Sed0023543 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0023543
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionVARLMGL domain-containing protein
LocationLG12: 8320066 .. 8331233 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0023543
SyntenySed0023543
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCGTCAAAGGCGGAGAAAAGTAAGGAGAAAAAAAAGCCTTCACGAAACAAACTGAGTGTGAGAGTTTCAATGAAGAAACAGAGCAGCTTGAAATCACCACCGTCTTCACCGCTCGAAATCTCTTCCGACGACCTCCTCCGCCGCAGCCTCCGCCGCCGGAACTCCAAATCCTTCGGCTGCGTCTCCGGCCTCCTCCACTTCCTCTCCACCACCACCAGCCACAGCTCCAAATCCATCACATTCGGTAAATCCCTCCCCCAATTCCAATCAATTTCAACCCAATTTCATAACATTCACAAGATTCCTCTGTTTATTTCAGTCCACACCCAAAATCAAGAACTCGAAGATTCAATTCCTCCGCCTCCAAAACCAGAATCCGCCGCTGATTGCAAAATTTCCTGTTCGGATTCGGATCCGCAGATCTCCGGGCGGTCGGAATCCGGAATGTGGAGGTTGAGGGGTCCGATCGTGCGGCTGATGGGACTGGAGGAAGCTCCGGCGACGGAGGCGGAGAAACAGAGGGAGGTTATGGCTGCTTTGGAGAAATGCGAGCGGGATTTGAAGGCGCTGAAGGAGTTTATCGACTCGTCGGATAGTTTCCGATCGTCGGCTCCGGCGGGTGAAGGGAAGAAGATTGAGTTCTTGGGTTGGGAGCCGAGTCCCGTATCGTTGCGGCATTTCGTTAACACTACTACCTCTGCTAATCCCGGTATGTTCTTACAATTTTTTTTAAATTCAATTATTATTATTATTATTATTTTCAATATATATATATATATATGTATGTATATATATATACATGTATATATATATATATGTATCATTTAAAATTTTGAGGTTTCTTTCATTTTTAAATTATCTTTTTGTTTGGTTGGAGCGTGAGAACATTAAGGAGACGTTTGGCTATTCCTCTCCCCATCGTTTGGCTCGCTGGGTTGAAATAATCCAGTCCAACCTGGCGCCTGGAGCCCACATGCGCATTTCCTTTTCTTTATTTTGCGTTTTTTTAACATTTATTTATACTTTTAATTTTCTTTTTGACTTAATATTGCCCACGTTTTTCCTTTTTTTAAAAAAATTTATTTATACATTTAATTTTCTTTTTTGAATTAATACTTGTTTGCTTTTATAATTATACATTTAATTTAATTTTTTATATTTTAATATTATTTTTTTAATAATATTTATTCAAAAATAAATTGTTAATATTACGATTCAAACGTGAACCATTTCTTAGATAAATAATTCAAGATAATACATTTAACCAACTCATCTATTTAAATTATTTGATTACATTTACGTGTTATATGTTACTTACTTACTTGCATATATTTTATTTTAATATGTATTAAACATTTATCATTTATATAATATTTGTAAATATTTATATATTTAAATTATTTATATCTAGTGATTGTATCTTTAAACAAATACAAACTTTATTTCATTTACGGATTTTTTTAATTCAATTATTAAATTTAATCATTTAAATTGTTTTACATCATTTTTGTTGTTGTTAATTTTAATGATTAATGTTTTAGATTTATCATTTAAATAATATTTATAATCATTTTTTTATTTATATTTGGATAAGAATTATTTGACAATGTTTTTTTGATAAATAATTTTTATTTATATTGCTCCTTTTTCACCTTATTTCACTCTTTTTTTTTTGTTAATTTTAATGGTATTTATAATATTTTATTTAACTAATATATGAAATGAAATAAAGTTTAAAATTCATTTTTTAAGAAATAGAAATAAAATATAAATAATTTTGAAACGTCTATTTTCCCTTAGAAAGAAATTTAAATACATATTTATATATTTTATTTTGATGTGATATAATCTTTTTAATTAATTATATATATATATATATTTATTTATATTTATATTTATATTTATATATTTATATGACTAAACTAATTAACTTCTGATTTAATTTTATTTATATAAAATTTATTCACATCAAATTATTTTGATTATTAATCTTTCAAATATAAAACCTAAATATTTGAATCATTTTACTTTTTATTTGATATTTTCTGTGATTTACTAAATTTCAACTACTATTTAAATAGTAATATAAATGAATAAACTTTAAAATAATATTTAATCAATAAATAAATTATATATTCAATTATTATATTAAAAAAAATACTAAATATATATTTTATAAATAAATCAAATAAAAAAACTTCATCTCTTTTCTTCCTATCCCATCTCACCAAACACATATACATATTAAATTTAATTTATTTGTATCTATTTATTTTTAACATGTCATGTTTTTTTTAAAATTATCATTAAAATAATATTTGTAGATATTTATATATTAATATTTTTATAAATATTAGTTGACAGTTTTTTTTAATTGTTAAATTTAATCATTTAAATTGCTTTACTTTATTTTATTTTTTTTGTTAATTTAATGATTGAAATTTACTAAATTTTAAATTTATTTCACTCATAAATGAAATGAAATAAAGCTTAAAATCTCACTTTTATTTAAAAGACATATTCGTAAAATATATCAAAATTTAAAAAAAAATGTTTACATTATTTTAAAAAGAAAATTAAATACATATTTGAATAATTTATTTAGATTGAGATATAATAATTTTAGATTAAATTAATATATAATTATTTTCCCCATATATTTGTATAAAAGATATACACATATATTTTTTATTTGATTTATTTATGAAAGTATATTTATATAACTAAATTAATTAAGTTTTGATTTTCTTGTTATATATAATTTATTTACATCAAATTATTTTGATTATTATTTTTTTAAATATGAAGTCTGACTATTTAAATTATTTATTTGATAGTTTTTATGATCTACTAAATTTTAAATAGTAAATTAAATGAATAAATTTTAAAATATATTTGATCAATAAATATAAATTACATATTTAATTATTATTATATTAAAAAACTACTAAATCATCTCATCCCACCAAACACTCATTTATTATCTCTTATCTTTTTATCCCTTTTCCACCAAACATAAACTTACTCTCACTTCCCTTCCCTTCCCAATTCATCCTACCCAAACATGCACTAAAACTTATTAGATAGGGATTGGTAGATGGTAGTTAGAGTTTTTTTAAAAAAAAATATAGACACTTTCTAATACTAGAATTTTAATACTAGAATTATATATATCTATATATATATATATATATATATATATATATATAAAAGTTTAATAAAATATGTCAATTGGGTGCTATATTTATTTATTTATAATTATAAACTGTTTCATACATTTTTACACTAAGTTTAAATCATCAAATAATAATTTCAATATAATATTGAATTTTATAACCATTTTTTCACGTTAGTTAAATTTATTAAAATTCACATTTATGTTAAAAAGATTAATATTTTATTTTTAGCTTAAAAATAATAGATGTTATTATTTTTTTAAAAAAAAAAAAACTTAAAAATTTATCGCATTAAAATTAAATTTTATCTCTGATTTTTAAAATAGATGTTCTTTAGTTTTTTCTCAATTTATCTATTAATCGACTAATTACTCTTAAATTATAAAATTTATAAGAGTTATATCATTATTATAATCATAATTATAAATAAGCGAAATATATTTATTAGTATATATCTATCAACTTACCTTTAATCTCAAATGATAATTTTATCAACAAAATATTCATACAAAAATTATTGTAATAAAAGTTAGATGAAAATTAAGGTAAATAATCTAACAAAAATAAGATAACTAAATTTTTTATTATAAAACAAAAAAAATAAAAAGAAACCAAGAAATGTAACCCGAAGAAAGAGAAATTCAAATGTTTTGTAAACAAAATATATAAAACTATATATATAGTAGGAAATCATTGTTTACCTAGAATTCATGTACTTTAACCTCGTCTTATCATTTTTCACATTTTTTTTCGAGATCTCCAAGTATTTTTTTGAAATGCAGAAACAATCCTTACAAAAATTATTGCAATAAAAGAAAAATTAGATGAAAGTTGAGGTAAATAATCCAATACAAATAAGATAACTTATTATAAAACAAAAAACAAAGAAAAGTAAATCCAAGCAAGGAAATTGGTATTGTAAACAAAATGTAGAGAATTATTTATAGGATTGGAAAATTCAATTTATTATTTTAATTAGAATATAAAATGTCACATAAAATCTATGAGATTTGGTAAAAATATCTTATTTTCTACACTAAAAGATGATGAAAATTGAAATGATATTGTAAACATTTTCATTTAATTGTTTAAATCTTTTATCTTCTAACTTAGCATAAAATGTATGAGATTTGATAAAAATATATTATCTTTTATGGATGAAAATCTAAATGATATTGTAAATATCTTCTACATCATTTGCATTTATTTTTTTTATATTGCAATGACATATTTGTAATTTAGGGTATGACTTAAGGATTAAAATCGTCCAAAAATGATTTTCTCTTTAAGTCACACTTTAAGGTAGTATGATATGATTATTTTAAATAAGATGAATTGATCAAAGATAATCAATTAACTTGAGTTTTTAAGTGCAGGAATTTTGATCATCTTACTTGGATCGTCACTTTTTCTGCTACTAGAATTTTAGCACGGCGTTGCACGTGATAATTTCTTAAATAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATATATATATTGTTTCTTACATTTTTAGTCTAAATTTAAATCATCAAATAATAATTTCAATATAATATTGAATTTTATAACCATTTTTTCAAGTAGTTAAATTTATTAAAATTCACATTTATGTTAAAAAGTAGTTAATTATTTATTTTAAGCTTAAAAAATAATAGGTGTTATTATTAAAAAAAAACTTAATAAAATTTATTGAATTAAAATTAAATTTTATCTCTAATTTTTAAAAATCGATGCTCTTTAATTTTTTTTCTCAATTTATCTATTAATAGACCATTACTTTTGAATTATAAAATTTATAAGAGTTATATCATTATTATAATTATAAATATAAATAAGCTAAATATATTTATTAGTATACATCTATGAACTTACCTTTAATCTCAAATGATAATTTTATCATTCTTCAAAAAAAATTCTCACATCCCCAAGTCAACCATTAAGCCACAAAATATCCTTACAAAAATTATTGCAACAAAAAAAATTTAAATGAAAGTTAAGTAAATAATCCAACAAAAATAAGATAACTAAATTTTTTATTATAAAAAAAAAACCAAGAAAGTAACCCCAAGAAAAAAGAAAGTTTCAAATGTGTTTATAAACAAAATATAGATAACTATATATATATAGTAGGAATTCATTGTTACCAAACTTTTGAAATTCAGCAATTCATGCACTAACTTCAGATGATAATCTTATAATTCTTCAAACTTTTTTTAAAAAGTATCTACAAAAATTATTGCACAAAAGAAAAATTAGATGAAAGTTAAGTAAATAATTCAACGTAACTTATTATAAAAAAAAAATAATAAATCCAAGCAAACAGAAAGTGTTCTTGTAAATAAAATGTAGGCACCTATTTATAGGATTGGAAAGTTCAATTTATTATTTTAATTAGAATATAAAATGTCAAATAAAATCTATGAGATTTGCTAAAAATATCTTATTTTCTACATGAAAACTTAAATGATATTGTAAATATCTTCATTTGATTGTTAAAATCTCTTATCTTCTAACTTAGTCATAAATCTATGAAATTTGATAAAAATATCTTATCTTCTACGGATGAAAATCTAAATGATATTGTAAACATCTTCTACGTCATTTGAATTTTGTGAAAAATTCAATTTATTATTTTAATTAGAATATAAAATGTCAAATAAAATCTATGAGATTTGGTAAAAATATTTTATTTTCTACGTAAAAATTTAAATGATATTGTAAATATCTTTATTTGATTGTTGAAATCTCTTATCTTCTAATTTAGTCATAAAATCTATGAGATTTGATAAAAATATAGTATCCGGATGAAAATCTAAATGATAATGTAAATATCTTTTAGTTTATTTGAATTTTTTTATATATTCCAATAAATGAAATTTTTGTAATTTAGGGTATGACTTAAGGGGTAAAATCGTCTAAAAATGATTTTTCTCTTAAGCCACACTTTAAGGTAGTATGATATGATTAAGCCACACTTTAAGGTAGTATGATATGATATGATATAATAAGCCACACTTTAAGGTAGTATGATTAATAAAATTTCTCTTATTAAATTAATAGAATTCGAAATATATTTAAGTCATCATAATGCTCAACTACGTGATCGGATATAGTTTATATCCTATTTTATTTCAAATCTAAAAGTTAAAAAAATAAATAAAGAAAATTATAATATGATTTATTAGGTCACCTAATTGGTCTATGACCTAAATATTCCTCTAAGAGTTTATAAAAACATAATTAAAGATGTAAGTCTTATAAACAATGTTTTTTTTTTAGTTTTAAATATAATTTATAAAGAAGAGCATTCTAACTTATAATATGTATTTTTGGGTTCACCGCCCTTCTATTGAATCTCAATTTTATTTTATTAGACTAAATATACATTTAAATTATCATACCGGCCATACTTGAGTTAATGTTGATATTCATCTTAAAACTAAGGAAAATTGTAGTGGATGACCTATTTTAACAAAATTATTACAAAAGTAGTTAAATTTGAAAATATTTACATCCATAATTATAAATACAGTTCAATAAGGTATTTATTACAATTATTAATATAATATTTTGTATTATTAATACTTATGATTATGGTCGTTAAAAAAATTTCAAATGTGATTACATTTATAATTATTTTCTGAATTTAACTAGTTTTGTAAATTTCTCAAAAACCAATAAGTAAGGAGAGAAATAGTTTACTTATCTTTTACCAAACTCCTACTTTTGATGTAAGACAATAATAGGATATTTAACACTCTTAAGCATATGTCTGTTATCAACTTTATGTAAGATAATTTTCAAATTTGAACTCAAATGTTTGAAAATTAAAACTAATACTTTACTATAAATTTAAATATTTCACAAAAATAAGGGTAACTATAGTAATGAAGAATATGTAAGTAAATTATTGTTTTTAAAAAAAGAGATTATGGGAGTAAACCAAACTTTTATTTGTTATTATTATTAGTTCTTTTTAAATCAAAATGATGTTCTTTTTAAAAATTTATTGTCGTATGGAATTCTTTCAAAATCTATTATCAAAATGGAATTCTTTTTATTTTTTCAAATAATGCTATTTTAGTTTGGAAATTGGTCTAACAGTCAACTGCCACGGCCGTGGACCATGGTTGTTTTGTTTAGCGGTGGTTGGACGGCACCGCTTGCAAAGACGTTTCTGTTTGTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTCTTTAAGATGTCACTAAATAAGAATAAATAAATAAAATCTCATTTTCATAATAAATTTATTTTGATGATAAAATTTAAAAAAACGTCATTTTGATTAAATAAAATAAGTCAAACATGCATAAACAATAAAAATTCACGATCAAAAGTAGTCTTGGGGAACTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTGAGAATAAGACTAAACAACTTGTGAAGACGCCGTCGTGGATAGCATAAATTGATTTTTTCACAAAATAATTATTTTAAATTTATAAATATTTTATTCATTGTCAATAATACATTTCATTACTATTTTAAATTTAAAAATATTTTTATTCATCGTCAATAATACATTTTATTACTGTACTATAAATACTACTAACTAAATTTTTTTAAAAAAAATCATATTATTAATTATTTTTTAGATTTATCTAGTCTTATAAATTTTTCATAAATAAATTGAATGTCGTAACTAAAAGAAAATTAAATTAAATTTTCACTATTTAATGAAATGAGAATTATAAAATCATATTCGTCCCAAAAAAAAGCATTAGTGAGTAAAATAAGTAGAAGAGAGTATCTATTATATACTATAACCATGGCTTGATAATATTTTCAAAAAAATAATAATAATAACCGAGGCTTGATAAATCATAGTTCAATTATGAAACACTATTTATCTTTTATTATAGCTAAAAATAGCAGTAGTTCAACCACATTAACTATACATTTAATGATTTAATGACTGAAAGGTATAAAACTTATTATGAAATGTTCAAATCTCCTCACCATGATTAGTCTGAGAGCTAATCATAAGGTGAAAAATGGTAATGTTAAACTCATTTTATAATTTATCTACAATCAGTTGAGATTATTAAATCATCTAAACTTCAATTCAAAAACAATATTAATAATCATACCTATGACTATGGGTGCTTGGGTTGAATTAGAGATTTCTTTACACCAACCAAACTTTTGATTTGGAGTAATTTATCAACCTTTATATTAGAACAACTCAACTCATCTCATATATTTTTTTTGTTTGATTGAATTGGATTATTAGATCGTAAATGTTTCATATTTTCTCTTTAAAACTAAACTTATAGCATGTAATCCATAAATATGTGGAAAACAAATTGCATATTTTGGACCCAAATTATTTATTTATCTTGTTAGTTGAGGATTAGAATTTATCTTATTAATTAATCTACTTAATTAATCTTAATAATATATATATATATATATATATATATTATTCTTAGTTTGTTCAGGTAAAGTTAGATTAAACCGAGCTAAAAATTTGTCAACTCAAGACCGAATTCGAATCAACCCAAAAAAATATAAATTATAATCTAACTCAACACAAAGAACATTATAACTCAATTCAATCTTTATATTTGAGGTGGGTAGTCCCGATCACTTGGGTAATTATTATTTTTTTATACATTTCTACTTTTTTTTTTTTGAAAATCGGGAAACCGGAGCTTTGCTCGGATCCCTAGAGTTTGATATCGGGATAATACTCTGAAATCCTTAGCCTCAACCACTGGGCTGCTCCTTCGAGACTATACATTTTTACTTAATGAAAAATAAATTAGTGATATATTCTTAACACTAATAAACTTTTTAGAAAAATTATTGGTTATTTAAACATTTTATTGCTAAAAATAACTATCGATTGAGCTTATATTGTTAAAGGTAACTTTTTTAAAATATAAAATTGAAATAGTTTTATAGAGTTTCAAATTATATATTAAAAAAAATAAAATTGTAGTGAATAGTCTATACTCACAAAATAATTGTAGATTTAGGAAATTTTAAAAATAAATATATTATATTGTATTATTAATATATTATTATGTATTATTAATAAAACATTATATGTTATTAGTACAATATTGTGTATTAATATAGTATTATTATTAATAATACCGTATAATTATTAATATATATAACTTTGATGGCTTTTATTTTGCCCCGTATTGTAAATACTTTTTAAATTTGGTCTATTCTTAAAGAAAATCCTTTAAAATGTCTTAATTTTTTAAAAAGATTTTTTTAAAAAAAAAAGTTTTAAAAAATATTTATAAAATTTAAGAACTTGGTAAACACAAAACAAAAATGTTTTAATTTAAAAATGAGCAACCCTATGATTTAAGCATAAAGATAAAGATTATTCATGAAAGGGAGAAATCTGTTATTGAATATGTATTGAGAAAGTCCACACAAAAAAATAAAACATGAAACATGAAAAAGGGACAAAAAGAAAACATAAAAGTAAAAAGGTGAAGAAAGTGATAATTTTGTATGTCTGTTGGGAGATAATAAAGTGAAAATAAGGAGTCAGCAATGATAGCACATCAATTGCAGCTTGCAATAATAGTAGTAATTTAGGGACCAACTAAAGTCATTGGCTTTATTGTTTAATGCAATTATTCTCAACTTCCATTCAATAACTTGTACCATTTCTTTTATTTGTTTATTTATTTGGATTGAGCTTTTAGACTACCTTATTCAAACTTCATGAACATTCACTTCCGTTTTAATTTCCACTTTCCAATTCAACATCCATGTAGTTTGATCTTACTATTTTTTTTTTTTTTTTGGAGTATTTTAGAAATACTTATCACCATATGTCAAAGAATGGATCACATCCTTTTATTTTTATTTTTTTAAAAAAAATTGACTTTAATCGATGAAGAGTGAAATGCTTACGTGTAAAATTGTTTAAAAAGTAAAACGATGTGTTCCAATTTTTGACATGTGATAGGTAAGTATTGCTTTTTTTTGTATGTGTGTTTTGAGTTTGTGATTCAAAATTTAGTTTGACAGAATATACTCAAGAGAGATAAAATCTTTCTGACTCAATTTCTCTTAGTTAATCTAATTTTATTTTTTTAAAGATTGAATTGTAAACTTGGTTCCTATAATTTAGAGAGAATTGTGTATAGTTTTGAAAGTTAAACTTTTAGTTGTCATGGTTTGATAAAATTTCATAAATAATCATTACGGATCATAATTACTAACAAATTAAGTATTTGTAGTTAATTATTCATATGTCAATGAAGTGATTTTTGTATTTTGTTAATGATGTGTGTTAGATAAGCTATAAAGAATGTGTTTGAAATGGCAATTAATTTATTTTTATAAATAAACTATTTAACTCACAATTTCAACTAAATACAAAGTTCGCCACATTTGTTCATGAATGTCTACTTGTCACATACTTAATTTGTAAACGATTACGAATGACATAAATTATTTATGAAGTTTCATCAAACCACACTCCAAACCAGCTGAGGGCTTGATTCCTCACCTTAATGTTTTGATTCAAAGGCATAAACATTTGAAATATTCATTCATTTATACCTTTTCTATGAAACATAATTTAATCTTTAACAAATGTAGAAAGAGCACAACTACCTCAAAGACAAGATCAATTGCAAAGGAAGAATCCAAGAGAAGAAGATGCCTTCAATCTAAACAAAATTGACAAAATCAAAACCAATGAAGAACTAGTTGGTAAGTGCAAGAATGAATTATTATCTCCATTATGTAGCAGCAGCAAGGCAATAATGAGAGATATTGTAGAAGGAGTTTCCAAAGACATTGCTTGGGGTCAAAAGAGGGAAGTGGAAAGAATAGTATTGGCTTTACAACATCAAATTTTTGCTGACTTGATTGAAGAGCTAGTTAAAGATTCAATTTTTAGCTATTCATTTAGTTATAGTTCTTTACCATTTGAAGCTTGCAAAAGAAGACTTTGTTTCTAG

mRNA sequence

ATGGCGTCAAAGGCGGAGAAAAGTAAGGAGAAAAAAAAGCCTTCACGAAACAAACTGAGTGTGAGAGTTTCAATGAAGAAACAGAGCAGCTTGAAATCACCACCGTCTTCACCGCTCGAAATCTCTTCCGACGACCTCCTCCGCCGCAGCCTCCGCCGCCGGAACTCCAAATCCTTCGGCTGCGTCTCCGGCCTCCTCCACTTCCTCTCCACCACCACCAGCCACAGCTCCAAATCCATCACATTCGTCCACACCCAAAATCAAGAACTCGAAGATTCAATTCCTCCGCCTCCAAAACCAGAATCCGCCGCTGATTGCAAAATTTCCTGTTCGGATTCGGATCCGCAGATCTCCGGGCGGTCGGAATCCGGAATGTGGAGGTTGAGGGGTCCGATCGTGCGGCTGATGGGACTGGAGGAAGCTCCGGCGACGGAGGCGGAGAAACAGAGGGAGGTTATGGCTGCTTTGGAGAAATGCGAGCGGGATTTGAAGGCGCTGAAGGAGTTTATCGACTCGTCGGATAGTTTCCGATCGTCGGCTCCGGCGGGTGAAGGGAAGAAGATTGAGTTCTTGGGTTGGGAGCCGAGTCCCGTATCGTTGCGGCATTTCGTTAACACTACTACCTCTGCTAATCCCGAAAGAGCACAACTACCTCAAAGACAAGATCAATTGCAAAGGAAGAATCCAAGAGAAGAAGATGCCTTCAATCTAAACAAAATTGACAAAATCAAAACCAATGAAGAACTAGTTGGTAAGTGCAAGAATGAATTATTATCTCCATTATGTAGCAGCAGCAAGGCAATAATGAGAGATATTGTAGAAGGAGTTTCCAAAGACATTGCTTGGGGTCAAAAGAGGGAAGTGGAAAGAATAGTATTGGCTTTACAACATCAAATTTTTGCTGACTTGATTGAAGAGCTAGTTAAAGATTCAATTTTTAGCTATTCATTTAGTTATAGTTCTTTACCATTTGAAGCTTGCAAAAGAAGACTTTGTTTCTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCGTCAAAGGCGGAGAAAAGTAAGGAGAAAAAAAAGCCTTCACGAAACAAACTGAGTGTGAGAGTTTCAATGAAGAAACAGAGCAGCTTGAAATCACCACCGTCTTCACCGCTCGAAATCTCTTCCGACGACCTCCTCCGCCGCAGCCTCCGCCGCCGGAACTCCAAATCCTTCGGCTGCGTCTCCGGCCTCCTCCACTTCCTCTCCACCACCACCAGCCACAGCTCCAAATCCATCACATTCGTCCACACCCAAAATCAAGAACTCGAAGATTCAATTCCTCCGCCTCCAAAACCAGAATCCGCCGCTGATTGCAAAATTTCCTGTTCGGATTCGGATCCGCAGATCTCCGGGCGGTCGGAATCCGGAATGTGGAGGTTGAGGGGTCCGATCGTGCGGCTGATGGGACTGGAGGAAGCTCCGGCGACGGAGGCGGAGAAACAGAGGGAGGTTATGGCTGCTTTGGAGAAATGCGAGCGGGATTTGAAGGCGCTGAAGGAGTTTATCGACTCGTCGGATAGTTTCCGATCGTCGGCTCCGGCGGGTGAAGGGAAGAAGATTGAGTTCTTGGGTTGGGAGCCGAGTCCCGTATCGTTGCGGCATTTCGTTAACACTACTACCTCTGCTAATCCCGAAAGAGCACAACTACCTCAAAGACAAGATCAATTGCAAAGGAAGAATCCAAGAGAAGAAGATGCCTTCAATCTAAACAAAATTGACAAAATCAAAACCAATGAAGAACTAGTTGGTAAGTGCAAGAATGAATTATTATCTCCATTATGTAGCAGCAGCAAGGCAATAATGAGAGATATTGTAGAAGGAGTTTCCAAAGACATTGCTTGGGGTCAAAAGAGGGAAGTGGAAAGAATAGTATTGGCTTTACAACATCAAATTTTTGCTGACTTGATTGAAGAGCTAGTTAAAGATTCAATTTTTAGCTATTCATTTAGTTATAGTTCTTTACCATTTGAAGCTTGCAAAAGAAGACTTTGTTTCTAG

Protein sequence

MASKAEKSKEKKKPSRNKLSVRVSMKKQSSLKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTTSHSSKSITFVHTQNQELEDSIPPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGMWRLRGPIVRLMGLEEAPATEAEKQREVMAALEKCERDLKALKEFIDSSDSFRSSAPAGEGKKIEFLGWEPSPVSLRHFVNTTTSANPERAQLPQRQDQLQRKNPREEDAFNLNKIDKIKTNEELVGKCKNELLSPLCSSSKAIMRDIVEGVSKDIAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFSYSSLPFEACKRRLCF
Homology
[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. NCBI nr
Match: XP_022983018.1 (uncharacterized protein LOC111481687 [Cucurbita maxima])

HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 1.8e-75
Identity = 197/354 (55.65%), Postives = 229/354 (64.69%), Query Frame = 0 

Query: 25  MKKQSSLKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTT-SHSSKSITFV 84
           MK+Q+S  S  SS +EISSDDLLRRSL RR SKSFGCVS LLHFLS    S  +KSITFV
Sbjct: 1   MKRQNSFLS-SSSQVEISSDDLLRRSLSRRRSKSFGCVSNLLHFLSNNNHSRRNKSITFV 60

Query: 85  HTQNQEL------EDSIPPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGM--------WRLR 144
           H  NQE       E  I   PKPESAA+  IS S S PQI+ RSES +           R
Sbjct: 61  HNSNQEFLDNASSESKISRSPKPESAANLLISSSVS-PQIAERSESEISTTKVERFLGAR 120

Query: 145 GPIVRLMGLEEAPATE-----AEKQREVMAALEKCERDLKALKEFID---SSDSFRSSAP 204
           GPIVRLMGLE +   E     AEKQR+VM ALEKCE+DLKALKEFID   S++SFR S+P
Sbjct: 121 GPIVRLMGLESSKVEESVPEAAEKQRKVMEALEKCEQDLKALKEFIDALESTESFRMSSP 180

Query: 205 AGEGKKIEFLGWE----PSPVSL-------RHFVNT----------TTSANPERAQLPQR 264
             EGK+IEF+ WE    PSPVS+       RHFVN             SANP R Q  QR
Sbjct: 181 VSEGKRIEFMAWEQLQDPSPVSVLEELSRPRHFVNRHACNNSRIFHQPSANPGRVQSQQR 240

Query: 265 QDQLQRKNPREED-AFNLNKIDKIKTNEELVGKCKNELLSPLCSSSKAIMRDIVEGVSKD 324
           Q  +QRK  +E D  FN++K ++ K  EE+VG  KNE  +      +  M+D VEGV KD
Sbjct: 241 QQMMQRKKKQEGDHIFNISKFERTKIPEEVVGNLKNEKAAESPGCGREAMKDSVEGVCKD 300

Query: 325 IAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFSYSSLPFEACKRRLCF 334
           I+WG K EV RI LALQHQIF DLIEELVKD    ++F+Y+SLPFEAC+RRLCF
Sbjct: 301 ISWGLKMEVGRIGLALQHQIFGDLIEELVKD----HTFTYTSLPFEACRRRLCF 348

[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. NCBI nr
Match: KAG7017598.1 (hypothetical protein SDJN02_19464 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 292.0 bits (746), Expect = 6.7e-75
Identity = 195/354 (55.08%), Postives = 229/354 (64.69%), Query Frame = 0 

Query: 25  MKKQSSLKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTT-SHSSKSITFV 84
           MK+Q+S  S  SS +EISSDDLLRRSL RR SKSFGCVS LLHFLS    S  +KSITFV
Sbjct: 1   MKRQNSFLS-SSSQVEISSDDLLRRSLSRRRSKSFGCVSNLLHFLSNNNHSRRNKSITFV 60

Query: 85  HTQNQEL------EDSIPPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGM--------WRLR 144
           H  NQE       E  I   PKPES A+  IS S S PQI+ RSES +           R
Sbjct: 61  HNSNQEFLDNASSESKISRSPKPESVANLLISSSVS-PQIAERSESAISTTTVERFLGAR 120

Query: 145 GPIVRLMGLEEAPATE-----AEKQREVMAALEKCERDLKALKEFI---DSSDSFRSSAP 204
           GPIVRLMGLE +   E     AEKQR+VM ALEKCE+DLKALKEFI   DS++SFR S+P
Sbjct: 121 GPIVRLMGLESSKVEESVPEAAEKQRKVMEALEKCEQDLKALKEFIDALDSTESFRMSSP 180

Query: 205 AGEGKKIEFLGWE----PSPVSL-------RHFVNT----------TTSANPERAQLPQR 264
             EGK+IEF+ WE    PSPVS+       RHFVN             SANP R Q  QR
Sbjct: 181 VSEGKRIEFMAWEQQQDPSPVSVLEELSRPRHFVNRHACNNSRIFHQPSANPGRVQSQQR 240

Query: 265 QDQLQRKNPREED-AFNLNKIDKIKTNEELVGKCKNELLSPLCSSSKAIMRDIVEGVSKD 324
           Q  +QRK  +E D  FN++K ++ K  EE+VG  KNE  +     S+  M+D +EGV KD
Sbjct: 241 QQMMQRKKKQEGDHIFNISKFERTKIPEEVVGNWKNEKAAESPPCSREAMKDSLEGVCKD 300

Query: 325 IAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFSYSSLPFEACKRRLCF 334
           I+WG K EV RI LALQHQIF DL+EELVKD    ++F+Y+SLPFEAC+RRLCF
Sbjct: 301 ISWGLKMEVGRIGLALQHQIFGDLLEELVKD----HTFTYTSLPFEACRRRLCF 348

[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. NCBI nr
Match: XP_022935193.1 (uncharacterized protein LOC111442147 [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 289.7 bits (740), Expect = 3.3e-74
Identity = 194/354 (54.80%), Postives = 228/354 (64.41%), Query Frame = 0 

Query: 25  MKKQSSLKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTT-SHSSKSITFV 84
           MK+Q+S  S  SS +EISSDDLLRRSL RR SKSFGCVS LLHFLS    S  +KSITFV
Sbjct: 1   MKRQNSFLS-SSSQVEISSDDLLRRSLSRRRSKSFGCVSNLLHFLSNNNHSRRNKSITFV 60

Query: 85  HTQNQEL------EDSIPPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGM--------WRLR 144
           H  NQE       E  I   PKPESAA+  IS S S P I+ RSES +           R
Sbjct: 61  HNSNQEFLDNASSESKISRSPKPESAANLLISSSVS-PPIAERSESAISTTTVERFLGAR 120

Query: 145 GPIVRLMGLEEAPATE-----AEKQREVMAALEKCERDLKALKEFI---DSSDSFRSSAP 204
           GPIVRLMGLE +   E     AEKQR+VM ALEKCE+DLKALKEFI   DS++SFR S+P
Sbjct: 121 GPIVRLMGLESSKVEESVPEAAEKQRKVMEALEKCEQDLKALKEFIDALDSTESFRMSSP 180

Query: 205 AGEGKKIEFLGWE----PSPVSL-------RHFVNT----------TTSANPERAQLPQR 264
             EGK+IEF+ WE    PSPVS+       RHFVN             SANP R Q  QR
Sbjct: 181 VSEGKRIEFMAWEQQQDPSPVSVLEELSRPRHFVNRHACNNSRIFHQPSANPGRVQSQQR 240

Query: 265 QDQLQRKNPREED-AFNLNKIDKIKTNEELVGKCKNELLSPLCSSSKAIMRDIVEGVSKD 324
           Q  +QRK  +E D  FN++K ++ K  EE+VG  KNE  +      +  M+D +EGV KD
Sbjct: 241 QQMMQRKKKQEGDHIFNISKFERTKIPEEVVGNWKNEKAAESPPCGREAMKDSLEGVCKD 300

Query: 325 IAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFSYSSLPFEACKRRLCF 334
           I+WG K EV RI LALQHQIF DL+EELVKD    ++F+Y+SLPFEAC+RRLCF
Sbjct: 301 ISWGLKMEVGRIGLALQHQIFGDLLEELVKD----HTFTYTSLPFEACRRRLCF 348

[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. NCBI nr
Match: XP_023528398.1 (uncharacterized protein LOC111791339 [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 285.8 bits (730), Expect = 4.8e-73
Identity = 194/356 (54.49%), Postives = 230/356 (64.61%), Query Frame = 0 

Query: 25  MKKQSSLKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTTSHSS---KSIT 84
           MK+Q+S  S  SS +EISSDDLLRRSL RR SKSFGCVS LLHFLS   ++ S   KSIT
Sbjct: 1   MKRQNSFLS-SSSQVEISSDDLLRRSLSRRRSKSFGCVSNLLHFLSNNNNNHSRRNKSIT 60

Query: 85  FVHTQNQEL------EDSIPPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGM--------WR 144
           FVH  NQE       E  I  PPKPESAA+  IS S S P+I  RSES +          
Sbjct: 61  FVHNSNQEFLDNASSESKISRPPKPESAANLLISSSVS-PKIEERSESAISTTTVERFLG 120

Query: 145 LRGPIVRLMGLEEAPATE-----AEKQREVMAALEKCERDLKALKEFI---DSSDSFRSS 204
            RGPIVRLMGLE +   E     AEKQR+VM ALEKCE+DLKALKEFI   DS++SFR S
Sbjct: 121 ARGPIVRLMGLESSKVEESVPEAAEKQRKVMEALEKCEQDLKALKEFIDALDSTESFRMS 180

Query: 205 APAGEGKKIEFLGWE----PSPVSL-------RHFVNT----------TTSANPERAQLP 264
           +P  EGK+IEF+ WE    PSPVS+       RHFVN             SANP R Q  
Sbjct: 181 SPVSEGKRIEFMAWEQQQDPSPVSVLEELSRPRHFVNRHACNNSRIFHQPSANPGRVQSQ 240

Query: 265 QRQDQLQRKNPREED-AFNLNKIDKIKTNEELVGKCKNELLSPLCSSSKAIMRDIVEGVS 324
           QRQ Q+QRK  +E D  FN++K ++ K  EE+VG  KNE  +      +  M+D +EGV 
Sbjct: 241 QRQ-QMQRKKKQEGDHIFNISKFERTKIPEEVVGNWKNEKAAESPPCGREAMKDSLEGVC 300

Query: 325 KDIAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFSYSSLPFEACKRRLCF 334
           KDI+WG K EV RI +ALQHQIF DL+EELVKD    ++F+ +SLPFEAC+RRLCF
Sbjct: 301 KDISWGLKMEVGRIGMALQHQIFGDLLEELVKD----HTFTCTSLPFEACRRRLCF 349

[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. NCBI nr
Match: XP_038905750.1 (uncharacterized protein LOC120091709 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 256.1 bits (653), Expect = 4.0e-64
Identity = 190/356 (53.37%), Postives = 228/356 (64.04%), Query Frame = 0 

Query: 25  MKKQSSLKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTT-SHSSKSITFV 84
           MK+Q+S  S  SS +EISSD+ LRRS R   S+SFGCVS LLHFLS    S  +KSITFV
Sbjct: 1   MKRQNSFLS-SSSQVEISSDNFLRRSHRHHGSRSFGCVSSLLHFLSNNNHSRRNKSITFV 60

Query: 85  HTQNQELED-----SIPPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGMWR--------LRG 144
           H    EL++     +I   PK ESAA+  IS SDS PQI+ RSES M           RG
Sbjct: 61  HNSIHELDNAISKSNISQSPKHESAANLLISSSDS-PQIAERSESTMSTTTVERFRGARG 120

Query: 145 PIVRLMGLEEAPATE-----AEKQREVMAALEKCERDLKALKEFI---DSSDSFRSSAPA 204
           PIVRLMGLE + A E      EKQR++M ALEKCE+DLK LKEFI   +S++SFRSS+PA
Sbjct: 121 PIVRLMGLESSTAEEGVPAAVEKQRQIMEALEKCEQDLKVLKEFIEAFESTESFRSSSPA 180

Query: 205 GEGKKIEFL----GWEPSPVSL---------RHFVNT----TTSANPERAQLPQRQDQLQ 264
           GEGK+IE +      E SPV+L         RHFVNT      SAN  R +L Q Q Q+Q
Sbjct: 181 GEGKRIELMVLKQKEEASPVALSVVEELSRRRHFVNTMFFHRPSANSGRMELQQIQ-QMQ 240

Query: 265 RKNPREEDAF--NLNKIDKIKT--NEELVGKCKNELL---SPLCSSSKAIMRDIVEGVSK 324
           RK P  +     NL+K D  KT  +E ++G  K+E     SPLC  SK  MRD VE V K
Sbjct: 241 RKKPEGDMMMFNNLSKFDSTKTKIHEIVIGNWKSEKAAEQSPLC-RSKVAMRDSVEQVFK 300

Query: 325 DIAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFS-YSSLPFEACKRRLCF 334
           +I+WGQ +E+ RI LALQ+QI  DLIEELVKD  ++Y+   YSSLPFEACKRRLCF
Sbjct: 301 EISWGQNKEMGRIGLALQNQICGDLIEELVKDLNYNYTCGYYSSLPFEACKRRLCF 352

[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J6K2 (uncharacterized protein LOC111481687 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481687 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 8.5e-76
Identity = 197/354 (55.65%), Postives = 229/354 (64.69%), Query Frame = 0 

Query: 25  MKKQSSLKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTT-SHSSKSITFV 84
           MK+Q+S  S  SS +EISSDDLLRRSL RR SKSFGCVS LLHFLS    S  +KSITFV
Sbjct: 1   MKRQNSFLS-SSSQVEISSDDLLRRSLSRRRSKSFGCVSNLLHFLSNNNHSRRNKSITFV 60

Query: 85  HTQNQEL------EDSIPPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGM--------WRLR 144
           H  NQE       E  I   PKPESAA+  IS S S PQI+ RSES +           R
Sbjct: 61  HNSNQEFLDNASSESKISRSPKPESAANLLISSSVS-PQIAERSESEISTTKVERFLGAR 120

Query: 145 GPIVRLMGLEEAPATE-----AEKQREVMAALEKCERDLKALKEFID---SSDSFRSSAP 204
           GPIVRLMGLE +   E     AEKQR+VM ALEKCE+DLKALKEFID   S++SFR S+P
Sbjct: 121 GPIVRLMGLESSKVEESVPEAAEKQRKVMEALEKCEQDLKALKEFIDALESTESFRMSSP 180

Query: 205 AGEGKKIEFLGWE----PSPVSL-------RHFVNT----------TTSANPERAQLPQR 264
             EGK+IEF+ WE    PSPVS+       RHFVN             SANP R Q  QR
Sbjct: 181 VSEGKRIEFMAWEQLQDPSPVSVLEELSRPRHFVNRHACNNSRIFHQPSANPGRVQSQQR 240

Query: 265 QDQLQRKNPREED-AFNLNKIDKIKTNEELVGKCKNELLSPLCSSSKAIMRDIVEGVSKD 324
           Q  +QRK  +E D  FN++K ++ K  EE+VG  KNE  +      +  M+D VEGV KD
Sbjct: 241 QQMMQRKKKQEGDHIFNISKFERTKIPEEVVGNLKNEKAAESPGCGREAMKDSVEGVCKD 300

Query: 325 IAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFSYSSLPFEACKRRLCF 334
           I+WG K EV RI LALQHQIF DLIEELVKD    ++F+Y+SLPFEAC+RRLCF
Sbjct: 301 ISWGLKMEVGRIGLALQHQIFGDLIEELVKD----HTFTYTSLPFEACRRRLCF 348

[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F9V5 (uncharacterized protein LOC111442147 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111442147 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 289.7 bits (740), Expect = 1.6e-74
Identity = 194/354 (54.80%), Postives = 228/354 (64.41%), Query Frame = 0 

Query: 25  MKKQSSLKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTT-SHSSKSITFV 84
           MK+Q+S  S  SS +EISSDDLLRRSL RR SKSFGCVS LLHFLS    S  +KSITFV
Sbjct: 1   MKRQNSFLS-SSSQVEISSDDLLRRSLSRRRSKSFGCVSNLLHFLSNNNHSRRNKSITFV 60

Query: 85  HTQNQEL------EDSIPPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGM--------WRLR 144
           H  NQE       E  I   PKPESAA+  IS S S P I+ RSES +           R
Sbjct: 61  HNSNQEFLDNASSESKISRSPKPESAANLLISSSVS-PPIAERSESAISTTTVERFLGAR 120

Query: 145 GPIVRLMGLEEAPATE-----AEKQREVMAALEKCERDLKALKEFI---DSSDSFRSSAP 204
           GPIVRLMGLE +   E     AEKQR+VM ALEKCE+DLKALKEFI   DS++SFR S+P
Sbjct: 121 GPIVRLMGLESSKVEESVPEAAEKQRKVMEALEKCEQDLKALKEFIDALDSTESFRMSSP 180

Query: 205 AGEGKKIEFLGWE----PSPVSL-------RHFVNT----------TTSANPERAQLPQR 264
             EGK+IEF+ WE    PSPVS+       RHFVN             SANP R Q  QR
Sbjct: 181 VSEGKRIEFMAWEQQQDPSPVSVLEELSRPRHFVNRHACNNSRIFHQPSANPGRVQSQQR 240

Query: 265 QDQLQRKNPREED-AFNLNKIDKIKTNEELVGKCKNELLSPLCSSSKAIMRDIVEGVSKD 324
           Q  +QRK  +E D  FN++K ++ K  EE+VG  KNE  +      +  M+D +EGV KD
Sbjct: 241 QQMMQRKKKQEGDHIFNISKFERTKIPEEVVGNWKNEKAAESPPCGREAMKDSLEGVCKD 300

Query: 325 IAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFSYSSLPFEACKRRLCF 334
           I+WG K EV RI LALQHQIF DL+EELVKD    ++F+Y+SLPFEAC+RRLCF
Sbjct: 301 ISWGLKMEVGRIGLALQHQIFGDLLEELVKD----HTFTYTSLPFEACRRRLCF 348

[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B6W0 (uncharacterized protein LOC103486818 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486818 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 241.5 bits (615), Expect = 5.0e-60
Identity = 182/358 (50.84%), Postives = 223/358 (62.29%), Query Frame = 0 

Query: 25  MKKQSS-LKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTTSHSSKSITFV 84
           MK+Q+S L S  SS L+ISSD+LLR S  RR S+SFGCVS LLHFLS +    +KSITFV
Sbjct: 1   MKRQNSFLSSSSSSQLQISSDNLLRHSHSRR-SRSFGCVSSLLHFLSNSHKRRNKSITFV 60

Query: 85  HTQNQELEDSI-----PPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGMWR--------LRG 144
           H    EL+D+I      P PK +SAA+     SDS  +I+ RS+S M           RG
Sbjct: 61  HNSIHELDDTISVSKTSPSPKHDSAANLLFFSSDSS-RIAERSDSTMSTTTVERFRGARG 120

Query: 145 PIVRLMGLEEAPATEAEKQREVMAALEKCERDLKALKEFID---SSDSFRSSAPAGEGKK 204
           PIVRLMGLE + A E EKQR+VM ALEKCERDLKALKEFID   S++SFRS +PAGEGK+
Sbjct: 121 PIVRLMGLESSTAVE-EKQRQVMEALEKCERDLKALKEFIDAFESTESFRSLSPAGEGKR 180

Query: 205 IEFL----GWEPSPVS----------LRHFVNTT-----TSANPERAQLPQRQDQLQRK- 264
           IE +      E SPV+           RH  N +      SAN  R Q  Q+  Q+QRK 
Sbjct: 181 IELMVLKQQEEGSPVAEELSWPWHLLNRHGFNNSMIFHRPSANSGRIQ-SQKIQQMQRKK 240

Query: 265 -NPREEDAFNLNKIDKI-----KTNEELVGKCK-----NELLSPLCSSSKAIMRDIVEGV 324
              +E+    LN + K      KT+E ++G  K      EL   LC S+K  MR+ VE V
Sbjct: 241 QEDQEDHMMMLNTVSKFDRTKNKTHEIVIGNWKLSEKAKELSPSLCRSNKVAMRESVEEV 300

Query: 325 SKDIAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFS-YSSLPFEACKRRLCF 334
            KDI WGQK+E+ RI L LQ+QI  DLIEELVKD  FS++F+ Y+SLPF+ACKR LCF
Sbjct: 301 FKDIFWGQKKELGRIGLTLQNQICGDLIEELVKDLNFSFTFTYYTSLPFQACKRSLCF 354

[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LF86 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G813800 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 170.6 bits (431), Expect = 1.1e-38
Identity = 123/245 (50.20%), Postives = 151/245 (61.63%), Query Frame = 0 

Query: 129 RGPIVRLMGLEEAPATEAEKQREVMAALEKCERDLKALKEFID---SSDSFRSSAPAGEG 188
           RGPIVRLMGLE   A E EKQR+V+ ALEKCERDLKALKEFID   S++SFRSS+PAGEG
Sbjct: 13  RGPIVRLMGLESTTA-EEEKQRQVLEALEKCERDLKALKEFIDAFESTESFRSSSPAGEG 72

Query: 189 KKIEFL----GWEPSPVSLR-----HFVNT----------TTSANPERAQLPQRQDQLQR 248
           K+IE +      E +PV+       HF N             S NP +    Q+  Q+QR
Sbjct: 73  KRIELMVLKQKEEGTPVAEELSLPWHFFNRQGFNNSMIFHRPSTNPGKTIQSQQIQQMQR 132

Query: 249 KNPREE--DAFNLNKIDKI-----KTNEELVGKCK------NELLSPLCSSS---KAIMR 308
           K   ++  D   LN + K      KT+E ++GK K      +EL   LC SS   K  MR
Sbjct: 133 KKQEDDQKDMMILNNVSKFDGTKNKTHEIVIGKWKLSEKGNDELCHSLCRSSNNNKVEMR 192

Query: 309 DIVEGVSKDIAWGQKREVERIVLALQHQIFADLIEELVKDSIFSYSFSY--SSLPFEACK 334
           + VE V +DI WGQK+E+ RI L LQ+QI  DLIEELVKD  FSY+F+Y  +SLPF+ACK
Sbjct: 193 ESVEEVFEDIFWGQKKELGRIGLTLQNQICGDLIEELVKDLNFSYTFTYYNTSLPFQACK 252

[Close]
BLAST of Sed0023543 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TPF4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold352G006000 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 154.5 bits (389), Expect = 8.0e-34
Identity = 106/184 (57.61%), Postives = 127/184 (69.02%), Query Frame = 0 

Query: 25  MKKQSS-LKSPPSSPLEISSDDLLRRSLRRRNSKSFGCVSGLLHFLSTTTSHSSKSITFV 84
           MK+Q+S L S  SS L+ISSD+LLR S  RR S+SFGCVS LLHFLS +    +KSITFV
Sbjct: 1   MKRQNSFLSSSSSSQLQISSDNLLRHSHSRR-SRSFGCVSSLLHFLSNSHKRRNKSITFV 60

Query: 85  HTQNQELEDSI-----PPPPKPESAADCKISCSDSDPQISGRSESGMWR--------LRG 144
           H    EL+D+I      P PK +SAA+     SDS  +I+ RS+S M           RG
Sbjct: 61  HNSIHELDDTISVSKTSPSPKHDSAANLLFFSSDSS-RIAERSDSTMSTTTVERFRGARG 120

Query: 145 PIVRLMGLEEAPATEAEKQREVMAALEKCERDLKALKEFID---SSDSFRSSAPAGEGKK 192
           PIVRLMGLE + A E EKQR+VM ALEKCERDLKALKEFID   S++SFRS +PAGEGK+
Sbjct: 121 PIVRLMGLESSTAVE-EKQRQVMEALEKCERDLKALKEFIDAFESTESFRSLSPAGEGKR 180

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Sed0023543 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022983018.11.8e-7555.65uncharacterized protein LOC111481687 [Cucurbita maxima][more]
KAG7017598.16.7e-7555.08hypothetical protein SDJN02_19464 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
XP_022935193.13.3e-7454.80uncharacterized protein LOC111442147 [Cucurbita moschata][more]
XP_023528398.14.8e-7354.49uncharacterized protein LOC111791339 [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
XP_038905750.14.0e-6453.37uncharacterized protein LOC120091709 [Benincasa hispida][more]
BLAST of Sed0023543 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Sed0023543 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1J6K28.5e-7655.65uncharacterized protein LOC111481687 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481687... [more]
A0A6J1F9V51.6e-7454.80uncharacterized protein LOC111442147 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC1114421... [more]
A0A1S3B6W05.0e-6050.84uncharacterized protein LOC103486818 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486818 PE=... [more]
A0A0A0LF861.1e-3850.20Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G813800 PE=4 SV=1[more]
A0A5A7TPF48.0e-3457.61Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold... [more]
BLAST of Sed0023543 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 208..230
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 85..122
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 21..40
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..45
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 208..223
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR37234OS03G0319200 PROTEINcoord: 25..333

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0023543.1Sed0023543.1mRNA