Sed0027979 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0027979
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG04: 1109714 .. 1116318 (+)
RNA-Seq ExpressionSed0027979
SyntenySed0027979
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGGAAGTGTTTGATTGTGAAACAGATAGATTAATTAAAGACTTAGAGACTAAACTTGTTACTAGCTAGATCTATGTAATAGAAGAGAAAAACAATATGTAAATAAGAACTCAATCAATCTATAATATTGTTGACAATTGTTTGATGATGATGATGATCTCTAGTAGAAGTTGAACGTCTCAAAGTTTCTTGAACGATCTCTTTTCCTCTTCGATTCATCGTCAACTTAGACCAAAACCCATGATGGGGTTTCTTCTTTCTATGATCTCCATCCACTAAAGATCTACTCGTGCTCAACAAATTAGTGGCTGATGATCTTCGTTTGAACAACATGGACATGGAAGAAATCGAAGCTTTTCTTGGAAAATAGGTCGAAGATGAAGAAGAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAGTAATAAGAAGATAAAGATGATAGTGAAGAAGAAGATGATAAAGAAGCAATTTTTATGGAGTTTTTCTTTGTGGTTGGGCCTGAAATTGTCAAATTTGAAAGCTTTTCTCTTAGACAAATAGAACAAACTCCCGGTGATTGCTTGTGTTTTGGGTGCGTCCGGCACCGGCCACACGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCATGACGACGATGATGATTCTTTAGTTTGCTCAAATTCTTTGGCATTGTTGTTGTTGTTGTATCATTTTGAAGTTTGAATCTCTTTTTTTTTGTGTTGTTGGGGATTAAAATGATATATATAAAGATGTAAACTTGGAAAAAAAAAGTGGAAAGTGTGGTGTATTTCGAGGATCTTTCCCCGGCAACTTCTTTGATTTTTCTTATTTTTTATTTAAAACAAAGGATAATAAATTAAGGGATTTTTAATTTTGTAATTTATTTTTTAATTTAATTTGAAAATGGGTGTTTTGACTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATTGTGTGTACACAAGTTGGCTGAATTAAAGACCAAAATTTGAACAGCTGTGATTCGAGGAGAGGGTTTGGTATGGGGACAATGGCCACTCCAATTTTTAAAATCGAGCCGGTTCGATCAGACCGGTCGTTTGGACACTAAAAATATATTTTATGTAATTTTTATTTAATATTTATTCGTCAAAATCAAACATTTTGATCACAGATATTTCGATCATCTTCCATTTTAATTCTCTAAGGTAACAAAACTGTTAATTCATAATAGAAAGTTGATTACAATTAAATTAAAATTTTAATAAATTATAATGTAATTATTTTGATTTTGATATGAATTTGATTTTTAAAAGAAAATGAATAAAAAGTTAGTTAAAAAAAATGAAATACATTGGACATTTTAGTTCGAGAAAAATGTCGGTTGGGTTAAAATAGTTTAAATTAATTATACATTTTAAAAGGTTATATTTCAATTTAATATAATTAGGGGTAAAATTGATTTCAAATTGAGACCATATATATTTTTTAGTTGAGATGTCAATGGTTATATTTTCAAGACATGAGTTGTGGAGGGCCTATCCTCGCCATTTTTTTTCAACCGAAAGAAAATCCCCAAAATTTAACATAAAAATCTCTCGTTTTTAAGATGCAATATTCTAAAATTAGGTCAGAAATTGACTAAGTGACATTTTAGTTTAACCTATAAAATCATGTAATTAATGTTTTTTGTTTTTTTAAAAAGAAACATACTAGAGAATAGTCCTATTATTCAAAGGAATAACACACATACATTGATTGTGTGTATTATAAAATAATGTAACAATTGGTTAATTGAATCACATACAAATATACAATATGATTTAAAAGTAGCTTGTTTGTATGTAATAATAATATGGATATGTCATGTGATAATTTTGGAAACTAAAAGTAGCTATACAATAATACATTTGGTTGACACATTAGGGTTGTATCCAAGGCTAGGAAGTAGTTGAGGAGTTTGATGACATTTATTCCTTGGTTCTCACACGTGTCATATATTTGGTTTAACACGTGTTTATTCTTGACAATTTTACAATATGCTTCAATTGGTACTGTTTTTTGGTTGAATAGTGGCTTTCAATACAATCAATATATTCAAGTACTTTCATATGTTTTTCATTCTACACTACACTTGATTCAATACGAGACAATATAATTCAAATGGTTAGAAAGTATTACAATTTTGATTAAAAGATGTAACGCTAGAGTTTAAGAGGAATACATAAAAGGATTTAAGACTGTATTTAAATGAAAAAAATCATAAGATAAAGTAATGATAGCTATTATATACATAATTCTTTTTGGATACATATGAACTCTAAAATGAAGCATATTTAACTTTAGAGTAATTAATTTTAGGTCGAGTGATTAATAGTTGAGTGAAACCAAATATGCTAAAAGAAACTTTTGCTAGACCCTGAGATACTCTTTGCTAGATGTATGTGTTGAAATATACCTTGAATTGTTTGATACCCCATGATTATTTAGTTAGTGGTCTCGCTGTCCGGCCAGCGAGCGGGTTATGAAAACTTTTAGAACCAACCTAAATTTCTAAGTTTGATTAATCTACCAACCCGTCTAACTATATTTATTAGAGAAGTTCAATCTAACTTAACTCATATATTTTTAGGTTTAGCTCGTAATCTAAAACTTAACCCATAGTTCATAATCTTAAAAAGAAAGGAAAAGAAAAGAAAATTTGAATGATACTAAAGGAAACTCACTCTTCACCCTTTGCCAACATGATAAAAAAAAAAAATCTGATTTGTTAATTATTAATAATTCTTAATTCGAGTTGGGATGAGTTGAACTAGCAAAAAATAAAAAGAAAAAAAAGACCAACCTAAAATCTGATTCAATCAAAAGAAAAATATGAAATTATAACACAACCCAATCTTTGTAGTTTTGGTTGGATAGTTTAGCCGTTTGAATTGTCGTTTTCTTTTACACTCATAATCTTCACTTTTAGAAGTAGCCAGAACATGTAAGAGTGGTTAGATCACAAGAGATGCAGTAAAATTTCAAAAGTCAAGAGGGGCAAAATCCGAATTCCAAATCGAGGTTGTAATCGGGGACCTCGAGCATTGCAAAAGATGCAATTGAAAATTATGGGTGAGAAAAGAAAAATGTGTTGGTAGGAAGAAAATGGTGTATAATATTGAAGAAAGTGTGGGCAAAAATGTTGAAGATGGAGTGTACTACTACTTTTTGTCTGCAAATCTGTGACACTCTCAGTTTATTACAACGTGGAAAACAAACTCCACTCTATTCTATGGATCTGATTCTATTACAACCTGTTCTTAATTTTTAATCTCATTTTCTCATACAAAATTTTGTTCCCATTCAATATATTGCTTTTGTTTATTACTTTCTATTTTCAACACATTCCAAATCAAATAATTATTTTTTTCAACACATTTCAAATTATAATTTCTAAAGTACATTCATGAGCTTAGCAAATCGATTCTGTTTAATTTTCTTATTAAAATCAAATGACAGCCAAGAGAGGCCCCAGAAATATTTTCCTGTCACTTTAATTTGAATAATCTTAAGGTCTTTGATTATGCTAGATACCCAAGAAACATATACTTCAAATTGTATAACAATTGATTTTTTTTTCTTCAAATAATTTGATTGTAAAATTCTTGAGAAGTAATGTTCATGCAACACAAATTGATATTATCTACGAAAAACAATAGAGGGTTTGAATTGATAATTTCTAGAGAATTGAATGGTCTTTCTGAACAAGTCTTTTATTTAGTAGGTTACATCGATGAACTACTGCAAAAGCTAAGAACTTAGAAATGGAGAGTAAGTTGAAGAAATGACCTTAAATCTTTTTGTCCGGACTCCGATCGAATTATTTAGAATTAAAAAATGATATAAATAATTTTAATTACGAACAGTGGACAAATTCGGTGTATTACCAAATGACGCACCTATAACCACAATTGAGCCTATTTATTCAAAACCTTAGGCATTGCACGAATCCCCTCCTTTTGGAGCTCTCTCAATCTTATGCTCCCCATGTCCCTGGTAGTAGGTGCTTTTTAAATTTGGTGCCCAAAATTGTTGTCTAATTCCTCCTAAAAAAACCACATTCAAACGATCTATTCTAACTACTCAAAATAACTCTTCATTTCTAACTATTCAAAATAACTTCTCATTTCTAACAATTCATTTCTGATCATTCATTTCCAACTCCTCATTTCAAATCTACATCCACACAAATTTTTGTCTCTAATTCCTCTATAAAAAAAAATCACATCCAAACAAGTTTTTTGCTACAACTTCTCCATAAAATTTAAATTATCTAACTACTCAAAATAACACTCATCCAAACACATGTCAGAGGATGAACTTGAGTTCTATTTAGAGCTTGAATCCTACTCCAAATAGCAAGGCCCAAAGAGGGACCAAAAGAGTTAGTCACTTAACTTAGTAAATCCTATACTGAAACTAAAAGCTCTTGAACAATGAAGTAGAGCTAACCAACACCAACACCTAACTGAAGCCAAAAGCCACTTCAAAACAGATCCCATGAGAAAGTCTAGGAGGCCTAATCAGGAAAATCTTTGTGGGTAAAGTCGACATTGAAGTCATGGTTTTGCAAGCAAAATCGACAACATACCTCATCAGTTAAGCGTCAAGTTCAATAAACTCTCGATGGAGACTCGTACTGAGTATACGCAGCACAACATAATTGATTCAAGACATTTCATCGAAGTTTCGTTGCAGCTAAGAAGCCTGATCTGCACCTACAAACTCCCTTGTGCTTGACATCCTAAAATCAGAAAGAAAATGTTAGGGACGGGTCCATGTGTTTGCCTGTCAACCTCATTTTTTGCTCTACCCTCACATAGAGAAGCTCAAGAAAGTGATAACAAGGGGAGGAATACTGTTAGAAAACACAGTGATTTCTACTTACTAAAAGGCCTTCTTAACTTGCAAAGAGCAATACTTACCAACTTGTATGTGTATATATTATATATACATACCAACGTATATAAGGATAATATTGTGTCGCATCAGTATATGTAAAATG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mRNA sequence

ATGGAAGTGTTTGATTGTGAAACAGATAGATTAATTAAAGACTTAGAGACTAAACTTGTTACTAATCTACTCGTGCTCAACAAATTAGTGGCTGATGATCTTCGTTTGAACAACATGGACATGGAAGAAATCGAAAACAAACTCCCGGTGATTGCTTGTGTTTTGGGTGCGTCCGGCACCGGCCACACGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCATGACGACGATGATGATTCTTTACTCAAGAAAGTGATAACAAGGGGAGGAATACTGTTAGAAAACACAAGCTCGACGATGGATCTTACAACCTTCGTGTTCGCCGTACTTTTCGCTTTACTAGCCGGTTCCGCCTCGGCTCAGTCTCCAGGACCGGCTCCGGCTCAGCGACACCCACCGACTCGGACCGCCACGCCACCATCGTCGCGGCTCGGTCCAACCTTTCCTCCAGAGGCTCCGGCGGCTCTCCCTCCGACGGAAAAGCCGCGTCCGCCGCCACTCGCGCCGATCGCTTCTCCTCCAGCTCCGCCTACGCCTTCTGAAACCTCTCCGGCGACTGCTATATCTCCGCCGCCGCCGACGGATCCCGGTCATGGCGCCGGATCAAGCGGTGTTCGCCGCTGTGGATTTCTTCCTGCAGTTCTCTTTGCGGTGGCGGCGGCGGTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGTGTTTGATTGTGAAACAGATAGATTAATTAAAGACTTAGAGACTAAACTTGTTACTAATCTACTCGTGCTCAACAAATTAGTGGCTGATGATCTTCGTTTGAACAACATGGACATGGAAGAAATCGAAAACAAACTCCCGGTGATTGCTTGTGTTTTGGGTGCGTCCGGCACCGGCCACACGCCGCCGCCGCCGCCACCGCCGCCGCATGACGACGATGATGATTCTTTACTCAAGAAAGTGATAACAAGGGGAGGAATACTGTTAGAAAACACAAGCTCGACGATGGATCTTACAACCTTCGTGTTCGCCGTACTTTTCGCTTTACTAGCCGGTTCCGCCTCGGCTCAGTCTCCAGGACCGGCTCCGGCTCAGCGACACCCACCGACTCGGACCGCCACGCCACCATCGTCGCGGCTCGGTCCAACCTTTCCTCCAGAGGCTCCGGCGGCTCTCCCTCCGACGGAAAAGCCGCGTCCGCCGCCACTCGCGCCGATCGCTTCTCCTCCAGCTCCGCCTACGCCTTCTGAAACCTCTCCGGCGACTGCTATATCTCCGCCGCCGCCGACGGATCCCGGTCATGGCGCCGGATCAAGCGGTGTTCGCCGCTGTGGATTTCTTCCTGCAGTTCTCTTTGCGGTGGCGGCGGCGGTGTAA

Protein sequence

MEVFDCETDRLIKDLETKLVTNLLVLNKLVADDLRLNNMDMEEIENKLPVIACVLGASGTGHTPPPPPPPPHDDDDDSLLKKVITRGGILLENTSSTMDLTTFVFAVLFALLAGSASAQSPGPAPAQRHPPTRTATPPSSRLGPTFPPEAPAALPPTEKPRPPPLAPIASPPAPPTPSETSPATAISPPPPTDPGHGAGSSGVRRCGFLPAVLFAVAAAV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePRINTSPR01217PRICHEXTENSNcoord: 170..191
score: 46.36
coord: 130..146
score: 41.18
coord: 153..165
score: 46.15
coord: 115..127
score: 23.08
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 57..77
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 116..203
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 141..195

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0027979.1Sed0027979.1mRNA