Sgr018702 (gene) Monk fruit (Qingpiguo) v1

Overview


Name	Sgr018702
Type	gene
Organism	Siraitia grosvenorii (Monk fruit (Qingpiguo) v1)
Description	protein RDM16 isoform X1
Location	tig00153207: 650569 .. 729981 (+)
RNA-Seq Expression	Sgr018702
Synteny	Sgr018702

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGCGGGAGGAACGTTCAGGTTTAGAGCCTGTGGAACCCTGGAAATGGATAGGGTTTCTGAGAAGGATAAATCGAGCAAGCGTTCCCGAGATGAACGCAGCGACCATAAGGATCGAGACCACAAGCATCGCAGTCGAGACGCCGAGGAAAGGCATTTCTCCAAGGATGAGAAGTCCCGCGAATCTGATTACCACCATCGCCGACGCCACCACCGATCGGACCGTGATTCGAAGCGTGAGCGTTCGCATGAGCCGCGTGATCACAAACATAGGCGTGATAGGTCTCCCGATGAGCGCGAAAGCTCTCAAGACCGCGATTTGCAGAGGGAAAGGTCGCATGATCTTAGGGATGAGAGAGAAAGGAGTAGAGATAGAGATTCGTCTAAACGAGAGCGGTCATATGAGCCGAGAGGGGAGAGAGAGGACAGCAGAGAGCGGGGCATGCTGCGCGAGTTGAGGCGCGAGCAATCAGATGATGAGTATGAACGGGAAGGATCATTTGAGCCAGCCCAGAATTCCGTACGTTCAAACAAGAGGAAGGAGAGGGGAGGAAGTGAGGATAGGTTTGATGGTGGTGAGAAGAGGGCTAGGGCTTCGGAAGATGGGAAGGATCTTAGATGGATTGAGGACGGGAAGGAAGTGAATGGAGCTGAGATGGGTGAGAGAGAGGAGCGGAGGAGATTTGCTGACGGTGAGAAAGATGAGGAAGCAAACTTGAGTGGTAGGGGAAGGAGGGAGAGGAAACGGTTTGAGGATCGGGTAAAGGAAGAGGATAATGGTGGAAATGTTGATGAGAAGAATGCAAACGTGAATGAATACAAGTCCAAGGGAGACGTGGGGGATGGGAAAGTTCAGATTGGAGGCACCACCGATGAAAAAAGTTCACTGGGGAATGGATCTATGGTGGAACCCATTGATATGTCATCAGCAAGTGTGCCCCAGAATTTGTTACACCCTAGTCATTCCCTTCCTATCAAGGTATCTTCAATTTCTACCACAAATGAAAATAAGGGAGTTAGTATTACCAGATCTCATGAGGTTCATGGAAAATCTAGTACAGATGGGACATCGTCAACTGCTGGGAAAAGTGGGAATCTCTCTCTTGATGCTTTAGCAAAAGCTAAGAAAGCTTTACAGATGCAGAAAGAACTGGCCGAGAAGTTGAAGAAAATTCCTCTGATGAAGAAGGATGGGGGGTCAAGTTCTGCAAGTAGCTCAGTTTTGAAATCGGAGGAGAGGGCTAAACCAGCAGTTGGTGTATTGGGGCCATCACCATCTACAAATAGTGCCGCAACTCTTTCTGCTGGGGTAGCATCAAGTTCATCGACCTTACCTGCTGCTGCCAATGCAGTTGGTGGTGGTATTAATGTTCCGGCTGGCCTTGCCTCTATACCCCATTTTGAAGCTGTCAAACGTGCACAGGAGCTTGCTGCCAGGATGGGATTTCGCCAGGATCCAGAGTTTGCTCCTCTCATAAATTTGTTTCCAGGGAACATAGCAACTGATGTTGCTGTTCCACAGAAGCCAATCAAGGCCCCTGTTCTTCGTCTTGATGCACTTGGCAGAGAAATAGATGAACAAGGAAATGTGATCAATATAACCAAACCGAGCAACCTTAGCACTCTAAAGGTTAACATTAACAAACAGAAAAAGGATGCATTTCAGATACTTAAACCTGAACTTGATGTGGATCCAGAATCAAACCCTCATTTTGATGAAAAGATGGGTATAAATAAAACTAAACTTTTGAGGCCGAAGAGGATGAGTTTCCAGTTTGTTGAGGAAGGGAAATGGTCTAAGGAGGCTGAAACCATGAAATTGAAGAGTAAATTTGGAGAGGCACAAGCCAAAGAGCGAAGGGAGAAGCAGGCACAATTGGCCAAGGCAAAGGCAGCACCTGATATAAATCCGAATTTGATCGAGGTATCAGAGAGAGTTATGGTGAAAGAAAAAACGAAAGAACCAATTCCTGAAATTGAGTGGTGGTATAAAGATCTGAACGGTAATGACTTACCGAATGCAATTCTTATATTAGGTTCTTG

Coding sequence (CDS)

AGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAGGCGGGAGGAACGTTCAGGTTTAGAGCCTGTGGAACCCTGGAAATGGATAGGGTTTCTGAGAAGGATAAATCGAGCAAGCGTTCCCGAGATGAACGCAGCGACCATAAGGATCGAGACCACAAGCATCGCAGTCGAGACGCCGAGGAAAGGCATTTCTCCAAGGATGAGAAGTCCCGCGAATCTGATTACCACCATCGCCGACGCCACCACCGATCGGACCGTGATTCGAAGCGTGAGCGTTCGCATGAGCCGCGTGATCACAAACATAGGCGTGATAGGTCTCCCGATGAGCGCGAAAGCTCTCAAGACCGCGATTTGCAGAGGGAAAGGTCGCATGATCTTAGGGATGAGAGAGAAAGGAGTAGAGATAGAGATTCGTCTAAACGAGAGCGGTCATATGAGCCGAGAGGGGAGAGAGAGGACAGCAGAGAGCGGGGCATGCTGCGCGAGTTGAGGCGCGAGCAATCAGATGATGAGTATGAACGGGAAGGATCATTTGAGCCAGCCCAGAATTCCGTACGTTCAAACAAGAGGAAGGAGAGGGGAGGAAGTGAGGATAGGTTTGATGGTGGTGAGAAGAGGGCTAGGGCTTCGGAAGATGGGAAGGATCTTAGATGGATTGAGGACGGGAAGGAAGTGAATGGAGCTGAGATGGGTGAGAGAGAGGAGCGGAGGAGATTTGCTGACGGTGAGAAAGATGAGGAAGCAAACTTGAGTGGTAGGGGAAGGAGGGAGAGGAAACGGTTTGAGGATCGGGTAAAGGAAGAGGATAATGGTGGAAATGTTGATGAGAAGAATGCAAACGTGAATGAATACAAGTCCAAGGGAGACGTGGGGGATGGGAAAGTTCAGATTGGAGGCACCACCGATGAAAAAAGTTCACTGGGGAATGGATCTATGGTGGAACCCATTGATATGTCATCAGCAAGTGTGCCCCAGAATTTGTTACACCCTAGTCATTCCCTTCCTATCAAGGTATCTTCAATTTCTACCACAAATGAAAATAAGGGAGTTAGTATTACCAGATCTCATGAGGTTCATGGAAAATCTAGTACAGATGGGACATCGTCAACTGCTGGGAAAAGTGGGAATCTCTCTCTTGATGCTTTAGCAAAAGCTAAGAAAGCTTTACAGATGCAGAAAGAACTGGCCGAGAAGTTGAAGAAAATTCCTCTGATGAAGAAGGATGGGGGGTCAAGTTCTGCAAGTAGCTCAGTTTTGAAATCGGAGGAGAGGGCTAAACCAGCAGTTGGTGTATTGGGGCCATCACCATCTACAAATAGTGCCGCAACTCTTTCTGCTGGGGTAGCATCAAGTTCATCGACCTTACCTGCTGCTGCCAATGCAGTTGGTGGTGGTATTAATGTTCCGGCTGGCCTTGCCTCTATACCCCATTTTGAAGCTGTCAAACGTGCACAGGAGCTTGCTGCCAGGATGGGATTTCGCCAGGATCCAGAGTTTGCTCCTCTCATAAATTTGTTTCCAGGGAACATAGCAACTGATGTTGCTGTTCCACAGAAGCCAATCAAGGCCCCTGTTCTTCGTCTTGATGCACTTGGCAGAGAAATAGATGAACAAGGAAATGTGATCAATATAACCAAACCGAGCAACCTTAGCACTCTAAAGGTTAACATTAACAAACAGAAAAAGGATGCATTTCAGATACTTAAACCTGAACTTGATGTGGATCCAGAATCAAACCCTCATTTTGATGAAAAGATGGGTATAAATAAAACTAAACTTTTGAGGCCGAAGAGGATGAGTTTCCAGTTTGTTGAGGAAGGGAAATGGTCTAAGGAGGCTGAAACCATGAAATTGAAGAGTAAATTTGGAGAGGCACAAGCCAAAGAGCGAAGGGAGAAGCAGGCACAATTGGCCAAGGCAAAGGCAGCACCTGATATAAATCCGAATTTGATCGAGGTATCAGAGAGAGTTATGGTGAAAGAAAAAACGAAAGAACCAATTCCTGAAATTGAGTGGTGGTATAAAGATCTGAACGGTAATGACTTACCGAATGCAATTCTTATATTAGGTTCTTG

Protein sequence

REREREREKAGGTFRFRACGTLEMDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDRDSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYEPRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKRARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVKEEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQNLLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAKKALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSAGVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLFPGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQAKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWWYKDLNGNDLPNAILILGSX

Homology

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. NCBI nr
Match: XP_022139030.1 (protein RDM16 isoform X1 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 1026.9 bits (2654), Expect = 7.8e-296
Identity = 578/647 (89.34%), Postives = 612/647 (94.59%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDRVSEK+KSSKRSRDER    DRD KHRSRDA+E+H SKDEK RESD+HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRVSEKEKSSKRSRDER----DRDQKHRSRDADEKHSSKDEKHRESDHHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEP DHKHRRDRSPDE ESSQD D +RERS+DLRDERERSRDRDSSKRERS E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPLDHKHRRDRSPDEHESSQDHDFKRERSYDLRDERERSRDRDSSKRERSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PR ERE S+ERG LRE RREQSDDE EREGSFEP QN+VRSNKRK+RGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRVEREGSKERGKLREARREQSDDECEREGSFEPIQNTVRSNKRKDRGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARASEDGKDLR IEDGKEVNGAEM E++ERRRFADGEKD+EANLSGRGRRERKRFED V 
Sbjct: 181 ARASEDGKDLRRIEDGKEVNGAEMDEKKERRRFADGEKDDEANLSGRGRRERKRFEDWVN 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDEK+ANVN++KSKG+VGDGK+QIGGTTD  SSLGNGS VEPIDMSSASVPQ+
Sbjct: 241 EEDNGGNVDEKHANVNKHKSKGNVGDGKIQIGGTTD-VSSLGNGSTVEPIDMSSASVPQS 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           L+HPSHS+PIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDG SSTAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LVHPSHSIPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGPSSTAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSV+K E+++KPA GVLGPSP+TN   T+SA
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVVKLEDKSKPAGGVLGPSPTTNIGTTISA 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GVASSSSTLPAA N  GGGINVPAGL SIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVASSSSTLPAATNTHGGGINVPAGLTSIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGNIATDVAVPQKP+KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNIATDVAVPQKPVKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPEL+VDPESNPHFDE+MGINKTKLLRPKRM+FQFVEEGKWSKEAET+KL+SKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELEVDPESNPHFDERMGINKTKLLRPKRMNFQFVEEGKWSKEAETIKLRSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW 671
           AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV+VKEKTKEPIPEIEWW
Sbjct: 601 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVIVKEKTKEPIPEIEWW 642

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. NCBI nr
Match: XP_022139031.1 (protein RDM16 isoform X2 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 1016.5 bits (2627), Expect = 1.1e-292
Identity = 573/647 (88.56%), Postives = 607/647 (93.82%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDRVSEK+KSSKRSRDER    DRD KHRSRDA+E+H SKDEK RESD+HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRVSEKEKSSKRSRDER----DRDQKHRSRDADEKHSSKDEKHRESDHHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEP DHKHRRDRSPDE ESSQD D +RERS+DLRDERERSRDRDSSKRERS E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPLDHKHRRDRSPDEHESSQDHDFKRERSYDLRDERERSRDRDSSKRERSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PR ERE S+ERG LRE RREQSDDE EREGSFEP QN+VRSNKRK+RGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRVEREGSKERGKLREARREQSDDECEREGSFEPIQNTVRSNKRKDRGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARASEDGKDLR IEDGKEVNGAEM E++ERRRFADGEKD+EANLSGRGRRERKRFED V 
Sbjct: 181 ARASEDGKDLRRIEDGKEVNGAEMDEKKERRRFADGEKDDEANLSGRGRRERKRFEDWVN 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDEK+ANVN++KSKG+VGDGK+QIGGTTD       GS VEPIDMSSASVPQ+
Sbjct: 241 EEDNGGNVDEKHANVNKHKSKGNVGDGKIQIGGTTD-------GSTVEPIDMSSASVPQS 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           L+HPSHS+PIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDG SSTAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LVHPSHSIPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGPSSTAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSV+K E+++KPA GVLGPSP+TN   T+SA
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVVKLEDKSKPAGGVLGPSPTTNIGTTISA 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GVASSSSTLPAA N  GGGINVPAGL SIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVASSSSTLPAATNTHGGGINVPAGLTSIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGNIATDVAVPQKP+KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNIATDVAVPQKPVKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPEL+VDPESNPHFDE+MGINKTKLLRPKRM+FQFVEEGKWSKEAET+KL+SKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELEVDPESNPHFDERMGINKTKLLRPKRMNFQFVEEGKWSKEAETIKLRSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW 671
           AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV+VKEKTKEPIPEIEWW
Sbjct: 601 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVIVKEKTKEPIPEIEWW 636

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. NCBI nr
Match: XP_038893249.1 (protein RDM16 isoform X1 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 993.4 bits (2567), Expect = 9.6e-286
Identity = 566/647 (87.48%), Postives = 594/647 (91.81%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDR+SEK+KSSKRSR+ER    DRDHKHRSRD EE+HFSKDEK RESD+HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRLSEKEKSSKRSREER----DRDHKHRSRDTEEKHFSKDEKHRESDHHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEPR+HKHRRDRSPDER SSQDRD +RERSHDLR+ERERSRDRDSSKRERS E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPREHKHRRDRSPDERGSSQDRDFKRERSHDLREERERSRDRDSSKRERSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PRG R  S ERG LRE+RREQS+DE EREGS EP  NSV SNKRK+RGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRGLRAGSEERGKLREVRREQSEDEREREGSLEPIHNSVGSNKRKKRGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARAS         E G EVNGAEM E++ERRRFAD EKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK
Sbjct: 181 ARAS---------EGGNEVNGAEMDEKKERRRFADSEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDE++A VNE KSKGDVGD KVQ GGTTDEK SLGNGSMVEP DMSS SVPQN
Sbjct: 241 EEDNGGNVDERHAKVNELKSKGDVGDVKVQFGGTTDEKGSLGNGSMVEPTDMSSTSVPQN 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           L+HPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTS+TAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LIHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSATAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLKKIPLMKK GGSSSASSSV+K EE+ KP  GVLG  P+TN A +LS 
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKVGGSSSASSSVMKLEEKPKPPAGVLGQLPTTNDATSLST 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GVASSSSTLP+AANA+ GGINVPAGL SIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVASSSSTLPSAANALDGGINVPAGLTSIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGNIATDVAVPQKP KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNIATDVAVPQKPTKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPELDVDP+SNPHFDE+MGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAET+KLKSKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELDVDPDSNPHFDERMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETIKLKSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW 671
           AKER+EKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVM KEKTKEPIPEIEWW
Sbjct: 601 AKERKEKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVM-KEKTKEPIPEIEWW 633

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. NCBI nr
Match: XP_004143591.1 (protein RDM16 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN50493.1 hypothetical protein Csa_000308 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 989.9 bits (2558), Expect = 1.1e-284
Identity = 565/660 (85.61%), Postives = 599/660 (90.76%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDRVSEK+KSSKRSR+ER    DRDHKHRSRD E++H SKDEK RESD HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRVSEKEKSSKRSREER----DRDHKHRSRDTEDKHLSKDEKHRESDRHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEPR+HKHRRD SPDERESSQDRD +RERS++LR+ERERSRDRDSSKRE+S E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPREHKHRRDMSPDERESSQDRDFKRERSYELREERERSRDRDSSKREKSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PRG RE S ERG LRE+RRE+SD+E+EREGSFEP QNSVR NKRKERGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRGLREGSEERGKLREVRREESDNEHEREGSFEPIQNSVRPNKRKERGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARAS         E G EVNGAEM E++ERRRFADGEKDE ANLSGRGRR+RKRFEDR K
Sbjct: 181 ARAS---------EVGNEVNGAEMDEKKERRRFADGEKDEGANLSGRGRRDRKRFEDRGK 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDEK+  VNEYKSKGDVGDGKVQ GGTTDEK SLGNGSMVEP DM SASVPQN
Sbjct: 241 EEDNGGNVDEKHGKVNEYKSKGDVGDGKVQFGGTTDEKRSLGNGSMVEPTDMPSASVPQN 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           LLHPSHSLPIKVSSISTTNEN+GVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENRGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLK+IPLMKK GGSSSA+SSV+K EE+AKP  G+LGP  +TN A TLS 
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKRIPLMKKVGGSSSANSSVVKLEEKAKPPSGILGPLSTTNDATTLST 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GV SSSSTLP+AANA+ GGINVPAGL SIPH EAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVVSSSSTLPSAANALDGGINVPAGLTSIPHIEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGN+ATDVAVPQKP KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNVATDVAVPQKPTKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPELDVDP+SNPHFDE+MGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAET+KL+SKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELDVDPDSNPHFDERMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETLKLRSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW---------YKDL 675
           AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV VKEKTK+PIPEIEWW         YKDL
Sbjct: 601 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV-VKEKTKDPIPEIEWWDVPLLQSGAYKDL 646

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. NCBI nr
Match: XP_008461606.1 (PREDICTED: U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 [Cucumis melo] >KAA0034019.1 U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 975.7 bits (2521), Expect = 2.1e-280
Identity = 559/647 (86.40%), Postives = 591/647 (91.34%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDRVSEK+KSSKRSR+ER    DRDHKHRSRD E++H SKDEK RESD HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRVSEKEKSSKRSREER----DRDHKHRSRDTEDKHLSKDEKHRESDRHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEPR+HKHRRDRSPDERE SQDRD +RERS++LR+ERERSRDRDSSKRE+S E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPREHKHRRDRSPDEREGSQDRDFKRERSYELREERERSRDRDSSKREKSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PRG RE S ERG LRE+RRE+SD+E EREGSFEP QNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRGLREGSEERGKLREVRREESDNEREREGSFEPIQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARAS         E G EVNGAEM E++ERRRFADGEKD+ ANLSGR RR+RKRFEDRVK
Sbjct: 181 ARAS---------EVGNEVNGAEMDEKKERRRFADGEKDDGANLSGRARRDRKRFEDRVK 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDEK+A V EYKSKGDVGDGKVQ GGTTDEK SLGNGSMVEP D+ SASVPQN
Sbjct: 241 EEDNGGNVDEKHAKVIEYKSKGDVGDGKVQFGGTTDEKRSLGNGSMVEPTDIPSASVPQN 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           LLHPS SLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LLHPSPSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLKKIPLMKK GGSSSA+SSV+K EE+AKP  GVLG   +TN A TLS 
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKVGGSSSANSSVVKLEEKAKPPSGVLGQLSTTNDATTLST 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GV SSSST P+AANA+  GINVPAGL SIPH EAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVVSSSSTFPSAANALDVGINVPAGLTSIPHIEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGNIATDVAVPQKP KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNIATDVAVPQKPTKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPELDVDP+SNPHFDE+MGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAET+KL+SKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELDVDPDSNPHFDERMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETLKLRSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW 671
           AKER+EKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV VKEKTK+PIPEIEWW
Sbjct: 601 AKERKEKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV-VKEKTKDPIPEIEWW 633

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C7E7 (Protein RDM16 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RDM16 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 335.9 bits (860), Expect = 1.1e-90
Identity = 287/603 (47.60%), Postives = 348/603 (57.71%), Query Frame = 0


Query: 75  RRRHHRSDRDSKRERSHEPRDHKHRRD--RSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRD 134
           + R+ RS RD  R+R   P DH  +R+  R  D    S+ RD    RS   R +RE  RD
Sbjct: 3   KERYSRSHRDD-RDRDSSP-DHSPQREGGRRRDRDVDSKRRDSDHYRS-SRRGDREDERD 62

Query: 135 RDSSKRERSYEPRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGG 194
           R   +R RS E RGERE SR+        RE+   E   EGS E    S R ++ +E G 
Sbjct: 63  RTKDRRGRSVE-RGEREGSRD--------REKHHHERSHEGSKEKESRSKRKDREEENG- 122

Query: 195 SEDRFDGGEKRARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGR 254
                         + DGK                    ++ RFADG  +          
Sbjct: 123 --------------ARDGK--------------------KKSRFADGNGE---------- 182

Query: 255 RERKRFEDRVKEEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEP 314
             R RFED   E      V+ K+A V+E               G T+  S +  G+    
Sbjct: 183 -RRSRFEDVAIE------VENKDAQVSEG-------------SGATNPTSGVTMGASTYS 242

Query: 315 IDMSSASVPQNLLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTS-STAGK- 374
              S AS       PS +L  KVSSISTT+ENK  S+ RSHEV GKSSTDG   STAGK 
Sbjct: 243 SIPSEASAA-----PSQTLLTKVSSISTTDENK-ASVVRSHEVPGKSSTDGRPLSTAGKS 302

Query: 375 SGNLSLDA---LAKAKKALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVG 434
           S NL LD+    AKA+KALQ+QK LA++LK +PL+KK            K      P   
Sbjct: 303 SANLPLDSSALAAKARKALQLQKGLADRLKNLPLLKK----------ATKPTSEGSPHTR 362

Query: 435 VLGPSPSTNSAATLSAGVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAAR 494
           V    PST + A +S G  S +STLP             AG  SI + EAVKRAQELAA 
Sbjct: 363 V---PPSTTTPA-VSTG-TSFASTLPHTG---------LAGFGSIANIEAVKRAQELAAN 422

Query: 495 MGFRQDPEFAPLINLFPGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNL 554
           MGF QD EFAP+INLFPG   +D+ V Q+P K PVLR+DALGREIDE GNVI++TKPSNL
Sbjct: 423 MGFHQDREFAPVINLFPGQAPSDMTVAQRPEKPPVLRVDALGREIDEHGNVISVTKPSNL 482

Query: 555 STLKVNINKQKKDAFQILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWS 614
           STLKVNINK+KKDAFQILKP+L+ D + NP+FD +MGI++ K+LRPKRMSFQFVEEGKW+
Sbjct: 483 STLKVNINKKKKDAFQILKPQLEADLKENPYFDTRMGIDEKKILRPKRMSFQFVEEGKWT 496

Query: 615 KEAETMKLKSKFGEAQAKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEI 671
           ++AE +K KS FGEA+AKE + KQAQLAKA    DINPNLIEVSERV  KEK KEPIP++
Sbjct: 543 RDAENLKFKSHFGEAKAKELKVKQAQLAKAN--DDINPNLIEVSERVPRKEKPKEPIPDV 496

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CB57 (protein RDM16 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010059 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1026.9 bits (2654), Expect = 3.8e-296
Identity = 578/647 (89.34%), Postives = 612/647 (94.59%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDRVSEK+KSSKRSRDER    DRD KHRSRDA+E+H SKDEK RESD+HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRVSEKEKSSKRSRDER----DRDQKHRSRDADEKHSSKDEKHRESDHHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEP DHKHRRDRSPDE ESSQD D +RERS+DLRDERERSRDRDSSKRERS E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPLDHKHRRDRSPDEHESSQDHDFKRERSYDLRDERERSRDRDSSKRERSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PR ERE S+ERG LRE RREQSDDE EREGSFEP QN+VRSNKRK+RGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRVEREGSKERGKLREARREQSDDECEREGSFEPIQNTVRSNKRKDRGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARASEDGKDLR IEDGKEVNGAEM E++ERRRFADGEKD+EANLSGRGRRERKRFED V 
Sbjct: 181 ARASEDGKDLRRIEDGKEVNGAEMDEKKERRRFADGEKDDEANLSGRGRRERKRFEDWVN 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDEK+ANVN++KSKG+VGDGK+QIGGTTD  SSLGNGS VEPIDMSSASVPQ+
Sbjct: 241 EEDNGGNVDEKHANVNKHKSKGNVGDGKIQIGGTTD-VSSLGNGSTVEPIDMSSASVPQS 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           L+HPSHS+PIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDG SSTAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LVHPSHSIPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGPSSTAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSV+K E+++KPA GVLGPSP+TN   T+SA
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVVKLEDKSKPAGGVLGPSPTTNIGTTISA 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GVASSSSTLPAA N  GGGINVPAGL SIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVASSSSTLPAATNTHGGGINVPAGLTSIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGNIATDVAVPQKP+KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNIATDVAVPQKPVKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPEL+VDPESNPHFDE+MGINKTKLLRPKRM+FQFVEEGKWSKEAET+KL+SKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELEVDPESNPHFDERMGINKTKLLRPKRMNFQFVEEGKWSKEAETIKLRSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW 671
           AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV+VKEKTKEPIPEIEWW
Sbjct: 601 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVIVKEKTKEPIPEIEWW 642

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CBF9 (protein RDM16 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010059 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1016.5 bits (2627), Expect = 5.1e-293
Identity = 573/647 (88.56%), Postives = 607/647 (93.82%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDRVSEK+KSSKRSRDER    DRD KHRSRDA+E+H SKDEK RESD+HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRVSEKEKSSKRSRDER----DRDQKHRSRDADEKHSSKDEKHRESDHHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEP DHKHRRDRSPDE ESSQD D +RERS+DLRDERERSRDRDSSKRERS E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPLDHKHRRDRSPDEHESSQDHDFKRERSYDLRDERERSRDRDSSKRERSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PR ERE S+ERG LRE RREQSDDE EREGSFEP QN+VRSNKRK+RGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRVEREGSKERGKLREARREQSDDECEREGSFEPIQNTVRSNKRKDRGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARASEDGKDLR IEDGKEVNGAEM E++ERRRFADGEKD+EANLSGRGRRERKRFED V 
Sbjct: 181 ARASEDGKDLRRIEDGKEVNGAEMDEKKERRRFADGEKDDEANLSGRGRRERKRFEDWVN 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDEK+ANVN++KSKG+VGDGK+QIGGTTD       GS VEPIDMSSASVPQ+
Sbjct: 241 EEDNGGNVDEKHANVNKHKSKGNVGDGKIQIGGTTD-------GSTVEPIDMSSASVPQS 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           L+HPSHS+PIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDG SSTAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LVHPSHSIPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGPSSTAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSV+K E+++KPA GVLGPSP+TN   T+SA
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVVKLEDKSKPAGGVLGPSPTTNIGTTISA 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GVASSSSTLPAA N  GGGINVPAGL SIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVASSSSTLPAATNTHGGGINVPAGLTSIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGNIATDVAVPQKP+KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNIATDVAVPQKPVKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPEL+VDPESNPHFDE+MGINKTKLLRPKRM+FQFVEEGKWSKEAET+KL+SKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELEVDPESNPHFDERMGINKTKLLRPKRMNFQFVEEGKWSKEAETIKLRSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW 671
           AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV+VKEKTKEPIPEIEWW
Sbjct: 601 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVIVKEKTKEPIPEIEWW 636

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KLQ4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G177130 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 989.9 bits (2558), Expect = 5.1e-285
Identity = 565/660 (85.61%), Postives = 599/660 (90.76%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDRVSEK+KSSKRSR+ER    DRDHKHRSRD E++H SKDEK RESD HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRVSEKEKSSKRSREER----DRDHKHRSRDTEDKHLSKDEKHRESDRHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEPR+HKHRRD SPDERESSQDRD +RERS++LR+ERERSRDRDSSKRE+S E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPREHKHRRDMSPDERESSQDRDFKRERSYELREERERSRDRDSSKREKSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PRG RE S ERG LRE+RRE+SD+E+EREGSFEP QNSVR NKRKERGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRGLREGSEERGKLREVRREESDNEHEREGSFEPIQNSVRPNKRKERGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARAS         E G EVNGAEM E++ERRRFADGEKDE ANLSGRGRR+RKRFEDR K
Sbjct: 181 ARAS---------EVGNEVNGAEMDEKKERRRFADGEKDEGANLSGRGRRDRKRFEDRGK 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDEK+  VNEYKSKGDVGDGKVQ GGTTDEK SLGNGSMVEP DM SASVPQN
Sbjct: 241 EEDNGGNVDEKHGKVNEYKSKGDVGDGKVQFGGTTDEKRSLGNGSMVEPTDMPSASVPQN 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           LLHPSHSLPIKVSSISTTNEN+GVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENRGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLK+IPLMKK GGSSSA+SSV+K EE+AKP  G+LGP  +TN A TLS 
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKRIPLMKKVGGSSSANSSVVKLEEKAKPPSGILGPLSTTNDATTLST 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GV SSSSTLP+AANA+ GGINVPAGL SIPH EAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVVSSSSTLPSAANALDGGINVPAGLTSIPHIEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGN+ATDVAVPQKP KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNVATDVAVPQKPTKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPELDVDP+SNPHFDE+MGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAET+KL+SKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELDVDPDSNPHFDERMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETLKLRSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW---------YKDL 675
           AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV VKEKTK+PIPEIEWW         YKDL
Sbjct: 601 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV-VKEKTKDPIPEIEWWDVPLLQSGAYKDL 646

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SXX5 (U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold65G00020 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 975.7 bits (2521), Expect = 1.0e-280
Identity = 559/647 (86.40%), Postives = 591/647 (91.34%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDRVSEK+KSSKRSR+ER    DRDHKHRSRD E++H SKDEK RESD HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRVSEKEKSSKRSREER----DRDHKHRSRDTEDKHLSKDEKHRESDRHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEPR+HKHRRDRSPDERE SQDRD +RERS++LR+ERERSRDRDSSKRE+S E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPREHKHRRDRSPDEREGSQDRDFKRERSYELREERERSRDRDSSKREKSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PRG RE S ERG LRE+RRE+SD+E EREGSFEP QNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRGLREGSEERGKLREVRREESDNEREREGSFEPIQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARAS         E G EVNGAEM E++ERRRFADGEKD+ ANLSGR RR+RKRFEDRVK
Sbjct: 181 ARAS---------EVGNEVNGAEMDEKKERRRFADGEKDDGANLSGRARRDRKRFEDRVK 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDEK+A V EYKSKGDVGDGKVQ GGTTDEK SLGNGSMVEP D+ SASVPQN
Sbjct: 241 EEDNGGNVDEKHAKVIEYKSKGDVGDGKVQFGGTTDEKRSLGNGSMVEPTDIPSASVPQN 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           LLHPS SLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LLHPSPSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLKKIPLMKK GGSSSA+SSV+K EE+AKP  GVLG   +TN A TLS 
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKVGGSSSANSSVVKLEEKAKPPSGVLGQLSTTNDATTLST 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GV SSSST P+AANA+  GINVPAGL SIPH EAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVVSSSSTFPSAANALDVGINVPAGLTSIPHIEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGNIATDVAVPQKP KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNIATDVAVPQKPTKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPELDVDP+SNPHFDE+MGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAET+KL+SKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELDVDPDSNPHFDERMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETLKLRSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW 671
           AKER+EKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV VKEKTK+PIPEIEWW
Sbjct: 601 AKERKEKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV-VKEKTKDPIPEIEWW 633

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CF39 (U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103500170 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 975.7 bits (2521), Expect = 1.0e-280
Identity = 559/647 (86.40%), Postives = 591/647 (91.34%), Query Frame = 0


Query: 24  MDRVSEKDKSSKRSRDERSDHKDRDHKHRSRDAEERHFSKDEKSRESDYHHRRRHHRSDR 83
           MDRVSEK+KSSKRSR+ER    DRDHKHRSRD E++H SKDEK RESD HHRRRHHRSDR
Sbjct: 1   MDRVSEKEKSSKRSREER----DRDHKHRSRDTEDKHLSKDEKHRESDRHHRRRHHRSDR 60

Query: 84  DSKRERSHEPRDHKHRRDRSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRDRDSSKRERSYE 143
           DSKRERSHEPR+HKHRRDRSPDERE SQDRD +RERS++LR+ERERSRDRDSSKRE+S E
Sbjct: 61  DSKRERSHEPREHKHRRDRSPDEREGSQDRDFKRERSYELREERERSRDRDSSKREKSNE 120

Query: 144 PRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 203
           PRG RE S ERG LRE+RRE+SD+E EREGSFEP QNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR
Sbjct: 121 PRGLREGSEERGKLREVRREESDNEREREGSFEPIQNSVRSNKRKERGGSEDRFDGGEKR 180

Query: 204 ARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGRRERKRFEDRVK 263
           ARAS         E G EVNGAEM E++ERRRFADGEKD+ ANLSGR RR+RKRFEDRVK
Sbjct: 181 ARAS---------EVGNEVNGAEMDEKKERRRFADGEKDDGANLSGRARRDRKRFEDRVK 240

Query: 264 EEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEPIDMSSASVPQN 323
           EEDNGGNVDEK+A V EYKSKGDVGDGKVQ GGTTDEK SLGNGSMVEP D+ SASVPQN
Sbjct: 241 EEDNGGNVDEKHAKVIEYKSKGDVGDGKVQFGGTTDEKRSLGNGSMVEPTDIPSASVPQN 300

Query: 324 LLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 383
           LLHPS SLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK
Sbjct: 301 LLHPSPSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTSSTAGKSGNLSLDALAKAK 360

Query: 384 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVGVLGPSPSTNSAATLSA 443
           KALQMQKELAEKLKKIPLMKK GGSSSA+SSV+K EE+AKP  GVLG   +TN A TLS 
Sbjct: 361 KALQMQKELAEKLKKIPLMKKVGGSSSANSSVVKLEEKAKPPSGVLGQLSTTNDATTLST 420

Query: 444 GVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 503
           GV SSSST P+AANA+  GINVPAGL SIPH EAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF
Sbjct: 421 GVVSSSSTFPSAANALDVGINVPAGLTSIPHIEAVKRAQELAARMGFRQDPEFAPLINLF 480

Query: 504 PGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 563
           PGNIATDVAVPQKP KAPVLRLDALGREIDEQGNV+NITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ
Sbjct: 481 PGNIATDVAVPQKPTKAPVLRLDALGREIDEQGNVVNITKPSNLSTLKVNINKQKKDAFQ 540

Query: 564 ILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETMKLKSKFGEAQ 623
           ILKPELDVDP+SNPHFDE+MGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAET+KL+SKFGEAQ
Sbjct: 541 ILKPELDVDPDSNPHFDERMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWSKEAETLKLRSKFGEAQ 600

Query: 624 AKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEIEWW 671
           AKER+EKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV VKEKTK+PIPEIEWW
Sbjct: 601 AKERKEKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERV-VKEKTKDPIPEIEWW 633

[Close]

BLAST of Sgr018702 vs. TAIR 10
Match: AT1G28060.1 (Pre-mRNA-splicing factor 3 )

HSP 1 Score: 335.9 bits (860), Expect = 7.7e-92
Identity = 287/603 (47.60%), Postives = 348/603 (57.71%), Query Frame = 0


Query: 75  RRRHHRSDRDSKRERSHEPRDHKHRRD--RSPDERESSQDRDLQRERSHDLRDERERSRD 134
           + R+ RS RD  R+R   P DH  +R+  R  D    S+ RD    RS   R +RE  RD
Sbjct: 3   KERYSRSHRDD-RDRDSSP-DHSPQREGGRRRDRDVDSKRRDSDHYRS-SRRGDREDERD 62

Query: 135 RDSSKRERSYEPRGEREDSRERGMLRELRREQSDDEYEREGSFEPAQNSVRSNKRKERGG 194
           R   +R RS E RGERE SR+        RE+   E   EGS E    S R ++ +E G 
Sbjct: 63  RTKDRRGRSVE-RGEREGSRD--------REKHHHERSHEGSKEKESRSKRKDREEENG- 122

Query: 195 SEDRFDGGEKRARASEDGKDLRWIEDGKEVNGAEMGEREERRRFADGEKDEEANLSGRGR 254
                         + DGK                    ++ RFADG  +          
Sbjct: 123 --------------ARDGK--------------------KKSRFADGNGE---------- 182

Query: 255 RERKRFEDRVKEEDNGGNVDEKNANVNEYKSKGDVGDGKVQIGGTTDEKSSLGNGSMVEP 314
             R RFED   E      V+ K+A V+E               G T+  S +  G+    
Sbjct: 183 -RRSRFEDVAIE------VENKDAQVSEG-------------SGATNPTSGVTMGASTYS 242

Query: 315 IDMSSASVPQNLLHPSHSLPIKVSSISTTNENKGVSITRSHEVHGKSSTDGTS-STAGK- 374
              S AS       PS +L  KVSSISTT+ENK  S+ RSHEV GKSSTDG   STAGK 
Sbjct: 243 SIPSEASAA-----PSQTLLTKVSSISTTDENK-ASVVRSHEVPGKSSTDGRPLSTAGKS 302

Query: 375 SGNLSLDA---LAKAKKALQMQKELAEKLKKIPLMKKDGGSSSASSSVLKSEERAKPAVG 434
           S NL LD+    AKA+KALQ+QK LA++LK +PL+KK            K      P   
Sbjct: 303 SANLPLDSSALAAKARKALQLQKGLADRLKNLPLLKK----------ATKPTSEGSPHTR 362

Query: 435 VLGPSPSTNSAATLSAGVASSSSTLPAAANAVGGGINVPAGLASIPHFEAVKRAQELAAR 494
           V    PST + A +S G  S +STLP             AG  SI + EAVKRAQELAA 
Sbjct: 363 V---PPSTTTPA-VSTG-TSFASTLPHTG---------LAGFGSIANIEAVKRAQELAAN 422

Query: 495 MGFRQDPEFAPLINLFPGNIATDVAVPQKPIKAPVLRLDALGREIDEQGNVINITKPSNL 554
           MGF QD EFAP+INLFPG   +D+ V Q+P K PVLR+DALGREIDE GNVI++TKPSNL
Sbjct: 423 MGFHQDREFAPVINLFPGQAPSDMTVAQRPEKPPVLRVDALGREIDEHGNVISVTKPSNL 482

Query: 555 STLKVNINKQKKDAFQILKPELDVDPESNPHFDEKMGINKTKLLRPKRMSFQFVEEGKWS 614
           STLKVNINK+KKDAFQILKP+L+ D + NP+FD +MGI++ K+LRPKRMSFQFVEEGKW+
Sbjct: 483 STLKVNINKKKKDAFQILKPQLEADLKENPYFDTRMGIDEKKILRPKRMSFQFVEEGKWT 496

Query: 615 KEAETMKLKSKFGEAQAKERREKQAQLAKAKAAPDINPNLIEVSERVMVKEKTKEPIPEI 671
           ++AE +K KS FGEA+AKE + KQAQLAKA    DINPNLIEVSERV  KEK KEPIP++
Sbjct: 543 RDAENLKFKSHFGEAKAKELKVKQAQLAKAN--DDINPNLIEVSERVPRKEKPKEPIPDV 496

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Sgr018702 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022139030.1	7.8e-296	89.34	protein RDM16 isoform X1 [Momordica charantia]	[more]
XP_022139031.1	1.1e-292	88.56	protein RDM16 isoform X2 [Momordica charantia]	[more]
XP_038893249.1	9.6e-286	87.48	protein RDM16 isoform X1 [Benincasa hispida]	[more]
XP_004143591.1	1.1e-284	85.61	protein RDM16 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN50493.1 hypothetical protein Csa_...	[more]
XP_008461606.1	2.1e-280	86.40	PREDICTED: U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 [Cucumis melo] >KAA0034019...	[more]

BLAST of Sgr018702 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9C7E7	1.1e-90	47.60	Protein RDM16 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RDM16 PE=2 SV=1	[more]

BLAST of Sgr018702 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1CB57	3.8e-296	89.34	protein RDM16 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010059 PE=4 SV=...	[more]
A0A6J1CBF9	5.1e-293	88.56	protein RDM16 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111010059 PE=4 SV=...	[more]
A0A0A0KLQ4	5.1e-285	85.61	Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G177130 PE=4 SV=1	[more]
A0A5A7SXX5	1.0e-280	86.40	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=119469...	[more]
A0A1S3CF39	1.0e-280	86.40	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC1035001...	[more]

BLAST of Sgr018702 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G28060.1	7.7e-92	47.60	Pre-mRNA-splicing factor 3	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Monk fruit (Qingpiguo) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 376..399
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 296..348
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..372
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 402..440
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 85..174
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 182..287
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 22..71
None	No IPR available	PANTHER	PTHR14212:SF2	SUBFAMILY NOT NAMED	coord: 244..672
IPR027104	U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3	PANTHER	PTHR14212	U4/U6-ASSOCIATED RNA SPLICING FACTOR-RELATED	coord: 244..672

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Sgr018702.1	Sgr018702.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0000398	mRNA splicing, via spliceosome
cellular_component	GO:0046540	U4/U6 x U5 tri-snRNP complex