Sgr023260 (gene) Monk fruit (Qingpiguo) v1

Overview
NameSgr023260
Typegene
OrganismSiraitia grosvenorii (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationtig00000892: 1633331 .. 1639767 (-)
RNA-Seq ExpressionSgr023260
SyntenySgr023260
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGCTCCCAGTTGAAACTTGAGAAAGGCTTGACACTAGACTTGGGTATGGCGAATTGGGCCGGCCCATTTTTCACTGCATACAAAAGTAACTGCCATTTCGAGAACACGATGGAAATGTCGAATTATAATTGGACGTAAACTTAGTCCCCAACTTTAATTAATTTTTCCTAAATTCGTCATATTAACGTTAATATGACCAATTTAGGAAAAATTAATTAAAGTTTTAGTTTTTATATTTTTATTTATTTTTCCTAGTCTTTATACTTGTATGATCATATAAATGTATTGCCCAACTTTAATTATTCAATTAAAACAGCAACTTCAGATATGCTTAAATTTAGCTACAAAATTACCCAAACTCAACTACAAAGTAAAGTAGCAATTTTTTTTTTTAGGAAACCCACTTCAACACCAAAGTGAAAAACCTAATCGAATCATATAGCCAACATGGCCACAAAAATTAGAATCTTTAGAAATATTCTCACATAGACGCAAATTAATGTTGCGCTACAAATCTAAAAAGAAATAAAATAATAAATAATATTAATATTAATAGAGATAATTATTTACTAAACTATCTCTCAGGCTTAAATTAACCCGTTCAATTAAATACAACACAAAAAATGTAACCATTATCAGTAAAATTAAAAAGATATGAGCATTCAATATTTAATTAAAATTACAAAGTTTCATATTTTCCATTTCTAATTTTGACTCTAATATTTCAATTAAATTGTGTTCAACAAGGAGCGGAGATTCGAACCTCCAACTTTTAGACAATTAAGTAATGCCTCGACTTGACCTATGCTGATGTTGGCTTTTATTTAGTCTAAATAATTACAAACACAAATGTTCATAAATTGGTTGAGTTGACTAAATGAAATATAACTTATTAACTTATAAGAACGAGGTAATGAATTAGAATTGGTTGATGTAACCAAAACTAATTTTGAAACTCAAACCATAACCCAAAAAGCTTATTGACCTAACCCAAAATCGTATATCAATTCTTTTCAATTGCCAAATATTTTGAATATCCCTAATTGCAAGCAAATTTTGCTCGACATCAATCATCTCTGTGTATCAATTTTTCTACATGTAAGAAACAAAAAAGTTACAAAAAATGAAGAAGAAAAAAATCCATCAAGACGATGGATAAGCAGACAACAAATGTGGAGGAATACATGAAGAGTTGTTCCAAACCCTAGAATGCAATTTAAGGATGTCTCTTGCCTTCTCCCTCGTCTTCAAACTACAATCCATTTGCAACACCAAACATAGCTTCGCCACCACTCCAACCTCCAACATTTCTTGAACTAACTTCCCCCTCGCCGAAAACCGACATATCGACGACAATATTCTCACCGCTCTGTCGCTCGCCAACGCCGAAACCCTAAGTATTTTCTTCGACACGATCGCCACCCCAGCCCCGTGTTCCGACAGCTTCTCTCGCCCCTCCGCGCACCTGCAAAGCTGATCCAAAGCTATCAGAGCCAGCTCCAAGCACCGCCTTTCAGTCGAGTTCAAAAGCAGCTCCACCAAGACCCCGACGGCGCCTCCTTCCACGGCTTTGATTCGGTTTCTCCCCCATGGGCAAATCTCCACCAGAAGCTTTAATGCGGATTTGGAGGTTTGATGAGAAATCTGATCATGTAGCACGCGCACGATCTCCCCGAAGAGTTCCCGATCGATGCTCATCAGACGGATTGGATCTGCAACTTCTGAGCTGGATTTGAGCAACATTGTTGCGTAGGCTCTGGACTGATAGTTCCCACGTTGGAGGACGCGAGTTAGAGAGTTTATAAAGTCAGCGTCGCCGTTTACAAGATTCTTGAGATGGGTATCGGAGGATTTAAGGTGGAAAAGAATTTCGATGGCCAGTTCGGTTGAATCAACGTCATCCCCGCTCCTTATCACGGCCGCCAGAAAGTCAAGAGCTCCGTCGGCTTCGGCGACGAGGTTGCGGTTTCTTTCGCTCTCCAAGGCAATGGCTTTGAGTCTGAGGAGGGATTTCTGCTGCGCCTCAGGAAATCTCTTGGCCTCTTTGAGAATTTTGACGACGTGGGTTTTGCCGACCGGCGTCTTCGGCGTCGGAATTCTTTCAACTCCATGAGAGGCGTTGAGGGTGCACCAAGCTTGGATCAACCGGCGAAGGGTGTGGTTTGGGGTTAGATCGGCGTCGGAGAGGGGTTGCTTAGTGATGGGACAAGTCTGTTTCTTGCATGAAAACAGCCATTTTTCAATGCTGGCTCGATCGTAAGTGATGCCGGTGGAGATGGTAACTGGATCTCTCATAAGTTGCAGAGAAATTGGGCAGAGAAAATAGGAGGGGACTTCAACGCCGTCTTCCGTTTTCATTTCGTTAAAGTACCCCAAAAAGAGGAGGACGAAACTTAAGTAAAAGAAGGCTAAAATGGAGAGCAGAAGAAATGAAAGGGAGAGTTGGAAGGTTGAATAAAAGATGTTATGTTGAAAGTGTTGGAATGGGTGAATTGAAGGTCGTTGGAATTCGCAGTTGAGAAAAAGGCAGTGGCTTTTAAATGAGGAGAAGTTTGCCATTGCAAGTTGATGATAACTACAAGTCAACAAATGGAAATTCGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATCAAAGTCAAAACACGGAAATTTGAGAACATTGGGGAGAGGACAGCTTGGTAGAAGGAGAAGAGAAGAAAAAAAAGGCAAGGCTATGTAATAAAAGACAAACTACAACCTTTTCCCAACATGTTGGAAAAAACAAAACTAATTAACCATAATCTAAACCAATAAAATTTCACCCAATACCTCTCGCTACCTATATAATCTTTATACTTTAAAAAAATTCTTATAAGCTCCCGAACTTTTATTATGTCTAATAAATTATTATCGTTAACTTTAAAAATTGAACACCTCATGCCACCAAACACTTAGAACATGCCCAAAACCAACTCACCCCAATTATCTTTAAGTAATATGGTCATGGAAACTAAACTAACAAAATTAAGGAAATAAACTTATTAAGCACAAAATTAAAAGTTTAACGACATATTAAAAAATTTTTAATTACAGGATCAAATAGACACAAATTTAAAAGTTCATGAATTTGTTAAATTTTTTAAAAGTATAGAGACTAAATAGTCACAACATGAAAGTAAAGACCAAATTTATAATTTAACATTAATTATAAATTAATCAATTAATTAAAGTAAAACGTCTTCATAGAATAGAAGTTGGTAGATGAGCTCAAGTAGGGCTATCATTGGAGGAAGCGTCTGAGATTGAAGTTGGAAGAAGGGGCCTTTTGACATTGATAATTTAAATATATTTAATTATTTTCTGAATTAATTACATAGTATTTAAAAGTTTATCTGTGTTTTTTATAAATAATATTAGTAATAGGGTTTTAAATTTTAATAAAGTATGTCAAAAACGATGTCTGAAGCTGCATGGCTGGCGCCGACCGCCTCTGATGGGGTTATAATTCACCCACGGATTTCATGGCTGATGCATTAAATTCCATATGTCGACATTTATCTAATCCAAAATATTCCCCAAAAAAAATTGCATTAATTGGGTCAACGAAAATGGCTAGCCAGCGATTTTTATATAAATTAAGATTATTTTAGGGTTTCCATTTGACAAATGGTATCCAAATCAAATGGCTCTTGAATTTCTCATATTATTTAATAATTTCCATATAATTAGGCAATTGGAATTATAGGGGTAGTACCAAAAAATTTCAATGACCCAAAAAATTTCAATGATCTAAACTTCTATCTATTGGTTTAGATTAATTCAAGTAAGGTTACACTTGTATGGATTAATATGACTTGTTGATTTTTTAAAACAAATTATTTTAGTCGTTGAATGAATTATGAAAACAACTTAAAATTTAAATGATTGATTATAAAAATACTTAAAAGTTATTTATTCACGTTTCTCTTTTAATTTATAAAAAAAAATAATGAGCTCAAGTCTATGAATGTTGTTGAACTGAAAAAAAAAAAAAGAAGTAAATATACACTTAAACTTACTTTTAACTAATTAAATAGATCCCTAAATTAAAATCTCATTAGTTTAGTAACTTCTTAAAATAAACCCTCAAAACAATTCAAATCAATCCAATTTATATAATATTACAAAGTATATTTAAGTTGAGCCCATCATTTAACTAACGTCATTTTAAGCTGGGCAATTATTATTTACGTTTGATTGTAGTATCTAAATAATCACTATTAATCCAACCCAATTCACAAATATTCCACTTTTGTCATATGAATCAAAATCACATTCTTCTTGTTCTTTTACTTACATGATTATATCAATATTGGGAATGTAAATAATATTCTACAACGACTAGGAAGAGAGAAATATCGAAATTATATAAGAACATAATATCTCTATTAGTATGAGATTTTTTTAGGTAAAATCAAAATTAAAGTCATGCAGTAAACTACATGGATGGATTTTGTTGTCCTAACTATCAACTCCAAAACAATCATTTAGTATTCAAGACAAAAATAAATAAAATTTATAATCTTTTATTTCTACAATAACAGAGATAAATTATGTAATAAACAATACATATATTAGAAGGGAAAAAAAGGGCAATTAAGTGCCTTGTGGCTTATTCTATAAATATTTTAAAGTAATCAAAAGTATTTTCTACTATTCTAATAATAATGTCAATTCTTAACTAACAATCAACGAGAGTCATACCAGAACAAAGGATAAAAAAAGAAAAAATTAGACGATTTTTTTTATTTTTTATTTTAGAATACACAGTAAACGATTTATTGAAAGTTTAATGAGGTAGAAAGCAGTAGTCTACTGTCTACGTGGAGGGTCCACAGCCATATCTCAACCTTAACAAGCTATTGACTTGGAATTTAAAAATTAAGAAATTAACTGATGTCCCGGTTGTCGGTCCCCAGCTTTCACACTATTATTCATTATTCAAAATTCAAAGTCAGCGACGAGAGATGATACCCAAAAACAACCCAT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mRNA sequence

ATGGGCTCCCAGTTGAAACTTGAGAAAGGCTTGACACTAGACTTGGGTATGGCGAATTGGGCCGGCCCATTTTTCACTGCATACAAAAGTAACTGCCATTTCGAGAACACGATGGAAATCCCCGTGTTCCGACAGCTTCTCTCGCCCCTCCGCGCACCTGCAAAGCTGATCCAAAGCTATCAGAGCCAGCTCCAAGCACCGCCTTTCAGTCGAAGAGTTTATAAAGTCAGCGTCGCCGTTTACAAGATTCTTGAGATGGGTATCGGAGGATTTAAGGTGGAAAAGAATTTCGATGGCCAGTTCGTCAAGAGCTCCGTCGGCTTCGGCGACGAGGTTGCGGTTTCTTTCGCTCTCCAAGGCAATGGCTTTGAGTCTGAGGAGGGATTTCTGCTGCGCCTCAGGAAATCTCTTGGCCTCTTTGAGAATTTTGACGACGTGGGTTTTGCCGACCGGCGTCTTCGGCGTCGGAATTCTTTCAACTCCATGAGAGGCGTTGAGGGTGCACCAAGCTTGGATCAACCGGCGAAGGGTCCATTTTTCAATGCTGGCTCGATCGTAAGTGATGCCGGTGGAGATGGTAACTGGATCTCTCATAAGTTGCAGAGAAATTGGGCAGAGAAAATAGGAGGGGACTTCAACGCCGTCTTCCGTTTTCATTTCGTTAAATCCAGTAAAGTCGGGAGGGGAACTGATGATGCCATGGATGCGACATCAATCTCTCTGGTGAGTCGTGACGGGGACAGTACGTTGCAATTGAAAGCAAGGTGGACATGGGGCGTGATTGATTACATTACAAAGCAAGTGGTGTCTCATCCCTCAAAATACTCAATCCTGCCCACGTTTAAAGGAGGGCCGGCCGGCGGACAAGGACCCAACCACTCCGTCCCCGAACCCGACCCCGACCCCAGACCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGGCTCCCAGTTGAAACTTGAGAAAGGCTTGACACTAGACTTGGGTATGGCGAATTGGGCCGGCCCATTTTTCACTGCATACAAAAGTAACTGCCATTTCGAGAACACGATGGAAATCCCCGTGTTCCGACAGCTTCTCTCGCCCCTCCGCGCACCTGCAAAGCTGATCCAAAGCTATCAGAGCCAGCTCCAAGCACCGCCTTTCAGTCGAAGAGTTTATAAAGTCAGCGTCGCCGTTTACAAGATTCTTGAGATGGGTATCGGAGGATTTAAGGTGGAAAAGAATTTCGATGGCCAGTTCGTCAAGAGCTCCGTCGGCTTCGGCGACGAGGTTGCGGTTTCTTTCGCTCTCCAAGGCAATGGCTTTGAGTCTGAGGAGGGATTTCTGCTGCGCCTCAGGAAATCTCTTGGCCTCTTTGAGAATTTTGACGACGTGGGTTTTGCCGACCGGCGTCTTCGGCGTCGGAATTCTTTCAACTCCATGAGAGGCGTTGAGGGTGCACCAAGCTTGGATCAACCGGCGAAGGGTCCATTTTTCAATGCTGGCTCGATCGTAAGTGATGCCGGTGGAGATGGTAACTGGATCTCTCATAAGTTGCAGAGAAATTGGGCAGAGAAAATAGGAGGGGACTTCAACGCCGTCTTCCGTTTTCATTTCGTTAAATCCAGTAAAGTCGGGAGGGGAACTGATGATGCCATGGATGCGACATCAATCTCTCTGGTGAGTCGTGACGGGGACAGTACGTTGCAATTGAAAGCAAGGTGGACATGGGGCGTGATTGATTACATTACAAAGCAAGTGGTGTCTCATCCCTCAAAATACTCAATCCTGCCCACGTTTAAAGGAGGGCCGGCCGGCGGACAAGGACCCAACCACTCCGTCCCCGAACCCGACCCCGACCCCAGACCCTAA

Protein sequence

MGSQLKLEKGLTLDLGMANWAGPFFTAYKSNCHFENTMEIPVFRQLLSPLRAPAKLIQSYQSQLQAPPFSRRVYKVSVAVYKILEMGIGGFKVEKNFDGQFVKSSVGFGDEVAVSFALQGNGFESEEGFLLRLRKSLGLFENFDDVGFADRRLRRRNSFNSMRGVEGAPSLDQPAKGPFFNAGSIVSDAGGDGNWISHKLQRNWAEKIGGDFNAVFRFHFVKSSKVGRGTDDAMDATSISLVSRDGDSTLQLKARWTWGVIDYITKQVVSHPSKYSILPTFKGGPAGGQGPNHSVPEPDPDPRP
Homology
[Close]
BLAST of Sgr023260 vs. NCBI nr
Match: KAF7804222.1 (E3 ubiquitin-protein ligase PUB23 [Senna tora])

HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 1.5e-04
Identity = 29/68 (42.65%), Postives = 42/68 (61.76%), Query Frame = 0 

Query: 110 DEVAVSFALQGNGFESEEGFLLRLRKSLGLFENFDDVGFADRRLRRRNSFNSMRGVEGAP 169
           +E +V FA+ G+GFE  EG  L  R   G+F+ F  +GF D RL   +  N++R + G P
Sbjct: 166 EEASVGFAVGGDGFEGSEGLELGERGLGGVFDEFGYLGFGDGRLGGGDPLNAVRSIHGTP 225

Query: 170 SLDQPAKG 178
           +L+Q AKG
Sbjct: 226 ALNQAAKG 233

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Sgr023260 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAF7804222.11.5e-0442.65E3 ubiquitin-protein ligase PUB23 [Senna tora][more]
BLAST of Sgr023260 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Sgr023260 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Sgr023260 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Monk fruit (Qingpiguo) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 280..304

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sgr023260.1Sgr023260.1mRNA