Spg008871 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg008871
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold10: 30399155 .. 30405311 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg008871
SyntenySpg008871
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGCGTGCCTCTTCGCACGAGCAGCCGCGAGTCGTCCTCTCCCTCTCATTTCTCTTCTCCTCCGGCAGGTAACCCCACGACCAGTAGCGTTTTAAGGTCGTCTCCCTCCTTTGCGCGTGTTTTCGTTGGTCACAGTAAGTGGGTTTCGGATTTTTCCCTTTGTTCGCGCGTAAGGCTGCTCTTTTTCTCTTTATTTCATTCGAATACAACGAGCAACATATTAATCCCCTCTTCTTCCTCTTGTTTTCGGCTGAGCTAGTGAGTAGAAGCTTGAATCCTCTTTATTCCGGCGTTTTGGAAGTTTCGGCGTGTTTGGGCTATCTTGGTAAGTTTTCTTTGTTACCCATGATTTATTAACCTCAAAGTCCGATTACCCATTCTTGTTCAGCTTTAGAATTTAGTTTTAGGATTGATTTCTTGATTTTCCAGCGCTGCGCAGAGCCGTCTTGGACTCGAAATCATCCTCGCCTCGTGACCCATCATCCGTTTTTCCTTAAACTCAAACACCCACTGTCTAGGGACTCTAAACAAGTGGTTTTAAACCTCATTGCTTGCTGGACAGCACGTGTTCGGGGTTATTCGTTGCTGAACGGTAAATTCCAGCACTCCTTAATTCCGTTATTAAGTCTTTTAGGTGCCTTAAATTTTTCCTAACCCTTAGAAGTCGTTGTTTGTAGTTCGGGCTCCTTAGGCTCTTCCGGTTGTCCTGTTGGTCTTTTAGGATTGCTTAGGAGCGCTATATAAGTAAGTAATTCTTACCTGTTAAGGTCAGTTTGATTGCATGATGCACGCTGCTTGTTTACTCGCTTTATAACTATTCTCTTGCTTCTTGCTTATTGCTTCTATGCTTATATACATGTTTTGCTTCTTGCTTTTATTGTTTATGTATATACAAAATCTTCGAGTAGCATGAACTGTTGTTGTGTGGGGATTGGTTGTTAAGCATGCTAGATTTTCTGGGCATTCATGGGTTAGCATGAGTCGAGAGCACGTTCTTGTATGTATATGCTTGGTGGGCATAGTACATGAGTCTAGGAGCATGTTGCAGGGCATATGCATTCTAGATAGTTGTAATAGAGAGGTCAGGGACCTGAATATGAAAGAAAGGAAAGTTGGGTGAATGTCAGTGCACCTCGGGTACAAATGGTCGAGGGGTGGCATGTCACCAGTGGTTTTAAGAGGAGCATCGAGACCTTGGGTACAAATGGTCAGGGATCGGTGTGATGAGTCTAGAAAGCATCGGTGCACCTTGGGTACAAATGGCCAAGGGGCGATGCACAGTTCGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGCCGAGCTCCGTAGAGAGGATTGTGGCCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGGTAGTGCGACTCAAAGGGTTAGTCTTGGAGAGCCAGGTGAGGGCTAAATACGTTTGATGATTAGTTGTGTGTTGCATAGAGGGTTGCATGAGTCATGACTTAGGAGAGTCACTCACTTTATTAGCTTTTGAGCATGTCGTTATGTTATCGCTTAAGGAAGCATGTTGTTTGTGCATGAAAAGTATGTTGTTTGCTTGGTTGTGATTGATGGCTTTTTAGGTAAGTGCTTACCAGTACCGTGGTTGTACTGACCCCTTCCCCTCATTTCCCCCAACATTTTAGATTATGCAGGTTATGAGGACTGCTATGAGCCTGATGGTGCAGAGGAGACGCATGAGGAAGGATCGTAGTTGGATAGCATTATGCTTTTTCCTTTATTTTTATCTTGGATAGGGTAGTGTTGTTTTCATTGGTTGGACAGTTGTTTGTCCTAATTGTTCTAGTTTTGAATTTATTCTTGTTGAGACTCTAGGCTAGTTGAGCTGGTTTTAATAAACTCTATCTGTTATTTCAGTTTATAATGATTAAGTTGCTTCTAATAAGTTAAAGTGTAGTAGTGGTGCTTAGTTGAGTTGTTGGTTGTGGATGCCTTGTTGATTTATATTATTGCGAGATCTGACTCGCTTGTCGTAGAAGTTCTGTTGTGAACCTGAGGCATTGTGGTGTGGTTGTGAGCGGATGATATTAGAAGTGTTATTTTTGTCCTAGCAGGTCTTTGGAAAATTTTTGGTTCAGTCTGTTATATGCCGTTATGCTGCCGAAATTTTCGGAGCACTCGGTTAGTTCATTATGAGTTAGTAATGTCACTAGGTTAGCAGTTAATAAAAACCTGGAGCGTTACAATTTGGATCCAATGAGTCTCCTTTGACCTATTTTCATCCATAACCAAATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATATATATATATATATATATATATATATGAGAGAAGTTCTTTGAATATGAGTAATATATGAGAAGTTCAAGAAAAAAATAATTCTTTCCTTAAACTTTGCACACGGTACCATAATTAAAACATTACACTAATAATTATATAAATTAAAATTCTAAATTTTCACAACTAAATAAATTTAGACTCCTCTTTTCAGTGATTCACAACTATTTTCTCTTGATTCTATTTAAAAATTAATTCAAAATTACCCAAATAACATTATTCTTCTCCCTAAAACTTAACAAAGTAGCAAGTAAATTTATCAGGTAATTATTTCAAAATACGTAGAGGAAAATAGAAGACCGTTCATATTGAGGAAAATAAACCTTAAAAAAAAGTAGAGGAAAATAGAAGAAGCGAACATGAAAAACCGTTCATTTTAATGAAAACTACTACTAACCACTTGATTTTAACATTTCTCTCTAATATTGTGCTAATCCTTGCATTGAAAGAAGTCTTACATACGTGTAAGAATTTTGCATTAACGATTTTAAAACAAAATCTTAACAGAGAGTCTAAATTGATTTATTTTTTAAAACTTATGATTTTAATTGATTATTTGTTTAGATTTTTGGATTTTTTTTTTTTACTTGATTCTAGGTGTAGGTGTGGGTATTTCTTTATGGCTATATGTACATTATCACCTATTGAAGCAAACATTTTAGGAAAGTTGAGGCTTTACTCTAACAACTCTATTAAAGTCTCCTTGCTGGGACCTCCATTAATATCCCTAAAATAGAGGGTTACTCGAATCTTTCATTTTTGTACTTATTCATTCCTTGAAAGTCTAATTAATTAATAGTAAAGTAATGTCTGGATGGTTAGTGTCCATTTTTGCATGACCTTGCAATGTTATAGTTAAAGGTTTGATAAAATAAATAAAGCATAATTGCCTTCTCTTTTACATACAATATGAGAGGATGGTTAGACTATATATATATATATATATCGAAGCCAAATGCATTAAATAGAGAAAATATTAAAGTACAGTTGCCCTGATTAATAAGGTGGGAAAATATCCAAACCGGTAAATCTGGGGACCAAAACGTTTGCCTTTCTTCCTGCAAGGAAGAACTCCCCTGAGGCTCAACAAAAAAAATCACCTAAAGCTTCCCTAGCTACACAGTGGGTTACTATGTTGGATGATCTGGGACAATGGCAAAAATCCACTTTCCCCAAGCTTCTGCAAACGTCTATGATGGCTTCGACATAATTTTTTTTACCTTTGTAAGCTTCTCTGTTCTACCGTTCAGAACGCTGATTATCTCCAAAGCATCAGATTCAACTATCATAGGCGCACGAACGAGGCTTCTCAATTTGTAACCTTTTGTAACCCTTCCCAATTCGCGGTTGCTTCCAGTAATCTAATTGGCCATTTCCTCTTCATTTTCTTCATATCGCAACCAATCGGGGATCCTATTGTTGGGTTTTATTCTCTAAAACTCATAGATAGTAAATGTAAATAATTGACTGTTATCAATAAAGTGTTGTTGATGATTATTCAATAAGAGTTATCGAATATATTGTATTAGTTTTGTCTTAAATAACCCTAAATCCAATAAACTAACATCCTAGGTTATCTTATGAGTCTTGAACAGTATGTGGAGACATACAAGGATCAATGTTCAAGATACAACCTAAAGGGTCTATAGTATAGGGATAAGGTTAGGTACCTTATCCTGGTGACACTATGGATACGACCCACTTTGTATTTGAGACAAACGCAATGATCCAACGCGTTTGTGTAGGTGACATGTGAGTGGGGGTATCCTATGCAATGAGTTTGCATAAGACCGGATTGCGAAATAGTAACCACTAGATGTAACTCCGTTGACTAGTTAGGTTTCTATTTCAAATATAGGATGACCTAGGCAACTTAGTCTTAATCCTAAGTGTATTATGGGCTCCTATTCACAAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTAGCCAGTTCGCCGACTCAATATGCCTACCATTTTGGGGACAAGACCGACTAGAGAGCTAAGAACATAATCATACAAGATGGAATTCGCTCCTTCCTGACTTTAGGGTAAGTAGATGAGTGTTCACTTAAGTGGTGTCTCCGAGACTTGAACAAAAGGCCCTACCCTCTCACTGGCCTGAGAGGGGTTTCTGTTCAATGGTTAGACCATAAACAAGTTGTTCATTAGAGGAGCACTGATACTTAAGGATATAGAGGTAACCTAAGGGTAAAACGGTAATTTGACCTAGCTGGTGTTACGAACACACGTGAAGGACTAACTTGCTGTTAATTGGTTTATATCCGTGAACACAAAAATATATCTGCAGTGAGAAGAGTGCAGCTGTGGGTCTTTAGTGGAGTGTACCTACAATTAATGAACATTGATTAATGTGATTAAAGAGTTTAGCCAATTAATCTCATATCGTTGGAGCTTCTGATCTGTAGGTCCATTAGGTCACACTGGCAGCTCGTAAAGGGTATTAAGGTCATTTAGTCTTGAATGTGCTTTGAAATGTTTAAATTCACGAATGGAAATAATATAATGTATGGTGATACATTATAATATAAACTTTATATTTTAATTAAACTTTATAATATAATTTTTTTTTTTGAGAAGAAACTTTATAATATAAATTTAATATTGAATATGATTCAAAATTAATTTATGAGAGAA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mRNA sequence

ATGCGTGCCTCTTCGCACGAGCAGCCGCGAGTCGTCCTCTCCCTCTCATTTCTCTTCTCCTCCGGCAGCGCTGCGCAGAGCCGTCTTGGACTCGAAATCATCCTCGCCTCATTTTCTGGGCATTCATGGGTTAGCATGAGTCGAGAGCACGTTCTTAAAGCATCGGTGCACCTTGGGTACAAATGGCCAAGGGGCGATGCACAGTTCGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGCCGAGCTCCGTAGAGAGGATTGTGGCCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGGTAGTGCGACTCAAAGGGTTAGTCTTGGAGAGCCAGATTATGCAGGTTATGAGGACTGCTATGAGCCTGATGGTGCAGAGGAGACGCATGAGGAAGGATCGTCCATTAGGTCACACTGGCAGCTCGTAAAGGGTATTAAGAGGAGAGTTCATGATCTTGCTATTCAATCCCAAGGAGTTGGAATTGGTGATTTTCAGAGCCGTCAAGGAGAGTTCCCTCCAGCGGTTTTTCCCATCATTCTTGACTCGACTGGCTCTCCCAAATCTCAAAACAGGGGAGCTTCTTTATTAGGTACGCTCCTTTCGACCTTGTTCTCTGATGTTGAGATGAATTTGCTTCGCCTGATCTTGATTGGGTCTGCTCTGAGATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCGTGCCTCTTCGCACGAGCAGCCGCGAGTCGTCCTCTCCCTCTCATTTCTCTTCTCCTCCGGCAGCGCTGCGCAGAGCCGTCTTGGACTCGAAATCATCCTCGCCTCATTTTCTGGGCATTCATGGGTTAGCATGAGTCGAGAGCACGTTCTTAAAGCATCGGTGCACCTTGGGTACAAATGGCCAAGGGGCGATGCACAGTTCGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGCCGAGCTCCGTAGAGAGGATTGTGGCCCTGGGTACAAATGGTCAGGGGGTAGTGCGACTCAAAGGGTTAGTCTTGGAGAGCCAGATTATGCAGGTTATGAGGACTGCTATGAGCCTGATGGTGCAGAGGAGACGCATGAGGAAGGATCGTCCATTAGGTCACACTGGCAGCTCGTAAAGGGTATTAAGAGGAGAGTTCATGATCTTGCTATTCAATCCCAAGGAGTTGGAATTGGTGATTTTCAGAGCCGTCAAGGAGAGTTCCCTCCAGCGGTTTTTCCCATCATTCTTGACTCGACTGGCTCTCCCAAATCTCAAAACAGGGGAGCTTCTTTATTAGGTACGCTCCTTTCGACCTTGTTCTCTGATGTTGAGATGAATTTGCTTCGCCTGATCTTGATTGGGTCTGCTCTGAGATGA

Protein sequence

MRASSHEQPRVVLSLSFLFSSGSAAQSRLGLEIILASFSGHSWVSMSREHVLKASVHLGYKWPRGDAQFEALGTNGQGSNAELRREDCGPGYKWSGGSATQRVSLGEPDYAGYEDCYEPDGAEETHEEGSSIRSHWQLVKGIKRRVHDLAIQSQGVGIGDFQSRQGEFPPAVFPIILDSTGSPKSQNRGASLLGTLLSTLFSDVEMNLLRLILIGSALR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg008871.1Spg008871.1mRNA