Sed0024029 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTCACTTCTCTCCTGCCAATTTTGCCCCTCTTTCGCCGGTGGGATTCTTGAAGAGAGCCGCCACCGTCTACGGCGGCCGTCCGTCGGTGGTTTACGGCGGTAGAGTGTTCACTTGGTCGGAGACTTATGAGCGGTGTCTCAACCTTTCTTCCGCTTTGGTTCATCACTTTCACATCTCTCCCACCGATTTGGTACTCTAAACTCTTTTCCTCTCTTCATAATTATTTATTATTTCATTGCTCTTAAAACTTTAGATATTCTGTTAAATTTTCTTTCTTTTTGTGCTATCAAGAGTTGAGTTAGCTTACATCATATATAATTTGATAACCAGAATGTTGAAGTTTGAATCTTTCTCTCTTCAATATCACTAAATTCATTAGAAAATAACTTGTTCTTTATAAACTTATTTTAACTTAGAATTGAGTTTAAATTCAATTCTTTTAAAACAGAATGAAACTAGTAGAGAAATCGAGAGAAAACGTGTTTAATTTTTAACGGCAAAAAACTGAAAATAAAATAATTATTAAACTAAATCAAAACCTTTTAAAGTTGTGTTTATAGTTTTTTTTAAAATAAATATTTCATGTTTAATCTATAAGGCATGTTTTAAGCTCTAAGAATATGTTAAATAATTAAAAACAACATAGCCTAGTGGCATGAACGTATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGAGGCTGTTTTTTTATATAATAATATTGGAGAAATAGAGATTCGAACCTGTAAGTTTGTATAAAATGTTGTTATAGCTATATTCTTGTTGGCTTTGATTTGATTGAGAAATTCTAGATTGGAGATTTAATTATTTTCTTTATTTCAACTAACATATGTTGGATATAAGAAAGTGCTAGGCATTGACCTTCTAGATCAATAATTTATATCTGAATTAATTGAACTAAATATAGGTTCAGAGAGGTTTGAACTTCTTCCAGTGTATTAAGAAGTATTTATTTATTTTTATTTTTTAGAATAATAGTGTATTAAGAAGTAAAATAACCTTTTTTGGGATGAAAATAGTAAATATGTTATCAAGTAGTATAGAAGAATATTTCTTCCTAAATGTTATTGAATAAAAGAAGAAGAACAAAAAGTAAGGTTGAATAGAATTTTCTAACGAGAATTTTTCCGTATGCAACGAAAGAATAAAATATCATAAATAGTTTATTTTCTTCTAATATAAAATTAATAAATAGTTTCTTTAAAAAAAAATAAGCTTGCACTATTATACTATACTTTCTCAAATCCAAGTATCACACTTCACCATTTTTATAGGCCAAAATTTTATTTCTTATTTTTAGAAAACAAAAGTTATATTTTTAAGTAAGGGCCTTCTAGAAGACAAGACGTGAGAATTATAATTTCTTTTTTCTGATACAGTGAGAATTATAATTTTAATTTATCATACAATATAAAAAAAAAAAAAATCAAATATCTTTCTCATTCTTTGAATTTAAAAATTCAAATACTCTCAATCAAATTGAAAACTTGTTTAATTATTGAAACGATTGATGGTCGGATGTTTCATTATTTGTTGAAATTCAATTCAATATCAAATTTGCGAGTTCTATTTTTTAAATTGATATTTAATTTTTATTTATTTGAAAATAATAGTATTATGTATATATAGTTTGTAGTCTCCTCCTCCAATTTGTACTTTAAAAAAACTAAAAAATAATTAAATTAATAAAAGAAACAAAAAAGAATAGAAAGAAGACTATGATTTGAAATATCATTTTGATATCGGCATATAATTATTTAATGTACACAATACACATCTAACCCATGTATCACAATATAAAAATAAACATATCTTACCTACGAGAAAATGTTGACTCCATATGAAGAATTTCTTCATTTTCTTTTCTGTATAAAAAATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAATTAAAAAATTCTATATTTAGTAGCTTGATTTCATCAAATTGCTTTGATCAAAGTCAATCTAACATCATATATATATATATAAGTAATATTTAGTTAAGAAATATACTTGTGTTTGTAAAAATAATAATAATAATTCTAGCTACAGTTGAGATATTCCACAAATTCGGTAGTTATGAATAATTGTTTTAGATTTCTTTCTTCATACGCATCACTTTTTTTTAAAAAAACTATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATCTTAATAGAAATATATTTTGAACCTTTTCTATTTTATAAGACTAAGAGCAAGTAAGTCTTAAGGTTATGGAAGGAAAAAAAAAAAAGTCATCTTCCTACTGTAGTTAGTTTTATAAGTTTGTTACTTTATCTTTCAATTTCATATCAATTGAATCCTAGACTTTGATGAAATGTGAAACAAGCAATTTCTCAAAACTAAATAATAAATTATTTCAAAAAATAAATATAAATTTATTTAAAAATCAAATAATAAACTACTTAAAATTCAACCAATAAAACACTTCAAATCAAGTAAAGGAAAGGAGGGAAAAAAAAGCAAAAAACTTAATACTTATACTTGAAAATGTCAAATCCAACTAGAGAATCAACAAGTAATAAATGAACACTTTCTTTAAAATTTAGCAACACAATCTAACTAAAAGATTATATGATATGAAAATTGTCAAAATAAACGTGTGCTTATACCTAAAAAGTTTGAATTATCGATTGTCAAGAGAGATTTAATTTTCCTACCCATCCATTATAAAAATATACCTAAAAACTAATAATGAACCCTACGAATAGTATCATTAATAAAAATAAATAAATCTTTAAAATTCAAAAAGAAAAATAAAAAGCTAGAAATTAGCCACCACATATACACACACATATAAAGAAGAGGATTTATTTAAATGATTTAAAAGTAAAAGAATAATGAAAATTTTTTTTAATAAAAGAATAATGAAAGTTTAGTCTTTAAATAACGTAATTTCTATTTACGTTTTTACTTATTTTTCAAAAAAATAATAATAATAATAATTTCATGTCATGGTTAAAGAGGACTACTGAATTCAAAAAAGAGGACTACTGAATCAATATATTATGATATTAAATTAGTAAGTAATTTTTTTAAAATCAGTAATTAACAGCTTTATATTTTAAAAATTAAAAATAAATATTATTAAAATGCCAGTGGTAAAAAAATGTTTGTTTTAAAATATAAACACCAAATAAAAATAAACTACATAATTTTCTAAAAATAATTTTAAATTATCATTAAAGTACAATTGGTGGGCTAGACTTGGATTGAGTCAACGGTCAACGCAATAAAGTAACGCACATGGAACTTAACATGTAAAACGGCGAAGCCGCGTGGGGCCATGTAACTTTTTGAGTGTATGTGGAAATTGTCCTACCCACACTTAAATTTAAACCTAATATCTATAACTATTTGATTTTTAAATTTAAATCATAAACAAATTTTTATAATATATTTTTTATTTGAATATCTACCTTTCACCTATTTTTATAAAATTAAACCAAATGTTTTTTTTTTTTTTAATTCAAAAGATTATTTTTGTTTTTGTAAGTTAGTTAATATTCACATACTTAAGAAGAAAGATGGATACATTTGTAAAAAACTGTAGAACACATTGTGAAAATTTGAATAAAAATATATTTATATTTTAAAAACAAAAAATTAAGGTCTCATTTGATAACCATTTCGTTTTTGGTTTTCTGTTTTTGTTTTTAATATTTTAAAAACAAGTTCGTTTGATAATGAATTTTAGTTTTTATTTTTAAAATTTTAAAAATGTTTTTAAAATATTAAAGGAATTTTAAAAACTAAAAAAAAGCTGTTTTCAAAAACACTTTTTTTTTGTTTTTAAAAAAAGCATGAATTATCAAATATGTTTTTTGGCTTTTAGTTTTCAAAAACAAAAAATTAAAATGAATTATTAAAGGTATATGATTTTGATTTTTTACAACAAAAAACCAAAATCCAAAAATGAAAAACTAGAAACAAAAAATAAAAAACGAAATGGTTATCAAATCGGACCTAAAATTTTGTTTTTTATTTTGTTTTGAAAAAGAAATATTCTCATTCAAAAAACATAGAAGTTACAAAAAAAGATGCAAACTCAGTTCAATCAATTTAGTGCATATAATGGTTTCATTATTTGGTTGTACAGTTTAACACTAGCGTCATAGGTTCGAGCTCGAGAATTGATACTTGTCCCTCCTCCCCCAATACATACTCCAAAAAAAAAAAAAAATTAGTGCATATAATTTTTAAAAACTAAAACTCAATTCTTATAATTTGATAAAGACTAAAAACTAGTTTTAATGGTTAGTAATTTATTGGCCAATTAAGTATATGAAAATTAGGTATTTATATATGTCAATAATTATGATATGGATTCAAGTAATAATTTAACCAAAAATAATATCAATAGTTACTTCCGTATACTTGATTAAATGGTATTTAAAACTATAAAGATTATATCTTATATTTTATCAAATCATAGAAACTATACTAGTTTCTTAAACTGTACTAAACCTAACATTCTCAAAACTAAATCTCTAGTTATGTCTAAACTTTAACATTTTTTTTTAATCATTGGCGAACAATATTTAAAATCTATTAAAACTTTTGTAACAAGTAAAAAAAGGAATTTTTCGACCATTCTCATATGGCATTTTGTTTAAAGGGTTGGACCACCCTATTTTGGTCAGTGCCATTTTTGTTTTATTTATCCAAAAGATGTTTTGAAAAATGAGTCAAATGTTTCAATACAATTGAGAATGAAAGCAAAATTCAAAATCATTTTTTCTATCTCTGAACTTCATTTTCAAAATATATTAATAAAATATAAATTTGATTATAATATAAAATTAAAATTTAGATCCATAATTTAAAAGCTCTTTTTTTTTATTCTTTAAAAAAATTATTTTTATAACTTGATTAAAGATCATAAATAGTTTTTATAGTTTAATATAACTCTCATAAATAATCC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MAHFSPANFAPLSPVGFLKRAATVYGGRPSVVYGGRVFTWSETYERCLNLSSALVHHFHISPTDLVAAMAPNIPELYELHFAVPMAGAIISPLNTKLDSPTLALLLQQLEPKIIFLDSQFLPIVLKSLSQNGNSIKIPALVLIPADPDTPPSEFLNYNQVLQMTFSDFTPQPIGELDPISVNCTSGSTGLHKGVVYSHRAAYLNSLATMFRTRICNTPSPVFLWTVDMFRCNGWCFVWAMAALGGCNVCLRTVTADAIFNNVELHKVTLLCGPTTLLKMISESSNRKPLSRRVDLVVAGALPIPEILTKVSEFGFDISYGYGMTEALGPAIIRPWKPNFDEETVQFEDLITSLEIDVKDPMSMESVLADGETLGEVMLKGNTLMSGYYKNLKATCDAFIGDWYRTGDVAVRHKSGRIEVKDRAKDVVVRADGATVSTVAVEAVLTSHPKVVEAAVIGFGERLCGFVKLKNGSRVSEEEIVEFCEFHLPKFMVPERVVFGDLPMNSTGKVQKFTVREKIKALNTS Homology
BLAST of Sed0024029 vs. NCBI nr
Match: KAG7015844.1 (putative acyl-activating enzyme 1, peroxisomal, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 861.7 bits (2225), Expect = 3.3e-246 Identity = 436/527 (82.73%), Postives = 469/527 (88.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. NCBI nr
Match: KAG6577804.1 (putative acyl-activating enzyme 1, peroxisomal, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 855.9 bits (2210), Expect = 1.8e-244 Identity = 433/527 (82.16%), Postives = 466/527 (88.43%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. NCBI nr
Match: XP_022923197.1 (probable acyl-activating enzyme 1, peroxisomal [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 855.1 bits (2208), Expect = 3.1e-244 Identity = 430/527 (81.59%), Postives = 469/527 (88.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. NCBI nr
Match: XP_023552791.1 (probable acyl-activating enzyme 2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 852.8 bits (2202), Expect = 1.5e-243 Identity = 429/526 (81.56%), Postives = 469/526 (89.16%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. NCBI nr
Match: XP_023007650.1 (probable acyl-activating enzyme 1, peroxisomal [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 850.9 bits (2197), Expect = 5.8e-243 Identity = 427/527 (81.02%), Postives = 466/527 (88.43%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SEY5 (Isovalerate--CoA ligase AAE2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AAE2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 479.9 bits (1234), Expect = 3.6e-134 Identity = 261/547 (47.71%), Postives = 359/547 (65.63%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HUK6 (Butanoate--CoA ligase AAE1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AAE1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 464.2 bits (1193), Expect = 2.0e-129 Identity = 252/544 (46.32%), Postives = 347/544 (63.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: M4IS92 (Probable CoA ligase CCL13 OS=Humulus lupulus OX=3486 GN=CCL13 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 456.1 bits (1172), Expect = 5.5e-127 Identity = 252/538 (46.84%), Postives = 344/538 (63.94%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: M4IRL4 (Isovalerate--CoA ligase CCL2 OS=Humulus lupulus OX=3486 GN=CCL2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 449.5 bits (1155), Expect = 5.1e-125 Identity = 245/538 (45.54%), Postives = 341/538 (63.38%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C8D4 (Butyrate--CoA ligase AAE11, peroxisomal OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AAE11 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 2.1e-110 Identity = 222/546 (40.66%), Postives = 345/546 (63.19%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E5I3 (probable acyl-activating enzyme 1, peroxisomal OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430963 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 855.1 bits (2208), Expect = 1.5e-244 Identity = 430/527 (81.59%), Postives = 469/527 (88.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L3K3 (probable acyl-activating enzyme 1, peroxisomal OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111500216 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 850.9 bits (2197), Expect = 2.8e-243 Identity = 427/527 (81.02%), Postives = 466/527 (88.43%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BKP8 (probable acyl-activating enzyme 2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103490658 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 795.8 bits (2054), Expect = 1.1e-226 Identity = 404/531 (76.08%), Postives = 460/531 (86.63%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L3L0 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G002400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 714.5 bits (1843), Expect = 3.2e-202 Identity = 364/463 (78.62%), Postives = 407/463 (87.90%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UEI8 (Putative acyl-activating enzyme 2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold139G00360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 691.4 bits (1783), Expect = 2.9e-195 Identity = 356/465 (76.56%), Postives = 403/465 (86.67%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. TAIR 10
Match: AT2G17650.1 (AMP-dependent synthetase and ligase family protein ) HSP 1 Score: 479.9 bits (1234), Expect = 2.5e-135 Identity = 261/547 (47.71%), Postives = 359/547 (65.63%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. TAIR 10
Match: AT1G20560.1 (acyl activating enzyme 1 ) HSP 1 Score: 464.2 bits (1193), Expect = 1.4e-130 Identity = 252/544 (46.32%), Postives = 347/544 (63.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. TAIR 10
Match: AT1G66120.1 (AMP-dependent synthetase and ligase family protein ) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 1.5e-111 Identity = 222/546 (40.66%), Postives = 345/546 (63.19%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. TAIR 10
Match: AT1G20560.2 (acyl activating enzyme 1 ) HSP 1 Score: 393.7 bits (1010), Expect = 2.4e-109 Identity = 218/473 (46.09%), Postives = 298/473 (63.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024029 vs. TAIR 10
Match: AT1G76290.1 (AMP-dependent synthetase and ligase family protein ) HSP 1 Score: 392.9 bits (1008), Expect = 4.1e-109 Identity = 220/533 (41.28%), Postives = 322/533 (60.41%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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