Spg005783 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTCGCGTTTGACGTATGCATTTGCATTATAGTTCTCCAACACATTAGTAAAGTACTTGCAGTCACAGTTGGCGGTTGGCTACGTATCGAAACGGGGACGGACTGTCCCTCGCACTCGGCTCGATACTTTCCTTCATCGCTTCCTACTCTAAAACCCGCCAAAATCTGCAGAATCAAATTCAGAGAAAATTGCGCTTAGAAATTCAGAACCGGGAAGACAACGGAAGTCCGGCGGCAAAACTCTGACATGAAATGGATCCAATTCAAGCAACAAAAGAGCTATCTTTTCGTGTCGGCTTTTCCGGCCACAGCGGCCATCTCAGGGTCGAGCCTCTTTCAACTGTCGAGCGCGCCAACCCCATTAGATCGCTCCCGGATTTCATACTTGTAAGCTGTTCTTTTTTGTAGTGTAGCCCTCGCAGAAGCTTATAGTTAGTATGTACATGCGTGCAGTTCTGTTTGTAGTTAATGGTTCTTGAGCATTTCCGTGTAAAATTATTTTTAGGGTTTATCAGCATTATACCATTCTTCATTTTTGAGTGTTTGGTGTTTAGAAATTCTGTAATCTCGTGCTTATTGCAAGCCTGGTATCACAATTTCACATAGCAGTTGAGGAAAATCAGGCACTTTGGAGGAGAATTATAGATGCCAAATACACGGAGCCTACCCATTGAATTTTAAACTTGGGAGAAGTATTATGAACCACCAAGGCCTTATTCTTGATTGGATATGCTGCAAGATAGGAAATGATACACATCTTTTTGGTACGACGGCTGGCTTCTGGAGGTTTCCTTGGCTACCCGTTTTCCACCTCTTTTCTTCATATTTCTCCAGAAATCTACCTCTGTGAATAACCTTTGGAAGGCCAACATGGGTTTTTGGGATTTGGGATTGAGAAGAAATCTCAAAGAAGAAGAGAAATTGTGGAATGGGCAGGCGTGTCACTCCTCCTATCAAACGCCCATTTATCTCAATCAGAAGATCTGTGGATCTGGAAATTGGACAAATCAGGGTCCTTTTCCACCAAATCTTTACTCCAACATATGGGTGCAAAAGGTGATGATTTAGACTCCCTCCTCGATGAGTCCATATTAAAAGATCAATACCCAAAAAAGATTAAATTCTTTCTTTGGGAATAAGTCACAGGGCCATCAACACCTTTGACAAAATGCAAAGGCGTGTGCCCTATTTGTGTACATCTCTCCTCATTGTTGCTTTCTTTGCAGGGCAGAGGCGGAATCCCAAAGTCGCATATTTCTGTCTTGTATTTTGTGGCCAAGTTCTGGGAGAATATGCTATCTTCCTTCAAATGGACAATGTCTTTACCTAACGATCAAAAGAGCCTCCTCTTTTACGCTCTTGTGGGTCATCCTTTTAAATAAGAGAAGAAACTTCTTTGGACACATCTCAGTAGAAGCTCTTTTTGGGCTTTATGGAGTGAGAGAAACCAAAGGGTCCTCTATGCAAAGTTCAACCTTATGATATGTTTTTTAAATATATTGTGTATTTAGCATTCTCTTAGTGTAAATTGTCTACATGTTTCCATTCTTATAGTTATTCTACACTTTTGTCCAATTGGAGAAGTTTCTTGTAACTCCTTTGGATGGAGGCTCTTCTCTCCTCATTTGTAATCGTATACATCAATGAAATTGTTTCATATAAAAAATTCTTCTTGCATAAAGGACACCAACCAGGGGACAAGGCATAAGAAGGGAGCTGTTTTTGAATCTTGTAATGGGTATTTAAGAAAAGCAGCTAAGATATCATTCCTTCATATGATTTGAGCTTCCTTTTTAAGCCTTTGGCCCCTATAAATTTGGACAGAAACTCGAATATCGACCTGGGAAAGCACCAGTAAAAAACAAAAAAAAGTAGAATAGTATATTCTGGTTATTGATGCTAGTGGGCCATTGACTAAAAAGTGCAGCAAAATCTCTTCCTTCCACTCCATAGCCACCAATTCGTGGAGAGAGCTGATGCTGGGAATCTGTTATGAACTTTTGGCTTTGTTCAAACAATGCTCACACAACAAAGTTGATCTTATCTGCCATCTTTTGTTTCTGGATAGGTTTATGTTGCCTACTAAGATCTTTATCTTTAGTAGTTTGGGGGGGGGGGGGGGGATTTGGCAGAAAAGAACTAAAAGATGCTAGAGCCTTCAAGACTCCACATTGTGGCATATATATGGTTTGGTGGCTGTATTGCGAATAATTTCACCACCCAAATTCCTCCTCAAATGCAGCCATGAATCTTGAGAGCCGAGGAAACTCAGTACTTCGAAAATTTGAAAGCTCAACTATCTTGCATTTTGTTGGAAGGAACCTAATGAAATACTTACGCAATAGTTTAAATGACTAGACAACAATCTGTAAATTGAATGCCAATGTAAAGTCAGTGAAGAAAGTACCTCCTTTCTTTCTCAATTTTTCTCTGTAGTGGAATTTCTTCATTTCTTAAGAATATTCCCTGTCCCATGTCTGTTTCTTCCCCCTTCTTAAAGAAGGAAACATTTCTTGCTAACCTGAATATAACTTAATTTACTAAGATATTAGTAATTCTTATAGGTTGAAGGTTTGAATTCCTATCTCCACATTTATCATGTTATTTTCTAAAAAAGGGTCATTTCTTCACTGCCACTAAGGCATCAATTATGAATTGTGTTTATTTTTTAACTTTTGGTTCAAATTCAGCCACCTGCATTTCTCAAGGAGACTCCTGAAACGATAAAGGGCTACATAGAAGAGACTTATCTCGAGCCAAGGTTAGACCCTGATGAATTTTCCCCAGAAAAAGTGGGAAGACAGTGGGATTTTGATTGGTTTGAAATGGCAAAAATATCTTTGGATCCATCACAACCAAGATCAGTCGTGGTTCCTACTTGGGTGTTGCCATTTGAACGTCCAAAGAAGGATGGAACAACTGGAGGGACATGGGAACCTGGTTCTGTGCAGGTACGTACTGCTTGATTGTTCAATCTATCTGCCATGCATGAAAAACGTTGGGTTAGCTTTACTGAATTAATTTTCCGTTATAAATTTCACGCATTTATGTTTCAAGAATTGAAACATCGAGTCAATGATCATGGCTATATTTTCTCATGACTGACTTTCCAATTTGACTAATTTCACTGTCAGGTGGATGTTTCTGAGTTAAATGTGGAAACTCAAGAATCTGGTTCACAGCCACGAGTGCCAGGACCAGCAAAAGATTTTGTAAGGGGAAGCATAAATAATCGTCCTTTTCGACCGGGTGGTTTGGATGATTCCCAATCTGTTGATAGAATTCTTCCTGATGCAGCTTCTAATGGAGAGTGGGTACATGAAGTTCTAAATGGTGGTCCTGTTCAATTTGTTCCACCTATTTTAAAGCAAGGATTGGACCTCGGTGATCTCAAGGTTATTTTTCTTATCATCGAGAAACATCGAACCAAATTCTATTACTGGATAATGTGTTGACCGTATTTATATTTATATTTTGCTCTTTTTTTAACTCTCTTATTTGGGTCATAAGGAATATCCTAACTCGTGGAATGTTTATGACGACCAAAGTTCATTCAAGACCTCACCAGTCGAAAACCTGGTTTGTTTTAATACCTTAGTTTCGTTATAAATTGTTGAAATGTGTTTTGTTAATGGAGAATATTTATTGAAAGCCTTAATAAGCTTTGGTAATGGAGTTTTCCTGTTTCTGACTAAGCTATCTGGGTTTCACAGCAGAGCGAATTGTCTGTACAATTTGATGATTTGTTCAAGAAGGCCTGGGAAGAGGAAGCCATAGTGTCTGTGGAAGATGGTGCGTGTTCTGGTATTTGTAAACTGAAACACTATAAATTTAAATTGATGATCTCATCCACAAGAGTGTCTTTTTGACGCTAAAAATGGAATATTGGATTCTACCATATTTGTAAGTCACGAGTCCTTTTATAGAGCCTGGTTCAATATTGTTGGCTCTACTGGTTGTCTTTTGGGTCGCATCAATTTCTTTCTCGATAAATTTGGGTCAAGTTTTTCTTTTTTGCCTTTGAACTCATTCCGAAAATATTAGAATGAATAAAATCAATTTCATTTTATGACATTTTGCAGCTGTGCATTGAAAAGTAACCTTCCTTTTTAGCTTTATCAGGGAGCTAGCTCCTCGTTTTTGTAATTACAGCTTGTATACTTTCATTAACCACTGGAAGTGTCTCTCTTACAATTACTTTCGATAGGATTTTTTTACACATTTCACCATATCAATGAAATGGTTTCTGTTTCCTATATGAAAAAACTGAAAATGAAATAAACCAATATATCCTTGCTAGTAGATTCTTAGGGAGGTTGGTATGGTGGCTTTATAGAATTGTCTTGGAATATACAATTGCTGCAAGCATGAAACACTTGCATTAAGGAAAACTTTATTTAACGAGAGTATATTGTTTTAATGAAAGGACAGTTCCTGTTGTTTGACTCCCTCTTTCATTCTTTTGTTCTCTATTATAATGGTTGATTAGGTCAATCACCAAAAGCAGAATCTATTAAGTCAGAAGTTCAAGTAAATGAGCTTGAAGCCACTAGCTTTGCACCTACACCTGAAATATCTGTGTTGGATGAAATTTTGTCCCTTGAATCTGGAGGATTGTCATTAAGATCCGGTCAAACTACTGACGATGGTGGAGGACAAAAGAAGGAGGTAAGTAACTGTCTCAATCAGCTTTACTTGTGTGCTTTTCATTCCTTTCTCTTTGTCACTGTTTTCTGCGGTGATTGATAAGCAGGCTTGGGTTGTTGTTGGTGGTCATGAAGAGATTTCTTTGCACTTTCGCGAGCTTGTACCTGATATGGCCCTTGATTTTCCTTTCGAATTGGACACTTTTCAAAAGGAGGTAATTATTATTATTATTATTATTATTTCTTGAGAAGAAACAAATATCATTTTTATTGTAAGATATATATAACCTGATGCTATGTATGAAAGCAATTTTGCTTATATTTCATTGATTGAAAAGTAGTAATATTT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MDPIQATKELSFRVGFSGHSGHLRVEPLSTVERANPIRSLPDFILKSTSVNNLWKANMGFWDLGLRRNLKEEEKLWNGQACHSSYQTPIYLNQKICGSGNWTNQGPFPPNLYSNIWVQKGRGGIPKSHISVLYFVAKFWENMLSSFKWTMSLPNDQKSLLFYALPPAFLKETPETIKGYIEETYLEPRLDPDEFSPEKVGRQWDFDWFEMAKISLDPSQPRSVVVPTWVLPFERPKKDGTTGGTWEPGSVQVDVSELNVETQESGSQPRVPGPAKDFVRGSINNRPFRPGGLDDSQSVDRILPDAASNGEWVHEVLNGGPVQFVPPILKQGLDLGDLKQSELSVQFDDLFKKAWEEEAIVSVEDGACSGQSPKAESIKSEVQVNELEATSFAPTPEISVLDEILSLESGGLSLRSGQTTDDGGGQKKEAWVVVGGHEEISLHFRELVPDMALDFPFELDTFQKEYWIKSKGILVDEGKGSRLVIASKCGLHPFEWIVSGVKGTPKNPWKEISAQFPIYSQFIHNMVGDGRDTYFFEDKWIGDAPLCSLFPRLYQLSSLRNHSVATILSSFDNQAAPSLGFHRPLTNRETTNIMSLLLMLEGFKFNQIHAIYHLEKGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAFALATKHCTRAVYTAPIKTISNQKYRDFCGKFDVGLLTGDVSLRPEASCLIMTTEILRSMLYRGADIIRDIEWVIFDEVHYVNDIERGVVWEEVIIMLPRHINIVLLSATVPNTIEFADWIGRTKQKRIHVTGTTKRPVPLEHCIFYSGELYKICESETFLSHGLKAAKDASKKKSLSVVSGSHVGASVANDGTRNRKNESFNRSKQNKHSGSQNLGNFSGTSWGNQKNGDGQNNWGSRRSDASLWLLLINRLSKKSLLPVVIFCFSKNRCDKSADSIYSIDLTSSSEKSEIRVFCDKAFSRLKGSDRSLPQIVRVQGLLRRGIGVHHAGLLPIVKEVVEMLFCRGVIKVLFSTETFAMGVNAPARTVVFDTLRKFDGKEFRQLLPGEYTQMAGRAGRRGLDKIGTVIVMCRDEIPEEKDLKHVIVGSATKLESQFRLTYIMILHLLRVEELKVEDMLKRSFAEFHAQKKLPEKQQLLMRKLAQPTRTVEYRNEALLGKGLWHSFNEANALWWKVNVSLYDPHPFEWISSGRLKESSKNLWTAIPLGFPLLSQFVKCSIGDDSNAYFWEDSWVGEKPLSVMFPRLYLFSDKRLHSVASAFPNSDFSLPSLSFCHPLTDQEATKITCLLSLLADQSFRHGGRDTRFWTLEPSAGFCFGSSELLGLLRLVTWIVPLFLRKFFGIPLSVTKGESFGKLAFLLFCGVFGLRGIVESLEEWRNSRLSFGRRLDLIQSVPSHACAFALRKICEDAIAVIFELPNLEILIWIGNPATYTKILTSAVRGLYRMGSVFSHLAMPLFSEPILDDPIFSLLIVFGLMLEKLLRCDHMENGNNSCIGFSFGGFIPEGCYMLLGYASWGSVSSICASILHQLAAICSVSERSVWKVVLRWDSLLGSKLRHGVHCPRLKSGIKRSSARSPPKEIACWQKFTLSPIPLVQHTQRKVMKLELLSLAANEEQSWRQKSKKKWIEEGDTNSSFFTLEEGGWKKVGLGEDWKERNIALECIKGEPTIEEYYDLYAEAEKHNNQILEAVMQSSAIQQFLTPGRVVVVKSQSAKDHLLAVIVKPLPMVSRQYIVLVLKPDSPPVQSSSSGDVEKKKEDFPQGYFMVPKSKRGLENDYYSPSTRKASGVVNIRLPHAGAAAGVSYEVRGVDAKEFLCVCNKKIKLDPGRLLEEVSNVAYSQTVQQLLDIKSDGKHPPALDPLKDFVNLDAFAQLFTIFTILIFLVLPL Homology
BLAST of Spg005783 vs. NCBI nr
Match: XP_038896037.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1664.8 bits (4310), Expect = 0.0e+00 Identity = 1012/1866 (54.23%), Postives = 1030/1866 (55.20%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. NCBI nr
Match: XP_038896041.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X5 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1664.8 bits (4310), Expect = 0.0e+00 Identity = 1012/1866 (54.23%), Postives = 1030/1866 (55.20%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. NCBI nr
Match: XP_038896038.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1664.0 bits (4308), Expect = 0.0e+00 Identity = 1011/1865 (54.21%), Postives = 1030/1865 (55.23%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. NCBI nr
Match: XP_022997907.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1655.2 bits (4285), Expect = 0.0e+00 Identity = 1002/1861 (53.84%), Postives = 1026/1861 (55.13%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. NCBI nr
Match: XP_022997908.1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1654.4 bits (4283), Expect = 0.0e+00 Identity = 1001/1860 (53.82%), Postives = 1026/1860 (55.16%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JAA5 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SKI2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1102.4 bits (2850), Expect = 0.0e+00 Identity = 734/1873 (39.19%), Postives = 854/1873 (45.60%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O59801 (Putative ATP-dependent RNA helicase C550.03c OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=SPCC550.03c PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 546.6 bits (1407), Expect = 1.1e-153 Identity = 292/509 (57.37%), Postives = 369/509 (72.50%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q15477 (Helicase SKI2W OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SKIV2L PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 544.3 bits (1401), Expect = 5.5e-153 Identity = 293/517 (56.67%), Postives = 367/517 (70.99%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P35207 (Antiviral helicase SKI2 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=SKI2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 507.3 bits (1305), Expect = 7.4e-142 Identity = 283/537 (52.70%), Postives = 371/537 (69.09%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P47047 (ATP-dependent RNA helicase DOB1 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=MTR4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 7.5e-110 Identity = 237/574 (41.29%), Postives = 351/574 (61.15%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K6C8 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492717 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1655.2 bits (4285), Expect = 0.0e+00 Identity = 1002/1861 (53.84%), Postives = 1026/1861 (55.13%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KFA8 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492717 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1654.4 bits (4283), Expect = 0.0e+00 Identity = 1001/1860 (53.82%), Postives = 1026/1860 (55.16%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G9W4 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452275 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1642.9 bits (4253), Expect = 0.0e+00 Identity = 994/1861 (53.41%), Postives = 1022/1861 (54.92%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KCV3 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492717 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1642.1 bits (4251), Expect = 0.0e+00 Identity = 999/1861 (53.68%), Postives = 1023/1861 (54.97%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G9Z1 (DExH-box ATP-dependent RNA helicase DExH11 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111452275 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1642.1 bits (4251), Expect = 0.0e+00 Identity = 993/1860 (53.39%), Postives = 1022/1860 (54.95%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. TAIR 10
Match: AT3G46960.1 (RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1 protein ) HSP 1 Score: 1102.4 bits (2850), Expect = 0.0e+00 Identity = 734/1873 (39.19%), Postives = 854/1873 (45.60%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. TAIR 10
Match: AT1G59760.1 (RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1 protein ) HSP 1 Score: 391.3 bits (1004), Expect = 4.2e-108 Identity = 224/511 (43.84%), Postives = 312/511 (61.06%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. TAIR 10
Match: AT2G06990.1 (RNA helicase, ATP-dependent, SK12/DOB1 protein ) HSP 1 Score: 364.4 bits (934), Expect = 5.5e-100 Identity = 217/503 (43.14%), Postives = 302/503 (60.04%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. TAIR 10
Match: AT1G70070.1 (DEAD/DEAH box helicase, putative ) HSP 1 Score: 248.1 bits (632), Expect = 5.7e-65 Identity = 188/525 (35.81%), Postives = 274/525 (52.19%), Query Frame = 0
BLAST of Spg005783 vs. TAIR 10
Match: AT1G12930.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 2.3e-21 Identity = 72/193 (37.31%), Postives = 89/193 (46.11%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 47.0 bits (110), Expect = 1.9e-04 Identity = 26/53 (49.06%), Postives = 33/53 (62.26%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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