
Spg006316 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAGATTACAAACCATCGGGCGAGAGAGAAAATCGGACAAACGAAGGAAAATGGAGAGAGAAGGGAAGCGTGTTACCGAAAGTGGGGAGCGAGAGAGCGGCGGATAATGAAACGAAAACGGGGGTTTGGAAAACCTAATCAAGCGTTTTCCAGCGGCCCAAACGCATGTTTCTTAAAAACGGGGTGTTTTAGAAACACCGGGCTTCCGAAGTTGGGCCCCCAAACACGCCCTAAAACTTAAACTTAAAAAACAAGTAACAATTGTTATAGGTAATTCTAGACAATTCCGAAAATTGAGAAACTGACAGAGCCAGCGAAGCATCAACCTGAAACGCAACCAAGAGCCCAACCACCGGAGAAACAGAGGGTTGAGGCCGACCCCGGGCACAAGCCCAGGTTTGACCCAATCTCACTTATTCTTGGTCCGTGGAGTTCAAACTAAGCCTAGTTGGACCAAATCTGATCCCATATCGCCTCCGAACGCAGGAAAAACCCTAAACACAGGAGAATGTATATAAACCATTCTTCAACCTTGAAAAAGGGATCCCGAAACTATTCTCTAAACTCTCTCTTCTCTTCCTTGAGCTCTATGGTTTGCTCATCTTCCTTCCTCTTTGCTTACTTGAGCATCGGAGGCGGTGTGACAAGTACAACACCAGTGTGCATGTTTCTTCTGTCTTGCAGGCCACATCTTCCCCTCTCAAACAAATTTATCGTTGATGTCACGTGAAGGTCAGTTGAGTTTTCTCTGTCCGGATTTTGACATCAACAACAATAATGTTACTAAATTAATACTAAAATATTGTGTTTAGCTGTAATAAGCCTATTATTTCAACTATTTATATATTTACATTTAATATCTAATTTTGTTATAATTTATAAGAATTACTTAAATATTTATATGATTCCAATCACAAATAATTTGCATAATTAAACGATAATTGACATTTATACTCGACAAAAACTGTTCGAATCCCCCACACACACCCAATGTACTAAAAAAAATCGCAAATTATTTTTTACATTAATTTGCAAAAATGATAAATTGATATTGCAGAGCAGACATTTGGATCAGAGACGAGCTTCTGAAAATTCAGACAACTCCGACTATGGCTTCTTACTGCAGCTATGGATTCTCCGTCGTAGATGCTACAATTCCCTCTACCAGCAGAGCCTTCATCCTTAATCCATGGCATTGGGACCTTTCCACTTCGTCTTTGTCCCAGCCTCATCGCCTGCAGCTCCCTGCATTTCGAGCTCGGAACATTAAGCAGCCCCATAGCAAAGCGAACAGAACCATTACTTTCGTCTCTGCTTTGCCTTTCGACCTCTCCCCTCCTCCCATCGATGAGGACCTCCTTGTAAGTTCTGTTCCTCCATTTATTCCACTTTGTTGGTCTGTTTAATTCGCTAGAAACTGGACAAGAGCGGTAAATTGTCGGAAATGATTAGTAATGTTTATAATCGGTGCTTTCGAACCTTGTTTATGTTTCTGGATTGTTGCTGATTTGATTCTGTTGTAACAAAGTCGCCTATGACGCTGTTGTTGATTGATGTGATAGTGTTCTGATATTTAAGTTGATGGATTGTGGACATATGCATTTCAATTAGGCAAGAGGGGAAAAAGAAGAGAGGAATGTGCTGGTATGATTGATTTTAGAGAAAGATTTCCGATTCTTGTTTGGTGAGAATGTGTATTGTATTACTTTGGGAGATTGAGAACCGTCCCTTTTCAGACGGCGGTCTAATACTGTATCATTGCTAACATTTGTATCATTTGCTAAATTTCAACTGAAACGTCAGTCCTTGCGATATTCTAAATTTAGATATCTATAATGGACAGGAGGCTGCGGCGACTAAAGGTGCAAGGATTTCTGATGATGGCATTATTGAAACTTTTCATAATGATGATGAAGCGTTGGACGCAGCCAATAGTGGGGTTGCAGTATGTAGTCTTCCGTTTTTTCTTACTGGCGTCTTTTTTGTTTTGCTCTGTTTAGTTTCGAAACTGTTTATATCTCCCTTTGGAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGAATTTTACATGCATCAAACATATGAAAACATTTCTAAATTGTTAATTGTCTAAATTACAATATGCCTTCTAATTCTCGAGTATCCAAATCAGAAGATGAATAGATGAATGAGAGGCAGTGCAGTGTGCTGTAGAACTGTAGATAGTAGCAATTTTGATAAGATGATCAATTAGAAGCTCCTATGTGTCACCCCCCAAAAAAGATCAAATGGGGCATGAGACTTGGCTTTTTGATCGTTAGGCAAGACCATTGGGTTTGTGATAAAGAGCAAGCTTTTGATAGGCTTTTTTATTCTATTGTTTATCTTGGTATCTCATGGTGTAAATTGTCACCTGTTTTTCATATTTATAGCTACTCTACACTTTTGTCCCATTGGAGAAGTTCTTGTAATCCACTTAGAGTGGGGCTTTTTCCCCCTTTTTGTAATTTTGTACTTCAATGAAATGGTTTCTCAACAGAAAAAAAATAATTATATCTTGCAACTGAGTTGATTTTTTTCATATTATGTTGTTAATTGTTAGGTTGTGGATCTTTCTCATTTCGGCCGAATAAGGGGTACACTCTCTTCTTACTGTCTAATTGGTTTATATATATATATATATATATAATTTTTTTGTTTGTACTATTATTTATGAGTTTGATCGTGCAGATTGAAGCATTCCATGTATAATATAGAGATTTATGACTGCTCATGATTTTGATGAGTTTGATTTTACATATGTACTTCCTCTAAAAAAATTTGCAATTATTTTTGTGTTTCCTCACGATTCTTTTCCCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAATTAACAATAAAATCATGAACATTTGTTTGTTATTTTTGTTTCTTAAGCTTTAGCTTAAAAAGAAAAATAGAATAATAAATGATGTATATGTATATGTCTTTGCCGTTCTTCTTTGAAATGTCATAACTTTGATACTCCATTCTTTCTCAAATGACCACTTATGTTAAAGGAAAAAAAATCTTCTAAAAATATGAAGATATTACAATTGAGTGTGAGAGAAATGAAAATATGTTTTAACTAGAGAATAGAAAGTCGTCAAAATAAGTGAGTGATTTTTCACCCCAAGGGATAATCTTGGTGGTAAGGGGTTGGGGTGTTTGGAAATTTCCTTCAAGGTTTTAGGTTCAAGCTTCTTGGTGGAAATGGAAAACATAATAATTTAAAATCCTCGTGGTCTCTTAAAGCGAGCCTTGGATTGAGTAGATGATGTGTAAAAACTCGCTATGCAAGCATACACAATCATAGGTAGTAATTGGTGAATTAAGATCGATCTCACAAGGACTAATTTATGCAATAACGAAAATTACCAGCTGGCTATTTCTAATTCTTGAACTTCAGTTCTTAAGCCAAGATAAACACATGTCTATGAAAGCGCAACACTAAAAAAAATGAAAGAGAACTAACATTACCTTAGCACTTATGGAAGGAAAGGAATGCTAGATATGACCTTCGGGCAGTACAAAGTCAACCTCTTCCGTAGAGGCAGGCAGATAGTAAACTAACCTTTAAAGAGTCTGTTCAAGGGGGGAGCCCTCTAACAATGGAAAGATCTTTGTGCGTGGCGTGAGGCTACGACTTTCTCTCATGGCACCTCAATTGCTAATGCAAGCATCCATCTAGTTCCATTCTATACCCTGCCCTCCCCTTCGTTGATTGCTATCCATTTTCCTTGCATCCATCCCGGGAGTGGAGCTATACTGAAAAAGATTTCAAATTGATATCAATCTTCTATGTTCTCACCCTCGCCAAGAAAGCGCAGCTTTAAGTTTAATCATTGATCAATAACAAGAAAGAGAAGGGAATCACATATTATATTAACAGACAGTCATTCGTATAACCGATGTTGCACTCCAGAGAAGGGCAGGTAGGAGACAACAGTTTGCCACGAAAATGATGGAACCAAATTGAAGAGAATTGTTACTTTACAAAATCATATTGGCATACTCTTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGCAGACCCCATTGAAGAGCGTTTAAATAAGTCTTTACGGTTGGATTCTTCTTGTAACATTGTACAAAATACGACGTATTGGTGGATTACTCTACACACAAAATTCTCTTATAATTACAGTCTCTTGGTGATTATCAATGATTGGAAGGCTCTTCTTATGTAGATCTAGAGGGGTGTCCTCAACCGTGGCCATTAGGCTATTCTTGTTGTTTTGTCTTATAAATGCATTTTGATGTTTCTTATAAAAAAAAAAAAAGAGAACTAACATTCCCTTATGGATTTTATCGAATGGTAGTTTAAATACGTCCGAAGTCCTACAAAGGAAGCTTCCTTTTTCGGTTCTTATACCTTCGGTTTGTTCTCTTTGTTATGAGAATGGGGATTCTGTACATGGCACAAGCTTCTCTCTCGTTTTAACGTATCATGGGTTTTCTCCTCTAATTTGAGGGACAATCTTCATTTGCTTTTATTTGGGCTCTCATTGGCCTCAAAGCCTCTTTTCGTTATGGTCTAATGCAATCAAAGTTCTTCTCTCGGAACTATGGATGGAAGGGACTTTGAGGATCTTTGAGGATAAGCATATGTCTTGGACCACTTGCTTTGATTCTGCTCATTTGAAAGCTTCTGCATGGTGTTCTCTTTCTAAAGTCTTTTTCTGGTTTCTTTTTGATAGATATTAATTTTAATTGGGATGCTCTAATTTTTTCCATGTGATGAGTTTTTCGTTCTTTCTCAGTTTTTATTTTCATTCCCTTGGGGAGTTTGTATCTTTGAGCTTTAATCTCTTTATATTATATCAATGAAAAGTTCGTTTCTTGTTAAAAAGAACAAGTGATTAGCTCAATTTTCCTAAGTTTACAAGCCAAAAGTAATATCCCTACACCTTTGAATTCACCTCTGATTCAAGTCATGAACCTATTTGTACTGCTTATGCTATTTCCA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BLAST of Spg006316 vs. NCBI nr
Match: XP_008449402.1 (PREDICTED: putative transferase At1g60990, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 560.8 bits (1444), Expect = 1.5e-155 Identity = 330/596 (55.37%), Postives = 352/596 (59.06%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. NCBI nr
Match: XP_038887599.1 (putative transferase At1g60990, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 558.1 bits (1437), Expect = 1.0e-154 Identity = 329/599 (54.92%), Postives = 359/599 (59.93%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. NCBI nr
Match: XP_022158902.1 (LOW QUALITY PROTEIN: putative transferase At1g60990, chloroplastic [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 536.6 bits (1381), Expect = 3.1e-148 Identity = 325/599 (54.26%), Postives = 354/599 (59.10%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. NCBI nr
Match: TYK13394.1 (putative transferase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 525.8 bits (1353), Expect = 5.5e-145 Identity = 317/599 (52.92%), Postives = 350/599 (58.43%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. NCBI nr
Match: XP_004140110.1 (putative transferase At1g60990, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN47936.1 hypothetical protein Csa_003267 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 2.1e-144 Identity = 317/599 (52.92%), Postives = 351/599 (58.60%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q681Y3 (Putative transferase At1g60990, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g60990 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 8.1e-83 Identity = 200/523 (38.24%), Postives = 261/523 (49.90%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q67N36 (Aminomethyltransferase OS=Symbiobacterium thermophilum (strain T / IAM 14863) OX=292459 GN=gcvT PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 8.6e-08 Identity = 46/140 (32.86%), Postives = 75/140 (53.57%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8D1D7 (Aminomethyltransferase OS=Halothermothrix orenii (strain H 168 / OCM 544 / DSM 9562) OX=373903 GN=gcvT PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 55.1 bits (131), Expect = 3.6e-06 Identity = 41/145 (28.28%), Postives = 74/145 (51.03%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1INT8 (Aminomethyltransferase OS=Koribacter versatilis (strain Ellin345) OX=204669 GN=gcvT PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 53.1 bits (126), Expect = 1.4e-05 Identity = 41/134 (30.60%), Postives = 68/134 (50.75%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B0KD95 (Aminomethyltransferase OS=Thermoanaerobacter pseudethanolicus (strain ATCC 33223 / 39E) OX=340099 GN=gcvT PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 50.8 bits (120), Expect = 6.8e-05 Identity = 33/123 (26.83%), Postives = 66/123 (53.66%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BLY7 (putative transferase At1g60990, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491300 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 560.8 bits (1444), Expect = 7.5e-156 Identity = 330/596 (55.37%), Postives = 352/596 (59.06%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DYD6 (LOW QUALITY PROTEIN: putative transferase At1g60990, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025359 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 536.6 bits (1381), Expect = 1.5e-148 Identity = 325/599 (54.26%), Postives = 354/599 (59.10%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CQT8 (Putative transferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold496G00010 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 525.8 bits (1353), Expect = 2.7e-145 Identity = 317/599 (52.92%), Postives = 350/599 (58.43%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KJI9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G417880 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 1.0e-144 Identity = 317/599 (52.92%), Postives = 351/599 (58.60%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JI89 (putative transferase At1g60990, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486027 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 521.2 bits (1341), Expect = 6.6e-144 Identity = 321/600 (53.50%), Postives = 356/600 (59.33%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. TAIR 10
Match: AT1G60990.1 (Glycine cleavage T-protein family ) HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 5.8e-84 Identity = 200/523 (38.24%), Postives = 261/523 (49.90%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. TAIR 10
Match: AT1G60990.2 (Glycine cleavage T-protein family ) HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 5.8e-84 Identity = 200/523 (38.24%), Postives = 261/523 (49.90%), Query Frame = 0
BLAST of Spg006316 vs. TAIR 10
Match: AT1G60990.3 (Glycine cleavage T-protein family ) HSP 1 Score: 309.7 bits (792), Expect = 5.8e-84 Identity = 200/523 (38.24%), Postives = 261/523 (49.90%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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