Sed0024619 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0024619
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionprotodermal factor 1-like isoform X1
LocationLG04: 44269866 .. 44271723 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0024619
SyntenySed0024619
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
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ATGAACATAATGGGAAGAGTATCATTAGCTTCTCTTCTGCTATGGACTCTCATTTTTGGGTTGCTTTCTCAAAACATGGCCATCGCTTTGACGCCTGCAAGTAATGAAGATCAGAAGACTTACTACACTCCAGACCCACATGCAGCAAGCCCACCTCCAGGTTTCTCTATCACACACACACAGACACACATTCCCTCGCATCCATGGTTCCCAAATATATTTTATTGTTTGTTGAGATACATTCCTAACCGCTAACCCACATTGAAACTTGTAAAACTATATGTTTTTAAGTATTAAAATCTTGACAAAGTGCATACCTTAGTTTTTTTTTTTTACTCATGATCCAGTATTTTTGGTCTTTGTAGATGGTATGCATGAGAGTCCAGCTTATGGTACACCACCACCTAAAGGTTCGGGAGAAAGCCATGAAGGAAAACCACCCTCACATGGACATGGTGGTAAAAAACACAGCCCAAAACCAAAACCAGGGAATTGCGAAAACCCACCATACACTCCTACTCCACCCAAACCTCCTTCTGGTCATAAACCTCCTACACATGGTCAAACCCCACACAAGCCTCCTTCCGGTGGAGGTGGACACCACAACCCTCCTAAATATGATCCAACCCCATCCAATCCTCCTGGTGGTGGTGGCTACTACAACCCTCCAAGTCATGATCCTACTCCACCTACTCCGTCTCCATCAACTCCGACCCCGTCTACTCCGACTCCATCAACTCCGACCCCGTCTACACCGACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCACATGGTCCTACTCCAACCCCATCAACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAAATGATCCTACTCCAACACCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATACTATAGCCCTCCAATTGATCCAACTCCAACACCATCTACTCCTTCGGGTGGTGGTGGATACTATAGCCCTCCAAATGATCCTACTCCAACACCATCCACACCTTCAACTCCTTCAGGTGGTGGCGGATACTATAGCCCTCCAAATGATCCAACTCCAACACCATCCACTCCTTCAGGAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAAATGATCCTACCCCATCAACTCCTTCAACTCCTTCAGGTAGTGGTGGATACTATAGCCCTCCAGCTTATGATCCTACCCCATCAACTCCATCAGGCGGTAGTCCTCCAGCTTATGATCCTACTCCGTCAACTCCATCAACTCCATCGACTCCATCAGGCGGTAGTGGATACTACAGCCCTCCAACTTATGATCCTACCCCAACAACTCCATCAACTCCTTCAGATGGTACACCATTCTACGGAACCCCACCAACCACATCAGCACCTCCCTTCGTTCCTGATCCCAATACCCCCTTTACTGGCACATGCAAGTAAGTAACTACAATAATTTTTCCATTGTTGCTCAAAGAAAGAAACAGCCTTCCTTCCCCTGCATATTTTCCAATACTAACAAACATCCTATGATCGTGCATTTTAAGCTATTGGATGGCGCACCCAGGATTAATATGGGGGATGCTGGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAATGTTTTTGGTATGACAGGCTCTCCTGTCTTTGGAACAACTCTCACCTTGCCACAAGCACTCGCAAACTCACGAACTGATGGCTTAGGAGCGCTGTACCGACAAGGAGCTGCAGCTTTTTTGAACTCCATGGCCAACAACAGATACCCCTTTACAACCAATCAAGTCCGTCAAAGTTTTGTTTCGGCGCTGAGCTCAAACCAAGCAGCAGCAGCTCAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCCAACGAGGGTAGATTCAAGCCTAGAACCTGA

mRNA sequence

ATGAACATAATGGGAAGAGTATCATTAGCTTCTCTTCTGCTATGGACTCTCATTTTTGGGTTGCTTTCTCAAAACATGGCCATCGCTTTGACGCCTGCAAGTAATGAAGATCAGAAGACTTACTACACTCCAGACCCACATGCAGCAAGCCCACCTCCAGATGGTATGCATGAGAGTCCAGCTTATGGTACACCACCACCTAAAGGTTCGGGAGAAAGCCATGAAGGAAAACCACCCTCACATGGACATGGTGGTAAAAAACACAGCCCAAAACCAAAACCAGGGAATTGCGAAAACCCACCATACACTCCTACTCCACCCAAACCTCCTTCTGGTCATAAACCTCCTACACATGGTCAAACCCCACACAAGCCTCCTTCCGGTGGAGGTGGACACCACAACCCTCCTAAATATGATCCAACCCCATCCAATCCTCCTGGTGGTGGTGGCTACTACAACCCTCCAAGTCATGATCCTACTCCACCTACTCCGTCTCCATCAACTCCGACCCCGTCTACTCCGACTCCATCAACTCCGACCCCGTCTACACCGACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCACATGGTCCTACTCCAACCCCATCAACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAAATGATCCTACTCCAACACCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATACTATAGCCCTCCAATTGATCCAACTCCAACACCATCTACTCCTTCGGGTGGTGGTGGATACTATAGCCCTCCAAATGATCCTACTCCAACACCATCCACACCTTCAACTCCTTCAGGTGGTGGCGGATACTATAGCCCTCCAAATGATCCAACTCCAACACCATCCACTCCTTCAGGAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAAATGATCCTACCCCATCAACTCCTTCAACTCCTTCAGGTAGTGGTGGATACTATAGCCCTCCAGCTTATGATCCTACCCCATCAACTCCATCAGGCGGTAGTCCTCCAGCTTATGATCCTACTCCGTCAACTCCATCAACTCCATCGACTCCATCAGGCGGTAGTGGATACTACAGCCCTCCAACTTATGATCCTACCCCAACAACTCCATCAACTCCTTCAGATGGTACACCATTCTACGGAACCCCACCAACCACATCAGCACCTCCCTTCGTTCCTGATCCCAATACCCCCTTTACTGGCACATGCAACTATTGGATGGCGCACCCAGGATTAATATGGGGGATGCTGGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAATGTTTTTGGTATGACAGGCTCTCCTGTCTTTGGAACAACTCTCACCTTGCCACAAGCACTCGCAAACTCACGAACTGATGGCTTAGGAGCGCTGTACCGACAAGGAGCTGCAGCTTTTTTGAACTCCATGGCCAACAACAGATACCCCTTTACAACCAATCAAGTCCGTCAAAGTTTTGTTTCGGCGCTGAGCTCAAACCAAGCAGCAGCAGCTCAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCCAACGAGGGTAGATTCAAGCCTAGAACCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAACATAATGGGAAGAGTATCATTAGCTTCTCTTCTGCTATGGACTCTCATTTTTGGGTTGCTTTCTCAAAACATGGCCATCGCTTTGACGCCTGCAAGTAATGAAGATCAGAAGACTTACTACACTCCAGACCCACATGCAGCAAGCCCACCTCCAGATGGTATGCATGAGAGTCCAGCTTATGGTACACCACCACCTAAAGGTTCGGGAGAAAGCCATGAAGGAAAACCACCCTCACATGGACATGGTGGTAAAAAACACAGCCCAAAACCAAAACCAGGGAATTGCGAAAACCCACCATACACTCCTACTCCACCCAAACCTCCTTCTGGTCATAAACCTCCTACACATGGTCAAACCCCACACAAGCCTCCTTCCGGTGGAGGTGGACACCACAACCCTCCTAAATATGATCCAACCCCATCCAATCCTCCTGGTGGTGGTGGCTACTACAACCCTCCAAGTCATGATCCTACTCCACCTACTCCGTCTCCATCAACTCCGACCCCGTCTACTCCGACTCCATCAACTCCGACCCCGTCTACACCGACTCCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCACATGGTCCTACTCCAACCCCATCAACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAAATGATCCTACTCCAACACCATCTACTCCTTCAGGTGGTGGTGGATACTATAGCCCTCCAATTGATCCAACTCCAACACCATCTACTCCTTCGGGTGGTGGTGGATACTATAGCCCTCCAAATGATCCTACTCCAACACCATCCACACCTTCAACTCCTTCAGGTGGTGGCGGATACTATAGCCCTCCAAATGATCCAACTCCAACACCATCCACTCCTTCAGGAGGTGGTGGATACTACAGCCCTCCAAATGATCCTACCCCATCAACTCCTTCAACTCCTTCAGGTAGTGGTGGATACTATAGCCCTCCAGCTTATGATCCTACCCCATCAACTCCATCAGGCGGTAGTCCTCCAGCTTATGATCCTACTCCGTCAACTCCATCAACTCCATCGACTCCATCAGGCGGTAGTGGATACTACAGCCCTCCAACTTATGATCCTACCCCAACAACTCCATCAACTCCTTCAGATGGTACACCATTCTACGGAACCCCACCAACCACATCAGCACCTCCCTTCGTTCCTGATCCCAATACCCCCTTTACTGGCACATGCAACTATTGGATGGCGCACCCAGGATTAATATGGGGGATGCTGGGCTGGTGGGGAACAATGGGCAATGTTTTTGGTATGACAGGCTCTCCTGTCTTTGGAACAACTCTCACCTTGCCACAAGCACTCGCAAACTCACGAACTGATGGCTTAGGAGCGCTGTACCGACAAGGAGCTGCAGCTTTTTTGAACTCCATGGCCAACAACAGATACCCCTTTACAACCAATCAAGTCCGTCAAAGTTTTGTTTCGGCGCTGAGCTCAAACCAAGCAGCAGCAGCTCAGGCCCAGGTTTTCCAGATGGCCAACGAGGGTAGATTCAAGCCTAGAACCTGA

Protein sequence

MNIMGRVSLASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESPAYGTPPPKGSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSGHKPPTHGQTPHKPPSGGGGHHNPPKYDPTPSNPPGGGGYYNPPSHDPTPPTPSPSTPTPSTPTPSTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPHGPTPTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSGGGGYYSPPIDPTPTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPSTPSTPSGSGGYYSPPAYDPTPSTPSGGSPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPTTPSTPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWMAHPGLIWGMLGWWGTMGNVFGMTGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGLGALYRQGAAAFLNSMANNRYPFTTNQVRQSFVSALSSNQAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Homology
BLAST of Sed0024619 vs. NCBI nr
Match: XP_011657562.2 (protodermal factor 1 isoform X1 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 632.1 bits (1629), Expect = 4.2e-177
Identity = 394/546 (72.16%), Postives = 422/546 (77.29%), Query Frame = 0

Query: 9   LASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESPAYGTPPPK 68
           LASLLLWTLI GL+SQN+AI LT A NEDQKTYYTPDPHA SPP D  H +P YG+PPP 
Sbjct: 5   LASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDS-HGNPPYGSPPPH 64

Query: 69  GSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSGHKPPTHGQTPHKPPSG 128
           GSG SH GKPPSHGHGGKKH  KPKPGNC NPPYTPTP KPP+    P+   TP KPPSG
Sbjct: 65  GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH--KPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPS---TPSKPPSG 124

Query: 129 GGGHHNPPKYDPTPSNPPGGGGYYNPPSHD--PTPPTPSPSTPT-------PS---TPTP 188
           GGGHHNP         P GGGGY +PPSHD  PTP TP+PSTP+       PS   TPTP
Sbjct: 125 GGGHHNP---------PTGGGGYNSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPSNDPTPTP 184

Query: 189 STPTPSTPTPSTPSGGGYYSPP-HGPTPTPSTPS-------GGGGYYSPP-NDPTPTPST 248
           STPTPS  TPSTPSGGGYYSPP H PTPTPSTP+        GGGYYSPP +DPTPTPST
Sbjct: 185 STPTPS--TPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPST 244

Query: 249 PS-------GGGGYYSPPI-DPTPTPSTPS-------GGGGYYSPPN-DPTPT-PSTPST 308
           P+        GGGYYSPP  DPTPTPSTP+        GGGYYSPP  DPTPT PSTPST
Sbjct: 245 PTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPST 304

Query: 309 PSGGGGYYSPPN-DPTPTPSTPSGGGGYYSPPN-DPTPSTPSTPSGSGGYYSPPAYDPTP 368
           PSGGGGY SPP  DPTPTPSTPSGGGGY SPP  DPTP TPSTPSG GGYYSPP YDPTP
Sbjct: 305 PSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTP-TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTP 364

Query: 369 STPSGGSPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPTTPSTPSDGTPFYGTPPTTS 428
           STP                    PSGG GY SPPT+DPTP+TP  PS GTPFYGTPPTTS
Sbjct: 365 STP--------------------PSGGGGYNSPPTFDPTPSTP--PSGGTPFYGTPPTTS 424

Query: 429 APPFVPDPNTPFTGTCNYWMAHPGLIWGMLGWWGTMGNVFGMTGSPVFGTTLTLPQALAN 488
           APPFVPDPN+PFTGTCNYW  HPG+IWG+LGWWGTMG+ FG+T +P FG TL+LPQAL+N
Sbjct: 425 APPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSN 484

Query: 489 SRTDGLGALYRQGAAAFLNSMANNRYPFTTNQVRQSFVSALSSNQAAAAQAQVFQMANEG 515
           +RTDGLG+LYR+GAAAFLNSM NNRYPFTTNQVR+SFVSALSSN+AAAAQAQVFQMANEG
Sbjct: 485 TRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEG 510

BLAST of Sed0024619 vs. NCBI nr
Match: KAE8647347.1 (hypothetical protein Csa_003649 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 623.2 bits (1606), Expect = 1.9e-174
Identity = 380/534 (71.16%), Postives = 407/534 (76.22%), Query Frame = 0

Query: 9   LASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESPAYGTPPPK 68
           LASLLLWTLI GL+SQN+AI LT A NEDQKTYYTPDPHA SPP D  H +P YG+PPP 
Sbjct: 5   LASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDS-HGNPPYGSPPPH 64

Query: 69  GSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSGHKPPTHGQTPHKPPSG 128
           GSG SH GKPPSHGHGGKKH  KPKPGNC NPPYTPTP KPP+    P+   TP KPPSG
Sbjct: 65  GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH--KPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPS---TPSKPPSG 124

Query: 129 GGGHHNPPKYDPTPSNPPGGGGYYNPPSHDPTPPTPSPSTPTPSTPTPSTPTPSTPTPST 188
           GGGHHNP         P GGGGY +PPSHDP                  TPTPSTPTPST
Sbjct: 125 GGGHHNP---------PTGGGGYNSPPSHDP------------------TPTPSTPTPST 184

Query: 189 PSGGGYYSPP-HGPTPTPSTPS-------GGGGYYSPP-NDPTPTPSTPS-------GGG 248
           PSGGGYYSPP + PTPTPSTP+        GGGYYSPP +DPTPTPSTP+        GG
Sbjct: 185 PSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGG 244

Query: 249 GYYSPPI-DPTPTPSTPS-------GGGGYYSPPN-DPTPT-PSTPSTPSGGGGYYSPPN 308
           GYYSPP  DPTPTPSTP+        GGGYYSPP  DPTPT PSTPSTPSGGGGY SPP 
Sbjct: 245 GYYSPPTNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPT 304

Query: 309 -DPTPTPSTPSGGGGYYSPPN-DPTPSTPSTPSGSGGYYSPPAYDPTPSTPSGGSPPAYD 368
            DPTPTPSTPSGGGGY SPP  DPTP TPSTPSG GGYYSPP YDPTPSTP         
Sbjct: 305 YDPTPTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTP-TPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTP--------- 364

Query: 369 PTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPTTPSTPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPF 428
                      PSGG GY SPPT+DPTP+TP  PS GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPN+PF
Sbjct: 365 -----------PSGGGGYNSPPTFDPTPSTP--PSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNSPF 424

Query: 429 TGTCNYWMAHPGLIWGMLGWWGTMGNVFGMTGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGLGALYRQ 488
           TGTCNYW  HPG+IWG+LGWWGTMG+ FG+T +P FG TL+LPQAL+N+RTDGLG+LYR+
Sbjct: 425 TGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYRE 482

Query: 489 GAAAFLNSMANNRYPFTTNQVRQSFVSALSSNQAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 515
           GAAAFLNSM NNRYPFTTNQVR+SFVSALSSN+AAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 485 GAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 482

BLAST of Sed0024619 vs. NCBI nr
Match: XP_031743089.1 (protodermal factor 1 isoform X2 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 613.6 bits (1581), Expect = 1.5e-171
Identity = 383/538 (71.19%), Postives = 411/538 (76.39%), Query Frame = 0

Query: 9   LASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESPAYGTPPPK 68
           LASLLLWTLI GL+SQN+AI LT A NEDQKTYYTPDPHA SPP D  H +P YG+PPP 
Sbjct: 5   LASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDS-HGNPPYGSPPPH 64

Query: 69  GSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSGHKPPTHGQTPHKPPSG 128
           GSG SH GKPPSHGHGGKKH  KPKPGNC NPPYTPTP KPP+    P+   TP KPPSG
Sbjct: 65  GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH--KPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPS---TPSKPPSG 124

Query: 129 GGGHHNPPKYDPTPSNPPGGGGYYNPPSHDPTPPTPSPSTPTPSTPTPSTPTPSTPTPST 188
           GGGHHNP         P GGGGY +PPSHDP                  TPTPSTPTPST
Sbjct: 125 GGGHHNP---------PTGGGGYNSPPSHDP------------------TPTPSTPTPST 184

Query: 189 PSGGGYYSPP-HGPTPTPSTPS-------GGGGYYSPP-NDPTPTPSTPSGGGGYYSPPI 248
           PSGGGYYSPP + PTPTPSTP+        GGGYYSPP +DPTPTPSTP+          
Sbjct: 185 PSGGGYYSPPSNDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPSHDPTPTPSTPT---------- 244

Query: 249 DPTPTPSTPSGGGGYYSPP-NDPTPTPS--TPSTPS--GGGGYYSPP-NDPTPTPSTPS- 308
               TPSTPS GGGYYSPP +DPTPTPS  TPSTPS   GGGYYSPP NDPTPTPSTP+ 
Sbjct: 245 --PSTPSTPS-GGGYYSPPSHDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTNDPTPTPSTPTP 304

Query: 309 ------GGGGYYSPPN-DPT---PSTPSTPSGSGGYYSPPAYD--PTPSTPSGG----SP 368
                  GGGYYSPP  DPT   PSTPSTPSG GGY SPP YD  PTPSTPSGG    SP
Sbjct: 305 STPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSP 364

Query: 369 PAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPTTPSTPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVPDP 428
           P YDPTPSTP     PSGG GY SPPT+DPTP+TP  PS GTPFYGTPPTTSAPPFVPDP
Sbjct: 365 PTYDPTPSTP-----PSGGGGYNSPPTFDPTPSTP--PSGGTPFYGTPPTTSAPPFVPDP 424

Query: 429 NTPFTGTCNYWMAHPGLIWGMLGWWGTMGNVFGMTGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGLGA 488
           N+PFTGTCNYW  HPG+IWG+LGWWGTMG+ FG+T +P FG TL+LPQAL+N+RTDGLG+
Sbjct: 425 NSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGS 484

Query: 489 LYRQGAAAFLNSMANNRYPFTTNQVRQSFVSALSSNQAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 515
           LYR+GAAAFLNSM NNRYPFTTNQVR+SFVSALSSN+AAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 485 LYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 489

BLAST of Sed0024619 vs. NCBI nr
Match: XP_038888912.1 (protodermal factor 1-like [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 604.4 bits (1557), Expect = 9.4e-169
Identity = 379/540 (70.19%), Postives = 406/540 (75.19%), Query Frame = 0

Query: 1   MNIMGRVSLASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESP 60
           MNIM R  LASLLLWTLI GL+SQN AI LT ASNEDQKTYYTPDPHA S PP G   SP
Sbjct: 1   MNIMER-RLASLLLWTLIVGLVSQNKAIPLTSASNEDQKTYYTPDPHAGS-PPSGSQGSP 60

Query: 61  AYGTPPPKGSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSG----HKPP 120
            YGTPPP+GSG SH GKPPSHGHGGKKH+  PKPG C NPP+TPTP KPPSG    + PP
Sbjct: 61  PYGTPPPRGSGGSHGGKPPSHGHGGKKHN--PKPGKCGNPPHTPTPSKPPSGGGGYYNPP 120

Query: 121 THG---QTPHKPPSGGGGHHNPPKYDPTPSNPP-GGGGYYNPPSHDPTPPTPSPSTPTPS 180
           TH     TP KPPSG GG+HNPP Y+PTPSNPP GGGGYY+PP+HDP             
Sbjct: 121 THDPTPSTPSKPPSGDGGYHNPPTYNPTPSNPPSGGGGYYSPPTHDP------------- 180

Query: 181 TPTPSTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPP-HGPTPTPSTPSGGGGYYSPPNDPTP-TPSTPSG 240
                TPTP TP+     GGGYYSPP + PTPTPSTP       S P   TP TPSTPS 
Sbjct: 181 -----TPTPLTPSNPPSGGGGYYSPPSYDPTPTPSTP-------STPTPSTPSTPSTPS- 240

Query: 241 GGGYYSPP-IDPTPTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPP-NDPTP-- 300
           GGGYYSPP  DPTPTPSTP+            TPTPSTPSTPS GGGYYSPP NDPTP  
Sbjct: 241 GGGYYSPPSYDPTPTPSTPT----------PSTPTPSTPSTPS-GGGYYSPPTNDPTPTP 300

Query: 301 -TPSTPSGGGGYYSPPN---DPTPSTPSTPSGSGGYYSPPAYDPTPST----PSGG---- 360
            TPSTPSGGGGYYSPP     PTPSTPSTPSG GGYYSPP YDPTPST    PSGG    
Sbjct: 301 STPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTPPSGGSGYS 360

Query: 361 SPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPTTPSTPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVP 420
           SPP +DPTPS P+TP  PSGGSGYY+PPT             GTPFYGTPP TSAPPFVP
Sbjct: 361 SPPTFDPTPSIPTTP--PSGGSGYYNPPT------------SGTPFYGTPPITSAPPFVP 420

Query: 421 DPNTPFTGTCNYWMAHPGLIWGMLGWWGTMGNVFGMTGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGL 480
           DPN+PFTGTCNYW  HPG+IWG+LGWWGTMG+ FG+T +P FG TL++PQAL+N+RTDGL
Sbjct: 421 DPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLSIPQALSNTRTDGL 480

Query: 481 GALYRQGAAAFLNSMANNRYPFTTNQVRQSFVSALSSNQAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 515
           GALYR+GAAAFLNSM NNRYPFTTNQVR SFVSALSSN+AAAAQAQVFQMANEGRFKPRT
Sbjct: 481 GALYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRDSFVSALSSNKAAAAQAQVFQMANEGRFKPRT 485

BLAST of Sed0024619 vs. NCBI nr
Match: XP_022989188.1 (leucine-rich repeat extensin-like protein 5 isoform X2 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 4.6e-168
Identity = 396/572 (69.23%), Postives = 431/572 (75.35%), Query Frame = 0

Query: 1   MNIMGRVSLASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESP 60
           M  MG  +LASLLLWTL  GL+S +MAI LT  S+EDQKTYYTPDPHA SPP      SP
Sbjct: 1   MKTMG-TTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSP 60

Query: 61  AYG-TPPPKGSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSG----HKP 120
            YG TPPP GSG SH GKPPSHGHGGKK S  PKPGNC NPP+TPTP KPPSG    HK 
Sbjct: 61  PYGTTPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRS--PKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKS 120

Query: 121 PTHGQT---PHKPPSGGGGHHNPPKYDP-----TPSNPP---GGGGYYNPPSHDPTPPTP 180
           P H  T   P  PPS GGG+++PP +DP     TPS+PP   GGGGYY+PP++D   PTP
Sbjct: 121 PKHNPTPSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPSSPPSDGGGGGYYSPPTYD---PTP 180

Query: 181 SPSTP-TPSTPTPSTPTPSTPTPSTPS-GGGYYSPP-HGPTPTPSTPS----GGGGYYSP 240
           +PSTP TPSTPTPS  TPSTPTPS PS GGGYYSPP + PTPTPSTPS          +P
Sbjct: 181 TPSTPSTPSTPTPS--TPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTP 240

Query: 241 PNDPTPTPSTPSGGGGYYSPP-IDPTPTPST-------------PSGGGGYYSPPN-DPT 300
               TPTPS PSGGGGYYSPP  DPTPTPST             PSGGGGYYSPP  DPT
Sbjct: 241 STPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPT 300

Query: 301 PTPSTPSTPSGGGGYYSPPNDP-TPTPSTPSGGGGYYSPPND--PTPSTPSTPSGS---- 360
           PTPSTPSTP+        P+ P TPTPSTPS GGGYYSPP D   TPSTPSTP+ S    
Sbjct: 301 PTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPS-GGGYYSPPTDDPTTPSTPSTPTPSTPSD 360

Query: 361 GGYYSPPAYD--PTPSTPSGG----SPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPT 420
           GGY SPP YD  PTPSTPSGG    SPP YDPTPSTPSTP  PSGGSGY SPP+YDP P+
Sbjct: 361 GGYNSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTP--PSGGSGYDSPPSYDPNPS 420

Query: 421 TP--------STPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWMAHPGLIWGMLGWW 480
           TP        + P+ GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYW  HPG IWG+LGWW
Sbjct: 421 TPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWW 480

Query: 481 GTMGNVFGMTGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGLGALYRQGAAAFLNSMANNRYPFTTNQV 514
           GTMG+VFG+TGSP FG TL+LPQAL+N+RTDGLG+LYR+GAAAFLNSM NNRYPFTT++V
Sbjct: 481 GTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTDEV 540

BLAST of Sed0024619 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9S728 (Protodermal factor 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDF1 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 184.9 bits (468), Expect = 2.3e-45
Identity = 139/282 (49.29%), Postives = 173/282 (61.35%), Query Frame = 0

Query: 254 YYSPPNDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPNDPTP-TPSTPSGGGGYYSPPNDPTPSTPS-T 313
           Y SPP+    TP + + PS   G  SPP DP+P TPS PS       P + PTPSTPS T
Sbjct: 37  YLSPPSGSHGTPPSHTPPSSNCG--SPPYDPSPSTPSHPS------PPSHTPTPSTPSHT 96

Query: 314 PSGSGGYYSPPAYDPTPSTP--SGGSPPAYDPTPSTPSTPSTPS-----GGSGYYSPPTY 373
           P+        P++ PTP TP  + GSPP++  TPS PSTPS P+      G  Y SPP  
Sbjct: 97  PTP-----HTPSHTPTPHTPPCNCGSPPSHPSTPSHPSTPSHPTPSHPPSGGYYSSPPPR 156

Query: 374 DPTPTTPSTP--SDGTPFY-GTPPT------TSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWMAHPGLIW 433
            P   TP +P    GTP   G+PPT      T   PF+P P  P TGTC+YW  HP LIW
Sbjct: 157 TPVVVTPPSPIVDPGTPIIGGSPPTPIIDPGTPGTPFIPAPFPPITGTCDYWRNHPTLIW 216

Query: 434 GMLGWWGTMGNVFGM----TGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGLGALYRQGAAAFLNSMAN 493
           G+LGWWGT+G  FG     +  P F   + L QAL+N+R+D +GALYR+G A++LNSM N
Sbjct: 217 GLLGWWGTVGGAFGTVSIPSSIPGFDPHMNLLQALSNTRSDPIGALYREGTASWLNSMVN 276

Query: 494 NRYPFTTNQVRQSFVSALSSNQAAAAQAQVFQMANEGRFKPR 514
           +++PFTT QVR  FV+ LSSN+AA  QA  F++ANEGR KPR
Sbjct: 277 HKFPFTTPQVRDHFVAGLSSNKAATKQAHTFKLANEGRLKPR 305

BLAST of Sed0024619 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SN46 (Leucine-rich repeat extensin-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRX5 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 3.6e-06
Identity = 134/344 (38.95%), Postives = 162/344 (47.09%), Query Frame = 0

Query: 95  GNCENPP-YTPTPPKPPS-GHKPPTHGQTPHKPPSGGGGHHNPPKYDPTPSNPPGGGGYY 154
           G    PP   P+PP  PS G  PP+   +P           +PP   P+P   P  GG  
Sbjct: 401 GRSTRPPVVVPSPPTTPSPGGSPPSPSISP-----------SPPITVPSPPTTPSPGGSP 460

Query: 155 NPPSHDPTPP--TPSPSTP--TPSTPTPSTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPHGPTPTPSTP 214
             PS  P+PP  TPSP +P  +P+TPTP    PS+PT  TP G    SPP  PT    TP
Sbjct: 461 PSPSIVPSPPSTTPSPGSPPTSPTTPTPGGSPPSSPTTPTPGG----SPPSSPT----TP 520

Query: 215 SGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSGGGGYYSPPIDPTP------TPSTPSGGGGYYSP----P 274
           + GG   SPP+ PT    TPS GG   SP I P+P       PSTP+  G   SP    P
Sbjct: 521 TPGG---SPPSSPT----TPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPPSTPTSPGSPPSPSSPTP 580

Query: 275 NDPTPTPSTPSTPSG--GGGYYSPPNDPTPT---PSTPSGGGGYYSP-----------PN 334
           + P P+P TPSTP      G  SPP  P+P    PS PS       P           P+
Sbjct: 581 SSPIPSPPTPSTPPTPISPGQNSPPIIPSPPFTGPSPPSSPSPPLPPVIPSPPIVGPTPS 640

Query: 335 DPTPSTP----STPSGSGGYYSPPAYDP-TPSTPSGGSPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSG 394
            P PSTP    S P  S GY  PP +   +P +P    PP + P+PS P  P  P   S 
Sbjct: 641 SPPPSTPTPVYSPPPPSTGYPPPPPFTGYSPPSPPPPPPPTFSPSPSIP--PPPPQTYSP 700

Query: 395 YYSPP-----TYDPTPTTPSTPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVPDP 397
           +  PP     TY P   +PS P   +P YGTPP  S  P++P P
Sbjct: 701 FPPPPPPPPQTYYPPQPSPSQPPQ-SPIYGTPP-PSPIPYLPSP 714

BLAST of Sed0024619 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P14918 (Extensin OS=Zea mays OX=4577 GN=HRGP PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 3.1e-05
Identity = 111/285 (38.95%), Postives = 136/285 (47.72%), Query Frame = 0

Query: 78  PPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSGHKPPTHGQTP------HKPPSGGGG 137
           PP++    K  +PKP P     P YTP+ PKPP+  KPPT   TP       KPP+    
Sbjct: 18  PPTYTPSPKPPTPKPTP-----PTYTPS-PKPPAS-KPPTPKPTPPTYTPSPKPPT---P 77

Query: 138 HHNPPKYDPTPSNPPGGGGYYNPPSHDPTPP--TPSPSTPTPSTPTPSTPTPSTPTPSTP 197
              PP Y P+P  P        PP+  PTPP  TPSP  PTP  PTP T TPS   P+T 
Sbjct: 78  KPTPPTYTPSPKPPA-----TKPPTPKPTPPTYTPSPKPPTPK-PTPPTYTPSPKPPATK 137

Query: 198 SGGGYYSPP-HGPTPTPSTPSGGGGYYSP-PNDPTPTPSTPSGGGGYYSPPIDPTPTPST 257
                 +PP + P+P P TP      Y+P P  PTP P+ P+       PP  PTP P+ 
Sbjct: 138 PPTPKPTPPTYTPSPKPPTPKPTPPTYTPSPKPPTPKPTPPTYTPS-PKPPTHPTPKPTP 197

Query: 258 PSGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPS 317
           P+    Y   P  PTP P+ P+       Y   P  PTP P+ P+     Y+P   P  +
Sbjct: 198 PT----YTPSPKPPTPKPTPPT-------YTPSPKPPTPKPTPPT-----YTPSPKPPAT 257

Query: 318 TPSTPSGSGGYYSPPAYDPTPSTPSGGSPPAYDPTPSTPSTPSTP 353
            P TP       +PP Y PTP  P+   PP Y PTP    TPS P
Sbjct: 258 KPPTPKP-----TPPTYTPTPKPPA-TKPPTYTPTPPVSHTPSPP 263

BLAST of Sed0024619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KGQ1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G423360 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 630.2 bits (1624), Expect = 7.7e-177
Identity = 396/553 (71.61%), Postives = 423/553 (76.49%), Query Frame = 0

Query: 9   LASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESPAYGTPPPK 68
           LASLLLWTLI GL+SQN+AI LT A NEDQKTYYTPDPHA SPP D  H +P YG+PPP 
Sbjct: 5   LASLLLWTLILGLVSQNIAIPLTSAGNEDQKTYYTPDPHAGSPPTDS-HGNPPYGSPPPH 64

Query: 69  GSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSGHKPPTHGQTPHKPPSG 128
           GSG SH GKPPSHGHGGKKH  KPKPGNC NPPYTPTP KPP+    P+   TP KPPSG
Sbjct: 65  GSGGSHGGKPPSHGHGGKKH--KPKPGNCGNPPYTPTPSKPPTHDPTPS---TPSKPPSG 124

Query: 129 GGGHHNPPKYDPTPSNPPGGGGYYNPPSHDPTPPTPSPSTPTPSTPTPSTPTPSTPTPST 188
           GGGHHNP         P GGGGY +PPSHDP             TPTPSTPTPS  TPST
Sbjct: 125 GGGHHNP---------PTGGGGYNSPPSHDP-------------TPTPSTPTPS--TPST 184

Query: 189 PSGGGYYSPP-HGPTPTPSTPS-------GGGGYYSPPN-DPTPTPSTPS-------GGG 248
           PSGGGYYSPP + PTPTPSTP+        GGGYYSPP  DPTPTPSTP+        GG
Sbjct: 185 PSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGG 244

Query: 249 GYYSPP-IDPTPTPSTPS-------GGGGYYSPPN-DPTPTPS--TPSTPS--GGGGYYS 308
           GYYSPP  DPTPTPSTP+        GGGYYSPP  DPTPTPS  TPSTPS   GGGYYS
Sbjct: 245 GYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYS 304

Query: 309 PPN-DPTPTPSTPS-------GGGGYYSPPN-DPT---PSTPSTPSGSGGYYSPPAYD-- 368
           PP  DPTPTPSTP+        GGGYYSPP  DPT   PSTPSTPSG GGY SPP YD  
Sbjct: 305 PPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPSGGGYYSPPTYDPTPTSPSTPSTPSGGGGYSSPPTYDPT 364

Query: 369 PTPSTPSGG----SPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPTTPSTPSDGTPFY 428
           PTPSTPSGG    SPP YDPTPSTP     PSGG GY SPPT+DPTP+TP  PS GTPFY
Sbjct: 365 PTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTP-----PSGGGGYNSPPTFDPTPSTP--PSGGTPFY 424

Query: 429 GTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWMAHPGLIWGMLGWWGTMGNVFGMTGSPVFGTTLT 488
           GTPPTTSAPPFVPDPN+PFTGTCNYW  HPG+IWG+LGWWGTMG+ FG+T +P FG TL+
Sbjct: 425 GTPPTTSAPPFVPDPNSPFTGTCNYWRTHPGIIWGLLGWWGTMGSAFGITNAPGFGATLS 484

Query: 489 LPQALANSRTDGLGALYRQGAAAFLNSMANNRYPFTTNQVRQSFVSALSSNQAAAAQAQV 515
           LPQAL+N+RTDGLG+LYR+GAAAFLNSM NNRYPFTTNQVR+SFVSALSSN+AAAAQAQV
Sbjct: 485 LPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTNQVRESFVSALSSNKAAAAQAQV 520

BLAST of Sed0024619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JPJ4 (leucine-rich repeat extensin-like protein 5 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 2.2e-168
Identity = 396/572 (69.23%), Postives = 431/572 (75.35%), Query Frame = 0

Query: 1   MNIMGRVSLASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESP 60
           M  MG  +LASLLLWTL  GL+S +MAI LT  S+EDQKTYYTPDPHA SPP      SP
Sbjct: 1   MKTMG-TTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSP 60

Query: 61  AYG-TPPPKGSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSG----HKP 120
            YG TPPP GSG SH GKPPSHGHGGKK S  PKPGNC NPP+TPTP KPPSG    HK 
Sbjct: 61  PYGTTPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRS--PKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKS 120

Query: 121 PTHGQT---PHKPPSGGGGHHNPPKYDP-----TPSNPP---GGGGYYNPPSHDPTPPTP 180
           P H  T   P  PPS GGG+++PP +DP     TPS+PP   GGGGYY+PP++D   PTP
Sbjct: 121 PKHNPTPSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPSSPPSDGGGGGYYSPPTYD---PTP 180

Query: 181 SPSTP-TPSTPTPSTPTPSTPTPSTPS-GGGYYSPP-HGPTPTPSTPS----GGGGYYSP 240
           +PSTP TPSTPTPS  TPSTPTPS PS GGGYYSPP + PTPTPSTPS          +P
Sbjct: 181 TPSTPSTPSTPTPS--TPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTP 240

Query: 241 PNDPTPTPSTPSGGGGYYSPP-IDPTPTPST-------------PSGGGGYYSPPN-DPT 300
               TPTPS PSGGGGYYSPP  DPTPTPST             PSGGGGYYSPP  DPT
Sbjct: 241 STPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPT 300

Query: 301 PTPSTPSTPSGGGGYYSPPNDP-TPTPSTPSGGGGYYSPPND--PTPSTPSTPSGS---- 360
           PTPSTPSTP+        P+ P TPTPSTPS GGGYYSPP D   TPSTPSTP+ S    
Sbjct: 301 PTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPS-GGGYYSPPTDDPTTPSTPSTPTPSTPSD 360

Query: 361 GGYYSPPAYD--PTPSTPSGG----SPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPT 420
           GGY SPP YD  PTPSTPSGG    SPP YDPTPSTPSTP  PSGGSGY SPP+YDP P+
Sbjct: 361 GGYNSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTP--PSGGSGYDSPPSYDPNPS 420

Query: 421 TP--------STPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWMAHPGLIWGMLGWW 480
           TP        + P+ GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYW  HPG IWG+LGWW
Sbjct: 421 TPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWW 480

Query: 481 GTMGNVFGMTGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGLGALYRQGAAAFLNSMANNRYPFTTNQV 514
           GTMG+VFG+TGSP FG TL+LPQAL+N+RTDGLG+LYR+GAAAFLNSM NNRYPFTT++V
Sbjct: 481 GTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTDEV 540

BLAST of Sed0024619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JF43 (protodermal factor 1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 594.7 bits (1532), Expect = 3.6e-166
Identity = 393/585 (67.18%), Postives = 429/585 (73.33%), Query Frame = 0

Query: 1   MNIMGRVSLASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESP 60
           M  MG  +LASLLLWTL  GL+S +MAI LT  S+EDQKTYYTPDPHA SPP      SP
Sbjct: 1   MKTMG-TTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSP 60

Query: 61  AYG-TPPPKGSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSG----HKP 120
            YG TPPP GSG SH GKPPSHGHGGKK S  PKPGNC NPP+TPTP KPPSG    HK 
Sbjct: 61  PYGTTPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRS--PKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKS 120

Query: 121 PTHGQT---PHKPPSGGGGHHNPPKYDPTPS---------------------NPPGGGGY 180
           P H  T   P  PPS GGG+++PP +DPTP+                     + P GGGY
Sbjct: 121 PKHNPTPSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPSSPPSDGGGSTPSTPTPSAPSGGGY 180

Query: 181 YNPPSHDPTPPTPSPSTP-TPSTPTPSTPTPSTPTPSTPS-GGGYYSPP-HGPTPTPSTP 240
           Y+PP++D   PTP+PSTP TPSTPTPS  TPSTPTPS PS GGGYYSPP + PTPTPSTP
Sbjct: 181 YSPPTYD---PTPTPSTPSTPSTPTPS--TPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTP 240

Query: 241 S----GGGGYYSPPNDPTPTPSTPSGGGGYYSPP-IDPTPTPST-------------PSG 300
           S          +P    TPTPS PSGGGGYYSPP  DPTPTPST             PSG
Sbjct: 241 STPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPTPSTPSTPTPSAPSG 300

Query: 301 GGGYYSPPN-DPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPNDP-TPTPSTPSGGGGYYSPPND--PTP 360
           GGGYYSPP  DPTPTPSTPSTP+        P+ P TPTPSTPS GGGYYSPP D   TP
Sbjct: 301 GGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPS-GGGYYSPPTDDPTTP 360

Query: 361 STPSTPSGS----GGYYSPPAYD--PTPSTPSGG----SPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGS 420
           STPSTP+ S    GGY SPP YD  PTPSTPSGG    SPP YDPTPSTPSTP  PSGGS
Sbjct: 361 STPSTPTPSTPSDGGYNSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTP--PSGGS 420

Query: 421 GYYSPPTYDPTPTTP--------STPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWM 480
           GY SPP+YDP P+TP        + P+ GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYW 
Sbjct: 421 GYDSPPSYDPNPSTPPSGGNGYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWS 480

Query: 481 AHPGLIWGMLGWWGTMGNVFGMTGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGLGALYRQGAAAFLNS 514
            HPG IWG+LGWWGTMG+VFG+TGSP FG TL+LPQAL+N+RTDGLG+LYR+GAAAFLNS
Sbjct: 481 THPGAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNS 540

BLAST of Sed0024619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JNN6 (protodermal factor 1-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 583.2 bits (1502), Expect = 1.1e-162
Identity = 380/565 (67.26%), Postives = 411/565 (72.74%), Query Frame = 0

Query: 1   MNIMGRVSLASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESP 60
           M  MG  +LASLLLWTL  GL+S +MAI LT  S+EDQKTYYTPDPHA SPP      SP
Sbjct: 1   MKTMG-TTLASLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSP 60

Query: 61  AYG-TPPPKGSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSGHKPPTHG 120
            YG TPPP GSG SH GKPPSHGHGGKK S  PKPGNC NPP+TP               
Sbjct: 61  PYGTTPPPDGSGGSHGGKPPSHGHGGKKRS--PKPGNCGNPPHTP--------------- 120

Query: 121 QTPHKPPSGGGGHHNPPKYDPTPS----NPPGGGGYYNPPSHDPTPPTPSPSTPTPSTPT 180
            TP KPPSGGGGHH  PK++PTPS     P  GGGYY+PPSHD   PTP+PSTP+     
Sbjct: 121 -TPSKPPSGGGGHHKSPKHNPTPSIPSTPPSDGGGYYSPPSHD---PTPTPSTPSSPPSD 180

Query: 181 PSTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPP-HGPTPTPST-------------------PSGGGGYY 240
               TPSTPTPS PSGGGYYSPP + PTPTPST                   PSGGGGYY
Sbjct: 181 GGGSTPSTPTPSAPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYY 240

Query: 241 SPPN-DPTPTPSTPS----GGGGYYSPPIDPTPTPSTPSGGGGYYSPPN-DPTPTPSTPS 300
           SPP  DPTPTPSTPS          +P    TPTPS PSGGGGYYSPP  DPTPTPSTPS
Sbjct: 241 SPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPS 300

Query: 301 TPSGGGGYYSPPNDP-TPTPSTPSGGGGYYSPPND--PTPSTPSTPSGS----GGYYSPP 360
           TP+        P+ P TPTPSTPS GGGYYSPP D   TPSTPSTP+ S    GGY SPP
Sbjct: 301 TPTPSTPSTPTPSTPSTPTPSTPS-GGGYYSPPTDDPTTPSTPSTPTPSTPSDGGYNSPP 360

Query: 361 AYD--PTPSTPSGG----SPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPTTP----- 420
            YD  PTPSTPSGG    SPP YDPTPSTPSTP  PSGGSGY SPP+YDP P+TP     
Sbjct: 361 TYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTP--PSGGSGYDSPPSYDPNPSTPPSGGN 420

Query: 421 ---STPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWMAHPGLIWGMLGWWGTMGNVF 480
              + P+ GTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYW  HPG IWG+LGWWGTMG+VF
Sbjct: 421 GYYNPPTSGTPFYGTPPTTSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTMGSVF 480

Query: 481 GMTGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGLGALYRQGAAAFLNSMANNRYPFTTNQVRQSFVSA 514
           G+TGSP FG TL+LPQAL+N+RTDGLG+LYR+GAAAFLNSM NNRYPFTT++VRQSFVSA
Sbjct: 481 GITGSPGFGATLSLPQALSNTRTDGLGSLYREGAAAFLNSMVNNRYPFTTDEVRQSFVSA 540

BLAST of Sed0024619 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EXH4 (protodermal factor 1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437076 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 576.6 bits (1485), Expect = 1.0e-160
Identity = 366/546 (67.03%), Postives = 398/546 (72.89%), Query Frame = 0

Query: 1   MNIMGRVSLASLLLWTLIFGLLSQNMAIALTPASNEDQKTYYTPDPHAASPPPDGMHESP 60
           M  MG  +LA LLLWTL  GL+S +MAI LT  S+EDQKTYYTPDPHA SPP      SP
Sbjct: 1   MKTMG-TTLAFLLLWTLFVGLVSGDMAIPLTSTSDEDQKTYYTPDPHAGSPPSGSSPGSP 60

Query: 61  AYG-TPPPKGSGESHEGKPPSHGHGGKKHSPKPKPGNCENPPYTPTPPKPPSG----HKP 120
            YG TPPP GSG SH GKPP+HGHGGKK S  PKPGNC NPP+TPTP KPPSG    HK 
Sbjct: 61  PYGTTPPPDGSGGSHGGKPPTHGHGGKKRS--PKPGNCGNPPHTPTPSKPPSGGGGHHKS 120

Query: 121 PTHGQT---PHKPPSGGGGHHNPPKYDPTP------SNPP---GGGGYYNPPSHDPTPPT 180
           P +  T   P  PPS GGG+++PP +DPTP      S PP   GGGGYY+PPS+DP    
Sbjct: 121 PKYNPTPSIPSTPPSDGGGYYSPPSHDPTPTPSTPLSPPPSGGGGGGYYSPPSYDP---- 180

Query: 181 PSPSTPTPSTPTPSTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPP-HGPTPTPSTPSGGGGYYSPPNDPT 240
               TPTPSTPTPS  TPSTPTPS PSGGGYYSPP + PTPTPSTPS            T
Sbjct: 181 ----TPTPSTPTPS--TPSTPTPSAPSGGGYYSPPTYDPTPTPSTPS---------TPST 240

Query: 241 PTPSTPSGGGGYYSPP-IDPTPTPSTPS-------GGGGYYSPPNDPTPTPSTPSTPS-- 300
           PTPS PSGGGGYYSPP  DPTPTPSTPS        GGGYYSPP D   TPSTPSTP+  
Sbjct: 241 PTPSAPSGGGGYYSPPTYDPTPTPSTPSTPTPSTPSGGGYYSPPTDNPTTPSTPSTPTPS 300

Query: 301 --GGGGYYSPPN-DPTPTPSTPSGGGGYYSPPN-DPTPSTPST-PSGSGGYYSPPAYDPT 360
               GGY SPP  DPTPTPSTPSGGGGYYSPP  DPTPSTPST PSG  GY SPP+YDP 
Sbjct: 301 TPSDGGYNSPPTYDPTPTPSTPSGGGGYYSPPTYDPTPSTPSTPPSGGSGYDSPPSYDPN 360

Query: 361 PSTPSGGSPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYYSPPTYDPTPTTPSTPSDGTPFYGTPPTT 420
           PSTP                    PSGG+G+Y+PPT             GTPFYGTPPTT
Sbjct: 361 PSTP--------------------PSGGNGFYNPPT------------SGTPFYGTPPTT 420

Query: 421 SAPPFVPDPNTPFTGTCNYWMAHPGLIWGMLGWWGTMGNVFGMTGSPVFGTTLTLPQALA 480
           SAPPFVPDPN+PFTGTCNYW  HPG IWG+LGWWGTMG+VFG+TGSP FG TL+LPQAL+
Sbjct: 421 SAPPFVPDPNSPFTGTCNYWSTHPGAIWGLLGWWGTMGSVFGITGSPGFGATLSLPQALS 480

Query: 481 NSRTDGLGALYRQGAAAFLNSMANNRYPFTTNQVRQSFVSALSSNQAAAAQAQVFQMANE 514
           N+RTDGLG+LYR+GAAAFLNS+ NNRYPFTTN+VRQSFVSALSSN+AAAAQA+VFQMANE
Sbjct: 481 NTRTDGLGSLYREGAAAFLNSLVNNRYPFTTNEVRQSFVSALSSNRAAAAQARVFQMANE 492

BLAST of Sed0024619 vs. TAIR 10
Match: AT2G42840.1 (protodermal factor 1 )

HSP 1 Score: 184.9 bits (468), Expect = 1.6e-46
Identity = 139/282 (49.29%), Postives = 173/282 (61.35%), Query Frame = 0

Query: 254 YYSPPNDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPNDPTP-TPSTPSGGGGYYSPPNDPTPSTPS-T 313
           Y SPP+    TP + + PS   G  SPP DP+P TPS PS       P + PTPSTPS T
Sbjct: 37  YLSPPSGSHGTPPSHTPPSSNCG--SPPYDPSPSTPSHPS------PPSHTPTPSTPSHT 96

Query: 314 PSGSGGYYSPPAYDPTPSTP--SGGSPPAYDPTPSTPSTPSTPS-----GGSGYYSPPTY 373
           P+        P++ PTP TP  + GSPP++  TPS PSTPS P+      G  Y SPP  
Sbjct: 97  PTP-----HTPSHTPTPHTPPCNCGSPPSHPSTPSHPSTPSHPTPSHPPSGGYYSSPPPR 156

Query: 374 DPTPTTPSTP--SDGTPFY-GTPPT------TSAPPFVPDPNTPFTGTCNYWMAHPGLIW 433
            P   TP +P    GTP   G+PPT      T   PF+P P  P TGTC+YW  HP LIW
Sbjct: 157 TPVVVTPPSPIVDPGTPIIGGSPPTPIIDPGTPGTPFIPAPFPPITGTCDYWRNHPTLIW 216

Query: 434 GMLGWWGTMGNVFGM----TGSPVFGTTLTLPQALANSRTDGLGALYRQGAAAFLNSMAN 493
           G+LGWWGT+G  FG     +  P F   + L QAL+N+R+D +GALYR+G A++LNSM N
Sbjct: 217 GLLGWWGTVGGAFGTVSIPSSIPGFDPHMNLLQALSNTRSDPIGALYREGTASWLNSMVN 276

Query: 494 NRYPFTTNQVRQSFVSALSSNQAAAAQAQVFQMANEGRFKPR 514
           +++PFTT QVR  FV+ LSSN+AA  QA  F++ANEGR KPR
Sbjct: 277 HKFPFTTPQVRDHFVAGLSSNKAATKQAHTFKLANEGRLKPR 305

BLAST of Sed0024619 vs. TAIR 10
Match: AT3G19430.1 (late embryogenesis abundant protein-related / LEA protein-related )

HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 1.5e-10
Identity = 109/244 (44.67%), Postives = 118/244 (48.36%), Query Frame = 0

Query: 122 PHKPPSGGGGHHNPPKYDPTPSNPPGGGGYYNPPSHDP--TPPTPSPSTPTPSTPTPSTP 181
           P  P   GGG            +  G  G Y PP+  P  +PP P+PS P+P+ P   +P
Sbjct: 53  PPSPGDDGGG-----------DDSGGDDGGYTPPAPVPPVSPPPPTPSVPSPTPPV--SP 112

Query: 182 TPSTPTPSTPSGGGYYSPPHGPTPTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSGGGGYYSPPI 241
            P TPTPS PS     SPP  PTPTPS PS       PP  PTPTPS PS       PP 
Sbjct: 113 PPPTPTPSVPSPTPPVSPP-PPTPTPSVPSPTPPVSPPP--PTPTPSVPSPTPPVSPPP- 172

Query: 242 DPTPTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSTPSGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSGGGGYYS 301
            PTPTPS PS        P  P PT   PS P       SPP  PTPTPS PS       
Sbjct: 173 -PTPTPSVPS--------PTPPVPTDPMPSPPPP----VSPP-PPTPTPSVPS------P 232

Query: 302 PPNDPTPSTPSTPSGSGGYYSPPAYDPTPSTPSGGSPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSGYY 361
           P   PTP TPS P       SPP   PTP TPS  SPP   PTP TP +  TPSG   Y 
Sbjct: 233 PDVTPTPPTPSVP-------SPPDVTPTPPTPSVPSPPDVTPTPPTPPSVPTPSGSPPYV 252

Query: 362 SPPT 364
            PP+
Sbjct: 293 PPPS 252

BLAST of Sed0024619 vs. TAIR 10
Match: AT4G18670.1 (Leucine-rich repeat (LRR) family protein )

HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 2.6e-07
Identity = 134/344 (38.95%), Postives = 162/344 (47.09%), Query Frame = 0

Query: 95  GNCENPP-YTPTPPKPPS-GHKPPTHGQTPHKPPSGGGGHHNPPKYDPTPSNPPGGGGYY 154
           G    PP   P+PP  PS G  PP+   +P           +PP   P+P   P  GG  
Sbjct: 401 GRSTRPPVVVPSPPTTPSPGGSPPSPSISP-----------SPPITVPSPPTTPSPGGSP 460

Query: 155 NPPSHDPTPP--TPSPSTP--TPSTPTPSTPTPSTPTPSTPSGGGYYSPPHGPTPTPSTP 214
             PS  P+PP  TPSP +P  +P+TPTP    PS+PT  TP G    SPP  PT    TP
Sbjct: 461 PSPSIVPSPPSTTPSPGSPPTSPTTPTPGGSPPSSPTTPTPGG----SPPSSPT----TP 520

Query: 215 SGGGGYYSPPNDPTPTPSTPSGGGGYYSPPIDPTP------TPSTPSGGGGYYSP----P 274
           + GG   SPP+ PT    TPS GG   SP I P+P       PSTP+  G   SP    P
Sbjct: 521 TPGG---SPPSSPT----TPSPGGSPPSPSISPSPPITVPSPPSTPTSPGSPPSPSSPTP 580

Query: 275 NDPTPTPSTPSTPSG--GGGYYSPPNDPTPT---PSTPSGGGGYYSP-----------PN 334
           + P P+P TPSTP      G  SPP  P+P    PS PS       P           P+
Sbjct: 581 SSPIPSPPTPSTPPTPISPGQNSPPIIPSPPFTGPSPPSSPSPPLPPVIPSPPIVGPTPS 640

Query: 335 DPTPSTP----STPSGSGGYYSPPAYDP-TPSTPSGGSPPAYDPTPSTPSTPSTPSGGSG 394
            P PSTP    S P  S GY  PP +   +P +P    PP + P+PS P  P  P   S 
Sbjct: 641 SPPPSTPTPVYSPPPPSTGYPPPPPFTGYSPPSPPPPPPPTFSPSPSIP--PPPPQTYSP 700

Query: 395 YYSPP-----TYDPTPTTPSTPSDGTPFYGTPPTTSAPPFVPDP 397
           +  PP     TY P   +PS P   +P YGTPP  S  P++P P
Sbjct: 701 FPPPPPPPPQTYYPPQPSPSQPPQ-SPIYGTPP-PSPIPYLPSP 714

The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_011657562.24.2e-17772.16protodermal factor 1 isoform X1 [Cucumis sativus][more]
KAE8647347.11.9e-17471.16hypothetical protein Csa_003649 [Cucumis sativus][more]
XP_031743089.11.5e-17171.19protodermal factor 1 isoform X2 [Cucumis sativus][more]
XP_038888912.19.4e-16970.19protodermal factor 1-like [Benincasa hispida][more]
XP_022989188.14.6e-16869.23leucine-rich repeat extensin-like protein 5 isoform X2 [Cucurbita maxima][more]
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9S7282.3e-4549.29Protodermal factor 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PDF1 PE=2 SV=1[more]
Q9SN463.6e-0638.95Leucine-rich repeat extensin-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=L... [more]
P149183.1e-0538.95Extensin OS=Zea mays OX=4577 GN=HRGP PE=2 SV=1[more]
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0KGQ17.7e-17771.61Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G423360 PE=4 SV=1[more]
A0A6J1JPJ42.2e-16869.23leucine-rich repeat extensin-like protein 5 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=36... [more]
A0A6J1JF433.6e-16667.18protodermal factor 1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335... [more]
A0A6J1JNN61.1e-16267.26protodermal factor 1-like isoform X3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111486335... [more]
A0A6J1EXH41.0e-16067.03protodermal factor 1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114370... [more]
Match NameE-valueIdentityDescription
AT2G42840.11.6e-4649.29protodermal factor 1 [more]
AT3G19430.11.5e-1044.67late embryogenesis abundant protein-related / LEA protein-related [more]
AT4G18670.12.6e-0738.95Leucine-rich repeat (LRR) family protein [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availablePRINTSPR01217PRICHEXTENSNcoord: 132..149
score: 34.44
coord: 88..109
score: 40.0
coord: 155..180
score: 40.0
coord: 109..125
score: 34.12
coord: 32..48
score: 30.59
coord: 58..70
score: 38.46
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 94..122
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 349..363
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 155..186
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 37..396
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 324..348
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33210:SF18PROTODERMAL FACTOR 1coord: 339..513
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33210:SF18PROTODERMAL FACTOR 1coord: 10..192
IPR039923Protodermal factor 1PANTHERPTHR33210PROTODERMAL FACTOR 1coord: 10..192
coord: 339..513

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0024619.1Sed0024619.1mRNA