Sed0019388 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0019388
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG04: 4751371 .. 4754437 (+)
RNA-Seq ExpressionSed0019388
SyntenySed0019388
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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GTAGAATTCTCTCCTCCGTGAGAGCTGGTGGAGATTTTTGCGTATCTTCAGTTTTTATCTTTTTTCTTTAGGGATTTGGTCGGATTCCAAATCGCTGATTGGCATATTCAAAAGGGTTGTGAAACTCTAGATGAAAATATGGTTGGGGGTGATGCAGATTCTGGGTATGGTCCCTTGGATGAGGGCGACTGAATTCAGAAGGAATGGTAGCAGCTGGGATGTGAGAAGTCCGTATCGTTTTGAGGAAGGTGGAGGCTCTAGAGGCTTGGGCAGAGGTCGTGGAGATGCTGATCGGGGTGGGCGTGGAGGCCGCTGGGATAGTTCTTGGTGGAGGAGTGAAGGTTCACCGGATCGAACTGGTTTATCTCCAATGAGTGAATCCAATCCAAAGATTGGTGGAGCATTGATGGCGATGGAAAGTCCTTTAGTTATGGCAGCGTTGGTTGAGAAAGAGGAAAAGTCATTGCCTACAAAAAACGTTACAAAGAAATTTGCTGAAGGCATTGAAGGCATTGGTGAAGGGATAATGGGGTCGGGTAATGAAGAAAGTCTCTCAGCCATGGACGTTAGCCCAATTGCGACTCCAAAAGGGGTAACGTTTGACGAAGATTCGGGTCCTAGCTGTACAAAATTTAGTAGAGCGGGCCGGGTTACTGGTGGGCCTTTTCTTGGGTCGATTCTAAAACTCAATATGGGCCTGCTACCTCCAAGTTCAAAAAAGAAACTGTTTCAGTCAAGCCCTTCTAAGGTGTTAGCAGGTGAATCACCATCAGAGCAATCTGATCCAAACTTGCCATTGATTGGGCCTGATGGTGATAAGCTGGATGAAGTCAACTTAGGGAAATTAAGACAGAAGAAATGGGCTCGACTTAAAACCCAGATGGATGGCAAAATGGATGTGGACCATGAGACTTTACTCGTTAATTTTAAAAAAGATGGGGTTAGTAGTGGCAAAAGAGCCTTGAACGTAGACAGTCTTCGAATCGACCAAGGGGTGCCAACAAAAGAAAACCAGTTTGGATGTGGAGGAAAGCAATGCAAAAGAATCAGAGGTGGAGGTTGTTTCTTGTTCGTTATTGGCGAACCCTGTTGAGCAGGGTCGCCAATCGCCATGAATCTCCTCGTTTGGAATGTCTGCGGGTTGGGCAACCAGTGGTCACTCCGAAATCTAAAGAAAGTAATTCTACTATCAAAGACTAGTGTGATTGTTATTCTTGAAAAAACAATGTGGTTCAAAGCGTGCACATTTTGTTAGAATGAGTATTGGTTTTGATTTTCTGTTTTCTGTGGATTGTACTGGCAAAAGTGGTGGTATTTGTGTTTTCTAGAATAAAAATGTGGACCTCAGTATACAATCGTATAACAATTTCTATGTGGATATGTATGTTAAAATGTTGGAAGGGAACTGGAGAATGACGGGGTTCTATGGCGACCCTCAAACCTCTAAAAGGCATTTATCGTGGGAACTTTTAAAGAGGTTGAGTTCTAACTTGGCAGGACCCTGGCTAGTAGCAGGGGATTTTAACGAAATTTTGTCCCAAAGTGAAAAATGGGGGGTGTAGAAAAAACTCAGAAACAATTAGAGGATATGGGCTTTAAAGGTACACCTTTTACTTGGTATAGATCGATGAAGAATAATATAGTATTGAAAGAGTGTTTGGACAGAGCTTTTTGTTCGTCAAATTTTTTGGAGTTGTTCCCATTCTCCGAAGTTCAACACTTGGACTATTGGGGGTCGGATCATTGCCCTCTTCTAATTAGTATTTCTAGCCGCACAAAATTTAGGCGAATTCGACATCCAAAATTTTTCAAATTTGAGGAAGTCTGGGCAATGCAAGAGGATTGTAAGGAGGTGGTAGACAAAGTGTGGAATAATTCGGTTGGTCAAGTTAACCAATCTGTATCCTTGGGGGAAAAATTAAGCAGGTGCCAAGAGAGTTTAACGGTTTGGGGGAATAATATAAAGGAAGGATATGTTGAGCGGATTAAAAAAGCCCGATCTGAGTTACAAAATGCAATCCAACAAAACTTGGATGTTCAAGGTTAAAGGAAAAATATTGAAAATCTTCTTGCTGAGGAAGAAGTTTTTTGGCGACAACGGTCAAGAGTCAATTGGCTTAAATGTGGGGATAAAAACTCCAAATGGTTCCATGCTTGCTCCTAAAAAGACCTTAGTAGCCTTTGTAGACATGATGGTACTTGGGTAAATTCTGAGGAGGAGCTTGAAGCAGAAGTTTGCTCCTATTTTAAAAAATTATTCACATCCAACAATGGTTCGAACAATTCGGTGGCGGAAAGCTTCTTCGATCAGGTTAGTCATTCCTTTACCTTTGACCAACTTCTCTCTGGCCTTTTTCTGAAGTGGAGGTGTTAGAAGCTTTAAAGTTTATGGGGTCCTCGAAAGCTCTAGGACTGGATGGTTATACAGTTTTTTTCTATAAAAAGTTTTGGGGAATAGTTGGGGGGGATGTGTTGAAGTTCTGTTTAAACGTCCTTAATGAGGGTGGGTCTCTATCAGAAATTAATAAGACGGCTATCACCCTAATCCCAAAGTGCAATGCTGCTAGTTCGCTAAAAGATTATAAACCGATTAGTTTGTGTAATGTTATTTATAAACTTATTTCTAAAACTGTGGCGAATAGACTTAAAGAAATTTGGAAGGATCTAATCTCTCCTTGCCAGAGTGCATTTGTCCCAAGGAGAAATATAGCTGATAATGCTCTTCTTGGTTATGAATGTCTGTATACCTTAAAAACCAGAAAGCGTGGGAAGGTTGGGATAGCGGCCCTAAAGTTGGATATGAGTAAGGCGTACGACAGAGTTGAATGGAGTTTTTTACCACGATTCATGCAAGTTGTGGGGTTCCCTGAGGCTTTTGCTGAGTTAATTATGAGGTGTATTTCAACAGTTTCTTTTACTTTCAACATTAATGGTGCTTGTAGAGGCTTGATTCATAATACCCGCGGTCTCCGACAAGGGGATCATTTATCTCCATACCTTTTTATTCTATACACTAAAGGCATGTCCCGTATTCTAGACGCTTATGAGGAGGCTGGGACAATTTCGG

mRNA sequence

GTAGAATTCTCTCCTCCGTGAGAGCTGGTGGAGATTTTTGCGTATCTTCAGTTTTTATCTTTTTTCTTTAGGGATTTGGTCGGATTCCAAATCGCTGATTGGCATATTCAAAAGGGTTGTGAAACTCTAGATGAAAATATGGTTGGGGGTGATGCAGATTCTGGGTATGGTCCCTTGGATGAGGGCGACTGAATTCAGAAGGAATGGTAGCAGCTGGGATGTGAGAAGTCCGTATCGTTTTGAGGAAGGTGGAGGCTCTAGAGGCTTGGGCAGAGGTCGTGGAGATGCTGATCGGGGTGGGCGTGGAGGCCGCTGGGATAGTTCTTGGTGGAGGAGTGAAGGTTCACCGGATCGAACTGGTTTATCTCCAATGAGTGAATCCAATCCAAAGATTGGTGGAGCATTGATGGCGATGGAAAGTCCTTTAGTTATGGCAGCGTTGGTTGAGAAAGAGGAAAAGTCATTGCCTACAAAAAACGTTACAAAGAAATTTGCTGAAGGCATTGAAGGCATTGGTGAAGGGATAATGGGGTCGGGTAATGAAGAAAGTCTCTCAGCCATGGACGTTAGCCCAATTGCGACTCCAAAAGGGGTAACGTTTGACGAAGATTCGGGTCCTAGCTGTACAAAATTTAGTAGAGCGGGCCGGGTTACTGGTGGGCCTTTTCTTGGGTCGATTCTAAAACTCAATATGGGCCTGCTACCTCCAAGTTCAAAAAAGAAACTGTTTCAGTCAAGCCCTTCTAAGGTGTTAGCAGGTGAATCACCATCAGAGCAATCTGATCCAAACTTGCCATTGATTGGGCCTGATGGTGATAAGCTGGATGAAGTCAACTTAGGGAAATTAAGACAGAAGAAATGGGCTCGACTTAAAACCCAGATGGATGGCAAAATGGATGTGGACCATGAGACTTTACTCGTTAATTTTAAAAAAGATGGGGTTAGTAGTGGCAAAAGAGCCTTGAACGTAGACAGTCTTCGAATCGACCAAGGGGTGCCAACAAAAGAAAACCAGTTTGGATGTGGAGGAAAGCAATGCAAAAGAATCAGAGGTGGAGGTTGTTTCTTGTTCGTTATTGGCGAACCCTGTTGAGCAGGGTCGCCAATCGCCATGAATCTCCTCGTTTGGAATGTCTGCGGGTTGGGCAACCAGTGGTCACTCCGAAATCTAAAGAAAGTAATTCTACTATCAAAGACTAGTGTGATTGTTATTCTTGAAAAAACAATGTGGTTCAAAGCGTGCACATTTTGTTAGAATGAGTATTGGTTTTGATTTTCTGTTTTCTGTGGATTGTACTGGCAAAAGTGGTGGTATTTGTGTTTTCTAGAATAAAAATGTGGACCTCAGTATACAATCGTATAACAATTTCTATGTGGATATGTATGTTAAAATGTTGGAAGGGAACTGGAGAATGACGGGGTTCTATGGCGACCCTCAAACCTCTAAAAGGCATTTATCGTGGGAACTTTTAAAGAGGTTGAGTTCTAACTTGGCAGGACCCTGGCTAGTAGCAGGGGATTTTAACGAAATTTTGTCCCAAAGTGAAAAATGGGGGGTGTAGAAAAAACTCAGAAACAATTAGAGGATATGGGCTTTAAAGGTACACCTTTTACTTGGTATAGATCGATGAAGAATAATATAGTATTGAAAGAGTGTTTGGACAGAGCTTTTTGTTCGTCAAATTTTTTGGAGTTGTTCCCATTCTCCGAAGTTCAACACTTGGACTATTGGGGGTCGGATCATTGCCCTCTTCTAATTAGTATTTCTAGCCGCACAAAATTTAGGCGAATTCGACATCCAAAATTTTTCAAATTTGAGGAAGTCTGGGCAATGCAAGAGGATTGTAAGGAGGTGGTAGACAAAGTGTGGAATAATTCGGTTGGTCAAGTTAACCAATCTGTATCCTTGGGGGAAAAATTAAGCAGGTGCCAAGAGAGTTTAACGGTTTGGGGGAATAATATAAAGGAAGGATATGTTGAGCGGATTAAAAAAGCCCGATCTGAGTTACAAAATGCAATCCAACAAAACTTGGATGTTCAAGGTTAAAGGAAAAATATTGAAAATCTTCTTGCTGAGGAAGAAGTTTTTTGGCGACAACGGTCAAGAGTCAATTGGCTTAAATGTGGGGATAAAAACTCCAAATGGTTCCATGCTTGCTCCTAAAAAGACCTTAGTAGCCTTTGTAGACATGATGGTACTTGGGTAAATTCTGAGGAGGAGCTTGAAGCAGAAGTTTGCTCCTATTTTAAAAAATTATTCACATCCAACAATGGTTCGAACAATTCGGTGGCGGAAAGCTTCTTCGATCAGGTTAGTCATTCCTTTACCTTTGACCAACTTCTCTCTGGCCTTTTTCTGAAGTGGAGGTGTTAGAAGCTTTAAAGTTTATGGGGTCCTCGAAAGCTCTAGGACTGGATGGTTATACAGTTTTTTTCTATAAAAAGTTTTGGGGAATAGTTGGGGGGGATGTGTTGAAGTTCTGTTTAAACGTCCTTAATGAGGGTGGGTCTCTATCAGAAATTAATAAGACGGCTATCACCCTAATCCCAAAGTGCAATGCTGCTAGTTCGCTAAAAGATTATAAACCGATTAGTTTGTGTAATGTTATTTATAAACTTATTTCTAAAACTGTGGCGAATAGACTTAAAGAAATTTGGAAGGATCTAATCTCTCCTTGCCAGAGTGCATTTGTCCCAAGGAGAAATATAGCTGATAATGCTCTTCTTGGTTATGAATGTCTGTATACCTTAAAAACCAGAAAGCGTGGGAAGGTTGGGATAGCGGCCCTAAAGTTGGATATGAGTAAGGCGTACGACAGAGTTGAATGGAGTTTTTTACCACGATTCATGCAAGTTGTGGGGTTCCCTGAGGCTTTTGCTGAGTTAATTATGAGGTGTATTTCAACAGTTTCTTTTACTTTCAACATTAATGGTGCTTGTAGAGGCTTGATTCATAATACCCGCGGTCTCCGACAAGGGGATCATTTATCTCCATACCTTTTTATTCTATACACTAAAGGCATGTCCCGTATTCTAGACGCTTATGAGGAGGCTGGGACAATTTCGG

Coding sequence (CDS)

ATGAAAATATGGTTGGGGGTGATGCAGATTCTGGGTATGGTCCCTTGGATGAGGGCGACTGAATTCAGAAGGAATGGTAGCAGCTGGGATGTGAGAAGTCCGTATCGTTTTGAGGAAGGTGGAGGCTCTAGAGGCTTGGGCAGAGGTCGTGGAGATGCTGATCGGGGTGGGCGTGGAGGCCGCTGGGATAGTTCTTGGTGGAGGAGTGAAGGTTCACCGGATCGAACTGGTTTATCTCCAATGAGTGAATCCAATCCAAAGATTGGTGGAGCATTGATGGCGATGGAAAGTCCTTTAGTTATGGCAGCGTTGGTTGAGAAAGAGGAAAAGTCATTGCCTACAAAAAACGTTACAAAGAAATTTGCTGAAGGCATTGAAGGCATTGGTGAAGGGATAATGGGGTCGGGTAATGAAGAAAGTCTCTCAGCCATGGACGTTAGCCCAATTGCGACTCCAAAAGGGGTAACGTTTGACGAAGATTCGGGTCCTAGCTGTACAAAATTTAGTAGAGCGGGCCGGGTTACTGGTGGGCCTTTTCTTGGGTCGATTCTAAAACTCAATATGGGCCTGCTACCTCCAAGTTCAAAAAAGAAACTGTTTCAGTCAAGCCCTTCTAAGGTGTTAGCAGGTGAATCACCATCAGAGCAATCTGATCCAAACTTGCCATTGATTGGGCCTGATGGTGATAAGCTGGATGAAGTCAACTTAGGGAAATTAAGACAGAAGAAATGGGCTCGACTTAAAACCCAGATGGATGGCAAAATGGATGTGGACCATGAGACTTTACTCGTTAATTTTAAAAAAGATGGGGTTAGTAGTGGCAAAAGAGCCTTGAACGTAGACAGTCTTCGAATCGACCAAGGGGTGCCAACAAAAGAAAACCAGTTTGGATGTGGAGGAAAGCAATGCAAAAGAATCAGAGGTGGAGGTTGTTTCTTGTTCGTTATTGGCGAACCCTGTTGA

Protein sequence

MKIWLGVMQILGMVPWMRATEFRRNGSSWDVRSPYRFEEGGGSRGLGRGRGDADRGGRGGRWDSSWWRSEGSPDRTGLSPMSESNPKIGGALMAMESPLVMAALVEKEEKSLPTKNVTKKFAEGIEGIGEGIMGSGNEESLSAMDVSPIATPKGVTFDEDSGPSCTKFSRAGRVTGGPFLGSILKLNMGLLPPSSKKKLFQSSPSKVLAGESPSEQSDPNLPLIGPDGDKLDEVNLGKLRQKKWARLKTQMDGKMDVDHETLLVNFKKDGVSSGKRALNVDSLRIDQGVPTKENQFGCGGKQCKRIRGGGCFLFVIGEPC
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 40..83
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 69..83

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0019388.1Sed0019388.1mRNA