Sed0023212 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0023212
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG06: 5576581 .. 5582345 (+)
RNA-Seq ExpressionSed0023212
SyntenySed0023212
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGTTGGGGAACTTTATCGGTTGGGACAAAGAAGCAGATCTGCCTGCGGGTGGGGTTGGAATGGATGGTGGGTTAGATCGGATTTGGGAGGAAACTCAGAGTGGTGAGAGGCTTCCGATGGAGATGTGCCGGAATCTCACCAACAACGTGTCGCCGGAGGCTGCATCGGGAGATGACGAGGGAAAAGAAGAAAGTTTCAGAGACGACAGGAGCTTTCGGCCTGGTTCAGCAAAAAAGTTGGTATAATGGAAGGAGATGAAGGGATGGGCTCATCCTTTTGTGATAACAAGAAGAAAGGTCAGGGTCAAGTGGCAGGTGACCAATTGGCAAAGTTGACAGAAAAGGGGAAAGAGAAGCTGACAGGACAAGGGGTTGAAGAACTTTTATTTGGACCGTTTGAAATTAAAATAAGTAAAAATATTTCATAAGGCTGATTTTTTGAATCCCGTTAAAAGAGTTAAAAAAGGGATTGCTATTAAAGAAGTGGTGGGCCCAAGTTTTAAAGAAAATGAAAATTTAATGGAGGTACTTGATGAAGGAAAAAATGGGAAAATTGAGATTCACAACCCGTGTTTTAATGAAAATGAAAGTTCAATGGGGGCATTTAATGATGATGAAGGAAAATGTGGGGAGTTTATGACCCACAACCCATGTTTTATAGGAAAGGAAAAATTAATGAGGTTATTTAATGAAAGAAAAAGTGAGAAATTGGATTTGGATTTGAGAAGTCAATTGGGCTTGCTGGAAAAAAGGAATTCTATAAAATATCAAAAGAAGATAAAGTGGGGTTTAATATGGTAGAGAAAGTTAAGGAGAATTCCAATATTACAAAAGAGGGGTGTGGCAATTTTTTGGGTAGAAAATACTACAACAAAAATGAAGTAAAAGAGGTGGGCAAGATGGTAGATGAGTTGGAAAAAACTAGGATGTTAGATAAAGAATATGATGGAGTTCGGGGTGGAAAAATTAAAGGGACAATGTCTATTGTCAAGTGGAGAAGGAAAGCAAGATAAAAGGAAAGATTGCTAGAAATGCAAACATGAGAAAATAAAAATAGTGAGGGAGGAGTAGTTTGGAAAAAAAACATGATTTGGAGTGGTCAGAAATGATCGAGGTTGGAAAAAGAGGTAGGTTCGAATACATTAACGGTGTCAGTGGGATATCGGCGGAGACTGTTGAGCAGTCATGCCGGACGCAATGAAAACCTTATGTTGGAATGCTCGGGGGTTAAAAAACCCCTGGGCCATTAGAGCTCTTCGTCACGAAGTGCTCAAAGCGAATCCCCATATTGTGTTTGTTTATGAAACAAAGTGTTGTGAGAATGAGGTGGTTAGCTTAAAAATTAGTTTGAATTTTGACTGTTGTTTTTGTGTTCCTTGAGTTGGGCTCAGTGGGGGCTTGATGCTTTTTTGGAATACTCATTTGAATGTTTGTATTCGTTCTTACTCTCAAGGTCATATTGATACCTTAATTAAGGACGAGGGTGAGATGTGGAGATTTACTGGGTTCTATAGGAACCCGGTGCAAAATAAGCGTAGAGATTCCTGGAATCTTTTAAGAAGACTGGCGGGAGGATCATCGTTGCCTTGGCTGGTAGGTGGTGATTTCAATGAGATTCTCAATGTTGAAGAGCAAATGTTTGGAGCTGGTAAAGGTAGAGCAGGTATGGCTGAGTTCAGAGAAGTGATTAATGAGTGCTCGCTCATTGATGTGGGCTTCTCTAGCGATTTATTCACTTGGATTAAAAGAAAAGATTGTGCTTCTGCAATTAGAGTTCGTCTGGACAGGTATTTTGCTAACTCTTATTTTATTTCTAAAGCTCGTAAGATATCTATTAATCATTTAAGTTTTCACTCTTCGGATCATAGAATTATTGTTGCTAATTATAATTGGGTGGGTGAATGTTCAAGTGTGTTTAATTCTTCCAATAAATTATTGAGATTTGAAGATAGTTGGGTCAATTTATTGAATGTAAAGATGTGCATAGAAAGTGCTGGGGGGTAGAGGGTTATAGAGATCATCGTGCCTTTAATCTTATTAATTGTATTAAAGGGTGTCTGAAAGAGATGGCTAGGTGGAATAAGATGAAATTGAAGGGTTCGGTGAGACAAGCTATTGTTGATAAAGAAAAAGCCCTTTCGATGAATTACATGCAGAGCAATGTGGTTAGATCTGATCAAATTATTAATATTGAGAATGAGATTGAGAAATTGCTCGAAGAGGAGAAGATCTTTTGGAAGCAAAGATCGAGGGATGTCTGGCTCAAGTGGGGAGACAGGAATACAAAATGGTTTCACATGAGAGCCTCTCAAAGGAAAAAAAGGAATCGTATTGATAAACTTAAGGACGTTTGCGAGAATTGGCAGGTTGATGGGAGTGACATTGTCAAAGTTGCTAAGGATTACTTTGTTGATATTTTCTCGTCTCACGACAAAGATGATGAGGCTGTTGGGAGGATCTTGGCTGGGGTTGAAAGAAAGCTCTCGGATAGGGATATTCAATTCCTCGATAGGCATTTTTTGAGATCTGATATTGAGATGGCTCTTAAAAATTTAAATCCTTCTAAGGCCTTTGGGCCGGATGGAACAAATGGGATTTTTTTCAAAACATACTGGGATATAATTGGCCATGATGTGGTCAATTCTTGCTTAGGGGTGCTTAATGTGGGTAAGTTGTTGGACTCGATGAATGATACATTAATTGCTTTGATTCCTATGGTCCAATGCCTTAAAAGAATGGAAGAGTTTCGATCGATCAGTCTTTGTAATACTATGTATAAAATCGTTGCTAAAGCAATGTCTAACAAGCTGAAAGTTGTGATTGATAAAATCATATCTCCTAATCAAGCGTTCTTTGTCCCTAGGAGACTTATTACTGATAATGTTATTCTTGGTTTTGAATGTATTCATACTATTAATCAGAGGAAATCTGGGAAGGTTGGTTGGGGAGCTCTGAAGTTAAATATGAGTAAGGCTTATGATAGAGTGGAGTGGAGCTTTGTCCTTGATATGAGGGAGCGGCTGGGTTTTAGTAAAGTTTGGATTAATCTTATAAGCAGATGCATCTCTTCGGTTCTCTTTGCGGTGATGGTTAATGGCTCCCCGTATGGGGAGATTATTCCGCAGAGAGGTCTAAGACAGAGAGACCCTCTCTCTCCTCATCTTTTTTTTATTTGTGTTGAAGGGTTGTTTATGCTCCTCAAGAAAGAGGAGTTGAATTCTTTTAAGAGTTTTAAGATTAATAACCATTGTCCTGCTATTTCTCATTTATTTTTTGCTGATGATACCTTGTTATTTTTCAGGGCTAATACTGAGGATTGTTTGAAAATTAAAAATATTCTTAATTGTTATGAAAGAGCTTCTGGTCAACTGATCAATTATGAGAAATCAACCATTATGTTTAGCGGTAATATCAGGGCAAATGATCAAATTTTTCTTAGCAATTTGTTTGGTGTTAAAGTGAATGAGAATCTTGGAGTTCATCTGGGTATACCCTCTCAAAATAGCAGGAACAAGAAGGCTCTTTTTCAATCCATCAGATGTAGATTGGAAAAGCGTCTTCAAGGGTGGAAAGGAAAAATGTTGTCGAGAGGTGGGAAAGAGGTGTTAGTTAAGGAGGTTGGTCAGGCGATCCCAACCTATGCTATGAGTTGTTTTCGTTTGACTAAATCTTTTAATGAGAACCTTCAAAATTTATGTTCTAAATTCTGGTGGGGGGAGGATTCGAATAGCAGAAAGGCCTATTGGATGAGCTGGAAAAATTTGAGCAAAAGTAAGAAGCTGGGGGGGCTTGGTTTTAGAAATCTGAATGTTTTTAATCAAGCTCTATTAGCTAAACATAATTGGCGAATCTTGAGAAACCCCAACATCTTATTAAGTAGATTGTTAAGAGGAAAGTATTTTGTGAGTGGAGATTATTTATCGGCTTCTTTGGGAAATAATCCTTCTTTAGTTTGGCGGAGTATTTTGTGGGGTAGAGATTTGTTTAAGAGAGGTTATAGGTGGAAGGTGGGCAATGGGTGGAAAATTAAGATTGGTAGAGATCTTTGGCTTAATAGAGTTGGAAATCCTTTTGCTGATGGGGTTAGGGAAGATTGGAAGGATATATATGTGGTAGATTTATTGAGGGATGATAGATCATGGAAGGAGGAGATTTTAGAGAATAGTTTTTGCAAAGAAGATGCTGAAATCATCTATAATACCCCTCTGAGTGATGTGGTGATGCCGGATGAAGTGATTTGGAATGCTAGCGAGAACGAAGTTTTTTCAGTGAAAAATGCATATCATATTGGGCTTGAGTTTGAAAATTTGAAAGAGGTGTCTACCTCGGATCCTAAAATGACGTCGGGAATTTAGAATAGCTTCTGGAAGGTGGAGCTTTCCCCTAAAATCAAAGTGGGTGCTTAGAGTGTCCTTGCTAATGCCATTCCGACTAAATGCAACATGTATTTGAGAGGGGTGGATTCTAATACTTATTGCCCTTTATGTGGGAAAGCGAGGGAGTCGAATATGCATACTTTGAAGGATTGTAAATTGGCCATCCGTCTTTGGAAATATATTTTTCCCTAGTTTTCTGAGTTTAGTAATTATTTCGTGAGGATAGAGAAGGGGGTGGATTTCTGGAAAGGATTAAGTGATAAAATTCCTAAGGAAGAGTGGTTTAAAGGTATTATTATCAGTTAGAGCTTATGGAACTTCAGAAACCAATGTATCAATGGCAAGTTGGTCTTGAAGTTTCATAATCTCATAAATATTATCGAAAAAGCTATTAATGTTTATAATTTTATTGGTGTAGGTTCTGTAGCCAAGTCCTCTCATGAATCAAATGTTGCTTGTAGATGGATGACTCCCTCTAAAGGAATTGGAAATTGAATGTGGATGCTTCTTTGCATCCAAATTCGAGAAGGGGAGGCATTGGATGGGTGGTTCGCGATTGGAAAAGGCATCCTAAGTTGATGGGTTGGAAATCCAATTTATTGCATCAATTAGTGAAGGTTTTTG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mRNA sequence

ATGTTGGGGAACTTTATCGGTTGGGACAAAGAAGCAGATCTGCCTGCGGGTGGGGTTGGAATGGATGGTGGGTTAGATCGGATTTGGGAGGAAACTCAGAGTGGTGAGAGGCTTCCGATGGAGATGTGCCGGAATCTCACCAACAACGTGTCGCCGGAGGCTGCATCGGGAGATGACGAGGGAAAAGAAGAAAGTTTCAGAGACGACAGGAGCTTTCGGCCTGGTTCAGCAAAAAAGTTGAGTCACTGCCGCCGATCTGGCCCTACCATCGCCGATCTACTCCAGCCGCCGTCGCAATCTGCGCCTCACGCCAGTGGAACCCTCGAGCCACGCGCACACGCCTCTTCTGCTCGCTTTAAGCAGCCGCCACCATCCATGCCTTGCTCCCTCGCGCACGCAATCTTGGGCAGACGAGTAGTAGGGGTCTACGCGCGAGCCTTAGCCAAGGTGTCACGCCAAAAACCTGAGCCTAATCGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGTTGGGGAACTTTATCGGTTGGGACAAAGAAGCAGATCTGCCTGCGGGTGGGGTTGGAATGGATGGTGGGTTAGATCGGATTTGGGAGGAAACTCAGAGTGGTGAGAGGCTTCCGATGGAGATGTGCCGGAATCTCACCAACAACGTGTCGCCGGAGGCTGCATCGGGAGATGACGAGGGAAAAGAAGAAAGTTTCAGAGACGACAGGAGCTTTCGGCCTGGTTCAGCAAAAAAGTTGAGTCACTGCCGCCGATCTGGCCCTACCATCGCCGATCTACTCCAGCCGCCGTCGCAATCTGCGCCTCACGCCAGTGGAACCCTCGAGCCACGCGCACACGCCTCTTCTGCTCGCTTTAAGCAGCCGCCACCATCCATGCCTTGCTCCCTCGCGCACGCAATCTTGGGCAGACGAGTAGTAGGGGTCTACGCGCGAGCCTTAGCCAAGGTGTCACGCCAAAAACCTGAGCCTAATCGTTGA

Protein sequence

MLGNFIGWDKEADLPAGGVGMDGGLDRIWEETQSGERLPMEMCRNLTNNVSPEAASGDDEGKEESFRDDRSFRPGSAKKLSHCRRSGPTIADLLQPPSQSAPHASGTLEPRAHASSARFKQPPPSMPCSLAHAILGRRVVGVYARALAKVSRQKPEPNR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 56..76
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 44..127

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0023212.1Sed0023212.1mRNA