Sed0021122 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0021122
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG06: 8626864 .. 8630258 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0021122
SyntenySed0021122
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GGGAAATGAGGTTTCAAAAGAGATTTTTCAACTTGAAGCAATTATAGAGAGAGGAAAAAAAAGAAAAAGAAATTCCATTTAAGAGCTAAAGAGAATGGCCCGATTTTAAAAAATGAGAAAAATAAAGGCTTATTTTTGTTGTTTTAAATAAAAGGAAAAAAATGGCCAATTAAGTTAAAAAAAAAACCAATTATTTTCTTCTCTTCCTCATCAAGCACAAACCCTAGATCTACCCACCCCTAACCCTGCACCACCGCCGCTCTCAGTCCGATGCCACCCACCGCCCGCGTCGTCTCTCTTCCGATCAGACTAAGCCGAGCCGCGTTGCACCGACGCATAGCAGTCCGACCCCACGCGCGCATCCCCTGCTTCTCCGACGCATCTCCCGGGTGCGCTCGCCTTGCTCTCGCCCAACTCCGTCGATGTCTCTCTTGTGCGCAGATTCATAAGGTTTATTTAGTTGATAATCAATGGTTCAGTAATATTTAGTTGGAGTTTGTGGTTGATTCTTTAGAATATCAAAGATGTATTTCACATTACTATTAAGGTTTTTCTGCAACCTTCAAGAGAAGGAAGGTCACAAGAAAGAGAAACCACGCTCGATTTTTGCTAACGAAAAGGAAAAAAATTATGGACTTGAAGCCCTTAAAGAGAAGACACGTTCGAGAAGTATCCCAACAAATGAAACCAGTCCTCGAAAGGTACCCTCCTCTTTGTTTTTCTTCTTGGCTCTAATTGGAACTTAGAGCAGATTCATTCTTGTTATGTTTGCTAATTGTTATGGCAAAATAATAGTATATTTAAATGTTGTTTTAATTATTCATATTTTTTTTTGCATTTTCTATGTTCTTTCATGGTTTCAAATTATATCACCACTTAGAATTTCAAATGTCTGGACTCGGAAGACTATTTGAAGAAAAGGCTTAGATTTTCACACTTTGAGGGTTGATTATTTGTTTGTGTTGATATTTTAAGGAAATTGATTAATGATTGATTATTTTGTGTTGCATTGGAAAAAATTGGTTAAAATGCTTATAAAATGATATTTTATAGTTTATAAAATGATAGATTTGTTGCTCTTTGATCTAAAATGATTTTTTTTTCAATCTGTATGAGGTACTAGATGAGTTTCGTGCTTATTGTTGTTTTTGTTTAACGCTTGATTGTGATTGATAATTTGAGAGATGGAGAAAGAAATTGAAAGAAAAGTTGAATGGCTATTAAAACTAATCTCTTTTGTGACTATAATATTTGTGGTTTACAATAATTTTTCATTCATGGGCCAGAAAGTTTTATCTCTAAGTTGCTTTTGATTTCCTTGGATGTTAAATATTTATGTTCCATTTAAAAAAAAAAAAATTAATCAGTATTGTCTTGAGTTAAATTATTTTTACATGGGACAACTTGTTGTAGCAATCTATGCCACTCTTGCAAGTCAAGGATCCACACTGTTTAAGAGGATGGAAGCGTTTAGATTGACTTACTTTTCAATTGATGGTACCTTTGCTTCCCCACATTTATCCTCCTGAATTTTTTAAATGTTTGAAACTATTGATTATAATGATGTTTTCCCTCTTTCTTGTCTTAAAAGGAATCTTTAGTCTACCGTGTTGCAATTTTCCAAGTTTACTGTGCATATATTTAGTTTAAAAAATATTGGGTAAGCTCCCTCCTTTATTTCATGATTATAGCTTTACTTGTTTTATTAATAGTTGGAGAGCTCTTTTGTAATTCTCTCTTATCCTTGTAATTCTTAATTTCATATGTTAATGAAATCATTTTAATCTTGTTCCTAGGAATTTTCTCTCATTTACAATCCCAAGAAGAAAACTATGATTACTTGGTTTTAATTGATTGGTAGATATTTTTTTTCAGGAACGAGATCTCAATTTTATTGTTATTTCTTTGGGTAAGCTCTCTTCTTTATTTCATGATTATAGCTTTACTAGTTTTATTTATAGTTGGAAAGCTCTTTTGTAATTCTTTCTTATCCTTGCAATTCTTAATTTCACATGTTAATAAAATCATTTTAATCTTCTTCCTAGGAATTTTCTCTCATTTACAATCCCAAGAAGAAAACTATGATTACTTGATTTTAATTGATTGGTAGATTTTTTTTTTCAGGAACGAGTTCTCAATCTTATTGTTATTTCTTTGGGTAAGCTCTCTTCTTTATTTCATGATTATAGCTTTACTAGTTTTATTTATAGTTGGAAAGCTCTTTTGTAATTCTTTCTTATCCTTGCAATTCTTAATTTCATATGTTAATGAAATAGTTTCTTATAAAAAAAACAGTAATGAGAACTCTAATTAAAATTAAGAAGTTACATCACATCTCAAGGTACATGCCTTTCTTCTTCAAAATGAAAAAGCATTGGTAATGTTTGTAAGTTTATTCTTGTGGTTTATTATCTTGGCCTTATTATTATTATTATTATTTATTCAGGAGTAGAACTCTTCTATTGGTCCACTACCAGCTTAGACTTGCAAAAAAAATTCTTTGTTCTAGCATCAATAGCTAGCCAACATGTTGTCATCGATGTAAGTTTGCTTATAGAGAACTTTTTGTTTCCTATACTTTTGCCTTTTGAATAAATTATAGAGAACTTTATTTATTATCTAGGTTTTGTTTTGTTGATGAAATTGGTCCTACTACTTATTCTTTCACTAATACCATCGATGGCGAGTTTATTTGATTTTGAGTTTTCTTTGCCTCTAAAGTTTTTGTCAAAATGGGCCAGGTGGACTTGGTTATTATTATTATTATTATTTGTGAATTATTATTGGGGGTTGGTTCTTGGGTTTTTTTTTCTTGATGGGTTTACCCTGAATTCGAAGTTGAAAGAAGTCAAGAAGTATGTAATCCACTTTGAGTGGTTTTGATGGAGTACTTGTTTGCTAAATCGCTTATTAGGAGGTTAGTTAGGAACTTAGCGAATAAAATTAATGATTATTGTGTTGAATTGATCAAAAAAGTATATTTGTTATGATCTTATAGTTAATTTGATCAATATTCATATGTTTTTTTGTTTTCCTACTTTGACTACGAATATTTATATTTGATTTTCTTTTGTCTTCAGCTTCATGATGAATTATGTGGCTTTGAAATAAGTTCTCCCCTCCAAGAGTCGACTACAATCGTGCCCATGTCTTCTCTTGAATTAAGGCAAGAATCGAGACAACCATTAGTTAGATTTTATTATTATGTAAATTTTCTACCAAGTTCAATGATAGTTTCCTTGTATTACATACGTTCATAACTAAAAATACTATATATGTTCGTAGGTAAAAATACTATCAACATTAATATTTATATATAGGTTGCTTTTTATATTTTTCTTAAATTGACTCAAATTTGGAGATCATTAATTTAATAGTAGTCTATGTAATAGCAG

mRNA sequence

GGGAAATGAGGTTTCAAAAGAGATTTTTCAACTTGAAGCAATTATAGAGAGAGGAAAAAAAAGAAAAAGAAATTCCATTTAAGAGCTAAAGAGAATGGCCCGATTTTAAAAAATGAGAAAAATAAAGGCTTATTTTTGTTGTTTTAAATAAAAGGAAAAAAATGGCCAATTAAGTTAAAAAAAAAACCAATTATTTTCTTCTCTTCCTCATCAAGCACAAACCCTAGATCTACCCACCCCTAACCCTGCACCACCGCCGCTCTCAGTCCGATGCCACCCACCGCCCGCGTCGTCTCTCTTCCGATCAGACTAAGCCGAGCCGCGTTGCACCGACGCATAGCAGTCCGACCCCACGCGCGCATCCCCTGCTTCTCCGACGCATCTCCCGGGTGCGCTCGCCTTGCTCTCGCCCAACTCCGTCGATGTCTCTCTTGTGCGCAGATTCATAAGGTTTATTTAGTTGATAATCAATGGTTCAGTAATATTTAGTTGGAGTTTGTGGTTGATTCTTTAGAATATCAAAGATGTATTTCACATTACTATTAAGGTTTTTCTGCAACCTTCAAGAGAAGGAAGGTCACAAGAAAGAGAAACCACGCTCGATTTTTGCTAACGAAAAGGAAAAAAATTATGGACTTGAAGCCCTTAAAGAGAAGACACGTTCGAGAAGTATCCCAACAAATGAAACCAGTCCTCGAAAGGAACGAGATCTCAATTTTATTGTTATTTCTTTGGGAACGAGTTCTCAATCTTATTGTTATTTCTTTGGGAGTAGAACTCTTCTATTGGTCCACTACCAGCTTAGACTTGCAAAAAAAATTCTTTGTTCTAGCATCAATAGCTAGCCAACATGTTGTCATCGATCTTCATGATGAATTATGTGGCTTTGAAATAAGTTCTCCCCTCCAAGAGTCGACTACAATCGTGCCCATGTCTTCTCTTGAATTAAGGCAAGAATCGAGACAACCATTAGTTAGATTTTATTATTATGTAAATTTTCTACCAAGTTCAATGATAGTTTCCTTGTATTACATACGTTCATAACTAAAAATACTATATATGTTCGTAGGTAAAAATACTATCAACATTAATATTTATATATAGGTTGCTTTTTATATTTTTCTTAAATTGACTCAAATTTGGAGATCATTAATTTAATAGTAGTCTATGTAATAGCAG

Coding sequence (CDS)

ATGGACTTGAAGCCCTTAAAGAGAAGACACGTTCGAGAAGTATCCCAACAAATGAAACCAGTCCTCGAAAGGAACGAGATCTCAATTTTATTGTTATTTCTTTGGGAACGAGTTCTCAATCTTATTGTTATTTCTTTGGGAGTAGAACTCTTCTATTGGTCCACTACCAGCTTAGACTTGCAAAAAAAATTCTTTGTTCTAGCATCAATAGCTAGCCAACATGTTGTCATCGATCTTCATGATGAATTATGTGGCTTTGAAATAAGTTCTCCCCTCCAAGAGTCGACTACAATCGTGCCCATGTCTTCTCTTGAATTAAGGCAAGAATCGAGACAACCATTAGTTAGATTTTATTATTATGTAAATTTTCTACCAAGTTCAATGATAGTTTCCTTGTATTACATACGTTCATAA

Protein sequence

MDLKPLKRRHVREVSQQMKPVLERNEISILLLFLWERVLNLIVISLGVELFYWSTTSLDLQKKFFVLASIASQHVVIDLHDELCGFEISSPLQESTTIVPMSSLELRQESRQPLVRFYYYVNFLPSSMIVSLYYIRS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0021122.1Sed0021122.1mRNA
Sed0021122.2Sed0021122.2mRNA