Spg009510 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACAGCGTCGTGACGCTGTCCTCTGCTGCCACAGGTAAATAAGGGAAACTTTGACAGCGTCAAGACACTCTAGGGCAGCGTCGCGACGCCATGGCCTTTATCGCCCGTTCTACTTATGGTAAGTTCCTAGCGTCGAGATGCCACAAGAGCAGCGTCGAGATGCTAGTTCTCGGGTATGCCCACTTTGTGAAGCCTCCAACTTTATTCCTTTTTTCTCTGTTGGCTTCTTTTAGCGTCCCGATCACCCAATCAACTCCAAATTCTCGTTTTAGCTTCAATAATCAATTCCTACAAAATACACATTAAAGTGCATTAAAATGGCCAAGAATTACTCAAAGACTAACTATAATTTATCGGGAAATATAGCTCGCTATGTGTGCTATCACTCTTAATGAAGTTTCTCGCACTTTAATATTCAATTGCATGCTTTAGTGATTCTATCTTTGTTTCTATAAATTCAAGTAATGTTGGGGAAAGATTGACAACCTTTGACTGCGGTTTATTTGAGTTTACTTGCTAATCAAAGTAGTGATAGGGATAGATGATTTAATTATTGTAATAAAGACGTTAATTCCCCTTGATTGCATGCATGGCTAGTCTAGCTAGTTCTCAATATGGTTTAGATTTAATTAATTGCGCAGTTAATTAGATTTAGGCTAGAATCGGGCTAACTGCGTTGGCCTGTCCATGATAGTAGAACACGACTCCTCGTAACTTTAGAGTACGCCAGACTTCAGTTTTGCAATTGAAATACTTTGTGAAATTTGTGATTTAATTGCATTGAACTGAATCCCGAAGACCCTGATTACAATAATCCTTATTGTAAGATCAACTAACCTTGCTTTTACTTTTCTTGCATTTAATTTTAGCATTCACTTTCCCGCCTTTATTTTATGTCTTAATATTTTATCCATAAACCCCCTTTTCGGTTACCCTAGAAAGCACAAAAAAATTTAGAAATAAATCGATTGTTCCCTGTGATCGACCTTGACCACTATTGCTACAAGTTAGCTTTAGGAATCGTGAATTATAAATTTATTTGAAAAAAGACCGCGACAATCTCTTCCATCAGGGAGTAATTGATCTTGGAGGTGGCCATTCGAACACAGTGGGAGTAATTGATCTTGGAGGCTCTATTCAAATGACATATGTAATTTCTGATGAAGATGCAGCAAAGGTACCCATTTCTTTTGATGGAAACCCTAAATTTGTTCATAATTTTTTTTCTCAAGGGTGCAAATTATAACCTCTACGTTCATAGAATTTTTTTTCTTTGGCATTTCATAATTTATTGACCCTCAGTTTACTAATTAATATTACATGTTTTCTTTGCTATGTTTTCTCATTACAGAGTAGTTTGTTTGATGCCAAATTTATCTATTTTGAGATTATGTTGATCAAGTTTTCTGAAATTTTTAGGATGGGGCTGCACTCACTAATCTTATTATTTTTGTTGCCTCTCTTGTTGAAGTAAATACCATCGAGAATGCAAATGATGACCATATTCGAGGTTTTGGAGATCTCGAATATGACAGGGATGGCTTCTTTGGCTCCAAAAATATATTTCTCCCTTATTTACTTGATTCAATAGTTTTCATTTTGAGCTCCAAAAAGACCTACATCCTTGTTTTATTGGATAATAAGCCAATCCATTAATTAATATGTATTAGGTTCTTTGAATGAAGTTCACTCTGAAAATTAGACATCATGTGTATGACAGTAAAATTATTGTGTTTCCATACTACAAGTTTTTTCCTTAACTTCTCAAATCTAGAATGTTTGATCTTTAATTAACAAGCTATAACATTTCTTAAACATGTAATTAGGAGGAATAAATTATGTTCTTTGATTGTTCAGCCGTATGAAAGGCTACTTCTAGCATTCTTTTAATTGAAAGGATAAACGTCTTTTCTTAATATTATAAATTAACTATTTTTTTTAAGGATTTTGTTTAAGGGTGTTTCTTTGTTTTTACAGCTCGGGCATATGCAATGTCATTGTTGATCATCTTCTAAATCATATCCTAGTAATTCTTGTTCCAATTTTGAAGCAATTTGTGGTGTATATATATTCATTTTAACTTTTCATTCTTAATGACGACATGAATCAAGTACATGAAAGCACGACAATGGGAGAAAGTATAAAGTTGCAAAAACAGGAAACTTGTAGGGATTTGGAAGAATAATGGACATTTTCTTGTCCTTTTTGTCTCTTGATCATTCACCCTTTTCCTTCATTTGAATATCATAATTTTTGTCCACATATAATCCAATTGTGTTTTATTATTAATTGAGGTGATGATATGCTTTATTTTAATCTAGGCCAAGTAATCTGATAAATGTTTTCACTTCAGGTTGTTAACATTACTGATGTGCAAATTGCTAACCGCAAGTGTACAGGTCAAGTAATAATATAGTGATATGAAATCAAATGTAGTCCTCTGGATTGGTTTTCTAGTTAAACTAATTACCGTGAATAATTTCGTCCAATTTTATTTAGAGAGCTAAACATAATGAAAAAGATAAATCTAAAACAAAAGCAAAAAATAAAAGTGGAGATTCAAATGGAAAGACTCTTAGAGAATTGATTTCATTATTTGAGATTGAGGATTGACTAATGAGAATGAATTTTAGCGTGCAATTATTTTATAAGTCAAGGAAACTTTCATCACAATTATCTCTCTCGAGCATAATTGATTCTCATGCATACAATAAACACAATATCCCTATCGAAGTTCATTAGCATGCAAGGTCTTGAGTTTAGTCCTTTTTACAACTTCTAAAGTTATTATAAATCTCCCGATCTTAGAATTTTAATTTAAGTCAAGCAATTAGGGCCTAAGCTAAATCCTCTCTCCCGAGCAAGATTCATCATTAAATCAATCAATCAATGGCCAGTTAATTAAATGTATTCTAATATAATTGCATGAATAAAGCAAAAGCACATTCATACCGTAAATCAATCCAACAATCCAAACAACTACATCAATCCCTAAGACAAACAATTAGCAACTCATAGTCTTGGAACTACAAACACTAATTGACAAAAAAGCCATAAAAACAACTAGATAAAAGGGAAAGAAAGGAATAAAACTCGAATCCGTCGAAACCGTACGTCCCCGTCACGATCTTCACGCCTTCTCGCTTGATTCCTGCTCCTTTTCCTTGCTTCAACTCCCACCAAAGGTCTCTAGTGGTGTTGTAAATTGCACTAGAATTATGTTCATTTTAGTTCTGAATTTTGTTACTCAATATCTCCATCAAACATTTTTCAGTGGATCCTTGAATTTAGAAAGTTAAATATATCTATTTTAGCTATTTGAAGTTGGGTGATGGAGTTGTTCTTAGAGGTGGCCTACGTGAATTAATACCATGCATTGTGAGGACAACAGTGGTTGTTCGAGTAGATGGGATATTCATGGAGGTATTCAAATTTTTCGGATACCAGTTAGTTTCATGGTACATTTAGAATGTTGAGTTGGATTAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAGATAGTGATCAAATGAACATTTCTTACTAGTCAAGCTAAAAACTAGGTTATATGTAGAACTAGTTATTATTATTATTTCTAAAACGTTGTGTAAAGTTTTGATTGGTGTAACATTCTTAACCTTGTTTATTTGTCTAACTGCAAAAAGTATTGAAAATATTTGAAATTTGAGTTTGAGTTTGTGTCCCTGGGTGGGATTACTGTGATTTATGCATGTTACTTTCTTTTCTTTTCTTTTTGTTTGAGTTCAACAACATTTGAGACGAGGGATATGAATCTCCCACCTCATGGTCGAGGGTACATGTTAATTACCGGTGAGCTATATTCACTTTGACATGTCGAAGTGAATAAAGCTCACCGGTAATTGATGAAACTAGTAATTTTATATTTATGGAGACTTAAATTTCTATCATGATGATTACTTAATAGTCTATGAGTATACAATTAATTGGTTGTTTGCTTTTAGTTTATGAGATTTTCTATGGATTGTTTTTTAATGGTTAGTTATATTATTTATAGAGTTAGATAATTGGTTCTTTATATATGGTTCTTTCGGTTATGACTCACTAGATATAAATTTGAAATTAAAGTTTTGTATGTAACTTTTGAGCTTATTGAGTTTTCTTTTGATTGTATCATAATTGTTAGTCATTGATGATGCTTTGGACACTACAATTATGTGATATACCGATAAATTCACTGTGTTAACAACTTTACTTTCAAGTTTGATTGAAGATGTTAATATCTAACATGTGGAAGCAATTTTGGATCTTAAACACATAATAACATCAATTTGATCATATAAAGCATGTTGTCCAAAGCTGCAAAAAACAGAGTTCAAAACACCAACCTCTTGTAGTTCGAAATTGGACCGATTATTGTGTTGTTTTTCTTCACCAATTGATCACGAACCACCACAAGATCTTCCTTGCTACTCTCGGGCCTTTGGAATGGATTGTAGGATCCTTTAGTGATGGAATTTGGAAGAGAATGAGCTTGGGGTTCAAGCTTTTGAGAGTTTTGAGCTTATGAGTTTGAGAGGTCAAATTAGCAGCATAACACCATGTAATTCTCATGTCATTTTTCAGCAAATTCCCCTTTATTTAAAGAGGAATTCATGCACTCTTGAAGCCCCAAAATTAGACAACAATACAAGGGATTATTAAGTGAGATTTGGTGGCTAATTGAGGAGGAGTGCATGGGTTTAGTCATCACGCACTCCACCTCCTAAAATTAATTTACTTTTGAATTGCTTAATCCAATTGGAAATTAATTTTGGTTAATTAATAATCTGAATTTCTAACTTAATTTTGAATTTCAATTTTAAATTAATTCATAATTAATTTAAAATAATTATTAATTAATTAATTAATTAATTATATTAATATATTAATTTAATATCAAATATTAAATTAATATTTTGCAACCAATCCTGACCCTTTCCAAAATACAATTTCTCAAACATGAATCTCTATTCACGTGCTCGA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BLAST of Spg009510 vs. NCBI nr
Match: XP_038898089.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280, mitochondrial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2027.3 bits (5251), Expect = 0.0e+00 Identity = 1013/1220 (83.03%), Postives = 1112/1220 (91.15%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. NCBI nr
Match: XP_022152221.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280 [Momordica charantia] >XP_022152222.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280 [Momordica charantia] >XP_022152223.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280 [Momordica charantia] >XP_022152224.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280 [Momordica charantia] >XP_022152225.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 2010.7 bits (5208), Expect = 0.0e+00 Identity = 1008/1218 (82.76%), Postives = 1098/1218 (90.15%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. NCBI nr
Match: XP_008461454.1 (PREDICTED: pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1964.1 bits (5087), Expect = 0.0e+00 Identity = 990/1220 (81.15%), Postives = 1086/1220 (89.02%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. NCBI nr
Match: XP_004139757.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280, mitochondrial [Cucumis sativus] >KGN44436.1 hypothetical protein Csa_016420 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1962.2 bits (5082), Expect = 0.0e+00 Identity = 983/1220 (80.57%), Postives = 1086/1220 (89.02%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. NCBI nr
Match: KAA0061257.1 (pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK09837.1 pentatricopeptide repeat-containing protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1953.7 bits (5060), Expect = 0.0e+00 Identity = 989/1220 (81.07%), Postives = 1082/1220 (88.69%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LXF4 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g15280 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 973.0 bits (2514), Expect = 4.3e-282 Identity = 537/1228 (43.73%), Postives = 772/1228 (62.87%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVQ5 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g55840 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g55840 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 211.5 bits (537), Expect = 7.5e-53 Identity = 233/1069 (21.80%), Postives = 445/1069 (41.63%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ASZ8 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g12620 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g12620 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 1.6e-42 Identity = 128/505 (25.35%), Postives = 236/505 (46.73%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WKV3 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g12300, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g12300 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 7.8e-42 Identity = 134/541 (24.77%), Postives = 254/541 (46.95%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LQ16 (Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g62910 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g62910 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 1.4e-38 Identity = 130/552 (23.55%), Postives = 242/552 (43.84%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DDB5 (pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111019997 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2010.7 bits (5208), Expect = 0.0e+00 Identity = 1008/1218 (82.76%), Postives = 1098/1218 (90.15%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CES3 (pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500046 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1964.1 bits (5087), Expect = 0.0e+00 Identity = 990/1220 (81.15%), Postives = 1086/1220 (89.02%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9E7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G290590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1962.2 bits (5082), Expect = 0.0e+00 Identity = 983/1220 (80.57%), Postives = 1086/1220 (89.02%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CCW5 (Pentatricopeptide repeat-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold39G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1953.7 bits (5060), Expect = 0.0e+00 Identity = 989/1220 (81.07%), Postives = 1082/1220 (88.69%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F202 (pentatricopeptide repeat-containing protein At5g15280, mitochondrial isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1943.7 bits (5034), Expect = 0.0e+00 Identity = 984/1221 (80.59%), Postives = 1088/1221 (89.11%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. TAIR 10
Match: AT5G15280.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 973.0 bits (2514), Expect = 3.0e-283 Identity = 537/1228 (43.73%), Postives = 772/1228 (62.87%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. TAIR 10
Match: AT5G55840.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 211.5 bits (537), Expect = 5.3e-54 Identity = 233/1069 (21.80%), Postives = 445/1069 (41.63%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. TAIR 10
Match: AT1G12620.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 1.1e-43 Identity = 128/505 (25.35%), Postives = 236/505 (46.73%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. TAIR 10
Match: AT1G12300.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 5.5e-43 Identity = 134/541 (24.77%), Postives = 254/541 (46.95%), Query Frame = 0
BLAST of Spg009510 vs. TAIR 10
Match: AT1G62910.1 (Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein ) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 9.8e-40 Identity = 130/552 (23.55%), Postives = 242/552 (43.84%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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