Sed0025150 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0025150
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG06: 9784236 .. 9792028 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0025150
SyntenySed0025150
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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ATGGCTATGGCCATGGCGGCCCTTATTTTGTCGCTGAGTGCCAGACGCTGCAATGCCGGCAATCAGACCCTTGCCACTGTTGCAGTCATGCGATGCGATGGCGGCATGGATAAATGCCTCGTTGGAGAAGACGATGTCGAGTACTCGTTTCAAAACCAGTTTACTTCTGAACCGAATCCTGGTGTTGGTGAAACCTCAATCCTGAATAAACCTACATGCGACCGACCTGATTCGAGGTATGTCTGTCTCGATCCTCCAAGAGATATCAACGCACAAAAATGTTCACCATTTACGCGCGCCGGTTGCTGAACTAATAAGCAGATGTAGAACGTTAAGTAGACGTGTGTACTTGTCCGTCAATTGCTTCACCAGCTATTCGTTGTCCAATGTACCTTATAATGGTCATTTAAATTTATCTCATATTTGTACCTCTACTTGCCTATGTGAGGTTTCACCTTCACTAATTCACTTCCAATTTCTCCTCTACTCTGCAAATTATATTTCTTTGCCATTTATTTGGAAGCAACAAAAGGGTTCAAATATAGCGAAGTTCATACATATGGTGAATCTTTATTACGAATTTGGTGTGAACCAGATCTGAACATAACTCAAGTATTATGATCTAGTGATCCAATGAGGCAACGCGAGTTTAATTTCTTATTCTCAAATGTTATTGAATTCAAAATACAAAATTACAAAATTAAGACTTTGTTTGATAACCATTTGGTATTTTATTTTTGGTTTTCGAAATTTAAAGTTATTTTTACTTAAATTTCATACCAGCAGTTTATATTTCCTACATAGTATCCATATTGTCTTAACATACTGTCCAAATGCACAAAATGGTTATCAAACGGGTCTAAATCTTTATAATTTGAAAAAAAAAATTGAAATTTAATTGGGCAAATGAAGAATCTTTTGTATTTTGCTCAAAGTGTGGGTTAAATTGTCGAGTGAGTTAATAAATACCGAGAGGTTGAAGTCTAAGGGTTACATTAAATTATAGCCAATTTTTGATAGATCAATTATTAACTCACATCATTAAAAAATACAAAAGATTACGTTATTCATACGCAAAGAGTAACTGTCACCACACACACATATATATGGAAACAAACTGTCACCATATTTAATTTGCTAGCAATTACAAAATTAAAAACTATTTATCAAATTTATTAAATCATAGAACTAATTTTTAACTTTAAAATTATAGGACTAAATTAAACTTTTACTGAGTCAAAAAATTTGTACAATTTTTATGACTCTAGAAGTTAAAGCTTTTCTTTTCTAAACCGTGGAGCACCACTTATTCGTCGATCATGATACATCATAGGACTAAAAGTGAAAATGAGAGACTTTGAGGGGAGCATACTACAAACGTTTAAGTGGTCGTTCACTTCATGATAATCCAAGATTCTCATGAGATGAACATCTAGATTACCACGTTTCTTTTCCAGTAATAAAAAAAATTCAGGCATCCTGAGATGCCCGACATCCTAGGATACCTATCAAAGAGTCATTTGCATGCCCTCCCCTATCATGAATTTTTATGATGCACATGTAGAGGCCATCCTTAGGATACCTATCAAAGAGTCGATTACACTTTTGCTCTTACAATTTTTTTTTTTGATAAAATTTTATATTTGTATCAATTTTTCTCTATATTTTGTGTGTACTAATTTGTACCTTAAAAATAATAAATATATATATTTTATACATAATTATTATGCATTAACAAATAAGCATCCATAATTAATTATATTTATATTTTTTATTTTGTTTTGTTTTAAATGCATTAAATTTAATAATATTTTGATTATTTTTAATTAAAATCAAAAGTGTATTGACTTTTGTTATATTTTTTAAATATAATTATCCTCACTTTCTATAATTAAAATTTTTTTACTTGTTCAACTCATAAATGAATTATATTTTTTTTCTAGGTAAATTTATTTTAAAATACAATATTCAAATTATGGATTTTTTTCATAAATATACCATATTTGAAAAGTATTTGCAAATATATGCATCTGCAAAAATATTAGCAAAATTTAATTTTATTTTAATACTTTATAAATTCCGAAAATAATGAATTACAATAATATCCTTAATTTCTTGATTTTTCATTTGGAAAGTGAAATTTTAAAAAAGGAAATTCTCACATTCCAAACAAGAAACTGCCAATTTAGGGTGCATTAATTGTGGAAAACCAAAAACCTCCAATTTATAGTGCATTAATTGTGGAAAACCAGAAACCGCCAATTTATGGTGCATTAATTGGTGAGCGAAAGTGTTGACAGTATATTGTTAGAGCTATATAGTTGTCATTTATATACAGTAAAGTTAGTAATGTACATGTTATTTTATTCTGGTAATTTTGTTCATAGATAGACCGTATGAGTTGTTGAATGTTCAATTTCGTTGATTGAAATCAGAACCCGTTTGATAACCACACAGTACTGAAATAACTTGGTATATATGGTACACTCATAATATATCATGTACCATACTACATTTTAAAACTTTATATTTTTTTAAAAGTATTTAATTTGTTGAGATGGATACTTGTACTGTGATTTAATATGAATGCAACAACGAACAAGTAATTTTAAATGTACTAACTTTTGAATGTATCACACCGTATAGTAAAACATTTGGAAATAACATACGTATTATTTGTGAATTGATAGAGTCGTATTGTTGTAACAACTTCACACAAAATTACTATTCAAAGTGAGATCAATAGTAAATAAAAAAGGTCTCATGAATTACAAAATTGAAACTGAAAGTGTTCGGTATAAAAAAATACTATAATGTAAAATCATCATTGGGTGAATGAGTTTCTCAATATTTATGCGATGCTCTTAAGCTACTTCATGATTATGGTACATCTTCATTTTCATCCCACTGACACTATGTGCAATACGGATTGAGATGTTTGTTGAACCTATAAGGAAAAATTGTATAGTATTATAAAAATGTCCAAACAGTACTGTACTATAATATTAGTTGTATAATATACATGTAAAAACAATACCGTTCTGCGAAATATAAATGTAATGGATAGTAATATGAGTACAAAAAATGTATTAGACATGAATAGAATGAATAATAAACCATAAATGTACCATGTAAGTTATATAGTATGTAGAATGAAATAATGCATATATAGTTTATACAGTATATAATTATACAGTATGTAGAATGAAACATATATAGTTATACAGTATGTAGAATGAAACATATATAGTTTTGTATAGTTTATACAGTAATATAACAGTACATGACAAACTACAGTCTTAATGGTATTATACAAATGGAATGATTGATGAACCTATAAGGAGAAGATGTACAGTATAACTAACCTAAAAACACAGTATGAACATACGATATATACTAAATTATACAGTTTTTGCAGATGTGTATATAGTTAATTATACCACACTAAGAAAATTAAAGTACGAAGAAACTACTGTTCTACATTTGATTTTGCTGCATTTCTAAACATGATTTTTGACATTCAAAAGACTGGAATGTAAATAAATTAAATGTACAGAAATGACAAAATTTGATTAAAACTGATCATACTCTACATGGCGAACTGCAGTATTAATGGTATTATACAGATGAAATGATTGATGAACCTATAAGGAGAAGATGTACAGTATAACTAACCTAAAAATATCGTATGAACAAATGGTATAGACTTAATTGTACAGTTTTGTAGATGTATATATAGTCAATTGTACCAGAATATGGAAATCAAAGTACGAAGAAATCATTGTTCTACATATGATTTTACTGCATTTCTACACATGATTTTTGACATTCTAAATACTGTAATTTTAATAAAATAAATGTACAGAAATGACAGAATAGGAATAAAACATACCATATTGAACCATCCGAGACATATAAGATTACGATTATACTCGAATGAACAGTAACCTACTGATGGTGATGAATAAGAAACAAAAATGTAATACAAATACCATGAAAAATGGAGATTATTGAGAGGAGATGGTTGAATTTGTATGATTATACCGTCCGATCGGAGCTTTGTGGTTGACGACAATTTACGTGGTGGCCGAAATGTGAAAAGAGAGAATGAATGAAACTGAAGAAACGAAAATGGAGGAATAGAGAATGGATGAAGAAAAGTGAAACGAAAAAAAGAATAGGAAGAAAGATAAGAGATAAATGAGAAAGGAATTAAAATCTCATTACATTAAAAATGTTGACAATTATATATGGTGATGAATGAGGAAGAAAAACATAATCCAAAAACTGTGTAAAACGGAGATTAGTGAACGAAGATGAATTAACTCGTCGAATTATACCGTCCGGTCGGACCTGAGTTGCCGACAAGAATTTACGCATTTGCAAGTGAAAAGTGAGAAGGAAAAAACACAGAAGAAATGAAAATGGAGGATTGGAAATAACGAAATGGAGAATGCAGGAAGAAAAAATGGAACGAAAAAGAAATGTGAATAATAATGAGAGATGTTTAAAGGAATAAAAATCTCTTTACATTTAATGAGTTGAAAATTAAATATGGTATCTTTTAAGTGATGGAAAGTTTTTAAATTGAAGGTTTAAATTCAAAAATTCTTTCTTAAATGTGAATAAGGGCAAAACGGTAATAAAAAATAAATATAAATTTCAGAATTTAAAATAAAAATTAACTTTGCAAAAAAAAAAAAACTTGGACGCCTAAATTTGCAAATACTTTTTCAATATGGTCTAGTTACTACAATTTCAATTCAAATTAATAAAAAAAAACGATATATAGATTTTAATTATACAAATTAATGTGTACATTAAGTTATGAGGGCATTTAAGACATTTTCATTAACAAAACTTATAAAATAAATACAGTTTTTAAAATACCCATAAAAATAATACTACAAAACAAACATGGTGATCTAAGAATGCCGGACATCTGAAATTCTGGGCATCAAAAGATTCTGGTTATCCTGATTGCCACAAAGTAAACGACC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mRNA sequence

ATGGCTATGGCCATGGCGGCCCTTATTTTGTCGCTGAGTGCCAGACGCTGCAATGCCGGCAATCAGACCCTTGCCACTGTTGCAGTCATGCGATGCGATGGCGGCATGGATAAATGCCTCGTTGGAGAAGACGATGTCGAGTACTCGTTTCAAAACCAGTTTACTTCTGAACCGAATCCTGGTGTTGGTGAAACCTCAATCCTGAATAAACCTACATGCGACCGACCTGATTCGAGGAAACCTTGGGAACTCGAGTGGAAACTCGCGTTGGCACAGTTTCCAGTTACGGAGGCTGGAGCCACTGGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGCTATGGCCATGGCGGCCCTTATTTTGTCGCTGAGTGCCAGACGCTGCAATGCCGGCAATCAGACCCTTGCCACTGTTGCAGTCATGCGATGCGATGGCGGCATGGATAAATGCCTCGTTGGAGAAGACGATGTCGAGTACTCGTTTCAAAACCAGTTTACTTCTGAACCGAATCCTGGTGTTGGTGAAACCTCAATCCTGAATAAACCTACATGCGACCGACCTGATTCGAGGAAACCTTGGGAACTCGAGTGGAAACTCGCGTTGGCACAGTTTCCAGTTACGGAGGCTGGAGCCACTGGTTGA

Protein sequence

MAMAMAALILSLSARRCNAGNQTLATVAVMRCDGGMDKCLVGEDDVEYSFQNQFTSEPNPGVGETSILNKPTCDRPDSRKPWELEWKLALAQFPVTEAGATG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 54..78

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0025150.1Sed0025150.1mRNA