
Sed0024544 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCCTTGTTTCAGTCAGTTTGCATATCTAAAGACGGTGCCAGTAAAGAGGTTAGAATGATATTTTTTTTTATGCTAATAATCTTCAAATTGTACCTGCGAGGTTGTGACTGAATGTTAAACAACCTTTCTTATAAAAAAAGGGGAAAAGAAACTGGCACCGTTTTGATCAATTCTGCCATATTTTGTTTGTTGCTTCCATTACAAATTCGTACATTGCTATGGTGATTAGTATGTGTACAATTTATTTTAGTTACTATTCAATTTAGAAATGAGGAAGAGAGCAGTGCGTTTCATTATGCTTTTGATCAGAGGAAGAAGGGTGATATTGCTCAAGGTAGGAAGCTGTATTGGACATTCCTTTTTTATTTTCTTGCATCTCTCTGCAGCTGGATTGCAACCCTCTCTGAATTCTCTAAAACATGTTCTAATTCCTGTTGTAATTGATTCTCTTCTTTCTCTGAGGATTTCTTTCATATTAGCTTCAAAAGAATCCAACAATCTCATCATTCGTTCGAAACGAACATCTCGCTCATCTTCGGAATCCATCTCTTTGGCCAAGGACGGATCGAAACCGCTCTGATACCTAATTGATACGAACCAAAACGATATATTGAAATATAACCGATAAAAGATTACAAACTAACCAAGTATTTGATAGGTACTTGAACCTCCCATCTTGAGAATACTCTTTCAAGCCCGATTACCAAAATGGCTACAATATTCTTGATATCCCTCTTCTTCTCTAATGCCTCTATTTATCACCATAAGCCCCTAACTTATTCCCCAAGTATTTGCTAACATACCCCTCTATTATTCTTTAATATCCTAAGGCTTAGAACGTAATACTTAACTTATTAGAAATATCATTATCTGTCAATATTCGCTTGTCTACTCATGCACTTTAACTTGAAATTCGGTAATTAATGTGAGTTGAGGAAATTGAATTGCCTGAGAAGGCAGACATTTTAATCTCAAAGTCAATGGGTGAGAGCCATTGTCAAATTGTAATACATTTTCAGATTATATCCTGGAAGATTGTGCAATTTTGGATAATCCCAAAACTTTTAGGGTGTGTTTGAGCCCTCGTTTATGTAAACGACCGGTTGGTTATAACCCAACCGATGTTCGCCCCACCGTTTATTATAAACAGTGGTTATCTAAACCTGCGTGCCCGTTTATCTAAACCTATGTGCCCGTTTATTTAAACATTACATATATTACTTTTTGTTACATAACCAGCCCCCCAAACACCATTTATAATAACCCACGGTGTATCATAACCCCCTATTTATCATAACCTTGCGCTAAACCGGTGCTCCAAACGCACCCTTGGCTATTTACAAAAAAATATATGCAAACTCCTCTAGATGTGCTATGATTGAGTATTCGAAAGGTATAGCACCCAATGATTTTTTTCAAGTCAATGAAAGAATGCTTGAAACCTACGTGATCGCCAAAGATCGTTTTTTGCACCGAAATGGAAAGATGTTCCCAACAATAGGAAGGTAAATTGACAGCAGAATTATTTTCATCGAGCAGTTTTCTTGTCGTTTGTGTTTGTTGAGTTTTTTTTGGGTTCTTATGACTTATAATTTCGTCCATGTAGGATTCACATGGCACCTTTCAATGATGAATATCTATTTGTCGAAATGGCTAACAAGGTAAGCCTTGTAATGATTGTTCTCAAACACTTTCAGCCTCTGAATTTTTTCTTTTGACTGAGGTCCTTAAGTTCTAAAAGTTTCAATTCAAATGACTCTTCTCTTAAACATAAAAAAGGAAAAATGTGTCATGTCATTCTATCCTTCAATTTTGAGAGCATTTTAGAAAGCACTTGATTAAGTTTCTATGCGTTATCGAAAGTATAGGGTTTAGCATAATGGATTGGCCTAGTGGTTTAGAGGGTCTTTGTGTACTAAGAGGTGATGAGTTCAATCCATGCTACCCACCTACTTAGAAATTATTTTCTTACTAATTTCCTTGACAACCCAATATAGTAGAGTTAGATTTTGTCTTTTTGTTAAGGTGCGCAGAAGTTGATTAAGACACTCATAAATATAAAATAAAAAAACAAAAAGTACCTTTTAGGCGTGGTCTTGTCCTAAGTACACTTCTAATGAAACAATATCTATAGACAATGGGCAGAAGGATAACATAGATTTCACATGTTTTGGCTTTGTAGCCACACAATGTGTTCTTTCTGTCTATTTTTGTCCAAAATAGTAAGGAAAAAACGAACTTAAATATGTTACTCTTTTTGTAGGCTCTCTATTGGCAGCAGCAAAACTATTATGAGCTTGATTTGACAGCCTTGCATGGGTCAGTATTTCAAGGCTATTTTTCTCAGGTGTGTGCATCACTTTCATTTATTTGAAAATGAAAATTTAGGACGAATTGTAATTTTGAGACTTTTTGGGATACCTTTTAGCTTAAAAACCTTGAGAAGTATTTTAAATAATGATTTTGCTAAAAAGCATTTTTCTTACAAGTAGTTCTAAACACGCTATTAGAGAGAGGAGGGAAGATAAGGTGATTATGCCTGAAAGAGCCCTGCCTCTAACCTCTACCATTGATTATGCTTCAATTCCCATCCATTGTTGTTGAACTAAAAGCATAAAGCATTATATATGTAGTTGGAATTTGCTGCTGCATCTCATTTTCTGTTTCTGTCATTAAACCTTGTATTTACAATATTCTCTGTTATTAAACGTTCCATGTCTCATGTTTTAGACTTCACAAATATTAAGGTATCCTTATCCTCTTGGACAAGGACTTGCATTTTGTCGATGCTAACTTTCCGGTATTTATGGCCTCTTACATATGATTTTCGTTTTGGATCTTTTACGAATAAAAGGATCTGTTTTTTTTTTTTTGGTGGGGAAGGTAACTTATCCTTCCATGTGTGTTGCCATTTAAGTGAGGAGCATGTTTCATTTGTACTTCTTAGAATCCGAACTGCTAAGAATCGTGTTTTTTTGTTCTTTTTAGCTTGTACTATCTCTTGATTGATAATTTTAGAACACACAATATCTAAAACTAAAAACCAAAAAATTTGCTTTCTTTTTCTATTGAATATTGAAAGAAAATAAAAATCAAATGGGGATTTTCGGTGAAAAATAAAAATTCAGGACAAATGGGAACCGTCTATACATTACGGTGGTTTACCTTGATTTTTCCCACTCTATAAATATATGCCTTGTAATGAACTCTGACCGAAGAAACACTCTTAATGTCAGGAAGAAGAATTGTATGACATTGATATTCCTCCGAAATTCGTTGCTTTTGTGGGTGCGTAGAGTGCATGGATTGACCTACGGTTTGTTGTATTATTTAATGGCAAAGTTAATATTGGGGTTGAAAGAAATTTTTACGATAGTATTACTAGTCTTTTTCTATATCCGTGTAAGCTTACGCTTACGAACACACCTCTACTTGATTTGTTTCTTAATCGCTTTAATTTGCGAAAGATCTTTGTGCAGAGGTGGCTTACCACTACCCCTGGTACACCGACGACCCATTGGTATCAACTCTCAATTACGCTGCGTCTTTTCCCAGCCGATTTATGTCATGGCGGGATCAGAAAATTACTGGCAGACTTCACATGGTCGCTCACAATGCCTAGAGTTACACAATTTATTTCACTCTAACAGGTTGATTTTCTTCTTCTTTTTCCCATTTTTTGTTCCTTGGTTTGCCATTCACTCTGACTAACATTGCTATATATATAGCCAAAATGTGGGGCCCCGGTGCCGATCAAGGAGGAATAATGCAGTCGTCGTAGTGCAAACTCAACTTGAAAGAGCCCTACTATAGAATGTCTCAACTGCAAGCCTACCCTGTGGCCCAAGATCAGCAACATCAGCTTATTCCGCCACAGGTGATTACGCGTTTTTCATGCTATATATACCCTACTACATTTGATTGTCAAGAAGTTCTGTAGGCTTGAATTTTTTGTGACGTGACCACCATAGATTAAATTCATCATCTCTTAGTTTATCTAGGTCTTTTTTACTACTAGCCAATTCGTAGTGTTTTGTTTGCATAATGTGAACCAACCAATAGGAAGATTTATTCTAGTTATGTTTTTTTATTCCTTTAAATGTTCATATTTTCATTCACGTTTTTTGTTCCTCCAAACGAGCGCAACTATTCAACCACAAGATTTAGAATATCTTTGATATGATGCTACATGCATCGCCTAACTCGGGGATTTAAGCGTTACGGATGAATTCTGGACACGGGATCGATGTCGGACATATAGACGCCTTTGCATCGGGTATTAGAACTTGGCAGAAGTCCTTTTTTTGTTCACCTCTAACCTCTACCATTGATTATGTTTCCACAGAGATTATTATGTACTATTTAAAATTAGGATTCAATACGTTAAATAAAAATTATATCTTGTTTCTGCAAAATTTTCCTCTTTTGCTAGTATACATTTGGTTACTTGAAAGTATTTGTCTTTAGATTTTCACTTATAGAGGAGATAACCATTTTACTACAAATAATAAAAGTACAAAATGTTGGGATGGTTTATATAGTGTACTCTACTACTCGTTAAATTCCATAAACGTTGGATGGATTGTGAGATATAGTTGAATTCCATAAAATTACAAATAAAAGTTTGGTTCAAGTTAACATACTTTTAGTTTTGTTTCTATCCAAATTTTCGTAATTTTAGAATTCATACTAAGAAAGACTGATGTTCAAAATATATCTCTTTGATGATTTTTCTTTAAAAATTATATTTGATTAAATTTGGATAAATATATAGGAGTGCTTGAAATTTTGACGAACTAATTCTTATCTAAATAATTGTTATGAATATTTTTACCAAATAAAATGTTACTGGTTAAAATAAAGTTAATGTATTTTTGTTTTGTTTTGATAATAATTGATGAAACTCAAGCATTACATCAATTATAAATTAGAGTTTAGATATGTTTTATAGGGTAAATTAGAAAATAAAAAATCATAGCCCATAAATTTGGGAG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GCCTTGTTTCAGTCAGTTTGCATATCTAAAGACGGTGCCATATGTGTACAATTTATTTTAGTTACTATTCAATTTAGAAATGAGGAAGAGAGCAGTGCGTTTCATTATGCTTTTGATCAGAGGAAGAAGGGTGATATTGCTCAAGACTCCCGTTTACCAAATGGTGCAATTTCCTCCTTAAAATGCAAGTTTGATGATAAAATAGAATCATCATCTGCAAAGATGTATTTCCACTACTATGGACAACTTCTACATCAACAAAATATGCTGCAGGACTATGTGAGGACAGGCACATATTATGCAGCAGTGATGGAAAATCTTGTCGACTTCACGGGTTGTGTTGTTATTGACGTCGGTGCTGGTAGTGGTATTTTGTCATTATTTGCCGGTGCAAAGCATGTTTATGCCGTGGAGGCATCTGAAATGGCTAAGTATGCTCGTGTACTAATTGAAGGAAACCCAGCCTTGAGTCATCGAATCACTCACCCAATGATTTTTCAAGTCAATGAAAGAATGCTTGAAACCTACGTGATCGCCAAAGATCGTTTTTTGCACCGAAATGGAAAGATGTTCCCAACAATAGGAAGGATTCACATGGCACCTTTCAATGATGAATATCTATTTGTCGAAATGGCTAACAAGGCTCTCTATTGGCAGCAGCAAAACTATTATGAGCTTGATTTGACAGCCTTGCATGGGTCAGTATTTCAAGGCTATTTTTCTCAGTTGGAATTTGCTGCTGCATCTCATTTTCTGTTTCTGTCATTAAACCTTGTATTTACAATATTCTCTGTTATTAAACGTTCCATGTCTCATGTTTTAGACTTCACAAATATTAAGGAAGAAGAATTGTATGACATTGATATTCCTCCGAAATTCGTTGCTTTTGTGGGTGCGAGAGTGCATGGATTGACCTTCTGGTTTGTTGTATTATTTAATGGCAGCACTGTGCAGAGGTGGCTTACCACTACCCCTGGTACACCGACGACCCATTGGTATCAACTCTCAATTACGCTGCGTCTTTTCCCAGCCGATTTATGTCATGGCGGTTACACAATTTATTTCACTCTAACAGCCAAAATGTGGGGCCCCGGTGCCGATCAAGGAGGAATAATGCAGTCGTCAATGTCCCAACTGCAAGCCTACCCTGTGGCCCAAGATCAGCAACATCAGCTTATTCCGCCACAGCCCCTCGCCATATGTATACCAAAAAAAAACTCTCCTCATTCATTAAAATAA ALFQSVCISKDGAICVQFILVTIQFRNEEESSAFHYAFDQRKKGDIAQDSRLPNGAISSLKCKFDDKIESSSAKMYFHYYGQLLHQQNMLQDYVRTGTYYAAVMENLVDFTGCVVIDVGAGSGILSLFAGAKHVYAVEASEMAKYARVLIEGNPALSHRITHPMIFQVNERMLETYVIAKDRFLHRNGKMFPTIGRIHMAPFNDEYLFVEMANKALYWQQQNYYELDLTALHGSVFQGYFSQLEFAAASHFLFLSLNLVFTIFSVIKRSMSHVLDFTNIKEEELYDIDIPPKFVAFVGARVHGLTFWFVVLFNGSTVQRWLTTTPGTPTTHWYQLSITLRLFPADLCHGGYTIYFTLTAKMWGPGADQGGIMQSSMSQLQAYPVAQDQQHQLIPPQPLAICIPKKNSPHSLK Homology
BLAST of Sed0024544 vs. NCBI nr
Match: XP_008458452.1 (PREDICTED: probable histone-arginine methyltransferase 1.4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 536.2 bits (1380), Expect = 2.5e-148 Identity = 305/450 (67.78%), Postives = 326/450 (72.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. NCBI nr
Match: KAG6593969.1 (putative histone-arginine methyltransferase 1.4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 533.5 bits (1373), Expect = 1.6e-147 Identity = 304/450 (67.56%), Postives = 327/450 (72.67%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. NCBI nr
Match: XP_022930532.1 (probable histone-arginine methyltransferase 1.4 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 533.1 bits (1372), Expect = 2.1e-147 Identity = 304/450 (67.56%), Postives = 326/450 (72.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. NCBI nr
Match: XP_023515168.1 (probable histone-arginine methyltransferase 1.4 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023515169.1 probable histone-arginine methyltransferase 1.4 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 532.3 bits (1370), Expect = 3.6e-147 Identity = 303/450 (67.33%), Postives = 326/450 (72.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. NCBI nr
Match: KAG7026311.1 (putative histone-arginine methyltransferase 1.4 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 530.8 bits (1366), Expect = 1.1e-146 Identity = 303/450 (67.33%), Postives = 328/450 (72.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84W92 (Probable histone-arginine methyltransferase 1.3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PRMT13 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 427.9 bits (1099), Expect = 1.3e-118 Identity = 242/427 (56.67%), Postives = 284/427 (66.51%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2YPT7 (Probable histone-arginine methyltransferase CARM1 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=CARM1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 422.5 bits (1085), Expect = 5.3e-117 Identity = 245/426 (57.51%), Postives = 278/426 (65.26%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XI75 (Probable histone-arginine methyltransferase CARM1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CARM1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 422.5 bits (1085), Expect = 5.3e-117 Identity = 245/426 (57.51%), Postives = 278/426 (65.26%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A3KPF2 (Probable histone-arginine methyltransferase 1.4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PRMT14 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 420.2 bits (1079), Expect = 2.6e-116 Identity = 242/417 (58.03%), Postives = 282/417 (67.63%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6DC04 (Histone-arginine methyltransferase CARM1 OS=Danio rerio OX=7955 GN=carm1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 2.7e-60 Identity = 137/301 (45.51%), Postives = 180/301 (59.80%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C7Z8 (probable histone-arginine methyltransferase 1.4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497854 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 536.2 bits (1380), Expect = 1.2e-148 Identity = 305/450 (67.78%), Postives = 326/450 (72.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EQT1 (probable histone-arginine methyltransferase 1.4 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436958 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 533.1 bits (1372), Expect = 1.0e-147 Identity = 304/450 (67.56%), Postives = 326/450 (72.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KCB9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G194130 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 530.8 bits (1366), Expect = 5.1e-147 Identity = 303/450 (67.33%), Postives = 325/450 (72.22%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KFU3 (probable histone-arginine methyltransferase 1.4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111494686 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 527.7 bits (1358), Expect = 4.3e-146 Identity = 302/448 (67.41%), Postives = 323/448 (72.10%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KVH4 (probable histone-arginine methyltransferase 1.4 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499078 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 527.3 bits (1357), Expect = 5.6e-146 Identity = 300/450 (66.67%), Postives = 324/450 (72.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. TAIR 10
Match: AT3G06930.1 (protein arginine methyltransferase 4B ) HSP 1 Score: 427.9 bits (1099), Expect = 9.0e-120 Identity = 242/427 (56.67%), Postives = 284/427 (66.51%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. TAIR 10
Match: AT3G06930.2 (protein arginine methyltransferase 4B ) HSP 1 Score: 427.9 bits (1099), Expect = 9.0e-120 Identity = 242/427 (56.67%), Postives = 284/427 (66.51%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. TAIR 10
Match: AT5G49020.1 (protein arginine methyltransferase 4A ) HSP 1 Score: 420.2 bits (1079), Expect = 1.9e-117 Identity = 242/417 (58.03%), Postives = 282/417 (67.63%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. TAIR 10
Match: AT5G49020.2 (protein arginine methyltransferase 4A ) HSP 1 Score: 417.2 bits (1071), Expect = 1.6e-116 Identity = 240/416 (57.69%), Postives = 281/416 (67.55%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024544 vs. TAIR 10
Match: AT3G20020.1 (protein arginine methyltransferase 6 ) HSP 1 Score: 99.0 bits (245), Expect = 9.5e-21 Identity = 83/265 (31.32%), Postives = 131/265 (49.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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