Sed0025782 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAACTATTTCACGATTGTACGAATTTTGTGCAGTAGAGGATGAGGGCGTAAAAGAAAAAAAAAGATTTGAATTCGCTTGTTGAAGATCATGATTACGATCAAATGCTTCAACGAATCATTCCGATCGAATTGAAGGCTACGAAATCGATTGCTGTTGAATCGATTTCCCAGAAGAAGGGAAGAACAAGAGGAATCCATTAGCGAAGCTTTTGATGTTCGATTTCTAGGTATAATTGGGCAAAAAGGGATGGATCCAGAACAAACGTTCATTCGAGTTCAAGAACGGTTTTCCCAGATGTTGACTCCCAAAGTCAGAGCCACTTTGGAGTATGTGAATCTCTGTATCGCCATTACCTTGTTCTGTATTCTCGTCGTCATGCACGCCAACTACGTACAGCAGGTTCTTCCATCATACGACTCTTCTTTGTAATTTGATTTATGTTCGTTTGTGTTTTGGTAGAATTTTAGGTTTGCGATGTTTTAGGGTTCGTCATTTGGTTTTAGGTCTTGGTTATTTTCGAATTGAGTGATTCTGCTGTTTTTTGATTCGATTTTAGTTTTAAAAACATGGGTTGGAGCTTTGAAAATTGTGGTGTAATGTAGTTGACCATGGTAGTTTCACTATTGGGTGTTCTTAGCTTTTTTTCTAGAGTTTTTTTTTTATAGTATGGATTTAGGATTCAGTCTTTTAGATTTACGATGAATTAGGAAGGGAAGGTTGGAATCTGGTTTTAAGGGTTTTCTAAAATGTTTGAATTTAATTCAGCTTGCGTATTGAGTTGAACTCTTTTGGTTTTGGGACACTCTATTTTGAGATAATAAAATGAGTTTTGAAAGAGAAGGAAATGTAGACAGTCTATTTTGAGTTGAACTCTTTTGGTTTTAGGGCACTTTATTTTGAGATGATAAAATCAGTTTTGAAAGAGAATGAAATTTAGATACTATTTTGAGTTGAACTCTTTGGGTGTTTGTTTGACATATTTAGGTAGGATTTAGCTTAAGGAGTTATATTGAGTAGTTAAAAATTGAGAGTTGTAGTAAAAAACTCGTTTGGATGTAGTTTTTGTGTAGAGGAATTAGAGTCAAAACCTTGTTTGGATGTAGATTTAAAATGAATAGTTATTTTTAGTAATTAAAAAAGAAATGATTAAAAATGAGGGGTTAAAAATGAGTTATTTTGATTGATTTGAAAGGAATGATTAAAACTGAGTGGTTAGAAATGATTGAGTAATTATAAATGAATGATTAAAAATGAATGTTTAGAATGTGAGTTATTTTTAAAAGTAAAATGAGGAGTTAGTAACAACTCGTTTGGATCCAAGTGTTGAGGAGGAGTTAATAAATCCTAAAATTAAATCCTACCTAAATATGCCAAACAAACAGCCCCTTTAGTTTTTAGGTTTTTATAGTTTCTCTTGATGCTATAGTCAATATATGGTTGTGTATTGGTGTAAATGCTCTCCCTTTTTCATCACTATAGGCTTTCTTCTCTCTTTTCCAATTGGAGAAGCCTTTCGTAAATTTGCCCCTTCCATTAGGGGCTTCCCCATCTTTTGTATTCTATAATTTCAGACCATCAATGAAATTGTTTCTTATAAATTTTTTAGGGCATGGTTTATTTCTGTTAGTGAATGTTTTTGAGGCATTTTCTTGTATGCATGGACTATATCTTAGTTTTTTAGTTTTATGCTGTTTTAATTAAGCTTTGTTCTTTCTTCATTCAAAGCCTGGTTGTTCAAGTGAGCTCTCTGGAGTTGAGACTACAGAAGCCCAACTTATTCAAATTAAGGTAAAACTTAAACTGCTTCTTGCTTTTGCTGATAATTTCTTTTCGAGAGGGTAGTAATTTTATGGATCAATGTTATCACGGCTTGTCTACAAAGGTTTTTGTTTGAGAAACATGAGTGGATTTTCCAGGGTTCATATAAAATATTAATTTTGTGAAATATTTTTACTACTTAGATTTATTGTTTCTAAGCTATATTCTATGTCGCAGAGCTCAATAATGTGCTCTTGTAATTTTATACTATATGCTAAGTTTTCTGTAACCGTGAGTCTGTGATACTTTTCTGATTTCTGCCAATCCTTTTTGTTTGTCCCGTTGGTTATTTTTGCAATTTCTCATTCCTTCCGTTTTACTCTCTCTGTTGATGTGGTTTTAGTTTCCTGTCTAGAGAATGCTTGCTTTTGTTGAAACGAATTTCTTATTTTGTGCCTAAGAAATATCTTATGATTTTTTGATGTTCCGAACTTCCGTATGTTTTTTTAACCATCTCCTTGATCAGTAAATAAAAATTTTAAATAAAAACATTCTAATCCTATTTATTTATTTATTATTATTTTTAAAAAAAAGAGCCTATGGAGTAGTTCTCATAATTGTTTCTGAACATGAATCATGATTAAACGAAATTTGAGTACAAAATCCTGATTTACTTTTCACTATGATTGTCAATATTGGAAATGCTCCAAGTGTTCAATTTGTATTAACCTATCTTCCTAAATGTATTTTTGTTCTTTCCCTTTTGCTTTCACGATTTCTTGTATACTTCAGTGAATAAAAGCTAAAATTGTGTCATTTTCCTTAGATTACTACTGCAGGCCTGTGGTCACAGAACAACTCTGAACTAAATGTGGAAGATGTCTCTGGTGGGGAAACTGTGAGAGAGAGTCTTGAAGTTGTAGATGATGGAGATGAGTTGACCTTTTTGGCTGCCAAATTTTGGTTAAATTGGTTTGGTTCAGGTGCTAGAAGGGGTAAGACGGCACCTCAGCTCCTGAAATCAGATACAGAGAGTCTGGAACATCAAGCAGAGACAACTGGTTTAGAACAATGCTCCAAAGCAGCAGTTGATGAGACAGTTATCAAACATGACAAAGAAGAGGTACACATTAGTTTTATGATATCAGTCAAGGAGACTTTCAAGGCAGCTATTGCGCATTTCGGTAGAAGATGGAACCGAAGAATTTTATTTATTTGTAGGCATACAAAGCAGATCCTGAACAGCTTGTTGAAGCTATCTGTGAGTATATTGTTGATTGCATTACTTTAAATGCAAGGTTCAAGCATGCTACTTAATTTGTTATAGAGAGTTGAAAACAGATTTGAAAGTGGTCCACTGAGGCATCCACTTTCCACTTTCATTATGGTGTAGGAGAGTTAAAAAAAAATCTAGCATATCCCCGCTTACCTCTCTTATCAAGCTATCTCTTAAATTTCAAGTTGAAATTCTAGCATGTCCTTGCTTACCTATTTTATTCTTTAGACTATTGACCTTTCAAGCTTTATAGTGTAGGAGAGTTTAAAAAAAATCTAGCCCTCTCTTATCAAGCTATCTCATATCCCCACTTTCATTATGGTGTAGGAGAGTTAAAAAAAAATCTAGCATATCCCCGCTTACCTCTCTTATCAAGCTATCTCTTAAATTTCAAGTTCCATCCTGAAATTCTAGCATGTCCTTGCTTACCTATTTTATTCTTTAGACAATTGACCTTTCAGGCTTTATAGTGTAGGAGAGTTAAAAAAAAATCTAGCATATCCCCGCTTACCTCTCTTATCAAGCTATCTCATATCCCCACTTTCATTATGGTGTAGGAGAGTTAAAAAAAAAATCTAGCATATCCCCGCTTACCTCTCTTATCAAGCTATCTCTTAAATTTCAAGTTCCATCCTGAAATTTTAGCGTGTCCTTGCTTACCTATTTTATTCTTTAGACTATTGACCTTTCAAGCTTTATAGTGTAGGAGAGTTAAAAAAAAATCTAGCATATCCCCACTTACCTCTCTTATCAAGTTATCTCATATCCCCACTTTCATTATGGTGTAGGAGAGTTAAAAAAAAATCTAGCATATCCCCGCTTACCTCTCTTATCAAGCTATCTCTTAAATTTCAAGTTCCATCCTGAAATTCTAGCATGTCCTTGCTTACCTATTTTATTCTTTATACTATTGACCTTTCAAGCTTTATAGTCAATAGGTTTTATTCTTTTCAACTCCGGCTTTCGTTCTTATCCTCCTACTTGTATACCTTAATGTTAGTGGAATGTTTTTTAATTCTTACAAAAACTACTTCCGAGCATATTTGATGGTTTCCTTATTGCTAGTGCAGAATGTTGCAGGAATAAATTTGAATCTTGATGTCTCTAAGTGGTCGTGGATTCTTCATCAGGACAGGCTCCAGTCTTCTGCAGGTAAATAAACTACTTTCTTTCTCTTTGTGCATGCTGTCTGTGATTATATGATGACTTGCAATGCTTTATTTAAGTTTAACATTAAGGGTGTGTTTTGGTCCCCATTATGTAAACGGCCGTGTTGGTTATAATAATTCAACCGATGTTTGTCCCACCGTTTATTATAAACAGTGGTTACCTAAACCTCCATGCCCGTTTATCTAAACCTTACATATATCACTTTTTGTTGCATAACCAACCCCTCAAACACCGTTTATCGTAATTCTTGTTATAATAACTTGCCCCTCAAACACCATTTATAATAACTCACCGTTTATCATAACTCACCATTTATTATAACCTTCCGTCTACTATAACCAAGCCGGTGCTCCAAACACACCCTAATAGTGCATTGAGAACTAGCCTTATACTTTGCAAAATTGTTTCCATATCCTTGAAGTTTATGATCATATTATTTGATTTTTGTGTTGAGAATTATCTATCCCCATTTTTGTGTTGAGAATTATTTATCCCCATTTTTGTGTTGAGAATTATTTATCCCCTTTTAAGATTTTAAGCATAAGTAGCGTGTATATATATTTTGAATCAGGCTAAATTCACAGTCAACCCAAAAGTTTAAACCGATGGATTCTGATAAAGTTAATTATATCGACCCACACTCCATGCTTCTCGTGGACTGGAAAATTTGGAAATGGCCATCAAGTAAAAATCGTGAAATGATTTGGTAAAGTTTTGAACATATGTTCTCTTGCTTTGATATTATCTTGAATTTTGGGACGAAAAATAATCTTTATTATTATATTTC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Match: XP_023535923.1 (uncharacterized protein LOC111797202 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1050.8 bits (2716), Expect = 4.3e-303 Identity = 540/590 (91.53%), Postives = 564/590 (95.59%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. NCBI nr
Match: XP_038883767.1 (membralin-like protein At1g60995 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1050.4 bits (2715), Expect = 5.7e-303 Identity = 539/590 (91.36%), Postives = 561/590 (95.08%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. NCBI nr
Match: XP_022979782.1 (uncharacterized protein LOC111479380 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1048.5 bits (2710), Expect = 2.2e-302 Identity = 539/590 (91.36%), Postives = 563/590 (95.42%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. NCBI nr
Match: XP_022942498.1 (uncharacterized protein LOC111447515 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1047.3 bits (2707), Expect = 4.8e-302 Identity = 538/590 (91.19%), Postives = 563/590 (95.42%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. NCBI nr
Match: XP_004146263.1 (membralin-like protein At1g60995 [Cucumis sativus] >KGN57586.1 hypothetical protein Csa_010225 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1045.0 bits (2701), Expect = 2.4e-301 Identity = 538/590 (91.19%), Postives = 559/590 (94.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GWG6 (Membralin-like protein At1g60995 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g60995 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 704.5 bits (1817), Expect = 1.0e-201 Identity = 395/595 (66.39%), Postives = 444/595 (74.62%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4ZIN3 (Membralin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TMEM259 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 2.6e-16 Identity = 94/333 (28.23%), Postives = 161/333 (48.35%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CIV2 (Membralin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tmem259 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 4.4e-16 Identity = 91/327 (27.83%), Postives = 160/327 (48.93%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IPM6 (uncharacterized protein LOC111479380 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479380 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1048.5 bits (2710), Expect = 1.0e-302 Identity = 539/590 (91.36%), Postives = 563/590 (95.42%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FUZ4 (uncharacterized protein LOC111447515 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447515 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1047.3 bits (2707), Expect = 2.3e-302 Identity = 538/590 (91.19%), Postives = 563/590 (95.42%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LC25 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G219210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1045.0 bits (2701), Expect = 1.2e-301 Identity = 538/590 (91.19%), Postives = 559/590 (94.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3M8 (uncharacterized protein LOC103496115 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496115 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1036.2 bits (2678), Expect = 5.4e-299 Identity = 537/590 (91.02%), Postives = 557/590 (94.41%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D7A5 (uncharacterized protein LOC111017680 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1033.1 bits (2670), Expect = 4.5e-298 Identity = 531/590 (90.00%), Postives = 558/590 (94.58%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0025782 vs. TAIR 10
Match: AT1G60995.1 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 10 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Membralin (InterPro:IPR019144); Has 172 Blast hits to 170 proteins in 70 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 110; Fungi - 0; Plants - 38; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 24 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 704.5 bits (1817), Expect = 7.1e-203 Identity = 395/595 (66.39%), Postives = 444/595 (74.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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