Sgr020548 (gene) Monk fruit (Qingpiguo) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTTTATTCTCAATTCATATTGGCTAAGAAAGGGCCGCTTGGGACAATATGGATAGCCGCACATTTGGAGAGGAAGCTGCGGAAAAATCAAGTGGCGGACACTGATATCGGGGTCTCCGTTGGTTAGTTGCTTTCGTTTCACTCTATGTTCTTGGTTCTTTCATTTTTCTTTTTCCTATTTAGACACACCAAAGCTAGAACATACGATAAAGATATGAAAATTTACAAAATCGGCCTACTTTAGTAGTATAGTATTTAGTGATGCAATTTCTCGTTAGTAAAGCCCAAGAATCCTTTTCTTTTGAGGGGTGAATTTAGTAATTTTAGGATGCAGTAGTTTCCCAGCAATACTGGCCTAAAATGTTTGTCGATAAGTAGCTATTTGCATGTTTCTGTGAACTGGTTGTGTTTTGGATCTCAGTACTGGTGTAGGATGATTAGAGTTAAATATTAATATGAATATATGTTCGACGTAGGAAATGGTCAGAGGCTTTACAGATCTATCTCCCCAATTTTTTCAGCCAGTACCTTTTGTTTATATAAAATACTCATAGCACTATTTAGTGGCAGTAACTTATATTTTATATATTGTAGTTCCAAAGATTGCTTTTACAAAGATTTTTTATTTTTCAATTTTTGGTGGTATATTTCTACGTTTGGGGATTGGACTAAGTTTACCTGTAAATAATGATTTAAAATGCATATGATACATTTTTTAAATTCTAGACTGTTTCCCCGTAGGAAATTACTTATTTTTTCAATTTTTTGGAACAGATTCAATTCTTTTCCCCGATGTGCCAATTGCACTGCGATTGTCCAGCCACCTTCTCCTTGGCGTGGTGAGGATATATTCTAGAAAGGTGAATTACCTATTTGATGATTGTAGCGAAGCTCTGCTTAAGATAAAACAAGCATTCCGTTCTACTGCTGTTGATTTACCCCCTGAAGAATCTACTGCTCCATATCATTCTATCACTCTGCCTGAGACTTTTGATCTTGATGATTTTGAGCTTCCAGACAACGAAATTTATCAGGGGTTAGTTTAAAGCTTTCCAGTTATGTTTATAATAAACGAGCAGCAATAGCAACAAAGCCTTATTGTAGCATTTTCCCCTCAGTGAATGACATCTAATTTTTCTGCAGTAATTATGTTGATCATCATGTTAGTTCTCGGGAGCAAATTACCCTTCAAGATACTATGGAGGGTGTAGTTTACACCACTTCTCAATTTGGCTTGGATGGTTAGTATTCTGTGCTGCATGTTTGATGTGATGGTATTTTAGTTAACTTCAATTATTCGCTGATCAAACAAGTTTTAATCTTCTTGGCTATTCAGAGCGTTTTGGTGATGGAGATGCTTCACAAATTGGTTTAGATCTTGACGAGGTAACGTAATATATATTTTGTTTTGAATGTTTTATTGGACTGTGAAGAATGTAGAGCTGTCAGTTTTCTTTTACTAAATGCAGTTTTCTAAAATTTGAGTTTGTAATTTTTTATGATTGAAGTCTTTGGTCTCTAAATTAATGTAGAGATCAAAATAGGATTGAAATTGATTTTATTTTTAGTGACAGAAACACCTTTCATTAAGAATGAAGAATAAAAAAGAAGGATGAGACATCCTTACAAATGCTTAGGAACTTACATAAGAGCACTCCAATTGGTGCCAATATCTAAAAAGGAGTATTACAGAAAGGTTTATAGAGAGCTCAATTTTCAAGCTAGACTATTTACCTTTTCCCAAAAGAGATAATTATCAACAAAACTATCTTAAAAATTTCTTCTATTTCTTTCCAACCAAAGCTCCCAAGAGGACTCTTCCGTGGACTGTGGGTCTGTATGCCTCCTATTGGGTTGGGCACCTATTGCCTTTTATGCCATTAATAGATCAAATTCACTAAGTGAGCAAAAAATTTGAACTATTCAATGCATATGGTCTGTAATGTAATTTTGTATGGTAGCGATGAGACCTAATGAACCTACAAAAAATTAGTTAAGCTCTTCGGTTGATTAATTTACATTTATTATCCCAAGGTTACTCCACTAAAAATTCAGACTAAGTTTTATCCAAATATGTAATTGTTGCATAAAAGTTGACCATTCACGAGTAGTTTGTAACTGTAATTAGCTAAAGGTTTATTTCACTCCTGTTATTGCATCTTGCTTGTTAAGTCCCATTCATCCTCTTGTAAACAAAATTTCTTTTGAAGTACTGCAAAGTTCTGATTTTCTCCAACTCCTACTTTCAACTATAAAAAAGAAAAAGAAAAATCGTCTTTGTTGTATTCTAAATCCATTTCCATTAATAAAGTTGTGAGTGATTATGATATCTGCATTGTCTTTACATATGTCATCATCCATGTGGAAATGAGTTTCAAAATTATTATTTTCATGAAAACTGGAGCCACAATATGAATTCTCCCGCCTTCTGCTGGTTTATTATATTCAGAAATTGGCTGGTAGTTTACGTTGAAAGCACTATGGATACATATATTTTATGTACGTACAAACATATGTACATACATACATATATATTTTGTTGAACAAGAAACAAACTTTTCATTGATAAATGAAAAGAAAGAACAAAGTTCAAGAATTCAAACTCCCAAAGGGAGTGAAAAATAATCAACCAAACCAAAATGGTAAAAGTCCCAAAAAACTACATAGACCAAATATAGCAATGATGAACGAGACATCCAAGAGAGAATCAAATAGCAAAATTAACCTGAAAACAAAACCACAACTGAAAAGCCACTGGAGCTAAAAGCATAAGCAAAACCAACTTTTGAACTACCCCCAAAGGACAAAACGCTAAGACAAAAGCCAAAAAGATTTAAACAAGAGAGAATTCTCCAACCCCCTACAAAGCTTCTGAACACCACGACGAATATTGAGATCAAACCGTTACTTAGACAAGAATATTGAGATCAAACCCCTACTTAGATAGAAGATCTGATGCAAAATTGAAAAAATGAGAAAGATCTTCAATAATATTTAAAAAATCACTTGGAGCTTCTTTGAAAGAGGAATTTTTTTCTGGAGAAGGAATAAGCAGCCCTAATCCACTAAGATCTTCGAAAAGACCATCAATATTCCACTCCAAATCAGAATCGATGCTACTAAGACTAACTATCGGATCCTCACTAAAATCTGAGAATTCTTCTTCTAAAGCATCTTTAATAGCATCATCATTAGTTTAATGAATAATACTGAGAAAATTGGATCTACTTTGAGAAATCATAGATACATATATATGACATAAGGTTAAGTTTATATTTTATGCCAATATCAAGTTGATAATATAGGTTCTTGTTTGACGTTTTTTATAAGCTGCTCTTTTCATGCTCCCATTTTCCTGTTATTTTTATTAGTTTTGACCAATGCATACAATTTTACTATGCTTAAGTAGGTAGTATTAATTATCAAACGTTTAACATAGTTGTGGACATCCAGTTTTGCCCATTTTAATCTCTCTTTTTGGGTGTCCACGACTAAATTATTTTGTAACTATCCTTCAGTTTTGATTTTTAAAATTGGAGCTTCGTCTTGTAATTGTGGCTCCTTTTCAGTTGAATTTGTTTCTTTGTATGACCCTTGCTTTTGTTCTTTATTTATCTTAATTGAAGTTCGTTTCATATGTATTTTTTTTTTAAAAAAACATATGTCTAGCATAGTGTTTTTATTGGTTCTTATTTTTCTTTCCTTTTTCTTTATTCCTGCTTTTCTTGTTTAAATATTTTTCTCCCTCCCTGTTTGTAATATGTCTCCCCCTTTCCCACCTACTGGTGACAAGCAGGAACTCTTTGTAGAGAAGATCACCGTTAAGGGACATGATGAGATTTTAGAGTAAGCATTTCATATCTGTAGGCTATTATAAAGCTTGTCTGCTTTATGTAATCTTGGTTTTCTTTGTGGGTTTGTGTATTGAATGATACCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTGCGTGTGTATATATCACAAAAAAAAAGCATCTTTTATAAAAGAGCAGAATTTCTTATTGACTGAATTTCTCATGGTAAAAGTATTGTTAAGGTTGGAAGCATTTTATATTTAGGTGCTGCTATAGGTTGTAGTTGATTTGGATTTTAAGAAAGGTCAGATCAAATTGAAATGTTTATATGAAGCATGAAGAAATAGGTACCTTGTTACAATCAAGCATGAAGTATCTGGCGGAGTATGAGTTGCTGGGAAAGTTTCCCCATAGCATCTGAGATCCACATCCGGTGGAATTAGTTGTCTTTTAGTTCCATTTTACAACAATTTCATCTATATTTTCTCTGATTACTTTTGGAGTCTTATGATTGAAGCACCTACTTTTTATTTTTATTTCCTCTCTGCTTGTTGATCTCTGTACTCATTATTTGTATTATTCTTTTTTTTTCCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGATTGCAGTACTGATCCTCAGGCACCTTCTCAATCAACAGTCTTGAAAGACAAGGATGAAAATACTGAGGACCTCCTAGAAACATTTGAAACGATGCAGGTATATGTCAGTGGATTCCAGGTTACTATCCCGACTTATTATCATCTGATGGTTGAAGCTTCCTATTTATTCTCCTATGTCCTGTGTAATTGTTTGTTTTCTTATTACATTCTAGTTTATGTGAATGATAGAATCTATTTGTACAAATTGGAACTGTTTAAATCCTAACATCTTAAGAGTTAGCCACAAATTCTAAGTTTATATGTTACACAGGGTCTATCATATACTACAAGACGAGTGGATGAATGCAACTTGTCTAGTGTTCAGGATAGTGATGGTTCTTTGAAAGTGGAAGATCATGGTGTAACAGAACAGGAAGCAGTGGAAATTGGAAAGAATGAATCCAGGAAGTTAGATATTTATGGTGGTACTACCGATGCTTCAGATTGGTCTTCCCATAATGATTTGGATTTTGAGACTGTAAGAAGCATGCACCCTAAAGAGAATGGCCATCTTTCTAGTGACCCAGATATC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Homology
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BLAST of Sgr020548 vs. NCBI nr
Match: XP_022149897.1 (sister chromatid cohesion 1 protein 4 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1738.0 bits (4500), Expect = 0.0e+00 Identity = 935/1154 (81.02%), Postives = 977/1154 (84.66%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. NCBI nr
Match: XP_038890977.1 (sister chromatid cohesion 1 protein 4 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1713.0 bits (4435), Expect = 0.0e+00 Identity = 924/1172 (78.84%), Postives = 983/1172 (83.87%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. NCBI nr
Match: XP_038890976.1 (sister chromatid cohesion 1 protein 4 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1709.9 bits (4427), Expect = 0.0e+00 Identity = 918/1155 (79.48%), Postives = 975/1155 (84.42%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. NCBI nr
Match: XP_008441908.1 (PREDICTED: sister chromatid cohesion 1 protein 4 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1707.2 bits (4420), Expect = 0.0e+00 Identity = 911/1149 (79.29%), Postives = 972/1149 (84.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W1Y0 (Sister chromatid cohesion 1 protein 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SYN4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 610.5 bits (1573), Expect = 4.2e-173 Identity = 476/1141 (41.72%), Postives = 612/1141 (53.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FQ19 (Sister chromatid cohesion 1 protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SYN3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 1.0e-33 Identity = 79/178 (44.38%), Postives = 117/178 (65.73%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O60216 (Double-strand-break repair protein rad21 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=RAD21 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 142.9 bits (359), Expect = 2.5e-32 Identity = 89/226 (39.38%), Postives = 130/226 (57.52%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3SWX9 (Double-strand-break repair protein rad21 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=RAD21 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 141.4 bits (355), Expect = 7.2e-32 Identity = 89/226 (39.38%), Postives = 128/226 (56.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O93310 (Double-strand-break repair protein rad21 homolog OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=rad21 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 141.4 bits (355), Expect = 7.2e-32 Identity = 91/221 (41.18%), Postives = 125/221 (56.56%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D708 (sister chromatid cohesion 1 protein 4 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018199 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1808.1 bits (4682), Expect = 0.0e+00 Identity = 963/1154 (83.45%), Postives = 1005/1154 (87.09%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D988 (sister chromatid cohesion 1 protein 4 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018199 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1738.0 bits (4500), Expect = 0.0e+00 Identity = 935/1154 (81.02%), Postives = 977/1154 (84.66%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U0D2 (Sister chromatid cohesion 1 protein 4 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold115G001900 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1707.2 bits (4420), Expect = 0.0e+00 Identity = 911/1149 (79.29%), Postives = 972/1149 (84.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B551 (sister chromatid cohesion 1 protein 4 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485906 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1707.2 bits (4420), Expect = 0.0e+00 Identity = 911/1149 (79.29%), Postives = 972/1149 (84.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LJH2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G073020 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1685.2 bits (4363), Expect = 0.0e+00 Identity = 906/1150 (78.78%), Postives = 965/1150 (83.91%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. TAIR 10
Match: AT5G16270.1 (sister chromatid cohesion 1 protein 4 ) HSP 1 Score: 610.5 bits (1573), Expect = 3.0e-174 Identity = 476/1141 (41.72%), Postives = 612/1141 (53.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. TAIR 10
Match: AT3G59550.1 (Rad21/Rec8-like family protein ) HSP 1 Score: 147.5 bits (371), Expect = 7.1e-35 Identity = 79/178 (44.38%), Postives = 117/178 (65.73%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. TAIR 10
Match: AT5G40840.1 (Rad21/Rec8-like family protein ) HSP 1 Score: 118.2 bits (295), Expect = 4.6e-26 Identity = 73/173 (42.20%), Postives = 107/173 (61.85%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. TAIR 10
Match: AT5G40840.2 (Rad21/Rec8-like family protein ) HSP 1 Score: 118.2 bits (295), Expect = 4.6e-26 Identity = 73/173 (42.20%), Postives = 107/173 (61.85%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr020548 vs. TAIR 10
Match: AT1G65560.1 (Zinc-binding dehydrogenase family protein ) HSP 1 Score: 113.2 bits (282), Expect = 1.5e-24 Identity = 49/72 (68.06%), Postives = 62/72 (86.11%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Monk fruit (Qingpiguo) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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