Spg005637 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg005637
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold8: 21367680 .. 21375723 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg005637
SyntenySpg005637
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGATGGGCGTCTCGACGCTGATGAGGCTCCAGGGGCAAAATGGTTATTTTATGCTCTGGTTTCGCTCGTTTAAGCCTCGAATTGCTTCCAAAGCTCCGGTGAGGACCTATAGACATATTATAACCATTTTAAAGCATTTTTCGCAAGAAATTCAACTAAGATAAGCAATTTTGGAGATTCTAAGTGTATAATAAATTGGACTTATCACTCGTGGGTAGAAGTTCGATCTTTTCTCTCCCTCGCGTTTTGGGCGTGATTAGGTTGGTTTAAGGTTTCTTCCGGCGTGTTCAGACTGTTTTGGTAAGCTTTTATCGTTACCCATGGTTTATTAACCTCAAAATCAAATTACCCATTCTTGCTCAGCTTTAAAATTGAGTTTTATGATTGATTTCTTGATTTTCCAACGCTGCGCAGAGCTGTCTTGGACTCGAAACCATCCTTGCCTCGTGACCCATCATCCATTTGGCCTTAAACTCGGACACCCACTGTCTAGGGACTTTAAACAAGTGGTTTCAAACCTCTTTGTTCGATGGACAGCACGTGTTTGAGGTTATTCGCTCGCTGAACGGTGAATTCCAACACCCTATTTCTTCCTTTATTAAGTCTTTTATGTGTTAGAAGTCGGTTCCTTACTCTTAGTAGGTTGTTGCTTGTAGTTTGGCTCTTTTAGGCTTTCCAGTTGAGAATCAAGTGGTTTCGGTAAGAAATTCCTTCTCTAAGCATTCTTTAGTTTTATCATTAGGTTCTTAAGCTTGGTTTTGACTCGTAGTATTTATCCTATTGTTTAGGAGCTTTGTTGATCTTATAGGATCGCTTAGGAGTGCTATAGATAAGTAGTTCTTACCTGTTGAAGTCTGTTTGATTGCATGATGCACACTTTTTGTTTACTCGCTTTATAACGATTCTCTTGCTTCTTGCTTCTTGCTTCTATGCTTAAATACATGTTTTGCTTCTTCCTTTTATTGTTTATGTATATATGAAATCTTCGAGTAGCATGAACTGTTGTTGTGTGGATATTGGTTGTTAAGCATGCTAGATTTGCTGGCATTCATGGGTTAACATGAGTCAAGAGCACGTTCTTATATTTATATGTTTGGTGGGCATAGTACATGAGTCTAGGAGCATGTTGCAGGGCATATGCATTCTAGATAGTTGTGATTAAGAGGTCAGGGACCTGGATGTGAAAGGAAGGCAAGTTGGGTGAATGTCAGTGCACCTCGGGTACAAATGGTCGAGGGGTGGGATGTCACCGGTGGTTTTAAGAGGAGCATCGAGGCCTTGGGTACAAATGGTCAAGGATCGGTGTGATGAGTCTAGAAAGCATCGGTGCACCTTGGGTACAAATGGCCAAGGGACGATGCACAGTTCAAGGCCTTCGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGTCGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTCGCCCTGGGTACAAATGGTCGGGGGACATTGCGACTCGAAGGGTTAGTCTTGGAGAGCCAAATGAGGGCTAAATACGTTTAATGATTAGTTGTGAGTTGCATAGAGAGATGCATGAGGTTTGGCTTAGGAGAGTCATTCACTTTACTTGCTTTGAAGCATGTTGTTGTGTTTATAGCTTTGAGAAGTATGTTGTTTGCGTATGAAAAACATGTTGGTTGCTTGGTTTCTGTTTGATGGCTTCTCAGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCGTGGTTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTCTCCCCCAACTTCCAGATTATGCAGGTTATGAAGGTTGCCTTGACCATGGTGATGCGGAGGAGGTGCTTGAGGAAGGACCATAGCTAGTTCGCGTTGCTTCCTCTTTTATTTTCATGTTGGTTAGGATAGTTTGTTGCTTAATATGGTTGGACGGCTGTTGTCCTGTTAGGTTTAGTTTCTGAATTATTCTTGTTGAATTCTAGATTTAGTTGTGTTTGTTCTAAAGAACTCTATCTCTTCTTTTTGTTAATGATAATTAAGTTTCTAGTTGTGCTTAGTTGAGCCTTTAGTTGTGGATGCTTTATTTAGTTGCCTATTATTATGCGAGACCTGACTCGCTTGTTCTCTGGAGTTCTGTTGTGTTGTAGTATGGTGGTGTTGTTGAAAATGTTATAGAAGTGTTGTTTTGTTCTAGCAGGTGTTTAGAAAATTTTCGTTTACTCCTATATATGCCGTTATGCTGCCAAAATTTTTGGTGCATTCGGTTAGTTCTGTTTTAGAGTTAGTAATGTCGTTAGGATAATTTTAAAATCCTGGGGCGTTACAACGCATTTCGCTTACCTCACTTTTTGTGGCGACTTGCACAACTGCAGGTGGTCCTCTCGTCCCGAATTGCTGAGAGTTCTCAGCCATAATTGAAATTAGTTGTCTAGCCTCAACAGGTGTCTTGTTGACTAACGCTCCTCCACTAGCTGCATCCACCATACTTCGATCCATAGGAAGTAGCCCTTCGTTAAAATACTGGATCAACAACTGATCCGAGATTTGGTGATGTGGAAAACTGGCACACAGACGCTTGAATCTCTACCAACATTCGTGGAATGTCTCCCCAATGATCTGCGAAATTCCATAATGCCCTAAGGTTCAGCGCTTCCTCTGTCATTCCATGGGGTTTCATACCAGAACATACTATGTGAAATTCTTGCAAATGTTTTTGCGGGCCCTCTCCTGCACTACCACGAAAAATAGGAAGTAAGTGTATCAAACCTGACTTTAATTCAAAAGTACCTGTCGTCTCGGGGTAGGTAATACAGAGTGGCTGCTGGTTCAGATCTCGCGCTACCATCTACCTTAATGTTCTCCCAGCCATGGCTGGTGCTTCAACCTCACCAAGATTATTAACTCTTCTCCTTCTTGCTTGTCTTTTAAATCTCGTCTCCGCTCTAGAAATTTCAGGTTCAAATCTAAGATCGTGAAGAGTGTGATAATTATTCTAAACTGATTTTATTAGTCCGACTGGCTTCTGGGTTACTCGAAGGACCCCCCTACACTAACCTGTGCTAGTGAAGAGTGTGATAGAGGTTGATGGTGTGTCTACCATTAGAGCCGATATTGCAATGTTAGCTAACGCTCTTAAAAACATAAATGTGGTAAGCAATGTTCAGCAGCCGCCGTGGTGGAGCCTACTGCAGTTGTAAACCAAGTGGCAGCGGAGTCATGTGTCTATTGTGGTGAAGAGCATAATTATGAGTTTTGCCCCAACAATCCAGCTTCTGTGTTTTTTTGTAGGTAATCAAAGGATTAACCCCTATTCGAATTTTTATAATCCAGGTTTGCGTAACCACACTAATTTTGCGTGGGGAGGGCAAGGAAGTAATTCGCAAGCCCCCAAGCACATCAAAAAGGTGGTGAATCAGTCCGGATTTGCTAAATAGTAGGTGATGCCCCAACAAAATCAGCAAGCAATGCCCCAGTACAGAATTCTCTGAAGTCGTTGATGAAATAATATATGGCTCATAATGATGCCACATTTCAAAGTATTCAAGCTTCATTGAGAGTACTAGAATTGCAAGTGGGTCAGCTAGCTAATGAGCTGAAGGCACGACCTCAAGGGAAACTTCCTTCGGATACTGAACACCTTAGAAGGGAAGGTAAGAAGCAGGTGCAGGCAGTGACTCTTAGGAGTGGTAAGCCACTAGAAGAGAGAAGAGAGCCTAGTAAACCCTAGTAAGTAGAGAAGAGTAGCGATAAAAATGTTGTTGTTGAGAAAGAGTTGGAGGATGAAGAGGCCTTAGTTAAGTTGCAGCCGCAATACCGCAAGGCAATAGGTTGGACATTAGCTGATATTCAGGGAATTAGTTCGTCTTTTTGTATGCATAAAATAACTCTAGAGGAGGGATCCTTTAGGAGTATTGAGCAATAGAGAAGGCTTAACCCTGGAATGAAAGAAGTTGTTAAGAAGGAGGTGATTAAATGGTTGGATGATGGGATTATTTATCCAATTGCGGATAGCAACTGGGTAAGCCCAGTCCAATGTGTTCCTAAGAAAGGAGGTGTGACGGTCGTAACTAATAAGGATAATGAGTTGATCCCCACTAGGACAGTAACTGGCTGGAGGGTTTATATGGATTATAGGGTTTGTATTGACTAGATGTTGGATAGGTTAGCTGGTCAAGCTTACTACTGTTTCCTAGATGGTTATTCTGGGTGTAACTAGATTACCATTGCTCCTGAGGACCAGGAAAAAAGAACTTTCACCTGCCCTTATGGGACATTTACTTTCAGGCGAATGCCTTTCGGTCTGTGCAATGCTCCAGCAACATTTCAGTGGTATATGTTAGCTATTTTTTCTGATATGATTGAGTCCACTGTTGAGGTATTTATGGACGATTTTTTAGTTTTGGGAGGGTCTTTTCATGAATGTTTGAATAATTTAGGTAAGGTACTAAAAAGGTGTGAGGATACCCATCAAGTTCTTAATTGGGAGAAATGCCACTTCATGGTGAATGAGGACATAGTGTTAGGTCACAAAATTTCAAAGAGAGGTCTAGAAGTTGATCGAGCAAAAATAGAGGTTATTGAGAGGTTAGAACCACCGAATTCAGTCAAAGGGATCCATAGCTTTTTAGGTCATGCTGGATTTTATAGAAGGTTCATAAAAGATTTTTCTAACATTAGTAAACCTCTTTGTAAATTGGTGTGTGTTGATAGTATTTTTGACTTTGATGCAGATTGTAGGAAGGCGTTTGAGACTTTAAGAGCTGCTTTGATTTCAGCACCCATTCTCTGTGCACCAAACTGGAGTTTGCCGTTCGAGGTGATGTGCGATGCTAGCAATGTGGCAGTAGGTGCAATGCTGGGGCAAAAGATGGGCAAAGTTATCCATCCTATTTATTATGCAAGCAGGGTTTTGAATGAGACACAAATCAATTATACAACTACTGAAAAGGAGTTGTTAGCAATTGTATTTTCCTTTGAGAAATTCTTCCCATATTAAGTGGGATCTAAAGCCACGGTGTTTACGGATCACGCAACAATAAGGTATTTAATGTCAAAG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mRNA sequence

ATGATGGGCGTCTCGACGCTGATGAGGCTCCAGGGGCAAAATGGTTATTTTATGCTCTGGTTTCGCTCGTTTAAGCCTCGAATTGCTTCCAAAGCTCCGGTTGTTGCTTGTAGTTTGGCTCTTTTAGGCTTTCCAGTTGAGAATCAAGTGGTTTCGAAAGCATCGGTGCACCTTGGGTACAAATGGCCAAGGGACGATGCACAGTTCAAGGCCTTCGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGTCGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTCGCCCTGGGTACAAATGGTCGGGGGACATTGCGACTCGAAGGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCGTGGTTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTCTCCCCCAACTTCCAGATTATGCAGGTTATGAAGGTTGCCTTGACCATGGTGATGCGGAGGAGAGCCGATATTGCAATGTTAGCTAACGCTCTTAAAAACATAAATGTGCAGGTGATCGAAGATATCGCTGATGAAGTGGCTGGAGAGGATCAACCAGCCAACCCTGAGGTAGAAAAAGTTCCAGAACCAAGAGGACCGCCAGTTGAAGGGCAAATTAAGAGAATCCGAACGGACACTCCATCTCCCCCTACCACCGAATCTAAGAAGGAGAACACAGAGGCAGAGGTCCATGCAGATAAGGAAACTGAAAAGAAAACTGAGGAAGATGAGGTTGAGGAGAAGAGACGCGAAGATAAGGGCAAAGGAGTTGCGGAAGCGGAGGAAGCAGAGCCTGAGCAACATCGCTTACCTTACGATCGCTTCATCAATAACCTTGCTAGAGTAAAGTACCTTGATATGCTAAAGCACGATTTTCTGTTCGAGAAGGGTTTTGGTGACAACCTTCCTCACTTTTTGAGATCCGACATCACAAACTATGGCTGGAAGCAATTTTGCGCCAAGCCAGAGCCCACAAACTTGTTGGGTTCTATGTCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGATGGGCGTCTCGACGCTGATGAGGCTCCAGGGGCAAAATGGTTATTTTATGCTCTGGTTTCGCTCGTTTAAGCCTCGAATTGCTTCCAAAGCTCCGGTTGTTGCTTGTAGTTTGGCTCTTTTAGGCTTTCCAGTTGAGAATCAAGTGGTTTCGAAAGCATCGGTGCACCTTGGGTACAAATGGCCAAGGGACGATGCACAGTTCAAGGCCTTCGGTACAAATGGTCAAGGGTCGAACGTCGAGCTCCGTAGAGAGCATTGTCGCCCTGGGTACAAATGGTCGGGGGACATTGCGACTCGAAGGGTAGGGGCTGCTTACCAGTACCGTGGTTGTACTGACCCCCTCCCCTCTCTCTCCCCCAACTTCCAGATTATGCAGGTTATGAAGGTTGCCTTGACCATGGTGATGCGGAGGAGAGCCGATATTGCAATGTTAGCTAACGCTCTTAAAAACATAAATGTGCAGGTGATCGAAGATATCGCTGATGAAGTGGCTGGAGAGGATCAACCAGCCAACCCTGAGGTAGAAAAAGTTCCAGAACCAAGAGGACCGCCAGTTGAAGGGCAAATTAAGAGAATCCGAACGGACACTCCATCTCCCCCTACCACCGAATCTAAGAAGGAGAACACAGAGGCAGAGGTCCATGCAGATAAGGAAACTGAAAAGAAAACTGAGGAAGATGAGGTTGAGGAGAAGAGACGCGAAGATAAGGGCAAAGGAGTTGCGGAAGCGGAGGAAGCAGAGCCTGAGCAACATCGCTTACCTTACGATCGCTTCATCAATAACCTTGCTAGAGTAAAGTACCTTGATATGCTAAAGCACGATTTTCTGTTCGAGAAGGGTTTTGGTGACAACCTTCCTCACTTTTTGAGATCCGACATCACAAACTATGGCTGGAAGCAATTTTGCGCCAAGCCAGAGCCCACAAACTTGTTGGGTTCTATGTCCTAA

Protein sequence

MMGVSTLMRLQGQNGYFMLWFRSFKPRIASKAPVVACSLALLGFPVENQVVSKASVHLGYKWPRDDAQFKAFGTNGQGSNVELRREHCRPGYKWSGDIATRRVGAAYQYRGCTDPLPSLSPNFQIMQVMKVALTMVMRRRADIAMLANALKNINVQVIEDIADEVAGEDQPANPEVEKVPEPRGPPVEGQIKRIRTDTPSPPTTESKKENTEAEVHADKETEKKTEEDEVEEKRREDKGKGVAEAEEAEPEQHRLPYDRFINNLARVKYLDMLKHDFLFEKGFGDNLPHFLRSDITNYGWKQFCAKPEPTNLLGSMS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 216..236
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 166..251
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 207..251

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg005637.1Spg005637.1mRNA