Spg007944 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTTGCTTCTAAATATTTCATGTCAAATTGAAGCTCCCCCACTCATCAACTTCCATTTCGGCTCTGAGATCAGTTCGTTGTGAAGTCTTCAATACACTTGGAAGGATATGGAGGAATCTCTGCTGGCAGGAGGAAGTAGCAGTAGCTCCAGCTCTCGACGTCAGATTCCTCACGTGAGGTTCAAGCGCCGCTCCGACGCCATCGCTTATGGCTCTGCGTACCAAAGAGCTGCTGCTCTCGTGGATCTGGTTAGACTCTGTTTGCCGCATTTGAATCACGCTCGCGTTTTTCTTTTTCACTGGTGATGGAAATGTGTTCTGGTGTTTGTCATTTGAGTGAACGATGTGATCCTTGCTTTACTTTGACTGTAGCTGTGTCTTTGAACTGTGATGAATTTGGGATCTGTTTTGGATTGTTTTTGACGGAATCTGGTTTGCGGTATCCGAATCTTGTGCTTGTCCTTTTGAGATATGTATTTCTGAATTTTGACTCAGTGACCTGGAAGTTAGTCCAGAGCGATTTTCGTTATGATCTTGAGTGGTTTAGTGGCCTAATTCCAGCTTAAACTGCTGCGTTTAATAAATTCAACATCTTTGATATGCTCTCCCTCTCCTATTTCCATTTCCTATTATGAACTTTTCTCTCTGAGAATCGATGGTTTTACTTTTCTACATCTTTAAAACAGAGCATAATCTCTATTTGGCGTCTCTATATTTCATTAGTTTCGCACAAGGTATATGCTACTTATTTTGCATGTTATTCCTACAACTTGATAATTTTCTATATTTCTTTATGGTACAAGTTTTGTGAAATATTTATTAATTAAGCTCAAGATTAATGCTAACCATTAACTTTGTCTATAAAACAAGGATTCTCTCATGGAATATATGGAAAAAAGGATATGGTTTTACTTCAAACCCTTAGTCAACAGAACATTTTTGTCATTGCTGATGGAGAATGAATTTTGCAGGCTGAAGATGGCATTGGTATACCCGAGAAAATTCTTGATCAGTCAAACTTTCAGAGTGCTGCAAGGCTCTACTTCATTTTTATTAAATTTGATATTATTTGGTCCTTAAATTTCTTTGCGCTGATAGTTCTAAATTTCTTTGAGGTTTGTTATTCCATTTTTTTTAACATTCCTTTTGTTTTCAGTTGTGAAAAGAAGTTTTAGTTCGTTTTTTAATATATATAAACATTTGCAGAAACCCTTATGGTGCTCCAAATACGAGACACATTCTTGTAATGATAGGGAGTATTTCTTTCTTGGGCAGTTGCCATACTTAACAGCTGTTGAATCTCTAATATATGAGGTAAGAATAAACTAAATGAATTATTATCTTTTTACTTCGACTCCAACCAAGTTGGACTTGTTCATGTTATGGTTTTGTCAGGATAAATTATGTGGTAGAATTGCAGTACTACATTCTCACAGTAGTTTCAATGCATATACGACCTTGCAATTGGCTCTATAAATTATATCTATGAATGCTACTACACATAAGCACGGAAGAAAAAACTGAATTATTATATTGGCGGAGGATGAGGTGCTTTATTTACTCACAAATATAAATTTGCAGGAAAATGCTGCTCGTAGATGCTGTATACTTTACGTCAACCAAATGCTTTTAATGTAAAACTCTACTGTTGCTGAATCTCACTCATTGAAAGTGTAATATTTGATGTGATATTAAATTCCACTACGTGCAAAAAGCAGTTATGTGCAGATTTTTAATTAAGTTTCACGTTTTAATTGAATGGGGAATGAAATTTCTTTGTTTCCTCGAACGATATTCACAAATGGTTCAAAGTGCAAAGCTATTTCAGTTGATGGTAGATGTTAATTTTCTAGATTATCTATATTTCTAAGAATCACTATGCATTGAAAAAGCAATTTTGTGAAGTTTTTCAGTCTTCTTAATCTTCCACTTTCCACTTTAGTTATCATCTGTTTCATCGAGTTTCTACTTTCTAAATGCAGGCTGTGACTCTCTTAATACTCGTGATACACACTTTTTTTCCAATTTCGTATGAAGGTGCCCAGCTTTATTGGAAAAATCCGTTGAACCAGTTGAAGGTACTTGTCCAATCCCTCTTTCCTTTGATAGGTATTCTTAAGGTAATTTGAATTATAAATGAACGGGAAGGTTCGATACTTGGTAGTTGGAAAACATTCACTTTTTAATGTTCTAAGTAATTTGAGTGTAAAGACAACTTCCTTATGCCCTTAATGTTAAAATGCACCTATAAATTATTTTCTTTGTCCATACGAGAATTTGAGCTTGGCAATAATACATAGATGAATGTCTTTTAGGAAAGGCAAAAAGTTTGTTAAGTGACTAAAAAGTTTTAGCAGAAATGTAACATTTATTGCCTTCACAGAATTATTTAGATAGGTTGAAGTTGAACATAACAGTCAGAATCACATTGCTGAAATGATGAAATGGTAGATTATCATATTTTATTATCTTATCAATGATACATTTCGTTTATAGTGCACTTCATCTTATGATTATGGTTATATATTTTTATTGTACCTTGGTTAAAGGTAGTCTTTAATTCTTTAGAATGAGCAAGTCAACATTCTAATAATTGGAATCTCTTCCTTATGAATTGTCAATACCCCATCGGGTTTTGGTGGCTATGATGTTGTGCTTTTAACAAAATTAATTCTAAATCTTTCCCGTTTTCCAGGTCATTTGCATAATTATTTTGGCTGCTGATTTTCTCATTTATGCTCTATATTTGTCGCCGGTGGCCTTTGATTATCTTCCATTCAGAGTTGCACCATATATAAGAGTTGTCTTTTTCATCATGAATATCAGGTATTTCTTGACAGGACTCTGATTTTGCTTGTCATTTTTATGTGAATCACATCTTATGTACTTAAAGATATCGTAGAGTCTAATTCAAATACTCTTGTATCAGCAAGTAACTTAATTTCAAGGAATGAATTTAAATATACTTCTTTTGGCAAATGATTGTTTCGAGATAGCCCTTTTAGTGGGTTAAAATAGACCAGTTAGTTCATATTAATTGCCAGCAGGTAATTATCCATTGTGTAAATAAGCATTTAATGGTGTTGGATGTGTTGCGGAGATTGAGAGAAGGGAGCTTCCTACATTTCATTTAAAGATAAAATTTCTGTGTAATATCAATTTTTGTCGTTGTTGGGTCTCCTGAATCATGATATCTAAAATGACCATCATAATACTCTCTTATTCTACTGATTGAAGAAAGAAGGCTTGAGATTATTTATTTATGGGAAAGGTTATGTTTTGATTGGGCCCTAATATTTTATCTTCATTAAATGCTGATGAAAATTCAAATGCAGTACCTATTCTGATATGGAATTACCTCTTCCATTAATATCTGATTCTTGTTCCTTATTGGTTGGAGGCAATCCTGTTTATGATTTAGTTATTTACTTTTAAACAACTCCAACAAACTTAATCATTTCATTTGGTTCTTAGGCATCTACGGGAGAGCATCATCATCCTGGCTGGAATGCTTGGAACATACTTGAATGTCTTGGTTTGTAGATAACTTTGGCATAATAAATATTCTGTTTCTGTAGAATTTATAATATACCTACATGACATCTTATACTTACCTTTTACTTGAAAAGTTGAAGAACTGTGAGTCTAAAATTATACTATCTTAATTATTATACCAACTCTTACTACTTTATTGCTACTTTTCTTGCAGGCTCTAGGGCTTTTGTTTCTTCTGTTTTCCAGCTGGTTGGCATATGTTATTTTTGAGGATACACAGCAGGGGAAAATAATATTTACTTCTTTTGGAGCCACATTATATCAAATGTTTATTTTGTTCACAACATCCAATAATCCAGATGTTTGGATACCTGCCTACAAGTAAGTGGGTAATATAGAATGATTAAAACACTGTTCATAGCTTTTATTGATATGTTTATCTACTAGTTTGACCAGTATTCTTTTCTTCTTCATTCCCTTTGAAATGTATTGATAAGCTCTTTTCAGGATTGTAAATTTTGGAAATGGTTGTTGTCCTTCTGCTAATAATCCAAGAAACAAGTTTAGGAAACTGTTTCATGAGGTAGCAAGCAGACACTGGAATAAGAGATTTGTGGAGTGATATACCAGTTTTCTGTTGAGTTCTTGCTTAGAGGAAAATTAATCCCCCTTTTCAATCACTATCCCGTTCCTGCATTTTGTACTGGTTGGGAGTAGAATGATGATGAAACATATACTATTAAAGCATGTTTTGGTCCAGAGAGTCCATGAAGACTTGGGTTTTCATTCATAAATTTTGTGATATTCAAAATGGTCTCTAATCACATTCAATTTGATCCCTACCTAAGAAGCACGGACACTTTAGTTTGGCTAGCGTGTCCTTGTCTGACGCATGTTGGACACTTGGACACTCCGACACTTGTTGAACATGTATCGGACACTTGTTAGTAGAATTGATATGTGGCAAACACTAGTTATACAAAGTCAATATAGGTTCATATCAAACACTTGTTAAGTATACTAAATAGACACAATATTAAATAACAAAAATAATACATTTTAAGAGTGAAATACATTAAACTCATTTTCTTAAGCATACAAATGCATTAACTTATTGATTTTGAATCTCCTTCCTGTATAAAAATGATATATATTTTAAAAAATGTATATTTTATTTAACGTGTCTGTGTCGTGTCCCTATCTTAGATTTTAAAAAAATGGCGTGTCATTGTGTCTGTGTCGTGTCATGTCGTATCTGTGTCTTGTGTCCGTTTCCGTTCTTCTTAGATCCCTACATTGCACAAGACAAGACCACAAATTTACCATATCAGTTTTAGAGATAGAATTACTTTTGAGAGAGAAACATAATGATTTCATTGATAAATGAAATGATCGGGATAAAACCCCGAACCATTATGAGCAAATTACAAAAAGGACCTCCAATTAAGAGTCAAAGAAGCAAGACTATAATCCTTAAAAGGATGTAAACATTTACACCAGT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BLAST of Spg007944 vs. NCBI nr
Match: XP_022968991.1 (two pore calcium channel protein 1A-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1295.4 bits (3351), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/738 (90.11%), Postives = 685/738 (92.82%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. NCBI nr
Match: XP_008455316.1 (PREDICTED: two pore calcium channel protein 1B isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1290.4 bits (3338), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/743 (89.64%), Postives = 685/743 (92.19%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. NCBI nr
Match: KAG6572364.1 (Two pore calcium channel protein 1A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1290.4 bits (3338), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/739 (89.99%), Postives = 685/739 (92.69%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. NCBI nr
Match: XP_022952442.1 (two pore calcium channel protein 1A-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1289.6 bits (3336), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/739 (89.99%), Postives = 685/739 (92.69%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. NCBI nr
Match: XP_022930707.1 (two pore calcium channel protein 1A-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1285.4 bits (3325), Expect = 0.0e+00 Identity = 662/738 (89.70%), Postives = 688/738 (93.22%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75VR1 (Two pore calcium channel protein 1A OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=TPC1A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 978.0 bits (2527), Expect = 5.6e-284 Identity = 496/732 (67.76%), Postives = 597/732 (81.56%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75VR0 (Two pore calcium channel protein 1B OS=Nicotiana tabacum OX=4097 GN=TPC1B PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 975.7 bits (2521), Expect = 2.8e-283 Identity = 497/738 (67.34%), Postives = 597/738 (80.89%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94KI8 (Two pore calcium channel protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TPC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 955.3 bits (2468), Expect = 3.9e-277 Identity = 468/710 (65.92%), Postives = 583/710 (82.11%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5QM84 (Two pore calcium channel protein 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TPC1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 885.6 bits (2287), Expect = 3.8e-256 Identity = 449/731 (61.42%), Postives = 554/731 (75.79%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6S5H8 (Two pore calcium channel protein 1 OS=Hordeum vulgare OX=4513 GN=TPC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 850.9 bits (2197), Expect = 1.0e-245 Identity = 433/736 (58.83%), Postives = 544/736 (73.91%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HWG3 (two pore calcium channel protein 1A-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468128 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1295.4 bits (3351), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/738 (90.11%), Postives = 685/738 (92.82%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1V7 (two pore calcium channel protein 1B isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495512 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1290.4 bits (3338), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/743 (89.64%), Postives = 685/743 (92.19%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GKF4 (two pore calcium channel protein 1A-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455128 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1289.6 bits (3336), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/739 (89.99%), Postives = 685/739 (92.69%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ERC4 (two pore calcium channel protein 1A-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437105 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1285.4 bits (3325), Expect = 0.0e+00 Identity = 662/738 (89.70%), Postives = 688/738 (93.22%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JDS0 (two pore calcium channel protein 1A-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111485952 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1281.5 bits (3315), Expect = 0.0e+00 Identity = 661/738 (89.57%), Postives = 685/738 (92.82%), Query Frame = 0
BLAST of Spg007944 vs. TAIR 10
Match: AT4G03560.1 (two-pore channel 1 ) HSP 1 Score: 955.3 bits (2468), Expect = 2.8e-278 Identity = 468/710 (65.92%), Postives = 583/710 (82.11%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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