Spg005432 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg005432
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold6: 35749339 .. 35755637 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg005432
SyntenySpg005432
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGGGAGCTGGGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTGTTCCCTTAAGTGGTTACTCTGAGTCTTGAACAAAGGACCCTACCCTCTCAATGACACAAGAGGGTTTTCTGTTTGATGGTTGGACCACAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGAATTGGTACTTAAGGAAATAGACGTAACCCAGGAGTAAAACAGTAATTTGACCCAGCTGGTGTTACAGACACTCGTGAAGGACTAACTAGTCGATATTGGTCTAGATTCGTGGACACAAAAAATATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGCGAGTCTATAGTGGAATGTACACACAGTTAACGAATATTTATTAATGTGGTTAATGAGTTTGACCAATTAATCTCACATCGTTGGAGCTTCTGATCTGCAGGTCCATTAGGTCCCACTGGTAGCTCATAAAGTAATTTGAAGCAACTAAGTAATAAATGTAAATTGAAAATGTTCAATTTACTAAGGGAAACAAATATAATATATATTGATATATTATTATGAGAGAAGTTAATATTTGAAGAAAATCAAATATAAATTTATGGAAGTTTGAAATAGTTCAAATAACGAATTAATTAATTTAAGGCCTAAAATCTATTTGGGCGAATTAATTAATTCAAGGCCGGAAATTAAAAATGTGATATTTAATTGGTGGTTAATTAATTAAAGAATTCATTAACTGGGAATTAATCAATTATGGAAATAATTAATCACTTAAGGAAGTGATTAATCATTTATGGAAATGATCTAATCACTTATGGAAGTAATTAGTCATTTGTGGAAAAGATTAATCAATTATGGAATTGATTGATCATGATTGATTAAATAAGAAATAAGATTGAATCAATTTTGGAAAAGATTGATTTAATTGAATATTTTATTCATGACCCCTCTTCTATAAATAGAACACTAGACCTAATTGGTCCAAAATAGAACACTAGACCTAATTTTGGAAAAGATTGATTTAATTGAATATTTTATTCGTTGTTGTTTCTTCCCAGAATTTGCTTCGAGACGCAACAACGTCGGGACGCTACCTCAGCAGTGTCTCGACGTTGTCTCGATACCGCAGGCGCTAGGTAAGGAAAGCACACAGCGTCTGGATGCTGTGTTGATATCGTCTCGACACTGTCACATCGTTGGAGCTTTTGATCTGCAGGTCCATTAGGTCCTACTGCTAGCTCATAAAGTAATTTGAGGCAACTAAGTAATAAATGTAAATTGAAAGTTTTCAATTTACTAAGGGAAAGAATATAATATATATTGATATATTATTATGAGAGAAATAAATATTTGAAGAATTTTCAAATATTAATGTGAATTTGATTCATATTCAATTTATAGGAATTTGAAAAAGTTCAAATATGAATTAATTAATTTAAGGCCTAAAATTAATTTGGGCAATTAATTAATTCAAGGCCGAAAATTAAATATGATGTTTAATTGGTGATTAATTAATTAAAGAGTTAATTAATTGAAAATTAATCAATTATGGAAATAATTAATCACTTATGGAAGTGATTAATCATTTCTGGAAATGATCTAATTACTTATGGAAGTAATTAGTAATAATTTGTGGAAAATATTAATAAATTATGGAATTTATTGATCATGAATTGATTAAATATGAAATAGATTCAATCATTTATGGAAAGAATTGATTTAATGTTAATATTTTATTCATGGTCTTTCTCCTATAAATTGAACACTAGACCTAATGGTTTAGAAGGCCTCTTGCTCTTAGACTCACAAGACCAGACCCTAATACTCTCTCTAGCCTCCCTCTTAGAGAAAGACTCCCACCAGTCCATTACCTCCTAGACTTAGAGACATACCGATGTAACCCCTTTGGTGATTGTGTTCTTGAGAATAAATTTCCAGCGAAGAAAAACAAGGTGGCTGCTACGTTTTTTTTTTTGTTGAAGCATCGTTGGCAAAGAACAGTCAAGTCTACAACGAAGGTTGGTAACAATTACCCTTTTCTTTAGAAAAGCATGAAAGTAAAAGTAGTTTTATTTTTCTTTCTTTTTTTTCATCATGTTTATAGAGATTTTACAGCAGCTTTAAAGCATGATTAAAGTTTCGTTTTGCTTATTTGTATTGGTATTTTGATATTAATTAATATACGACACAAGGTCCTATCGATGCGCTTCCGCTGCGCCGGGGCTTTCATTCCCTTCACAATCAGCGTCAACAGGTTTAGACGATGATAAAGCCGACTAAAACTCGTGACTCTATGCTATAATTATAAATAAATATGAGAGGAATCAATAAGAAAATATACAACCATGACTTCGAGACGAAAAAGACAGAGGAAACCAAGAGAAAAATAAAAAATTACAACTCTCCACCACACCCTAACGGCGGAATAAAATGAGGGTTTATATAGAACTTTAATCATGGCGTCGAGACGATGGGCATGACGTCTCGACGCCATGCCCTCTAGGCCTAGGGTCCGGAAACCTTTGACTCAGGTCTTGAACCTTTGACTCCTTGGAACAATTCTTTGGGCTCGTCATGATCATCACGGTCTTCTCAGCTCCTCAAGATCCATGGCACTCAAATTAGCTCCAAAACTCTCTAAATCGCCCGAATTAGCTCCAATTTGTGTAGTTCGTCGCTGTTGCCCTAAAGACACAAATAATCTACAAAATAGACAAATAAAGCATAAAGTGCGCTCTAAAGGGTTTAGATTAACAACAAATAAATAGGGCTAATTTGGTCCTATCAGTAGTATATGTTTTGCATTTATAAAACCGTTGGCTACGAAATGATATTGAAACGGTTTAACTAAACAAACTTCTTTTTTGTGTTGAGTATCTAATTTAAATAAAAATATTTGTGTTCATATTTATGGGGTGTTAGTCTGAACATAATATTTCAATATTGTTTCTATTACTATTCCACAAGAATAATTAAATAATTCATTAATATATATGGCTCAATAAACATAAAAATGAAAGTTTATAAACATGTTAATTACATTATAATCGTCTCAACTCTGACACAATAGTAAAAGTGGATGAACTAAACATATAACATACAACAGTTTTGAATATCACAAACATTTCAATAAAAAAAACGAAATTACTAAACATGTGTAAAATAATATTAAGTTTATTTGTAGATCTCAAGGAAATTTCGAGACAAGGAGAGCGTTAACGGGTCTACCTGTGTAGTTTCGAAGAGAATTGAATTAACTTTGTAACAATTTTAAGAAATATAGAAAGTTGAAAGGTATTGTTATCTATTACAAGAAAAATAGTATAGTCTATATATAGAAGAAATGTTTTTTATAGAATGTCAAACAATTTAAACATTACGAACTACTATATTTAGCAGTATTTAGTTTTAGAAATTTATCATCAAATTGATTATATTACGAGAAAAGGTTTTATAAAAAGACAAAGCCAAATGGTGTGAATAAGGAATATCCTTGAGCAATAAAAAGTCAGGCTACCCATAAAAAAAAAGTATGTCAAACTAGCAAAGCAAAAAGCTTCATATTACATATTTTCAAAAAGATGGTTCATAAAGAAGCATCAATTTCATGCAAATGTCTCCTTCAGTTTTTCAGTTTTCTTTTGATTTTCTTGCTAGTTATTACACCAACAGGTAACAACAAAAAAACACATAAATTCTATTGGATTATTACCGTGATTGACACAAATAATAATACATTCTTATGTATGAATTCCTCATTAACATTTTATTTATTTATTTTTTATTTTATATTGTTTATTTTGTTTACAAATTCAAGTAACCCAACTTATGCTTTATTTTTAGGTTCTTTGGCTACACGAAGTTTTGTACAAGAGACAAGTAGAAGAAGACTGGAGAATTTGGTCTATGAAAATCGTGGTGTGGCCCCGCCAAACTACGATGACATGGTTGTTATGGATTATTCTCCACCGAGAACTAGCCCTGATGTCCATAACTAGCACGAAGAATGGTAAAAAAGACCACAATCCAACTACTAAATATATATATAATACGAATAACTATTGTATAATATTTTTTATGTGATATGAAATTGTATGTTTCTATATTGTTTGAATATATACAATTGTCATTATTGAAAGATAAATTCGGGAAATTTTACAAAATTTGAAGTACTTCGATATAATCAGTATTGTTGTCTATATGCGTATCTATACATCGAGACAATAATTAAAAAACGTAATATACATTGCCGTTTAAGTATGTTGTATCTCCCAATATTGAAAGACGGATGAGTCCAATTAGGTGGTTGTGATAATAAAAAAAAAAAAAAAGAAGAAGAAGAAGAAAATGAATACATCAATAGATATCATAATTTACGTTTTGTTTAAAGGAAAAAAAAATATTTAAAGGCAGGACAAATTAAAAACGAAAAATGATAGTCAATCTCCTAAACAATCAATAAAAAAAAAATGGAAATCAAACATAAGATGAAAGAAACAAAACTATCAACAACAATGACATTAGTTACTTTATTTTACCATGCATTGGTCTTATATGGTATAAATAATACTTGCTACTGTGAATGCGTGAAAAATAGTCTAATAAAAATAATTTGTAATAAAAGCTTGTAAAAAAATGATGGTGATGTAATAACGAGTTGTAAAGTCTTTAAAATTTATTAACAAATGATTTAACTGTGTAAGTCATTATGATTGTATAACATAACTCATTGAAAACTACATGCATATTAGATATAAAATTTTAATTTCTAAAAGCCCTATTTAAAAGCATGTAAATAAAGTAAGGAAGATGTAACAGTCATTGCAATAACAGGTTGCACCGTCATAAACCATCATTTACATGTTCTTTGACTTTGTAAATCACTGTGATTATTAAAGACCTATTTTTTCCCATGAAAACTTTGTTTTTTTTTTTTTTTATTTTGTGTAAAATGAACATTGTACAAGTACAAAACTTTTTCATTTCTTAAAATCATGAGCTGACCAATCTCATCCTGTTATGAACTAAACGCTCCAAATAGGCTCTACATAAAGTCCATTGGATGGATTCTAAACATTTACTGACTAATGAAAACCTATTGCACATGGCTACGAAATTATGAACTTTATCCAATCCAGGGCAATTTCAAAAGCTATTCACTTTAATTTACTTCCAATATCAATTTTCGTAATGGATACTGTTGAGTGAGAAATTTCGGCCAATCACAAATTGCCACGTCATTAATTTGAATTAATGATAAAATAATTTTGGGGACCAATTACAAATTTACACGTGTCCCTAAATTAAATTAATAGATATTAAAATTTGGCAAATCAAACAATACCACGTGTCTATTATTGATCCATCAGATGACATAAGCCGAGTCCAATCAAGCTATGCCACATGGCAATTGGACCCGAGACTAATGTGACCCGAGATCATTGAAGAAATTGGGCTAAATTACAATAATCCAATTTTATTACAAAATGAGTTGGATTAAAGCCCAAATAGAGTCCAAGCACAAAGGTTGGGCCCAGACCCAAGCCCATATGAGGTCCATCAAACTCTATAAATAGAGGAGGCCACCATTCATTTTGGGGATTCAGATAGAGTCAGAGAAGCCAGAGTCCAGAGCTTTCTCCCAAGGTCCAGAGTCTTCAGAAGTCAGAGAGTCCAGATAATTCAGAAGATCCAAGATTCAGAATTCGGCCATCTCAAGACTCAAAAGATCCAACGACTGGAAGACTCCGAAGAATCAGTTGTTTCTTCATCAAGATACAAGCTGAAGATTCAACCTTCCTCCGTCTGAGATCAAGCTCGCCAGCCATCAGATCAGACTCTACATTTTGAGAGAAAGCATCAGAGGATAAATATTAGAGATTGTAACACATATACATACATAATCAATAAAATCAAGTTCATTTCCACGAATTAAATTTCCTTGTCGAAATCTCGTGTGAACAAATTGGCACGCCCAGTGGGACAGTCTCTACCTCTCATCTCTTTTTCTCGCAAAGAAATCATGACTTCCGAATAAGCTTCTTCAAAGATCGCTGCTTCAAGCAACTCCTATGTGGGGCCAATTACTCGTAGTCGCTCCAAGGAAACCCAACGCGAAGACAACCAAACTCCTGTCATTGCAAACAAGATGCTAAGACGCATGACAGAATATGCTCAACTTGAAATCGCCACTGTAGAAAATCCGATGCTTGGCAAATTCATCTCTTATTTTCAGCAACCAAACGAAACATCCAGTCCTGATGTGATGTCTGTTATGATGACTGATGCTGGAACTAGTGAATAA

mRNA sequence

ATGGGGAGCTGGGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTGTCCATTAGGTCCCACTGAATTTGCTTCGAGACGCAACAACGTCGGGACGCTACCTCAGCAGTGTCTCGACGTTGTCTCGATACCGCAGGCGCTAGGTAAGGAAAGCACACAGCGTCTGGATGCTGTGTTGATATCGTCTCGACACTGTCACATCGTTGGAGCTTTTGATCTGCAGAGTCAGAGAAGCCAGAGTCCAGAGCTTTCTCCCAAGGTCCAGAGTCTTCAGAAGTCAGAGAGTCCAGATAATTCAGAAGATCCAAGATTCAGAATTCGGCCATCTCAAGACTCAAAAGATCCAACGACTGGAAGACTCCGAAGAATCAAATATGCTCAACTTGAAATCGCCACTGTAGAAAATCCGATGCTTGGCAAATTCATCTCTTATTTTCAGCAACCAAACGAAACATCCAGTCCTGATGTGATGTCTGTTATGATGACTGATGCTGGAACTAGTGAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGGAGCTGGGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTGTCCATTAGGTCCCACTGAATTTGCTTCGAGACGCAACAACGTCGGGACGCTACCTCAGCAGTGTCTCGACGTTGTCTCGATACCGCAGGCGCTAGGTAAGGAAAGCACACAGCGTCTGGATGCTGTGTTGATATCGTCTCGACACTGTCACATCGTTGGAGCTTTTGATCTGCAGAGTCAGAGAAGCCAGAGTCCAGAGCTTTCTCCCAAGGTCCAGAGTCTTCAGAAGTCAGAGAGTCCAGATAATTCAGAAGATCCAAGATTCAGAATTCGGCCATCTCAAGACTCAAAAGATCCAACGACTGGAAGACTCCGAAGAATCAAATATGCTCAACTTGAAATCGCCACTGTAGAAAATCCGATGCTTGGCAAATTCATCTCTTATTTTCAGCAACCAAACGAAACATCCAGTCCTGATGTGATGTCTGTTATGATGACTGATGCTGGAACTAGTGAATAA

Protein sequence

MGSWEHNRTRWNSLLPDFREADECPLGPTEFASRRNNVGTLPQQCLDVVSIPQALGKESTQRLDAVLISSRHCHIVGAFDLQSQRSQSPELSPKVQSLQKSESPDNSEDPRFRIRPSQDSKDPTTGRLRRIKYAQLEIATVENPMLGKFISYFQQPNETSSPDVMSVMMTDAGTSE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 82..103
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 82..128
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 104..128

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg005432.1Spg005432.1mRNA