Sed0024020 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCATTCATTACAAGAAAGGTAAGGACAATGTGGTGGGTGATGCATTGTCAAGAAGGTATGCATTATTTTCTTCTCTTAGTGCAAAAATTCTTGGTTTTAAACATATGGTTGAGTTGTACAAAGTTGAGAAGTCTGAATTTCATGATGTTTATTTGCAATGCTTAGGAGGAAACAATGTTCATGATCATATTGTATTTGATGACATGCTTTTTAGGAAAGGGAAACTTTGTATTCCTAAGTGTTCAATTAGGGAGTTACTTGTAAAAGAAGCTCATGGGGAGGACTTATGGGACATTTTGGGAATTTAAAACATATAGCATGTTGAGTGAACACTTTTATTGGTTGAAAATGAGGAAGGATGTGAACAAAGTATGCAAACAATGTTTCAAATGTAAAGAGGCTAAGTCTAAGACACAACCACATGGTCTTTACACACCTTTAGATGTTCCTAGCGAACCTTGGGTTGACATTAGCATGGATTTTGTTCTAGGATTACCAAAGACTAAGAGACATCATGATAGCATTTTTGTTGTTGTTGATAGATTTAGTAAGATGGCACATTTCATTCCATGTAACAAAACAGATGATGCCACAAACATAGCTAATCTTTTCTTTAGGAAGTGGTTAGATTACATGGAATTCCCAAAACAATTGTGAGTGATAGAGATGTCAAATTTTTAAGTCATTTTTGGAAAGTTTTATGGGGAAAATTAGGAACCAAGCTTTTGTTTTCTACAACATGTCACCCCCAAACTGATGGACAAACCGAGGTGGTTAATAGAACGTTAGGAGCCCTACTTAGATCCTTAATTTCAAAGAATCTGAATACATGGGAAGAAACTCTACCATTTGTGGAATTTGCATACAATAGAGCGATACATAGTACCACTCATTGTTCACCATTTGAGATTGTGTATGGCTTTAATCCTCTAACTCCACTAGATTTATCACCATTGCCGCCTAATATGTTTACTAGTGATGCAGCATCTTCTAAGTCCGAATACGTAAAGGAATTGCACAAAGAAATCAAAGAAAGGATTGAAAAGAAAAATCAGAAGCTAATCACTACCAAATATCATGGGAGAAAGCAATTGATTTTTAAAAAGGGGGATTGGGTTTGGGTTCATCTACGAAAAGAGAGGTTTCCGGATCAAAGGAAGTCTAAACTACAACCAAGGGGAGATGGTCCTTTTCAAGTACTTGAACGAATAAATGATAATGCATACAAGCTAGATCTTCGAGGTGAGTACAATGTAAGTTCTACTTTTAATGTGGCTGACTTGACTCCTTTTGATGTAGGAATTGAAGATCTTGATTTGAGGTCAAATCCTTTTACAGAAAGGGGGGATGATACGAATCAAATAACCGATCCATTGCATGTACCTGAAGGACCTATTACAAGGAGTAAGGCAAAGAAGATTCAAGAGGAATATATATTACATCTTCAAAAGCTTGCCAATGCACAAGAAGAGACAAAACTTTTTCATCCCGAATTTATTTACAACGTTAGCGCAACAAGTGAAGAAGAGATTGAAGTGAAGATGACATGAGAATAGTAATTTTATTTTGGAAGATGACAACATGGCAGAATTTTAAATAAAGAAATTTCTAGATTTCTTATTTTGGGACTTTTTGATTTCAATGCTTGCCAACCATGCTCATTATTGCAATGGACCTTCTAGAAGAGTTGGTTGAGTGTATTTAAAGCATATCTACCCTTTTGTCTAGCATTTAAGCCATGCAATTTACTTTTGGCTTCTTATGTCTTATTTTCTACAAAATGCATTTAATAGCTTTTTGAGTCCTTTTTGTATTCAAGGCATGCACGAATTTTTGGCCTTTAAAATGGCTTGTAATACATCATTTTGGACAGATTCATGAATGAAAAACTTGTGTTTTCTTATACCCCATTTGGTGTTGTCTTTCTTTCAAATCTTGTTTTAGGTTTGAAGTTAAATCAATTCATTGGATTAGTCTTGATCAAACTAATTCTGGAGTGAGTTGTCTTAGGATCTAAGAGTGACCATTTTAGATTTTGAGTGTGATCTAAGTTAGCTATCATTGTGAGTTTTTACAAGGATCCTAGAAGGACCTCTAGCTTTGTAAAATTCAAGCAAGGATCGGCGCTTATCAGTCACTCTTAGATCCTAAGACAACTCACTCCAGAACTAGCTTGATCAAGACTAATCCAATGAATTGATTTTACTTCAAACCTAAAGCAAGATTTGAAAGAAATGAAACACCAAATGGGGTTCAAGAAAACACAAGTTTTTCATTCATGAAATCTGTCCAAAATGATGAATTACAAGCCATTTTAAAGGCAAAAAAATTCGTGCATGCCTTGAAATACAAAAGGACTCAAAAAGCTACTAAATGCATTTTGTAGAAAATAAGGCCTAGGAAACCAAAACTCAATTGCATGGCTTAAATGTTAGACAAAAGGGTAGATAAGCTTTGAATAGGACCAACTAACTCTTCTAGAAGGTCCCTTACAATTAAGAGCATGGTTGACAAGCATTGAAATAAAAAAGTTCTAAAATATAAAAATCTGGAAATTCCACTATTTAAATTTATGCATTCTAATTTTAAAAAGGCTCTTGAAATCTTCTTTTCTTGCTTCTTGTTGCTTCTTCATGTGAATACAATAAGTCGGTAGTTGAATTCATATCAAGGATCCTACAAGGACCTCTAGCTTTGTAAAGTTCAAGCAACGTTTGGCGCTTATCATTTGGTATCAGAGCATTTGGTCGACATTCCTTGGCCGGCTCTAGAGGTAAACTATCTTTTCAACATGTCACATAATGAACACAATTCAACACATGTACCGGGTTTCAGTACCGTTCTTGAAGCTCTTAAAGATATGTTGGAAATGATGAGAGAAGATATGAAAGAACGAAGAGCACATCGCAAAATGATGTCTTCAAGGTACACTAATCCTAAACCAATTTCAAATACTCAATTGTCTTTGGAAAATGATAATTTATGTGATGAAGTTCAGCCTATGGTTGAAGTAGAAAGTGGAAAAATTGAAAATGAAATGCTTTATGGTTTAGTTGCAACACATGCGAATGAGGTTAGTAGGGGATTAGATTGTAAGGACTTATTTTCTTGTATCCCCTTCGACTATTGTAAAACCTATGCTTAATGATGTACATATTGATGTGTGTGGAGTCTGGGAAAAAGGCACAAAAGGCTAAAACAAAAGCAAGTGAATTTATGGAAAAAGAATCTTGTGAGAAAATGAGTGTGAGAGATAAGCATGAGATTAGTTTATGGCCTATACAAAAAAAATGAGAGAAAAGCCAAAATTGTGAGCTCGTGTGAAAGAGTCAAAGAGGTTAAATCTATTTTGTTTTCAAAGCAAAATATTTTTAGACTTTTATATAAAGGAACTTGTTATTTAATGGGCGAGCTCAAACCATGTTTGTCTAGTGTTTCTTTTGAGTTCTTACAGAAGCAAAAGATCTTATACAACATCTCGAAGCGAAGATTCCTTCTAAAGTAAAGAATGTCCACAAACACAATGGCAACTTGTTTATTATGATGAAATACTCCAAATTTTCTTCTAAGTTCATCCATGGCAGCAAGCATAAAGTGTTCAAAAGAAGACAAAGATTTTGATTTGAGGACAAATCCTTCTAAAGAAAGGGGGGATCATATGAATTCAACTACCAACTTATTGCATGCACATGAAAGAGCAATTACAAGAAGAAGGAAAAGACGATTCCAAGAGGATGATAACAATTACATGGCAGAATTTTAAATAAAGAAATTTCTAGATTTCTTATCTTGGGACTTTTTGATTTCAATGCTTGCCAACCATGCTCATAATTGCAAGGGACCTTCTAGAAGAGTTGGTTGAGTCTTTTTTTTAAAGCTTACCTACCATGTCGTCTAGCATTTAAGCCATGCAATTGCGTTTTGGTTTTCTAGGCCTTATCTTCTACAAAAAGCATTTAATAGCTTTTAGAGTCCTTTTGTATTTCAAGGCATGCGTGAATTTTTGGCCTTTCAAATGGCTTGTAATTCATCATTTTGGACAGATTTATAATTGGAAAAACTTGTGTTTTGTTGAACCCCATTTGGTGTTTCATTTCTTTCAAATCTTGCTTTAGGTTTGAAGTTAAATCAATTCATTGGATTAGTCTTGATCGATCTAATTCTGGAGTGAGTTGTCTTAGGATCTAAGAGTGACTATTTTAGATTTTAAGTGTGATCTAAGTGATATGAATTCAACTACCAATTTATTGCATGCACATGAAGGAACAATTACAAGAAGAAGGAAAAGAAGATTCCAAGAGAATTATAACAATTACATGGCAGAATTTTAAATAAATAAATTTCTAGATTTCTTATCTTGAGACTTTTTTATTTCAATGCTTGCCAACCATGCTCATTATTGCAAGGGACATTCTAGAAGAGTTGGTTGAGTGTATTTAAAGCATATCTACCCTTTTGTCTAGCATTTAAGCCATGCAATTTACTTTTGGCTTCTTATGTCTTATTTTCTACAAAATACATTTAATAGCTTTTTGAGTCCTTTTGTATTCCAAGGCATGCACGAATTTTTGGCCTTTAAAATGGCTTGTAATTCATCATTTTGGACAGATTTCATGAATGAAAAACTTGTGTTTTCTTGAACCCCATTTGGTGTTTCATTTCTTTCAAATCTTGCTCTAGGTTTGAAGTAAAATCAATTCATTGGATTAGTCTTGATCAAGCTAATTCTGGAGTGAGTTGTCTTAGGATCTAAGAGTGACTATTTTAGATTTTAAGTGTGATCTAAGTTAGCCTTCATTGTGAGTTTTTGCAAGGATCCTAGAAGGACCTCTAGCTTTGTAAAATTCAAGCAACGATCGGCGCTTATCATTTGGTATCAGAGCATTTGGTCAACATTCCTTGGCCGACTCTAAAGGTAAACTATCTTTTCAACATGTCACATAATGAACACAATTCAACACATGTAGCGGGTTTCAATACCGTTCTTGAAG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ATGTCATTCATTACAAGAAAGGTAAGGACAATGTGGTGGGTGATGCATTGTCAAGAAGGTATGCATTATTTTCTTCTCTTAGTGCAAAAATTCTTGCTTTTAATAGGACCAACTAACTCTTCTAGAAGGGGGGATGATACGAATCAAATAACCGATCCATTGCATGTACCTGAAGGACCTATTACAAGGAGTAAGGCAAAGAAGATTCAAGAGGAATATATATTACATCTTCAAAAGCTTGCCAATGCACAAGAAGAGACAAAACTTTTTCATCCCGAATTTATTTACAACGTTAGCACAACAAACCCCATTTGGTGTTGTCTTTCTTTCAAATCTTGTTTTAGGTTTGAAGTTAAATCAATTCATTGGATTAGTCTTGATCAAACTAATTCTGGAGATCCTAGAAGGACTTCTGGCTTTGTAAAATTCAAGCAACGATCGGCGCTTATCATTAGTCTTGATCAAGCTAATTCTGGAGAACAAAAGGCTAAAACAAAAGCAAGTGAATTTATGGAAAAACAATCTTGTGAGAAAATGAGTGTGAGAGATAAGCATGAGATTAGTTTATGGCCTATACAAAAAAATGAGAGAAAAGCCAAAATTGTGAGCTCGTGTGAAAGAGTCAATGAGGTTAAATCTATTTTGTTTTCAAAGCAAAATATTTTTAGACTTTTATATAAAGGAACTTGTTATTTAATGGGCGAGCTCAAACCATGTTTGTCTAGTGTTTCTTTTGAGTTCTTACAGGAAGCAAAAGATCTTATACAACATCTCGGCGAAGATTCCTTCTAA MSFITRKVRTMWWVMHCQEGMHYFLLLVQKFLLLIGPTNSSRRGDDTNQITDPLHVPEGPITRSKAKKIQEEYILHLQKLANAQEETKLFHPEFIYNVSTTNPIWCCLSFKSCFRFEVKSIHWISLDQTNSGDPRRTSGFVKFKQRSALIISLDQANSGEQKAKTKASEFMEKQSCEKMSVRDKHEISLWPIQKNERKAKIVSSCERVNEVKSILFSKQNIFRLLYKGTCYLMGELKPCLSSVSFEFLQEAKDLIQHLGEDSF Homology
BLAST of Sed0024020 vs. NCBI nr
Match: TYJ98381.1 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 1.5e-16 Identity = 51/102 (50.00%), Postives = 66/102 (64.71%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024020 vs. NCBI nr
Match: KAA0067206.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold418G00080 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 1.3e-12 Identity = 39/63 (61.90%), Postives = 48/63 (76.19%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024020 vs. NCBI nr
Match: TYK09768.1 (Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 1.3e-12 Identity = 38/63 (60.32%), Postives = 49/63 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024020 vs. NCBI nr
Match: KAA0025406.1 (reverse transcriptase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 1.3e-12 Identity = 38/63 (60.32%), Postives = 49/63 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024020 vs. NCBI nr
Match: KAA0057648.1 (putative polyprotein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 1.7e-12 Identity = 39/63 (61.90%), Postives = 49/63 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BI77 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold232G001240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 97.8 bits (242), Expect = 7.0e-17 Identity = 51/102 (50.00%), Postives = 66/102 (64.71%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VL78 (RT_RNaseH_2 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold418G00080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 6.2e-13 Identity = 39/63 (61.90%), Postives = 48/63 (76.19%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CEW5 (Transposon Ty3-I Gag-Pol polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold127G00520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 6.2e-13 Identity = 38/63 (60.32%), Postives = 49/63 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SHU3 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold1220G00430 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 84.7 bits (208), Expect = 6.2e-13 Identity = 38/63 (60.32%), Postives = 49/63 (77.78%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0024020 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UR86 (Putative polyprotein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold43054G00210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 84.3 bits (207), Expect = 8.1e-13 Identity = 39/63 (61.90%), Postives = 49/63 (77.78%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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