Spg001843 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAAGAATGATTCGTGGTATAGAAGAGTTGTCCGAACGCATGGGAAGGTTGGAGGCTCAGTACCAACCTCGTGAGAGAGTTCCACCACCACGTATTGACAATGATCGAGAGGATGACTATGAGGATGATGGTTCCGATCAACCAGATGATGACCAAGTTACCTTGGTAGCGGTTCCAAGAGGAAGACAAAGACGTGCTGGTCGTGGCATGGAAAGAGGGCGAGGTCGTGGACGAGGACATCATATTTTCCAACAACGAGTTCCTCAATATGAGGGAGTTGATCGAAATGTGGGTAACATCAAATTGAAGCTTCCAAAGTTCTATGGCAAAACCGATCCGGAGGAATACCTTGAATGGGAGAAGTCAGTGGAGTCCGTATTCAATTGCCATAATTTCAGTGATGAAAAGAAGGTAATATTATGTGTTGCTCAATTTAAACAATATGCTCAAACATGGTGGGATAAGTTGATGTCAAGTAGGAGAAGAAATCTTGAGGCACCGATCGATGATTGGTACGAGTTCAAGGAGGCCATGAGGAAGCGTTTTGTTCCAAAACATTTTCAACGGGACATGGCGCAAAAGCTTCAAGCATTGAAACAAGGAAGTAAGTCCGTGGAGGATTATTACAAGGAGATGGATACGTTGATGGATCGACTTGATATAGATGAAGACATGGAGAATCTCATGGCACGGTTTCTTAATGGGCTAAACACGGAGATTGCGGACAAGGTTGATCTACAACCTTATTTTGACATGGAAGAGATGCTGCATATTGCAATCAAAATTGAGAGGCAACTCCAACGAAAGTCACGACGGTATTCTTCTAAACACTTTTCCAACTCTAGCTCATCATGGAAAAGGGATAGTAAGAGTATTGATTATAAGCCTAGAAATCGAGAGGGGTATGAGAAACCTAAAGAGAAGTTTGAAAAGGGGGAGAGTTCCAAGAAGGGGAAAGAGAAGGTAGATGAATCTAATGTGCGAAATAGGGATTTGAAGTGCTGGAAATGTCAAGGGGTAGGTCATTATAGTAGAGATTGCCCAAATAGGAGAACGATGATCCTTCGAGAGGGAGAGTTTGTGACGGAGGATGAAGAGGAAGATGAGGTCATAGAGGAAGGAAAAGTAGAGTGTGAAAGTGATGAGTTTAGTGAAGAGGATCCTACTTATATGTCCTTAGTCACTAGGAGAGCTTTAAACACCCAAATTAAGGAGGATAGTCTAGACCAACGGGAGAACTTATTTCACACTAGGTGTCTTGTTCAATCTGTACCTTGTAGTGTGGTTATCGATAGTGGTAGTTGTACCAATGTTGTGAGTTCCATTCTGGTCAAGAGACTTAATTTAGAAACCAAACCCCATCCTAAACCATATAGGCTTCAATGGTTGAATGATTGTGGGGAGGTAAGGGTAAGTAGGCAAGCTCTTGTTTCTTTTACCATTGGGAAGTATGCTGATGATGTTTTGTGTGATGTTGTATCCATGCATGCTGGGGATTTATTGTTGGGGAGACCTTGGCAATTTGATCGTCGGGTAGTCTATGATGGGTATGCTAATCGTTACTCTTTTACTCATAATGGGAGAAAAACTACTCTTGTACCTTTGTCTCCAACAGACGTGTATATTGATCAATGTAAACTTGAAAAGAAAAGGCAAGAGGTCGATGCAAAAGCAAAAGGTTCAAAAGAAATGAAAGAAAAAGAATTGAGAGAAAAAAAAGAGTTGAGTGAAAAGCAAGTGACTAGCAATCGGCCTAGAGAGAAAAATGAGAGAAAAGCCAAAATAGTGAGCTTGTATGTTAGATCAAGTGAGGCTAGGAATGTTTTGCTCTCTAACCGGACCATTCTTGTACTTTTGTACAAAGGGTCTTGTTTTCTTACTAACGAGCTTAACCCTTCTTTGCCTAGTGTTTTTGTTACACTTTTGCAGGAGTTTGAAGATTTATTTCCCGAGGAGATGCCAAGTGGTTTGCCACCACTTAGAGGAATTGAGCACAAGATTGACTTCATTCCGGGAGCGACCATTCCAAATCGTCCAGCATATAGGACTAATCCAAAGGAGGCTGAAGAAATACAAAGGCAAGTAAGTGAACTCCTTGATAAAGGGTATGTGCGTGAGAGTTTGAGTCCATGTTCTGTTCCGGTTATTCTTGTGCCTAAGAAAGATGGATCATGGCGGATGTGTGTTGATTGTAGGGCTATAAACAAGATAACTATTAAGTATAGGCATCCAATTCCTAGATTAGATGATATGCTTGATGAGTTGCATGGATGTAGTCTATTTACTAAAATTGATTTGAAATCAGGTTATCATCAAATTCGCATGCATATTGGTGATGAATGGAAAACCGCTTTCAAAACTAAGTATGGCCTTTATGAGTGGTTAGTTATGCCTTTTGGATTGACTAATGCACCTAGTACATTCATGAGGTTAATGAATCATGTCTTGCGTGAATACTTAGGGAAGTTTGTGGTTGTGTATTTTGATGACATACTTGTTTATTCTAAATCCTTAGATGAGCATGTTGAGCATGTGCGTTCTGTTTTGATTACTTTGCGAAAAGAATGCTTGTATGCAAATTTTAAAAAATGTAGCTTTTGTATGGAAAAAGTTAATTTTCTTGGATTTGTCGTTTCATCTAATGGTGTTGAGGTTGACGAGGAGAAGGTAAAGGCAATACGAGATTGGCCTACACCTAAAAGTGTAAGTGAGGTAAGAAGTTTTCATGGTCTTGCAGGATTTTATCGTAGGTTCATAAAGGATTTTAGTACTATTGCTTCACCTTTGAATGAACTTGTTAAAAAAAATGTTTCTTTTGAATGGGGAAAAGACCAAGAACTTGCTTTTAATACTTTGAAAGAAAAATTGAGTTCTGCTCCATTACTGGCATTACCTAATTTTGACTTAACTTTTGAAATTGAATGTGATGCTAGTGGTGTTGGAATAGGGGCTGTTTTAATGCAAAATCAAAGACCTTTAATGTTCTTTAGTGAAAAATTGAATGGTGCTTCTTTGAAGTATCCGACTTATGACAAAGAACTTTATGCTTTGGTTCGTGCATTACAAACTTGGCAACATTATCTTTGGCCTAAAGAGTTTGTTATTCATACTGATCATGAGAGTTTAAAACACTTGAGAGGTCAAGATAAGCTCAATCGTCGCCATGCTAAATGGGTGGAGTTCATCGAGTCATTTCCTTATGTCATTAAGTATAAACAAGGTAAAGAGAATGTTGTTGCTGATGCTTTGTCTCGAAGGTATGCTCTTTTTAACCGATTGAATGCTAAGTTTTTGGGTTTTGAGCATATAAAGTCTTTGTATTATCATGATGTGTTCTTTGCTCCTTTTGTTGAATCTTGTGAAAAAGGACTTGTTGTGGATGATTACATGTTGTTTGATGGATTTTTGTTTAGAAAAGGGAAACTTTGCATACCATTTTGTTCCATTCGTGAGTTACTTGTAAGGGAAGCTCATGGAGGTGGCTTAATGGCTCATTTTGGAGTTTCTAAAACTTATGATATGCTTGCTGAACACTTTTACTGGCCTAAAATGAGACATGATGTTAATAAAGTGTGTGCACGATGCATAACATGTAAACAAGCTAAGTCTAGGCTTCAACCACATGGTTTGTATTCACCTTTGCCCATTCCTAATGGTCCTTGGATTGATATATCAATGGATTTTGTTTTAGGCTTACCTAGAACTAGGAAAGGTAGGGATAGCATCTTTGTTGTGGTTGATAGATTTAGTAAAATGGCTCATTTTATTCCTTGTCACAAAACTGATGATGCAAAGCATATTGCTGATTTATTTTTTAGGGAGGTTGTGAGATTGCATGGTATTCCTAAAAGCATAGTAAGTGATCGTGATGTTAAATTTTTAAGTCACTTTTGGCGTGTTTTGTGGGGTAAATTGGGAACTAAGCTAGTGTATTCAACTACATGTCATCCACAAACGGATGGACAAACTGAGGTTGTTAATCGGACCATGACTACTATGCTTAGAGCTATTATCGACAAGAATCTTAAGACTTGGGAGGATTGTTTGCCATTCATAGAATTTGCATATAATAGGGCTGTACATAGCACTACTAAATGCACTCCTTTTGAAATTGTTTATGGCTTTAATCCTCTAACTCCTATTGATTTATTACCTATGCCCCCTAATGAGTTTGTGAGTTTTGATGCCAATGCAAAGGTTGACTTTGTTCATAAGCTGCACCAAAAAGTGAAAGAGAACATTGAGAAGCATAATTCCAAGGTTGCTTCAAGAATTAATAAGGGACGCAAGCTTTTAGTCTTCAAACCTGGAGATTGGGTTTGGGTGCATTTTCGAAAAGAAAGGTTTCCTACACAAAGAAGATCGAAACTTTTGCCCAGAGGAGATGGTCCTTTCCAAGTTCTTGAGCGCATCAATGACAATGCTTATAAAATTGATTTACCAGGTGAGTATGGTGTTAGTGCAACCTTTAATGTTGCTGACTTGAGTCCTTTTGATGTAGGTGATGGCTATGATTCGAGGACGAATCCTTCTGAAGAGGGAGAAGATGATGTGAACCAAGCTACATCTATTGTCATGCCTCAAGGTCCAATTACAAGGTCGAGAGCCAAGAAGATACAACAAGCATTAATCACCTATATTCAAGCTATGGTGAGCTCGACAAAGGACGTTCAAGGAGATGTTGGACTATTTCCCTACACTATTTCCAAAATTGAGATTCAAGATGGAGACACGTTAAATGCATTTTCACTTGCATTTAATGAACTATAGTTGGCTTTATGGAACTTAAGCTTAAACTACTCCAAGTGAAGCTTCAATTAATATGGGAGGTTACAAACAACTCAAAGCTGACCATTGGAGTTCAATTCTCGGATTTATGGCCCTCCATTATATAATTTTCAGTTTTTAAGTCTTTTTCATAACTTATAGGTTACATTTGAGTAGTGGCTGATTATGGGCTTTAATATTGTGGAGGTTACACTCTTAAATAT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ATGGAAAGAATGATTCGTGGTATAGAAGAGTTGTCCGAACGCATGGGAAGGTTGGAGGCTCAGTACCAACCTCGTGAGAGAGTTCCACCACCACGTATTGACAATGATCGAGAGGATGACTATGAGGATGATGGTTCCGATCAACCAGATGATGACCAAGTTACCTTGGTAGCGGTGGTCCTTTGTGTACGCTTCAATCAACCACTCACCTTCGGAGGATGCAACTCACATTCGAAGCAAGCAAAACAATCAAAGAACTCTCACACGAAATCAGAGAAACTCACTGAAGATCACGAAGAAGAAGAAGTATATTCAATCACTCATGCGCAGAGAAAACATGAGAAGAGCTTGTTGTTTGCAACCGATTTGACTGGATTATCCTTTGATCTGCATGGGAGAGAGTGGCCAAACTTCGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGAAAAGACCGAGTAGATAGTTGGGGACATAGTGATCTTGCAAGATGA ATGGAAAGAATGATTCGTGGTATAGAAGAGTTGTCCGAACGCATGGGAAGGTTGGAGGCTCAGTACCAACCTCGTGAGAGAGTTCCACCACCACGTATTGACAATGATCGAGAGGATGACTATGAGGATGATGGTTCCGATCAACCAGATGATGACCAAGTTACCTTGGTAGCGGTGGTCCTTTGTGTACGCTTCAATCAACCACTCACCTTCGGAGGATGCAACTCACATTCGAAGCAAGCAAAACAATCAAAGAACTCTCACACGAAATCAGAGAAACTCACTGAAGATCACGAAGAAGAAGAAGTATATTCAATCACTCATGCGCAGAGAAAACATGAGAAGAGCTTGTTGTTTGCAACCGATTTGACTGGATTATCCTTTGATCTGCATGGGAGAGAGTGGCCAAACTTCGCCGACTCAATAAGCCTACCATTTTGGGGAAAAGACCGAGTAGATAGTTGGGGACATAGTGATCTTGCAAGATGA MERMIRGIEELSERMGRLEAQYQPRERVPPPRIDNDREDDYEDDGSDQPDDDQVTLVAVVLCVRFNQPLTFGGCNSHSKQAKQSKNSHTKSEKLTEDHEEEEVYSITHAQRKHEKSLLFATDLTGLSFDLHGREWPNFADSISLPFWGKDRVDSWGHSDLAR Homology
BLAST of Spg001843 vs. NCBI nr
Match: XP_022157414.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111024115 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 3.0e-04 Identity = 33/59 (55.93%), Postives = 41/59 (69.49%), Query Frame = 0
BLAST of Spg001843 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWE9 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111024115 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024115 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 56.2 bits (134), Expect = 1.4e-04 Identity = 33/59 (55.93%), Postives = 41/59 (69.49%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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