Spg000728 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg000728
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold8: 36221553 .. 36226356 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg000728
SyntenySpg000728
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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CTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGACGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTGTCGGCGGATTCGAGTTTTCCTTTCTCTTTCCCTTAACTCTTGTAGTTTTTATGGCTTTTCTTTCAAGCAGTGTTTGTGGTTTAAAGACTATGAATTGCTAATTGTTTGTCTTAGGGTTTGATGTAGTTGTTTAAATTGTTGGATTGAATTTTGGGTATGAATGTGTTCTTATTCTATGCATGCAATTTTATGTGTAATGTTTTCAATTACTTGATCACTAATTGAATGATTTAAGTGTTGAATCTAACTCGGGAGAGAGGATTTGGCCTAAGACTTGCTTTGTTCAATTGCATGACTAGAGTAGAAATTCTAAGTTTGTGACGGGATTTAGAATATCTCTAGAAGTATAACAAGGACCGAACCGAATAATGCCTTGCATGTTAAGGAACTTAGATAGGGATATTAAGTTAGTTTATATGCATGAGAATCAATTATACTCGGGAGAGGTAATCGTGATAAAAGTTTCCTTGGCTTGTAGAATAATTGCACGGTCAATTCATTCCTATTAATCAATCCTCAATCTTAATCAATGAAATCAATTCCCTAAGAGTCTTTCCATTTGAGTCTCCACTTTTATTTTTATGCTTTTAGTCTTTACTTTTATCTTTATCATTGAGTTTTGCTCCCTAAATAAAATTGGACAAAAGTATTCACGATACTTAATTTGCTAGAAAACCAATCCAGAGGACGACACTCGTTTTACACGAAAACACTATATTATTACTTGACCCGTACACTTGCGGTTAGCAATTTGCGCATCAAGTTTTTGGCGCCGTTGCCGGGGATTGGTATATTTAGTTAAATTAATATTGTGGAAAAATTGTCCGGTCTTAGTTTAGGGTGTATTTTATTTTTTGTTATTTTTGTTAGTTTTGTTTTTAGGTAGATTGCATTTTTTTTCCTTTGTTGGTTTGTTTTCCATATTTAGATTTTTCCATATTTGTTTGAGTTTTCCATAGATAGAATTTTTCTTTTTAGTTTTTTCCTTTTTAGTATAGTTTTTCCTTATTTGCTAGTTTCCTTATTTGTTTTTGCCATATTTGTTTTTGCATTCCTTATTTTTATTTTGTAGATAGATTGCTTTTCTTTTTCCTTATTTGTTTTCTTTCCATATTTGTTAGTTTCCTATTTTAGTTCTTTCCTTACTTGTTTGATTTTTTTCCCTTATTTGTCTTTCCCTTATTTGCTTTTGTTTTTTTTATTTATTTTTTTTTCTTTCTTTCCTTTTTTGTTTGAGTCTTAGTCCTTTGTTCTTGTTGGGTTATTATTTGATTGGAAGCCTAATTATCATTGATGCTTTAATTGAATGGCTTTTTATTCAACACCATATTCCAATTTTTCATCTTCAAGTTTTACCCCTTTAAAAGAAAATTCTTCCTTAGAAAGCATAATTAAAAATTATATTGAGGAGTCTAGAGCGAGGAGTCTAAAATTTGATGAAATTATAAAAGGACTTCAGACCCCAAAGGAAGTTAGTGAGGTGGGATCCACTTCCATAGGATGTCTAGTGAGTCATGTGGCCGATGATTCATTGGCACCTATCCAGGAGCATAATTCTTTAGATTTTTCTATGGTTGAGCATTTAGGGGTGAGTTGCATGAACAGTGGGGAAGAATTGGAGAGTTGTAGCACCTTTCAAGAACACGTTTGTGAGGAAGAAAAAGAAAATGAGCTTGCAGTGACAGAGGAAGTTCAGGAGGTAGAGTTTGAGGTTGATCAACCTTCGTCTGTTTTATCTTCTTTATCCTTTGTTGAATATGATTGTTCTTTTTTCTATTCTCACGAGTCAGTTTTAGAGTCAGAGTCTATTTATGTTGATCTTTCTCCTTTGATGCTTATTTTAATAAAAAATTCCAAAAATAGATATGTTTCAGGGGCCCATGAGAAGCTAGTAAGCTTGCTAGCGATCGTGTGTTTTATTGATTCAAGGAAGAAGGACCCGAAGAAATACGAGAATTTTTATATGCCTTGACAGATTACACGAGCACGTCGAGCTAAAGACGATAAACAAGCGCTTATGGGAGGCAACCCAAGTTATTTATTTATTTTTTCTTTCTTTGTTTTTATGTTGTTGTTGTTTTTGTTTTGAAGGAGTTCCCGGGCTCTTGACTTTGCTAGCAATCATGAAAGGTCATCATTCCAGGGCAGTATCGTTCACCCCTTCCATTCTTTATTTGTTCTCATGCTTGACTATGCTTTATTGATTTATACATTGAGGACAATGCATGTTTTAAGTTTGGGGGTGGAATATCATGTTTGTGGAGCCCTTGAGCATCTGAGTTCGGGCTATAGTTTTGAGCTTTCTTTGAATTGAGCATATGGTTGTTTTCTGGATGCTATTTTTGCATGACTATGATTTCCTAGGATAGGCTTTCTTGTCAATTTTCAAGTTTTCGATGAGTTGTAAGCATGAGTGCCCAAAAAGGGAGACTTTTTAAACTTTTTCTAGGAGATGTCTTGCATGAGTAGAGTATTTGTCTTGGCTAGATTTGGATTTGAATGCTTAGGAGCGAATTATTAGGTTCATATGCTTGTTGTCACCTCGATAGGTGTAGGGAAGAGCTAAAGAGTTAATTTTTTGCAAATTAGCATGTTTGATCTTGCTTAGGAGGAAAGAAAAGAATATATGCTTATCATGCTCATAAAGAAAAATCATTCTTGTTGTTACTTTTGAAAGAAAAAAAAAAATTATTATGCCATGGCCTGTGCACAGTTTGCAATGAGTAATAAAGATTTAGGCAAAAAGAGCTACCCCTGTTGTGATCAGTTAGGCCAACCAGAGAAAACTCAGGTTAAGGGTCCCTGCAATAGGTGTGTGAAAGCTAGTGCCACATATAAATGCTTGATTAAATTTTCAATTATAAGCACCTAAGTATGGATGAAAACAAACTAATTTGTTCCATTGACTCGTTAGTGAATCCTTAGTGCCAGTGTAGAGGGAAGATGAGTTGAGAGTTTAATAATCCAATCCCGGGCTAGTAGAGTCTGATCTAGTTGAGTTAGATCTCGCTTGTGCAAGTTAATTTTGGAAAACTTTTGATTTGTCTCCCTCATTGGTCTTTATGTGCATGTCTCTTGATTGCTTGACTATTGACTTTTGAGCCTTGAGGATTGAGTCATGTTTGTTGCATCCATTCTTCCACTGTATGCTTGATTTTTAGTTTGCTCGAGGACTAGCAAAAGCTTAAGTTTGGGGGTATTTGATAGCGAGCATAGCTAGCTATTTTTCTCTGATTAATTAAGCTAGTCTTTTACAGTTATTTACCCAAATTTATGCATTTTTATGTTTTATTTGTAGGAAGTATGTGTTTGAAGCTTAATTCAGCAATTGGAGTCAAATGGAGTCTTCAATCTAAAAAAAAAAAAAAAAATCATAGCGTCGCGACACTATGACCAGCGTCGCGACGCTATAGGCAAAATTTCCAAAAATGCGGTATCGCGACAGCGTCGCGACGCTGTCCATAGCGTCTCGACGCTGTCCATAGCGTCTCGACGCTATCGCCAGATTTTCTATAAATTCATCTTTTCATGCTACGGCCAAGGGGACTCCAATTGGTTAGATTTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTTTGTGGGAGCTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGACGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCGGTGTCGGCGGATTCGAGTTTTCCTTTCTCTTTCCCTTAACTCTTGTAGTTTTTATGGCTTTTCTTTCAAGCAGTGTTTGTGGTTTAAAGACTATGAATTGCTAATTGTTTGTCTTAGGGTTTGATGTAGTTGTTTAAATTGTTTGATTGAATTTTGGGTATGAATGTGTTCTTATTCTATGCATGCAATTTTATGTGTAATGTTTTCAATTACTTGATCACTAATTGAATGATTTAAGTGTTGAATCTAACTCGGGAGAGAGGATTTGGCCTAAGACTTGCTTTGTTCAATTGCATGACTAGAGTAGAAATTCTAAGTTTGTGACGGGATTTAGAATATCTCTAGAAGTATAACAAGGACCGAACCGAATAATGCCTTGCATGTTAATGAACTTAGATAGGGATATCAAGTTAGTTTATATGCATGAGAATCAATTATACTCGGGAGAGGTAATCGTGATAAAAGTTTCCTTGGCTTGTAGAATAATTGCACGGTCAATTCATTCCTATTAATCAATCCTCAATCTTAATCAATGAAATCAATTCCCTAAGAGTCTTTCTATTTGAGTCTCCACTTTTATTTTTATGCTTTTAGTCTTTACTTTTATCTTTATCATTGAGTTTTGCTCCCTAAATAAAATTGGACAAAAGTATTCACGATACTTAATTTGCTAGAAAACCAATCCAGAGGACGACACTCGTTTTACACGAAAACACTATATTATTACTTGACCCGTACACTTGCGGTTAGCAATTTGCGCATCATTGTTCTTCCTCTAAAATGAGACTCTTCTCAGTCAATTTCTAATACCAGAATAACTCATATTCCATTAGATATTAACCACCGTTGTTCGGTCAAGGATTTGTTAACAAATTAACTCCTCCCCGTAAGTGTTACCCTCCCACTTTCAGATCTCAGAGGCACGGACCAACAGGCTACCGTTAGGAAAGACAACTGTTGGTAATTAGCCTAAGCGATCCTATCCTATTCAGGAGTTCACGGTGTTCCGAATCCTATGATCAGGCCCTCCGAAGGGATGGTTGCACCAGGGCAACACGCAAGCGGATCATAG

mRNA sequence

CTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGACGTGGAGATCGTGACGGGGACACCCCAAAGGAAGTTAGTGAGGTGGGATCCACTTCCATAGGATGTCTAGTGAGTCATGTGGCCGATGATTCATTGGCACCTATCCAGGAGCATAATTCTTTAGATTTTTCTATGGTTGAGCATTTAGGGGTGAGTTGCATGAACAGTGGGGAAGAATTGGAGAGTTGTAGCACCTTTCAAGAACACGTTTGTGAGGAAGAAAAAGAAAATGAGCTTGCAGTGACAGAGGAAGTTCAGGAGGTAGAGTTTGAGGTTGATCAACCTTCGTCTGTTTTATCTTCTTTATCCTTTGTTGAATATGATTGTTCTTTTTTCTATTCTCACGAGAGTTCCCGGGCTCTTGACTTTGCTAGCAATCATGAAAGGTCATCATTCCAGGGCAGTATCGTTCACCCCTTCCATTCTTTATTTGTTCTCATGCTTGACTATGCTTTATTGATTTATACATTGAGGACAATGCATGTTTTAAGTTTGGGGGTGGAATATCATGTTTGTGGAGCCCTTGAGCATCTGAGTTCGGGCTATAGAGTTCACGGTGTTCCGAATCCTATGATCAGGCCCTCCGAAGGGATGGTTGCACCAGGGCAACACGCAAGCGGATCATAG

Coding sequence (CDS)

CTAAAGGCAAGGCCAAGGAGCGGGAATCAAGCGAGAAGACGTGGAGATCGTGACGGGGACACCCCAAAGGAAGTTAGTGAGGTGGGATCCACTTCCATAGGATGTCTAGTGAGTCATGTGGCCGATGATTCATTGGCACCTATCCAGGAGCATAATTCTTTAGATTTTTCTATGGTTGAGCATTTAGGGGTGAGTTGCATGAACAGTGGGGAAGAATTGGAGAGTTGTAGCACCTTTCAAGAACACGTTTGTGAGGAAGAAAAAGAAAATGAGCTTGCAGTGACAGAGGAAGTTCAGGAGGTAGAGTTTGAGGTTGATCAACCTTCGTCTGTTTTATCTTCTTTATCCTTTGTTGAATATGATTGTTCTTTTTTCTATTCTCACGAGAGTTCCCGGGCTCTTGACTTTGCTAGCAATCATGAAAGGTCATCATTCCAGGGCAGTATCGTTCACCCCTTCCATTCTTTATTTGTTCTCATGCTTGACTATGCTTTATTGATTTATACATTGAGGACAATGCATGTTTTAAGTTTGGGGGTGGAATATCATGTTTGTGGAGCCCTTGAGCATCTGAGTTCGGGCTATAGAGTTCACGGTGTTCCGAATCCTATGATCAGGCCCTCCGAAGGGATGGTTGCACCAGGGCAACACGCAAGCGGATCATAG

Protein sequence

LKARPRSGNQARRRGDRDGDTPKEVSEVGSTSIGCLVSHVADDSLAPIQEHNSLDFSMVEHLGVSCMNSGEELESCSTFQEHVCEEEKENELAVTEEVQEVEFEVDQPSSVLSSLSFVEYDCSFFYSHESSRALDFASNHERSSFQGSIVHPFHSLFVLMLDYALLIYTLRTMHVLSLGVEYHVCGALEHLSSGYRVHGVPNPMIRPSEGMVAPGQHASGS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 9..24
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..29

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg000728.1Spg000728.1mRNA