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Sgr019024 (gene) Monk fruit (Qingpiguo) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTCGCTTCTCTCTCTCTCTGTCTCAAGCCTCTCCTCACCCCTCAGTATTCTCACACTTGCTTTCACATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTGGTTTCATCTTTCACATTCACGGTTGGAGCTCATTGATGTCGTGTCGGTTCAAGCTCCCTCAAGTACTGTCGTGAAGATGGCACCACCTTCAAGAAAATCACTGGATGCCCCGAAGTTCAATAAGCATTCCAAGAAGTCGTTCAAATCAAAGAGAAAAACGAGTGAAATATCTAGAACAGAAACTATGTCGTTGCAGATTGAAGATGATGTTCCTGACTTCCCCAGAGGAGGTGGGCTCTGTCTCTGACCTTTGTTTGATTTCCTAGAAGTTGCCTTGAGTGAATATGGCCGTTTGTTTTTGCGGCGTTTTGTTGGAAGCTTGATGGGTTGGAATTGGAAAGTTAATATTGGTTAATGCTTCCATGTTCTCTCCAGATGAAAGGGAATTTATGTTATCAACTGCTTTTTATTTTTAAACAATTATTGTTCTGGTTCCAGATAAGAATGGCTTGGAAGATTTGGTTTGCTTACGTTTAACAATGATTTAATTTGGAGGAAGTCAAATGAATTTAAATTACTTGACTTTTTCATATTTGGAACTTAAATTGAACATTTTTTTTTTTATGTTTAGTTACTTTTTTAATGTCTCTCACTGAATTATTTCAATTTGCAGGGGCAGGAGGTTCTTTAGGTCATCTAAAACGTGAAAAAATACATGCCCAAGGAGATAAGAAGTTTCAGACTGACAATCTGAAGAGGACAACAAAAAGGGGAAAGATGAGAAGAAAGCATTCATCAAATGAGGATGATTTGGACTCCCTATTGAACAGTGGTGTAGTGGGAAACCTTCCTAAATATGCAAATAGGATAACTTTGAAGGTATGGCCTGAAACACTATGGTTTGCTATATCAATTGAGGGAGAGATGGTTATTTTTTATACGTCATAGATTACCTTAAGTTATGATATGTGAGCTGACTACTTTCGTTTTATTATTGCTATTATTCTTTTTTTTTTCTTGTGGAAAAAAAACTGGTAAACTGAATATCTTTTTTAACTCTCACTCACTTGAAATTCGCAATTGATACTATTTTCTTTTGTTCCAAGAGGAGAACGTTTTTGTTAACCTCAATAGTATTTTGCAAATCTTCGATTCTATGTCTAGTCTTAGAATTAATAGGTGTAGGTATTCATTTGATCTTGATAAGCATGATAGGTGGCTCATTTGGTGGGTTGTGAGGTGTCCTTGTGGCTTAAGGAATTTTTTACGGACATGATTCTAGATCATTTTTTTTAAAGAATATTGTGGTGGAAAAACTTCAAAAGCACCTTTTGTCATGGAAGAAAGTGTTTGTCTTTACATAGTGGAAGTAAAGCTCATGCAAGTAAAACTTTTTGTTGGGAAATTTTCGATATTTAGTATACTTGTTGAGATTTCAACATGTTGATAGGATATCAATGACAGGGAAGTTTCCTCCTCGATATCTTGCACCTTTCAAGAGTGTGACATGTCAGCTTGTTGCTCAACATTTTATTGCTTGCTTGTAGTCGCCACTTGTCATCTTGGTGCTCACCATGTATGTAGATGTTCAATAAATGCATTATGCATGTCCTTGGCCACGTGCTCGAATGCATTGTCTTTACTCTTTGTGCCCATTGCGTGCATGGCTTATGTGTGCCTGCCATGCTCAATCCTTCTCTGCTTGCTCTTTCTCAATCCACCACTGTGTCGTGACATACTCATTTGTCAACAACACGACTTGGTCCTACGCCCTTTTGTCTATTGTTGTGCGTCTTGCTGAATGTCAATTATGCACCCACCTCCTAATGCCTGTCTCGCTTGGCTATTGTGCACCTATTTACTGCTAGTGCCCACAAGTATCCCAATTATGTTTGTTGATGTGCTACTTGGACACCTACCTACGTTTGCCAAATACAATACTCACCTGCATCGTTGCTTGTTGGGCCTATGCTCTTGGGATGTGCATAGTCAGGAACTAGGGATGTTACACTCTGTTGAATGCCCTAACTATAAAATTGTGAAAATTTTGTGGGAGTGCTGGAGAATGCTCTTTTTTAAGATATTGTAATTAGGAGAATATTGTAAATTGATTCTAAATTTTTTCAATCACAGGATGCTTTGGAGGGATTCTAATTTGTCATATTCATGTTAGGATTATGTTGATATAGACTCGAGTATCTATTAAACAGATTTATATCATGTTGAGCTACGTAAGTACTTCCACAATATTGATGTTGCAATTTGTGCCTTACATGACAACTGACAAGTAGGTAGTTGGTTAGTTAACTTGTTAGTGATTGGCCTGTTAATCGTCTATATTACCTACCTTGGAGCAATTATTCTCTAGATGTATAAAAGGGGTACAAGTACTCAAATTTTATGAAGTTTTGTAATCGGAAAAAAATTAATAGTTGTTCCCACGCTATGTGGTATCGAAGCATGATGATGGCCTACATGTAAAACATTTACAGATGGATGAAGTTCTTTTTCATTCAAATTCATATTGTCTTAGTCAATATTAAGCCATGCATTCTGCCTTACTACCTACACGAGTGGTTGGAAGATTTATGATGGTTCCCCTTCTTGCTGCTGGAATTTGAACTATGGTTGAGTGGAAAAAGAGGAAAAAGGAAGGTTTAATTTTGAAAATGGACTTAGAAAAGGCCTATGATAAAGTTGACTAAAACTACCTTGATGTAGTCATGGACTTAAAAGGCTTTGAGACTAGATGGAGGAACAGTATTTGGGTATGTCTCTCTTCGATTAAATATTAATTATTCTATCTTTGTGAGTTGAAGACATAGAGGCAAGATCTATGCTTCTCAAGGTATTTATTTGTGTAAGGGGACCCCTCTCCCCTTGCTTAGTCACTCTTGTAGCATATTTTCTTAGCCAAATCATTATCAATATCAAAGAGGACGGTATTGTTGAACGGTGACAAGGTTGGTAGCCAGCAAATTCATGTCTCTCATATTCAATATGCTAACGATACTATTATTTTTAGTTCAAATAAAGATGGTATGTTGAGTAATTGGTAGAAGCTCCTCAATGTCTTCCAACAGGCCTCAAGTCTTTCTATATATTCATTTAAATCCCCCTCCATTGACATCAATATTGAAGAGAATGAAGTTAGAAGCAAAGTGACTTATTTTATTTGCAAGTTTGATTCATTGCCCTTTTTCTTCCTGTGGTCTTCCCTTGGGAGGTAATCCTTATTCTAAGTTTATTTTTGGAGCTAGTCTTGGACAAGGTTAGAAATAGAATTGCCAAATGGAAGAACATATCTCTCTTGAAATGTGGTAGATTGACCCTTGTTCAAGTGATTTTCTCCAATATCCTGAACAACTATTTATCTCTTTTTAGAATTTCGGTTACATTTTCCAAGATTTTGAAGAAGATTATCAGAGATTTTATTGAGAGAGGTGCAATTTAATTTTGCGTGACAATAATTTAGAGAGGTGCAAATTATGATCAAGATAGTCCTTTAGTTAGTTTGAAATGGGGTACTCTCCCTCTTTATTTAGGCAGTTTGGGGATTGGAAACTTGAGACACTTTGCTCACAAAGTGACTTTGAGATTCATTCATGAGGAGGAGGCTTTATGGAGAAGAGACATCTTTGAGTAAGTATGGTGCGATCCACTTGGTTGGTTCACAAAAGTAGCAGGCAAATAACCTTGGAGGAAGCGTGTGGCCTAAAATCATGAAGAGTTAAGGATTTTTAATGAGTCAACTAAGTAGGTATCTGAGACAATTTAATTTTGGGAAGATGTGCAGTTGAAGGATAGACCCCACCCCTCACCCCACCATGTTTTTTCTAATATTTATGCTATCAATAACACTAGGATGGGATGTCACATTAAGCAGAAGGTTTTTTGATAGATAGATAGATAGAAGAATGACTTCATTTTTCCTTGAAACTTGATTCTACTAGGCTGGGCTTTGGGAAGGATAAAGTGGTTTGGTGGAACCTTGACATGATTCTTTCTTATTGCAAATCAACTACTTTTAAGCTCAACTCTAAGCATACCAAGCTTAGCTTCTTTTGACATGAATATTTAGTGTGTGTTTGGCATGCCTTTTAAAGTGCTTATGGATGGCTAAAAATGTTTTTTTAATTTCTAGTGTTTGGATAAAATTTATAAAAGTGATCAATTAAAAGCGCTTTTTAAATTTTCAATAATCAAAAGTGGTTTGGAAAATTCTAATAACAGATAAAAAGCACTTAAAATACTTTTAGAGAAATCATATAAGTAATTTTCTTTCAAAAGTGCTTTACTTAGAAACACTTTTTTTCAAAAGGCATGCCAAACACACACTTAATATCTATCACAAAGACCCATGCCAAAATCCTTGAAGCAGATAGGACCTCAATGAATGTTTGGTAGGTTTTAATAAGCCTAAGTTTATGAAACTTGGAAATTTGGGTTTGGCGTGCGCAAAGGAATCAGTTGTAAAAACCTAAATTTTTGTAACTTGTGTTTGGTTTATGGATTTGTAATTTTCAAAAGTTATTATATAGTATTAAAAGTGAGTTTTATGAGCTCGGGTTTATGTAACTTGTGTATGAACCTTTGTAACTTTTCACAATATCAATGAAAAGGTTGTTTCCTTTGCTACTTTCTTTGCTTTCTTATGGAACATTTTGCTTGAGAGGAATGAAAGAGATTTTGAGAGTTAGAGAGTTCTTGTGGAGGTTTTGTCTTTGGCTAGGTTCAATGCTTCTCTTTAGGTTCTGTAAACATGGTTTTTTGTAAGTATCCTCTATCTCTCATCCTGAAAGCCATTTTTTGTAACTTTTTGTTCTTTTATAGTTTGTTTTCTTAATACAAGCTCTTTTTTTTTTTAGGCTTTTTTTATTGCCCTTTTGTATTCTTTGGGATTAGAAAACTTATAGCTTGAGATAAGCAAAACCCACATACCAAACATAGATTTGACTTCT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FASLSLCLKPLLTPQYSHTCFHISLSLSLTWFHLSHSRLELIDVVSVQAPSSTVVKMAPPSRKSLDAPKFNKHSKKSFKSKRKTSEISRTETMSLQIEDDVPDFPRGGAGGSLGHLKREKIHAQGDKKFQTDNLKRTTKRGKMRRKHSSNEDDLDSLLNSGVVGNLPKYANRITLKNISPRMKLWGIVAEVNKKDLVISLPGGLRGLVCAADAFDPILEEEIEDSEHDLLPVMFHVGQLVPCVVLQVDDDKKESGKRKIWLSLRLSILYKDFSLDLLQEGMVLTSYVKSIEDHGYILHFGLTSFTGFLPKTSQSDQPGNEVHVGQLLQCVVRSVDKTRKVVYLSSDQDIVSRCVAKDLKGISIDLLMPGMMVSARVQSTLENGIMLYFLTYFSGTVDMFHLQNSLHSSDWKAYYNHNMKVNARILFIDPSTRAVGLTLIPHLVHNKAAPPHVKIGDIYESAKVVRVDRGSGLLLEVISSPESTPTFVSVSDMAEEDVKKIEKKFKVGSHVRVRILGFRHLEGLAIGTLKASAFEGPVFSYSDVKPGMLIRAKVIVVDDFGAIVQFPGGLKALCPLSHMSEFEIAKPRKKFKVGAELIFRVLGCKSKRITVTHKKALVKSKLEILSSYADATAGFVTHGWITKIEKHGCFVRFYNGVQGFAPRLELGIEPGSDPSSTYHIGQVIKCRITSSVPSSKRISLSFVMKPARVSEDEKVELGCIVSGVVDEITQNHVTLHINRTSYSRGRISTEHLSDHQAHATLMKSVLKPGYEFDKLLVLDIEGESLILSGKQSLINLAHQLPSDPSQIKQYSVIHAMEDKKSDLPEAFYFGQSVRSNVVDVSGETGRITLSLKQSTCFSTDASFIQEYFFTEEKIAKLQSLDESNWAEEFAIGSVVEGKVQEVKDIGVIISFEKHQDVFGFIALHGLSGSIVETGSTIQAAVLDVSKTERLVDLSLKPELVDKCKGKILAGQLIGSHAISHSLVVDHISLSWIDIMTYVHCLVLSLPECGYTIGYASTFDYNTQRLPQKQFAIGQSVVASVAALPCPSTFGRLLLLLKSISEATATPTSKRSKKNSTCEVGSLVPAEITDIQPLEMRLKFGVGLRGRVHVTEVSNEHDETSETPFSNFRVGQTVDARIVAEANHSANKKKGYLWELSIKPKVLKX Homology
BLAST of Sgr019024 vs. NCBI nr
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BLAST of Sgr019024 vs. NCBI nr
Match: XP_022925023.1 (rRNA biogenesis protein RRP5 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1838.2 bits (4760), Expect = 0.0e+00 Identity = 952/1142 (83.36%), Postives = 1013/1142 (88.70%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. NCBI nr
Match: KAG6595619.1 (rRNA biogenesis protein RRP5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1834.3 bits (4750), Expect = 0.0e+00 Identity = 949/1142 (83.10%), Postives = 1014/1142 (88.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. NCBI nr
Match: XP_022156043.1 (rRNA biogenesis protein RRP5 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1833.2 bits (4747), Expect = 0.0e+00 Identity = 959/1139 (84.20%), Postives = 1021/1139 (89.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. NCBI nr
Match: XP_023517465.1 (rRNA biogenesis protein RRP5 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023517466.1 rRNA biogenesis protein RRP5 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1831.6 bits (4743), Expect = 0.0e+00 Identity = 949/1142 (83.10%), Postives = 1011/1142 (88.53%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4J8K6 (rRNA biogenesis protein RRP5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RRP5 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1230.3 bits (3182), Expect = 0.0e+00 Identity = 651/1133 (57.46%), Postives = 836/1133 (73.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7MB10 (Protein RRP5 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=PDCD11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 357.5 bits (916), Expect = 5.9e-97 Identity = 317/1151 (27.54%), Postives = 533/1151 (46.31%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q14690 (Protein RRP5 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PDCD11 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 354.4 bits (908), Expect = 5.0e-96 Identity = 310/1125 (27.56%), Postives = 524/1125 (46.58%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NS46 (Protein RRP5 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pdcd11 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 351.7 bits (901), Expect = 3.2e-95 Identity = 324/1168 (27.74%), Postives = 527/1168 (45.12%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O74835 (rRNA biogenesis protein rrp5 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=rrp5 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 211.8 bits (538), Expect = 4.0e-53 Identity = 208/781 (26.63%), Postives = 362/781 (46.35%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DS33 (rRNA biogenesis protein RRP5 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023013 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1838.9 bits (4762), Expect = 0.0e+00 Identity = 959/1135 (84.49%), Postives = 1021/1135 (89.96%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EE30 (rRNA biogenesis protein RRP5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432393 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1838.2 bits (4760), Expect = 0.0e+00 Identity = 952/1142 (83.36%), Postives = 1013/1142 (88.70%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DPI8 (rRNA biogenesis protein RRP5 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023013 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1833.2 bits (4747), Expect = 0.0e+00 Identity = 959/1139 (84.20%), Postives = 1021/1139 (89.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HM63 (rRNA biogenesis protein RRP5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465903 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1818.9 bits (4710), Expect = 0.0e+00 Identity = 944/1145 (82.45%), Postives = 1007/1145 (87.95%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L3Z5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G553660 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1791.2 bits (4638), Expect = 0.0e+00 Identity = 934/1135 (82.29%), Postives = 1000/1135 (88.11%), Query Frame = 0
BLAST of Sgr019024 vs. TAIR 10
Match: AT3G11964.1 (RNA binding;RNA binding ) HSP 1 Score: 1185.2 bits (3065), Expect = 0.0e+00 Identity = 636/1133 (56.13%), Postives = 814/1133 (71.84%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Monk fruit (Qingpiguo) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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