Spg010725 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg010725
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold10: 7032228 .. 7038357 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg010725
SyntenySpg010725
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
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AGGGCGCGTGTCTTTGCCCCAACGAAGGAAGAAGCAGATGATGAGGATGTCGTGGTTACAAGTACGCTCACTCTAACCTTGTCTTGTGTGTGATTGTGTGGTTGTGAATCTTATTCTTGTCACCTATTGCTTCAGGAACTATTTTGGTTCTGAGTGTCCCCGCCTTTGTTATGTTTGATTCGGGGTCAAGTCATTCATTTATTTCTTCAGTGTTTGTTAGCCAAGAAAATCTTGAGTTAGAACCGTTAGGTTATCTTCTTTCGGTATCTACACCCTCCAGCTCTGTTTTGCTTGCTCAGCAAGTAGTCAAGTTCGGAGTAGTCTCGATTGCAGGTCAGACCCTTGAAGCAAGGTTAATCCAATTGGATATGCACGACTTCGATGTAATCCTGGGCATGGACTGGTTGGCTAGCAATAAAGCCACCATTCATTGTGCTAAGAAGGAGGTGCATCTCAAATTGCCTTCAGGCCAAGGGTTTAAGTTTAAAGGATCAAAGAGCGGAAGTCCTAAGGTAGTTTCTACCTTAAAAGCCAAGCATCTTCTGCAGCATGGAGCTTGGGCTTACTTGGCAAGTGTGGTGGATGTTTCTAAGGATTTGCCCAGTTTGGACTCTGTCCCTATTGTTAAAGAGTACCCAGATGTCTTCCCAGAAGATCTCCCTAGGCTACCTCCAGCTCGAGAAGTGGACTTCTATATAGACCTTCTTCCTGGGACAACACCATTGTCTAAGGCACCTTATAGGATGGCACCAGCTGAGCTGAAGGAACTCAAAGTGCAGCTTGACGAGCTGTTGGATAAGGGGTTAGTGTTTCCCCTTGGGGTGCTCCGGTCTTGTTTGTCAGGAAGAAATATGGTTCAATGAGGCTCTGCATTGACTATCGGGAGTTAAATAAGGTGACTGTGAAGAACAGATACCCCCTCCCTCGTATTGATGATCTCTTTGATCAGCTTCAGGGAGCTAGGGTGTTCTCGAAGATCGATTTGCGTTCTGGTTACCATCAGCTGAGGATTAAGGAAGCCGACATCCCTAAGACTACCTTCAGGACCAGGTATGGCCATTATGAATTCACCGTAATGTCGTTTGGACTTACCGATGCTCCTGCAGCCTTCATGGATCTCATGAATCGTGTGTTCAAAAGCTTCCTGGACTCGTTTGTGATAGTCTTCATCGATGACATCTTGATCTATTCTAAGAGCAAGAGTCAGCACGAGCAGCACCTCAGGCAGGTTCTGGAAGCCTTGAGGAGCAACGAACTCTATGCTAAATTCTCAAAGTGCGAGTTTTGGCTGAATGAAGTTGCTTTTCTCGGCCATGTGGTTACCAAGGATGGTATTGCAGTTGATCCGTCTAAAGTGGCAGCAGTGCGTAGTTGGCCCATACCCAGCACAGTGACCGAAATTCGCAGTTTCCTTGGGTTAGCAGGCTACTACCGGAAGTTTGTCCAAGATTTCTCTAGCCTTGCGGCACCATTGACTCAGTTGACTCGCAAGAATGCGACCTTCACCTGGAGCGAGGATTGTGAAAAGAGTTTCCAGGAGTTGAAGGACCGGTTGACCACTGCCCCAGTGCTAACCATCCCTGATGATTCGGTGGGAATAGTGGTGTACAGTGATGCTTCAAGGAAGGGATTGGGTTGTGTGCTCATGCAATATGGGAAGGTAATTGCTTATGCCTCGCGTCAGCTTAAAGGGCATGAGCTTAACTACCCCACGCACGACTTGGAGCTTGCAGTGGTATTTGCCTTGAAAATCTGGAGACACTATCTGTATGGAGAAAGGATTCAGATTTTCACCGATCATCAGAGTCTGAAGTACTTCTTCACCCAGAAGGAGCTGAACCTAAGGCAGAGACGATGGTTGGAGTTGGTCAAGGATTATGATTGCGAGATCAGCTATCAACCTGGAAAAGCAAATGTTGTGGCAGATGCTCTTAGCATGAGAGCAGCAAGCGTGGCGTCCCTGGTTTCTTCTAGAAGCCCTTTGCTAGCTGAGTTGGATCGGTCAGAGATTGAATTGGTCGTGTCAGATGTTTCAGCTTTGTTGGGCTCAGTAATCAGTGGTTACTAGCTTAAGGCAGTGGATCGCGGATGCCCAACAAGAAGATCCAGAGTTAGTCAAGCACCTGGGTAAGGTAGGTCAAGGTGATTTTACCCTCGCCAGTGACTCGGCCTTACTGTTCCAAAGAAGGTTGTGTGTGCTTAAGGATGACTCGTTGAAGCAGTTGTTGATGGAAGAGGCCCACGACACCCCTTTCTCGGTTCATCCTGGCAGTACTAAAATGTACAAGGACCTCAAGATGCATAACTGGTGGCATGACATGAAGAAAGAGATTGCTTTGTTTGTTAGCAAGTGCTTGACGTGTCAGCAGGTGAAAGCCTTGAGGCAAAGGCCATCTGGATTGTTGCAACCTTTGGAGATTCCTGTTTGGAAGTGGGAGAATGTTGCTATGGATTTTGTGGTTGGTTTGCCGAGATCCGTGAAAGGCAACACAGTGATTTGGGTGGTGATTGATCGTTTGACCAAGTCATCTCATTTTATTTCGGGTAAAGCCACTTATTCTGTGGAAAAGTGGGCGTAATTGTACCTTAAGAAGATAGTGAGGCTTCACAGTGTGCCAGTTTCGATAGTATCTGACAGAGACCCTCACTTCACATCTACCTTTTGGCGTAGTTTGCAAAAGGCGCTTGGTACTCGGTTGGATTTCAGTACTGCTTTCCACCCCCAGACCGATGGCCAGACTGAGCGTTTGATTCAGGTTTTAGAGGATATGCTCAGAGCCTGCGTGTTGGACTTTTGAGGCAGTTGGGAAAGTCATTTGTATCTAATAGAGTTCGCTTACAATAACAGCTACCAGTCAACCATTGGCATGGCTCCTTATGAGGCTCTGTATGGTAAAAGGTGCAGGTCGCCCGTTCATTGGGATGAGGTTGGTGAAAAGGCTTTATTAGGACCAGAAATGGTTCAGATGACTAACGATGCTGTCCAGAGGATAAGGGCAAGGATGCAGCTTGCTCAAAGTAGGCAGAAGAGCTATGCATATACTAGGCGCAAAGAACTGGAGTTCAGTGTTGGTGATCATGTGTTCTTGCGAGTGGCGCCTATGAAAGGAGTTCTTCGTTTTGGAAAGAAGGGAAAGCTTAGCCCCAGATTCATCCGGCCTTATGAGATATTCGAACGTGTTGGCCCTGTTGCCTACAAGTTGGCATTACCACCAGCCATGTCTGCAGTGCATAATGTGTTTCATGTGTCTATGCTAAGGAAGTATGTCCACAACCCTGCTCATGTGTTGAAACCAGAACCATTATTGCTTAATGAGGATTTGACATATGAGGAGAAGCCTATCAAGATTTTGGCCAGGGAAGCAAAAGTCTTGAGAAACAGGACCATTAACTTGGTAAAGGTGTTGTGGAAGAATCATCGAATGGAGGAAGCGACCTGGGAAAATGAAGCTGAGGTTCGAGCCAAATATCCAGAACTCTTCGAGCAGCAAACTTTCGAGGACGAAAGTTCTTAAGGTGGGGAGATTGTAACGCCCCGCATTTTCAGGTACGAATAACTCTGTTAAATTATAATTTAATTCGGAGTTTTAGTTCCTGTTGGGCTGCTTTAAGTTATTTATTTTTGGTGGTTGCTTGGAGTGGGTTAATTTTATTTAAGCCAAGAAATTCTTTTTCCTTCGAGAATTAAATTTAAAATTTGCCTAAATCCTTATAGATAATCTAAGATTTGATTGGGTTTTTGGAGACCTTAATTGAGTCTTTAAATATGAGGCTTAGGTTATTAGTTTTAATTTAAGAAAAGAAAAAAAGGAAGCCCTAAACTAAACTCTTTCTCCCTCATTCTTTTCGTGAAGCAGAAGCCGCAAGCCCCCTTCTTTTCCTTCCCATTTTTCTTCCTCTCCCGCGCAGCCAAGCTTCCCGAAGGCCATCTTCGGCGTCTTTTCTCTCTCCCTCTTGTGTGTTCGTCTGCCGGCAGCAAGGCTCTCGAAGCCGTTGATTTCTCCCTCTCGCGTGGTCGATGCCGTTTCCCTTGTTTGCAGCTCGCTGCCGCCGTTTCAAGTCGCGCCGCCCTACAGTCCGTTCCGTCTCTTTCCTCGCGTGTAAGGTCCCTCTCTCTCCCGTTTTCTTCCCTTCTCCGGCAAGTAACCCCCGACCAGCGGCGGTTTAAGGCTGTCAATCCCTCTCTTTCGCGCGCCGCTAACCCTTCCAGTGTGTTCTCCATCCTTCATCCGCACGCGCGTAGCAGACTCTCGGCTGTAGCAATAGCTCGTCATCATCCCACCTCCTTATTTCGTGAGTAGGTTGAGTGTAAGTCGCCGTTTCCTTCGATTTTCTTCTTTTAGTTCAGTGGGTTGCATTTTCTTCCATTCGAGTTCTACAGGCAGCGTGTTAATCAATCTTTTTCCTGTTGTTTTCGGCTAGACTCGTGGGTACAAGGCAGAGTGTTCGTTGTTCTGGCATTTTAGGCGCGTTCGGGCTGATTTAAGGATCGTTTCGGCGTGTTTAGGCTCTTTCGGTAAGCTCTCGATATTACCCATGAATTATTAAGCTCGAAATAAGTTTACCCACTCTCGTTCGGTGTTTAAATTGAGTTTCGTTGTTGGTTCTTGTTTTTCTTGCGCTGTTCGGAGCCGTTTTGGGTTTGAGATCACCCCTGTATTGTGACCCATCGTTCGTGGAGCCTTAAACTTGGACACCCAGTGCCTAGGGTCTCTAAGCAAGTGGTTTTAAACCTCTTTGCTTGCTGGACAGCACGTGTTCGAGGTCTTTCGGACGCTGAACGGTAAATTCCAGCACCTCTAGTTCCTTTTCTCAAGTCTCTTAGGTGGTTTATGTCGATTCCTAACCTTTTGAGAGCCTTTGCTTGTCCTTTAGGCTCAATCGGATACTTTCGATCAAGGCCCAAGCCCTTAAAGTAAAGTTAAGGCGGTAAGGGTGTGTTTAGGCCCTTTTTAATTTAATTTAAGTAATTTAGAATGGGTCCTAATCCTTGGAGCACT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mRNA sequence

AGGGCGCGTGTCTTTGCCCCAACGAAGGAAGAAGCAGATGATGAGGATGTCGTGGTTACAACCAAGCTTCCCGAAGGCCATCTTCGGCGTCTTTTCTCTCTCCCTCTTGTGTGTTCGTCTGCCGGCAGCAAGGCTCTCGAAGCCGTTGATTTCTCCCTCTCGCGTGGTCGATGCCGTTTCCCTTGTTTGCAGCTCGCTGCCGCCGTTTCAAGTCGCGCCGCCCTACAGTCCGTTCCGTCTCTTTCCTCGCGTGTAAGGCGCGTTCGGGCTGATTTAAGGATCGTTTCGGCGTGTTTAGGCTCTTTCGCACGTGTTCGAGGTCTTTCGGACGCTGAACGGCTCAATCGGATACTTTCGATCAAGGCCCAAGCCCTTAAAGTCTGGGTTGGGGCTTCGTTGGTTGGTTTAGGATCGTTTAGGAGCATTAGAGCTTCCAAATATATTGTTGAGCAACTTGAGGGAGCAAAATCTGTGCTGAAGCAAAGCTGGGAGCAAAACTGCCACGTCACAGCTCGTTAG

Coding sequence (CDS)

AGGGCGCGTGTCTTTGCCCCAACGAAGGAAGAAGCAGATGATGAGGATGTCGTGGTTACAACCAAGCTTCCCGAAGGCCATCTTCGGCGTCTTTTCTCTCTCCCTCTTGTGTGTTCGTCTGCCGGCAGCAAGGCTCTCGAAGCCGTTGATTTCTCCCTCTCGCGTGGTCGATGCCGTTTCCCTTGTTTGCAGCTCGCTGCCGCCGTTTCAAGTCGCGCCGCCCTACAGTCCGTTCCGTCTCTTTCCTCGCGTGTAAGGCGCGTTCGGGCTGATTTAAGGATCGTTTCGGCGTGTTTAGGCTCTTTCGCACGTGTTCGAGGTCTTTCGGACGCTGAACGGCTCAATCGGATACTTTCGATCAAGGCCCAAGCCCTTAAAGTCTGGGTTGGGGCTTCGTTGGTTGGTTTAGGATCGTTTAGGAGCATTAGAGCTTCCAAATATATTGTTGAGCAACTTGAGGGAGCAAAATCTGTGCTGAAGCAAAGCTGGGAGCAAAACTGCCACGTCACAGCTCGTTAG

Protein sequence

RARVFAPTKEEADDEDVVVTTKLPEGHLRRLFSLPLVCSSAGSKALEAVDFSLSRGRCRFPCLQLAAAVSSRAALQSVPSLSSRVRRVRADLRIVSACLGSFARVRGLSDAERLNRILSIKAQALKVWVGASLVGLGSFRSIRASKYIVEQLEGAKSVLKQSWEQNCHVTAR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg010725.1Spg010725.1mRNA