLDWGSGGDKYNRNFKMNRYKRNITLYLVMTP 352

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
KAG7023057.18.2e-1249.04Non-specific phospholipase C6 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg010972.1Spg010972.1mRNA