Spg002724 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg002724
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold6: 5078699 .. 5085694 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg002724
SyntenySpg002724
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TCAATATTGGTGCTCCTTCTTCTTGATCTTCATCTTTTTGCCTTCTGCAAGAGACCCTATGAATCTCTTATACTGTGCATCTCTTTAGGATTTGGACCCACTGGAACATTGATCGGTTTATGGTCTTTTTCAGGAGTTTGTCCAGGGAGCCTAGTCTTGTGATTTTGATCGGTTGTTGGAGCTTTGTTTTTAAGATTGTCCATGTGCCGAGGATTCTCACGATGAGCAGTATCAGACATTTAGGGAACCAGTAACTGATTCTCTAAAACCCTTCTTCTGGTGACTTGTTGTGTGGTTTTGGTGATCCCTGTGTGTGTGTGTTTTTTTCCCTTCTTTCTGAGGGAATTGTTAAAATTAATGTTTGAAGTGTTGGAACTGGACTAACTTTCTTGGTCAAGGTGGCTGGGCTAAGAATCTGGAGTGATTCCCTTTTTTTCTTGATTGGTTTTCTTTGGTAGTCGGACTGAGGGAAGCCTTCATTATTTGGAAGTTTTATTCTTTAGTTTTAATAGAAATAATAGTTTCCTTTCATTATCATTTTTGGCATGAAAATTCGTGCATTTGCTCACTTCCTAACTCAATAAGTACACAATTTAGAGGACTGTCGATAATTCAAGCCATGTTAGATGTCTAATGTGTATTTGTAATCTTCTTGTTCTGTTCCATGTGTATTCTCACTACTACAACTTAGGTAACTTTTATATACCATCAGGGAAGTGAGATCTGGGAAAGTGGAGCTTCCCCAGTCACTTTGTGTATTGGCTCGTATTTTATCTTGCACTTGTCCTCAGGGTTTGTATCTCATTCTTTCTCAGTTGTCATTTCTGCATTGGCATGACTTGAGCAACTTCTTTTTTGTTAATTACAAAATCTGTATTACATTAATGGATGCAGGTAATGTCACACATTTAATAGAGTTGCAAAATTAATTTTTTCCTTTTTTTTATTTCTCAAATGTTGCTCATATTCTTGCATTGCTTTGTGTTGGAGATTGAGACACTAATATGAATGATAGATTTGTATATTTTTGTGTACTACCCGGACAATCTAAATCTTCTTGTATTGGCCATGTAGGCACTGTGGCCTATTGATTCTCCATGTTTGTGCAAAAAGTTGGCACTGCGACAGTTAATGGCCCAACATCTCCTCTCTGGTGAGCTTCGTATCTTCATCTCTGCTACTGCTTGGCTGAAGAATTATTGTTACACCATTTAGATTCACCACTAAAAATATTATAAATTATAATAGGGGTTTTGGATCAAGATTTTTAATTATGATGATGCTCATTTTTATAATACTATACCTATTCATACTCAACTATTTATTTTTATTTTTATACGCTTTCAATTGTAGTGAATTTGCATCTAGTTATTTAAAATGCTATGATATCTTTAATGCATTTGCACGGGGAATATGTTCATTCTATCATACTATACCTATGTAGACACCATTAACTATTATTGTTTTAAAGTGTTCTAATTTGCTTAAAGATAAGTCAACTAAAAAACTGGAACACACATTAAATTAATTTTAGTCTTCATAAAACTTATTCTAAATTTTAGTGTTGAATCGGTTTGGTAAAACTGATTATATTCATTAGTTTATCTAAATCAAACTTCTAACTAAATTTCACCCTATATCAATAAAGTTTTGATTGATTTAATTTTTTATAACATTGAACTTCTATTAAATAATTTAGATTAAACAAAATAACTTATAGTTTAAATCATATAAATTATCAATATAAATATATTTCAAATAATTTGTCTACTTGGGTCATAGTGAAATGAAAACACTTTTGTATTATTTTATTCGACATTATAATTTGAATTTCTAAGTTTAAATTGAAAGTGACCAAACACTAATTTTCTTCAGATTAAAAGTTGATTTTTTAAAAAAACCTTATAGTCCCATTTACTTAACAATTAAATATAATTTAATGGTTAAAAAAACTATAATTTAATGGTAAAAATTTAAATGTTTATCTTAGAAATGAAAACAATTTTTTTAAGAATGGAAGAGACAAACTATTTTATGAAGTTTTATTTTGTTAATAATTAACAATCACCTGGCAAGTTATTAATTAAAATAAAAAACAAAAGGAAAAAAAAGAATGGAGATTGGTCAAAGTCTTTGACCGGATCATGGGAGTTTTATTGATTTAATTTTATTTACTCATCTTAATTTACGCTTCTTTACTCTTTAACTCAGTAATTTTGTTTGGATAATATTAGCAGTGATATATTTTAGGGGTGGATGAGTTTTATATAAATAAAGGGGATTATGATTTACTTCTTTAGGGCTGGAGAAGTTTATAATAAGAAGCTAATTAACTTTGTTGAAAGAGGACGCTAGTGCAAATGGCCTGCCTCTTAAGCTCTTAATTTCAATTGTAGTGAATTTGCATCTGGTTATTTAAAATGCTAATTGATTTCCTTTATAAATTTTTCGTGGTCTAGATTTGGACGAGCACCAATGTTATTTGATTATTTCCCTCTATAGATTCAATAATGGTGCTCCCTCTTCTTGGTCTTCATCTTTTTGCCTTCTGCAAGATACCCTATGTATCTTTTATATTGTGCATCTCTTTAGGGTTTGGAATCTCTGGAACATTGATTAGTCTATGGTCTTTCTCAGGAGTTCATCTAGGGAGCCTAGTCTTCTGTTTTTGATGGGTTGTTGGAGCTTTGCTGTTAGGATTGTCCATGTGCTGAGGAATCTCACGATGAGCAGTATCAGAGATTTAAAGAGGTCAGTAACTGATTCTCGAAAACCCTCCTTCTGGTGACTTTTTGTGTGCTTTTGGTGATCGCTGTGTGTGTGTGTGTTTTTCCCTTCTTTCTGAGGGAATTGCTAAAATTAATGTTTGAATTGCTGGAACTGGACTAACTTTCTTGGTCAAGGTGGCTGGGCTAAGAATCCGGAGTGATTCCCTTTTTTTTTCTTTGGTAGTCGGACTGAAAGAAGCCTTCATTTTTTGGAAGTTTTATTCTTTTAATAGAAATAATAGTTTCCTTTCATTATCATTTTTTGGCATGAAAATTCGTGCATTTGCTCACTTCCTAACTCAATAATTACACAATTTAGAGGACTGTCGATAATTCAAGCCAGGTTAGATGTCTAATGTGTATTTGTAATCATCATGTTCTTGCATGTGTATTCTCACTACTATAACTTAGGTAACTTTTATATACCTCAGGGAAGTGAGATCTGGGAAAGGGAGAGGTCTTCTTCCCCGATCACTTCGTGTATTTGCTCGTATTTTATCTTGCACTAGCCCTCATGGTTTGTATCTCATTCTTTCTCAGTTGTCATTTCTGCATTGGCATGGCTCGAGTTTGATCCTTTTTTGGTCCTTTTGTTGAATATGTAGAGTTAAATGACTTGTTGAACTTGTACTTTAAAAACTGTTTTTTGAAACTCAAGACTTTCCAAATCCTCCACTTAAAAACCTCCAAACTTAGTAAACCAAAACTTAAGATGTGAAACCCGTGTCTCGAACAACTCTATGAGCTAAATATATCTTTGAACAACCCTATTCATTACTTTCAAAATCTGTCACTTTTCTTTTTGTTATTTACAAAGTCTGTATTACATTAATGGATGCTGGTGATGTCACACATTTAATAGAGGTGTGAAATTAACTTTTTCCTTTTTTTCTTTCTCAAATGTTTGCTCATATTCTTGCATTGCTTTGTGTTGGAGATTGCGATAGGTTTGTATATTTTTGTGTACTACTCGGGACAAACTAAATCTTCTTGTGTTTTTTGCCACATAGGTATGATGGCCTGTTGATTCTCCATGTTTGTGCAAAAAGTTGGCACTGTGAAGGCTAATGGCCCAACATCTCCTCTCTGGTGAGCTTTTCACATCTTCATGTCTGCTACTGCTTGGATGAAGAATTATTCGGACACCACTTAGATTCACCACTAAAAGTATTATAAATTATAATAGGGGTTTTGGGTCAAGATTTTTTTATTATGATAATGCTCATTTTATCATACTATACCTATTCATACTCAATTATTTATTATTGTTTCTATATGCTTTCAATTGTAGTGAATTTGCATCTTGTTATGTAAAATGATATGATATCTTTAATGAATTTGCACAGGGAATATGTTCATTCTATCATACTATACCTATGTAGACACCGTTAACTATTATTGTTTTAAAGTGCTCTAATTTGTTTAAAGATAAGTCATCTGGAAGATTGGAACACATCAAATTAATTTTAGTCTTCATAAAATTTGTTCTAAATTTTAGGTTTCCCCCTTATCTCTTTGCAAAATCATCTTGATCCTTTTGAAATTGATTAGGTTTTGGTATGAATTTTCTAGAATCTGTCAATGTCAAACAATGGTGTCTAGGTCGAGAGATCGCTTTTAGAAAGAGTTAACTCATCTTAATCTAGTTTTTTCACAAAAACTCTGTTGTTCCTTCCTATTCATAGTTGTCACGACAACATCACAATTCATTTGACCACAACACTTAAGTTTCTTCTTGATCCAAGTGTAGATGAATTATCTTTGGCTGCATCATGGTAAGATCAGGACCAGGGTGAGCTTAATTTGGAATTGAACCAAGTAGCACTTTTGAGTTTTGACTAAAGGGATGCATAAAATGCTAATGATTTAGGGCACTGCTCGGATTTAACATGTTTTTCCATTTATTTATTCGTCTTTATTTACGTGTCTTTACTCTTTAACTCAGTAATTTTTGTTTCTAAAATTTAAAAATGGATGGTTTGAATTCCACCCATTCCAATGGATAGTTCTTCTGCTTTGACTAATTCTTCTGCTTCTGGGACAAGTTCCGTCTTCAGATGCTAAGATGTTTGATCACACCCATCCTTCCAGATCCTTGAAGATGGAGTTCATTGGAACGGCAGGATTGCGTCATTATCCTTCTGCCGCCACTGTTGCAGTGAGTATCATACTTATTTTCTGAATTTTCTCATGGTCTGATCCTCTTCTCGTGATTAGGGTTAGGGTTTATCA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mRNA sequence

TCAATATTGGTGCTCCTTCTTCTTGATCTTCATCTTTTTGCCTTCTGCAAGAGACCCTATGAATCTCTTATACTGTGCATCTCTTTAGGATTTGGACCCACTGGAACATTGATCGGTTTATGGTCTTTTTCAGGAGTAACTTTTATATACCATCAGGGAAGTGAGATCTGGGAAAGTGGAGCTTCCCCAGTCACTTTGTGTATTGGCTCGTATTTTATCTTGCACTTGTCCTCAGGGAGTTCATCTAGGGAGCCTAGTCTTCTGTTTTTGATGGGTTGTTGGAGCTTTGCTGTTAGGATTGTCCATGTGCTGAGGAATCTCACGATGAGCAGTATCAGAGATTTAAAGAGGGAAGTGAGATCTGGGAAAGGGAGAGGTCTTCTTCCCCGATCACTTCGTGTATTTGCTCGTATTTTATCTTGCACTAGCCCTCATGTTCCGTCTTCAGATGCTAAGATGTTTGATCACACCCATCCTTCCAGATCCTTGAAGATGGAGTTCATTGGAACGGCAGGATTGCGTCATTATCCTTCTGCCGCCACTGTTGCAGTGATGTGTCCAGCTTACCCTATAGATTTTGGGTAG

Coding sequence (CDS)

TCAATATTGGTGCTCCTTCTTCTTGATCTTCATCTTTTTGCCTTCTGCAAGAGACCCTATGAATCTCTTATACTGTGCATCTCTTTAGGATTTGGACCCACTGGAACATTGATCGGTTTATGGTCTTTTTCAGGAGTAACTTTTATATACCATCAGGGAAGTGAGATCTGGGAAAGTGGAGCTTCCCCAGTCACTTTGTGTATTGGCTCGTATTTTATCTTGCACTTGTCCTCAGGGAGTTCATCTAGGGAGCCTAGTCTTCTGTTTTTGATGGGTTGTTGGAGCTTTGCTGTTAGGATTGTCCATGTGCTGAGGAATCTCACGATGAGCAGTATCAGAGATTTAAAGAGGGAAGTGAGATCTGGGAAAGGGAGAGGTCTTCTTCCCCGATCACTTCGTGTATTTGCTCGTATTTTATCTTGCACTAGCCCTCATGTTCCGTCTTCAGATGCTAAGATGTTTGATCACACCCATCCTTCCAGATCCTTGAAGATGGAGTTCATTGGAACGGCAGGATTGCGTCATTATCCTTCTGCCGCCACTGTTGCAGTGATGTGTCCAGCTTACCCTATAGATTTTGGGTAG

Protein sequence

SILVLLLLDLHLFAFCKRPYESLILCISLGFGPTGTLIGLWSFSGVTFIYHQGSEIWESGASPVTLCIGSYFILHLSSGSSSREPSLLFLMGCWSFAVRIVHVLRNLTMSSIRDLKREVRSGKGRGLLPRSLRVFARILSCTSPHVPSSDAKMFDHTHPSRSLKMEFIGTAGLRHYPSAATVAVMCPAYPIDFG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg002724.1Spg002724.1mRNA