Sgr024620 (gene) Monk fruit (Qingpiguo) v1

Overview


Name	Sgr024620
Type	gene
Organism	Siraitia grosvenorii (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
Description	Auxin-responsive protein
Location	tig00002486: 1303381 .. 1309261 (-)
RNA-Seq Expression	Sgr024620
Synteny	Sgr024620

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGAAGCGACGGTGATGGTCCAGAAGCGGCCGACGAAAGAATCGGCGATGAAAGCTCCGATGAGCGGCGTCAGGCTGGCGGCGCCGTTGAAGTTGGTGATGGTGTTGGCTCCTTTAGTTAAGGGCATATGAAGCTGCTTCGTCAAGTAGCTAATCATATTGGCATTAAAACCAACCACCGCCAGCTTCTCACAGATCTCATTAGCTTCCATCCAAAACCCACCATATATTAACACTCAAAAACAAGAGAGAGAAAACTCAAAATGCATATAGAGAGAGAAATCCAAAGAGGGTACCAAAAATGAAGGGCATGGTGACCAGACCACCCTTCTTCTTCGTCTTCTTCCTCCCGACCTGGTTATTCTCATCAGTTTCATGATCCGCCATTGTTGCCATCTTGAAGAAGCTCCGAAAATGGCCTCCAAAAGCCTCACCTTTTAAAGGCTTTCAATGGAAAAGAAAACTGTGTTGGTAATTCACAAAACAAGAAACAAAATCCACAAGCATATTTTGCTGCGTATTATGAGGCCCAAAAATATATTGATTAAAAGCATGTAACATGAAGGAATTATGTAATGGATATTGATCATGACACAACATTAATACAAAGATAGGAAAATAAACGTCGAATTATTACATTAATTGCTTCAAAATTGAGATGGGAAAAATATATTTTTCCTTCTACTGCTTCTTTCCTGTGTTCAAGTTTCTGTTTTTGGATTCTTTTCTTTTGGGTTCACAGAGAGAGGAAGTAGAGACTAGAGAGAGAGAGAGAGACAGACAGATTGACATGTAATTTAGAGAGAGGAAATGAATCGGTTGATTTTGGAAGAATTTAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTATTACCAAATCTTTTGTTAGGTGATGGAAATGAATTGGGTTGATCCTTTTTCGAGAATCTTAAGGTTCAATCTTTTCTCCAAGATTTGTTTGTTTTTATCGTTTTGTAAGAATACCAAAAATACAAAACGAAGCATAAAAAGAGTAGTCTTTTTTTATTACACATGTTTATCACCAATTAAAATCAATGATGTTAATTCACATACAAGCTTATAAGCAAAAAGATTAAAGTATGTCTTTTATTTTTTTTCAATGTTTTTTTACATTTATGTCAGTTTTGCGTCGTTTGTTTTCAGTTCGTCACATCTTTACACCTTCAAAAAAAAGAAAAAATGTTTCGATTTATATCTTTATACATATTTTGATGGAGTAATTTCAATGATTGAGAAGGTCAACAACTGATATTAATATAGCAGATAATTGACGTGATGCTAATATGGTAATAATCTTTTTGACATCTATTAGTGGTAAGAATTATTAAAATTAATAAACTAAAATATAGAGGTGAAGTTGAAGCTTTTAAAAATATGGAAATGAATTGATAAACGTGTGTGTATATATATATATATTTTTTTTTAGTTTAACGAGGAGGTGAGGGTGGAGATTCCAACATTTGACTTTTAGAGAGATTACTAAATGTCTTAATCAATTGAGCTATTGCTCAATTTGACAATAAAGGTATAATTGGAGGTAATAAAAATACAAGAATATAGTTATAATAATCTACAATTATTGAATTTTCAATTAATTTGACTTTGTTTGTCAATTATTTTCTAATTTATTGAGGTGGCTCTATATTTAGCTCTCTTTAGCTTATTTGTTAAAATATCTCTACCTTTAAAATGTCAGAGGTTCAAATCCCTATTCTTATATATGTGATATAATAATATTTTTAAAAAATCTATAAACAAAAATATTGTTTACTTTTTCTCTTTTTTTGAGTGCCGTTGGCCTTTGGCAATTGTTAAATAAAAGCTTAGACGTATATTAATTTCACTAATCCAATCAATAATCATAATTAATGGAAAATAATGGAAATTCCAAAATAGAAGAGCCACCTACATAGCTACTTCAACCAAAAAAGGGGGGAAAAAAAGGACAGAAAGTTGATGGATTTTCCAAAATATAATATTCTTTTAAACTATTTTGCATCTTTAGTTATTATAAGCTTGTCTATGGTATACTGCATCACTATAATTGTTCCTTTTTTTTTTCATGATTTTGAAATTTTTCCACAAAACTCAATTATTGCTTGTTGTTTCCTAAGGGCTGTTTCGGTGTATATCATATAAATCATTTATATCGATAAGATTCAATTACAAATTTGGTCTCTAAACTTTTAACGTTGTATCTATTAAGTTCTTATATATTAAAAAAATTTTAACATGTCCTTAAACTTTCAATAGTATGTTTATCAAACCTTGTACTTTAACAAAATTCTAATACGACTTAGAACTTTTAATTTTGTACTTAATAAGTCATTATCGTTAACTCTATCAGTTCAACATTTACATGACATGATAGCTATATTATTTAAGAATTATGTGGTGGGTTTGATTTCGAGCAAGTTCAAGTAATTAGTGGTGCATGTGTTAACAAACGAAGTTAACAAAAAAATCTTGTTAACCACGGAATTGGAATTTTAGGGGCCTATGAGTAGCAATTACTCATTTCCTTTTCACTGTTCAGCTAAGACCGAGTCTTCGGATCCGGTTTTGGGCCATGGAGTAAGGTCTTGAAAATCCAATCCATGTTTGTTTTGAAAGGTTACACAACTCTAAGTCCACCTCAGTCAACTCAAGAAAACTTTCCACTAGAGATTTTTTACTCGTAGTTTATATTTGTGTTATCGAAGTTGAGAATATGAGCCTATTAAATACAAGTTGAATTTGTTTAAAAATAAATAAATAAATACAAGTTGATTTTGTTTAAAAATAAATAAACAAATACAAGTTGATTTGTTTATTTTAGAATACGATTTTATAAACCACGTGCCTTCCAACCAAATGCATGCTACATAAACTAGAGTTTTTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTCTAGAATATAGTACAAAATTTGAATTTTCAATATATAAGGAAGATTATCGATGCCTTAATGAACTATGCTTAGGTTGGCATAGGAGCAAAGTGAAGAAAGAAAGAGGAGGATAAAGTTTTCTCTCTAATTTGTCCTCCTTAAATTTTTAGAATTGAAAGATTATATATATATAAATAAAGTAAAAATGTACACTTTTACTCCCCTTATGAAAATTGTTTGCTCCGCCCTTGGGTTGGCACATAAACAAAAGTTTCTATAACTCATTAATTTTGCACAATTTAAACAAAAGTTGCAAATGTCCAAAATTTTTAGTCTTATTGAGCTTCATAACCTCAAACTTGTTAAAACTAGGTTAAAAAATACATTTGGTCCTTATATTTTTATTGAAGTAACGATTTAACTCCTAAACTTTCATATGTAACGATTTAATATTTGTAGTTTAAATTTTGTAACGAATTTAGTCTTTGTAGTTTAAAATTTGTATCGATTTAGTCCTCAACATGAAAATCTTGTCAGCTTGAAGTATCAATTTTTAATATGTAATAATTTAATACATGTAGTTTAAAAATGCATTTGATTCCTAAGCGATTTATTGGTTTACATAAGTCAGAAAATCTTATTACACATTAGTGGATTTTTTCACAATAGGGACTAAATCGTTAATACATTTCTACCTCTTCGAAGAGGTTGTAAGTTCGAATCTCCACTCTTATATTTATGAGGTACTTTTCTAAAAACAACTATTATTAATTTTGCATTAAACGGTTAAAAACAAAAACATTTAAAAATGCCACAATACCTTCGTTAAACAAAATTTAATAACCTCTAGCTCCCCTTGGTATTCTCAAGTTTTGAAGGCCCACTTTCCCACTAACCAAACATATCTTTAAGCTTCACTTTCTACAACAAAGGTGTCTATATGCCAATTGTCTTGCAAGTGGAAGACAAGGGAAAAAGGAGAAAGAGAAGGGAGGGTGGATTAAGAATAGTATAAATGTGTTGGTCTGTAAAAGCCACAACCTTGAGAATAATAAAACCCTAACCCCTCTTTTTTCTCCCCACTAAAGATGGAGACACCCATTTCACCCTCAATTTTTGTTTACTATTTCTTTTCATCACTTTACTTTGCCCTTTGTCTTTTATGGTTTATCAACATTTAGAGTAGAATCTATGTAGCGATCTAAAAATCTCTCTCTCATCAATCCATGGATTAAATAGAGAAATTAATATTTATATTAAACTATATAGGTTAAATTACAAATTTATTCCCTGAACATGAATTTTCAGAGTTGTATCTAATAAGTTCTTGAACTTTAAAAAGTATTTTATAGGTCTCAAAATTTTTAATTTTGTGTCTAATAGAATCTAAATTTTGTGTTCTTATAGGTGTGTGAAATTTAAAAAATGTCTAATATGCCAAAAACCTATTAAGTACAAAATTGAAAATTCAAGAATCTATTAAACACAAAATTGAAGGTTTGAGAATCTATTAGACATTTGTTAAAGTTCAGGGACCTATTAGACACAATCTTGAAAGTTTATCAACCAAACTTGTAATTTAACCAACTATATATATAAATAGAGGAGAAACACATTTTGATAGTAATATTCCTTAAACCAAGTGTAAATTTGTGACATTTTTTTTTAGAATATCACAAATTAGGGGTGTGGGGATTCGAATCTACAACCTCTTTGAAAAAATAGGAATGTCTTAACCGCTGAGCGGTACTCATGTTAGCAAACATTGATATATCCTTTTATGAAACTATCAAGGCTAGTCTAGTGGTAATTAAGACAAGTGGAAAAAAGTATATATATAAAAAAATCTTAGGAGAATGACTTCAAATTTTATAGTAACAACCTATTTATGATATCAAAATCATACAAATTTTTTTATAATCAAATATTGTAAAATCAGACAATTGTCTCGTAGGATAAGATTAGTTAGGATATGTTTGATTAGGGACTCTTATACATCGTATATCCTCTCATGAGATAGAGAGATACTAAATATCTGAATATTTGTTTTTCTTTTTGAGAATAAATATCTCGACAACTGAGTCATGGGTAAAAATAATTTAATGGCATTTTAAAATTATATACTCGTATTTGAAATATAATATTGTTAAAAAAAGGGAAAATTACAAAAACCACCCCTGAACTATAGGGGTTGTTACAATCACACCCTCGAATTTTCAATTTGATCAATCACCCCCTTAAACTTTGAAATTGTTGCAATCAAACCCTTAAAATATTGAAATTGCACAAACCACCCCTAAACTTTAATGATTGTTACAATTAAACCCTTAAACTATAAAATTGTTACAATTTTACCCAAGTTTTTAATTCCAACACAATTTTTTTTTTAATTCTATAAAATTTAAACTATAATATTAACCTTGAAAAAAATTTGATTTTCATATCAATGTAAAAGCCGACATCTCGATTTAAGAAAACAAAAAATTGATGTAAAAAATTTGGGTTTGATTTTAACTATTTTATAGTTTGAGGGTTAAATTGTAACAATCATTAAAGTTTAGGGGTGGTTTGTGCAATTTCAATATTTTAAGGGTTTGATTGCAACAATTTCAAAGTTTAAGGGGGTGATTGATCAAATTGAAAATTCGAGGATGTGATTGTAACAACCCCCATAGTTCAGGGGTGGTTTTTGTAATTTTCCCTTAAAAAAAATTGAATGCGGAGAATTTCAATGGCAGTACAGATATACAGACCACAGAGAGAGATCCTGAAGGGGACATGAATCGTGTCGAGATTCAGCTCAAAAGGGAAATTCCTGTCGAGAACAATGGAGAGCCATGGTGGGTAACTGCTAACTCTGGTAGCCGCACTACCAGACATCTGGGTCCCATCATCATCACCCCCACCACCTCCTCCTCCTCCAGCCTTCTCTCTCTCAACCACCCACCCCCACCTTCTTCTTCAACACAACCATCTCTGTAA

mRNA sequence

ATGGAAGCGACGGTGATGGTCCAGAAGCGGCCGACGAAAGAATCGGCGATGAAAGCTCCGATGAGCGGCGTCAGGCTGGCGGCGCCGTTGAAGTTGCTAAGACCGAGTCTTCGGATCCGGTTTTGGGCCATGGATACAGATATACAGACCACAGAGAGAGATCCTGAAGGGGACATGAATCGTGTCGAGATTCAGCTCAAAAGGGAAATTCCTGTCGAGAACAATGGAGAGCCATGGTGGGTAACTGCTAACTCTGGTAGCCGCACTACCAGACATCTGGGTCCCATCATCATCACCCCCACCACCTCCTCCTCCTCCAGCCTTCTCTCTCTCAACCACCCACCCCCACCTTCTTCTTCAACACAACCATCTCTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGCGACGGTGATGGTCCAGAAGCGGCCGACGAAAGAATCGGCGATGAAAGCTCCGATGAGCGGCGTCAGGCTGGCGGCGCCGTTGAAGTTGCTAAGACCGAGTCTTCGGATCCGGTTTTGGGCCATGGATACAGATATACAGACCACAGAGAGAGATCCTGAAGGGGACATGAATCGTGTCGAGATTCAGCTCAAAAGGGAAATTCCTGTCGAGAACAATGGAGAGCCATGGTGGGTAACTGCTAACTCTGGTAGCCGCACTACCAGACATCTGGGTCCCATCATCATCACCCCCACCACCTCCTCCTCCTCCAGCCTTCTCTCTCTCAACCACCCACCCCCACCTTCTTCTTCAACACAACCATCTCTGTAA

Protein sequence

MEATVMVQKRPTKESAMKAPMSGVRLAAPLKLLRPSLRIRFWAMDTDIQTTERDPEGDMNRVEIQLKREIPVENNGEPWWVTANSGSRTTRHLGPIIITPTTSSSSSLLSLNHPPPPSSSTQPSL

Homology

[Close]

BLAST of Sgr024620 vs. ExPASy TrEMBL
Match: B3U2A2 (Auxin-responsive protein OS=Cucumis sativus OX=3659 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 7.2e-04
Identity = 24/32 (75.00%), Postives = 27/32 (84.38%), Query Frame = 0


Query: 59 MNRVEIQLKREIPVENNGEPWWVTANSGSRTT 91
          MNRVEIQLKR+I V+NNGEPWWVTA +G   T
Sbjct: 1  MNRVEIQLKRQILVDNNGEPWWVTAITGLMPT 32

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Sgr024620 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Sgr024620 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Sgr024620 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
B3U2A2	7.2e-04	75.00	Auxin-responsive protein OS=Cucumis sativus OX=3659 PE=3 SV=1	[more]

BLAST of Sgr024620 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Monk fruit (Qingpiguo) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 78..115
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 76..125

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Sgr024620.1	Sgr024620.1	mRNA